Made available in DSpace on 2015-04-14T13:09:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 348620.pdf: 3321421 bytes, checksum: 7310e788944d70426c89ea68a3c5e468 (MD5) Previous issue date: 2006-03-31 / Foram investigados alguns aspectos da din?mica populacional do marisco branco Mesodesma mactroides Deshayes, 1854, como a abund?ncia, densidades populacional e relativa, freq??ncias de ocorr?ncia total e relativa, distribui??o espacial, distribui??o vertical, per?odo de recrutamento e biometria, al?m da estrutura e associa??o interespec?fica da comunidade infaunal em praias arenosas do litoral do Rio Grande do Sul. As coletas foram realizadas entre agosto (2004) e setembro (2005), a partir da praia de Pinhal (S30?15 35 W50?14 01,9 ) em dire??o ao sul do Estado, em seis transectos eq?idistantes 15 km. O primeiro transecto foi determinado mediante sorteio entre dez pontos eq?idistantes um quilometro (cinco para o norte e cinco para o sul), a partir de um local permanente e pr?-determinado, a fim de garantir a aleatoriedade na coleta dos dados. Em cada transecto procedeu-se o c?lculo de 30 ondas consecutivas para avaliar o seu ponto m?dio de amplitude (P0). A partir de P0 foram assinalados dois pontos em dire??o ao infralitoral (P-1 e P-2) e tr?s em dire??o ao supralitoral (P1, P2 e P3), distantes um desvio padr?o da m?dia de amplitude das ondas (P0). Enterrou-se um cilindro de 30 cm x 50 cm at? 40 cm de profundidade em cada ponto e tamisou-se o material em malha de 0,25 cm. Foram coletados 13104 esp?cimens, sendo que M. mactroides foi ? quarta esp?cie mais abundante, respons?vel por cerca de 9% da macroinfauna da comunidade com 1179 esp?cimes coletados. A densidade anual foi de 42,53 ind/m2, com m?xima de 77 ind/m2 (mar?o) e m?nima de 5,55 ind./m2 (julho). No que diz respeito ? influ?ncia da urbaniza??o sobre a popula??o de M. mactroides, observou-se que esta influi sobre os esp?cimes considerados adultos (acima de 43 mm de comprimento). Isso, provavelmente, decorre do processo de explora??o destinado ao consumo e ao abastecimento das in?meras iscarias existentes na regi?o. Os indiv?duos jovens (entre 10 e 43 mm) aparecem em maior propor??o nas ?reas urbanizadas, devido, provavelmente, ? aus?ncia de seu maior predador em potencial que ? muito abundante nas ?reas n?o urbanas, a ave Haematopus palliatus Temminck, 1820. M. mactroides foi ? segunda esp?cie mais capturada, sendo encontrada em cerca de 22% das unidades amostrais (87 pontos) em que ocorreu a presen?a de macroinfauna. O padr?o de distribui??o espacial encontrado para o marisco branco e para os demais organismos da comunidade foi o agregado. O padr?o de zona??o e da estrutura da comunidade encontrada foi similar ?queles observados em outras praias arenosas expostas, diferenciando-se na diversidade de esp?cies capturadas. Na distribui??o vertical a popula??o apresentou segrega??o por tamanho entre os indiv?duos recrutas (menores de 10 mm) e os adultos, com os recrutas ocupando as zonas acima do ponto m?dio da zona de varrido e os adultos deste ponto em dire??o ao mar. Constatou-se um leve movimento de migra??o vertical em dire??o aos pontos P-2 e P-1 durante o inverno e a primavera, principalmente por parte de indiv?duos jovens e adultos, fen?meno possivelmente associado ao per?odo de recrutamento da esp?cie, uma vez que os picos de recrutamento ocorreram no final do inverno (agosto) e no in?cio da primavera (setembro), tendo in?cio em julho e t?rmino em fevereiro. Nas rela??es biom?tricas entre o comprimento e a largura da concha, e destas com as mensura??es em peso (peso total, peso ?mido e seco das partes moles, peso da concha e diferen?a entre peso ?mido e seco), foi constatada uma congru?ncia entre as m?dias das classes de comprimento em que ocorre a altera??o na taxa de crescimento (~45,47 mm), relacionado, possivelmente, com os processos de matura??o das g?nadas, ou seja, na transi??o dos esp?cimes de jovens para adultos.

Neste estudo, 26 amostras de ostras (Crassostrea gigas) comercializadas na cidade de São Paulo e em alguns pontos do litoral de São Paulo, e 36 amostras de mexilhões (Perna perna) colhidas mensalmente em 3 pontos do litoral de Ubatuba - SP, foram submetidas à pesquisa de vibrios potencialmente patogênicos. As amostras desses moluscos eram submetidas a enriquecimento em água peptonada alcalina sem cloreto de sódio e com 1 por cento de cloreto de sódio, e GSTB. O isolamento foi realizado em ágar TCBS. Colônias sacarose positivas e negativas, sugestivas de espécies de Vibrio foram identificadas presuntivamente em meio de ágar ferro de Kligler, sendo confirmadas através de provas bioqufmicas complementares. Uma parte das amostras de vibrios potencialmente patogênicos isoladas foi submetida ao teste de Dean e teste de alça ligada em íleo de coelhos. Os vibrios potencialmente patogênicos encontrados em amostras de ostras foram V. alginolyticus (81 por cento ), V.parahaemolyticus (77 por cento ), V. cholerae não 0:1 (31 por cento ), V. fluvialis (27 por cento ), V. furnissii (19 por cento ), V. mimicus (12 por cento ) e V. vulnificus (12 por cento ) e em amostras de mexilhões foram V. alginolyticus(97 por cento ), V. parahaemolyticus(75 por cento ), V. fluvialis (47 por cento ), V. vulnificus (11 por cento ), V. cholerae não 0:1 (6 por cento ), V. furnissii (6 por cento ) e V. mimicus (6 por cento ). Observou-se acúmulo de fluido em alça ligada de íleo de coelho entre 0,25 e 0,49 ml/cm em 6,9 por cento das amostras, entre 0,5 e 0,99 ml/cm em 15,6 por cento e maior ou igual a 1 ml/cm em 15,1 por cento , e/ou intestino de camundongos lactentes (Teste de Dean) em 26,6 por cento das amostras testadas, confirmando o elevado potencial desses microrganismos em causar gastrenterite. Verificou-se ausência de variação sazonal e também, de correlação entre os vibrios potencialmente patogênicos isolados e os indicadores de contaminação fecal, confirmando que a presença desses microrganismos ocorre de forma autóctone e que, as condições climáticas foram favoráveis à sobrevivência dessas espécies em todas as épocas do ano. Considerando-se os resultados obtidos no presente estudo e o fato de que ostras e mexilhões são habitualmente ingeridos crus ou insuficientemente cozidos, pode-se concluir que sua ingestão constitui-se em um determinado grau de risco para a saúde do consumidor. / In this work, 26 oysters samples (Crassostrea gigas), found in the market of São Paulo city and some coastal areas of São Paulo State, and 36 mussels samples (Perna perna), that were collected monthly in 3 coastal areas of Ubatuba city - SP., were analyzed for the potential patogenic vibrios occurrence. Samples were enriched in alcalin peptone water with (1 per cent ) and without sodium cloride and GSTB. Isolation was performed on TCBS agar. suspect sacharosis positive and negative colonies, resembling vibrio species, were presumptively identified on Kligler iron agar, and confirmed by complementary biochemical tests. Some of this potential patogenic vibrios were submitted to suckling mouse assay and rabbit ileal loop assay. Potential patogenic vibrios isolated from oyster samples were: V. alginolyticus (81 per cent ), V. parahaemolyticus (77 per cent ), V. cholerae non 0:1 (31 per cent ), V. fluvialis (27 per cent ) I V. furnissii (19 per cent ), V. mimicus (12 per cent ) and V. vulnificus (12 per cent ) and from mussels samples were: V. a.1ginolyticus (97 per cent ), V. parabaemolyticus (75 per cent ), V. fluvialis (47 per cent ), V. vulnificus (11 per cent ), V. cholerae non 0:1 (6 per cent ), V. furnissii (6 per cent ) and V. mimicus (6 per cent ). It was found 6,9 per cent of samples between 0,25 and 0,49 ml/cm of fluid accumulation in ileal loop assay, 15,6 per cent between 0,5 and 0,99 ml/cm and 15,1 per cent was equal or higher than 1 ml/cm. Among the samples assayed for suckling mouse 26,6 per cent were positive. These results confirm the high potential of these microrganisms to induce gastroenteritis. Seasonal variation as well as correlation between the potential patogenic vibrios isolated and the fecal contamination indicators were not found, confirming that the presence of such microrganisms occurs autochthonously and that the climate conditions were favourable to these species survival during the whole year. with the results of this work and considering that oyster and mussels are usually ingested raw or insufficiently cooked, the conclusion is that the ingestion of such mollusks presents a certain degree of risk for the consumer\'s health.

The focus of this study was to determine the effect of clam presence and behavior on the crossflow of the ambient horizontal flow and the effect of ambient horizontal flow characteristics influence the clam feeding behavior. Hence, there is a reciprocal relationship between organisms and the physical environment, and this study ultimately addressed the role of hydrodynamics in the predator-prey relationship between bivalve clams, Mercenaria mercenaria, and their predators, blue crabs and whelks. The study concludes that clams alter the chemical odorant source characteristics and control the transmission of the chemical signal through altering the crossflow. The first part of the study is a field experiment designed to quantify the effect of the presence and behavior of clams on the crossflow of the horizontal crossflow. The second part of this study is a two-part laboratory experiment designed to isolate the influence of environmental factors on clam behavior. One experiment quantifies the unsteadiness of the clam excurrent jet velocity time record according to environmental cues such as the horizontal crossflow velocity, the density of the clam patch, and the size of the clam. The second laboratory experiment quantifies the unsteadiness of the jet velocity values according to the presence of predator cues in the upstream flow. Clams are found, using an ADV system in the field, to alter the vertical distribution of velocity according to the sediment in which they are buried. Also, turbulence characteristics, such as Turbulent Kinetic Energy and Reynolds shear stress, are altered in the presence of clams according to the ambient horizontal crossflow velocity and treatment site. The laboratory flume PIV system captured vector plots for two-dimensional planes that bisect the clam excurrent siphons and clam jet velocity time records were extracted. A fractal analysis and a lacunarity analysis of the jet velocity time records found that clams alter their jet excurrent velocity unsteadiness according to the horizontal crossflow velocity. This behavioral change may contribute to the differences in the turbulence characteristics in the field experiment. Another result from the laboratory experiments is that the effect of clam patch density on the feeding activity was dependent on the size of the organism. This size/density dependent relationship suggests that predation by blue crabs dominates the system since larger clams are no longer susceptible to blue crab predation, whereas clams of all sizes are susceptible to whelk predation. Finally, clams increase the randomness of their excurrent jet velocity values when predator cues are located in the upstream flume flow. This suggests that the presence of predators elicits clam behavior that promotes the mixing and dilution of their chemical metabolites.

The Kremmling Paleontological Resource Area (KPRA) contains one of the most fossiliferous units within the Late Cretaceous Western Interior Seaway of North America. It was deposited during the late Campanian Baculites compressus/cuneatus ammonite biozones ((\approx) 72.5 Ma) and records slightly less than one million years of depositional history. Examination of the fauna, its dominant preservational mode and taphonomy as well as the lithologic evidence from measured stratigraphic sections strongly suggests that the depositional environment of the KPRA was a shallow, relatively nearshore environment. A detailed taxonomic examination of the molluscan fauna was undertaken in order to re-evaluate past work as well as to more thoroughly document the fauna. Samples were collected from 79 locations within the (\approx) 1 km² study area. The molluscan fauna from the KPRA consists of 47 bivalve, 22 gastropod, and 13 cephalopod species; ten of these species are new. In addition, two inarticulate brachiopods and one serpulid are described. This highly diverse assemblage points to an increase in nearshore diversity as compared to faunas described from earlier intervals with similar environmental settings. The timing of this increase in species richness remains elusive, but may have initiated in the late Campanian and continued into the early Maastrichtian.

No description available.

No description available.

No description available.

Thesis (M.S.)--University of North Carolina at Wilmington, 2006. / Includes bibliographical references (leaves: 53-59)

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia, Florianópolis, 2010 / Made available in DSpace on 2012-10-25T08:15:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 286371.pdf: 1947104 bytes, checksum: 68df212a986afad58f62e633e601bcc8 (MD5) / Patógenos virais humanos têm sido associados a muitos episódios de gastrenterites, bem como a doenças relacionadas ao consumo de moluscos contaminados. O risco pode ser reduzido por um tratamento destes moluscos visando sua auto-limpeza previamente a sua comercialização. A depuração de moluscos reduz os níveis de microrganismos presentes na carne, diminuindo a chance de uma potencial infecção associada ao seu consumo in natura. Em um sistema de depuração, a água do mar pode ser recirculada pelo menos por 24 horas e, durante este ciclo, a água é tratada química ou fisicamente para eliminar a contaminação por microrganismos. Neste trabalho, um sistema fechado de depuração de moluscos foi testado para eliminar os patógenos virais em ostras. Além disso, a capacidade do cloro livre em inativar esses vírus, bem como a estabilidade viral em água do mar, com e sem radiação U.V. foram investigadas. Para os ensaios de depuração, ostras (Crassostrea gigas) foram artificialmente contaminadas em aquários, contendo água do mar semeada com Vírus da Hepatite A (HAV) e Adenovírus Humano (HAdV5). Em seguida, as ostras foram colocadas no tanque de depuração, e foram analisadas após 48h, 72h e 96h. Em cada amostragem, o trato gastrointestinal das ostras foi homogeneizado e processado visando a eluição das partículas virais. Para os estudos de desinfecção pelo uso do cloro, água do mar natural e artificial foram semeadas com Norovírus Murino 1 (MNV-1), HAdV2 e Poliomavírus JC (JCPyV) e tratadas com uma concentração inicial de cloro livre de 2,5 mg/l, por 60min. Para os ensaios de estabilidade viral em água do mar e desinfecção viral por luz U.V., 300L de água do mar foram semeadas com o HAV, MNV-1 e HAdV2 e tratados com U.V. (36W), em um mini-tanque de depuração, com recirculação por 120h. Um litro de água do mar foi coletado a cada 24h em até 120h e as amostras de água foram tratadas pelo método de floculação com leite acidificado para adsorção e concentração das partículas virais. O monitoramento viral nos tecidos das ostras e água do mar foi avaliado por métodos moleculares (PCR e q(RT)-PCR), e por métodos de cultura celular associados a métodos moleculares ou imunológicos (ICC-PCR, RT-PCR ICC, IFA, Citometria de Fluxo e Ensaio de Placas de Lise). A detecção por PCR, em amostras de ostras, mostrou que o genoma de HAdV5 foi detectado em todos os períodos de amostragem, e o genoma do HAV foi detectado até 72 h. Os testes envolvendo viabilidade viral por ICC-PCR, demonstraram uma inativação viral progressiva, nas ostras, ao longo das 96h de recirculação de água do mar tratada com luz U.V. Nos ensaios de desinfecção por cloro, após 30 minutos de tratamento de água do mar, foi observada uma redução de ~2log10 e ~3log10 para MNV-1 e HAdV2, respectivamente, com base nos resultados q(RT) PCR. Quando a infecciosidade viral foi analisada, uma redução de mais de 4log10 foi observada para MNV-1, enquanto HAdV2 apresentou uma redução de ~ 2.3log10, mantendo-se infeccioso após 60 minutos. JCPyV apresentou em média uma redução de 1,6 log10, quando avaliado por qPCR. Não houve diferenças na cinética de desinfecção viral observadas em água do mar natural e artificial. Para os ensaios de estabilidade viral em água do mar tratada ou não com luz U.V., com base nos resultados q(RT)-PCR, foram observadas cinéticas diferentes para cada vírus em 120 horas de contato. Reduções de ~ 5log10 e 3log10, em 120h, para HAdV2 e HAV, respectivamente; para MNV-1, foi observada uma redução de ~4,5 log10 em 72h sob tratamento com luz U.V. Apesar da detecção do genoma, HAdV2 foi capaz de permanecer infeccioso até 72h, de acordo com resultados de ICC-RT-PCR. Ensaios envolvendo estabilidade viral sem radiação U.V. demonstraram uma redução progressiva da carga viral ao longo das 120h de recirculação de água do mar para os três vírus (~ 2log10 para HAdV2; ~ 2,5 log10 para HAV e ~ 3log10 para MNV-1). Esta cinética diferente provavelmente está associada às espécies de cloro presentes, ao tempo de contato com a radiação U.V. e a características estruturais peculiares de cada um dos vírus. A diminuição natural da carga viral pode ser devido à existência de fatores ambientais, tais como força iônica e compostos encontrados naturalmente na água do mar. Este trabalho confirmou que HAdV é um patógeno viral particularmente resistente e exige mais tempo para inativação. Estes dados serão úteis para a otimização de desinfecção da água nos tanques de depuração de moluscos. / Viruses have been linked to nearly all episodes of gastroenteritis as well as outbreaks of illnesses related to consumption of contaminated shellfish. The risk may be reduced by appropriate treatment following harvesting as well as by depuration, which is a method that reduces the levels of microorganisms present in mollusk meat, decreasing the potential for infections associated with mollusk consumption in natura. In a depuration system, seawater may be recirculated for at least 24h, and during this cycle, the water must be chemically or physically treated to eliminate microbial contamination. In this work, a shellfish depuration closed system was tested to eliminate viral pathogens from oysters. Moreover, the chlorine capability to inactivate these viruses, as well as the viral stability and disinfection in seawater with and without U.V. irradiation were investigated. For depuration assays, oysters (Crassostrea gigas) were first artificially contaminated in aquariums containing seawater seeded with Hepatitis A virus (HAV) and Human Adenovirus (HAdV5). Then, the oysters were placed into the depuration tank, and were harvested after 48h, 72h and 96h. After each sampling, the gastrointestinal tracts were homogenized and the viral particles were eluted. To chorine disinfection assays, natural and artificial seawater were seeded with selected viruses (Murine Norovirus 1, MNV-1; HAdV2; JC Polyomavirus, JCPyV) and treated by adding initial free chlorine concentration of 2.5mg/l for up to 60min. For the stability assays, 300L of natural seawater were seeded with HAV, MNV-1 and HAdV2, and treated by 36W U.V. lamp, into the mini depuration tank, with recirculation, for up to 120h. One liter of viral seeded seawater was harvested every 24h and viral particles were concentrated by flocculation method using skimmed milk. The kinetics of viral decay in oysters and seawater was evaluated by molecular techniques (PCR and q(RT)-PCR), and by cell culture associated with molecular and immunological methods to access the viral infectivity (ICC-PCR, ICC RT-PCR, IFA, Flow Cytometry and Plaque Assay). The molecular detection by PCR for both viruses showed that the presence of HAdV5 genome was positive in all of the sampling periods, and the HAV genome was detected until 72 h. The tests involving viral viability by ICC-PCR, demonstrated a progressive viral inactivation along the 96h of seawater recirculation under U.V. light irradiation. After 30 minutes of treatment of natural seawater a ~2log10 and ~3log10 reduction where observed for MNV-1 and HAdV2, respectively, based on q(RT)PCR results. When viral infectivity was analyzed, a reduction of more than 4log10 was observed for infectious MNV-1, while HAdV2 presented ~2.3log10 reduction, remaining infective viruses present after 60 minutes. JCPyV presented a average reduction of 1,6 log10, analysed by qPCR. No differences in the disinfection kinetics have been observed between natural and artificial seawater. Based on qPCR results, the kinetics observed were different for each virus, reaching, at 120h of contact time, ~5log10 and ~3log10 reduction for HAdV2 and HAV, respectively; for MNV-1, was observed a ~4,5log10 reduction at 72h under U.V. treatment. Despite the genome detection, HAdV2 was able to remain infectious only up to 72h, according ICC-RT-PCR results. Assays involving viral stability without U.V. irradiation, demonstrated a progressive reduction of viral load along the 120h of seawater recirculation for three viruses (~2log10 for HAdV2; ~2,5log10 for HAV and ~3log10 for MNV). This different kinetics is probably associated to the chlorine species present, the contact time with the U.V. radiation and structural characteristic of each virus. The natural decreasing of viral load can be due to the existence of environmental factors, such as ionic strength and compounds naturally found in seawater. This work confirmed that HAdV is a particularly a resistant viral pathogen and requires longer periods for inactivation. These data will be subsequently useful to plan water disinfection in shellfish depuration tanks.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro Tecnológico, Programa de Pós-graduação em Engenharia de Produção, Florianópolis, 2014 / Made available in DSpace on 2015-02-05T21:17:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 328635.pdf: 2327361 bytes, checksum: 8a94c2894e4a7f2ba7e1be5c2b1af1b8 (MD5) Previous issue date: 2014 / Santa Catarina posiciona-se atualmente como o segundo maior polo produtor de moluscos bivalves da América Latina. Além disso, o estado é responsável por 95% da produção nacional de moluscos bivalves. Dada a crescente importância conquistada pelo setor, este trabalho tem o objetivo de realizar uma analise comparativa entre os resultados do Programa Nacional de Controle Higiênico-Sanitário de Moluscos Bivalves - PNCMB em Santa Catarina e os padrões internacionais de comercialização de moluscos bivalves, mais precisamente na atividade da ostreicultura. Para tanto, foram analisados artigos publicados em revistas conceituadas, manuais, documentos técnicos e os requerimentos legais previstos tanto na legislação nacional quanto internacional de comercialização de moluscos bivalves. Nesta análise destaca-se o PNCMB, criado em 2012 em âmbito federal e gerido a nível estadual pela CIDASC (Companhia Integrada de Desenvolvimento Agrário de Santa Catarina). Através da utilização de 15 meses de dados, fornecidos pela CIDASC, relativos aos parâmetros ambientais das águas de cultivo do estado, pôde-se analisar o status da atividade frente aos embargos comerciais ainda existentes para o seu desenvolvimento. Os achados da pesquisa apontam as localidades mais aptas para o desenvolvimento da atividade em Santa Catarina e suas potencialidades e necessidades em relação às exigências necessárias para efetivar-se o comércio internacional de produtos derivados do cultivo de moluscos bivalves. Com esta análise conclui-se que as áreas produtivas de Santa Catarina estão aptas ao comercio internacional de moluscos bivalves quando se consideram os parâmetros ambientais necessários para tal e a legislação internacional vigente para a atividade.<br> / Abstract: Santa Catarina currently ranks as the second largest production hub of bivalve molluscs in Latin America. In addition, the state is responsible for 95% of the national production of bivalve molluscs. Given the increasing importance gained by industry, this paper aims to conduct a comparative analysis between the results of the National Hygiene - Sanitary Control of Shellfish Bivalve - PNCMB in Santa Catarina and international marketing patterns of bivalve molluscs, more precisely in the oyster farming activity. For this purpose, were analyzed articles published in reputable journals, manuals, technical documents and Legal requirements set out in both, the national and international legislation of bivalve molluscs. This analysis highlights the PNCMB, created in 2012 at the federal level and administered at the state level by CIDASC (Companhia Integrada de Desenvolvimento Agrário de Santa Catarina). By using 15 months of data, provided by CIDASC, regarding the environmental parameters of the cultivation's waters of the state, could be assess the current status of the activity and their development trade embargoes. The research findings suggest the most suitable locations for the development of activity in Santa Catarina and its potential and needs regarding the requirements necessary to carry up international trade in products derived from the cultivation of bivalve molluscs. This analysis led to conclude that the productive areas of Santa Catarina are suitable for the international trade of bivalve molluscs when considering the environmental parameters required for such activity and the international law that set up this market.