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Uma abordagem baseada em técnicas de visualização de informações para avaliação de características de imagens e aplicações / Approach based on information visualization techniques for evaluation of image features and applications

Cruz, Laura Elizabeth Florian 24 September 2012 (has links)
Na maioria dos processos de análise de imagens há a necessidade de um pré-processamento, no qual são extraídos e calculados vetores de características que representem as imagens são utilizados no cálculo de similaridade. Uma dificuldade nessas tarefas é o grande número de características que definem um espaço de alta dimensionalidade, afetando fortemente o desempenho das tarefas que seguem, que podem envolver uma análise visual, um agrupamento ou uma classificação de dados, por exemplo. Lidar com esse problema normalmente exige técnicas de redução de dimensionalidade ou seleção de características. O presente trabalho dá sequência a trabalhos que utilizam técnicas de visualização como suporte para avaliar espaços de características gerados a partir de coleções de imagens. Nele, objetiva-se aprimorar um método baseado na análise visual de conjuntos de imagens empregando a árvore de similaridade Neighbor-Joining que apoia o usuário a selecionar um subespaço de características que mantenha ou melhore os resultados das visualizações do conjunto de imagens. A partir da metodologia proposta, a avaliação e a seleção de características representativas é realizada usando a visualização NJ. A maior parte dos experimentos responde positivamente para diferentes conjuntos de imagens representados por vários extratores, obtendo-se processos de seleção personalizados mais precisos e eficazes, em termos de agrupamento, do que abordagens automáticas reportadas na literatura / In the majority of the image analysis processes there is need for a pre-processing step, in which feature vectors representative of the images are extracted and similarity methods are calculates. A difficult step in the process is to choose amongst the large number of features available, that will define a feature space of high dimensionality, impacting the cost of the subsequent processing tasks, such as visual analysis, clustering and classification. This problem is usually handled by dimension reduction of feature selection techniques. This work extends and improves previous work that employs visualization and visual analysis techniques to support evaluation of feature spaces created from image collections. The goal is to improve a previous method of feature selection through visualization to employ similarity trees via the Neighbor Joining (NJ) algorithm as the basis for the visual layout, as well as to improve the choices of the analyst regarding tools for visual selection of features. The same process can be employed to support evaluation of feature spaces using the NJ visualization. The majorities of experiments results in improvement of spaces generated by various extractors, yielding personalized selection process that are more precisely related to user\'s perspective of the data set and are perform similarly or better than automatic approaches available in the literature. Keywords: information visualization, mining, visual images, visual analysis of the feature space, similarity trees
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Diagnóstico de câncer de mama em imagens mamográficas através de características locais e invariantes / Diagnosis of breast cancer in images mammography through local features and invariants

MATOS, Caio Eduardo Falcão 08 February 2017 (has links)
Submitted by Maria Aparecida (cidazen@gmail.com) on 2017-04-27T13:46:48Z No. of bitstreams: 1 Caio Eduardo Falcão Matos.pdf: 1884390 bytes, checksum: a5489f8f52a87e6c5958458ed5470488 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-27T13:46:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Caio Eduardo Falcão Matos.pdf: 1884390 bytes, checksum: a5489f8f52a87e6c5958458ed5470488 (MD5) Previous issue date: 2017-02-08 / Breast cancer is one of the leading causes of death among women over the world. The high mortality rates that cancers achieves across the world highlight the importance of developing and investigating the means for the early detection and diagnosis of this disease. Computer Detection and Diagnosis Systems (Computer Assisted Detection / Diagnosis) have been used and proposed as a way to help health professionals. This work proposes a new methodology for discriminating patterns of malignancy and benignity of masses in mammography images by analysis of local characteristics. To do so, it is proposed a combined methodology of feature detectors and descriptors with a model of data representation for an analysis. The goal is to capture both texture and geometry in areas of mammograms. We use the SIFT, SURF and ORB detectors, and the descriptors HOG, LBP, BRIEF and Haar Wavelet. The generated characteristics are coded by a bag of features model to provide a new representation of the data and therefore decrease a dimensionality of the space of characteristics. Finally, this new representation is classified using three approaches: Support Vector Machine, Random Forest, and Adaptive Boosting to differentiate as malignant and benign masses. The methodology provides promising results for the diagnosis of malignant and benign mass encouraging that as local characteristics generated by descriptors and detectors produce a satisfactory a discriminating set. / O câncer de mama é apontado como uma das principais causas de morte entre as mulheres. As altas taxas de mortalidade e registros de ocorrência desse câncer em todo o mundo evidenciam a importância do desenvolvimento e investigação de meios para a detecção e diagnóstico precoce dessa doença. Sistemas de Detecção e Diagnóstico auxiliados por computador (Computer Aided Detection/Diagnosis) vêm sendo usados e propostos como forma de auxílio aos profissionais de saúde. Este trabalho propõe uma metodologia para discriminação de padrões de malignidade e benignidade de massas em imagens de mamografia através da análise de características locais. Para tanto, a metodologia combina detectores e descritores de características locais com um modelo de representação de dados para a análise, tanto de textura quanto de geometria em regiões extraídas das mamografias. São utilizados os detectores SIFT, SURF e ORB, e descritores HOG, LBP, BRIEF e Haar Wavelet. Com as características geradas é aplicado o modelo Bag of Features em uma etapa de representação que objetiva prover nova representação dos dados e por conseguinte diminuir a dimensionalidade do espaço de características. Por fim, esta nova representação é classificada utilizando três abordagens: Máquina de Vetores de Suporte, Random Forests e Adaptive Boosting visando diferenciar as massas malignas e benignas. A metodologia contém resultados promissores para o diagnóstico de massas malignas e benignas fomentando que as características locais geradas pelos descritores e detectores produzem um conjunto descriminate satisfatório.
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Estudo da hidrólise enzimática do amido de mandioquinha-salsa (Arracacia xanthorrhiza): efeito do tamanho dos grânulos

Rocha, Thaís de Souza [UNESP] 27 February 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:28Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-02-27Bitstream added on 2014-06-13T20:10:53Z : No. of bitstreams: 1 rocha_ts_me_sjrp.pdf: 4148399 bytes, checksum: ce0ff94a04b39123b97024a446e8f545 (MD5) / Enzymatic hydrolysis of granular starch has been used to study the structure and the physicochemical properties of the granules. It depends, among others, on the starch botanic source, on the enzymatic system used and on the size of the granules. The aim of this work was to investigate the effect of granule size on enzymatic susceptibility and on structural and physicochemical properties of Peruvian Carrot starch. Starches from two varieties (Amarela de Carandaí, AC and Amarela de Senador Amaral, ASA) were isoladed, fractionated by size and classified into whole granules (without separation); large granules (d 20æm); medium granules (> 10 e < 20æm) and small granules (£ 10æm). The whole and fractionated granular starches were hydrolysed with bacterial -amylase and fungal amyloglucosidase. Samples, before and after hydrolysis, were analyzed regarding their structural and physicochemical characteristics. The whole and fractionated native starches shown in optical microscope and scanning electron microscope circular shape for large granules and polygonal shape for small granules. The granular surface was smooth with some had openings, especially for the larges granules, with some depressions and holes. From chromatograms of gel permeation in Sepharose CL-2B was not possible to observe differences on the molecular size from both varieties of Peruvian Carrot. The amylose content, that was higher to AC variety, was concentraded mainly in large granules. Both varieties exhibited B-type X-ray diffraction pattern and relative degree of cristallinity (DC) (~20%) was not different for the different starches, despite the intensity of the peaks decrease for small granules. The intrinsic viscosity of starches from both varieties was smallest 24% and 14%, respectively, to small granules in relation of large granules. Gelatinization temperatures, from DSC, decreased as the granule sizes decreased, while the enthalpy remained the same. The smaller the granule
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Qualidade da madeira de cinco espécies nativas para o envelhecimento da cachaça. / Wood quality of five native species for the aging of cachaça.

CATÃO, Catarina Gama. 15 June 2018 (has links)
Submitted by Élida Maeli Fernandes Quirino (maely_sax@hotmail.com) on 2018-06-15T19:26:12Z No. of bitstreams: 1 CATARINA GAMA CATÃO - DISSERTAÇÃO PPGEA 2009..pdf: 7690001 bytes, checksum: f460166509eb88bd9e96162186426e7b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-06-15T19:26:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CATARINA GAMA CATÃO - DISSERTAÇÃO PPGEA 2009..pdf: 7690001 bytes, checksum: f460166509eb88bd9e96162186426e7b (MD5) Previous issue date: 2009-07 / Esta pesquisa propôs como objetivos, avaliar a qualidade das madeiras de amburana (Amburana cearencis (Fr. Aliem.) A.C. Sm.), bálsamo (Myroxylon peruiferum L.f); ipê amarelo (Tabebuia chrysotricha (Mart. ex DC) Standl.); jatobá (Hymenaea courbaril L. var. stilbocarpa (Hayne) Lee et Lang.) e jequitibá-rosa (Cariniana legalis (Mart.) Kuntze) no armazenamento de cachaças; comparar as cachaças com a armazenada em barri] de carvalho (Quercus sp.), analisar o efeito do envelhecimento e comparar os valores obtidos com os padronizados pela Legislação Brasileira. Para tanto, as cachaças foram armazenadas em barris de madeira e em recipiente de vidro, durante dois, quatro e seis meses e analisadas suas características físico-químicas (acidez volátil, álcool metílico, álcool superior, aldeído, cobre, éster, extraio secado a 100° C, fúrfural e grau alcoólico) e organolépticas (cor, sabor e aroma). Após seis meses de armazenamento as cachaças foram comparadas com os valores padronizados. Independente da espécie, a madeira melhora as qualidades sensoriais da cachaça incorporando, à bebida, gosto, cor e sabor peculiar. A cachaça armazenada em barris de bálsamo se assimilou, quanto às características físico-químicas, com a armazenada em barris de carvalho. Após os seis meses de armazenamento nos barris de madeira as cachaças apresentaram maiores concentrações de acidez volátil, ésteres, aldeídos, fúrfural, álcoois superiores, congéneres e extrato seco. As concentrações de etanol e de metanol não se alteraram e o teor de cobre apresentou ligeiro declínio com o tempo de armazenamento. As características sensoriais das cachaças melhoraram com o tempo de envelhecimento e aquelas armazenadas nas madeiras de amburana e bálsamo foram as preferidas em função de suas características organolépticas. Todas as cachaças avaliadas continuaram dentro dos padrões de qualidade, estabelecidos pela Legislação Brasileira. / The research aimed to evaluate the wood quality of Amburana cearencis (Fr. Aliem.) A.C. Sm., Myroxylon peruiferum L.f; Tabebuia chrysotricha (Mart ex DC.) Standl.; Hymenaea courbaril L. var stilbocarpa (Hayne) Lee et Lang. and Cariniana legalis (Mart.) Kuntze in the storage of cachaças; to compare the studied "cachaças" with the stored one in barrei of oak (Quercus sp.), to analyze the effect of the aging and to compare the values gotten with the standardized ones for the Brazilian Legislation. Thus, the "cachaças" had been stored in barreis wooden and glass container duríng two, four and six months and analyzed the physical-chemistry characteristics (volatile acidity, methylic alcohoL superior alcohol. aldehyde, cupper, éster, dry extract to 100° C, fúrfural contents and alcoholic degree) and organoleptic characteristics (color, flavor and aroma). After six months of storage of "cachaças" were compared with the standardized values by Brazilian Legislation. Independem ofthe species, the wood improves the sensorial qualities of "cachaça", incorporating the drink taste, color and peculiar flavor. The "cachaça" stored in barreis of Myroxylon peruiferum was assimilating, how much to the physical-chemistry characteristics, with the stored one in barreis of oak. After the six months of storage in the barreis wooden, the "cachaças" had presented greater concentrations of volatile acidity, esters, aldehydes, fúrfural, alcohol, congeners and dry extract. The concentrations of etanol and methanol had not gotten excited and the cupper contem presented fãst decline with the storage time. The sensorial characteristics of "cachaças" had improved with aging time and those stored in wood of Amburana cearensis and Myroxylon peruiferum had been the preferred ones in fúnction of its organoleptics characteristics. AH "cachaças" evaluated had continued inside ofthe standards of quality established Brazilian Legislation.
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Características fenotípicas, genotípicas, soroepidemiológicas, antigênicas, imunoquímicas e de virulência de isolados brasileiros de Sporothrix schenckii / Phenotyping, genotyping, soroepidemiological, antigens, immunochemical and virulence of Brazilian Sporothrix schenckii isolates

Fernandes, Geisa Ferreira [UNIFESP] January 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-12-06T22:54:32Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / Neste estudo, 151 isolados brasileiros de Sporothrix schenckii foram caracterizados quanto as suas características fenotípicas e genotípicas. Quanto às características fenotípicas, a maioria dos isolados apresentou conídios ovais, sendo que os de origem animal são maiores que os de origem humana (animal: 2,96 ± 1,07 versus forma linfocutânea: 2,37 ± 0,43; forma fixa: 2,33 ± 0,53). Os isolados provenientes da região Norte do Brasil são os mais termotolerantes e os isolados do Nordeste são os mais termossensíveis. Os isolados de origem animal são mais tolerantes à temperatura quando comparados com isolados obtidos de pacientes. Os isolados brasileiros apresentaram grande variabilidade genética quando avaliados por RAPD. Por Southern Blot, utilizando a enzima APA I para o estudo do polimorfismo das regiões ITS, três genótipos foram obtidos. Não houve correlação entre o perfil obtido por RAPD ou Southern Blot com a origem clínica ou geográfica dos isolados. A secreção de proteínas/glicoproteínas é variável entre os isolados, sofrendo influência direta do meio de cultura. Os isolados brasileiros avaliados são produtores das enzimas DNAse e urease, 15,78% produzem gelatinase, 26,31% produzem proteinase e 21,05% produzem caseinase. Todos os isolados avaliados toleram pressão osmótica de 16,6% de glicerol, 89,47% toleram 20% e todos são inibidos a 23% e 28,5 % de glicerol. Todos os isolados avaliados toleram pressão salina de 6% e 8%; 42,10% toleram pressão de 9% e 10% de sal e todos são inibidos a 12% de sal. Todos os isolados avaliados crescem na faixa de pH de 2,2 a 12,5. A patogenia e virulência são variáveis entre os isolados, podendo estar relacionada ao genótipo do isolado. Diferentes proteínas são reconhecidas pelos soros dos camundongos infectados, sendo a molécula de 60 kDa, a mais reconhecida neste sistema. Em relação à esporotricose humana, as moléculas de 70 kDa e 38 kDa são comumente reconhecidas por soros de pacientes com esporotricose fixa e linfocutânea. O antígeno bruto do isolado Ss 118 e a fração SsCBF são eficientes para diagnóstico da esporotricose felina através da técnica de ELISA. A fração SsCBF é capaz de elicitar resposta imune do tipo HTT em camundongos experimentalmente infectados. Em geral, os resultados indicam que os isolados brasileiros são heterogêneos, apresentando características genéticas e fenotípicas individuais, independentes de sua origem. Somente a área conidial e a tolerância a temperatura foram características fenotípicas relacionadas à origem. / In this study, we analyzed 151 Brazilian S. schenckii isolates by phenotyping and genotyping aspects. About phenotyping aspects, most of isolates showed oval conidia and the mean conidial area of S. schenckii animal isolates was greater than clinical isolates (animal: 2.96 ± 1.07 versus lymphocutaneous form: 2.37 ± 0.43; fixed form: 2.33 ± 0.53). Isolates from the Northeast region exhibited the lowest thermotolerance and the Northern isolates exhibited the highest thermotolerance. Animal isolates are better thermotolerants than clinical isolates. The Brazilian isolates showed great genetic diversity when analyzed by RAPD. By Southern blot using the endonuclease APA I to study polymorphism of ITS regions, three genotypes were obtained. There was no association between RAPD and Southern profiles with clinical forms origin or geographic origin. The protein/glycoprotein secretion was variable among isolates and was directly influenced by the medium composition. All Brazilian isolates studied produced DNAse and urease exoenzymes, 15.78% produced gelatinase, 26.31% produced proteinase and 21.05% produced caseinase. All analyzed isolates grew at 16,6% of glycerol, 89,47% grew at 20% of glycerol and all of them were inhibited at 23% and 28,5 % of glycerol. All analyzed isolates grew at 6% and 8% of NaCl, 42.10% grew at 9% and 10% of NaCl and all of them were inhibited at 12% of NaCl. All of them were able to grow at pH 2.2 to 12.5. The pathogenicity and virulence were variable among isolates and it can be related to the genotype. Different proteins were recognized by sera of infected mice and the 60 kDa molecule was the most one recognized in murine system. In relation to human sporotrichosis, 70 kDa and 38 kDa molecules were common recognized by sera from patients with fixed and lymphocutaneous sporotrichosis. The crude exoantigen of Ss 118 isolate and the SsCBF fraction are able to be used in the diagnosis of feline sporotrichosis by ELISA. The SsCBF fraction is able to elicit DTH immune response in infected mice. In general, our results indicate that Brazilian isolates are heterogeneous, which present individual phenotyping and genotyping characteristics, independent of origin. Only the conidial area and thermotolerance were related to origin. / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Efeitos genéticos e ambientais sobre o intervalo desmame-cio em fêmeas suínas

Leite, Carla Daniela Suguimoto [UNESP] 16 February 2009 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:07Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009-02-16Bitstream added on 2014-06-13T19:12:58Z : No. of bitstreams: 1 leite_cds_me_jabo.pdf: 286709 bytes, checksum: 5dbd29633c088bfd8c09e91c549a77c3 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / A seleção baseada em características reprodutivas tem sido muito empregada em programas de melhoramento genético de suíno. Assim, objetivaram-se avaliar os efeitos ambientais e genéticos que influenciam o intervalo desmame-cio (IDC) e verificar sua influência no número de nascidos total (TL), nascidos vivos (NV) e mortos (NM) em fêmeas suínas. Para análise dos efeitos ambientais, utilizaram-se 8.104 dados da 1ª a 6ª ordem de parição, e, para as estimativas dos parâmetros genéticos, apenas as informações do 1º ao 3º IDC, o que resultou em 6.548 observações, que foram analisadas pelo método REML, utilizando-se modelos uni e multicaracterística. Para este último, considerou-se cada IDC (1º, 2º e 3º) como uma característica distinta. Avaliaram-se, também, as correlações genéticas entre o IDC, TL, NM e idade ao primeiro parto (IPP). Para os fatores ambientais, o modelo incluiu como efeitos fixos rebanho, linhagem, ano (AP) e estação (EP) de parto, e as covariáveis idade da porca ao parto (IDPP), TL e duração da lactação (DL). A DL, na forma linear, e a IDPP, na forma quadrática, influenciaram o IDC. Rebanho, AP e EP foram fontes de variação significativas, enquanto TL e linhagem não o foram. Não foi observada influência do IDC sobre TL, NV, nem sobre NM. A herdabilidade estimada para o IDC pelo modelo de repetibilidade foi baixa. As correlações genéticas entre os IDC (1º, 2º e 3º) foram de moderada a baixa magnitude, evidenciando que o modelo multicaracterística é mais indicado para as estimativas de parâmetro genético nessa população. As correlações genéticas entre IDC, TL e NM, assim como IDC e IPP foram favoráveis à seleção. / Selection for reproductive traits has been largely used in swine breeding programs. The aims of this study were to evaluate environmental and genetic effects that affect the weaning-to-estrus interval (WEI) in sows and to assess their influence on litter size (LS), number of live born (LP) and dead born piglets (DP). Data consisting of 8,104 WEI from the 1st to 6th farrowing recorded in two herds were used for environmental analysis, but for estimating the genetic parameters only data from the 1st to 3rd farrowing were used, totalling 6,548 records. Genetic analysis was performed using the REML method with single and multitrait models, where each WEI was considered as a different trait. Genetic correlations among WEI, LS, DP and age at first farrowing (AFF) were also estimated using a multitrait model. For the environmental analysis, the model included as fixed effects the herd, line, and year (YF) and season (SF) of farrowing, and as covariates the sow’s age at farrowing (SAF), LS, and lactation length (LL). The effects were linear for LL and quadratic for SAF. The herd, YF and SF were important sources of variation, whereas LS and line were not significant. There were no effects of WEI on the litter traits (LS, LP and DP). The heritability estimated for WEI was low, and genetic correlations among its different intervals were of moderate to low magnitude, evidencing that a multitrait model was more indicated for estimating the genetic parameters for this trait in this population. The genetic correlations between WEI and LS, DP and AFF would be favourable in a selection.
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Redução de dimensionalidade usando agrupamento e discretização ponderada para a recuperação de imagens por conteúdo

Pirolla, Francisco Rocha 19 November 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:06:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4756.pdf: 1515606 bytes, checksum: 12146689055c9826f258e527c3ae001a (MD5) Previous issue date: 2012-11-19 / Universidade Federal de Sao Carlos / This work proposes two new techniques of feature vector pre-processing to improve CBIR and image classification systems: a method of feature transformation based on the k-means clustering approach (Feature Transformation based on K-means - FTK) and a method of Weighted Feature Discretization - WFD. The FTK method employs the clustering principle of k-means to compact the feature vector space. The WFD method performs a weighted feature discretization, privileging the most important feature ranges to distinguish images. The proposed methods were employed to pre-process the feature vector in CBIR and in classification approaches, comparing the results with the pre-processing performed by PCA (a well known feature transformation method) and the original feature vector: FTK produced a reduction in the feature vector size with an improving in the query precision and a improvement in the classification accuracy; WFD improved the query precision up to and a improvement in the classification accuracy; the combination of WFD and FTK improved also the query precision and a improvement in the classification accuracy. These are very important results, especially when compared with PCA results, which leads to a minor reduction in the feature vector size, a minor increase in the query precision and a minor increase in the classification accuracy. Also the proposed approaches have linear computational cost where PCA has a cubic computational cost. The results indicate that the proposed approaches are well-suited to perform image feature vector pre-processing improving the overall quality of CBIR and classification systems. / Neste trabalho, propomos diminuir o gap semântico e os problemas de maldição de dimensionalidade apresentando duas técnicas de préprocessamento do vetor de características com o objetivo de melhorar a recuperação de imagens baseada em conteúdo e sistemas de classificação de imagens: um método de redução de dimensionalidade do vetor de características original, baseado no algoritmo k-means, chamado FTK (Feature Transformation based on K-means) e um método de discretização ponderada de características que privilegia as faixas de características mais importantes para distinguir imagens, chamado WFD (Weighted Feature Discretization). Os métodos propostos foram utilizados para pré-processar os vetores de características nas abordagens CBIR e classificação, comparando o pré-processamento executado pelo método PCA e os resultados dos vetores de características originais. O algoritmo FTK promoveu uma redução no tamanho do vetor de características com uma melhoria na precisão da consulta e na precisão de classificação. O algoritmo WFD melhorou a precisão da consulta e classificação; a combinação de dos dois algoritmos propostos também melhorou a precisão da consulta e classificação. Estes resultados são muito importantes, especialmente quando comparados com os resultados do método PCA, que também leva a uma redução no tamanho do vetor de características, a um menor aumento na precisão da consulta e a menor aumento na precisão da classificação. Além disso, as técnicas propostas têm custo computacional linear, enquanto o PCA tem um custo computacional cúbico. Os resultados indicam que os métodos propostos são abordagens adequadas para realizar pré-processamento dos vetores de características de imagens em sistemas CBIR e em sistemas de classificação.
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Crescimento inicial, trocas gasosas e status hídrico de clones de eucalipto sob diferentes regimes de irrigação. / Initial growth, gaseous changes and water status of eucalyptus clones under different irrigation regimes.

Tatagiba, Sandro Dan 24 February 2006 (has links)
Made available in DSpace on 2016-12-23T14:37:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertacao_Sandro.pdf: 1073612 bytes, checksum: 32d65322ff6d4ce9aa2a775f64a664fe (MD5) Previous issue date: 2006-02-24 / O objetivo desse estudo foi avaliar o efeito do déficit hídrico sobre as características de crescimento: diâmetro do coleto; altura das plantas; área foliar; relação raiz/parte aérea; matéria seca de: folhas, haste e ramos, raízes e total; e as características fisiológicas das trocas gasosas (fotossíntese líquida, condutância estomática, transpiração) e potencial hídrico foliar, em seis clones de eucalipto (1, 2, 3, 4, 5 e 6) crescendo em vasos plásticos de diâmetro de 42 cm e altura de 72 cm, com aproximadamente 100 dm3, de modo a subsidiar a seleção desses materiais genéticos para estabelecimento em áreas com disponibilidade diferenciada de água no solo. Foram avaliadas algumas variáveis climáticas durante todo o período experimental, a fim determinar a condição no ambiente em estudo. As plantas cresceram nos vasos com teor de água próximo a capacidade de campo por um período de 150 dias, quando, então, foram iniciados os manejos hídricos diferenciados até o final do experimento que durou cerca de 250 dias. Os manejos hídricos aplicados foram: sem déficit - manutenção dos vasos próximo à capacidade de campo ao longo de todo o período experimental, ou seja, 250 dias; déficit 1 - corte da irrigação aos 150 dias de experimentação, durante 45 dias e posterior retomada da irrigação por mais 55 dias; déficit 2 - corte da irrigação aos 150 dias de experimentação, prolongando até o final do experimento (100 dias de déficit hídrico). O clone mais afetado pela deficiência hídrica foi o 3, apresentando menor acúmulo xiv de matéria seca total e maior redução em área foliar, provocada principalmente pela abscisão foliar. Contrariamente, os clones 1, 2, 4 foram os mais tolerantes aos efeitos do déficit hídrico, em razão de terem apresentado maior acúmulo de matéria seca total. De modo geral, o déficit hídrico promoveu a redução dos valores da fotossíntese, condutância estomática, e transpiração foliar de todos os clones. Os clones 1, 2 e 4 apresentaram os valores mais altos de potencial hídrico foliar nas plantas submetidas ao déficit hídrico ao longo das campanhas realizadas, mostrando obter mecanismos eficientes no controle de perda de água, já que apresentaram as menores taxas transpiratórias e menores valores de condutância estomática. Pressupõe-se que o aparato fisiológico destes clones permita alcançar um menor consumo de água, favorecendo a planta a suportar um período mais longo de déficit hídrico, e possibilitando uma maior conversão de CO2 atmosférico em carboidrato por período maior de tempo. O clone 3 apresentou menores valores de fotossíntese, condutância estomática e transpiração quando submetido ao déficit hídrico nas duas campanhas realizadas. O clone 6 apresentou maior transpiração no nível de manejo sem déficit e sob déficit em relação aos demais clones, sugerindo elevado consumo de água pelas plantas. Após a retomada da irrigação, todos os clones recuperaram suas taxas fotossintéticas similares às registradas pelos clones mantidos sem déficit, contribuindo para acréscimos na matéria seca total das plantas. / The objective of this study was to evaluate the effect of the deficit water on the following growth characteristics: diameter of the stem; height of the plants; foliate area; relationship root/aerial part; dry matter: of the leaves, stem and branches, roots and total; and the physiologic characteristics of the gaseous changes (liquid photosynthesis, stomatal conductance, transpiration) and leaf potential water, in six eucalyptus clones (1, 2, 3, 4, 5 and 6) growing in plastic vases of diameter of 42 cm and height of 72 cm, with approximately 100 dm3, in way to subsidize the selection of these genetic materials for establishment in areas with differentiated readiness of water in the soil. Some variable climatics were evaluated during all the experimental period, to determine the condition in the environment in studying. The plants grew in the vases with tenor of water close to the field capacity for a period of 150 days, when, then, were initiated the differentiated handlings of water until the end of the experiment that lasted about 250 days. The water handlings applied were: without deficit- maintenance of the vases near to the field capacity along the whole experimental period, in other words, 250 days; deficit 1- irrigation cutting to the 150 days of experimentation, during 45 days and subsequent retaking of the irrigation for more 55 days; deficit 2- irrigation cutting to the 150 days of experimentation, prolonging until the end of the experiment (100 days of deficit water). The most affected clone was 3, introducing smaller accumulation of matter total dry and larger reduction in foliate area, provoked mainly by foliate abscission. Contrarialy, xvi the clones 1, 2, and 4 were the most tolerant to the water deficit effects, in reason of having presented a larger accumulation of matter total dry. In general, the water deficit promoted the reduction of the values of the photosynthesis, the stomatal conductance and the transpiration of all of the clones. The clones 1, 2 and 4 presented the highest values of the leaf water potential in the plants submitted to the water deficit along the accomplished campaigns, showing to obtain efficient mechanisms in the control of losing water, since they presented the smallest transpiration rate and smaller values of stomatal conductance. It is presupposed that the physiologic apparatus of these clones allow to reach a smaller consumption of water, favoring the plant to support a longer period of water deficit , and making possible a larger conversion of at atmospheric CO2 in carbohydrate for a larger period of time. The clone 3 presented smaller photosynthesis values, stomatal conductance and transpiration when submitted to the ware deficit in the two accomplished campaigns. The clone 6 presented larger transpiration in the handling level without deficit and under deficit in relation to the other clones, suggesting high consumption of water by the plants. After the irrigation retaking, all the clones recovered their similar photosynthesis rate to the ones registered by the clones maintained without deficit, contributing to increments in the matter total dry of the plants.
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Alternativas para seleção de touros da raça Nelore considerando características múltiplas de interesse econômico / Alternatives for election of bulls of the nelore race considering characteristic multiple of economic interest

José Eduardo do Val 25 May 2006 (has links)
Este estudo foi desenvolvido a partir de informações das avaliações genéticas de touros pertencentes a rebanhos participantes do Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore (PMGRN-Nelore Brasil), que desenvolve, desde 1995, um teste de progênie denominado Reprodução Programada (RP), o qual tem como finalidade principal de disponibilizar animais com valores genéticos mais confiáveis no mercado de reprodutores. Assim, as Diferenças Esperadas nas Progênies (DEPs) de 234 touros participantes da RP no período de 1996 a 2003 foram analisadas com os seguintes objetivos: 1- Avaliar o mérito genético dos touros ao longo dos anos, utilizando regressão linear entre a DEP e ano de participação do touro na RP para as características, peso aos 120 e 210 dias, efeitos direto e materno (DDPP120, DDPP210, DMPP120 e DMPP210); peso e perímetro escrotal aos 365 e 450 dias, efeito direto (DDP365, DDP450, DDPE365 e DDPE450) e idade ao primeiro parto (DDIPP); 2- Identificar, por meio de abordagens multivariadas, grupos de animais cujas DEPs apresentem padrões de semelhança, assim como discriminar as variáveis que mais influenciam na divisão dos grupos, numa tentativa de auxiliar a tomada de decisão nos sistemas de produção de bovinos de corte, com vistas a maximizar a produtividade. Os procedimentos multivariados de análises de agrupamento e componentes principais foram aplicados às DEPs de sete características (DMPP120, DMPP210, DDPP365, DDPP450, DDPE365, DDPE450 e DDIPP). As análises foram processadas com o auxílio do software Statistica (STATSOFT, 2004). As tendências genéticas das DEPs relacionadas com as características de fertilidade, DDPE365, DDPE450 e DDIPP, mostraram progressos genéticos de 0,051 e 0,061 cm e -0,026 mês por ano respectivamente, enquanto que DDPP450 foi à característica que obteve maior ganho genético dentre as DEPs de crescimento, 1,467 kg/ano. Com referência às abordagens multivariadas, a análise de agrupamento k-médias foi aplicada e o resultado envolvendo três grupos foi o melhor obtido, dos quais dois se destacaram quanto aos valores médios das DEPs. A importância desses dois grupos de touros foi confirmada pela análise de componentes principais que associou a eles valores superiores de DEPs diretas de peso e perímetro escrotal. A quantidade de variabilidade original retida pelos dois primeiros componentes principais foi de 70,22%. Foram observados progressos genéticos nos touros da Reprodução Programada para todas as características durante o período estudado, indicando que a estratégia de seleção praticada vem sendo efetiva e evidenciando a importância da contribuição dos touros da RP para o melhoramento das características reprodutivas e de crescimento da raça Nelore. Neste estudo pode-se verificar o poder classificatório e discriminatório das análises de agrupamentos e componentes principais, o que muito pode contribuir na classificação de touros, facilitando a seleção de animais em Programas de Melhoramento Genético. / This research was developed with genetic information of sires that belong to herds of the ?Programa de Melhoramento Genético da Raça Nelore? (PMGRN-Nelore Brasil), witch has been carried on, since 1995, a progeny test denominated ?Reprodução Programada? (RP), whose the main aim is to obtain reliable genetic values for sires market. Therefore, the Expected Progeny Difference (EPD) of 243 sires taking part of the RP from 1996 to 2003 were used with the following objectives of: 1- Evaluating the genetic merit over the years applying linear regression between the EPD and the year of the sires RP participation, for the following traits: weight at 120 and 210 days of age, direct and maternal effects (DDPP120, DDPP210, DMPP120 and DMPP210) weight and scrotal circumference at 365 and 450 days of age, direct effect (DDPP365, DDPP450, DDPE365 and DDPE450) and age at first calving (DDIPP); 2- Identifying groups of animals, whose, EPDs show similarity patterns, as well as, verifying which were the variable that showed greater power in discriminating group formations, trying to help the decisions making support in the beef cattle production system by multivariate approaches, in order to maximizing the productivity. The multivariate procedures of clusters analysis and principal components were applied in the EPDs from seven traits (DMPP120, DMPP210, DDPP365, DDPP450, DDPE365, DDPE450 and DDIPP). The analyses were performed by software Statistica (STATSOFT, 2004). The genetic trends of the EPD related to the fertility traits, DDDPE365, DDPE450 e DDIPP, showed some genetic progress of 0.051 and 0.061 cm and ? 0.026 month per year respectively, while, the DDPP450 was the trait that obtained the highest genetic gain in the growth EPDs, 1.467 kg/year. About the multivariate approaches, the k-means clustering analysis was applied and the results of three groups formation were the best option, two of them stood out in relation to values of the EPDs means. The importance of these two groups was confirmed by the analyses of principal components that associate the direct EPDs of weight and scrotal circumference values to them. The quantity of original variability kept in the first main components was 70.22%. It was observed genetic progress in the RP sires for every trait during the studied period, indicating that the selection has been effective and evidencing how important the contribution of the RP sires for the reproductive and growth traits for the Nelore breed improvement is. In this research, the classificatory and discriminatory power of cluster analyses and principal components could be verify, and certainly could contribute in the sire classification, helping the selection in the Animal Breeding Program.
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Uma abordagem baseada em técnicas de visualização de informações para avaliação de características de imagens e aplicações / Approach based on information visualization techniques for evaluation of image features and applications

Laura Elizabeth Florian Cruz 24 September 2012 (has links)
Na maioria dos processos de análise de imagens há a necessidade de um pré-processamento, no qual são extraídos e calculados vetores de características que representem as imagens são utilizados no cálculo de similaridade. Uma dificuldade nessas tarefas é o grande número de características que definem um espaço de alta dimensionalidade, afetando fortemente o desempenho das tarefas que seguem, que podem envolver uma análise visual, um agrupamento ou uma classificação de dados, por exemplo. Lidar com esse problema normalmente exige técnicas de redução de dimensionalidade ou seleção de características. O presente trabalho dá sequência a trabalhos que utilizam técnicas de visualização como suporte para avaliar espaços de características gerados a partir de coleções de imagens. Nele, objetiva-se aprimorar um método baseado na análise visual de conjuntos de imagens empregando a árvore de similaridade Neighbor-Joining que apoia o usuário a selecionar um subespaço de características que mantenha ou melhore os resultados das visualizações do conjunto de imagens. A partir da metodologia proposta, a avaliação e a seleção de características representativas é realizada usando a visualização NJ. A maior parte dos experimentos responde positivamente para diferentes conjuntos de imagens representados por vários extratores, obtendo-se processos de seleção personalizados mais precisos e eficazes, em termos de agrupamento, do que abordagens automáticas reportadas na literatura / In the majority of the image analysis processes there is need for a pre-processing step, in which feature vectors representative of the images are extracted and similarity methods are calculates. A difficult step in the process is to choose amongst the large number of features available, that will define a feature space of high dimensionality, impacting the cost of the subsequent processing tasks, such as visual analysis, clustering and classification. This problem is usually handled by dimension reduction of feature selection techniques. This work extends and improves previous work that employs visualization and visual analysis techniques to support evaluation of feature spaces created from image collections. The goal is to improve a previous method of feature selection through visualization to employ similarity trees via the Neighbor Joining (NJ) algorithm as the basis for the visual layout, as well as to improve the choices of the analyst regarding tools for visual selection of features. The same process can be employed to support evaluation of feature spaces using the NJ visualization. The majorities of experiments results in improvement of spaces generated by various extractors, yielding personalized selection process that are more precisely related to user\'s perspective of the data set and are perform similarly or better than automatic approaches available in the literature. Keywords: information visualization, mining, visual images, visual analysis of the feature space, similarity trees

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