Orientadores: Mariangela Ribeiro Resende, Maria Luiza Moretti / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-24T01:04:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Ferrari_MichelaDeLuca_D.pdf: 2448021 bytes, checksum: 102166bb9666827fb2f7de549ded2752 (MD5) Previous issue date: 2013 / Resumo: O resumo poderá ser visualizado no texto completo da tese digital / Abstract: The complete abstract is available with the full electronic document / Doutorado / Clinica Medica / Doutora em Clínica Médica

Made available in DSpace on 2015-12-06T23:46:41Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2013 / Candidemia persistente tem sido descrita como uma complicacao do quadro de candidemia, caracterizada pelo isolamento de Candida spp. em amostras sequenciais de hemocultura apos o diagnostico inicial, mesmo em pacientes expostos ao tratamento antifungico adequado. Embora fatores predisponentes relacionados ao hospedeiro ja estejam bem estabelecidos, poucos estudos tem analisado os atributos do patogeno envolvidos no desenvolvimento dessa complicacao. O objetivo do presente estudo foi avaliar a ocorrencia de resistencia as equinocandinas em isolados de Candida spp. provenientes de pacientes com candidemia persistente submetidos a terapia antifungica com esta classe de farmaco. As amostras foram identificadas atraves de sequenciamento da regiao ITS do rDNA. O perfil de susceptibilidade in vitro aos antifungicos foi realizado utilizando metodologia de microdiluicao em caldo (CLSI, documento M27-S4). Alem disso, nos avaliamos a ocorrencia de resistencia a partir do sequenciamento do gene FKS1. Dentre 436 pacientes com candidemia, 63 (14,4%) apresentaram quadros de candidemia persistente, desses, 13 atenderam aos criterios de inclusao estabelecidos no presente estudo. Atraves das identificacoes fenotipica e molecular, foi observado 5 dos 13 pacientes (38,5%) foram infectados por isolados de C. parapsilosis (sensu stricto), 3 (23%) por isolados de C. albicans, 2 (15,4%) por isolados de C. krusei, 1 (7,7%) por isolado de C. tropicalis e 1 (7,7%) teve como agente etiologico da candidemia isolados de C. orthopsilosis. Alem disso, um paciente (7,7%) apresentou episodio de infeccao mista com alternancia de isolamento de duas diferentes especies, C. tropicalis e C. parasilosis (sensu stricto). Em relacao ao perfil de susceptibilidade aos antifungicos, a grande maioria dos isolados foi classificada como sensivel a todos os antifungicos testados, com excecao dos cinco isolados de C. krusei provenientes dos pacientes 2 (dois isolados) e 10 (tres isolados), os quais apresentaram resistencia ao fluconazol e a caspofungina, sendo que dois deles foram intermediarios a anidulafungina. Nao foi verificado aumento de valores de CIM entre os isolados sequenciais de um mesmo paciente a despeito do tratamento antifungico utilizado. Nenhum dos isolados apresentou mutacao nas regioes dos HS1 e HS2 do gene FKS1, sendo classificados como selvagens em relacao aos genotipos de resistencia ja descritos. Por outro lado, os isolados de C. krusei apresentaram mutacao nao sinonima em regiao muito proxima ao HS1, o que poderia, ao menos em parte, explicar o desfecho clinico negativo durante tratamento com equinocandinas e os elevados valores de CIM observados para estes isolados. Os dados obtidos no presente estudo mostram que a ocorrencia de resistencia as equinocandinas ainda permanece rara em nosso meio, mesmo quando analisada em coorte de pacientes com risco elevado a ocorrencia de tal fenomeno. Por fim, conclui-se que as caracteristicas clinicas do paciente parecem ter maior relevancia que os mecanismos de resistencia as equinocandinas no que se refere a ocorrencia de candidemia persistente / BV UNIFESP: Teses e dissertações

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Saúde Coletiva, Florianópolis, 2015. / Made available in DSpace on 2016-04-15T13:16:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 337724.pdf: 1611978 bytes, checksum: 18168a210679de660fafe85ec5ad4b21 (MD5) Previous issue date: 2015 / As infecções relacionadas à assistência à saúde (IRAS) estão entre as principais causas de morbidade e mortalidade hospitalar, com elevados tempo de internação e custos de tratamento. As infecções de corrente sanguínea representam uma das principais causas de infecções nosocomiais e, portanto, são alvos prioritários das medidas de controle e prevenção. As leveduras Candida têm grande importância devido à alta freqüência que podem colonizar e infectar os seres humanos e disseminar a infecção através da corrente sanguínea (candidemia). As espécies Candida têm propriedades específicas que podem influenciar a resposta terapêutica aos agentes antifúngicos. Assim, a identificação das espécies envolvidas nos epísódios de candidemia e a determinação do perfil de suscetibilidade antifúngica podem definir as decisões terapêuticas apropriadas e melhorar o desfecho clínico dos pacientes. Este estudo longitudinal retrospectivo, baseado em dados secundários, objetivou descrever a ocorrência de IRAS e determinar o perfil epidemiológico da candidemia no Hospital Universitário da Universidade Federal de Santa Catarina (HU-UFSC) no período de janeiro de 2009 a dezembro de 2013.<br> / Abstract : Healthcare-associated infections (HAIs) are among the leading causes of morbidity and mortality, with high length of stay and treatment costs. Bloodstream infections present a major cause of nosocomial infections and are therefore, high priority targets for control and prevention measures. Candida yeasts have great importance due to their facility in colonizing and infecting humans, and spreading infection through the bloodstream (candidemia). Candida species have specific properties that can influence the therapeutic response to antifungal agentes. Thus, the identification of the species involved in episodes of candidemia and the determination of the antifungal susceptibility profile can help finding optimal treatment decisions and improve the clinical outcomes. This longitudinal retrospective study, based on secondary data, aimed to describe the occurrence of IRAS and determine the epidemiological profile of candidemia in the University Hospital of the Federal University of Santa Catarina (HU-UFSC) from January 2009 to December 2013.

Submitted by Pedro Barros (pedro.silvabarros@ufpe.br) on 2018-08-07T17:35:30Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Renata Baltar da Silva.pdf: 1613088 bytes, checksum: 8fec2a7eed707edd49f18f2c26930d9c (MD5) / Approved for entry into archive by Alice Araujo (alice.caraujo@ufpe.br) on 2018-08-15T21:04:09Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Renata Baltar da Silva.pdf: 1613088 bytes, checksum: 8fec2a7eed707edd49f18f2c26930d9c (MD5) / Made available in DSpace on 2018-08-15T21:04:09Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 811 bytes, checksum: e39d27027a6cc9cb039ad269a5db8e34 (MD5) DISSERTAÇÃO Renata Baltar da Silva.pdf: 1613088 bytes, checksum: 8fec2a7eed707edd49f18f2c26930d9c (MD5) Previous issue date: 2017-06-28 / Candidemias são infecções fúngicas caracterizadas pela presença de espécies de Candida na corrente sanguínea de pacientes. Cerca de 38% das infeções fúngicas são diagnosticadas durante a permanência de pacientes em Unidades de Terapia Intensiva (UTIs). O objetivo deste trabalho foi descrever as características epidemiológicas das candidemias e determinar os principais fatores de risco da doença em pacientes críticos. Este estudo prospectivo, transversal e observacional foi desenvolvido de janeiro de 2015 a julho de 2016, através da análise descritiva dos resultados de hemoculturas e da revisão dos prontuários médicos de pacientes internados na UTI de um Hospital Público Terciário do Nordeste do Brasil. Foram incluídos no estudo aqueles pacientes com sinais e sintomas de sepse, que tiveram um resultado confirmado de candidemia em hemocultura. Ocorreram 1.573 admissões no período estudado e 4.129 hemoculturas foram realizadas. A incidência de candidemia foi de 42,59 casos para cada 1000 admissões na UTI. A maioria dos pacientes era do sexo masculino (53,3%), com idade superior a 65 anos e permaneceram internados por período prolongado superior a 7 dias (86,6%). A infecção por Candida não-albicans foi predominante em 60% das hemoculturas. A mortalidade encontrada foi de 80% dos pacientes com candidemia. Antibioticoterapia de largo espectro foi prescrita em 98,4% dos pacientes. Entre os diagnósticos observados, sepse (73,3%), doença respiratória (60%) e doença do trato urinário (56,6%) foram os mais frequentes tanto em homens, quanto em mulheres, além de presença de tumores sólidos (15%) e doenças do trato gastrointestinal (23,3%). Procedimentos cirúrgicos foram realizados em 43% dos pacientes. Destes, 23,3% foram submetidos a cirurgias abdominais e tiveram mortalidade de 92,8%. Outros fatores de risco foram acesso venoso central (93,3%), ventilação mecânica (81,6%), sonda nasoenteral (83,3%), sonda nasogástrica (25%), sonda vesical de demora (88,3%), diabetes mellitus (38,3%), hemotransfusão (55%) e traqueostomia (36,6%). Os resultados sugerem que existe uma correlação positiva entre a presença de sonda vesical e o desfecho clínico de óbito (r = 0.07412, p = 0.0353). Observa-se a necessidade de uma adequada interação entre as equipes multidisciplinares assistenciais de cuidados intensivos, para um controle de infecções e diagnóstico laboratorial, que deve ser associado a suspeita de um diagnóstico clínico e a determinação de fatores de risco, de colonização por Candida spp. e da gravidade do quadro clínico para um desfecho mais favorável. / Candidemias are fungal infections characterized by the presence of Candida species in the bloodstream of patients. About 38% of fungal infections are diagnosed during the stay of patients in Intensive Care Units (ICUs). This prospective, transversal and observational study was carried out from January 2015 to July 2016, involving the descriptive analysis of the results of blood cultures and through the review of medical records of critically ill patients admitted to the ICU of a Tertiary Public Hospital in the Northeasthn. The objective of this work was to describe the epidemiological characteristics of candidemia and determine the main risk factors of the disease in critically ill patients. The study included those patients with signs and symptoms of sepsis, who had a confirmed result of candidemia in blood culture. There were 1,573 admissions during the study period and 4,129 blood cultures were performed. The incidence of candidemia was 42.59 cases per 1000 admissions in the ICU. The patients were male (53.3%), older than 65 years and were hospitalized for an extended period (86.6%). Candida non-albicans infection was predominant in 60% of blood cultures. Mortality was 80% of patients with candidemia. Broad spectrum antibiotic therapy was prescribed in 98.4% of patients. Among the diagnoses observed, sepsis (73.3%), respiratory disease (60%) and urinary tract disease (56.6%) were the most frequent in both men and women, besides the presence of solid tumors (15 %) Diseases of the gastrointestinal tract (23.3%). Surgical procedures were performed in 43% of the patients. Of these, 23.3% were submitted to abdominal surgeries and had a mortality rate of 92.8%. Other risk factors were central venous access (93.3%), mechanical ventilation (81.6%), nasoenteral catheter (83.3%), nasogastric tube (25%), vesical catheter delay (88.3%), , Diabetes mellitus (38.3%), hemotransfusion (55%) and tracheostomy (36.6%). The results suggest that there is a positive correlation between the presence of bladder catheter and the clinical outcome of death (r = 0.07412, p = 0.0353). It is observed the need for an adequate interaction between multidisciplinary care intensive care teams for infection control and laboratory diagnosis, which should be associated with suspicion of a clinical diagnosis and the determination of risk factors for colonization by Candida spp. and the severity of the clinical picture for a more favorable outcome..

No description available.

As leveduras do gênero Candida são responsáveis por 80% das infecções fúngicas sistêmicas. Nas Unidades de Terapia Intensiva, essas leveduras estão envolvidas em aproximadamente 17% das infecções. Essas doenças aumentam o tempo de hospitalização, resultando em aumento de gastos; além disso, as infecções sistêmicas causadas por Candida spp. apresentam elevada taxa de mortalidade. A candidemia representa grande parte das candidíases invasivas e sua epidemiologia pode variar de acordo com o local de estudo, práticas hospitalares e país estudado. Assim, o objetivo do presente estudo foi caracterizar 79 isolados de candidemia de pacientes internados no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto de junho de 2014 a novembro de 2015. Para isso, os isolados foram submetidos a testes de microdiluição em caldo para a determinação da Concentração Inibitória Mínima dos antifúngicos anfotericina B, caspofungina, fluconazol e voriconazol; testes para avaliar a produção de fatores de virulência: hemolisina, fosfolipase e proteinase; e genotipagem por Pulsed-field Gel Electrophoresis, Microsatellite Length Polymorphism e Multilocus Sequence Typing. Como esperado, C. albicans foi a espécie predominante (44%), seguida por C. glabrata (19%), C. tropicalis (19%), C. parapsilosis (14%) e C. orthopsilosis (4%). Os isolados, em geral, não apresentaram resistência aos antifúngicos testados. Entretanto, todos os isolados de C. glabrata e um isolado de C. parapsilosis apresentaram-se suscetíveis dose-dependentes ao fluconazol, três isolados de C. glabrata foram suscetíveis dose-dependentes à caspofungina, um isolado de C. albicans foi suscetível dose-dependente ao voriconazol e um isolado de C. albicans apresentou-se resistente ao fluconazol e voriconazol. Os isolados da espécie C. albicans foram os principais produtores de fatores de virulência. Os resultados dos testes de genotipagem indicaram a espécie C. glabrata apresentou menor variabilidade genética. A incidência de candidemia no período estudado foi de 1,52/1000 admissões e a taxa de mortalidade foi de 52%. O principal fator de risco foi antibioticoterapia (86%), seguido de sonda vesical (68%), acesso venoso central (60%), cirurgias (54%), nutrição parenteral (42%) e neutropenia (14%). Das doenças de base, o câncer sólido estava presente em 28% dos pacientes, seguido por diabetes (23%), doenças gastrointestinais (20%) e doenças hepáticas (15%). Finalmente, os resultados obtidos são úteis para o melhor entendimento do perfil da candidemia no hospital estudado e podem auxiliar na escolha da terapia empírica para essa doença / Candida spp. are responsible for 80% of all systemic fungal infections. In the Intensive Care Units, these yeasts are present in 17% of all infections. These diseases result in extended hospitalization, leading to increased hospital costs; besides, the systemic infections caused by Candida spp. are related to high mortality rates. Candidemia is the main invasive candidiasis and its epidemiology may vary among study location, local healthcare practices and studied countries. Therefore, the aim of this study was to characterize 79 bloodstream isolates from patients of the Hospital das Clínicas of Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, from June 2014 to November 2015. The Minimal Inhibitory Concentration of amphotericin B, caspofungin, fluconazole and voriconazole was determined using broth microdilution; virulence factor production was analyzed; and the strains were typed by Pulsed-field Gel Electrophoresis, Microsatellite Length Polymorphism and Multilocus Sequence Typing. As expected, C. albicans was the most predominant species (44%), followed by C. glabrata (19%), C. tropicalis (19%), C. parapsilosis (14%) and C. orthopsilosis (4%). In general, the strains did not show resistance to the tested antifungals. However, all C. glabrata and one C. parapsilosis isolates exhibited dose-dependent susceptibility to fluconazole, three C. glabrata isolates exhibited dose-dependent susceptibility to caspofungin, one C. albicans isolate was susceptible dose-dependent to voriconazole and one C. albicans isolate was resistant to fluconazole and voriconazole. Candida albicans strains were the main virulence attributes producer. C. glabrata isolates showed less genetic variability than the others studied species. The candidemia incidence was 1.52 per 1,000 admissions, and the mortality rate was 52%. The main risk factors were antibiotic therapy (86%), followed by urinary catheterization (68%), central venous access (60%), surgical procedures (54%), parenteral nutrition (42%) and neutropenia (14%). The most common underlying diseases were solid cancer (28%), diabetes (23%), gastrointestinal disease (20%) and liver disease (15%). Finally, the results are useful to bring a better comprehension of candidemia in the studied hospital and can help in the identification of efficient empirical treatment strategies

INTRODUÇÃO: Embora Candida albicans continue sendo a espécie mais isolada na sepse fúngica do recém-nascido (RN), a recuperação de espécies não-albicans vem aumentando significativamente, sobretudo nos últimos anos. OBJETIVOS: Verificar a prevalência das espécies de Candida, principalmente do complexo C. parapsilosis em RN infectados por estes agentes, a apresentação clínica, o desfecho (alta ou óbito), o diagnóstico molecular e o perfil de susceptibilidade in vitro à antifúngicos. CASUISTICA E METODOS: Trata-se de estudo retrospectivo observacional, aprovado pelos Comitês de Pesquisa dos hospitais estudados na cidade de Cuiabá com ciência da CAPpesq do Hospital das clínicas da FMUSP. O período de análise dos dados registrados nos prontuários foi de 2006 a 2012 e foram incluídos 54 RN no estudo. Todos eles tinham hemocultura positiva para fungos e apresentavam sinais clínicos de sepse, segundo critérios de Goldstein et al. (2005) sem melhora com antibioticoterapia. Foram excluídos os RN com hemoculturas positivas para bactérias no mesmo período ou com hemocultura negativa. Para isolamento dos fungos foram utilizados a hemocultura para fungos, e nos casos de C. parapsilosis a caracterização molecular dos isolados foi realizada em duplicata, por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o teste de susceptibilidade in vitro a antifúngicos foi realizado empregando-se o método do Etest. RESULTADOS: A prevalência geral foi de 1,66% IC 95% [1,25%; 2,16% ] e a de C. parapsilosis (lato senso) 0,77% (IC 95% [0,50% ; 1,14%]), superior ao observado na literatura. Do complexo C. parapsilosis foi identificada a C. orthopsilosis, isolada pela primeira vez na cidade do Cuiába em RN como agente etiológico de infecção. O encontro de C. orthopsilosis, em nosso estudo foi de 11,1% valor semelhante ao percentual isolado em outros estudos na América Latina. As manifestações clínicas em ordem de frequência foram hipertermia, hipotermia e plaquetopenia e nestes pacientes foi estatisticamente significante o uso de cateter venoso central (p < 0,001), nutrição parenteral (p < 0,001) e ventilação mecânica (p < 0,001). Todos os isolados de C.parapsilosis lato sensu apresentaram sensibilidade in vitro aos três antifúngicos testados (anfoterina B, micafungina, voriconazol). A taxa de mortalidade foi de 24%. CONCLUSÕES: O aumento da infecção fúngica nos RN internados nas Unidades de Cuidados Intensivos Neonatais torna obrigatório este tipo de estudo, pois contribui para conhecer os aspectos epidemiológicos, os defechos clínicos (alta ou óbito), os fatores associados a este tipo de infecção além da susceptibilidade aos antifúngicos e são de grande importância para auxiliarem nos programas de controle de infecção hospitalar / INTRODUCTION: Although Candida albicans remains the most frequent species in fungal sepsis of newborn, the recovery of non-albicans species has increased significantly, especially in recent years. OBJECTIVES: To determine the prevalence of Candida species, mainly C. parapsilosis Complex in infants infected by these agents, clinical presentation, outcome (discharge or death), molecular diagnosis and susceptibility profile in vitro to antifungal agents. METHODS: This is a retrospective observational study approved by the Research Committees of the hospitals studied in the city of Cuiabá with science CAPPesq do Hospital das Clínicas da FMUSP. The period of analysis of data from medical records was 2006-2012 and 54 infants were included in the study. All of them had positive blood cultures for fungi and clinical signs of sepsis, according to criteria of Goldstein et al., (2005 ) and did not improve with antibiotic therapy. The newborns excluded were than them have blood negatives for bacterial in the same period. For isolation of the fungi blood cultures were used, and in cases of C. parapsilosis, were done molecular characterization and were performed in duplicate by polymerase chain reaction ( PCR) and susceptibility testing of antifungal in vitro was performed employing the Etest method . RESULTS : The overall prevalence was 1.66 % CI 95 % [ 1.25 % ; 2.16 % ] and C. parapsilosis (sensu lato ) 0.77 % ( 95% CI [ 0.50 % , 1.14 % ] ) , higher than that observed in the literature. In the parapsilosis complex was identified C. orthopsilosis. This is the first isolated in the Cuiabá city in one newborn as the etiological agent of infection. The finding of C. orthopsilosis in our study was 11.1 % the same to the percentage isolated in other studies in Latin America. Clinical manifestations in order of frequency were hyperthermia, hypothermia and thrombocytopenia. The use of of central venous catheter (p < 0.001), parenteral nutrition (p < 0.001) and mechanical ventilation (< 0.001) have statistical significance with p value <0,01 . All isolates of C. parapsilosis sensu lato were susceptible in vitro to three antifungal agents tested (anfoterina B, micafungin, voriconazole) . The mortality rate was 24 %. CONCLUSIONS: The increase in fungal infection in infants hospitalized in the Neonatal Intensive Care Units mandating this type of study because it helps to know the epidemiological, clinical aspects (discharge or death), factors associate beyond susceptibility to antifungal agents and are of great importance to aid in the hospital infection control programs

INTRODUÇÃO: Embora Candida albicans continue sendo a espécie mais isolada na sepse fúngica do recém-nascido (RN), a recuperação de espécies não-albicans vem aumentando significativamente, sobretudo nos últimos anos. OBJETIVOS: Verificar a prevalência das espécies de Candida, principalmente do complexo C. parapsilosis em RN infectados por estes agentes, a apresentação clínica, o desfecho (alta ou óbito), o diagnóstico molecular e o perfil de susceptibilidade in vitro à antifúngicos. CASUISTICA E METODOS: Trata-se de estudo retrospectivo observacional, aprovado pelos Comitês de Pesquisa dos hospitais estudados na cidade de Cuiabá com ciência da CAPpesq do Hospital das clínicas da FMUSP. O período de análise dos dados registrados nos prontuários foi de 2006 a 2012 e foram incluídos 54 RN no estudo. Todos eles tinham hemocultura positiva para fungos e apresentavam sinais clínicos de sepse, segundo critérios de Goldstein et al. (2005) sem melhora com antibioticoterapia. Foram excluídos os RN com hemoculturas positivas para bactérias no mesmo período ou com hemocultura negativa. Para isolamento dos fungos foram utilizados a hemocultura para fungos, e nos casos de C. parapsilosis a caracterização molecular dos isolados foi realizada em duplicata, por reação em cadeia da polimerase (PCR) e o teste de susceptibilidade in vitro a antifúngicos foi realizado empregando-se o método do Etest. RESULTADOS: A prevalência geral foi de 1,66% IC 95% [1,25%; 2,16% ] e a de C. parapsilosis (lato senso) 0,77% (IC 95% [0,50% ; 1,14%]), superior ao observado na literatura. Do complexo C. parapsilosis foi identificada a C. orthopsilosis, isolada pela primeira vez na cidade do Cuiába em RN como agente etiológico de infecção. O encontro de C. orthopsilosis, em nosso estudo foi de 11,1% valor semelhante ao percentual isolado em outros estudos na América Latina. As manifestações clínicas em ordem de frequência foram hipertermia, hipotermia e plaquetopenia e nestes pacientes foi estatisticamente significante o uso de cateter venoso central (p < 0,001), nutrição parenteral (p < 0,001) e ventilação mecânica (p < 0,001). Todos os isolados de C.parapsilosis lato sensu apresentaram sensibilidade in vitro aos três antifúngicos testados (anfoterina B, micafungina, voriconazol). A taxa de mortalidade foi de 24%. CONCLUSÕES: O aumento da infecção fúngica nos RN internados nas Unidades de Cuidados Intensivos Neonatais torna obrigatório este tipo de estudo, pois contribui para conhecer os aspectos epidemiológicos, os defechos clínicos (alta ou óbito), os fatores associados a este tipo de infecção além da susceptibilidade aos antifúngicos e são de grande importância para auxiliarem nos programas de controle de infecção hospitalar / INTRODUCTION: Although Candida albicans remains the most frequent species in fungal sepsis of newborn, the recovery of non-albicans species has increased significantly, especially in recent years. OBJECTIVES: To determine the prevalence of Candida species, mainly C. parapsilosis Complex in infants infected by these agents, clinical presentation, outcome (discharge or death), molecular diagnosis and susceptibility profile in vitro to antifungal agents. METHODS: This is a retrospective observational study approved by the Research Committees of the hospitals studied in the city of Cuiabá with science CAPPesq do Hospital das Clínicas da FMUSP. The period of analysis of data from medical records was 2006-2012 and 54 infants were included in the study. All of them had positive blood cultures for fungi and clinical signs of sepsis, according to criteria of Goldstein et al., (2005 ) and did not improve with antibiotic therapy. The newborns excluded were than them have blood negatives for bacterial in the same period. For isolation of the fungi blood cultures were used, and in cases of C. parapsilosis, were done molecular characterization and were performed in duplicate by polymerase chain reaction ( PCR) and susceptibility testing of antifungal in vitro was performed employing the Etest method . RESULTS : The overall prevalence was 1.66 % CI 95 % [ 1.25 % ; 2.16 % ] and C. parapsilosis (sensu lato ) 0.77 % ( 95% CI [ 0.50 % , 1.14 % ] ) , higher than that observed in the literature. In the parapsilosis complex was identified C. orthopsilosis. This is the first isolated in the Cuiabá city in one newborn as the etiological agent of infection. The finding of C. orthopsilosis in our study was 11.1 % the same to the percentage isolated in other studies in Latin America. Clinical manifestations in order of frequency were hyperthermia, hypothermia and thrombocytopenia. The use of of central venous catheter (p < 0.001), parenteral nutrition (p < 0.001) and mechanical ventilation (< 0.001) have statistical significance with p value <0,01 . All isolates of C. parapsilosis sensu lato were susceptible in vitro to three antifungal agents tested (anfoterina B, micafungin, voriconazole) . The mortality rate was 24 %. CONCLUSIONS: The increase in fungal infection in infants hospitalized in the Neonatal Intensive Care Units mandating this type of study because it helps to know the epidemiological, clinical aspects (discharge or death), factors associate beyond susceptibility to antifungal agents and are of great importance to aid in the hospital infection control programs

Essa tese teve como objetivo avaliar todos os casos de candidose sistêmica por Candida albicans identificadas através de kit comercial ID 32C® (bioMérieux), diagnosticados no Laboratório de Micologia da Santa Casa de Misericórdia de Porto Alegre/RS, durante o período de 1999 a 2009, buscando identificar a prevalência de C. dubliniensis, bem como avaliar os fatores de virulência e diferença de perfil de suscetibilidade antifúngica entre os isolados clínicos. Foi realizado um levantamento clínico-epidemiológico dos casos incluídos no estudo, avaliando sexo, idade, manifestações clínicas, evolução, região proveniente do paciente, doença de base, condições predisponentes, utilização de corticóides e antibióticos e resposta ao tratamento recebido. Para a diferenciação das duas espécies utilizou-se testes fenotípicos (arranjo dos clamidosporos, teste de termotolerância, formação do tubo germinativo, crescimento em meio hipertônico e niger), molecular (espectrometria de massa) e genotípico (reação em cadeia da polimerase - PCR). Em adição, foi avaliada a eficácia do método de conservação das leveduras estocadas a -20ºC e comparamos quatro substratos (soro fresco, soro congelado, ágar e caldo Mueller-Hinton) para a prova do tubo germinativo. Determinou-se a produção da fosfolipase e proteinase em isolados incluídos no estudo. A atividade in vitro dos antifúngicos fluconazol, anfotericina B e anidulafungina frente aos isolados estudados foi determinada através da concentração inibitória mínima (CIM), a concentração fungicida mínima (CFM) e ponto de corte epidemiológico (ECV). Os casos de candidemia por C. albicans diagnosticados durante 10 anos ocorreram com maior frequência em pacientes adultos com presença de cateteres. Observamos que houve maior chance de ocorrência desta em pacientes oncológicos. O percentual de alta nos pacientes foi baixo. O método utilizado para a conservação de leveduras nesse estudo apresentou taxa de 70% de viabilidade. O ágar e o caldo Mueller-Hinton demonstraram sensibilidade de 90% e especificidade de 100%. Os isolados de C. albicans provenientes de hemocultivos apresentaram produção de fosfolipase em 78% e proteinase em 97% dos isolados. A espécie C. dubliniensis não foi identificada em isolados de hemocultivos, sendo todos os casos de candidemia por C. albicans. Os testes microcultivo em ágar fubá, espectrometria de massa, caldo niger e caldo hipertônico concordaram com o teste genotípico. Os isolados de C. albicans apresentaram maior suscetibilidade a anidulafungina, entretanto, os menores valores obtidos em 90% dos isolados (CIM90) foi pela anfotericina B. E através do ECV, os isolados poderiam ser resistentes ao fluconazol, demonstrando a importância da associação desses dois parâmetros. / The aim this tesis was to evaluate systemic candidiasis cases by Candida albicans through ID 32C® (bioMérieux), at Mycology Laboratory of the Santa Casa de Porto Alegre/RS, during 1999 to 2009, seeking to identify the C. dubliniensis prevalence, as well as evaluating the virulence factors and antifungal susceptibility profile difference of among isolates. The clinical and epidemiological survey was made through gender, age, clinical manifestations, evolution, patient's region, underlying disease, predisposing conditions, steroids and antibiotics use, and response to treatment. The phenotypic tests (tthermotolerance, germ tube, hypertonic and Niger medium), molecular (mass spectrometry) and genotypic (polymerase chain reaction – PCR) was used for two species identification. We also assessed if the mantainance of C. albicans stored at - 20ºC in a freezer with sterile distilled water was usefull.The four substrate (fresh and frozen serum, agar and broth Mueller-Hinton®) were used for germ tube formation and the phospholipase and proteinase activity were evaluated. The in vitro activity of fluconazole, amphotericin B and anidulafungin were compared through the minimum inhibitory concentration (MIC), the minimum fungicidal concentration (MFC) and epidemiological cutoff value (ECV). The candidemia cases by C. albicans for ten years occurred more frequently in adult and catheters use. We observed the more chance this occurrence in cancer patients. The survival percentage was low. The used method in the study for yeast stored had 70% of viability. The agar and broth Mueller-Hinton were 90% sensitivity and 100% specificity. The boodstream isolates of C. albicans produce virulence factors, such the germ tube production and hydrolytic enzymes (78% of phospholipase and 97% of protease) production. The C. dubliniensis was not identified in bloodstream isolates, thus all candidemia cases were by C. albicans. The mass spectrometry, cornmeal agar, Niger and hypertonic broth agreed with genotypic test. The isolates exhibited more susceptibility to anidulafungin, and 90% of them (MIC90) exhibited the lowest values against amphotericin B. Based on ECV and Pfaller classification, isolates could be resistant to fluconazole, demonstrating the importance of the combination of these parameters.

Essa tese teve como objetivo avaliar todos os casos de candidose sistêmica por Candida albicans identificadas através de kit comercial ID 32C® (bioMérieux), diagnosticados no Laboratório de Micologia da Santa Casa de Misericórdia de Porto Alegre/RS, durante o período de 1999 a 2009, buscando identificar a prevalência de C. dubliniensis, bem como avaliar os fatores de virulência e diferença de perfil de suscetibilidade antifúngica entre os isolados clínicos. Foi realizado um levantamento clínico-epidemiológico dos casos incluídos no estudo, avaliando sexo, idade, manifestações clínicas, evolução, região proveniente do paciente, doença de base, condições predisponentes, utilização de corticóides e antibióticos e resposta ao tratamento recebido. Para a diferenciação das duas espécies utilizou-se testes fenotípicos (arranjo dos clamidosporos, teste de termotolerância, formação do tubo germinativo, crescimento em meio hipertônico e niger), molecular (espectrometria de massa) e genotípico (reação em cadeia da polimerase - PCR). Em adição, foi avaliada a eficácia do método de conservação das leveduras estocadas a -20ºC e comparamos quatro substratos (soro fresco, soro congelado, ágar e caldo Mueller-Hinton) para a prova do tubo germinativo. Determinou-se a produção da fosfolipase e proteinase em isolados incluídos no estudo. A atividade in vitro dos antifúngicos fluconazol, anfotericina B e anidulafungina frente aos isolados estudados foi determinada através da concentração inibitória mínima (CIM), a concentração fungicida mínima (CFM) e ponto de corte epidemiológico (ECV). Os casos de candidemia por C. albicans diagnosticados durante 10 anos ocorreram com maior frequência em pacientes adultos com presença de cateteres. Observamos que houve maior chance de ocorrência desta em pacientes oncológicos. O percentual de alta nos pacientes foi baixo. O método utilizado para a conservação de leveduras nesse estudo apresentou taxa de 70% de viabilidade. O ágar e o caldo Mueller-Hinton demonstraram sensibilidade de 90% e especificidade de 100%. Os isolados de C. albicans provenientes de hemocultivos apresentaram produção de fosfolipase em 78% e proteinase em 97% dos isolados. A espécie C. dubliniensis não foi identificada em isolados de hemocultivos, sendo todos os casos de candidemia por C. albicans. Os testes microcultivo em ágar fubá, espectrometria de massa, caldo niger e caldo hipertônico concordaram com o teste genotípico. Os isolados de C. albicans apresentaram maior suscetibilidade a anidulafungina, entretanto, os menores valores obtidos em 90% dos isolados (CIM90) foi pela anfotericina B. E através do ECV, os isolados poderiam ser resistentes ao fluconazol, demonstrando a importância da associação desses dois parâmetros. / The aim this tesis was to evaluate systemic candidiasis cases by Candida albicans through ID 32C® (bioMérieux), at Mycology Laboratory of the Santa Casa de Porto Alegre/RS, during 1999 to 2009, seeking to identify the C. dubliniensis prevalence, as well as evaluating the virulence factors and antifungal susceptibility profile difference of among isolates. The clinical and epidemiological survey was made through gender, age, clinical manifestations, evolution, patient's region, underlying disease, predisposing conditions, steroids and antibiotics use, and response to treatment. The phenotypic tests (tthermotolerance, germ tube, hypertonic and Niger medium), molecular (mass spectrometry) and genotypic (polymerase chain reaction – PCR) was used for two species identification. We also assessed if the mantainance of C. albicans stored at - 20ºC in a freezer with sterile distilled water was usefull.The four substrate (fresh and frozen serum, agar and broth Mueller-Hinton®) were used for germ tube formation and the phospholipase and proteinase activity were evaluated. The in vitro activity of fluconazole, amphotericin B and anidulafungin were compared through the minimum inhibitory concentration (MIC), the minimum fungicidal concentration (MFC) and epidemiological cutoff value (ECV). The candidemia cases by C. albicans for ten years occurred more frequently in adult and catheters use. We observed the more chance this occurrence in cancer patients. The survival percentage was low. The used method in the study for yeast stored had 70% of viability. The agar and broth Mueller-Hinton were 90% sensitivity and 100% specificity. The boodstream isolates of C. albicans produce virulence factors, such the germ tube production and hydrolytic enzymes (78% of phospholipase and 97% of protease) production. The C. dubliniensis was not identified in bloodstream isolates, thus all candidemia cases were by C. albicans. The mass spectrometry, cornmeal agar, Niger and hypertonic broth agreed with genotypic test. The isolates exhibited more susceptibility to anidulafungin, and 90% of them (MIC90) exhibited the lowest values against amphotericin B. Based on ECV and Pfaller classification, isolates could be resistant to fluconazole, demonstrating the importance of the combination of these parameters.