Resumo: O búfalo de rio (Bubalus bubalis) é uma espécie de interesse econômico pertencente à família Bovidae, utilizado para a produção de carne e leite, além de força de trabalho no campo, constituindo-se em um animal de tripla aptidão. Recentemente, a construção de um painel de células somáticas híbridas irradiadas (linhagens celulares) contendo fragmentos do genoma do búfalo de rio, incorporado ao genoma de hamster (BBURH5000), está permitindo, pela primeira vez, o mapeamento de todos os cromossomos bubalinos. A utilização desse painel de células associado a análises estatísticas, está gerando mapas genômicos de alta resolução contendo diferentes tipos de marcadores moleculares. O presente trabalho teve por objetivo utilizar este painel de células para gerar grupos de ligação com os marcadores mapeados no cromossomo 9 bubalino e assim comparar a organização dos grupos de ligação obtidos com aqueles já descritos para o cromossomo 7 bovino. Para tal, foram testados com DNA bubalino, seqüências de "primers" para PCR de 26 marcadores moleculares previamente mapeados no cromossomo 7 bovino, o qual foi descrito na literatura como o homólogo ao cromossomo 9 de búfalo. Do total de marcadores testados, 18 geraram produtos de PCR adequados ao mapeamento utilizando o painel BBURH5000, sendo que destes 18, foi possível a genotipagem final de 10 marcadores. A partir das análises de ligação com os 10 marcadores genotipados, foi possível distribuir os mesmos em três grupos de ligação no BBU9. A análise comparativa entre os grupos de ligação do BBU9 e do BTA7 revelou a presença dos mesmos grupos de ligação nos cromossomos de ambas espécies, evidenciando conservação de sintenia. / Abstract: The river buffalo (Bubalus bubalis), a member of the Bovidae family, is an economically important livestock specie useful to produce milk and meat, as well as source of labor, comprising an animal of triple aptness. The recent construction of a whole-genome 5000-rad radiation hybrid somatic cell panel for the river buffalo genome (BBURH5000), is allowing for the first time the mapping of all chromosomes from the specie. The use of BBURH5000 panel associated with statistical analyses is generating high-resolution RH maps integrating different types of molecular markers. The goal of this study was to genarate linkage groups with the markers mapped on the river buffalo chromosome 9 (BBU9), using the BBURH5000 panel, and then compare these groups with those already described in BTA7. Previous studies have identified bovine chromosome 7 as homologous to BBU9. Cattle derived PCR primers from 26 markers, previously mapped in cattle, were tested with buffalo DNA. A total of 18 of the 26 markers amplified PCR products suitable for RH mapping. From these 18 markers, it was possible the genotyping of 10. The analyses of linkage with the 10 markers genotyped turned possible to distribute them in three linkage groups on the BBU9. The comparative analyses between the linkage groups of BBU9 and BTA7 revealed the presence of the same linkage groups on the chromosome of both species, revealing conservation of synteny between them. / Orientadora: Maria Elisabete Jorge Amaral / Coorientadora: Vera Fernanda Martins H. de Lima / Banca: Humberto Tonhati / Banca: Simone Cristina Méo Niciura / Mestre

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-05T11:28:03Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CaracteristicasFenotipicasManejo.PDF: 925848 bytes, checksum: 035025f01eb69e98818666c2becad1cb (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-09T18:43:21Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CaracteristicasFenotipicasManejo.PDF: 925848 bytes, checksum: 035025f01eb69e98818666c2becad1cb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-09T18:43:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_CaracteristicasFenotipicasManejo.PDF: 925848 bytes, checksum: 035025f01eb69e98818666c2becad1cb (MD5) Previous issue date: 2015-08-10 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O búfalo é um animal que pode competir com produtos diferenciados nos mercados interno e mundial, que apresenta características próprias e grande rendimento quando da transformação em subprodutos e derivados. Não obstante a isso, o agronegócio do búfalo se ressente de animais melhoradores provados e/ou testados para atender uma demanda que é vital por melhor padrão genético. O presente estudo teve o objetivo de avaliar características fenotípicas da produção de leite e da eficiência reprodutiva de búfalos e efetuar análises genéticas, determinando parâmetros e índices genéticos, visando a seleção de búfalos, para a elaboração de um ranking de reprodutores geneticamente superiores, incrementando a cadeia produtiva dos búfalos do País. Foram utilizados 2.459 registros fenotípicos de búfalos das raças Murrah, Mediterrâneo e meio-sangue, do rebanho da EMBRAPA – CPATU, do período de 1953 a 2013. As características avaliadas foram: produção total de leite (PTL), percentual de gordura (G), idade ao primeiro parto (IPP), intervalo de partos (IDP) e período de serviço (PS). A análise descritiva se iniciou com a editoração dos dados trabalhados nos ambientes da planilha Excel e no pacote SAS. Os resultados gerais foram: PTL = 1741,00 ± 496,48 kg, G = 7,07 ± 0,86 %, IPP= 49,39 ± 7,37 meses, IDP = 13,16 ± 0,79 meses e PS = 91,52 ± 24,22 dias. Os efeitos que mais influenciaram a PTL foram a Ordem de Parto e o Grau de Sangue da fêmea, para G foi Grau de Sangue da fêmea, para IPP foi Estação de Parto e Ordem de Parto e para IDP e PS foram Estação de Parto e o Sexo do bezerro. A correlação fenotípica entre PTL e G foi 0,034, entre PTL e IPP 0,118, entre PTL e IDP 0,070, entre PTL e PS 0,070, entre G e IPP -0,113, entre G e IDP -0,025, entre G e PS -0,025, entre IPP e IDP 0,445, entre IPP e PS 0,445 e entre IDP e PS 1,00. Os dados foram trabalhados na planilha Excel e no pacote SAS e as análises genéticas foram efetuadas pelo software WOMBAT. Na estimação de parâmetros genéticos foi utilizado o modelo animal com análise de bicaracterísticas. A PTL foi regredida em função da duração de lactação e o coeficiente de regressão foi utilizado para correção das lactações em 305 dias (PL305). Os efeitos fixos foram grupo de contemporâneos e efeito linear e quadrático da idade da fêmea ao parto, como (co)variável. Para IPP e PS o modelo foi igual ao anteriormente descrito com a exclusão do termo do efeito de ambiente permanente materno. As estimativas de herdabilidade para a raça Murrah foram: 0,49 para PTL; 0,59 para G; 0,75 para IPP; 0,006 para IDP e 0,06 para PS; para a raça Mediterrâneo foram: 0,31 para PTL; 0,08 para G; 0,78 para IPP; 0,90 para IDP e 0,90 para PS. As correlações genéticas entre PTL e as demais características na raça Murrah foram 0,065 PTL e G; 0,097 PTL e IPP, -0,450 PTL e IDP e 0,079 PTL e PS, para Mediterrâneo foram: -0,267 PTL e G; 0,629 PTL e IPP, 0,559 PTL e IDP e 0,624 PTL e PS. O ranking de touros/reprodutores foi elaborado com base nas predições da Provável Habilidade de Transmissão (PTA’s), utilizando-se o pacote SAS, o que permite a edição de um catálogo de touros da espécie bubalina da Embrapa Amazônia Oriental, no referido período. Com base nos resultados a variabilidade do rebanho estudado é passível de ser trabalhada com o manejo genético, tanto para as características produtivas quanto para as de eficiência reprodutiva. / The buffalo is an animal that can compete with differentiated products on internal and world markets, which presents own features and great performance when processing by-products and derivatives. Despite this, buffalo agribusiness resents of enhancers animals proved and / or tested to meet a demand that is vital for better genetic pattern. This study aimed to evaluate phenotypic characteristics of production milk and reproduction efficient of buffalo and perform genetic analyzes determining parameters and genetic index aimed at selection of buffalo to prepare a ranking of genetically superior breeding, increasing production chain of buffaloes in the Amazon region. We used 2,459 phenotypic records of Murrah, Mediterranean and half-blood buffaloes of EMBRAPA - CPATU herd from period between 1953 to 2013. The characteristics evaluated were: total milk production (TMP), fat percentage (F), age at first calving (AFC), calving interval (CI) and service period (SP). The descriptive analysis began with the editing of the data worked in the environments of Excel spreadsheet and SAS package. The overall results were: TMP = 1741.00 ± 496.48 kg, F = 7.07 ± 0.86%, AFC = 49.39 ± 7.37 months, CI = 13.16 ± 0.79 months and SP = 91.52 ± 24,22 days. In the analysis of variance for TMP the most significant effects were the birth order and the degree of blood from female, and to F was degree of female blood and AFC was calving season and birth order and CI and SP were station childbirth and the calf sex. The phenotypic correlations between TMP and F was 0.034, between TMP and AFC 0.118, between TMP and CI 0.070, between TMP and SP 0.070, between F and AFC -0.113, between F and CI -0.025, -0.025 between F and SP, among AFC and CI 0.445, 0.445 between AFC and SP and between CI and SP 1.00. Genetic analysis began with the editing of the data discussed in the environments of Excel spreadsheet and the SAS package and genetic analyzes were performed by WOMBAT software. For estimation of genetic parameters we used the animal model with two-trait analysis. The TMP was regressed depending on length of lactation and the regression coefficient was used for correction of lactation in 305 days (PL305). Fixed effects were contemporary group and linear and quadratic effects of birth female age as (co) variable. AFC and SP model was the same as described above with the exclusion of the term of the maternal permanent environmental effect. The heritability estimates for Murrah were: 0.49 for TMP; 0.59 for F; 0.75 for AFC; 0.006 for CI and 0.06 for SP; for the Mediterranean race were 0.31 for TMP; 0.08 for F; 0.78 for AFC; 0.90 for CI and 0.90 for SP. Genetic correlations between TMP and other features in the Murrah were 0.065 TMP and F; TMP and AFC 0.097, -0.450 TMP and CI and 0.079 TMP and SP for the Mediterranean were: -0.267 TMP and F; 0,629 TMP and AFC; 0.559 TMP and CI and 0.624 CI TMP and SP. The ranking of bulls / breeding was based on predictions of probable transmission ability (PTA's), using the SAS package which allows editing a bulls catalog of buffalo species of EMBRAPA Amazônia Oriental in that period. Based on the results the variability of the studied herd is likely to be crafted with the genetic management for both production characteristics as to the reproductive efficiency.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-05T15:09:31Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_AvaliacaoDinamicaFolicular.PDF: 2257871 bytes, checksum: 14aa0bbe8a3ce8ac4cd508db526dedd1 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-10T12:29:12Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_AvaliacaoDinamicaFolicular.PDF: 2257871 bytes, checksum: 14aa0bbe8a3ce8ac4cd508db526dedd1 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-10T12:29:12Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Tese_AvaliacaoDinamicaFolicular.PDF: 2257871 bytes, checksum: 14aa0bbe8a3ce8ac4cd508db526dedd1 (MD5) Previous issue date: 2015-08-11 / Neste experimento objetivou-se monitorar a dinâmica folicular e atividade ovariana de fêmeas bubalinas no puerpério através de exames ultrassonograficos, investigando-se alguns eventos relacionados a atividades ovariana no Período Pós-Parto (PPP), e a involução uterina, desde o 7º dia de paridas, até o segundo cio pós-parto. Foram utilizadas dez (10) fêmeas mestiças entre as raças Murrah e Mediterrânea com parições eutócicas e sem histórico de problemas reprodutivos, manejados em regime semi extensivo, com disponibilidade de água e suplementação mineral ad libitum. Constatou-se a presença de padrões de crescimento folicular de duas ondas (2OCF) e de três ondas (3OCF), na proporção de 40% e 60%, respectivamente. O 1º e 2º cios pós parto se manifestaram aos 37,00+13,12 e 58,83+14,56 dias pós parto para os animais de 2OCF e aos 45,00+15,19 e 66,00+23,02 dias pós parto para os animais de 3OCF. Os intervalos estrais foram de 21,00+2,44 e 21.83+2,56 dias para os animais de 2OCF e 3OCF, respectivamente. A emergência folicular, ocorreu em média aos 1,02+0,34 e 7,25+0,50 dias do ciclo para a primeira e segunda onda, respectivamente, dos animais do 2OCF e aos 0,93+0,35; 6,6+1,36 e 10,83+1,94 dias do ciclo para a primeira, segunda e terceira onda, respectivamente, para os animais de 3OCF. O diâmetro folicular pré ovulatório foi de 13,08+2,6 e 11,45+0,35 mm para o 1º e 2º cios pós parto dos animais de 2OCF e 13,24+2,41 e 12,74+1,10 mm para o 1º e 2º cios pós parto dos animais de 3OCF. A involução uterina ocorreu em média aos 29,00+1,48 dias, P<0,05, com diâmetro do corno uterino pós gravídico (CUPG) em torno de 18,84+0,33 mm. A taxa da involução uterina foi de 0,97+0,21, (P<0,05). Observou-se alta correlação entre o PPP e CUPG, representada por r=-0,8179 (P<0,0001), sendo possível estabelecer uma regressão linear entre os dois parâmetros, representada pela equação Y=40,8809 + (-0,8214.X) (P<0,0001). / In this experiment aimed to monitor the follicular dynamics and ovarian activity of buffalo females in the postpartum period through ultrasound exams, investigating whether some events related to ovarian activity in the Postpartum Period (PPP), and uterine involution, since the 7th day calved until the second post-partum estrus. ten were used (10) crossbred females between Murrah and Mediterranean breeds with eutócicas parities and no history of reproductive problems, managed in semi extensive system, with availability of water and mineral supplementation ad libitum. It was found the presence of follicular growth patterns of two waves (2 OCF) and three waves (3OCF) at a ratio of 40% and 60%, respectively. The 1st and 2nd postpartum estrus demonstrated to 37,00+13,12 and 58,83+14,56 days postpartum for 2OCF animals, 45,00 + 15,19 and 66,00 + 23.02 days postpartum for animal 3OCF. The estrous intervals were 21,00+2,44 and 21,83+2,56 days for animals 2OCF and 3OCF respectively. Follicular emergency occurred at an average of 1,02+0,34 and 7.25+0,50 days cycle for the first and second waveform, respectively, of animals and 2OCF 0,93+0,35; 6,6+1,36 and 10,83+1,94 days cycle for the first, second and third wave, respectively, for the animal 3OCF. The pre ovulatory follicular diameter was 13,08±2,6 and 11,45+0,35 mm for the 1st and 2nd postpartum estrus of 2 OCF animals and 13,24+2,41 and 12,74+1,10 mm for the 1st and 2nd postpartum estrus of 3OCF animals. The uterine involution occurred at an average of 29,00+1,48 days, (P <0.001), diameter of the post gravid uterine horn (DPGUH) around 18,84+0,33 mm. The rate of uterine involution was 0,97+0,21 mm/day, (P <0,001). There was a high correlation between the PPP and CUPG, represented by r = -0,8179 (P<0,0001), being possible to establish a linear regression between the two parameters, represented by the equation Y = 40,8809 + (-0,8214.X) (P<0,0001).

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-15T11:31:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_RespostaImuneHumoral.PDF: 1103336 bytes, checksum: f20142b1495f0855c37bd778d9a9dda5 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-16T17:13:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_RespostaImuneHumoral.PDF: 1103336 bytes, checksum: f20142b1495f0855c37bd778d9a9dda5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-16T17:13:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_RespostaImuneHumoral.PDF: 1103336 bytes, checksum: f20142b1495f0855c37bd778d9a9dda5 (MD5) Previous issue date: 2013-08-31 / A brucelose está distribuída em todo território nacional, com maior prevalência para a espécie Brucella abortus que apesar de ser endêmica, apresenta-se de forma heterogênea entre as diferentes regiões do Brasil. O presente estudo tem por objetivo avaliar a resposta imune humoral de bezerras bubalinas criadas na Mesorregião do Médio Amazonas, vacinadas com a cepa B19 de B. abortus na idade preconizada pelo Programa Nacional de Controle e Erradicação da Brucelose e Tuberculose (PNCEBT). Foram selecionadas e acompanhadas 36 fêmeas (grupo teste) e 6 machos (grupo controle) com idades entre 3-8 meses. No dia 0 foi coletado sangue de todos os animais, em seguida todas as fêmeas receberam vacina comercial com amostra B19 em dose padrão conforme orienta o PNCEBT, com posteriores coletas de sangue realizadas aos 30, 60, 90, 120, 150, 180, 210, 330, 360 e 390 dias. Os soros sanguíneos foram avaliados pelo soro aglutinação das provas de triagem: Antígeno Acidificado Tamponado - AAT e pela prova confirmatória: 2 Mercaptoetanol - 2ME. Os resultados obtidos para todas as amostras coletas no dia 0 apresentaram resultado negativo na reação. Aos 30 e 60 dias todas as fêmeas apresentaram 100% de reação na prova AAT e titulação de 1:200, iniciando o declínio da titulação aos 90 dias nas duas provas. Aos 210 dias as fêmeas ainda reagentes apresentaram resultados similares nas duas provas, tendo apenas um animal se mantido reativo nas duas provas até 360 dias e, somente aos 390 dias 100% das fêmeas obtiveram reação negativa nas duas provas, durante todo o experimento os machos foram não reativos. Assim, pela avaliação dos resultados, a vacinação mostrou-se eficaz para a imunização, sendo uma ferramenta importante na profilaxia da brucelose na espécie estudada, bem como as provas aplicadas para o diagnostico dessa enfermidade em búfalos a nível regional. / Brucellosis is spread throughout the country, with the highest prevalence for the strain Brucella abortus that despite being endemic presents unevenly among different regions of Brazil. This study aims to evaluate the humoral and immune response of buffalo calves raised in the Middle Amazon Mesoregion, Pará state, vaccinated with B19 strain of B. abortus according the age recommended by the National Program for the Control and Eradication of Brucellosis and Tuberculosis (PNCEBT). Thirty-six female (test group) and six males (control group) aged 3-8 months were selected and monitored. On day 0 of the experiment, blood was collected from all animals, then all females received commercial vaccine with standard-dose sample B19 as recommended by PNCEBT with subsequent blood samples were taken at 30, 60, 90, 120, 150, 180, 210, 330, 360 and 390 days, respectively. The blood serums were evaluated for evidence of agglutination screening through Buffered Acidified Antigen - AAT and the confirmatory test through 2 Mercaptoethanol - 2ME. The results for all samples collected on day 0 were negative in the reaction, however at 30 and 60 days all females were 100% positive through test reaction AAT and titration 1:200, starting the decline through the titration at 90 days in both events. Females at 210 days still present reagents with similar results in both tests, however only one animal remained reactive in both tests up to 360 days. After 390 days of the begin of the experiment 100% of the females had a negative reaction in both events and throughout the experiment males were negative. Thus, by the evaluation of results, vaccination was effective for immunization, as well as an important tool in the prophylaxis of brucellosis in the species studied, as well as the tests applied to the diagnosis of this disease in buffaloes species at regional level.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-15T11:40:13Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AvaliacaoSorologicaMolecular.PDF: 971805 bytes, checksum: 7836f84ab3ed16c96797b58541a7d7cc (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-16T20:06:24Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AvaliacaoSorologicaMolecular.PDF: 971805 bytes, checksum: 7836f84ab3ed16c96797b58541a7d7cc (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-16T20:06:24Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AvaliacaoSorologicaMolecular.PDF: 971805 bytes, checksum: 7836f84ab3ed16c96797b58541a7d7cc (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Com o objetivo de analisar a ocorrência de Toxoplasma gondii em búfalos da Ilha de Marajó através de método sorológico e molecular, foram coletadas amostras de sangue e tecido cerebral de 100 búfalos. Os soros sanguíneos foram submetidos à Reação de Imunofluorescência indireta (RIFI), utilizando a diluição 1:64 como ponto de corte para T. gondii, essas amostras foram testadas para detectar a presença de anticorpos IgG anti-T. gondii. Para confirmar a presença do gene B1 de T. gondii no material gênomico de sangue e tecido cerebral, as amostras foram submetidas à amplificação por reação em cadeia pela polimerase (Nested-PCR). Dentre os soros de búfalos testados, 14 (14%) foram reagentes contra o T. gondii pela técnica da RIFI, enquanto que as amostras de sangue e tecido cerebral testados 4 (4%) foram amplificados o DNA de T. gondii pela técnica da PCR, sendo 3 (3%) em amostras de sangue e 1(1%) em amostras de tecido cerebral. Apesar da baixa ocorrência de anticorpos IgG anti-T. gondii em soro de búfalos, pode-se concluir que a infecção por este protozoário encontra-se presente em búfalos criados na Ilha de Marajó, além disso, foi possível a detectar o material genômico do T. gondii, em amostras de sangue e tecido cerebral desses animais, havendo assim, a necessidade de mais pesquisas, utilizando a técnica molecular no diagnóstico da toxoplasmose uma vez que, a detecção do bioagente em búfalos torna ainda mais relevante à importância desses animais na cadeia epidemiológica da toxoplasmose como prováveis fontes de infecção principalmente para o ser humano. / In order to analyze the occurrence of Toxoplasma gondii in buffalo Marajó Island by serological and molecular method, blood samples and brain tissue of 100 buffaloes were collected. Blood sera were tested by indirect immunofluorescence assay (IFA) using a 1:64 dilution as the cutoff point for T. gondii, these samples were tested for the presence of antibodies IgG anti-T. gondii. To confirm the presence of T. gondii B1 gene in genomic material of blood and brain tissue samples were subjected to amplification by polymerase chain reaction (nested PCR). Among the tested sera buffaloes, 14 (14%) were reactive against T. gondii by the IFA technique, while blood samples and brain tissue tested 4- (4%) were amplified DNA by the technique of T. gondii PCR, 3 (3%) in blood samples and 1 (1%) in brain tissue samples. Despite the low occurrence of antibodies anti-T. gondii in serum buffalo, it can be concluded that infection by this parasite is present in buffalo breed in Marajo, moreover, it was possible to detect the genomic material of T. gondii in blood samples and brain tissue these animals, thus there is the need for further research, using the molecular technique for the diagnosis of toxoplasmosis since the detection of the bioagent buffaloes becomes even more relevant to the importance of these animals in the epidemiological cycle of toxoplasmosis as possible sources of infection primarily for the human being.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-15T11:43:56Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_RespostasTermograficasTouros.PDF: 7412305 bytes, checksum: c1df089dabb702b375fc17c404d7073f (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-17T12:20:02Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_RespostasTermograficasTouros.PDF: 7412305 bytes, checksum: c1df089dabb702b375fc17c404d7073f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-17T12:20:02Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_RespostasTermograficasTouros.PDF: 7412305 bytes, checksum: c1df089dabb702b375fc17c404d7073f (MD5) Previous issue date: 2014-04-30 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A produção de búfalos (Bubalus bubalis) está praticamente concentrada entre os trópicos, onde predominam elevadas temperaturas. Portanto, o conhecimento da resposta desses animais frente ao ambiente tropical e às mudanças climáticas são essenciais. Assim, o objetivo do trabalho foi avaliar a variação dos índices de conforte térmico, parâmetros fisiológicos, hemáticos, seminais e de temperaturas superficiais de touros bubalinos mantidos sob clima tropical úmido (Afi de Köppen). Dez búfalos foram mantidos em baias coletivas, com acesso à sombra. Durante os meses de abril a agosto de 2013 foram obtidos dados climatológicos de estação meteorológica e dataloggers, instalados no interior das baias para cálculo do índice de temperatura e umidade (ITU). Foram aferidas frequência respiratória (FR), frequência cardíaca (FC), temperatura retal (TR), temperatura superficial de globo ocular (GLO), temperatura superficial do escroto (ESC), temperatura superficial do flanco direito (FLd) e esquerdo (FLe) e calculado o índice do conforto térmico de Benezra (ICB). Foi realizada coleta de sêmen semanalmente por vagina artificial, e realizada coleta de sangue para avaliação do hemograma mensalmente. A média da temperatura máxima do ar foi de 31,5ºC e a média da umidade relativa máxima foi de 93,2%. O ITU apresentou diferença somente entre turnos (P<0,05). A FR, FC e ICB apresentaram incrementos significativos ao longo dos meses e com diferença entre turnos (P<0,05). Já a TR apresentou diferença entre turnos e variação decrescente nos meses, com menor valor em agosto (37,8±0,7ºC). Para os valores de TR, GLO, FLd, FLe e ESC houve diferença (P<0,05) tanto para o turno quanto para os meses. O hematócrito, volume corpuscular médio, hemoglobina corpuscular média, concentração de hemoglobina corpuscular média, turbilhonamento e vigor espermático apresentaram diferença significativa (P<0,05) ao longo dos meses. As maiores correlações obtidas entre ITU e temperaturas superficiais foram entre ITUmed e FLdmed (0,77; P<0,0001), ITUmed e FLemed (0,75; P<0,0001), ITUmed e GLO (0,72; P<0,0001), e ITUmed e ESC (0,41; P<0,0001). A maior correlação entre temperatura interna e temperatura superficial foi de TR e GLOmax (0,58; P<0,0001). Correlações significativas foram encontradas entre ICB e FR (0,97; P<0,0001), ICB e FC (0,89; P<0,0001), FC e FR (0,87; P<0,0001), ITU e integridade de membrana plasmática dos espermatozoides (-0,17; P<0,05). Os resultados mostraram que, apesar dos animais apresentarem variações no índice de conforto de Benezra e elevação da temperatura superficial nos períodos mais quentes, os touros foram capazes de manter a homeotermia. Por fim, concluiu-se, também, que a termografia infravermelha pode ser usada como uma ferramenta não invasiva e auxiliar nos estudos sobre a fisiologia da termorregulação animal. / Buffalo (Bubalus bubalis) livestock is mostly performed in the intertropical zone, where high temperatures prevail. Therefore the knowledge about buffaloes physiology on tropical environments and their possible responses due to tropical climate changes are essential. The objective of the study was to evaluate the variation in thermal comfort, physiological, hematological, seminal parameters and the superficial temperatures of buffalo bulls raised on humid tropical climate (Afi, Köppen classification). Ten buffaloes were kept in collective paddocks with free access to shade. During five months, data were registered from climatological meteorological station and three distinct dataloggers installed inside the stalls for calculating the Temperature and Humidity Index (THI). Respiratory rate (RR), heart rate (HR), rectal temperature (RT), superficial temperature of the eye (GLO), superficial temperature of the scrotum (ESC), superficial temperature of the right flank (FLd) and left flank (FLe) were registered. The Benezra´s Comfort Index (ICB) was also calculated. Semen collection was performed weekly by artificial vagina and blood sampling for assessment of blood counts were done monthly. The mean maximum of air temperature was 31.5°C and maximum a verage relative humidity was 93.2%. The THI was different only between periods (P<0.05). The RR, HR and ICB showed significant difference over the months and between shifts (P <0.05). RT differed between periods and reduced along months with lower value in August (37.8 ± 0.7°C). RT, GLO, FLd, FLe and ESC showed no diffe rence (P<0.05) for both periods and months. The hematocrit, mean corpuscular volume, mean corpuscular hemoglobin, mean corpuscular hemoglobin concentration, gross motility and sperm vigor showed significant differences (P<0.05) along the months. The highest correlations between THI and superficial temperatures were between ITUmed and FLdmed (0.77; P<0.0001), ITUmed and FLemed (0.75; P<0.0001), ITUmed and GLO (0.72; P<0.0001), and ITUmed and ESC (0.41; P<0.0001). The highest correlation between internal temperature and surface temperature was TR and GLOmax (0.58; P<0.0001). Significant correlations were found between ICB and FR (0.97; P<0.0001), ICB and FC (0.89; P<0.0001), FC and FR (0.87; P<0.0001), THI and integrity of the plasma sperm membrane (-0.17; P<0.05). The results showed that animals had variations in thermal comfort and increased superficial temperature in the hottest periods of the day, however they were able to maintain homeothermy. Finally, the infrared thermography can be used as a noninvasive and auxiliary technique in studies about animal physiology and thermoregulation.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-15T11:44:50Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_PrevalenciaSorologicaMolecular.pdf: 861713 bytes, checksum: ffddee7491410356b82fbbbef16f58ea (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-17T12:36:50Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_PrevalenciaSorologicaMolecular.pdf: 861713 bytes, checksum: ffddee7491410356b82fbbbef16f58ea (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-17T12:36:50Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_PrevalenciaSorologicaMolecular.pdf: 861713 bytes, checksum: ffddee7491410356b82fbbbef16f58ea (MD5) Previous issue date: 2014-06-26 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / O objetivo do presente estudo foi verificar a prevalência sorológica e molecular de Babesia bovis e Babesia bigemina em búfalos da Ilha de Marajó, estado do Pará, Brasil. Foi utilizado o Ensaio de Imunoadsorção Enzimático indireto (ELISAi) com antígeno total contendo proteínas de superfície externa e a Reação em Cadeia da Polimerase quantitativa (PCRq), envolvendo o uso de SYBR Green com base na amplificação de um pequeno fragmento de gene do citocromo b. A prevalência de animais positivos no ELISAi para B. bovis, B. bigemina e para infecção mista foi de 24.87% (199/800), 20.75% (166/800) e 18.75% (150/800), respectivamente. Na PCRq foi detectado a presença de B. bovis em 15% (18/199) e de B. bigemina em 16% (19/199) dos animais, sendo que destes, 58% (11/19) apresentavam-se co-infectados pelos dois agentes. Os resultados mostram uma baixa prevalência de anticorpos anti-B. bovis e anti-B. bigemina em búfalos da Ilha do Marajó. Porém, observou-se que os agentes da babesiose bovina circulam em búfalos, podendo atuar como reservatório. / The aim of the study was to estimate the prevalence of Babesia bovis and Babesia bigemina in water buffaloes of the Marajó Island, State of Pará, Brazil. We used an indirect enzyme-linked immunosorbent assay (iELISA), with total antigen containing proteins outer surface, and polymerase chain reaction (qPCR), involving the use of SYBR Green based on amplification of a small fragment of the cytochrome b gene. The prevalence of positive animals in iELISA to B. bovis B. bigemina and mixed infection was 24.87% (199/800), 20.75% (166/800) and 18.75% (150/800), respectively. Using the PCR, the presence of B. bovis was detected in 15% (18/199) and B. bigemina in 16% (19/199) of animals, and of these, 58% (11/19) presented co-infected by the two agents. The results show a low prevalence of an- tibodies anti-B. bovis and anti-B. bigemina in water buffaloes from Marajó Island. However, it was observed that the agents of bovine babesiosis circulate in buffaloes, and these may act as reservoirs.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-15T17:36:53Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_DeterminacaoOcorrenciaAnticorpos.pdf: 639897 bytes, checksum: 2d581f30c15c3267fe2a4566af3cd1e5 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-19T15:00:40Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_DeterminacaoOcorrenciaAnticorpos.pdf: 639897 bytes, checksum: 2d581f30c15c3267fe2a4566af3cd1e5 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-19T15:00:40Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_DeterminacaoOcorrenciaAnticorpos.pdf: 639897 bytes, checksum: 2d581f30c15c3267fe2a4566af3cd1e5 (MD5) Previous issue date: 2015-12-04 / O presente trabalho objetivou estudar a ocorrência da infecção por Leptospira spp. em bubalinos no Bioma Amazônico do Estado do Pará, assim como, identificar os sorovares de maior ocorrência na região. Foram testadas 387 amostras de soro bubalino de nove municípios paraenses, Cachoeira do Arari, Santa Cruz do Arari, Salvaterra, Soure e Chaves, localizados na Ilha de Marajó, Abaetetuba, Ipixuna, Nova Timboteua e Paragominas, localizados na região continental. Foram testados oito sorovares: Bataviae, Bratislava, Hardjobovis, Hardjo (OMS), Hardjo (CTG), Icterohaemorrhagiae, Pomona e Hardjo (Bolivia), por meio da técnica de soroaglutinação microscópica (SAM). Do total de amostras testadas 354 (91,50%) foram sororeagentes para pelo menos um sorovar testado e 33 (8,50%) tiveram resultado negativo. Três dos sorovares do sorogrupo Sejroe tiveram maior ocorrência, sendo Hardjo (Bolivia) (79,30%), Hardjo (OMS) (64,8%), Hardjobovis (64,10%). É importante conhecer os sorovares de maior ocorrência na região estudada para que os direcionamentos de combate e controle da infecção sejam eficientes, minimizando o potencial risco de contaminação e manutenção da leptospirose no rebanho. / This study investigated the occurrence of Leptospira spp. in buffaloes in the Amazon biome of Pará, as well as identify the higher incidence of serotypes in the region. They tested 387 serum samples of buffalo nine Pará municipalities, Cachoeira do Arari, Santa Cruz do Arari, Salvaterra, Soure and Chaves located on Marajó Island, Abaetetuba, Ipixuna, Nova Timboteua and Paragominas, located on the mainland. Eight serotypes were tested: Bataviae, Bratislava, Hardjobovis, Hardjo (OMS), Hardjo (CTG), Icterohaemorrhagiae, Pomona and Hardjo (Bolivia), through the microscopic agglutination test method (SAM). Of the total samples tested 354 (91.50%) were reactive serum for at least one serovar and 33 (8.50%) were negative. Three serotypes of serogroup Sejroe were more frequent, Hardjo (Bolivia) (79.30%), Hardjo (OMS) (64.8%) and Hardjobovis (64.10%). It is important to know the higher incidence of serotypes in the region studied so that the directions of combat and infection control are efficient, minimizing the potential risk of contamination and maintenance of leptospirosis in the herd.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-15T17:54:15Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_OcorrenciaAnticorposContra.PDF: 1109270 bytes, checksum: c6ad182dbe76da3e60b8512f01c5f05a (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-22T13:59:31Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_OcorrenciaAnticorposContra.PDF: 1109270 bytes, checksum: c6ad182dbe76da3e60b8512f01c5f05a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-22T13:59:31Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_OcorrenciaAnticorposContra.PDF: 1109270 bytes, checksum: c6ad182dbe76da3e60b8512f01c5f05a (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A leucose bovina, a diarréia viral bovina e a rinotraqueite infecciosa bovina estão entre as principais viroses que levam a perdas na produtividade e no desempenho reprodutivo de ruminantes. Embora bovinos e bubalinos sejam frequentemente criados em conjunto e apesar da comprovada ocorrência dessas enfermidades em bubalinos, trabalhos sobre ocorrência natural dessas viroses nessa espécie ainda são escassos. Deste modo, objetivou-se verificar a ocorrência de anticorpos contra os vírus da Leucose enzoótica bovina (LEB), Diarreia viral bovina (BVD) e Rinotraqueíte infecciosa bovina (IBR) em bubalinos de criações localizadas nas Mesorregiões Nordeste Paraense, Metropolitana de Belém e do Marajó, no Estado do Pará, além de identificar os fatores de risco para a BVD em criações das Mesorregiões Nordeste Paraense e Metropolitana de Belém. No presente estudo foram avaliados 350 soros de bubalinos (Bubalus bubalis) procedentes de propriedades agropecuárias localizadas nas respectivas mesorregiões, que foram submetidos às técnicas de sorologia: imunodifusão para LEB e soroneutralização para BVD e IBR. A frequência para as respectivas doenças na população de estudo foram: 0% (0/350), 53,71% (188/350) e 91,71% (321/350). Bubalinos machos e animais com idade mais avançada apresentaram maior soropositividade para BVD. A frequência de bubalinos sororreagentes para BVD foi maior na Mesorregião do Marajó, em relação às Mesorregiões Nordeste Paraense e Metropolitana de Belém, enquanto para IBR foi maior nas Mesorregiões Nordeste Paraense e Metropolitana de Belém. Dentre as variáveis investigadas, o tipo de ordenha foi o único identificado como fator de risco para a ocorrência da BVD em bubalinos. / Bovine Leukosis, Bovine Viral Diarrhea and Infectious Bovine Rhinotracheitis are among the main viruses that lead to losses in productivity and reproductive performance of ruminants. Although cattle and buffalo are often created together, and despite the proven occurrence of these diseases in buffalo, papers about natural occurrence of these infections in this species are scarce. Thus, the objective of this study was to verify the occurrence of antibodies against the Bovine Leukosis Virus (BLV), Bovine Viral Diarrhea (BVD) and Infectious Bovine Rhinotracheitis (IBR) in buffalo creations located in the “Paraense” Northeast Mesoregion, Greater Metropolitan Belém and Marajó Mesoregion, Pará, in addition to identify the risk factors for BVD in creations located in “Paraense” Northeast Mesoregion and Greater Metropolitan Belém. In this study 350 buffaloes (Bubalus bubalis) sera were evaluated, coming from farms located in each mesoregion, that were subjected to serological techniques: immunodiffusion for (BLV) and serum neutralizing for BVD and IBR. Frequency of the respective diseases in the study population were: 0% (0/350), 53,71% (188/350) and 91,71% (321/350). Male buffaloes and older animals had higher seropositivity for BVD. The frequency of BVD seroreagents buffaloes was higher in Marajó Mesoregion compared to “Paraense” Northeast Mesoregion and Greater Metropolitan Belém, whereas for IBR the opposite occurred. Among the variables investigated, the type of milking was the only identified as a risk factor for the occurrence of BVD in buffaloes.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-05-15T17:59:15Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoSistemasProducao.PDF: 1277464 bytes, checksum: 5448cd47195c80c77d67c8524d400420 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-05-22T14:33:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoSistemasProducao.PDF: 1277464 bytes, checksum: 5448cd47195c80c77d67c8524d400420 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-22T14:33:52Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_CaracterizacaoSistemasProducao.PDF: 1277464 bytes, checksum: 5448cd47195c80c77d67c8524d400420 (MD5) Previous issue date: 2014-02-25 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / A pecuária leiteira assume grande importância na economia regional, do ponto de vista de ocupação e geração de renda, sobretudo para agricultura familiar. Conhecer a realidade desses sistemas torna-se fundamental para que se possam gerar subsídios específicos para maior desenvolvimento da atividade. Nesse contexto os estudos sobre os diferentes sistemas de produção despontam como uma ferramenta relevante. O objetivo deste trabalho foi caracterizar os sistemas de produção de leite nas mesorregiões do sudeste e nordeste paraense através da utilização de técnicas de análise multivariada. A pesquisa foi realizada através da aplicação de questionários a 112 propriedades localizadas nos municípios de Ulianópolis-PA e Irituia-PA. Os dados obtidos foram tabulados no Microsoft Excel e processados no software SPSS 18.0. Através da análise de frequência observou-se que a área total das propriedades variou de 7 a 1600 ha. Os proprietários foram classificados de acordo com a quantidade de vacas existentes nas propriedades e constatou-se que 5,35% dos produtores possuíam menos de 10 vacas e 23,21% mantinham em seus estabelecimentos mais de 50 vacas. Com relação à produtividade do rebanho observou-se uma média geral de 4,34 (L vaca-1 dia-1). A alimentação do rebanho é baseada em pastagens cultivadas, sendo o braquiarão a mais utilizada. Apenas 19,60% das propriedades realizam suplementação com concentrado e 13,39% com volumoso. O manejo reprodutivo é realizado em 86,6% através de monta natural sem nenhum controle, o que resulta em animais pouco especializados para produção leiteira. O manejo da ordenha apresenta-se deficiente quanto às condições higiênica-sanitária, resultando num produto de baixa qualidade. As práticas de gestão apresentam pouca expressão entre os produtores. Com relação à tipologia estabelecida através da análise fatorial, revelou-se quatro fatores que explicaram 66,99% das variáveis originais, sendo que a análise de cluster identificou 4 grupos de produtores com perfis similares. O grupo III correspondeu ao grupo de produtores que apresentou maior adoção de tecnologia, como suplementação alimentar, manejo sanitário, tecnologia da ordenha e gestão da atividade, possuindo consequentemente melhor desempenho com média de produtividade de 5,04 (L vaca-1 dia-1). Os grupos I e II caracterizam-se por sistemas de produção familiares, com baixo nível de especialização e baixa produtividade e o grupo IV consiste em produtores familiares que apresentaram uma produção incipiente com participação da agricultura, possuindo os menores rendimentos produtivos e econômicos. / The dairy industry is of great importance in the regional economy in terms of employment and income generation , especially for family farming . Know the reality of these systems becomes essential so that they can generate specific grants for further development of the activity. In this context, studies on the different production systems emerge as an important tool. The objective of this study systems of milk production was characterized in the regions of Southeast and Northeast Pará through the use of multivariate analysis techniques . The survey was conducted through questionnaires with 112 properties located in the municipalities of Ulianópolis - PA and PA - Irituia . Data were tabulated in Microsoft Excel and processed using SPSS 18.0 software . Through frequency analysis revealed that the total area of varied properties 7-1600 ha . The owners were ranked according to the number of cows in the existing properties and the lowest represented by those with less than 10 cows, which corresponded to 5.35 % and higher over 50 ( 23.21 %). Regarding herd productivity observed an overall average of 4.34 ( L cow -1 day -1) . Feeding the flock is based on cultivated pastures , being the most used braquiarão . Only 19.60% of the properties held supplementation with concentrate and roughage with 13.39% . The reproductive management is performed in 86.6 % through natural mating without any control , which results in little specialized animals for dairy production . The management of milking presents itself as the poor hygienic and sanitary conditions , resulting in a poor quality product . Management practices show little expression among producers . With respect to the typology established through factor analysis revealed four factors that explained 66.99 % of the original variables , and the cluster analysis identified 4 groups of producers with similar profiles . The group III corresponded to the group of producers that had the highest adoption of technology such as supplemental feeding , health management , milking and activity management technology, thus having better performance with an average productivity of 5.02 ( L cow -1 day -1) . Groups I and II are characterized by family production systems with low specialization and low productivity and group IV consists of family farmers who presented with an incipient share of agriculture production , having the lowest production and economic returns.