Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-graduação em Engenharia Química. / Made available in DSpace on 2012-10-24T01:50:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 255653.pdf: 1907221 bytes, checksum: 0c93fe1f48bf9620cbb617616e9fee05 (MD5) / Biofilmes são comunidades de microrganismos ligados a uma superfície inerte ou viva. Na complexa constituição do material extracelular de biofilmes, os polissacarídeos possuem um importante papel. Dentro da família de exopolissacarídeos sintetizados pelas bactérias com intuito de se proteger do sistema de defesa hospedeiro, encontra-se um com o monômero N-Acetil-D-Glicosamina ligado por conformação ß-1,6. Grupos de genes que produzem tal polímero encontram-se no genoma de diversas bactérias. A associação deste polissacarídeo com fatores de virulência, aliado à síntese em bactérias causadoras de infecção, torna-o um potencial alvo no desenvolvimento de novos antibióticos. A Chromobacterium violaceum, um patógeno oportunístico, e na maioria das vezes fatal, possui o operon hmsHFR-CV2940 cujas proteínas podem sintetizar tal polissacarídeo. Neste trabalho foram utilizados alinhamentos múltiplos entre proteínas de bactérias que sintetizam polissacarídeos com o intuito de verificar a existência de aminoácidos críticos para a atividade patogênica conferida por biofilmes. Foram gerados modelos tridimensionais para visualização da distribuição espacial destes aminoácidos. A análise efetuada mostra que a proteína HmsR conserva os aminoácidos D135, D228, Q264 e R267, considerados críticos para a formação de biofilmes, e estes se encontram próximos. A proteína HmsF de C. violaceum conserva os resíduos D86, D87, H156 e W115. No modelo estrutural gerado observa-se que estes resíduos também encontram-se favoravelmente localizados. Para a proteína HmsH houve comprovação de conservação para o resíduo R104, e na proteína CV2940 conservou-se o resíduo W94. A conservação de aminoácidos considerados importantes para a formação de biofilmes entre as proteínas deste operon em C. violaceum indica que eles desempenham a mesma função enzimática na síntese de biofilmes. Também como no caso de operons de outros organismos patogênicos, pode-se sugerir que o operon hmsHFR-CV2940 esteja ligado à sua patogenicidade.

Submitted by Francisco Costa (xcosta@ufba.br) on 2013-06-03T13:25:54Z No. of bitstreams: 1 Identificação biológica e aplicação de biocidas na população microbiana que forma os biofilmes de alguns monumentos históricos da bahia.pdf: 1162328 bytes, checksum: 42a43538aac85781e236f8ad18d663cf (MD5) / Approved for entry into archive by Edilene Costa(ec@ufba.br) on 2013-06-19T18:55:50Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Identificação biológica e aplicação de biocidas na população microbiana que forma os biofilmes de alguns monumentos históricos da bahia.pdf: 1162328 bytes, checksum: 42a43538aac85781e236f8ad18d663cf (MD5) / Made available in DSpace on 2013-06-19T18:55:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Identificação biológica e aplicação de biocidas na população microbiana que forma os biofilmes de alguns monumentos históricos da bahia.pdf: 1162328 bytes, checksum: 42a43538aac85781e236f8ad18d663cf (MD5) / Este trabalho visa a caracterização biológica e a aplicação de biocidas na população microbiana presente nos biofilmes encontrados em diferentes substratos em processo de biodeterioração nos monumentos históricos da Bahia, conventos franciscanos: de Salvador, de Santo Antônio de São Francisco do Conde e de Santo Antônio de Cairu, relacionando-os a fatores ambientais. As amostras foram submetidas a análises microbiológicas quantitativas e qualitativas, análises moleculares, além da determinação de temperatura, umidade relativa e luminosidade dos ambientes. Após 30 dias de aplicação dos biocidas, foi realizada nova avaliação microbiológica para verificar a ação dos biocidas. Os fungos presentes cultiváveis e isolados, por métodos tradicionais, no convento de Cairu, são caracterizados pelos gêneros: Aspergillus sp1, Aspergillus sp2, Paecilomyces sp1, Paecilomyces sp2, Penicillium sp1, Phialophora sp1 e Rhizopus sp. A microbiota fúngica cultivável, identificada por técnicas moleculares presentes no convento de Salvador, é das espécies: Aspergillus aculeatus e Cunninghamella blakesleeana. Os fungos identificados no convento do Conde pertencem às espécies: Aspergillus aculeatus e Trichoderma longibrachiatum. Esses micro-organismos presentes nos biofilmes, associados a fatores ambientais, podem influenciar os processos de biodeterioração. Os índices de temperatura, umidade e luminosidade favoreceram o crescimento de bactérias e fungos. A partir dos resultados obtidos, podemos sugerir a concentração de 0,5% do biocida de Cobre e Zinco, o melhor entre os aplicados in loco, pois apresenta toxicidade mediana ao ser humano, possui eficácia equivalente aos demais biocidas testados na redução dos micro-organismos avaliados, além de menor custo. Entretanto, por mais que se obtenha o efeito residual, a proliferação para ser controlada é necessária à manutenção preventiva dos edifícios históricos por parte das autoridades e dos usuários. Este trabalho possibilitou o conhecimento acerca da ocorrência de micro-organismos relacionados à biodeterioração dos edifícios, para auxiliar os restauradores na escolha de agentes de controle adequados à preservação do patrimônio histórico e do meio ambiente. / Salvador

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Físicas e Matemáticas, Programa de Pós-Graduação em Química, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T11:14:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 270193.pdf: 13278512 bytes, checksum: 1d2cf54ebc57f91bce21d2ad75146bbe (MD5) / Neste estudo foram obtidos e caracterizados filmes e esferas a partir dos biopolímeros carboximetilcelulose e alginato de sódio para aplicação em processos de liberação de potássio em solo arenoso. Os filmes desenvolvidos foram também avaliados quanto a potencial aplicação em processos de recobrimento de sementes. A liberação de potássio em solo arenoso foi avaliado em filmes sem aditivos e em filmes reticulados com EDC e cloreto de cálcio. Quando o potássio foi adicionado diretamente no solo arenoso, praticamente 100% do nutriente foi lixiviado durante o período de análise. Por outro lado, quando o potássio foi incorporado nos filmes de composição CMC/AS 50/50, porcentagens de 25-85% foram liberadas no mesmo período para incorporações na faixa de 120-480 mg. O processo de reticulação dos filmes promoveu alterações na estrutura polimérica, influenciando as propriedades mecânicas e de absorção de água dos filmes. Estas modificações promoveram uma maior liberação do potássio incorporado nos filmes reticulados com cálcio e EDC em solução, principalmente devido ao maior intumescimento destes. O desenvolvimento de esferas de composição CMC/AS 50/50 apresentou resultados de liberação semelhante àqueles obtidos para os filmes não reticulados. Avaliando os resultados de liberação de potássio comprovamos que ambos os dispositivos desenvolvidos, filmes e esferas, apresentam viabilidade para a aplicação proposta. O recobrimento de sementes de feijão com os filmes sem aditivos mostraram a formação de um filme polimérico denso e homogêneo na superfície das sementes que não afetou a capacidade de germinação das mesmas.

RIBEIRO, Louise Helena de Freitas. Potencial biotecnológico do óleo essencial de Vitex gardneriana na prevenção e controle de biofilmes de espécies de Candida de importância clínica. 2016. 42 f. Dissertação (Mestrado em Biotecnologia e Recursos Naturais)-Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2016. / Submitted by Anderson Silva Pereira (anderson.pereiraaa@gmail.com) on 2017-01-19T17:02:11Z No. of bitstreams: 1 2016_dis_lhfribeiro.pdf: 1781281 bytes, checksum: 5b8b915c1304185cf1394d9878ae000c (MD5) / Approved for entry into archive by Jairo Viana (jairo@ufc.br) on 2017-01-23T20:13:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2016_dis_lhfribeiro.pdf: 1781281 bytes, checksum: 5b8b915c1304185cf1394d9878ae000c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-01-23T20:13:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2016_dis_lhfribeiro.pdf: 1781281 bytes, checksum: 5b8b915c1304185cf1394d9878ae000c (MD5) Previous issue date: 2016 / Candida species have been considered as important causes of nosocomial fungal infections. Their ability to form biofilms has been related to high mortality rates in patients with candidemia. Due to the capacity to colonize surfaces of catheters and other medical devices, Candida biofilms may play important roles in systemic infections, which are difficult to treat by conventional antifungal agents. Therefore, the discovery of new drugs useful in the prevention and eradication of Candida biofilms is of great interest. Essential oils are excellent sources of bioactive molecules with antifungal and antibiofilm potential. Some species of the genus Vitex have proven antifungal activity against Candida species. However, to this date, there are no reports on the antifungal activity exerted by Vitex gardneriana, which is found mainly in Brazil. This study aimed to evaluate the biotechnological potential of the essential oil from V. gardneriana in inhibiting Candida planktonic and biofilm forms. In order to assess the oil antifungal potential, Candida albicans and C. tropicalis planktonic cells and biofilms were treated with different oil concentrations and its action on cell growth, biomass formation and viability of biofilm-entrapped cells was determined. The essential oil was able in reducing significantly C. albicans (71% to 9%) and C. tropicalis (33% to 3%) planktonic growth. Regarding biofilm mass formed in the presence of the oil, all tested concentrations (2.5% to 0.039%) reduced C. albicans and C. tropicalis biomass. The same effect was not seen on the viability of C. albicans biofilm-entrapped cells, since no reduction was achieved. On the other hand, all tested concentrations reduced C. tropicalis viability. Concerning pre-formed biofilms, C. albicans biomass was reduced in most of the concentrations evaluated, whereas C. tropicalis biomass was reduced at concentrations between 2.5% and 0.625%. For both species, the oil was able in reducing the number of viable cells of pre-formed biofilms in all tested concentrations. To the best of our knowledge, this is the first report describing the V. gardneriana essential oil ability in inhibiting C. albicans and C. tropicalis planktonic and biofilm forms. Thus, the study showed that the oil action affected a major virulence factor of Candida, which can direct the new anti-Candida drugs development. / Leveduras do gênero Candida são consideradas as principais causas de infecções fúngicas nosocomiais. Sua capacidade de formar biofilmes é um fator de virulência importante, estando relacionado com as taxas de mortalidade em pacientes com candidemia. Ao colonizar superfícies de cateteres e outros dispositivos médicos, os biofilmes podem causar infecções sistêmicas de difícil tratamento pelos antifúngicos convencionais. Portanto, existe uma grande necessidade da descoberta de novos agentes antifúngicos capazes de prevenir e erradicar biofilmes formados por espécies de Candida. Óleos essenciais são excelentes fontes de compostos bioativos com potencial antifúngico, além de sua comprovada capacidade antibiofilme. Algumas espécies do gênero Vitex têm demonstrado atividade antifúngica contra Candida, contudo não existem relatos sobre a espécie Vitex gardneriana, encontrada no sertão do Nordeste brasileiro. Nesse contexto, o presente trabalho teve como objetivo avaliar o potencial biotecnológico do óleo essencial de V. gardneriana quanto sua ação sobre em as formas planctônicas e biofilmes de espécies de Candida relacionadas a infecções. As leveduras foram submetidas a diferentes concentrações do óleo essencial (2,5% a 0,039%) e sua atividade antifúngica avaliada em relação ao crescimento planctônico, formação de biomassa e número de células viáveis dos biofilmes. Os resultados mostram que o óleo essencial foi capaz de reduzir significativamente o crescimento planctônico de C. albicans (71% a 9%) e de C. tropicalis (33% a 3%). Em relação aos biofilmes formados na presença do óleo essencial, todas as concentrações reduziram a biomassa de C. albicans, enquanto a biomassa de C. tropicalis foi inibida nas concentrações de 2,5% a 0,312%. O número de células viáveis de C. albicans não foi reduzido, porém todas as concentrações do óleo reduziram significativamente as unidades formadoras de colônia de C. tropicalis. Quanto aos biofilmes pré-formados, em C. albicans foi observada redução da biomassa na maioria das concentrações testadas, enquanto a biomassa de C. tropicalis foi reduzida nas concentrações 2,5%, 1,25% e 0,625%. O óleo essencial reduziu o número de células viáveis dos biofilmes pré-formados de ambas as espécies em todas as concentrações testadas. Este é o primeiro relato da propriedade do óleo essencial de V. gardneriana de inibir as formas planctônicas e biofilmes de C. albicans e C. tropicalis. Deste modo, o estudo demonstrou que a ação do óleo afetou especialmente um dos principais fatores de virulência de Candida, podendo direcionar o desenvolvimento de novas drogas anti- Candida.

OLIVEIRA, S.T. Uso do peptídeo sintético Lys-a1 no favorecimento da atividade antimicrobiana de ciprofloxacina contra Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027. 2014. 89 f. Dissertação (MESTRADO EM BIOTECNOLOGIA) - Campus de Sobral, Universidade Federal do Ceará, Sobral, 2014. / Submitted by Djeanne Costa (djeannecosta@gmail.com) on 2017-09-01T13:21:48Z No. of bitstreams: 1 2014_dis_stdoliveira.pdf: 2487485 bytes, checksum: d0cf8dea8b60a03dcd5bf061b1c033af (MD5) / Approved for entry into archive by Djeanne Costa (djeannecosta@gmail.com) on 2017-10-03T14:48:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2014_dis_stdoliveira.pdf: 2487485 bytes, checksum: d0cf8dea8b60a03dcd5bf061b1c033af (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-03T14:48:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2014_dis_stdoliveira.pdf: 2487485 bytes, checksum: d0cf8dea8b60a03dcd5bf061b1c033af (MD5) Previous issue date: 2014 / Most microorganism lies embedded in communities called "biofilms". Among these stand out Pseudomonas aeruginosa, an opportunistic pathogen of plants, animals and humans, frequently associated with nosocomial infections difficult to be eradicated due to the presence of biofilm. The fluoroquinolone antibiotics such as ciprofloxacin (CIP) against this bacterium are used, however, the mechanism of resistance has been developed for this microorganism. Thus, new forms of microbial control have been the subject of numerous studies in order to replace or enhance conventional methods. For this purpose, antimicrobial peptides (AMPs) obtained from various living beings represent an alternative to the development of new drugs. Synthetic forms analogous to Hylin a1 AMP (Hy-a1), isolated from species Hypsiboas albopunctatus, has shown excellent antimicrobial efficacy, among which stand out the peptide Lys-[Trp6]hy-a1 (Lys-a1). Thus, the aim of this work was to verify the influence of the peptide Lys-a1 in antimicrobial activity of CIP against pathogenic microorganism Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027. Minimum inhibitory concentration (MIC), minimum bactericidal concentration (MBC) and the curve death were determined to CIP and Lys-a1 separately. The influence of Lys-a1 in the antimicrobial activity of the CIP has been verified by the checkerboard method to quantify the biomass and the number of viable cells in biofilms by crystal violet staining and counting of colony forming units (CFU), respectively. The MIC and MBC values of Lys-a1 was 125 μg.mL-1 and the CIP was 0.24 and 0.48 μg.mL-1, respectively. The data showed that both the CIP as Lys-a1 are potent antibiotics against P. aeruginosa is able to inhibit both the planktonic growth and biofilm development. The interaction of substances interpreted by the fractional inhibitory concentration index (FICI) and showed an additive effect, establishing a decrease of 16 times the MIC and MBC of the CIP, when combined with the Lys-a1. This effect was also observed in the kinetics of death and antibiofilm activity. In conclusion, the additive effect of the Lys-a1 and CIP in antimicrobial activity suggests that the peptide has potential as a therapeutic agent and an adjuvant for the treatment of infectious diseases caused by P. aeruginosa can enable the use of lower concentrations of the antibiotic. / A maioria dos micro-organismos encontra-se integrados em comunidades denominadas “biofilme”. Dentre estes se destaca a Pseudomonas aeruginosa, um patógeno oportunista de vegetais, animais e humanos, frequentemente associado à infecções nosocomiais difíceis de serem erradicadas devido à presença de biofilme. Os antibióticos fluoroquinolonas, tais como a ciprofloxacina (CIP), são utilizados contra esta bactéria, entretanto, mecanismos de resistência vem sendo desenvolvidos por este micro-organismo. Assim, novas formas de controle microbiano têm sido alvo de inúmeras pesquisas a fim de substituir ou potencializar os métodos convencionais. Para esse fim, peptídeos antimicrobianos (AMPs) obtidos de diversos seres vivos representam uma alternativa para o desenvolvimento de novas drogas. Formas sintéticas análogas ao AMP Hilina a1 (Hy-a1), isolado da espécie Hypsiboas albopunctatus, tem demonstrado excelente eficácia antimicrobiana, dentre os quais se destacam o peptídeo Lys-[Trp6]hy-a1 (Lys-a1). Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi verificar a influência do peptídeo Lys-a1 na atividade antimicrobiana de CIP contra o micro-organismo patogênico Pseudomonas aeruginosa ATCC 9027. A concentração inibitória mínima (CIM), a concentração bactericida mínima (CBM) e a curva de morte foram determinadas para a CIP e a Lys-a1, separadamente. A influência da Lys-a1 na atividade antimicrobiana da CIP foi verificada pela metodologia checkerboard com quantificação da biomassa e do número de células viáveis do biofilme através da coloração pelo cristal violeta e contagem de unidades formadoras de colônia (UFC), respectivamente. Os valores de CIM e CBM da Lys-a1 foi de 125 μg.mL-1, e para a CIP foi de 0,24 e 0,48 μg.mL-1, respectivamente. Os dados mostraram que tanto a CIP quanto a Lys-a1 são potentes antimicrobianos contra P. aeruginosa, sendo capazes de inibir tanto o crescimento planctônico como o desenvolvimento do biofilme. A interação das substâncias foi interpretada pelo índice de concentração inibitória fracional (ICIF) e mostrou um efeito aditivo, estabelecendo uma diminuição de 16 vezes da CIM e da CBM da CIP, quando combinada com a Lys-a1. Esta influência foi observada também na cinética de morte e na atividade antibiofilme. Em conclusão, o efeito aditivo entre a Lys-a1 e a CIP na atividade antimicrobiana sugere que o peptídeo tem potencial como um agente terapêutico e adjuvante para o tratamento de doenças infecciosas causadas por P. aeruginosa, podendo habilitar o uso de concentrações menores do antibiótico.

Este estudo objetivou investigar a distribuição e a relação entre os genes envolvidos com a virulência e formação de biofilme em 196 Enterococcus faecalis isolados de alimentos, clínicos e suabes cloacais de frangos de corte que receberam oocistos de Eimeria maxima e Eimeria acervulina e ração suplementada ou não com anticoccidiano. No primeiro experimento foi investigada a frequência dos genes agg, ace, tet(M), tet(L) e do operon bopABCD; e foi analisada a produção da enzima gelatinase em duas temperaturas de crescimento (36°C e 42°C). Assim como a capacidade de formar biofilme em meio de cultura suplementado com 10% de sangue, 10% de urina ou 0,75% de glicose por 70 Enterococcus faecalis isolados de frangos. Os Enterococcus faecalis isolados de frangos de corte que receberam oocistos de Eimeria maxima e Eimeria acervulina e ração suplementada ou não com anticoccidiano apresentaram capacidade de se adaptar a diferentes nichos biológicos, como por exemplo, sangue e urina. Foi observado um alto percentual dos genes dos fatores de virulência. No segundo experimento, foi avaliada a diversidade filogenética, com base no método de PCR, de 182 cepas isoladas de humanos, frangos de corte e alimentos. Estas cepas formaram quatro grupos filogenéticos (A, B, C e D) e quatro subgrupos (A1, A2, B1 e B2) com índice de similaridade entre 65 a 100%, demonstrando a adaptação de Enterococcus faecalis a diferentes ambientes. No terceiro experimento, foi determinada a capacidade de formação de biofilme de isolados clínicos e alimentares em diferentes meios de cultivo. Observou-se que o meio suplementado com 0,75% de glicose demonstrou ser o mais adequado para estabelecimento de forte aderência e, consequente formação do biofilme microbiano nos isolados de todas as origens. Em contrapartida, o meio suplementado com 10% de sangue foi o que registrou as maiores taxas de fraca formação de biofilme. Os estudos conduzidos demonstram características fenotípicas e genotípicas de Enterococcus faecalis que sugerem uma ampla adaptação ambiental entre os isolados pesquisados. / This study aimed to investigate the distribution and the relationship between genes involved in virulence and biofilm formation in 196 Enterococcus faecalis isolates from food, clinical and cloacal swabs of broilers that received oocysts of Eimeria maxima and Eimeria acervulina and diet supplemented or not with anticoccidial. The first experiment investigated the frequency of agg, ace, tet(M), tet(L) genes and bopABCD operon; production of gelatinase enzyme was analyzed at two growth temperatures (36°C and 42°C). Thus the ability to form biofilm in culture medium supplemented with 10% of blood, 10% of urine and glucose 0.75% for 70 Enterococcus faecalis isolates of chicken. The Enterococcus faecalis isolates from broilers that received oocysts of Eimeria maxima and Eimeria acervulina and supplemented or not with anticoccidial showed the ability to adapt to different biological niches, such as blood and urine. A high percentage of genes of virulence factors were observed. In the second experiment, we evaluated the phylogenetic diversity based on PCR method of 182 strains isolated from humans, broilers and food. These strains formed four phylogenetic groups (A, B, C and D) and four subgroups (A1, A2, B1 and B2) with similarity index between 65 and 100%, demonstrating the adaptation of Enterococcus faecalis to different environments. In the third experiment, the ability of biofilm formation of clinical and food isolates in different culture media was determined. It was observed that the medium supplemented with 0.75% glucose was shown to be more suitable for the establishment of strong adhesion and subsequent formation of the biofilm isolates from all sources. In other hand, medium supplemented with 10% blood was reported that the highest rates of weak biofilm formation. Studies conducted show phenotypic and genotypic characteristics of Enterococcus faecalis that suggest a broad environmental adaptation among the isolates studied.

Made available in DSpace on 2016-08-29T15:34:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_6739_DISSERTAÇÃO Aline Dias Ribeiro.pdf: 1995821 bytes, checksum: 257ebf9537bf0f4881b2a7d2bf130050 (MD5) Previous issue date: 2013-08-09 / INTRODUÇÃO: Infecções de corrente sanguínea por fungos têm se destacado principalmente pelo crescente número de casos de candidemia (infecções por Candida spp neste sítio). Atualmente, este fungo figura como um dos sete patógenos mais comuns em infecções nosocomiais, apresentando taxas de mortalidade bruta entre 40 e 70% e atribuída, de 50%. Formação de biofilme é frequentemente associada a persistente infecção por Candida spp. e dificulta o tratamento devido à elevada resistencia que as células fúngicas adquirem a drogas antifungicas, nestas circunstâncias. OBJETIVOS: Determinar a incidência de candidemias no Hospital Universitário Cassiano Antônio de Moraes (HUCAM), entre 1º de março de 2011 a 30 de dezembro de 2012; determinar as taxas de prevalência das espécies de Candida spp.e testar a potencial atividade das drogas anfotericina B e voriconazol na inibição de formação de biofilme pelas espécies isoladas. MATERIAIS e MÉTODOS: Informações sobre o número total de admissões e de pacientes-dia, na UTI e UTIN do HUCAM foram fornecidos pelo setor de estatística e as 32 cepas de Candida spp., obtidos de sangue, urina e ponta de cateter foram isoladas no laboratório de Análises Clínicas deste hospital. Para as análises de inibição de formação de biofilme foram utilizados os testes estatísticos de Wilcoxon, de Sinais e de Mann-Whitney. RESULTADOS: O setor do HUCAM com maior incidência de candidemia foi a UTIN (8,6/10.000 pacientes-dia e 14,2/1.000 internações). Candida spp foi 5º microrganismo mais isolado das ICS, com predomínio de espécies não-albicans (81%), sendo C. parapsilosis a espécie mais frequente. Na UTIN, a frequência de candidemia por C. albicans foi de 67% e a única espécie não-albicans isolada foi Candida parapsilosis. Na avaliação da inibição de formação de biofilme foi constatado que as concentrações de anfotericina B estatisticamente significantes foram: 128 µg/mL para as epécies C. albicans, C parapsilosis e C tropicalis e 64 µg/mL para as espécies agrupadas em outros. Voriconazol foi capaz de inibir formação de biofilme apenas para isolados da espécie C. albicans e na maior concentração testada (16 µg/mL). CONCLUSÕES: A maior incidência de candidemia no HUCAM foi encontrada para recém-nascidos internados na UTIN. A distribuição das espécies de Candida variou de acordo com setores do hospital, mas sofreu pouca alteração em relação ao período estudado. No geral, anfotericina B foi mais eficaz que voriconazol na inibição de formação de biofilme por espécies de Candida.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-Graduação em Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2012-10-26T09:27:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 308269.pdf: 3335644 bytes, checksum: c3b643175e12fdae0d9404a8196c68ca (MD5) / A presente tese buscou aprofundar a compreensão da interação entre processos longitudinais e ortogonais na definição do comportamento morfodinâmico do perfil praial. A pesquisa foi desenvolvida a partir do exemplo de sistemas praiais de diferente configuração planimétrica do litoral norte de Santa Catarina, Brasil, submetidos à incidência oblíqua de ondas de S/SE e ENE. A metodologia adotada incluiu: a análise de perfis de praia e da granulometria dos sedimentos da face praial; a propagação do regime de ondas; o estabelecimento do balanço de transporte sedimentar longitudinal, apoiado na calibração de equações empíricas com o uso de traçadores fluorescentes; a classificação do perfil praial baseada no parâmetro ômega e a análise de sua capacidade em prever o comportamento morfodinâmico de praias submetidas a um regime misto de ondas e correntes longitudinais. Os resultados obtidos apontaram a presença de dois domínios granulométricos e morfodinâmicos distintos na área de estudo, com o predomínio de areia média e estado morfodinâmico intermediário a reflectivo associado às praias mais expostas e de areia fina e comportamento dissipativo a intermediário nas praias mais protegidas. O modelamento do regime de ondas evidenciou a ocorrência de fluxo hidrodinâmico longitudinal dominante para norte, com intensidade modulada pelo grau de exposição das praias. Os experimentos com traçadores fluorescentes apontaram a equação de Kamphuis-1991 como a mais adequada para o estabelecimento do balanço sedimentar longitudinal na área de estudo. O balanço sedimentar confirmou a ocorrência de deriva litorânea resultante para norte, associada à incidência de ondas de quadrante sul. As taxas de transporte oscilaram entre 200.000 a 550.000m3/ano nas praias expostas e entre 20.000 a 200.000m3/ano nas praias mais protegidas. A pesquisa apontou o impacto da deriva litorânea resultante nos processos morfossedimentares praiais, com o aumento e redução das taxas de transporte entre setores adjacentes definindo, respectivamente, tendência erosiva e deposicional, resultando no incremento da granulometria média dos sedimentos no primeiro caso, e na redução do tamanho médio do grão, no segundo. A declividade da face praial acompanhou largamente a granulometria média e as oscilações no transporte sedimentar, mas os resultados apontaram a influência da interação entre processos ortogonais e longitudinais na determinação do parâmetro ao longo das praias. Nesse sentido, os resultados indicaram maior influência dos processos longitudinais no comportamento morfodinâmico do perfil praial nos setores praiais menos expostos, onde a capacidade previsional do parâmetro ômega foi limitada. Nos setores praiais mais expostos, o comportamento do perfil praial sugere maior interação entre processos ortogonais e longitudinais, com maior adequação do parâmetro ômega em prever o estado morfodinâmico da praia. Os resultados demonstraram a importância do transporte longitudinal para os processos morfossedimentares praiais em diferentes escalas espaço-temporais. A verificação de ajuste entre transporte sedimentar longitudinal e declividade da face praial em outros setores costeiros e em presença de maior espectro de energia permitirá avaliar o alcance da relação identificada no presente estudo, ampliando os horizontes analíticos relativos à configuração dos processos morfodinâmicos praiais e os subsídios científicos à gestão do estoque sedimentar costeiro

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-graduação em Engenharia Ambiental / Made available in DSpace on 2012-10-21T18:55:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1 208245.pdf: 5453155 bytes, checksum: 000a0ef4bd950404e2a77df6166d309f (MD5)

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico. Programa de Pós-graduação em Engenharia Química. / Made available in DSpace on 2012-10-22T01:54:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 212669.pdf: 1833661 bytes, checksum: 70e133626b8e9ea8a2f36eae5af1993f (MD5) / Exopolissacarídeos (EPS) são os principais constituintes de biofilme bacteriano. Esses polímeros, componentes da matriz extracelular bacteriana, têm despertado grande interesse em aplicações industriais e na área médica. Entretanto, têm sido associado com mecanismos de combate bacteriano. A celulose tem sido identificada como um dos EPS da matriz extracelular produzido por várias espécies de bactérias durante a formação de biofilmes. A bactéria Gram-negativa Chromobacterium violaceum, linhagem ATCC 12472, teve seu genoma recentemente seqüenciado pelo Brazilian National Genome Project Consortion. A análise do genoma da C. violaceum mostrou a presença de genes relacionados à biossíntese de celulose, até então desconhecidos. Neste trabalho, analisou-se a estrutura e organização dos genes diretamente envolvidos na biossíntese de celulose, e buscou-se evidências experimentais da presença de celulose na matriz extracelular do biofilme formado por esta bactéria. A metodologia empregada envolveu o uso de ferramentas de bioinformática que exploram informações do seu genoma, como estrutura dos genes, elementos de regulação, domínios e motivos conservados. Ensaios laboratoriais foram utilizados para se obter evidências experimentais das informações genômicas. Estas estratégias permitiram determinar a existência de um operon que compreende cinco genes estruturais codificando as proteínas e enzimas do complexo celulose sintase, como também propor uma via metabólica de biossíntese de celulose a partir de glicose. Identificaram-se ainda 43 ORFs (open reading frames) com domínio GGDEF normalmente associado à atividade de síntese de diguanilmonofosfato cíclico (c-di-GMP) a partir de duas moléculas de guanosina trifosfato (GTP). A molécula c-di-GMP funciona como um componente regulatório de diversas atividades celulares, entre elas a ativação da síntese de celulose. Experimentalmente foi analisado o produto do biofilme formado durante o cultivo de C. violaceum em meio Luria Bertani (LB), culturas estática e agitada. Os resultados obtidos sugerem a presença de celulose como componente do biofilme.