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Software gerenciador de base de dados e imagens radiológicas para avaliação de monitores / Software to manage database and radiological images developed to monitor´s evaluation

Pires, Silvio Ricardo [UNIFESP] January 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-12-06T23:47:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Objetivo: A proposta deste trabalho e identificar as caracteristicas dos monitores que podem influenciar na deteccao de sinais presentes na imagem e quantificar com que precisao eles sao detectados. Metodos: Foi desenvolvido um software capaz de gerenciar o processo de avaliacao do desempenho dos profissionais na deteccao de microcalcificacoes e fibras utilizando monitores comuns de 19 e 22, monitores especificos Clinton e Barco e um negatoscopio. Foram geradas 180 imagens em mamografos com diferentes condicoes tecnico-operacionais, utilizando o simulador estatistico ALVIM® e digitalizadas no scanner Lumiscan75. Foram avaliadas por 35 profissionais em negatoscopios e em diversas estacoes de trabalho, controladas por um servidor de banco de dados. As 180 imagens foram simuladas em espessura equivalente a de uma mama padrao e grande. A comparacao entre os dispositivos de visualizacao foi estatisticamente avaliada sob tres condicoes: dados originados das imagens que simulam mama padrao (4,5cm), dados originados das imagens que simulam mama grande (6,5 cm) e dados das imagens analisadas em conjunto. Para cada um destes grupos de imagens foi efetuada uma avaliacao estatistica, considerando a deteccao das estruturas de forma individual, bem como em conjunto. Para cada condicao foi gerada uma analise da concordancia na deteccao dos sinais presentes nas imagens (valores de Kappa), probabilidade de detectabilidade (P(det)) e a curva ROC. Uma fase de treinamento utilizando as ferramentas de manipulacao das imagens disponiveis no software foi realizada durante 8 horas. Para a analise estatistica foram considerados os resultados de 3.821 imagens avaliadas. Resultados: o treinamento utilizando os sistemas digitais demonstrou que os profissionais evoluem significativamente na deteccao de sinais na imagem com uma reducao no tempo de interpretacao com correlacao de -0,55 para os residentes e -0,05 para os especialistas. Nas imagens avaliadas em sistemas digitais os profissionais apresentaram maior sensibilidade e menor especificidade em comparacao ao negatoscopio. Os profissionais demonstraram menor subjetividade na interpretacao das imagens para sistemas digitais, bem como maior deteccao para fibras em relacao as microcalcificacoes. Os monitores Clinton e Barco apresentaram um desempenho de brilho 150 por cento maior do que o apresentado pelos monitores de 19 e 22. Ambos os monitores Clinton e Barco foram qualificados como apropriados para interpretacao de exames radiol6gicos em formato digital. Conclusao: Sistemas digitais permitem por meio do uso das ferramentas de manipulacao de imagens, maior concordancia na detectabilidade dos sinais presentes nas imagens simuladas. 0 treinamento dos profissionais alem de melhorar a detectabilidade de microcalcificacoes e fibras, agiliza a analise das imagens. A deteccao de fibras em imagens simuladas foi superior a deteccao de microcalcificacoes. As caracteristicas minimas dos monitores para analise de imagens mamograficas garantem que 0 desempenho do profissional seja equivalente ao obtido com o negatoscopio, sao: resolucao espacial de 3.0 Megapixels, resolucao de contraste de 10 bits/pixel e luminancia de 500 cd/m2 / Objective: The purpose of this work is to identify the characteristics of monitors that can modify the detection of signals into images and quantify the detection accuracy. Methods: It was developed a software able to manage the professional’s performance process at the microcalcification and fiber detection using viewbox and the following monitors: 19”, 22”, Clinton and Barco. A hundred and eighty images were generated in different mammographic equipment under several technical conditions using ALVIM statistical phantom. These images were randomly presented for thirty five professionals that evaluated them at viewbox and monitors in workstation controlled by a Database Server. The images were generated simulating standard and thickness breast (4.5 and 6.5 cm) and the data from image visualization devices were analyzed individually for each type of object and together. For each case was made a statistical analysis considering the microcalcifications and fibers separately and grouped. For each condition were generated the signals detectability agreements (Kappa values), detectability probability (Pdet) and ROC Curve. The professionals accomplished a training using software tools during eight hours previously to starting the objects detection into images. For the statistical analysis were considered 3.821 images. Results: The training using digital systems showed significant performance evolution while the time consumed decreased. The professionals presented higher sensibility and lower specificity for soft copy displays comparing with viewboxes. They also presented less subjectivity in the images readings using monitors. The Clinton and Barco monitors showed brightness 150% bigger than the others two. These were classified as appropriate to digital image readings. Conclusions: The digital readings using software tools generate higher agreements at the phantom image signals detection. The training can improve the microcalcifications and fibers detection along with timing saving. The fibers detection in the phantom image is higher than the microcalcification detection considering both phantom thicknesses (4,5 and 6,5cm). The minimum soft copy display specifications for mammograms readings are: 3 Megapixels for spatial resolution, 10 bits/pixel for contrast resolution and 500 cd/m2 for luminance. / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Predicción del parto vaginal a través de la puntuación Bishop en nulíparas inducidas con oxitocina de 41 y 42 semanas de gestación, atendidas en el Hospital Docente Madre Niño “San Bartolomé” – 2014

Chávez Tacas, Liseth Rosaura January 2015 (has links)
OBJETIVO: Evaluar la puntuación Bishop que predice el parto vaginal en nulíparas inducidas con oxitocina de 41 y 42 semanas de gestación, atendidas en el Hospital Docente Madre Niño “San Bartolomé” – 2014. METODOLOGÍA: Estudio de tipo observacional, descriptivo correlacional, retrospectivo, longitudinal. Para el estudio se trabajó con el total de gestantes atendidas en el Hospital Docente Madre Niño “San Bartolomé” de enero a diciembre del 2014, lo cual fue de 152 pacientes. Los datos se registraron en el programa Statistics SPSS v.21. Para el análisis descriptivo de las variables cuantitativas se estimó medidas de tendencia central (media) y medidas de dispersión (desviación estándar) y para el análisis de variables cualitativas (nominal) se estimó frecuencias absolutas y porcentajes (frecuencias relativas). Para el análisis inferencial se utilizaron pruebas paramétricas (T* Student) y no paramétricas (Chi cuadrado). Asimismo para obtener el punto de corte de mayor rendimiento se elaboró la curva ROC. RESULTADOS: El 55.9% de la población gestante con 41 y 42 semanas de gestación finalizó en cesárea y el 44.1% culminó por parto vaginal. La duración promedio de la fase latente en el grupo de gestantes que finalizó en parto vaginal con puntuación Bishop >= a 7 puntos fue 8.35 horas y en el grupo de gestantes con puntuación Bishop < 7 puntos fue 4.88 horas. La duración de la fase activa promedio en las gestantes con puntuación Bishop >= 7 fue 5.73 horas similar a la duración de la fase activa promedio en las gestantes con puntuación Bishop < 7 puntos (4.84 horas). La duración promedio del expulsivo en las gestantes del primer grupo con puntuación Bishop >= 7 puntos fue 19.86 minutos y en el grupo con puntuación Bishop < 7 puntos fue 15.54 minutos. Según puntuación Bishop >= 7, el 67.2% culminaron en parto vaginal y 60% de las gestantes finalizó en cesárea. Asimismo, en el grupo de gestantes con puntuación Bishop < 7, el 32.8% de las gestantes finalizaron por parto vaginal a diferencia del 40% de gestantes que culminaron por cesárea. La estimación de los valores diagnósticos para los puntos de corte de la puntuación Bishop 7 en la predicción del tipo de parto son: sensibilidad 67%, especificidad 40%, VPP 47% y VPN 61%. Se Evaluó el área bajo la curva (AUC) el cual fue 0.601, planteándose que el puntaje Bishop es un test diagnóstico, aceptable para predecir el parto vaginal, estimándose un nuevo punto de corte de 6 con una sensibilidad de 70% y la especificidad de 40%. Al evaluar con puntuación Bishop >= 6 puntos, el 100% culminaron en parto vaginal y 71.4% de las gestantes finalizó en cesárea. Asimismo, en el grupo de gestantes con puntuación Bishop < 6 puntos, el 28.6% de las gestantes finalizaron por parto cesárea, observándose que existe relación significativa entre la puntuación Bishop >= 6 puntos y la culminación por parto vaginal. CONCLUSIÓN: La puntuación Bishop con mayor rendimiento diagnóstico para la predicción del parto vaginal en nulíparas inducidas con oxitocina de 41 y 42 semanas de gestación, fue 6 con una sensibilidad de 70% y especificidad del 40%. / Tesis
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Valores dos pontos de corte ótimo do IMC para predizer níveis de obesidade: novo índice antropométrico / Values of optimal cutoff points of BMI in predicting obesity levels: New Anthropometric Index

Torres, Samuel Guerra [UNIFESP] January 2013 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-12-06T23:46:16Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Introdução: A obesidade, como um grave problema de Saúde publica, vem sendo vista atualmente como uma epidemia mundial. Diante disso, varios indicadores antropometricos foram criados para detectar e prevenir precocemente a obesidade. Objetivo: Verificar o poder discriminativo do indice de massa corporal (IMC) para classificar diferentes niveis de obesidade em individuos do sexo masculino. Em paralelo, sugerir e comparar com o IMC uma nova formula para estimar diretamente o percentual de gordura corporal (%G). Metodos: O estudo foi composto por 5072 avaliacoes fisicas realizadas em individuos do sexo masculino, entre os anos de 2002 e 2004, em clubes recreativos na Grande São Paulo. As avaliacoes foram separadas de forma randomizada em dois grupos. No primeiro grupo, denominado Regressao foi realizada uma regressao linear para o desenvolvimento de um novo indicador antropometrico. No segundo grupo, denominado Teste, foi aplicada curva ROC para verificar o poder discriminativo e determinar os pontos de corte com suas respectivas sensibilidades e especificidades. Foi verificado se ocorre diferenca significante entre as areas sob a curva ROC do IMC e IMG, tambem foi utilizada correlacao de Pearson e analise descritiva. O nivel de significancia adotado nos testes foi de 5%. Resultados: Os resultados da regressao linear foram: (Indice de massa gorda) IMG = 0,19 (Idade) + 0,39 (peso) - 9,36 (estatura). O poder discriminativo do IMC variou entre 0,7030 e 0,7925, ja o IMC variou entre 0,6908 e 0,7747, para os diferentes niveis de obesidades estudados. As comparacoes entre as areas sob as curvas ROC demonstraram que nao houve diferenca significativa entre o poder discriminativo do IMC e o IMG. As correlacoes de Pearson entre %G x IMC e %G x IMG foram de 0,7684 e 0,7708, respectivamente. Conclusao: O IMC apresentou valores dos pontos de corte abaixo dos propostos pela Organizacao Mundial de Saúde (OMS) para classificacao de diferentes niveis de obesidade. Nao houve diferenca significativa nas areas abaixo da curva ROC entre o IMC e IMG / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Tuberculose no idoso: reatividade ao teste tuberculínico e níveis de células T regulatórias

Michele Gondim de Brito, Cintia 31 January 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo2892_1.pdf: 5502983 bytes, checksum: 9d6ee430e513460ac62f54bea9784b36 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Faculdade de Amparo à Ciência e Tecnologia do Estado de Pernambuco / Considerada uma das principais doenças infecciosas em saúde publica, a tuberculose (TB) alcança níveis de alta endemicidade em países em desenvolvimento. Em 2008, o Brasil ocupava o 19º lugar entre os 22 países considerados de maior incidência. Neste mesmo ano o Estado de Pernambuco apresentava o mais alto coeficiente de incidência da região Nordeste e a Cidade do Recife (PE) a capital brasileira com mais casos novos de TB. Nos últimos 20 anos, a incidência de TB na população de idosos com idade igual ou acima de 60 anos, residentes no Recife, permaneceu sempre alta ao longo dos anos. Com o envelhecimento da população brasileira, a doença TB pode vir a constituir um grave problema, principalmente se considerarmos que as taxas de letalidade tendem a aumentar com a idade. Apesar disso, poucos estudos investigando o comportamento da tuberculose nessa população têm sido realizados no Brasil. A presente dissertação constou de três estudos abordando a tuberculose no idoso. No primeiro, realizou-se uma revisão bibliográfica acerca dos estudos publicados sobre fatores imunológicos relacionados ao desenvolvimento da TB no idoso, particularmente o papel das células T regulatórias (T regs), e sua relação com a reatividade ao teste tuberculínico (TT). A revisão bibliográfica foi realizada mediante uma busca on-line nas bases de dados Medline-PubMed, Science-Direct, Lilacs, Bireme e Scielo, com foco nas publicações dos últimos dez anos, nos idiomas português e inglês. Os resultados do primeiro artigo demonstram que poucos estudos têm avaliado o nível das células T regs na população idosa e a informação sobre essas células nesse grupo é limitada e controversa. Concluíse com essa revisão que existe uma lacuna de informação no contexto da resposta ao TT e produção de células T regs em idosos com tuberculose. O segundo é um estudo tipo série de casos cujo objetivo foi descrever o padrão de reatividade ao TT e características dos indivíduos idosos com e sem TB doença e adultos com TB, assim como identificar o ponto de corte da curva ROC (Receiver Operating Characteristic) que melhor descrimina idosos com e sem TB doença. Foram estudados 87 pacientes residentes da cidade do Recife, no período de janeiro de 2008 a dezembro de 2009. Os resultados do artigo 2 mostra que ao comparar a média em milímetros do valor do TT dos três grupos, essas são diferentes e a diferença foi estatisticamente significante (p=0,001). Além disso, ter idade entre 60 a 69 anos, ser do sexo masculino, está desnutrido, beber e fumar são características presentes no idoso com TB. A curva ROC identificou o ponto de corte de 5 mm como aquele que apresenta os valores de sensibilidade (0,61) e especificidade (0,78) mais elevados para discriminar os idosos com TB doença dos idosos sem TB doença. Com base nos resultados encontrados, sugerimos que o critério de positividade do TT nos indivíduos idosos seja revisto. O objetivo do terceiro estudo foi verificar a correlação entre os níveis de células T regs e a reatividade ao TT em idosos e adultos com TB e idosos sem TB. A expressão de FOXP3 por PCR em tempo real foi realizada em 61 pacientes, enquanto que quantificação das células Treg por citometria de fluxo em 25. Ao analisar a correlação do TT e células T regs observou-se que só houve correlação estatisticamente significativa no grupo de adultos com TB doença. Verificou-se ainda, uma correlação positiva entre o TT e os níveis de FOXP3 nos grupos de adultos e idosos com TB e uma correlação negativa no grupo de idosos sem TB. Os resultados encontrados no artigo 3 indicam uma diminuição dos níveis de células T regulatórias na circulação periférica de pacientes idosos com TB em atividade, sugerindo existir uma imunodepressão nesse grupo que pode ser responsável pela menor reatividade ao TT quando comparado aos adultos com tuberculose
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Influencia de tempos alternativos de dessensibilização das placas de fosforo do sistema denoptix na qualidade da imagem digital / Performance of alternative DenOptix PSPs erasing times on subjective digital image quality

Melo, Daniela Pita de 28 February 2007 (has links)
Orientador: Guilherme Monteiro Tosoni / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-08T15:57:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Melo_DanielaPitade_M.pdf: 2421264 bytes, checksum: 450ce050ad326e2d47d3b89064367748 (MD5) Previous issue date: 2007 / Resumo: O objetivo, neste trabalho, foi verificar se tempos alternativos de dessensibilização das placas de fósforo do sistema DenOptix causam interferência na qualidade da imagem radiográfica e no diagnóstico de cáries proximais. Foram obtidas imagens de 10 phantoms, constituídos de dentes humanos, utilizando-se placas de fósforo parcialmente dessenbilizadas. Os dez tempos de dessensibilização estudados foram em ordem decrescente: 130s, 98s, 66s, 34s, 25s, 20s, 15s, 10s, 5s e 0s. As imagens foram posteriormente avaliadas, quanto à sua qualidade subjetiva, por dois examinadores. Cada avaliador atribuiu escores para contraste, densidade e nitidez da imagem; para definição das estruturas - esmalte, dentina e junção amelo-dentinária; e para a presença ou ausência de imagem dupla. Os resultados foram submetidos à correlação de Spearman, análise de variância e teste de Tukey. Os tempos de 20s a 130s apresentaram qualidade satisfatória em todos os quesitos abordados. Após esta primeira avaliação, os seis tempos considerados estatisticamente eficazes nos quesitos referentes à qualidade geral da imagem foram submetidos a uma nova avaliação, quanto à presença de cárie proximal. As imagens correspondentes aos tempos selecionados foram interpretadas por cinco avaliadores. Cada avaliador atribuiu um escore para cada uma das faces dentárias interpretadas. Esses escores foram posteriormente comparados ao padrão ouro. Os tempos de dessensibilização alternativos foram avaliados, quanto à sua acurácia no diagnóstico de cárie, por meio da curva ROC. As médias das curvas ROC correspondentes aos tempos de dessensibilização avaliados variaram de 0,61 a 0,66 e não apresentaram diferença estatística significativa entre elas. O desempenho dos tempos de dessensibilização alternativos de 20s a 130s foi satisfatório tanto nos quesitos de qualidade geral da imagem como no diagnóstico de cáries proximais, demonstrando a possibilidade da utilização de tempos alternativos de dessensibilização das placas do sistema DenOptix na redução do tempo de trabalho na clínica diária / Abstract: The aim on this study was to verify if DenOptix¿s phosphor plates alternative erasing times would cause any influence on the image quality and on the diagnosis of approximal caries. Ten human teeth phantoms were radiographed using phosphor plates, partially erased. The chosen erasing times were: 130s, 98s, 66s, 34s, 25s, 20s, 15s, 10s, 5s e 0s. Two observers, independently, evaluated the general quality of each image, scoring the images on contrast, density, sharpness and structures definition (enamel, dentine and enamel-dentine junction). The presence of double image was also evaluated. The resultant data was evaluated using the Spearmen¿s correlation, variance analysis, and Tukey¿s test. The erasing times from 20s to 130s had a satisfactory quality in all the evaluated items. After the first evaluation, the erasing times that showed statistical efficiency in the evaluated quality items of the image went through another evaluation regarding the presence of approximal caries. The images of the selected erasing times were evaluated by five observers. Each observer scored the approximal surfaces of each tooth. The scores were compared to the golden standard. The alternative erasing times were evaluated by their accuracy on predicting caries by means of the ROC curve analysis. The means of the ROC curves of each erasing time evaluated varied from 0,61 to 0,66 and did not show significant statistical difference between them. The alternative erasing times from 20s to 130s was satisfactory both on the quality analysis as on approximal caries diagnosis, what makes the use of those alternative erasing times of DenOptix¿s phosphor plates feasible during clinical practice / Mestrado / Radiologia Odontologica / Mestre em Radiologia Odontológica
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Algoritmos de detección de estrellas variables en imágenes astronómicas basados en factorización no negativa de matrices

Berrocal Zapata, Emanuel Antonio January 2015 (has links)
Ingeniero Civil Matemático / En este trabajo se presenta una metodología para de detectar estrellas variables en estampillas de 21 x 21 píxels provenientes de imágenes astronómicas a partir de un pipeline de procesamiento de imágenes para el telescopio Dark Energy Camera (DECam). Para aquello se realizará un aprendizaje con una muestra de imágenes que están etiquetadas como estrellas y no estrellas con el objetivo de detectar nuevas estrellas variables en imágenes desconocidas. Los objetos astronómicos que se observan en las imágenes, pueden ser agrupados en las categorías de: estrellas variables, estrellas fijas, rayos cósmicos, fuentes puntuales falsas, malas restas, supernovas y objetos desconocidos. Para la labor de detectar estrellas se ocuparon 2 algoritmos basados en NMF (Nonnegative matrix factorization) y un tercer algoritmo basado en Análisis de Componentes Principales (PCA). El enfoque del primer algoritmo NMF es la rapidez, mientras que el segundo se enfoca en la dispersión de información. Para el uso de los algoritmos anteriores se generó una metodología con la que trabajarán, los cuales ocupan técnicas de optimización no lineal y descomposición de matrices; finalmente se demuestra cual es el mejor de ellos para detectar estrellas gracias a una herramienta llamada Curva ROC. Una vez escogido el mejor método se realiza un estudio de sensibilidad de parámetros para mejorar la detección de estrellas y obtener una representación más genérica a través de la descomposición de matrices. El resultado final es que utilizando uno de los algoritmos basados en NMF, se obtienen los mejores resultados de clasificación, esto se concluye del análisis de la Curva ROC.
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Método para avaliação dos algoritmos utilizados no processamento de imagens médicas / Method for evaluation of the algorithms used in the processing of medical images

Rodrigues, Silvia Cristina Martini 24 September 1999 (has links)
Este trabalho apresenta como parte de resultados, uma ampla pesquisa que permitiu identificar os grupos de pesquisas mais importantes do mundo, os quais possuem em comum o processamento de imagens médicas, mais especificamente o processamento de imagens que busca a identificação de microcalcificações mamárias. O vasto levantamento, a seleção e organização culminou na reunião de mais de cem artigos, publicados nos mais importantes periódicos da área, que mostram claramente as formas utilizadas pelos grupos de pesquisa para apresentação dos resultados encontrados pelos seus algoritmos. Esses resultados devem auxiliar o médico no diagnóstico do câncer de mama. Demonstramos neste trabalho porque as técnicas utilizadas para apresentação dos resultados são insatisfatórias e propusemos um novo método de avaliação desses resultados. O método proposto no trabalho baseia-se no teste do X&sup2 (Qui-Quadrado), nas curvas ROC (Receiver Operating Characteristic) e no teste de concordância, que juntos permitem apresentar de forma clara e objetiva as relações entre verdadeiros positivos e falsos positivos, verdadeiros negativos e falsos negativos, sensibilidade e especificidade do algoritmo analisado. O novo método é preciso e tem bases estatísticas conhecidas pelos médicos e pelos pesquisadores, facilitando sua aceitação. / This work presents as part of results, a wide investigation that it allowed to identify the principal research groups of the world, which possess in common the processing of medical images, more specifically the processing of images that search for the identification of mammary microcalcifications. The vast collection, selection and organization culminated in the meeting of more than a hundred articles, published in the most important newspapers of the area, that show the forms used by the research groups to present the results found clearly by its algorithms. Those results should assist the doctor in the diagnosis of the breast cancer. We demonstrated in this work that the techniques used for presentation of the results are unsatisfactory and we proposed a new method of evaluation of those results. The proposed method bases on the test of the X&sup2 (Qui-square), in ROC curve (Receiver Operating Characteristic) and in the agreement test, that take together allow to present in a clear and objective way the relationships among true positive and false positive, true negative and false negative, sensibility and specificity of the analyzed algorithm. The new method is precise and has statistical bases known by the clinicians and researchers, facilitating its acceptance.
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LIPO-CAD: SISTEMA DE AVALIAÇÃO DO NÍVEL DE COLESTEROL TOTAL POR MEIO DE PROCESSAMENTO DE IMAGENS DIGITAIS

Oliveira, Paula Lorenzoni Paste de 15 December 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2016-08-10T10:55:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Paula Lorenzoni Paste de Oliveira.pdf: 1048800 bytes, checksum: 578b18c5642e39d43d7fcc9b72357fc4 (MD5) Previous issue date: 2006-12-15 / Nowadays the high level of cholesterol is one of the illnesses that reach millions of people causing about 12 million deaths in many developed countries, being the main cause of deaths in developing countries. Various researches in the world had defined the reference values for the total cholesterol levels in the blood. The reference values for the cholesterol exam are: desirable smaller than 200; smaller than 200 and larger or equal to 239 moderate risk and high risk larger ou equal to 240. Currently the dosage is carried through by spectrophotometer that it is based on the analysis of the color concentration, such concentration is directly proportional to the dosage of cholesterol (mg/dL) found in the sample. With computers, several techniques are being improved to aid clinical diagnosis. The aim of our work was to develop a technique using Digital Image Processing to dose the cholesterol level in a sample. The ELISA microtiter plate was used to capture a digital image with cholesterol exams samples. From this image, techniques of image processing were applied to find out the cholesterol concentration. The results were compared by statistical analysis with the results found for the current technique (spectrophotometer). The correlation coefficient analysis was applied and the results found was -0,94 (IC 95% = -0,9668 the -0,9036, P smaller than 0,0001), demonstrating that the process of capture and analysis of the cholesterol images has a strong correlation with the current method. To validate the experiment a ROC curve of the test was constructed. The area under the ROC curve was of 0,868 (IC 95% = 0,798 the 0,920, P smaller than 0,0001) evidencing to be a method with good discriminatory power. These results demonstrate that the analysis and image capture process obtained the desired results. The method proposed is an alternative way to assist in the dosage of the total cholesterol and can be used to develop equipments at low cost. / Nos dias de hoje a hipercolesterolemia é um dos distúrbios metabólicos que atinge milhões de pessoas, causando cerca de 12 milhões de óbitos em diversos países desenvolvidos, sendo a principal causa de óbitos em países em desenvolvimento. Diversas pesquisas em várias partes do mundo definiram os valores de referência para os níveis de colesterol total no sangue. Os valores de referência para o exame de colesterol são: desejável menor que 200; risco moderado de 200 à 239 e alto risco maior ou igual a 240. Atualmente a dosagem é realizada pelo espectrofotômetro que se baseia na análise da concentração de cor, sendo diretamente proporcional à dosagem de colesterol (mg/dL) encontrada na amostra. Com a evolução da informática, várias técnicas estão sendo aprimoradas por meio do uso de computadores no auxílio ao diagnóstico clínico. Neste trabalho propôs-se desenvolver uma técnica utilizando processamento de imagens para dosar o nível de colesterol existente nas amostras. Utilizou-se uma placa de ELISA para realizar a captura de uma imagem digital com amostras de colesterol. A partir desta captura, aplicaram-se técnicas de processamento de imagens para encontrar a concentração de colesterol existente. Estes resultados então, foram comparados estatisticamente com os resultados encontrados pela técnica atual (espectrofotômetro). A análise de correlação foi efetuada e os resultados encontrados com os experimentos foram de -0,94 (IC 95% = -0,9668 a -0,9036, p menor que 0,0001). Esse trabalho sugere que o processo de captura e análise das imagens de colesterol tem uma correlação forte com o método atual. Para validar o experimento, construiu-se a curva ROC do teste. A área abaixo da curva foi de 0,868 (IC 95% = 0,798 a 0,920, p menor que 0,0001) evidenciando um bom poder discriminatório. Estes resultados demonstram que o processo de captura e de análise obtiveram os resultados esperados. O modelo proposto é um método alternativo para auxiliar na dosagem do colesterol total, podendo ser utilizado para desenvolver um equipamento de baixo custo.
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Avaliação do desempenho de modelos preditivos no contexto de análise de sobrevivência / Evaluation of predictive models in survival analysis.

Santos, Tiago Mendonça dos 17 May 2013 (has links)
Modelos estatísticos com objetivos preditivos são frequentemente aplicados como ferramentas no processo de tomadas de decisão em diversas áreas. Uma classe importante de modelos estatísticos é composta por modelos de análise de sobrevivência. Duas quantidades são de interesse nessa classe: o tempo até o instante do evento de interesse ou o status para um determinado instante de tempo fixado. Aplicações importantes desses modelos incluem a identificação de novos marcadores para certas doenças e definição de qual terapia será mais adequada de acordo com o paciente. Os marcadores utilizados podem ser dados por biomarcadores, assim como por marcadores baseados em modelos de regressão. Um exemplo de marcador baseado em modelos de regressão é dado pelo preditor linear. Ainda que a utilização de modelos de sobrevivência com objetivos preditivos seja de suma importância, a literatura nesse assunto é muito esparsa e não há consenso na forma de se avaliar o desempenho preditivo desses. Esse trabalho pretende reunir e comparar diferentes abordagens de se avaliar o desempenho preditivo de modelos de sobrevivência. Essa avaliação é feita principalmente utilizando-se funções de perda para o tempo de sobrevivência e quantidades associadas a diferentes definições de curva ROC para o status. Para a comparação dessas diferentes metodologias foi feito um estudo de simulação e no final aplicou-se essas técnicas em um conjunto de dados de um estudo do Instituto do Câncer de São Paulo. / In many fields, predictive models are often applied as a helpful tool in the decision making process. An important class of predictive models is composed by survival models. Two quantities of special interest in these class are: time until the occurrence of a specified event and survival status for a fixed moment of time. Important applications of these models include new markers identification for certain diseases, as well as defining which therapy is the most appropriated for a patient. Markers can be given by biomarkers, but they can also be derived from regression models. An example of regression models based markers is the linear predictor. Despite the importance of survival models applications with predictive goals, literature is this subject is very sparse and there is no agreement on the best methodology to evaluate predictive performance of these models. In this work we intend to assemble and to compare different methodologies for assessing the predictive performance of survival models. This assessment is made mainly with loss functions for the survival time and ROC curve associated quantities for status. An simulation study was done in order to compare these different methodologies, which were also applied to a study about survival of patients at ICU of ICESP (Instituto do Câncer de São Paulo)
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Padrões de atividade física e proteína C reativa no estudo longitudinal de saúde do adulto (ELSA-Brasil)

Queiroz, Ciro Oliveira January 2013 (has links)
Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio (fiscina@bahia.fiocruz.br) on 2014-09-18T14:01:56Z No. of bitstreams: 1 Ciro Oliveira Queiroz Padrões de atividades... 2013.pdf: 1277176 bytes, checksum: a198eee940e5fba7bc389f439dc5b358 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-18T14:01:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ciro Oliveira Queiroz Padrões de atividades... 2013.pdf: 1277176 bytes, checksum: a198eee940e5fba7bc389f439dc5b358 (MD5) Previous issue date: 2013 / Fundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisa Gonçalo Moniz. Salvador, BA, Brasil / Introdução: A proteína C reativa (PCR) é um biomarcador conhecido da inflamação sistêmica e está associado à predição de doenças cardiovasculares. A atividade física regular tem muitos benefícios, uma vez que reduz o risco do desenvolvimento de diversas doenças crônicas, incluindo as doenças cardiovasculares. Alguns estudos tem mostrado que a atividade física pode estar inversamente associada aos níveis de PCR, entretanto, ainda não se tem um consenso sobre a quantidade de atividade física necessária para manter os níveis de PCR normais. Objetivo: identificar o poder discriminatório e a quantidade de atividade física necessária para discriminar níveis de PCR em adultos. Métodos: estudo transversal com amostra de 14.250 adultos de 35 a 74 anos de idade, participantes do Estudo Longitudinal de Saúde do Adulto. Foram construídas curvas Receiver Operating Characteristic (ROC) para identificar o poder preditivo e os pontos de corte da quantidade de atividade física em dois domínios (tempo livre e deslocamento) e níveis de PCR. Para testar as diferenças entre as áreas sob a curva ROC utilizou-se o teste qui-quadrado considerando-se 5% de nível de significância estatística. Verificou-se a sensibilidade e especificidade para identificar os melhores pontos de corte de atividade física necessários para manter níveis normais de PCR (<3mg/L). Resultados: a maior parte dos participantes tem nível superior completo (53,1%), são da cor branca (52,4%) e tem sobrepeso (40,7%). Com relação a PCR, um quarto da amostra se encontra com níveis elevados (25,2%) e quando comparado por sexo, as mulheres apresentam uma maior proporção. Quando se avaliou a quantidade de atividade física realizada por semana, 57,5% dos participantes do estudo não praticavam no mínimo 10 minutos de atividade física no tempo livre. Encontrou-se significância estatística das áreas sob a curva ROC na soma dos dois domínios investigados e no domínio do tempo livre isoladamente. A atividade física acumulada nos dois domínios durante 200 minutos/semana apresentou o melhor equilíbrio para discriminar os níveis normais de PCR em adultos de ambos os sexos. Conclusão: a prática de atividade física combinada nos domínios do tempo livre e deslocamento podem contribuir para manter os níveis de PCR normais. Esses achados podem contribuir também para a construção de políticas públicas em relação à promoção da atividade física e da saúde. / Background: C-reactive protein (CRP) is a known biomarker of systemic inflammation and is associated with the prediction of cardiovascular disease. Regular physical activity has many benefits, as it reduces the risk of developing several chronic diseases, including cardiovascular disease. Some studies have shown that physical activity may be inversely associated with levels of CRP, however, there isn’t still consensus on the amount of physical activity required to maintain levels of CRP normal. Purpose: Identify the discriminatory power and amount of physical activity required to discriminate levels of CRP in adults. Methods: Cross-sectional study with a sample of 14.250 adults age 35 to 74 years, participating in the Brazilian Longitudinal Study of Adult Health. Receiver Operating Characteristic (ROC) curves was constructed to identify the predictive power and the cutoff of physical activity in two domains (leisure time and displacement) and levels of CRP. To test the differences between the areas under the ROC curve was used the chi-square test considering a 5% significance level. Sensitivity and specificity were observed to identify the best cut-off of physical activity to keep normal levels CRP (<3mg/L). Results: The most participants have completed college (53.1%) are white (52.4%) and is overweight (40.7%). With respect to CRP, a quarter of participants meets high levels (25.2%) and compared by sex, women have a higher proportion. When assessing the amount of physical activity per week, 57.5% of study participants did not practice at least 10 minutes of physical activity during leisure time It was found a statistical significance of the areas under the ROC curve of the sum of the two domains investigated and in the leisure time alone. Physical activity accumulated in the two domains during 200 minutes/week showed the best balance for discriminating normal levels of CRP in adults of both sexes. Conclusion: The physical activity combined in the domains of leisure time and displacement may contribute to keep the levels of CRP normal. These findings may also contribute to the development of public policies regarding promotion of physical activity and health.

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