Onicomicose é um termo geral usado para definir infecção fúngica da unha. Seus agentes podem ser dermatófitos, leveduras ou fungos filamentosos não dermatófitos - FFNDs. Estes são comumente encontrados na natureza como saprófitas do solo e de restos vegetais e patógenos de plantas e têm sido considerados fungos patógenos primários de lesões cutâneas. Não existe até o momento terapêutica padrão para o tratamento de onicomicoses por Scytalidium spp., sendo escassos os dados na literatura pesquisada. Este trabalho tem como objetivo avaliar e comparar a resposta terapêutica a três abordagens diferentes de tratamento combinado para onicomicose por Scytalidium spp., todos associados à onicoabrasão. Foram selecionados 30 pacientes com diagnóstico de onicomicose provocada por Scytalidium spp., divididos em três grupos de dez, recebendo cada um os seguintes tratamentos, além da onicoabrasão: Grupo I: Terbinafina oral e esmalte de ciclopiroxolamina 8%, duas vezes por semana por 12 meses; Grupos II e III: Esmalte de ciclopiroxolamina 8%, duas e 5 vezes por semana, respectivamente, por 12 meses. Os parâmetros de avaliação da eficácia foram clínico e micológico ao término do tratamento e seis meses após. Foram utilizados os critérios de cura total, cura parcial, falha terapêutica aos 12 meses e recidiva/reinfecção no acompanhamento de seis meses. Vinte e cinto pacientes completaram o estudo. Não houve diferença estatística entre os grupos nos diversos parâmetros utilizados para avaliação da resposta terapêutica. A avaliação do resultado terapêutico mostra que ao final de 12 meses de tratamento apenas um paciente preencheu os critérios para cura total, e que 32% dos pacientes de todos os grupos apresentaram cura parcial. Todos os pacientes que completaram o estudo obtiveram melhora clínica, que se manteve no período de acompanhamento. A presença dos fungos na lâmina ungueal foi constante, mesmo com a melhora clínica. Embora não se possa afirmar qual a melhor forma de intervenção entre as três terapêuticas propostas devido ao pequeno número de pacientes do estudo, deduz-se, deste trabalho, que não houve vantagem na administração de terapia sistêmica concomitante. É possível considerar que a terapia tópica exclusiva, seja duas ou cinco vezes por semana, possa constituir opção mais adequada para o tratamento da onicomicose por Scytalidium spp. / Onychomycosis is a general term used to define a fungal infection of the nail. Its officials may be dermatophytes, yeasts and non-dermatophyte moulds. These are commonly found in nature as soil saprophytes and plant remains and plant pathogens. In recent years fungi have been considered primary pathogens of skin lesions. The main ones are Scopulariopsis and Scytalidium spp. There isnt by now a standard therapy for treatment of onychomycosis by Scytalidium spp., and there are few data in the literature. To evaluate and compare the therapeutic response to three different approaches of combined treatment of onychomycosis by Scytalidium spp., all associated with onicoabrasão. We selected 30 patients diagnosed with onychomycosis caused by Scytalidium spp, divided into three groups, each receiving the following treatments, besides receiving mechanical abrasion: Group I: oral terbinafine and ciclopirox 8% nail polish twice a week for 12 months; Groups II and III: Nail polish of ciclopirox 8% two and five times per week, respectively, for 12 months. Twenty-five patients completed the study. There was no statistical difference between groups in the various parameters used to evaluate therapeutic response. The evaluation of the therapeutic result shows that after 12 months of treatment only one patient met the criteria for cure, and that 32% of patients in all groups showed partial healing. All patients who completed the study achieved clinical improvement, which persisted during the follow-up period. The presence of fungi in the nail plate was constant, even with clinical improvement. Although one cannot say what the best form of intervention among the three therapeutic proposals due to the small number of patients studied, it appears in this study there was no advantage in the concomitant administration of systemic therapy. One may consider that topical therapy alone, or two or five times a week may be more suitable option for the treatment of onychomycosis caused by Scytalidium spp.

INTRODUÇÃO: Infecções fúngicas superficiais podem ser causadas por dermatófitos, leveduras ou fungos filamentosos não dermatófitos. O tipo de lesão desenvolvida eventualmente se correlaciona ao agente etiológico, à capacidade de resposta imunológica do hospedeiro, ao sítio anatômico da lesão e tecido afetado. A proposta desse trabalho é isolar e identificar agentes de onicomicose em pessoas idosas (acima de 60 anos de idade), que frequentemente apresentam alteração da resposta imune. CASUISTICA E MÉTODOS: A técnica de identificação de fungos foi a análise do resultado conjunto do exame micológico direto, isolamento e microcultura do raspado ungueal. Escamas subungueais e escamas interdigitais foram coletadas de 35 pessoas idosas, com suspeita clínica de onicomicose, institucionalizados em duas casas assistenciais no município de São Bernardo do Campo, SP, Brasil. RESULTADOS: Os materiais coletados foram analisados e, no raspado ungueal, observou-se 18 (51,40%) resultados positivos no exame direto e 15 (44,40%) no isolamento. Os dermatófitos foram evidenciados em 8 (44,40%) dos isolados, identificando-se 5 (27,80%) como Trichophyton rubrum e 1 (5,60%) de cada um como Trichophyton tonsurans, Trichophyton mentagrophytes e Microsporum gypseum. O segundo grupo mais isolado foram 7 (38,90%) leveduras, identificadas como: 3 (16,70%) Candida guilliermondii, 2 (11,10%) Candida parapsilosis e 1 (5,60%) Candida glabrata, 1 (5,60%) Trichosporon asahii. O último grupo foi representado por 3 (16,70%) isolados de fungos filamentosos não dermatófitos, identificados como: Fusarium sp, Aspergillus sp e Neoscytalidium sp, 1 (5,60%) de cada um. Trinta (85,70%) dos raspados interdigitais foram negativos e em 5 (14,30%), a identificação dos agentes coincidiu com o fungo causador da onicomicose (2 Trichophyton rubrum, 1 Trichophyton mentagrophytes, 1 Candida guilliermondii e 1 Fusarium sp). No grupo controle (9 pessoas idosas clinicamente sem lesão ungueal) realizou-se coleta interdigital, isolando-se Candida guilliermondii em apenas 1 (11,0%). CONCLUSÕES: Pelo método de identificação empregado, observou-se que os fungos causadores de onicomicoses encontrados neste trabalho estão de acordo com relatos da literatura recente; a apresentação clínica da unha com onicomicose por fungos filamentosos não dermatófitos foi indistinguível daquela por dermatófitos ou candidoses e, do ponto de vista etiológico, não se observou diferença entre a onicomicose de pessoas idosas institucionalizadas com os dados da ocorrência de onicomicose na população geral divulgados pela literatura / INTRODUCTION: Superficial fungal infections can be caused by dermatophytes, yeasts or filamentous non-dermatophyte fungi. The type of injury eventually correlates to the the etiologic agent, the ability of the host immune response, the anatomical site of the lesion and the kind of the affected tissue. The purpose of this study is to isolate and identify agents of onychomycosis in the elderly (people over 60 years old), who often have alterations in the immune response. MATERIAL AND METHODS: The technique for the identification of fungi was the analysis of the combined result of mycological examination, isolation and microcultures of nail scrapings. Subungual and interdigital scales were collected from 35 elderly with a clinical suspicion of onychomycosis, institutionalized in two care houses in the city of Sao Bernardo do Campo, SP, Brazil. RESULTS: The collected materials were analyzed and the nail scrapings displayed 18 (51.40%) positive results on direct examination and 15 (44.40%) in isolation. Dermatophytes were found in 8 (44.40%) isolates, 5 (27.80%) beeing identified as Trichophyton rubrum and 1 (5.60%) of each others as Trichophyton tonsurans, Trichophyton mentagrophytes and Microsporum gypseum. The second more isolated group were composed by 7 (38.90%) yeasts, identified as: 3 (16.70%) Candida guilliermondii, 2 (11.10%) Candida parapsilosis, 1 (5.60%) Candida glabrata, and 1 ( 5.60%) Trichosporon asahii. The last group was represented by 3 (16.70%) isolated of non-dermatophyte filamentous fungi, identified as Fusarium sp, Aspergillus sp and Neoscytalidium sp 1 (5.60%) of each. Thirty (85.70%) of the interdigital scrapings were negative and 5 (14.30%) positive, being the agents coincident with the onychomycosis causing fungi (2 Trichophyton rubrum, 1 Trichophyton mentagrophytes, 1 Candida guilliermondii and 1 Fusarium sp) . In the control group (9 elderly with clinically uninjured nail) interdigital collecting was held, isolating Candida guilliermondii in only one (11.0%). CONCLUSIONS: Using this identification method, it was observed that the fungi that cause onychomycosis found in this study are consistent with the reports in the recent medical literature, the clinical presentation of toenail onychomycosis caused by non-dermatophyte molds was indistinguishable from that due to candidosis or dermatophyte and, in terms of etiology, no difference was observed between the onychomycosis of the institutionalized elderly from the occurrence of onychomycosis in the general population disclosed in the literature

Submitted by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2015-11-11T19:43:11Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maysa Paula da Costa - 2012.pdf: 1943875 bytes, checksum: b80f4f02efcb888e3b6b59c7d58f6bc8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2015-11-12T09:34:11Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maysa Paula da Costa - 2012.pdf: 1943875 bytes, checksum: b80f4f02efcb888e3b6b59c7d58f6bc8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-12T09:34:11Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Maysa Paula da Costa - 2012.pdf: 1943875 bytes, checksum: b80f4f02efcb888e3b6b59c7d58f6bc8 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) Previous issue date: 2012-03-08 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Secondary metabolites that have been discovered from the plant kingdom are major sources of innovative therapeutic agents for infectious diseases. Plants have been demonstrated to present important biological activities and are considered as potential clinical application when show compatibility with the human organism. Hymenaea courbaril Linnaeus var. stilbocarpa a tree known as jatoba, presents chemicals products obtained from their leaves, stem, fruit and seeds that are used in folk medicine. Antimicrobial and cytotoxic activity of this plant is little known. An initial screening was performed to evaluate the in vitro susceptibility to sap and compounds of H. courbaril against dermatophytes and Cryptococcus isolates. The sap and the compound fisetin were more active and thus they were used to determine the in vitro susceptibility against eighteen dermatophytes and twenty-six Cryptococcus isolates. The results of in vitro susceptibility assay showed antifungal activity of H. courbaril against all fungi studied. The sap of H. courbaril showed minimal inhibitory concentrations (MIC) ranging between 32-128 μg/mL for dermatophytes and 8-256 μg/mL for complex C. neoformans yeast. The compound of H. courbaril fisetin inhibited the growth of dermatophytes and of Cryptococcus in concentration of 4-128 μg/ml, and of 8 a 128 μg/ml, respectively. In vitro cytotoxicity assays of sap and compound were performed with fibroblast 3T3-A31 by using the technique of absorption of the dye neutral red. Cytotoxicity assays showed that sap and compound have an low toxicity on these cells. The sap and the compound showed IC50 values of 109 μg/mL of 158μg/mL, respectively. The results of this study are relevant and promising because they show that the “fisetin” present a good biological activity for fungi, and is a compound biocompatible with basal cells of mammals. Products with such concentrations of MIC and IC50 can be considered of great value for further pharmacological studies. / As plantas e seus metabólitos secundários são uma grande fonte de inovação de agentes terapêuticos para inúmeras enfermidades, incluindo doenças infecciosas. Plantas de uso popular apresentam atividade biológica em potencial, sendo que devem ser consideradas a importância da aplicação clínica e a compatibilidade com o organismo humano. Hymenaea courbaril Linnaeus var. stilbocarpa uma árvore conhecida como jatobá, possui produtos químicos obtidos de suas folhas, tronco, frutos e sementes que são usadas na medicina popular, no entanto atividade antifúngica e a citotoxicidade desta planta ainda é pouco conhecida. Uma triagem inicial foi realizada para avaliação da suscetibilidade in vitro com a seiva e compostos de H. courbaril sobre isolados de dermatófitos e Cryptococcus. A seiva e o composto fisetina apresentaram-se mais ativos e desta forma foram usados para determinar a suscetibilidade de dezoito isolados de dermatófitos e vinte e seis de Cryptococcus. A seiva de H. courbaril apresentou concentrações inibitórias mínima (CIMs) que variaram de 32 a 128 μg/mL para os dermatófitos e de 8 a 256 μg/mL para as leveduras do complexo C. neoformans. O composto fisetina foi capaz de inibir os dermatófitos em CIMs que variaram de 4 a 128μg/mL e as leveduras do complexo C. neoformans em CIMs que variaram de 8 a 128 μg/mL. A avaliação da citotoxicidade in vitro com fibroblastos 3T3-A31 foi realizada para a seiva e o composto fisetina usando a técnica de absorção do corante vermelho neutro. Por este método foi possível verificar que a seiva de H. courbaril apresentou um IC50 de 109 μg/mL e o composto de 158μg/mL Os resultados encontrados neste estudo são relevantes e promissores, pois mostram que esta planta apresenta uma boa atividade biológica para fungos, além de possuir um composto isolado biocompatível com celulas basais de mamíferos. Produtos com tais concentrações de CIM e IC50 podem ser considerados de grande valor para posteriores estudos farmacológicos.

Made available in DSpace on 2015-04-11T13:54:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 MARIA PSBCF.pdf: 946422 bytes, checksum: 9a7615024f31d940b37aa13463521a8f (MD5) Previous issue date: 2013-11-05 / Introduction: The increase in fungal infections, adverse effects and resistance to antifungal agents currently used, stimulate new studies in search of better antifungal. In this context, the naphthoquinones are widely studied for possessing various biological activities, among them antifungal. The aim of this study was to evaluate the antifungal activity of new naphthoquinones semissintéticas against opportunistic fungi / dermatophytes and to evaluate the interference of a naphthoquinone selected in cell wall formation, membrane ergosterol and cell membrane strain of Candida albicans (ATCC 36232). Methods: The antifungal activity of four new naphthoquinones semi synthetic was evaluated against 89 cultures of microorganisms belonging to the collection of the National Institute for Amazonian Research (INPA), including opportunistic yeast, agents of dermatophytosis and opportunistic filamentous fungi. The test for determining the minimum inhibitory concentration (MIC) was performed as described by the CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) documents M27 - A2 and M38-A/CLSI, 2002. The substance showed better activity was assessed as the action in the cell wall (test sorbitol) and interference in the membrane -associated interaction with ergosterol , the osmotic balance ( K + efflux ) and an essay by leakage of substances that absorb at 260 nm. Results: All new naphthoquinones tested exhibited antifungal activity, and the IVS320 (1H - cyclopenta [ b ] naphtho [2,3 - d] furan- 5 , 10 (3Ah , 10BH) - dione) showed the lowest MICs front species tested. The MIC IV320 was particularly low for dermatophytes , with MIC averages ranging from 5-28 mg / mL and against isolates of the genus Cryptococcus spp . Mean MIC ranged from 5.3 mg / mL. So it was subjected to preliminary tests of mechanism of action. In these trials , the IVS320 caused no change in the fungal cell wall , but caused problems in cell membrane permeability ( efflux of K + and leakage of substances that absorb 260nm ) unrelated to the connection with the ergosterol membrane . / Introdução: O aumento das infecções fúngicas, os efeitos adversos e a resistência aos antifúngicos atualmente utilizados, estimulam novos estudos em busca de melhores agentes antifúngicos. Nesse contexto, as naftoquinonas são amplamente estudadas por possuir várias atividades biológicas, dentre elas antifúngica. O objetivo deste estudo foi avaliar a atividade antifúngica de novas naftoquinonas semissintéticas frente a fungos oportunistas/dermatófitos e avaliar a interferência de uma naftoquinona selecionada na formação da parede celular, ergosterol de membrana e membrana celular de cepa de Candida albicans (ATCC 36232). Métodos: A atividade antifúngica de quatro novas naftoquinonas semissintéticas foi avaliada frente a 89 culturas pertencentes a coleção de microrganismos do Instituto Nacional de Pesquisa da Amazônia (INPA), incluindo leveduras oportunistas, agentes de dermatofitoses e fungos filamentosos oportunistas. O ensaio de determinação da Concentração inibitória mínima (CIM) foi realizado como descrito pela CLSI (Clinical and Laboratory Standards Institute) nos documentos M27-A2 e M38-A/CLSI,2002. A substância que apresentou melhor atividade foi avaliada quanto à ação na parede celular (ensaio sorbitol) e a interferência na membrana associada à interação com ergosterol, ao equilíbrio osmótico (efluxo de K+) e a um ensaio de extravazamento de substâncias que absorvem a 260 nm. Resultados: Todas as novas naftoquinonas testadas exibiram atividade antifúngica, sendo que a IVS320 (1H-cyclopenta[b]naphtho[2,3-d]furan-5,10(3aH,10bH)-dione) apresentou as menores CIMs frente as espécies testadas. A CIM de IV320 foi particularmente baixas para dermatófitos, com médias de CIM variando de 5-28 μg/mL e frente aos isolados do gênero Cryptococcus spp. médias de CIM variaram de 3-5 μg/mL. Por isso, foi submetida a ensaios preliminares de mecanismo de ação. Nesses ensaios, a IVS320 não causou alteração na parede celular do fungo, mas causou problemas na permeabilidade da membrana celular (efluxo de K+ e extravasamento de substâncias que absorvem a 260nm), não relacionados à ligação com o ergosterol da membrana.

de pele é o tipo mais frequente, correspondendo a cerca de 25% de todos os tumores malignos registrados no Brasil. Há que se destacar que uma formulação de uso tópico foi desenvolvida pelo grupo para uso contra câncer de pele e o estudo da estabilidade acelerada desta formulação foi avaliado nesse trabalho. Os frutos da espécie S. lycocarpum foram coletados, secos, triturados, submetidos à extração ácido-base e o precipitado foi suspenso em etanol e filtrado. Os heterosídeos alcaloídicos, SS e SM, foram isolados por cromatografia em coluna a vácuo e purificados em CLAE semipreparativa. A formulação contendo extrato alcaloídico armazenada em temperatura ambiente (27 ± 2 oC) apresentou a melhor estabilidade física. Ensaios para avaliação da atividade antifúngica in vitro do extrato alcaloídico, SS, SM e aglicona (SD) foram realizados com cepas de fungos dermatófitos e Candida spp., sendo que a SM apresentou o menor valor de concentração inibitória. No ensaio de citotoxidade em células humanas de carcinoma espinocelular (A431) e células de fibroblastos de camundongos (L929) foi possível observar a toxidade do extrato alcaloídico e das substâncias, SS, SM e SD frente às células cancerígenas. No ensaio in vivo, os animais foram induzidos ao câncer de pele não-melanoma do tipo espinocelular com células A431 e verificou-se que apenas o grupo de animais tratados com a formulação Curaderm BEC 5 apresentou redução tumoral. Em contrapartida, o grupo tratado com formulação contendo extrato alcaloídico se comportou da mesma maneira que os grupos controle da formulação e controle negativo. Com auxílio da histologia confirmou-se que o câncer de pele induzido nos animais foi do tipo espinocelular. No ensaio imunoistoquímico foi utilizado o anticorpo caspase-3 para marcar as células em apoptose nos tumores, sendo que o maior número de células apoptóticas foi verificada no grupo tratado com a formulação Curaderm BEC 5. / Solanum lycocarpum A. Saint-Hilaire (Solanaceae), commonly known as wolf apple or wolf´s fruit, is a plant native of Brazil very common in the Brazilian savanna. High concentrations of steroidal alkaloids are found in S. lycocarpum fruits, and solasonine (SS) and solamargine (SM) are the most important ones. These two alkaloids present potential antifungal and anticancer activities. Dermatophytic fungi are the most common agents responsible for superficial mycoses in humans and animals, by infecting exclusively the stratum corneum of skin, hair and nails. Skin cancer is the most frequent type corresponding to roughly 25% of all the malignant tumors registered in Brazil. A topical formulation for skin cancer treatment was developed by our research group and its stability tests are reported in this work. The S. lycocarpum fruits were collected, dried, milled and submitted to acid-base extraction furnishing a precipitate, which was solubilized in ethanol and then filtered. The heterosidic alkaloids SS and SM were isolated by using vacuum column chromatography and purified by semi-preparative HPLC. The formulation containing the alkaloidic extract stored at room temperature (27 ± 2 oC) was more stable than the ones in other conditions. Antifungal in vitro test of the alkaloidic extract, SS, SM and the aglycone (SD) were performed with Candida spp and dermatophytic fungi strains. The alkaloid SM displayed the lower inhibitory concentration. The toxicity of the alkaloidic extract, SS, SM and SD was verified in a cytotoxicicity test performed with both cultured human cells of spinocellular carcinoma (A431) and mice fibroblast cells (L929). An in vivo cytotoxicicity test was performed by inducing non-melanoma skin cancer in mice with spinocellular cells A431, in which only the animals treated with a commercial formulation Curaderm BEC 5, showed tumor reduction. There was no statistical difference between the group treated with the formulation containing the alkaloidic extract and control groups. Histological analysis confirmed that the skin cancer induced in the animals were spinocellular type. In an immunohistoquimic test, caspase-3 antibody was employed to stain the cells in apoptosis in the tumors, showing that apoptotic cells were more numerous in the group treated with the formulation Curaderm BEC 5.

O dermatófito Trichophyton rubrum é um fungo filamentoso, antropofílico, que invade tecidos queratinizados causando infecções superficiais e cutâneas. Algumas drogas são usadas para o tratamento das dermatofitoses, sendo o ácido undecanóico (AUN) uma delas. O AUN é o mais tóxico dos ácidos graxos saturados de cadeia média, utilizado como medicamento de uso tópico. O estudo de expressão gênica e mecanismos regulatórios são fundamentais para ampliar o conhecimento dos mecanismos moleculares envolvidos na resposta à exposição a estes agentes citotóxicos. Portanto, o objetivo deste trabalho foi caracterizar os mecanismos moleculares envolvidos no processo adaptativo da exposição ao ácido undecanóico, através da análise global do transcriptoma e mecanismos regulatórios como o processamento alternativo. Para tanto o micélio de T.rubrum foi submetido ao ácido undecanóico por 3 e 12 h de exposição, em triplicata biológica, e o RNA resultante foi submetido ao sequenciamento por RNAseq. O sequenciamento gerou aproximadamente 58 milhões de reads por biblioteca, as quais foram filtradas e alinhadas com o genoma de referência utilizando-se os softwares FASTQC e bowtie2, respectivamente. A análise de expressão gênica diferencial foi feita por meio do pacote do Bioconductor DESeq e, para esta análise, foi utilizada a amostra de 0h como referência. Foram identificados 492 genes diferencialmente expressos em resposta ao AUN, sendo 385 e 210 genes modulados em resposta a 3 e 12 horas de exposição, respectivamente. Estes genes estão relacionados a vários processos celulares envolvendo transporte transmembrana, degradação de xenobióticos, metabolismo de lipídeos e aminoácidos, secreção de enzimas proteolíticas e patogênese, sugerindo que o AUN ativa duas principais vias de sobrevivência em resposta a este agente estressor, a degradação e o efluxo da droga. Posteriormente, foram realizadas as análises de processamento alternativo quanto ao uso diferencial de exons por meio do algoritmo HTSeq e DEXSeq e retenção de introns utilizando-se algoritmos construídos na linguagem Perl. Os genes envolvidos em algum tipo de processamento alternativo estão relacionados com funções metabólicas variadas como tradução, transporte vesicular, metabolismo lipídico, biogênese ribossomal, sequência de ligação ao DNA, regulação da transcrição e processamento do pré-mRNA. Estes resultados contribuem para uma melhor compreensão dos mecanismos moleculares envolvidos na resposta de sobrevivência perante a exposição ao AUN. / The dermatophyte Trichophyton rubrum is a filamentous fungus, anthropophilic that invades keratinized tissue causing superficial infections on the skin. Some drugs are used for the treatment of dermatophytosis, being the undecanoic acid (AUN) one of them. The AUN the most toxic of the saturated medium chain fatty acids, is used as a topical medicine. The study of gene expression and the regulatory mechanisms are fundamental to understand the molecular mechanisms involved in response to exposure of these cytotoxic agents. So, the aim of this study was to characterize the molecular mechanisms involved in the adaptive process of the exposure to undecanoic acid, by the global analysis of the transcriptome and regulatory mechanisms such as alternative splicing. To this end, the mycelium of T. rubrum was exposed to undecanoic acid for 3 or 12 hours in biological triplicate, and the resulting RNA was sequenced by RNA-Seq. The sequencing generated approximately 58 million of reads per library, which were filtered and aligned with the reference genome using the softwares and Bowtie2 and FASTQC, respectively. The analysis of differential gene expression was performed through the Bioconductor package DESeq and, for this analysis, we used as reference sample the 0h time. We identified 492 differentially expressed genes in response to UDA, being 385 and 210 genes modulated in response to 3 and 12 hours of exposure, respectively. These genes are related to various cellular processes involving the transmembrane transport, xenobiotics degradation, lipids and amino acids metabolism, secretion of proteolytic enzymes and pathogenesis, suggesting the activation of two major survival pathways in response to this stressor, degradation and drug efflux, by UDA. Also, the alternative splicing analysis was performed through the differential use of exons using the algorithms HTSeq and DEXSeq and intron retention using algorithms built in Perl language. The genes involved in some kind of alternative splicing are associated with various metabolic functions such as translation, vesicular transport, lipid metabolism, ribosomal biogenesis, DNA binding sequence, transcription regulation and processing of pre-mRNA. These results contribute to increase the knowledge of the molecular mechanisms involved in the survival response upon exposure to the AUN.

Dermatófitos são fungos filamentosos que infectam substratos queratinizados como pele, unha e cabelo em busca de nutrientes para se desenvolverem e permanecerem no hospedeiro. Pertencem aos gêneros Epidermophyton, Microsporum ou Trichophyton, os quais, dependendo de seu habitat natural, são classificados em espécies geofílicas, zoofílicas ou antropofílicas. O uso indiscriminado de antifúngicos levou à seleção de cepas resistentes, e o comportamento invasivo desses patógenos em pacientes imunodeprimidos aumentou nos últimos anos, dificultando o tratamento das dermatofitoses. Há, portanto, a necessidade de estudos para um melhor entendimento da biologia dos dermatófitos devido as suas importâncias médica e/ou veterinária e o escasso conhecimento da interação destes patógenos com os hospedeiros. No presente trabalho, analisamos oito espécies de dermatófitos: Arthroderma benhamiae, Microsporum canis, Microsporum gypseum, Trichophyton interdigitale, Trichophyton equinum, Trichophyton rubrum, Trichophyton tonsurans e Trichophyton verrucosum. Análises de genômica comparativa e de expressão de genes potencialmente envolvidos na degradação de queratina foram realizadas. Além disso, efetuamos o sequenciamento genômico em larga escala de uma das linhagens. A estrutura dos genes sub3, sub5 e sub7, que codificam serina endopeptidases com atividade queratinolítica, mep3 e mep4, que codificam proteínas pertencentes ao grupo das metaloendopeptidases, dppV, lap1 e lap2, que codificam exopeptidases, foi analisada por meio de ferramentas computacionais. Essas análises revelaram que os genes que codificam proteases possuem alto grau de conservação em suas estruturas, que é menor quando comparadas apenas suas regiões não codificadoras. As análises permitiram também a identificação em regiões promotoras de consensos específicos a gêneros de dermatófitos. Observamos que o acúmulo de transcritos destes genes, avaliados durante o cultivo em queratina, mimetizando o processo infeccioso, não está correlacionado à similaridade das sequências gênicas entre as espécies. Não encontramos correlação entre o nicho preferencial dos dermatófitos e suas sequências gênicas ou níveis transcricionais. Observamos que, na grande maioria das vezes, genes que codificam endo e exopeptidases, possuem acúmulo de transcritos em períodos iniciais de degradação de queratina. Nossos resultados sugerem que diferenças pontuais na sequencia gênica, diferenças em regiões promotoras ou, até mesmo, expressão variável destes genes que codificam um conjunto proteico com funções sinérgicas e provavelmente compensatórias, contribuam para os diferentes graus de reações inflamatórias no hospedeiro, bem como para a especificidade patógeno-hospedeiro. / Dermatophytes are filamentous fungi that infect keratinized substrates such as skin, nail and hair, searching for nutrients for their development and permanence in the host. They belong to the genera Epidermophyton, Microsporum or Trichophyton, and, depending on their natural habitat, are classified into geophilics, zoophilics or anthropophilics species. The indiscriminate use of antifungals has led to the selection of resistant strains, and the invasive behaviour of these pathogens in immunocompromised patients increased in the last years, hampering the treatment of the dermatophytoses. Therefore, there is a need of studies for a better understanding of the biology of the dermatophytes due to their medical and/or veterinary importance and the scarce knowledge about the interaction of these pathogens with their hosts. In this work, we analyzed eight species of dermatophytes: Arthroderma benhamiae, Microsporum canis, Microsporum gypseum, Trichophyton interdigitale, Trichophyton equinum, Trichophyton rubrum, Trichophyton tonsurans, and Trichophyton verrucosum. Comparative genomics and gene expression analyses of genes potentially involved in keratin degradation were performed. Moreover, we performed a large-scale genome sequencing of one of the strains. The structure of the genes sub3, sub5, and sub7, which encode serine endopeptidases with keratinolytic activity, mep3, and mep4, which encode proteins belonging to the group of the metalloendopeptidases, dppV, lap1, and lap2, encoding exopeptidases, were analyzed by computational tools. These analyses revealed that the genes encoding proteases possesses high degree of conservation in their structures, which are lower when their non-coding regions are compared. The analyses also allowed the identification of consensus in promoter regions, specific of dermatophytes genera. We observed that the transcripts accumulation of these genes, evaluated during the cultivation in keratin, mimicking the infection process, is not correlated to the gene sequence similarities among the species. We have not found any correlation between the preferential niche of dermatophytes and their gene sequences or transcription levels. Most of the times, we observed that genes encoding endo and exopeptidases accumulated transcripts at the beginning of keratin degradation. Our results suggest that specific differences in the genic sequencing, differences in promoter regions, or even variable expression of these genes encoding a set of proteins with synergic and probably compensatory functions, contribute to different levels of inflammatory reactions in the host, as well as to the host-pathogen specificity.

Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-03-03T12:29:55Z No. of bitstreams: 1 cesaraugustocaneschi.pdf: 2235312 bytes, checksum: 872ace88c40c0c376a4cde548eeed64b (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-04-24T01:42:30Z (GMT) No. of bitstreams: 1 cesaraugustocaneschi.pdf: 2235312 bytes, checksum: 872ace88c40c0c376a4cde548eeed64b (MD5) / Made available in DSpace on 2016-04-24T01:42:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 cesaraugustocaneschi.pdf: 2235312 bytes, checksum: 872ace88c40c0c376a4cde548eeed64b (MD5) Previous issue date: 2013-03-21 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / As dermatofitoses são infecções fúngicas que acometem o ser humano e os animais. São causadas principalmente por fungos filamentosos dermatófitos, cuja presença provoca alterações nos tecidos queratinizados. O tratamento destas doenças é longo e recidivas são frequentes. Isto posto, os objetivos deste trabalho foram identificar os componentes do óleo essencial de Baccharis trimera Less (D.C.) e investigar in vitro seu potencial antifúngico frente a seis linhagens: Trichophyton rubrum CCT 5507 URM 1666, Trichophyton mentagrophytes ATCC 9533, Trichophyton mentagrophytes ATCC 11481 e Trichophyton mentagrophytes ATCC 11480, Microsporum gypseum ATCC 14683 e Microsporum canis ATCC 32903. Foi realizada a análise da composição química do óleo essencial por cromatografia gasosa (CG) e os ensaios antifúngicos por meio da triagem microbiológica, da determinação das concentrações inibitória mínima (CIM) e fungicida mínima (CFM). Foi empregada a microscopia eletrônica de varredura (MEV) a fim de avaliar as alterações morfológicas nas linhagens fúngicas de interesse submetidas aos tratamentos propostos. Os resultados cromatográficos demonstraram a presença de vinte constituintes, sendo o β-pineno (23,4%) o majoritário. Os valores da CIM para o óleo essencial de B. trimera foram de 0,03 a 125 μg.mL-1 para cinco linhagens de fungos filamentosos avaliados com destaque para sua ação frente a linhagem de T. rubrum CCT 5507 URM 1666 que teve seu crescimento inibido na menor concentração. Para o T. mentagrophytes ATCC 11481 a CIM foi ≥ 1.000 μg.mL-1. A ação deste óleo essencial foi considerada fungicida após realização da CFM que ficou na faixa de 0,06 a 125 μg.mL-1. Através das eletromicrografias foi possível evidenciar alterações morfológicas nas estruturas fúngicas das cinco espécies submetidas à ação do óleo essencial de B. trimera. Os resultados apresentados neste trabalho permitem atribuir ao óleo essencial de carqueja ação antifúngica frente a fungos filamentosos dermatófitos, o que pode representar uma nova alternativa para o tratamento de dermatofitoses. / Dermatophytoses are fungal infections that affect humans and animals. These are mainly caused by filamentous fungi dermatophytes, whose presence causes changes in keratinized tissues. The treatment of this illness is long, and recurrences are frequently detected. In this context, the purpose of the present work was to identify the components of the essential oil of Baccharis trimera Less (DC) and to investigate their in vitro antifungal activity against six strains: Trichophyton rubrum CCT 5507 URM 1666, Trichophyton mentagrophytes ATCC 9533, Trichophyton mentagrophytes ATCC 11481 e Trichophyton mentagrophytes ATCC 11480, Microsporum gypseum ATCC 14683 e Microsporum canis ATCC 32903. The chemical composition of the oil was subjected to analysis by gas chromatography (GC) and the antifungal assay by microbial screening, determining its minimum inhibitory concentrations (MIC) and minimum fungicidal concentration (MFC). Scanning electron microscopy (SEM) was used to investigate morphological changes in the strains of interest submitted to the treatments. The chromatography results demonstrated the presence of twenty compounds, with β-pinene being responsible for the majority (23.4%) of its constitution. The MIC values for the essential oil of B. trimera were 0.03 to 125 μg.mL-1 for five strains of filamentous fungi evaluated highlighting on the strain of action against T. rubrum CCT 5507 URM 1666 that had their growth inhibited at lower concentrations. For T. mentagrophytes ATCC 11481 the MIC was ≥ 1,000 μg.mL-1. The oil was considered to have fungicide potential after completion of CFM which was in the range from 0.06 to 125 μg.mL-1. Through the images of scaning electron microscopy it was possible to verify the morphological changes in the structures of the five fungal species subjected to the action of the essential oil of B. trimera. The results presented in this work allows us to assign the essential oil of carqueja as having antifungal activity against filamentous fungi dermatophytes, which may represent a new alternative for the treatment of dermatophytoses.

Orientador: Luis Octavio Regasini / Resumo: As micoses superficiais e cutâneas são infecções fúngicas que acometem a camada mais externa do estrato córneo da pele e seus anexos. São as micoses mais frequentes dentre todas as infecções fúngicas e estão distribuídas por todo o mundo, afetando todas as faixas etárias. O impacto primário destas micoses é seu aspecto visual com estética negativa. Contudo, não se restringem apenas ao aspecto estético, vindo a ser um grave problema de saúde na população neonatal, senescente e de imunocomprometidos. Além disso, muitos fármacos exibem toxicidade alta, interações medicamentosas e alto custo econômico. As recidivas por meio do tratamento convencional costumam ser frequentes, as quais podem ser ocasionadas por cepas resistentes. Esse cenário torna premente a busca por antifúngicos inovadores. No presente estudo avaliou-se atividade antifúngica de 19 curcuminoides, provenientes da composteca do Laboratório de Antibióticos e Quimioterápicos (LAQ), contra fungos filamentosos dermatofíticos dos gêneros Trichophyton, Epidermophyton e Microsporum e leveduriformes (Candida spp.), de cepas de referência ATCC e de isolados clínicos, provenientes da coleção do Laboratório de Microbiologia da Faculdade de Medicina de São José do Rio Preto (FAMERP), bem como avaliou-se toxicidade dos curcuminoides mais potentes contra células de queratinócitos humanos (HaCat) e larva G. mellonella. Afim de verificar a atividade antifúngica dos compostos, foram determinados os valores: Concentração Inibitória ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Superficial and cutaneous mycoses are fungal infections that affect the outermost layer of the stratum corneum of the skin and its attachments. They are the most frequent mycoses among all fungal infections and are distributed all over the world. The first impact of these mycoses is their visual appearance with a negative aesthetic. However, they are not restricted to the aesthetic aspect, becoming a serious health problem in the neonatal, senescent and immunocompromised population. In addition, many drugs exhibit high toxicity, drug interactions and high economic cost. Relapses through conventional treatment are often frequent, which can be caused by resistant strains. This scenario demands the development of potent but safer compounds. Herein, we described the antifungal activity of a novel curcuminoid against dermatophyte and Candida species. A series of nineteen curcuminoid analogs was submitted to antifungal assay to assess MIC (minimum inhibitory concentration) and MFC (minimum fungicidal concentration) determined by the broth microdilution method. First, all compound were tested at 31.2 µg mL-1 in order to select the most active compound. The compound 3, 3'-Dimethoxycurcumin (DMC) showed the highest growth-inhibitory activity the largest spectrum of action against dermatophyte clinical isolates and reference strains of Candida tropicalis ATCC and Trichophyton rubrum CBS, with MIC values range of 1.9±31.2 µg mL-1. DMC exhibited fungistatic activity. Inverted microscope ... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

Orientadora: Regina Celia Candido / Banca: Ely Nahas / Banca: Izabel Yoko Ito / Resumo: A etiologia, epidemiologia e sintomatologia das dermatofitoses são quase heterogêneas e complexas. Nos últimos anos, a literatura vem divulgando o aumento das infecções fúngicas, sendo as dermatofitoses as principais responsáveis. Este trabalho teve como objetivos a observação de bovinos como possíveis reservatórios de dermatófitos, isolando e identificando esses fungos nos animais, ambiente e solo, bem como a determinação do perfil de suscetibilidade in vitro frente às drogas antifúngicas itraconazol, terbinafina e fluconazol; e aos medicamentos tópicos de uso veterinário LEPECID®, UNGÜENTO® spray e iodo a 5%. Foram coletadas 538 amostras em São Carlos - SP e região sul do estado de Mato Grosso do Sul. Foram identificados 12 (2,23%) dermatófitos nas amostras, sendo que, oito (7 Microsporum gypseum e um Microsporum spp) foram isolados de animais aparentemente saudáveis e quatro (M. gypseum) no solo. Dos 38 (7,6%) animais que apresentaram lesões sugestivas de dermatofitoses, somente três tinham características clínicas de tricofitose, porém, não foram identificados dermatófitos em cultura. Os antifúngicos itraconazol e terbinafina apresentaram melhor atividade fungicida in vitro que o fluconazol. Os medicamentos de uso veterinário LEPECID® e iodo a 5% foram mais ativos in vitro que o UNGÜENTO® spray. Todos os medicamentos apresentaram atividade fungicida frente ao M. gypseum, revelando serem excelentes alternativas para o tratamento tópico de lesões causadas por dermatófitos em bovinos. / Abstract: The etiology, epidemiology and symptomatology of dermatophytosis are quite heterogeneous and complex. In the last years, the literature showed an increase of fungal infections, being dermatophytosis main the responsible ones. This work had as objective the comment of bovines as possible reservoirs of dermatophytes, isolating and identifying to these fungi in animals, environment and soil, as well as determining susceptibility profile in vitro against antifungal agents (itraconazole, terbinafine and fluconazole) and against topical veterinarian use medicines (LEPECID®, UNGÜENTO® spray and iodine 5%). For this, 538 samples had been collected in São Carlos - SP and south region of the Mato Grosso do Sul state. The dermatophytes had been identified in 12 (2,23%) of the samples, being that, eight (7 Microsporum gypseum and 1 Microsporum spp) had been in apparently healthy animals and four (M. gypseum) in. Thirty-eight animals had presented suggestive dermatophytosis lesions being three to clinical characteristics of trichoophytosis, however, in these samples had not been identified dermatophytes. The antifungals itraconazole and terbinafine had presented fungicidal activity better in vitro that fluconazole. The veterinarian use medicines LEPECID® and iodine 5% had been more active that the UNGÜENTO® spray in vitro, however, all had presented fungicidal activity against M. gypseum, disclosing to be excellent alternatives for topical treatment to dermatophytosis in cattle. / Mestre