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Caracterização estrutural da Stanniocalcina-1 por Proteômica Estrutural / Structural characterization of Stanniocalcin-1 by Structural ProteomicsFerrari, Állan Jhonathan Ramos, 1991- 27 August 2018 (has links)
Orientador: Fábio Cesar Gozzo / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Química / Made available in DSpace on 2018-08-27T10:34:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2015 / Resumo: A Stanniocalcina-1 (STC1) é um hormônio glicoproteico que apresenta padrão de expressão diferencial destacado em diversas patologias, notadamente em neoplasias, mas seus aspectos funcionais e estruturais são pouco explorados até o momento. Nesse sentido, a STC1 foi escolhida como alvo para a utilização de uma abordagem integrativa das técnicas que utilizam os reagentes de ligação cruzada, espectrometria de massas e modelagem molecular para a modelagem estrutural. A partir dos experimentos de ligação cruzada, foram obtidas 37 restrições de distância envolvendo espécies ligadas com DSS, sendo 11 destas espécies com N-terminal e uma restrição envolvendo a espécie dimérica, além das cinco ligações de dissulfeto já publicadas. Essas restrições foram utilizadas para a geração de modelos estruturais nas plataformas online I-Tasser e Quark e, localmente, mais de 100.000 modelos pelo protocolo Ab Initio Relax do software Rosetta em quatro diferentes condições iniciais de modelagem. O Rosetta apresentou maior eficiência na geração de modelos quando ausente arquivo de predição de estrutura secundária. As restrições de distância foram ferramenta discriminatória fundamental para a seleção de estruturas candidatas para a STC1. O agrupamento utilizando o parâmetro global distante test (gdt) das 1500 modelos de menor score que respeitavam todas as restrições identificou 22 estruturas representativas estruturalmente distintas. Essas estruturas representativas podem agora ser utilizadas em testes envolvendo substituição molecular nos dados de difração de raios-X / Abstract: The Stanniocalcin-1 (STC1) is a glycoproteic hormone, which shows a differential expression pattern in a variety of pathologies, especially in neoplasia, but its functional and structural aspects have not been explored. Accordingly, the STC1 was chosen as a target to the use of an integrative approach including chemical cross-linking, mass spectrometry and molecular modeling. From cross-linking experiments,37 distance constrains were identified involving the DSS cross-linker, 11 of them in the N-terminus part of the protein and one involving the dimeric specie, in addition to five disulfide bonds already published. These constrains were used to generate structural models by I-Tasser and Quark online platforms and, locally, more than 100,000 models in the Ab Initio Relax protocol package present in the Rosetta software in four different modeling conditions. Rosetta was the most efficient in generating models when secondary structure prediction was absent. The distance constrains were found to be a key discriminatory tool for the selection of candidate structures for the STC1. For the 1,500 lowest score structures that satisfied the distance constrains, the clustering method employing the global distance test parameter (gdt) identified 22 structurally distinct representative structures. These representative structures can be used to in molecular replacement test to solve the X-Ray diffraction data / Mestrado / Quimica Organica / Mestre em Química
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Cross contamination of Listeria monocytogenes in ready-to-eat meat product during slicing: a predictive approach / Contaminação cruzada de Listeria monocytogenes em produto cárneo pronto para o consumo durante o fatiamento: uma abordagem preditivaJanaina Thaís Lopes 12 May 2017 (has links)
Ready to eat (RTE) meat products are subject to recontamination after industrial processing, mainly by Listeria monocytogenes, a pathogenic microorganism that can persist for a long time in the environment. A RTE meat product that is contaminated with L. monocytogenes due to cross contamination during some stage after industrial processing, such as weighing, slicing or wrapping, can be an important causer of disease, due to absence of a kill step before consumption. The objective of this project was to measure the transfer of L. monocytogenes during slicing of cooked ham (cross contamination) at retail, simulating in the laboratory the practices in commercial slicing, and to develop a predictive model capable of describing this transfer. It was observed that in the first slices obtained after the experimental contamination of the slicer, the counts and the transfer rates of L. monocytogenes were higher than in the subsequent slices, and the counting curves presented a long tail as the slices were obtained. The data demonstrate that the slicer may be a relevant source of cross contamination of L. monocytogenes for RTE meat products, regardless of the level of contamination of the slicer. With the data obtained, a new transfer model was proposed called 4p-2se, as it contained four parameters (4p) and two environments (2se), and was independent of the quantification of the pathogen transferred to the slicer. The proposed model was compared to two pathogen transfer models previously described, and the predicted data presented lower RMSE (Root Mean Sum of squared errors) values than the other models. The 4p-2se model was able to satisfactorily predict the pathogen transfer data during slicing of cooked ham, which could assist the food retail establishments and regulatory agencies in the evaluation and control of cross contamination of RTE foods and in the design of proper risk management strategies. / Os produtos derivados da carne que são prontos para consumo estão sujeitos à recontaminação após o processamento industrial, principalmente por Listeria monocytogenes, um microrganismo patogênico capaz de persistir por longo tempo no ambiente. Um produto cárneo pronto para consumo que se contamina com L. monocytogenes devido à contaminação cruzada durante alguma etapa após o processamento industrial, tal como pesagem, fatiamento ou acondicionamento, pode ser um importante causador de enfermidade, pois não há uma etapa de eliminação do patógeno antes do consumo. Este projeto teve por objetivo mensurar a transferência de L. monocytogenes durante o fatiamento de presunto cozido (contaminação cruzada), simulando em laboratório práticas adotadas nos estabelecimentos comerciais de fatiamento de produtos prontos para o consumo, e desenvolver um modelo preditivo capaz de descrever esta transferência. Foi observado que nas primeiras fatias obtidas após a contaminação experimental do fatiador, as contagens e as taxas de transferência de L. monocytogenes eram mais altas que nas subsequentes, observando-se que as curvas de contagem apresentavam uma longa cauda ao longo do fatiamento. Os dados demonstram que o fatiador pode ser uma fonte importante de contaminação cruzada de L. monocytogenes para produtos cárneos prontos para o consumo fatiados, independentemente do nível de contaminação do fatiador. Com os dados obtidos, foi possível sugerir um novo modelo de transferência, denominado 4p-2se, formado por uma equação com apenas quatro parâmetros (4p) e dois ambientes (2se,) sendo esse modelo independente da quantificação do patógeno transferido para o fatiador. O modelo sugerido foi comparado a outros dois modelos de transferência previamente descritos, observando os dados preditos no modelo 4p-2se apresentavam valores de RMSE (Root Mean Sum of squared erros) mais baixos que os demais modelos. O modelo proposto mostrou-se capaz de predizer satisfatoriamente os dados de transferência de patógeno durante o fatiamento de presunto cozido, podendo auxiliar os estabelecimentos comerciais de alimentos e as agências reguladoras na avaliação e controle da contaminação cruzada de alimento prontos para consumo e na concepção de estratégias adequadas de gestão de risco.
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Um estudo comparativo das técnicas de validação cruzada aplicadas a modelos mistos / A comparative study of cross-validation techniques applied to mixed modelsCunha, João Paulo Zanola 28 May 2019 (has links)
A avaliação da predição de um modelo por meio do cálculo do seu risco esperado é uma importante etapa no processo de escolha do um preditor eficiente para observações futuras. Porém, deve ser evitado nessa avaliação usar a mesma base em que foi criado o preditor, pois traz, no geral, estimativas abaixo do valor real do risco esperado daquele modelo. As técnicas de validação cruzada (K-fold, Leave-One-Out, Hold-Out e Bootstrap) são aconselhadas nesse caso, pois permitem a divisão de uma base em amostra de treino e validação, fazendo assim que a criação do preditor e a avaliação do seu risco sejam feitas em bases diferentes. Este trabalho apresenta uma revisão dessas técnicas e suas particularidades na estimação do risco esperado. Essas técnicas foram avaliadas em dois modelos mistos com distribuições Normal e Logístico e seus desempenhos comparados por meio de estudos de simulação. Por fim, as metodologias foram aplicadas em um conjunto de dados real. / The appraisal of models prediction through the calculation of the expected risk is an important step on the process of the choice of an efficient predictor to future observations. However, in this evaluation it should be avoided to use the same data to calculate the predictor on which it was created, due to it brings, in general, estimates above the real expected risk value of the model. In this case, the cross-validation methods (K-fold, Leave-One-Out, Hold-Out and Bootstrap) are recommended because the partitioning of the data in training and validation samples allows the creation of the predictor and its risk evaluation on different data sets. This work presents a briefing of this methods and its particularities on the expected risk estimation. These methods were evaluated on two mixed models with Normal and Logistic distributions and their performances were compared through simulation cases. Lastly, those methods were applied on a real database.
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Obtención de líneas de costa con precisión sub-píxel a partir de imágenes Landsat (TM, ETM + y OLI)Almonacid Caballer, Jaime 30 March 2015 (has links)
En esta tesis se presenta un método y una serie de herramientas informáticas para obtener
automáticamente la posición de líneas de costa partiendo de imágenes registradas por los satélites
Landsat (5,7 y 8) con un nivel de precisión cercano a 5,5 m (EMC). Para conseguirlo se han resuelto tres
cuestiones: (i) la definición de un algoritmo de extracción automática de la línea de costa a nivel subpíxel,
(ii) la georreferenciación de las sucesivas imágenes también a nivel sub-píxel y (iii) la adaptación
específica a los distintos tipos de imágenes Landsat.
El método desarrollado se sustenta en el análisis de las bandas del infrarojo próximo y medio, en las que
existe una diferencia muy marcada en la respuesta radiométrica del agua y el suelo. Una umbralización
inicial permite la detección de la línea de costa a nivel píxel. Alrededor de tal línea, se aplica el algoritmo
propuesto para alcanzar la precisión sub-píxel. Concretamente, se ajusta una función alrededor de cada
píxel de la línea aproximada y, sobre dicha función matemática, se deducen, realizando perfiles
transversales, los puntos de máximo gradiente. Finalmente, el promedio de tales puntos define la
posición de la línea de costa.
En primer lugar se ha evaluado el algoritmo sobre imágenes QuickBird (2,4 m de resolución espacia)
definido la posición verdadera de la línea de costa mediante fotointerpretación para servir de referencia.
Posteriormente, se han remuestreado esas mismas imágenes a tamaños de píxeles similares a los de las
imágenes Landsat, se ha aplicado al algoritmo propuesto y evaluado frente a la línea de referencia.
En segundo lugar, se ha propuesto y evaluado un método de georreferenciación basado en la correlación
cruzada. Para realizar una evaluación independiente de las líneas de costa, se ha generado un conjunto
de imágenes de traslación conocida. Al aplicar el método propuesto y comparar sus resultados con la
traslación conocida se ha podido describir el comportamiento de los errores. Los errores observados se
acercan a los 0,1 píxeles. Esto implica, al aplicarse sobre imágenes con una resolución igual a la de
Landsat (30m/píxel), un error esperable de 2 m.
En tercer lugar, se han unificado los procesos de obtención de la línea de costa y de georreferenciación
para su aplicación sobre las bandas infrarrojas de Landsat TM/ETM/OLI. Para la validación, se han
tomado como referencia ciertas zonas de costa que no han sufrido variaciones en el tiempo de estudio.
Se ha demostrado que la reflectancia de las zonas terrestres próximas a la costa afecta a la posición de
la línea de costa que obtiene el algoritmo. Este comportamiento ha podido ser descrito estadísticamente.
De esta manera, en función de qué sensor y banda se empleen, es posible corregir la línea de costa y
llevarla a su posición definitiva. Tomando el total de líneas de costa analizadas se obtiene un error medio
cuadrático de 5,5 m.
Una vez establecido el nivel de precisión que se consigue con la metodología propuesta en la tesis se
abordan dos aplicaciones específicas: (i) un estudio sobre el impacto de una serie de temporales
costeros sobre un amplio segmento de playas arenosas (100 km) y los procesos de recuperación de esas
playas y (ii) un estudio de la tendencia a medio plazo (casi treinta años) de un segmento costero (14
km). Estos dos estudios han permitido mostrar la utilidad de las líneas de costa así obtenidas,
evidenciando que aportan una nueva fuente de información para los estudios de la dinámica de las
playas. Si bien la metodología presenta algunas limitaciones, resulta claro que también resuelve otras
que son propias del resto del fuentes de datos disponibles para los estudios de la dinámica costera. / Almonacid Caballer, J. (2014). Obtención de líneas de costa con precisión sub-píxel a partir de imágenes Landsat (TM, ETM + y OLI) [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/48462 / TESIS / Premios Extraordinarios de tesis doctorales
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Propuesta de Diseño General e Implementación del Uso de Materiales Eficientes en la Construcción de un Módulo de Vivienda Sostenible en Sondorillo - Huancabamba - Piura / Proposal for General Design and Implementation of the Use of Efficient Materials in the Construction of a Sustainable Housing Module in Sondorillo – Huancabamba - PiuraHerrera Navas, Marcela Berenice, Oyola Matta, Carlos Alberto 02 September 2020 (has links)
En la actualidad, un gran porcentaje de las viviendas construidas en Perú son producto de la autoconstrucción, estas son construidas con materiales inadecuados, presentan deficiencia estructural y se encuentran ubicadas en zonas no aptas para la construcción, lo cual genera peligro a la población. En el primer trimestre del 2017, ocurrió el fenómeno del Niño Costero, en el cual se generaron importantes daños a la población, viviendas, infraestructura vial, servicios básicos y paralización de actividades socio-económicas. Piura fue uno de los departamentos más afectados por el fenómeno del Niño Costero, donde se registraron en total 105 369 viviendas afectadas y destruidas, 889 establecimientos educativos y 240 establecimientos de salud afectados, 189 790 km de caminos rurales, 1377 km de carreteras afectados y destruidos, y 27 puentes destruidos. Hasta la fecha, las obras e intervenciones de reconstrucción y soluciones de vivienda, no se han ejecutado según lo planificado, motivo por el cual, existe una gran cantidad de familias damnificadas que esperan acceder a una vivienda segura. En la presente investigación, se desarrolló la propuesta de diseño general de un módulo de vivienda sostenible con el objetivo de implementar y valorar la construcción de módulos de vivienda sostenibles en el distrito de Sondorillo - Huancabamba - Piura, basado en la Construcción Vernácula a través del uso de materiales eficientes según los criterios establecidos en el Reglamento Nacional de Edificaciones. El diseño general de la vivienda modular sostenible desarrollado en la presente investigación, está compuesto por una cimentación corrida de concreto ciclópeo de 0.40 m de ancho de base, 0.50 m de altura y sobrecimiento de 0.30 m; vigas soleras de sección de 4” x 4” con longitud máxima de 6.25 m y longitud mínima de 3.30 m; columnas de sección de 4” x 4” y 2.50 m de altura; muros de quincha con ancho desde 0.40 m - 1.40 m con espesor de 0.10 m y alturas de 1.00 m, 1,90 m y 2.50 m; el techo del ambiente social de 4.80 m de luz con viguetas transversales de madera y viguetas de caña en el mismo sentido de la caída del agua con secciones 2” x 4” y 25 mm respectivamente, techo de la cocina comedor de 3.30 m de luz con viguetas transversales de madera y viguetas de caña en el mismo sentido de la caída del agua de secciones 2” x 4” y 25 mm respectivamente. Asimismo, se desarrolló el análisis estático y el análisis dinámico, según los parámetros establecidos en la E.030 Norma de Diseño Sismoresistente y la E.080 Norma de Diseño y Construcción con tierra reforzada, donde se determinó la fuerza sísmica horizontal o cortante basal de 3.51 t, y se registró la aceleración espectral más baja de 0.18 para un periodo mayor de 3 segundos Así mismo, se comparó la literatura estudiada con un modelo matemático analizado en SAP 2000, cumpliendo los criterios de resistencia, estabilidad y comportamiento sismo resistente, donde el øRn fue menor que el Ru con valor de 3509.9 kg. / Nowadays, a large percentage of the houses built in Peru are the product of self-construction, these are built with inadequate materials, have structural deficiencies and are located in areas not suitable for construction, which generates danger to the population. In the first quarter of 2017, the Coastal Child phenomenon occurred, in which significant damage was generated to the population, housing, road infrastructure, basic services and paralysis of socio-economic activities. Piura was one of the departments most affected by the El Niño Costero phenomenon, where a total of 105,369 affected and destroyed houses, 889 educational establishments and 240 affected health establishments, 189,790 km of rural roads, 1,377 km of affected roads, and destroyed, and 27 bridges destroyed. To date, the reconstruction works and interventions and housing solutions have not been carried out as planned, which is why there are a large number of affected families waiting to access safe housing. In the present investigation, the general design proposal of a sustainable housing module was developed with the objective of implementing and evaluating the construction of sustainable housing modules in the Sondorillo - Huancabamba - Piura district, based on Vernacular Construction through the use of efficient materials according to the criteria established in the National Building Regulations. The general design of the sustainable modular house developed in the present investigation, is made up of a continuous cyclopean concrete foundation of 0.40 m in base width, 0.50 m in height and a rise of 0.30 m; 4 "x 4" section sole beams with a maximum length of 6.25 m and a minimum length of 3.30 m; columns of section 4 "x 4" and 2.50 m high; quincha walls with width from 0.40 m - 1.40 m with thickness of 0.10 m and heights of 1.00 m, 1.90 m and 2.50 m; the ceiling of the social environment of 4.80 m light with wooden cross joists and cane joists in the same direction as the waterfall with sections 2 "x 4" and 25 mm respectively, ceiling of the kitchen-dining room of 3.30 m light with transverse wooden joists and cane joists in the same direction as the water fall of sections 2 "x 4" and 25 mm respectively. In addition to this, the static analysis and the dynamic analysis were developed, according to the parameters established in E.030 Design Standard for Earthquake Resistant and E.080 Design and Construction Standard with reinforced earth, where the horizontal seismic or shear force of 3.51 t, and the lowest spectral acceleration of 0.18
ms2
for a period greater than 3 seconds Likewise, the literature studied was compared with a mathematical model analyzed in SAP 2000, meeting the criteria of resistance, stability and earthquake resistant behavior, where the øRn was less than the Ru with a value of 3509.9 kg. / Tesis
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A noção de infância no Brasil na década de 1930: Uma análise da Revista InfânciaMoura, Marina de 28 May 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-05-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The purpose of this research is to analyze the notion of childhood present in
Infância ( Childhood ), a magazine published in Brazil by Cruzada Pró-Infância
(Crusade for Childhood), an institution devoted to fighting child mortality and
illiteracy as well as promoting the education of children. Its target constituency
was upper class mothers who helped the Crusade to fulfill its objectives among
the lower classes. The magazine was published in the city of São Paulo, with
irregular frequency, in the years 1935-1937. Approximately half of the articles
were signed by renowned physicians, educators, and helpers. Usually the texts
were illustrated with photos or drawings, and a large amount of space was
given to advertising. Products for men, women and children were advertised in
the magazine. During the three years 18 issues were published, of which 15
were analyzed for this research. During that time, only the last issues
mentioned the editor. The subjects discussed in the magazine were intended to
convey to the general public scientific information mainly in the areas of health
and education. Its aim was to urge parents, educators, and those who were
interested in children s life conditions to work towards a prosperous, healthy,
and educated nation, under the mottos an educated country is a wealthy
country and the children of today are the adults of tomorrow . Therefore we
conclude that, in its use of scientific information for lay persons, Infância
magazine was a progressive publication in which psychology and education
were given great prominence and recognition / Esta pesquisa tem como objetivo analisar a noção de infância presente na
revista Infância, publicada no Brasil pela Cruzada Pró-Infância, órgão com a
finalidade de combater a mortalidade infantil e o analfabetismo e, promover da
educação de crianças. Seu público-alvo eram as mães da classe alta que
colaboravam com a Cruzada para cumprir seus objetivos entre as classes
baixas. Essa revista foi publicada na cidade de São Paulo, com periodicidade
irregular, nos anos de 1935 a 1937. Cerca de metade dos textos da revista
foram assinados por renomados médicos, educadores e outros colaboradores.
Em geral os textos eram ilustrados com fotos ou figuras e a publicidade tinha
grande espaço na revista. Nela eram anunciados produtos para homens,
mulheres e crianças. Nos três anos de publicação da revista foram lançados 18
números, dos quais 15 foram analisados na presente pesquisa. Durante os três
anos, apenas nos últimos números foi mencionado um redator responsável. Os
assuntos tratados na revista pretendiam revelar a população em geral
conhecimentos científicos principalmente nas áreas de saúde e educação. Seu
objetivo era que pais, educadores e todos aqueles interessados nas condições
de vida das crianças pudessem trabalhar para a construção de um país
próspero, sadio e culto, com o lema um país educado é um país rico; as
crianças de hoje são os adultos de amanhã. Diante disso, concluímos que a
revista Infância ao utilizar informações científicas para os leigos foi uma
publicação de vanguarda e que a psicologia e a educação tiveram grande
espaço e reconhecimento
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[en] MERCADO SÃO SEBASTIÃO: A STUDY ON THE PROJECT OF THE CRUZADA SÃO SEBASTIÃO AS PART OF THE URBAN CONSTRUCTION OF RIO DE JANEIRO IN THE 1960S / [pt] MERCADO SÃO SEBASTIÃO: UM ESTUDO SOBRE O PROJETO DA CRUZADA SÃO SEBASTIÃO COMO PARTE DA CONSTRUÇÃO URBANA CARIOCA NA DÉCADA DE 1960CAREN CAROLINE PAULO FERREIRA 30 June 2022 (has links)
[pt] Esta dissertação pretende fazer uma reflexão sobre o período de construção e os
anos iniciais de atuação do Mercado São Sebastião, compreendendo as transformações
urbanísticas na cidade do Rio de Janeiro. Esse mercado é uma obra da Cruzada São
Sebastião, instituição vinculada a Igreja Católica, fundada por Dom Helder Camara com
o objetivo de urbanizar as favelas cariocas e proporcionar melhores condições de moradia
aos seus moradores. A venda dos lotes e espaços do mercado São Sebastião seriam
utilizados para financiar os projetos urbanísticos da cidade. Trata-se de um estudo
qualitativo, com base teórica sobre o processo de urbanização da cidade nas décadas de
1950 e 1960. A pesquisa tem suporte documental sobre o acervo Maria Luiza e Edgar
Amarante, doado ao Núcleo de Memória da PUC-Rio e que contém centenas de
documentos sobre os projetos da Cruzada São Sebastião. Na elaboração da dissertação
foi utilizado também a hemeroteca da Biblioteca Nacional com pesquisas de jornais da
época. Por fim, o estudo buscou resgatar os motivos pelos quais o Mercado deixou de
ser uma grande influência como centro de abastecimento da cidade e foi paulatinamente
abandonado por parte de seus administradores e dos poderes público. / [en] This dissertation aims to reflect on the construction period and the initial y ears of
operation of the Mercado São Sebastião, urbans transformations in the city of Rio de
Janeiro. This market is a work of the Cruzada São Sebastião, an institution linked to the
Catholic Church, founded by Dom Helde Câmara with the objecto of urbanizing rio s
favelas and providing better housing conditions for its residents. The sale of lots and
spaces of the Mercado São Sebastião would be used to finance the city s urban projects.
This is a qualitative study, based on the theoretical process of utbanization of the city in
the 1950s and 1960s. The research has documentary support on the collection Maria Luiza
and Edgar Amarante given to the Momory Center of PUC-Rio, which contains hundreds
of documents on the projects of the Cruzada São Sebastião.
The dissemite used the hemeroteca of the National Library with the research of newspap
ers of the time. Finally, the project seeks to rescue the reasons why the market is no long
era major influence as a supply center of the city and was abandoned by its administrators
and the public authorities.
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Estudo e implementação de sinais de excitação aplicados em identificação de sistemas multivariáveis. / Study and implementation of excitation signals applied in multivariable system identification.Núñez Larrotta, Fabian 30 March 2015 (has links)
Devido à crescente implementação do Controle Preditivo baseado em Modelo (MPC) em outros processos além de refino e plantas petroquímicas, que geralmente possuem múltiplas entradas e saídas, tem-se um aumento na demanda de modelos gerados por identificação de sistemas. Identificar modelos que representem fielmente a dinâmica do processo depende em grande medida das características dos sinais de excitação dos processos. Assim, o foco deste trabalho é realizar um estudo dos sinais típicos usados em identificação de sistemas, PRBS e GBN, em uma abordagem multivariável. O estudo feito neste trabalho parte das características da geração dos sinais individualmente, depois é feita uma análise de correlação cruzada dos sinais de entrada, observando a influência desta sobre os resultados de identificação. Evitar uma alta correlação entre os sinais de entrada permite determinar o efeito de cada entrada sobre a saída no processo de identificação. Um ponto importante no projeto de sinais de identificação de sistemas multivariáveis é a frequência dos mesmos para conseguir excitar os processos nas regiões de frequência de operação normal e assim extrair a maior informação dinâmica possível do processo. As características estudadas são avaliadas por meio de testes em três plantas simuladas diferentes, categorizadas como mal, medianamente e bem condicionadas. Estas implementações foram feitas usando sinais GBN e PRBS de diferentes frequências. Expressões para a caracterização dos sinais de excitação foram avaliadas identificando os processos em malha aberta e malha fechada. Para as plantas mal condicionadas foram implementados sinais compostos por uma parte completamente correlacionada e uma parte não-correlacionada, conhecido como método de dois passos. Finalmente são realizados experimentos de identificação em uma aplicação em tempo real de uma planta piloto de neutralização de pH. Os testes realizados na planta foram feitos visando avaliar os estudos de frequência e correlação em uma aplicaficção real. Os resultados mostram que a condição de sinais completamente descorrelacionados n~ao deve ser cumprida para ter bons resultados nos modelos identificados. Isto permite ter mais exibilidade na geração do conjunto de sinais de excitação. / Due to the Predictive Control based on Model (MPC) rising in other process beyond refining and petrochemical plants, which in general have multiple inputs and outputs, there have been an increase in demand of models generated by system identification. Identify models that accurately represent the dynamics of the process depends largely on the characteristics of the processes excitation signals. Thus, the focus of this work is to perform a study of the typical signals used in identification systems, PRBS and GBN, in a multivariable approach. The study carried out in this work begins on the individual generation characteristics of the signals, and then an analysis is made of input signals cross-correlation, by observing the in uence of this on the identification results. Avoid a high correlation among the input signals allows to determine the effect of each input on the output of the identification process. An important point in the signals design for multivariable system identification is its frequency to get excite the processes in the normal operation frequency regions and thus extract the maximum dynamic information possible of the process. The studied characteristics are evaluated by testing three different simulated plants, categorized as well, medium and ill conditioned. These implementations were made using GBN and PRBS signals of dierent frequencies. Expressions to characterize the excitation signals were evaluated identifying the processes in open and closed-loop. For ill-conditioned plants were implemented signals composed by a fully correlated part and a non-correlated part, known as two-step method. Finally, identification experiments are performed on a real time application in a pilot pH neutralization plant. The tests were made in the plant in order to evaluate the frequency and correlation studies in a real application. The results show that the completely uncorrelated signals condition must not be satisfied to have good results on the identified models, which besides allows greater exibility in the generation of the excitation signals set.
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Caracterização genética de amostras do vírus da raiva isoladas de morcegos. Avaliação da patogenicidade e proteção cruzada em camundongos / Genetic characterization of rabies viruses isolated from bats. Evaluation of the pathogenicity and cross protection in miceCunha, Elenice Maria Sequetin 17 May 2006 (has links)
Vírus da raiva provenientes de 23 morcegos de espécies hematófagas, frugívoras e insetívoras foram caracterizados geneticamente pelo seqüenciamento completo da região que codifica a nucleoproteína N. A análise filogenética das seqüências, incluindo lyssavirus e isolados de morcegos do Chile e Estados Unidos, mostrou que os diferentes isolados do vírus da raiva foram de modo geral segregados em quatro grupos genéticos distintas: morcegos hematófagos, morcegos insetívoros 1, 2 e 3. Os morcegos insetívoros 1 constituiram-se por isolados de Eptesicus furinalis: BR-EF1, BR-EF2, BREF3, BR-EF-4, BR-EA1 e BR-NL2; os morcegos insetívoros 2 consistiram de isolados de Molosssus spp: BR-MM1, BR-MM2 e BR- MA1 e os morcegos insetívoros 3 isolados de Nictinomops laticaudatus: BR-NL1 e BR-NL3. A homologia de nucleotídeos entre cada grupo de morcegos insetívoros 1, 2 e 3 foi maior que 99%, 97% e 99%, respectivamente. O grupo de morcegos hematófagos foi representado pelos isolados de: 3 morcegos hematófagos Desmodus rotundus (BR-DR1, BR-DR2 e BR-DR3); 5 morcegos frugívoros Artibeus lituratus BR-AL1, BR-AL2, BR-AL3, BR-AL4 e Artibeus planirostris BRAP1; 2 morcegos insetívoros (BR-MR1 e BR-EA2) e 2 de espécies não identificadas (BR-BAT1 e BR-BAT2). Entre as amostras seqüenciadas foram selecionadas cinco (BR-EF1, BR-NL1, BR-AL3, BR-MM1, BR-DR1) e um isolado de cão (BR-C) para os estudos de patogenicidade em camundongos albinos suíços inoculados pela vias intracerebral (IC) e intramuscular (IM). Todas as amostras quando inoculadas em camundongos pela via IC apresentaram-se patogênicas, provocando a morte dos mesmos num período de 4 a 14 dias pós-inoculação. No entanto, 500DLIC50 das mesmas amostras inoculadas pela via IM levaram a uma mortalidade de camundongos de: 60% (BR-DR1); 50% (BR-C, BR-NL); 40% (BR- AL3); 9,5% (BR-MM1); 5,2% (BR-EF10). As mesmas amostras foram utilizadas para a verificação de proteção cruzada, conferida por vacina comercial de uso animal, de camundongos que receberam uma ou duas doses de vacina pela via subcutânea (SC) e desafiados pelas vias IC e IM. Camundongos inoculados com duas doses de vacina foram protegidos quando desafiados pela via IC, com todas as amostras testadas. Quando os camundongos receberam uma dose da mesma vacina houve proteção parcial daqueles desafiados com as amostras de vírus PV e BR-C. Houve proteção de 100% dos camundongos desafiados pela via IM, com exceção daqueles vacinados com uma dose de vacina e desafiados com a amostra PV que apresentaram um índice de 66% de sobreviventes. Os resultados indicam a possibilidade de existir variantes do vírus da raiva espécies específicas circulando em morcegos. Sugerem ainda, que espécies de morcegos hematófagos, frugívoros e insetívoros compartilham o mesmo polimorfismo de vírus. A vacina comercial contra a raiva contendo vírus inativado e de uso veterinário protegeu os camundongos contra o desafio com as diferentes amostras testadas, sugerindo que as vacinas usualmente utilizadas são efetivas no tratamento profilático da raiva transmitida por morcegos, apesar da marcada diferença de neurovirulência dos diferentes isolados quando inoculados em camundongos pela via IM. / Twenty-three rabies viruses isolated from hematophagous, frugivorous and insectivorous bats were characterized genetically by complete sequencing of the region coding the nucleoprotein N. The phylogenetic analysis of the sequences, including the lyssavirus and the bat isolates from Chile and USA revealed that the isolates were segregated into four distinct genetic lineages: those related to the vampire bats and to the insectivorous bats 1, 2 and 3. The isolates related to the insectivorous bats 1 were from the Eptesicus furinalis: BR-EF1, BR- EF2, BREF3, BR-EF-4, BR-EA1 e BR-NL2; those of the insectivorous bats2 included the isolates from Molosssus spp: BR-MM1, BR-MM2 and BR-MA1 and the group 3, by the isolates from the Nictinomops laticaudatus: BR-NL1 and BR-NL3. The homology among each group of the insectivorous bats 1, 2 and 3 were greater than 99%, 97% and 99%, respectively. The lineage related to vampire bats was represented by three isolates from the D. rotundus (BR-DR1, BR-DR2 e BR-DR3); five from the fruit bats Artibeus lituratus (BR-AL1, BR-AL2, BR-AL3, BR-AL4) and Artibeus planirostris (BRAP1); two from insectivorous bats (BR-MR1 and BR-EA2) and two from unidentified species (BR-BAT1 and BR-BAT2). Among the sequenced amples, five bat isolates (BR-EF1, BR-NL1, BR-AL3, BR-MM1, BR- DR1) and one dog isolate (BR-C) were selected for the study of their pathogenicity in Swiss mice, inoculating through intracerebral (IC) and intramuscular (IM) routes. All the isolates, when inoculated via IC, were pathogenic, provoking death in 4 - 14 post inoculation days. However, mice inoculated with 500ICLD50 of the same isolates through IM route were found with different death rates: 60.0% (BR-DR1); 50.0% (BR-C, BR-NL); 40.0% (BR-AL3); 9.5% (BR-MM1) and 5.2% (BR-EF10). The same isolates were used for the assessment of cross protection conferred by a commercial vaccine of veterinary use. The mice were vaccinated subcutaneously, receiving either one or two shots of vaccine, and challenged through IC and IM routes. Mice receiving two shots were protected against all the isolates, when challenged intracerebrally. Mice receiving one shot were found only partially protected against the challenge with the fixed PV strain and BR-C isolate. Mice challenged intramuscularly showed 100.0% of protection, with the exception of those vaccinated with one dose and challenged with PV strain, which were found with 66.0% of survivors. These results indicate the possibility of the existence of rabies virus variants circulating in different species of bat population. The data also suggest that the vampires, frugivorous and insectivorous bats share the same lineage of rabies viruses. The commercial vaccine has protected the mice against the challenge with different rabies virus isolates, suggesting that the vaccines usually employed in the field are effective, although some marked difference in neurovirulence by IM inoculation was found among the isolates tested.
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Comparação da eficácia antibacteriana do álcool 70% (p/v) sobre superfície da câmara escura portátil com e sem limpeza prévia: um estudo experimental laboratorial / Comparison of the antibacterial efficacy of the alcohol 70% (w/v) over portable darkroom surfaces through rubbing, with and without previous cleaning processes: a laboratorial and experimental studyGraziano, Maurício Uchikawa 09 August 2011 (has links)
No contexto da prevenção da infecção cruzada na radiologia odontológica, superfícies que entram em contato direto com as mãos dos profissionais, como as superfícies da câmara escura portátil, devem ser descontaminadas. A recomendação clássica da descontaminação com álcool 70% p/v após limpeza prévia, nem sempre é seguida justificada pela não praticidade, acrescida do tempo curto disponível entre um atendimento e outro, limitando-se à aplicação direta do álcool o que, a priori, contraria as Boas Práticas de Controle de Infecção. A presente investigação, de caráter experimental laboratorial, controlado, randomizado e unicegado, teve como objetivo avaliar comparativamente a eficácia desinfetante do álcool 70% (p/v) sob fricção, com e sem limpeza prévia nas superfícies de câmaras escuras portáteis como procedimento de limpeza/desinfecção concorrente em radiologia odontológica. Três grupos de estudo foram constituídos: Grupo controle: superfícies previamente contaminadas com desafio (micro-organismo teste Serratia marcescens ATCC 14756, acrescido de 10% de saliva humana), submetidas à limpeza clássica por meio de água e detergente sob fricção, e posterior enxágue e consecutivamente, desinfecção com aplicação do álcool 70% p/v. Grupo experimental: superfícies previamente contaminadas com desafio, à semelhança do grupo controle, submetidas à aplicação direta do álcool 70% p/v sob fricção, SEM limpeza prévia. Grupo controle positivo: superfícies contaminadas com desafio. O tamanho amostral para os grupos experimental e controle foi de 85 unidades. Os experimentos foram realizados no Laboratório de Ensaios Microbiológicos do Departamento de Enfermagem Médico-Cirúrgica da Escola de Enfermagem da Universidade de São Paulo. Após o procedimento de contaminação, desafio da área superior da câmara escura portátil e sua posterior secagem, no grupo experimental a superfície foi diretamente friccionada com álcool 70% (p/v) durante 30 segundos. No grupo controle, o mesmo procedimento foi realizado, após a limpeza prévia. Imediatamente, após a evaporação do álcool da superfície, foi realizada a coleta microbiológica por meio da fricção com swab. Em seguida, a ponta do swab foi quebrada e mergulhada em um tubo de ensaio esterilizado com 1 mL de SF e agitado em Votex® por 30 segundos, intermitente e todo o conteúdo do tubo de ensaio foi vertido no centro de uma placa de Petri e, sobre ele, derramados 15 a 20 mL do meio Trypticase Soy Agar à temperatura aproximada de 30ºC. As placas foram deixadas na posição invertida, em ambiente à temperatura aproximada de 22ºC por 72 horas, com leitura diária da recuperação das UFC da Serratia marcescens. O controle positivo foi colhido da mesma forma que o dos Grupos Controle e Experimental, porém sem a aplicação de métodos para descontaminação. As médias das UFC foram comparadas entre os grupos experimental e controle, por meio do teste estatístico t de Student. Os resultados permitiram concluir que o álcool 70% p/v, quando aplicado diretamente sobre a superfície contaminada com matéria orgânica sob fricção, é um desinfetante eficaz, comprovado pela redução de seis logaritmos da população microbiana intencionalmente desafiada nos experimentos, não diferindo da redução observada no grupo controle (p=0,440). Estes achados permitiram atestar a segurança desta prática na limpeza/desinfecção concorrente durante as práticas de radiologia odontológica. / Aiming to avoid cross infection in the context of dental radiology, surfaces that get in direct contact with the hands of the professionals involved in dental procedures are ought to be decontaminated, such as the portable darkroom surfaces. The classical recommendation for the alcohol 70% w/v decontamination (which requires previous cleaning process) is not always applied due to its lack of practicality in addition to the short amount of time between dental procedures; so the decontamination is restricted only to the application of alcohol contradicting then, a priori, the good Practices of Infection Control. This investigation, which was conducted following laboratorial and experimental character, controlled, randomized and blinded, has had as its aim: evaluating comparatively the disinfecting efficacy of rubbing the surfaces of portable darkrooms with 70% w/v alcohol, with and without previous cleaning processes, as an alternative procedure for cleaning/disinfection in dental radiology. Three study groups were established: Control Group: previously contaminated surfaces with the worst case contaminant (test microorganism Serratia marcescens ATCC 14756 added to 10% of human saliva) firstly, traditionally cleaned by rubbing with water and detergent, rinsed afterwards then decontaminated using alcohol 70% w/v; Experimental Group: previously contaminated surfaces with the worst case contaminant similarly to Control Groups sample, however submitted straight away to the decontamination by rubbing with alcohol 70% w/v, with NO previous cleaning processes; Positive control Group: surfaces contaminated with the worst case contaminant. The sampling for both, the experimental and control groups, was 85 units. The experiments were conducted at the Microbiology Laboratory of the Medical-Surgical Nursing Department of the University of Sao Paulos Nursing School. After the worst case contamination procedure of the portable darkrooms upper area and drying, at the experimental group: the surface was directly rubbed with alcohol 70% w/v for thirty seconds. At the control group, the same procedure was performed, however, with previous cleaning following the traditional processes. Immediately after the alcohols evaporation from the surface, a microbiological collection was performed by swab friction. Afterwards, the swabs tip was broken and put in a sterile test-tube with 1mL of sterile saline solution and shaken in Vortex® for thirty seconds, and all its content poured into a Petri dish. Fifteen to 20 mL of Trypticase Soy Agar at approximately 30ºC was poured over the Petri dish. The dishes were left inverted, in an acclimatized environment (approximately at 22ºC) for 72 hours, with daily assessment of the Serratia marcescens CFUs (Colony-forming unit) growths. The positive control was collected following the same procedure as the other groups (control and experimental), with no decontamination methods applied. The CFU levels were compared between the Control and Experimental groups, regarding the statistic test of the t test of Student. The results allowed concluding that the alcohol 70% w/v rubbing, when applied straight to the contaminated surface, is an efficient disinfection method, proved by the 6 logs reduction of the worst case bacterial population; no different from the reduction observed at the control group (p=0,440 test t of Student). These results allow attesting and ratifying the safety of this alternative cleaning/disinfection processes in the context of dental radiology.
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