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Análise da resistência a cobre e zinco sobre o crescimento e expressão gênica em Xylella fastidiosa em condições de biofilme

Rodrigues, Carolina Munari [UNESP] 27 July 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:26:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-07-27Bitstream added on 2014-06-13T18:29:22Z : No. of bitstreams: 1 rodrigues_cm_me_botib.pdf: 878460 bytes, checksum: 50adcf0ae69bed0497b25ed84bbbb9d4 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Baseado nas informações geradas após o seqüenciamento do genoma, foi desenvolvido uma série de meios de cultura de composição definida (XDM1, XDM2, XDM3, XDM4 e XDM5). Portanto, um dos objetivos do presente trabalho foi estabelecer a curva de crescimento da X. fastidiosa no meio definido XDM2. Foi utilizada a estirpe 9a5c de X. fastidiosa mantida nesse mesmo meio de cultura. A medida da taxa de crescimento bacteriano foi realizada através de leituras de densidade óptica durante dezesseis dias com intervalos de 48 horas. A avaliação da viabilidade celular foi realizada através da contagem de unidade formadora de colônia (UFC) por diluição seriada. As duas avaliações apresentaram uma alta correlação (R2= 0,91) verificada através de regressão exponencial. O início da fase estacionária foi obtido após 10 dias de crescimento. De posse dos dados de UFC, foi possível calcular o tempo de geração da X. fastidiosa no meio XDM2, de aproximadamente 21 horas. Comparando o tempo de geração obtido na curva de crescimento em meio PW (11,37h), foi comprovado que a bactéria apresenta um crescimento mais rápido em meio PW do que no meio definido XDM2. Outro aspecto interessante revelado no estudo do genoma funcional da X. fastidiosa está relacionado à expressão de genes associados à patogenicidade. O principal mecanismo de patogenicidade é a formação de biofilme no xilema da planta hospedeira conduzindo ao bloqueio dos vasos do xilema. Análise da expressão diferencial de genes desse fitopatógeno em condição de virulência e durante a formação do biofilme revela padrões de genes associados à adaptação e competitividade no ambiente do hospedeiro. Esses genes possivelmente são ativados no biofilme maduro e são essenciais para sua manutenção na planta. Além disso, sabe-se que bactérias que formam biofilme apresentam resistência crescente a compostos... / Based on informations generated after the genome sequencing, a series of culture media of defined composition were developed (XDM1, XDM2, XDM3, XDM4 e XDM5). Therefore, one of the objectives of the present work was to establish the growth curve of X. fastidiosa in the defined medium XDM2. For this, we utilized the 9a5c strain of X. fastidiosa maintained in this medium. The measurement of the bacterial growth rate was done by optical density analysis during sixteen days with intervals of 48 hours. The evaluation of cellular viability was carried out counting the colony units forming (CFU) by serial dilution. Both evaluations presented a high correlation (R2 = 0,91) verified by exponential regression. The beginning of the stationary phase was observed after ten days of growth. With the data of CFU, it was possible to calculate the generation time of X. fastidiosa in XDM2 medium, estimated to be of approximated 21 hours. Comparing the generation time obtained for the growth curve in PW medium (11,37 hours), we proved that the bacteria grow faster in PW compared with the defined medium XDM2. Another interesting aspect reveled by the study of functional genome of X. fastidiosa is related to the expression of genes associated with pathogenicity. The main mechanism of its pathogenicity is the formation of a biofilm in the xylem of the host plant, causing the blockage of the xylem vessels. Analysis of the differential expression of genes of this phytophatogen in condition of virulence and during the biofilm formation reveals standards associated to adaptation and competition in the host environment. These genes are possibly activated in the mature biofilm and are essential for its maintenance in the plant. Besides, it is known that bacteria that form biofilm present elevated resistance to antimicrobial compounds while biofilm is structured, like antibiotics, heavy metals... (Complete abstract click electronic access below)
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Estudo comparativo in vitro da suscetibilidade à ciprofloxacina e à vancomicina em linhagens de Enterococcus faecalis isoladas de processos infecciosos /

Genaro, Angelma. January 2002 (has links)
Orientador: Carlos Alberto de Magalhães Lopes / Resumo: O Enterococcus faecalis é considerado, atualmente, um dos grandes agentes responsáveis pelas infecções hospitalares, onde sua resistência a diversas drogas tem sido motivo de preocupação das autoridades. Neste contexto, o trabalho teve como objetivo determinar a suscetibilidade antimicrobiana e a presença de linhagens mutantes em E. faecalis. Foram obtidas 74 linhagens provenientes de hemoculturas e de secreções purulentas de pacientes internados no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu, UNESP, no período de 1995 a 2001. Foram analisadas "in vitro", quanto à sua suscetibilidade, a vancomicina e a ciprofloxacina através da determinação da concentração inibitória mínima (CIM), da concentração bactericida mínima (CBM) e a presença de linhagens mutantes através da determinação da taxa de mutação espontânea à ciprofloxacina. Os resultados demonstraram uma maior efetividade da vancomicina, que inibiu 98,6% das linhagens de E. faecalis (CIM 0,06 a 1mg/ml). Entretanto, quando da análise bactericida, o perfil de sensibilidade desta droga apresentou-se elevado, onde 73% das linhagens tiveram a CBM igual ou maior que 64mg/ml. Para a ciprofloxacina, o perfil de sensibilidade ficou distribuído entre as classes de CIM e CBM. Nesse estudo, não foi encontrada a presença de linhagens mutantes. Há probabilidade de algumas linhagens serem tolerantes à vancomicina, sendo necessário então, a realização de testes mais apurados, no sentido de confirmar esta característica. / Abstract: Enterococcus faecalis has been considered one of the major agents of nosocomial infection; its resistance to several drugs has been the concern of health authorities. The objective of this study was to determine antimicrobial susceptibility and the presence of mutant strains in E. faecalis. Seventy-four strains were obtained from hemocultures and purulent secretions of patients hospitalized at the Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu - UNESP between 1995 and 2001. They were analyzed in vitro for their susceptibility to vancomycin and ciprofloxacin by determining the minimum inhibitory concentration (MIC), minimum bactericidal concentration (MBC), and the presence of mutant strains through determination of the spontaneous mutation rate to ciprofloxacin. Our results showed vancomycin higher efficacy, inhibiting 98.6% of E. faecalis strains (MIC 0.06 1μg/ml). The bactericidal analysis, however, showed vancomycin high susceptibility profile, with 73% of strains, presenting MBC equal or higher than 64μ/ml. Ciprofloxacin sensitivity profile was found in MIC and MBC classes. No mutant strains were found in this study. It is probable that some strains are resistant to vancomycin, which requires that further tests be performed. / Mestre
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Caracterização fenotípica e tipagem molecular de MRSA isolados na unidade de terapia intensiva do Hospital de Clínicas da Universidade Federal do Paraná

Rosa, Alexandre Walter 19 October 2009 (has links)
No description available.
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Fatores de virulência, resistência antimicrobiana em isolados de Escherichia coli provenientes do trato genito-urinário de humano e das fezes de seus animais de companhia

Paula, Cleber Jacob Silva de [UNESP] 10 May 2012 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:53Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-05-10Bitstream added on 2014-06-13T21:05:09Z : No. of bitstreams: 1 paula_cjs_dr_jabo.pdf: 584953 bytes, checksum: ec9392065fb3f24ecd68608f81b4c9f5 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / De 2008 a 2011 foram isoladas 110 cepas de Escherichia coli, sendo 59 a partir de urina de mulheres com ITU bacteriana. Os outros 51 isolados foram coletados por meio de swabs anais dos respectivos animais de estimação. Foram pesquisados por PCR a presença de genes de virulência e os genes mais encontrados foram o hlyF (44,06%), iss (42,37%) e fimH (100%) e hlyF (13,72%), iss (11,76%) e fimH (96,07%) entre as cepas de origem humana e animal, respectivamente. Foi realizada também a técnica de ERIC-PCR, onde pode observar dissimilaridades genéticas entre estes dois grupos bacterianos estudados, dando fortes indícios de que a transmissão no presente trabalho esteve ausente. Foram realizados antibiogramas a partir de cada um dos cinco isolados de cada amostra encontrando maior número de cepas resistentes em mulheres que nos animais em 8 dos 11 antimicrobianos testados, as maiores resistências para as cepas de origem humana foram o ácido nalidíxico e o ciprofloxacino com 97,14% e para as de origem animal a amoxicilina / ácido clavulânico e ampicilina com 74,28% e 68,57% respectivamente. As cepas de origem humana apresentaram também maiores índices de multirresistência que dos animais com 71,42% e 40%, respectivamente. Estas diferenças entre as resistências fortalecem a hipótese de que a origem das bactérias causadoras de ITU em mulheres não é de seus respectivos animais de companhia / A hundred-ten Escherichia coli strains was isolated from 2008 to 2011, among them 59 were from women with urinary tract infection (UTI) and 51 were from their pets collected by rectal swab. The virulence genes was search by PCR and the most found genes were fimH (100%), hly (44%) and iss (42.3%) all of then from women. Also was used the ERIC-PCR method to check the similarity among both bacterial groups analyzed. The results showed different patterns for each pair women-animal bacterial isolates. In general the isolates from human showed more resistance to the antimicrobial drugs examined, the highest resistance rate was for nalidixic acid (97.1%) and for streptomicin (96.0%) both from human isolates. The results obtained in this study do not permit to suggest a transmission of bacterial strains involving humans and their companion animals
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Diagnóstico de resistência anti-helmíntica em bovinos

Neves, José Henrique das [UNESP] 21 February 2014 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-11-10T11:09:55Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-02-21Bitstream added on 2014-11-10T11:57:43Z : No. of bitstreams: 1 000785387.pdf: 1004100 bytes, checksum: 60651dd50c503ca75c5c206fb2da89b0 (MD5) / A resistência anti-helmíntica em bovinos se tornou um problema global, e no Brasil tem sido relatada em alguns estados. Devido à necessidade de métodos mais precisos de diagnóstico da resistência anti-helmíntico, o objetivo deste trabalho foi avaliar duas técnicas (McMaster e Flotac) e duas fórmulas matemáticas (FECRT1 - de acordo com a média de OPG e FECRT2 - de acordo com o número total de ovos contados) para calcular o teste de redução de ovos nas fezes (FECRT). O anti-helmíntico testados foram ivermectina (0,2 mg/kg), moxidectina (0,2 mg/kg) , sulfóxido de albendazol (2,5 mg/kg) e fosfato de levamisol (4,7 mg/kg) , administrada na dose recomendada pelo fabricante. Dez propriedades foram avaliadas, quatro visitas em cada, pré-tratamento (D - 2), processamento (D 0), 10 dias pós-tratamento (D10) e 28 dias póstratamento (D28). Em todas as propriedades foi observada resistência a um ou mais agentes anti-helmínticos testados, independentemente da técnica ou da fórmula matemática avaliada. Os gêneros/espécies encontradas com resistência a um ou mais anti-helmínticos foram Haemonchus placei, Cooperia spp., Trichostrongylus spp. e Oesophagostomum radiatum. Em conclusão, a resistência anti-helmíntica está presente em todos os rebanhos avaliados. A técnica Flotac e a fórmula matemática FECR2 foram mais precisas do que a técnica de McMaster e fórmula FECR1. Há necessidade de maior conscientização dos produtores sobre o uso de anti-helmínticos. Portanto, em estudos futuros de resistência anti-helmíntica em bovinos, recomenda-se a utilização do método de diagnóstico com uma maior precisão, como é o método Flotac. Na interpretação dos resultados, nosso estudo indica que o cálculo pela fórmula FECR2, o que elimina o uso de um grupo de controle, deve ser recomendada / The anthelmintic resistance in cattle has become a global problem, and in Brazil it has been reported in some states. Due to the need for more accurate methods of diagnosis of anthelmintic resistance the purpose this work was to evaluate two techniques (McMaster and Flotac) and two mathematical formulas (FECRT1 - according to the average EPG and FECRT2 - according to the total number of eggs counted) to calculate the faecal egg count reduction test (FECRT) in the diagnosis of anthelmintic resistance in cattle. The anthelmintic tested were ivermectin (0.2 mg/kg), moxidectin (0.2 mg/kg), albendazole sulfoxide (2.5 mg/kg) and levamisole phosphate (4.7 mg/kg), administered at the dose recommended by the manufacturer. Ten farms were assessed, four visits in each pre-treatment (D -2), processing (D 0), 10 days post-treatment (D 10) and 28 days post-treatment (D 28). In all of the properties was observed resistance to one or more anthelmintics tested, regardless of the technique (McMaster or Flotac) or FECRT the mathematical formula (1 and 2). The genera/species found with resistance to one or more anthelmintics were Haemonchus placei, Cooperia spp., Trichostrongylus spp. and Oesophagostomum radiatum. In conclusion, the anthelmintic resistance is present in all herds evaluated. The Flotac technical and mathematical formula FECR2 were more accurate than the McMaster technique and formula FECR1. Need is greater awareness of the producers on the use of anthelmintics. Therefore, in future studies on anthelmintic resistance in cattle, use of the method of diagnosis with higher accuracy, it is recommended, as is the case FLOTAC method. In interpreting the results, our study indicates that the calculation by formula FECR2 %, which eliminates the use of a control group, should be recommended
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Fatores de virulência, resistência antimicrobiana em isolados de Escherichia coli provenientes do trato genito-urinário de humano e das fezes de seus animais de companhia /

Paula, Cleber Jacob Silva de. January 2012 (has links)
Orientador: José Moacir Marin / Banca: Maria Cristina Monteiro de Souza Gugelmin / Banca: Simone Barone Salgado Marques / Banca: Everlon Cid Rigobelo / Banca: Tammy Priscilla Chioda Delfino / Resumo: De 2008 a 2011 foram isoladas 110 cepas de Escherichia coli, sendo 59 a partir de urina de mulheres com ITU bacteriana. Os outros 51 isolados foram coletados por meio de swabs anais dos respectivos animais de estimação. Foram pesquisados por PCR a presença de genes de virulência e os genes mais encontrados foram o hlyF (44,06%), iss (42,37%) e fimH (100%) e hlyF (13,72%), iss (11,76%) e fimH (96,07%) entre as cepas de origem humana e animal, respectivamente. Foi realizada também a técnica de ERIC-PCR, onde pode observar dissimilaridades genéticas entre estes dois grupos bacterianos estudados, dando fortes indícios de que a transmissão no presente trabalho esteve ausente. Foram realizados antibiogramas a partir de cada um dos cinco isolados de cada amostra encontrando maior número de cepas resistentes em mulheres que nos animais em 8 dos 11 antimicrobianos testados, as maiores resistências para as cepas de origem humana foram o ácido nalidíxico e o ciprofloxacino com 97,14% e para as de origem animal a amoxicilina / ácido clavulânico e ampicilina com 74,28% e 68,57% respectivamente. As cepas de origem humana apresentaram também maiores índices de multirresistência que dos animais com 71,42% e 40%, respectivamente. Estas diferenças entre as resistências fortalecem a hipótese de que a origem das bactérias causadoras de ITU em mulheres não é de seus respectivos animais de companhia / Abstract: A hundred-ten Escherichia coli strains was isolated from 2008 to 2011, among them 59 were from women with urinary tract infection (UTI) and 51 were from their pets collected by rectal swab. The virulence genes was search by PCR and the most found genes were fimH (100%), hly (44%) and iss (42.3%) all of then from women. Also was used the ERIC-PCR method to check the similarity among both bacterial groups analyzed. The results showed different patterns for each pair women-animal bacterial isolates. In general the isolates from human showed more resistance to the antimicrobial drugs examined, the highest resistance rate was for nalidixic acid (97.1%) and for streptomicin (96.0%) both from human isolates. The results obtained in this study do not permit to suggest a transmission of bacterial strains involving humans and their companion animals / Doutor
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Técnicas sorológicas e moleculares na avaliação da efetividade do tratamento contra Trypanosoma vivax em caprinos experimentalmente infectados /

Sampaio, Paulo Henrique. January 2017 (has links)
Orientador: Fabiano Antonio Cadioli / Resumo: Trypanosoma vivax é hemoparasita que infecta ruminantes e causa grandes perdas econômicas na pecuária, reduzindo os índices produtivos e reprodutivos dos animais. A principal alteração causada pelo parasita é anemia, podendo em alguns casos levar a sinais clínicos neurológicos e eventualmente levar o animal ao óbito. Os sinais clínicos são inespecíficos, fato que dificulta seu diagnóstico. O correto diagnóstico e tratamento são fundamentais para o efetivo controle da doença. Desta forma, o presente trabalho objetivou utilizar a LAMP, cPCR, RIFI e ELISA como ferramentas diagnósticas para verificar a cura parasitológica e soronegativação de caprinos experimentalmente infectados por T. vivax após o tratamento com o diaceturato de diminazeno (DM) ou cloridrato de isometamidium (ISM), além de avaliar as alterações histopatológicas do encéfalo para esclarecer melhor os mecanismos que levam a manifestações neurológicas. No presente trabalho detectamos anemia nos animais experimentalmente infectados por T. vivax e o parasita apresentou resistência a ambos os medicamentos, a qual foi comprovada por métodos sorológicos e moleculares. Também foram detectadas alterações na celularidade do neurópilo de animais infectados, o que pode resultar em danos aos neurônios e no desenvolvimento dos sinais clínicos neurológicos nos animais cronicamente infectados. Concluímos que o isolado testado no experimento foi resistente aos quimioterápicos testados, sendo a melhor forma de diagnóstico a associ... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Trypanosoma vivax is a hemoparasite that infects ruminants and causes huge economic losses in livestock, reducing animals productive and reproductive indexes. The main alteration caused by this parasite is anemia and may eventually lead animal to death. The clinical signs are nonspecific which explains the correct diagnosis difficult. Correct diagnosis and treatment are essential for the effective control of this disease. Thus, the goals of this present work was use tools diagnostics molecular (LAMP and PCR) and serological (ELISA and IFAT) to verify the parasitological cure and seronegativation of goats experimentally infected with T. vivax after treatment with diminazene diaceturate (DM) or isometamidium hydrochloride (ISM), besides assess histological alterations in ruminants' brains to elucidate the mechanism that cause neurologic disorders. In our study we detected anemia and, parasitic resistance to both drugs in animals experimentally infected with T. vivax, which was confirmed by serologic and molecular methods. Additionally, we detected alterations in neuropyl cells of infected animals, which may cause injuries in neuron and consequently neurologic signs in chronic infected animals. Therefore, we conclude that the tested T. vivax isolate was resistant to both drugs, being the best way of diagnosis is the association of serologic and molecular methods and T. vivax cause alterations in neuropyl cells. / Doutor
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Estudo comparativo in vitro da suscetibilidade à ciprofloxacina e à vancomicina em linhagens de Enterococcus faecalis isoladas de processos infecciosos

Genaro, Angelma [UNESP] January 2002 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:02Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2002Bitstream added on 2014-06-13T19:49:31Z : No. of bitstreams: 1 genaro_a_me_botfm.pdf: 377043 bytes, checksum: 72c1832d7ec88dfecbd5ba14344427c1 (MD5) / O Enterococcus faecalis é considerado, atualmente, um dos grandes agentes responsáveis pelas infecções hospitalares, onde sua resistência a diversas drogas tem sido motivo de preocupação das autoridades. Neste contexto, o trabalho teve como objetivo determinar a suscetibilidade antimicrobiana e a presença de linhagens mutantes em E. faecalis. Foram obtidas 74 linhagens provenientes de hemoculturas e de secreções purulentas de pacientes internados no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu, UNESP, no período de 1995 a 2001. Foram analisadas “in vitro”, quanto à sua suscetibilidade, a vancomicina e a ciprofloxacina através da determinação da concentração inibitória mínima (CIM), da concentração bactericida mínima (CBM) e a presença de linhagens mutantes através da determinação da taxa de mutação espontânea à ciprofloxacina. Os resultados demonstraram uma maior efetividade da vancomicina, que inibiu 98,6% das linhagens de E. faecalis (CIM 0,06 a 1mg/ml). Entretanto, quando da análise bactericida, o perfil de sensibilidade desta droga apresentou-se elevado, onde 73% das linhagens tiveram a CBM igual ou maior que 64mg/ml. Para a ciprofloxacina, o perfil de sensibilidade ficou distribuído entre as classes de CIM e CBM. Nesse estudo, não foi encontrada a presença de linhagens mutantes. Há probabilidade de algumas linhagens serem tolerantes à vancomicina, sendo necessário então, a realização de testes mais apurados, no sentido de confirmar esta característica. / Enterococcus faecalis has been considered one of the major agents of nosocomial infection; its resistance to several drugs has been the concern of health authorities. The objective of this study was to determine antimicrobial susceptibility and the presence of mutant strains in E. faecalis. Seventy-four strains were obtained from hemocultures and purulent secretions of patients hospitalized at the Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Botucatu – UNESP between 1995 and 2001. They were analyzed in vitro for their susceptibility to vancomycin and ciprofloxacin by determining the minimum inhibitory concentration (MIC), minimum bactericidal concentration (MBC), and the presence of mutant strains through determination of the spontaneous mutation rate to ciprofloxacin. Our results showed vancomycin higher efficacy, inhibiting 98.6% of E. faecalis strains (MIC 0.06 1μg/ml). The bactericidal analysis, however, showed vancomycin high susceptibility profile, with 73% of strains, presenting MBC equal or higher than 64μ/ml. Ciprofloxacin sensitivity profile was found in MIC and MBC classes. No mutant strains were found in this study. It is probable that some strains are resistant to vancomycin, which requires that further tests be performed.
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Diagnóstico de resistência anti-helmíntica em bovinos /

Neves, José Henrique das. January 2014 (has links)
Orientador: Alessandro Francisco Talamini do Amarante / Banca: Cyntia Ludovico Martins / Banca: Helder Louvandini / Resumo: A resistência anti-helmíntica em bovinos se tornou um problema global, e no Brasil tem sido relatada em alguns estados. Devido à necessidade de métodos mais precisos de diagnóstico da resistência anti-helmíntico, o objetivo deste trabalho foi avaliar duas técnicas (McMaster e Flotac) e duas fórmulas matemáticas (FECRT1 - de acordo com a média de OPG e FECRT2 - de acordo com o número total de ovos contados) para calcular o teste de redução de ovos nas fezes (FECRT). O anti-helmíntico testados foram ivermectina (0,2 mg/kg), moxidectina (0,2 mg/kg) , sulfóxido de albendazol (2,5 mg/kg) e fosfato de levamisol (4,7 mg/kg) , administrada na dose recomendada pelo fabricante. Dez propriedades foram avaliadas, quatro visitas em cada, pré-tratamento (D - 2), processamento (D 0), 10 dias pós-tratamento (D10) e 28 dias póstratamento (D28). Em todas as propriedades foi observada resistência a um ou mais agentes anti-helmínticos testados, independentemente da técnica ou da fórmula matemática avaliada. Os gêneros/espécies encontradas com resistência a um ou mais anti-helmínticos foram Haemonchus placei, Cooperia spp., Trichostrongylus spp. e Oesophagostomum radiatum. Em conclusão, a resistência anti-helmíntica está presente em todos os rebanhos avaliados. A técnica Flotac e a fórmula matemática FECR2 foram mais precisas do que a técnica de McMaster e fórmula FECR1. Há necessidade de maior conscientização dos produtores sobre o uso de anti-helmínticos. Portanto, em estudos futuros de resistência anti-helmíntica em bovinos, recomenda-se a utilização do método de diagnóstico com uma maior precisão, como é o método Flotac. Na interpretação dos resultados, nosso estudo indica que o cálculo pela fórmula FECR2, o que elimina o uso de um grupo de controle, deve ser recomendada / Abstract: The anthelmintic resistance in cattle has become a global problem, and in Brazil it has been reported in some states. Due to the need for more accurate methods of diagnosis of anthelmintic resistance the purpose this work was to evaluate two techniques (McMaster and Flotac) and two mathematical formulas (FECRT1 - according to the average EPG and FECRT2 - according to the total number of eggs counted) to calculate the faecal egg count reduction test (FECRT) in the diagnosis of anthelmintic resistance in cattle. The anthelmintic tested were ivermectin (0.2 mg/kg), moxidectin (0.2 mg/kg), albendazole sulfoxide (2.5 mg/kg) and levamisole phosphate (4.7 mg/kg), administered at the dose recommended by the manufacturer. Ten farms were assessed, four visits in each pre-treatment (D -2), processing (D 0), 10 days post-treatment (D 10) and 28 days post-treatment (D 28). In all of the properties was observed resistance to one or more anthelmintics tested, regardless of the technique (McMaster or Flotac) or FECRT the mathematical formula (1 and 2). The genera/species found with resistance to one or more anthelmintics were Haemonchus placei, Cooperia spp., Trichostrongylus spp. and Oesophagostomum radiatum. In conclusion, the anthelmintic resistance is present in all herds evaluated. The Flotac technical and mathematical formula FECR2 were more accurate than the McMaster technique and formula FECR1. Need is greater awareness of the producers on the use of anthelmintics. Therefore, in future studies on anthelmintic resistance in cattle, use of the method of diagnosis with higher accuracy, it is recommended, as is the case FLOTAC method. In interpreting the results, our study indicates that the calculation by formula FECR2 %, which eliminates the use of a control group, should be recommended / Mestre
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Investigação de genes de resistência às quinolonas e aminoglicosídeos em Klebsiella pneumoniae produtoras de carbapenemases do tipo KPC em hospitais do estado de São Paulo /

Tolentino, Fernanda Modesto January 2015 (has links)
Orientador: Mara Correa Lelles Nogueira / Coorientador: Doroti de Oliveira Garcia / Banca: Ana Cristina Gales / Banca: Afonso Luis Barth / Banca: Aripuanã Sakura Aranha Watanabe / Banca: Margarete Teresa Gottardo de Almeida / Resumo: O aumento nas taxas de infecção por K. pneumoniae produtoras de KPC tornou-se um sério problema de saúde pública mundial. Estas enzimas hidrolizam carbapenêmicos, oxyimino-cefalosporinas, cefamicinas e não são inibidas por inibidores das -lactamases tais como o ácido clavulânico, sulbactam e tazobactam. Além disso, em plasmídeos que carreiam o gene blaKPC, geralmente são encontrados genes de resistência a outros antimicrobianos, como quinolonas e aminoglicosídeos. Deste modo, o objetivo deste estudo foi investigar, de forma comparativa, a presença de genes de resistência aos aminoglicosídeos, quinolonas e - lactâmicos entre K. pneumoniae produtoras de KPC, provenientes de diversos hospitais da cidade de São Paulo e de um hospital terciário localizado em São José do Rio Preto, região noroeste do estado de São Paulo. A similaridade genética e a relação clonal entre as cepas isoladas em cada região também foram determinadas. Foram estudadas cem cepas de K. pneumoniae produtoras de KPC, sendo cinquenta de hospitais da cidade de São Paulo, armazenadas na coleção do Instituto Adolfo Lutz de São Paulo, denominadas SP, e cinquenta do Hospital de Base de São José do Rio Preto, denominadas KP. O gene blaCTX-M foi detectado em 76% das cepas KP e em 58% das cepas SP. Entre as cepas KP, 68,4% apresentaram blaCTX-M-15, 23,7% blaCTX-M-2, 2,6%% blaCTX-M-59, 2,6% blaCTX-M-15 e blaCTX-M-59 simultaneamente e 2,6% não identificado. Entre as cepas SP, 51,7% apresentaram blaCTX-M-2, 37,9% blaCTX-M-15, 2,5% blaCTX-M-15 e blaCTX-M-2 simultaneamente e 5% blaCTX-M-14. Dos sete genes de AMEs investigados, foram detectados cinco, sendo aph(3')-VI, aph(3')-Ia, aac(6')- Ib, aac(3)-Ia e aac(3)IIa, distribuídos entre 95% das cepas, sem diferença entre KP e SP. Dos sete genes de metiltransferases 16S RNAr, apenas o gene rmtB foi detectado, em duas cepas SP. Quanto aos genes determinantes de resistência às quinolonas, 42% das cepas KP... / Abstract: The increase in infection rates by KPC producing K. pneumoniae is a serious global public health problem. These enzymes hydrolyze carbapenems, oxyimino-cephalosporins, cephamycins, and -lactamase inhibitors such as clavulanic acid, sulbactam and tazobactam. In addition, the plasmids carrying blaKPC genes generally harbor other antimicrobial resistance genes. Thus, the aim of this study was to investigate, in a comparative way, the presence of genes conferring resistance to aminoglycosides, quinolones and -lactams between KPC producing K. pneumonia from various hospitals in São Paulo City and from a tertiary hospital located in Sao Jose do Rio Preto, northwest of São Paulo state. The genetic similarity and the clonal relationship among strains were also determined. One hundred isolates were studied: fifty from different hospitals in São Paulo (named SP), and fifty from the "Hospital de Base de São José do Rio Preto" (named KP). The blaCTX-M gene was detected in 76% of the KP strains and in 58% of the SP strains. Among the KP strains, 68.4% had blaCTX-M-15, 23.7% blaCTX-M-2, 2.6% blaCTX-M-59, 2.6% blaCTX-M-15 and blaCTX M-59 simultaneously, and 2.6% were unidentified. Among the SP strains, 51.7% presented blaCTX-M-2, 37.9% blaCTX-M-15, 2.5% blaCTX-M-15 and blaCTX-M-2 simultaneously, and 5% blaCTX-M-14. Regarding the genes for AMEs, among the seven types investigated, five were detected: aph (3') -VI, aph (3 ') - Ia, aac (6') - Ib, aac (3) -Ia and aac (3) IIa were detected among 95% of the strains, and no difference was observed between KP and SP strains. Among the seven genes for 16S rRNA methyltransferases, only the rmtB was detected, in two SP strains. Concerning genes that determine resistance to quinolones, 42% of he KP and 14% of the SP strains showed qnrB. The oqxAB gene was detected in 56% and 2% of the SP and KP strains, respectively. Molecular typing by ERIC-PCR revealed that genetical... / Doutor

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