Para avaliar a circulação e freqüência dos genótipos de eritrovírus na região amazônica, foi analisado um total de 487 amostras de soros/plasmas colhidas de pacientes apresentando sintomas e sinais clínicos sugestivos de infecção pelos eritrovírus. O ensaio imunoenzimático foi utilizado para detecção de anticorpos específicos para B19, das classes IgM/IgG, e a reação em cadeia da polimerase/semi-nested PCR para detecção do DNA. Das 487 amostras examinadas, 117 (24%) mostraram a presença do DNA dos eritrovírus, sendo todas as 117 foram posteriormente seqüenciadas e genotipadas. A maioria dos isolamentos foi classificada como genótipo 1 (91% das amostras) e 3b (9% ). Também observamos três diferentes grupos dentro do genótipo 1 (A1, A2, B). Conseqüentemente, estas linhagens de B19 introduzidas em Belém apresentaram uma elevada taxa de mudanças dos aminoácidos, decorrência da pressão seletiva, gerando reinfecções consecutivas em uma pequena rede de transmissão, metaforicamente comparada a uma \"panela de pressão evolutiva\". / To assess the circulation and relative frequency of erythrovirus genotypes in clinical samples from patients living in the Amazon region we screened a total of 487 samples from patients suffering from different clinical manifestations suggestive of erythrovirus infections. Enzyme-linked immunosorbent assay was used to detect B19-specific IgM/IgG antibodies and polymerase chain reaction/ semi-nested PCR for viral DNA detection. Of the 487 samples 117 (24%) were positive for the erythrovirus DNA and all 117 isolates were sequenced and genotyped analyzing a fragment of 476 bp of VP1 and VP2 gene sequences of the erythrovirus. The majority of isolates was classified as genotype 1 (91% of the samples) and 3b (9% of the samples). We also reported three different clusters (A1, A2, B) within genotype 1. Our analysis revealed a strikingly different pattern of evolutionary change for those viral lineages introduced in Belém, which exhibited a higher rate of nonsynonymous substitutions compared to those viruses sampled from other locations.

As espécies do gênero Rineloricaria são representantes típicos da subfamília Loricariinae, família Loricariidae, tradicionalmente caracterizada pela presença de odontódios recobrindo o corpo, corpo fortemente deprimido e ausência de nadadeira adiposa. Rineloricaria compreende 65 espécies nominais, sendo o gênero mais rico em espécies na subfamília Loricariinae. Estudos filogenéticos prévios sobre Loricariidae não concordaram sobre a hipótese de monofiletismo e posicionamento filogenético de Rineloricaria entre outros Loricariinae. Os objetivos deste trabalho foram testar o monofiletismo do gênero e determinar seu posicionamento entre outros Loricariinae. Um estudo filogenético incluindo 36 espécies de Rineloricaria e 181 caracteres foi realizado utilizando parcimônia estrita. Os principais dados para análise foram derivados de morfologia esquelética e morfologia externa. O grupo externo incluiu uma quantidade representativa de gêneros considerados proximamente relacionados à Rineloricaria, sendo Neoplecostomus microps o táxon mais externo e ponto de enraizamento. Os resultados indicaram que Rineloricaria é monofilético e grupo-irmão dos outros Loricariinae. Doze sinapomorfias sustentam o monofiletismo de Rineloricaria. Dentre estas, uma sinapomorfia exclusiva é um processo dorso-mesial bem desenvolvido no quarto osso faringobranquial. Outras sinapomorfias não exclusivas para o gênero são: uma grande placa pré-anal trapezoidal circundada por três placas poligonais e caracteres específicos de dimorfismo sexual. / The species of Rineloricaria are typical members of Loricariinae subfamily, family Loricariidae, traditionally characterized by the presence of odontodes covering the body, strongly depressed body and absence of adipose fin. Rineloricaria comprises 65 nominal species and it is the most speciesrich genus in the subfamily Loricariinae. Previous phylogenetic studies on Loricariidae have not agreed on the putative monophyly and phylogenetic position of Rineloricaria among other Loricariinae. The objectives of this work were to test the monophyly of the genus and to determine its position among other Loricariinae. A phylogenetic study including 36 species of Rineloricaria and 181 characters was conducted using strict parsimony. The primary data for the analysis came from skeleton and external morphology. The outgroup included a number of representatives of genera previously considered as closely related to Rineloricaria, with Neoplecostomus microps as the most distant outgroup and rooting point. The results indicate that Rinolericaria is monophyletic and sister group to all other Loricariinae. Twelve sinapomorphies support the monophyly of Rineloricaria. Unique among them is the presence of a well-developed dorso-mesial process on the fourth pharyngobranchial bone. Other non-unique synapomorphies for the genus include: a great trapezoidal preanal plate surrounded by three polygonal plates and some specific dimorphic sexual features.

Nesta tese apresentamos alguns resultados teóricos e práticos da modelagem de seqüências simbólicas com cadeias estocásticas parcimoniosas. As cadeias estocásticas parcimoniosas, que incluem as cadeias estocásticas de memória variável, constituem uma generalização das cadeias de Markov de alcance fixo. As seqüências simbólicas às quais foram aplicadas as ferramentas desenvolvidas são as cadeias de aminoácidos. Primeiramente, introduzimos um novo algoritmo, chamado de SPST, para selecionar o modelo de cadeia estocástica parcimoniosa mais ajustado a uma amostra de seqüências. Em seguida, utilizamos esse algoritmo para estudar dois importantes problemas da genômica; a saber, a classificação de proteínas em famílias e o estudo da evolução das seqüências biológicas. Finalmente, estudamos a velocidade de convergência de algoritmos relacionados com a estimação de uma subclasse das cadeias estocásticas parcimoniosas, as cadeias estocásticas de memória variável. Assim, generalizamos um resultado prévio de velocidade exponencial de convergência para o algoritmo PST, no caso de cadeias de memória ilimitada. Além disso, obtemos um resultado de velocidade de convergência para uma versão generalizada do Critério da Informação Bayesiana (BIC), também conhecido como Critério de Schwarz. / In this thesis we present some theoretical and practical results, concerning symbolic sequence modeling with parsimonious stochastic chains. Parsimonious stochastic chains, which include variable memory stochastic chains, constitute a generalization of fixed order Markov chains. The symbolic sequences modeled with parsimonious stochastic chains were the sequences of amino acids. First, we introduce a new algorithm, called SPST, to select the model of parsimonious stochastic chain that fits better to a sample of sequences. Then, we use the SPST algorithm to study two important problems of genomics. These problems are the classification of proteins into families and the study of the evolution of biological sequences. Finally, we find upper bounds for the rate of convergence of some algorithms related with the estimation of a subclass of parsimonious stochastic chains; namely, the variable memory stochastic chains. In consequence, we generalize a previous result about the exponential rate of convergence of the PST algorithm, in the case of unbounded variable memory stochastic chains. On the other hand, we prove a result about the rate of convergence of a generalized version of the Bayesian Information Criterion (BIC), also known as Schwarz\' Criterion.

Esta pesquisa lidou com a unificação de grafos aplicada ao problema das redes haplotípicas. A partir da baixa confiabilidade encontrada nas redes geradas pelos algoritmos tradicionais, foi necessário introduzir uma nova proposição para melhorar o resultado obtido. Para esta avaliar o resultado obtido pelo novo algoritmo, desenvolveu-se um arcabouço teórico-formal possibilitando a generalização de soluções relativas a redes haplotípicas através de aplicação de funções parametrizáveis, facilmente representadas através de linguagens funcionais no estilo LISP. Para aplicação em problemas reais, desenvolveu-se estrutura de simulação e testes que constrói cadeias genéticas de maneira aleatória ou ainda parametrizável. Os testes gerados permitiram observar a melhoria esperada no algoritmo, especialmente para os casos de baixa mutação. O arcabouço de simulação e testes mostrou-se extremamente propício e de fácil utilização, o que o torna, em si mesmo, uma ferramenta a ser disponibilizada para a comunidade acadêmica da área de Biologia. / This research dealt with the unification of graphs applied to the problem of haplotype networks. From the low reliability found in networks generated by the traditional algorithms, it was necessary to introduce a new proposition to improve the outcome. For proper evaluation of the results obtained by the new algorithm, a formal-theoretical framework for generalization of haplotype networks related solutions, making use of parameterized functions easily represented through LISP-like functional languages. Seeking for real case application of the theory developed, a structure of simulation and testing were developed to build genetic code strings randomly or even parameterized. The generated tests have allowed to observe the expected improvement in the algorithm, especially for cases of low mutation. The framework for simulation and testing was extremely useful and easy to use, making itself a product to be distributed to the academic Biology community.

A genética molecular permite o entendimento dos mecanismos que regulam o desenvolvimento dos órgãos vegetais em resposta a fatores bióticos e abióticos. A regulação de vias gênicas é de fundamental importância no sucesso reprodutivo, evolutivo e econômico dos vegetais. Uma das modalidades de regulação é a pós transcricional através de microRNAs (miRNAs). Tratam-se de pequenos RNAs endógenos não codantes que possuem uma complementaridade quase perfeita em plantas. Em plantas, muitos genes-alvos de miRNA codificam-se para fatores de transcrição, como os genes SQUAMOSA Promoter-Binding Protein-Like (SPL/SBP). O microRNA156, conservado entre as Angiospermas, regula diversos fatores de transcrição da família SBP. O módulo miR156/SBP, denominado via da idade (AGE), atua ao longo do ciclo de vida dos vegetais regulando as transições de fase: juvenil-adulta e vegetativa-reprodutiva. O tomateiro, Solanum lycopersicum L., possui genes SlSBPs regulados pelo miR156 e com funcionalidade não esclarecida. Dentre aqueles, o gene SlSBP6c (Solyc12g038520) se destaca por possuir maior similaridade filogenética com SPL6s/SBP6s de solanáceas do que seus genes homólogos SlSBP6a e SlSBP6b o que sugere a hipótese de um possível ganho de função. Com o intuito de testar essa hipótese, o presente trabalho objetivou caracterizar funcionalmente o gene SlSBP6c. Para tanto, utilizou-se o genótipo 35S::rSlSBP6c, planta transformada de tomateiro cultivar Micro-Tom (MT) que super-expressa a versão resistente ao miR156 do gene SlSBP6, fusionada ao promotor viral 35S. Este material vegetal foi gerado pelo laboratório de Genética Molecular do Desenvolvimento Vegetal e cedido para execução desta pesquisa. O trabalho se desenvolveu em duas etapas: caracterização molecular e morfo-fisiológica. Primeiramente, os genes SlSBP6a, SlSBP6b e SlSBP6c de tomateiro foram analizados quanto a sua expressão ao longo do desenvolvimento em folhas e inflorescência. E, posteriormente, foram analisados a complexidade foliar, o tempo de florescimento, a transição do meristema vegetativo para o reprodutivo, o teor relativo de clorofila e a fotossíntese líquida. Os resultados obtidos demonstram que os genes SlSBP6a e SlSBP6c são semelhantes no padrão de expressão gênica na homologia das protéinas que o codificam, indicando similaridade funcional. A de-regulação do gene SlSBP6c leva ao aumento a complexidade foliar, o teor relativo de clorofila e a fotossíntese líquida. O atraso na transição do meristema vegetativo para o reprodutivo se evidencia por um florescimento tardio nas plantas que super-expressam o gene SlSBP6c. Os resultados demonstram que o gene SlSBP6c exerce funcionalidade no tomateiro atuando na transição de fase vegetativo-reprodutivo. / Molecular genetics allows the understanding of the mechanisms that regulate the development of plant organs in response to biotic and abiotic factors. The regulation of gene pathways is of fundamental importance in the reproductive, evolutionary and economic success of the plants. Research has been increasing the knowledge about post-transcriptional regulation through microRNAs (miRNAs). The miRNAs are small non-coding endogenous RNAs that have almost perfect complementarity in plants. Many miRNA target genes in plants are encoded by transcription factors, such as the SQUAMOSA PROMOTER-BINDING PROTEIN-LIKE (SPL / SBP) genes. MicroRNA156 is conserved among Angiosperms and regulates several transcription factors of the SBP family. The miR156 / SBP module, called the age pathway (AGE), acts throughout the life cycle of plants regulating phase transitions juvenile-adult and vegetative-reproductive. The tomato, Solanum lycopersicum L., has newly described and unintelligently regulated miR156 regulated SlSBPs. Among these, the gene SlSBP6c (Solyc12g038520) stands out for having greater phylogenetic similarity with solanaceous SBP6s than its homologous genes SlSBP6a and SlSBP6b, indicating a possible gain of function related to characteristics of this family of plants as fleshy fruits and composite leaves. In order to test this hypothesis the work aimed to characterize the SlSBP6c gene functionally. Using as a tool the 35S::rSlSBP6c genotype, transformed tomato plant micro-Tom (MT) that over-expresses the miR156 resistant version of the SlSBP6 gene, fused to the 35S viral promoter. The Laboratory of Molecular Genetics of Plant Development generated this plant material. The work was developed in two stages: molecular and morpho-physiological characterization. In the first the genes SlSBP6a, SlSBP6b and SlSBP6c of tomato were analyzed for their expression throughout the development in leaves and inflorescence. In the second, the leaf complexity, the flowering time, the transition from vegetative to the reproductive meristem, the relative chlorophyll content and the net photosynthesis were evaluated. The results obtained demonstrate that the SlSBP6a and SlSBP6c genes are very similar in the pattern of gene expression in the homology of the coding proteins, indicating a functional similarity. The SlSBP6c gene acts to increase leaf complexity, relative chlorophyll content and liquid photosynthesis. A late flowering in plants that overexpress the SlSBP6c gene evidences the delay in the transition from the vegetative to the reproductive meristem. The data set demonstrates that the SlSBP6c gene has important functionality in tomatoes acting on vegetative-reproductive phase transition.

O vírus respiratório sincicial humano (HRSV) é o principal agente viral causador de doença respiratória em bebês e crianças em idade pré-escolar. A fim de estudar a variabilidade genética de HRSV, grupo B, com inserção de 60 nucleotídeos no gene G, selecionamos amostras de aspirado de nasofaringe de crianças menores de 5 anos de idade, com doença respiratória aguda, admitidas no hospital universitário da Universidade de São Paulo. Testamos 521 amostras, das quais 35,3% foram positivas para HRSV. A região G2 da glicoproteína G foi utilizada para genotipar essas amostras. Todas as amostras do grupo B apresentaram a inserção de 60 nucleotídeos no gene da proteína G, como descrito anteriormente em Buenos Aires, em 1999. As modificações de aminoácidos e nucleotídeos dessas amostras foram comparadas com outras amostras com inserção de 2001-2005. A seqüência de nucleotídeos duplicados foi a cópia exata dos 60 nucleotídeos precedentes em vírus mais antigos, mas as cópias do segmento duplicado acumularam substituições de nucleotídeos em vírus mais recentes. / Human respiratory syncytial virus (HRSV) is the leading viral cause of respiratory illness in infants and young children. In order to study the genetic variability of HRSV group B, with 60-nucleotide duplication in the gene G, we selected nasopharyngeal aspirates samples of children less than five years of age, with acute respiratory illness admitted in the university hospital of São Paulo (USP). We tested 521 samples and the HRSV-detection test positivity rate was 35.3%. The G2 region of glycoprotein G was used as genotyping default. All type B HRSV had a 60-nucleotide duplication in the attachment protein gene like previously described in Buenos Aires, in 1999. Changes in aminoacids and nucleotides in these samples were compaired with other samples with duplication from 2001-2005. The duplicated nucleotide sequence was an exact copy of the preceding 60 nucleotides in early viruses, but copies of the duplicated segment accumulated nucleotide substituions in more recent viruses.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-08-02T20:48:43Z No. of bitstreams: 2 Dissertacao_DimorfismoSexualTamanho.pdf: 143594477 bytes, checksum: 84a6bb6c410ca1c3fe5b6e69b41d397d (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-08-16T14:40:54Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertacao_DimorfismoSexualTamanho.pdf: 143594477 bytes, checksum: 84a6bb6c410ca1c3fe5b6e69b41d397d (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-16T14:40:54Z (GMT). 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Este trabalho teve três objetivos principais: (a) avaliar o padrão de dimorfismo sexual quanto ao tamanho em T. albicollis phaeopygus, T. fumigatus fumigatus e T. leucomelas albiventer; (b) contribuir para o estudo do dimorfismo sexual quanto ao tamanho em aves monocromáticas Neotropicais e (c) fornecer subsídios para o estudo ecológico-evolutivo do gênero Turdus , em particular, e da família Turdidae, em geral. A hipótese de trabalho era que as três espécies de Turdus analisadas seriam cripticamente dimórficas, tais como os outros passeriformes florestais estudados nas florestas mexicanas. Concluiu-se que das três espécies estudadas, duas são monomórficas ( T. f. fumigatus e T. a. phaeopygus ) e uma é cripticamente dimórfica ( T. l. albiventer ). Na única espécie cripticamente dimórfica, machos diferem significativamente das fêmeas quanto ao comprimento da asa, cauda, tarso e unha do quarto dedo. Mesmo assim, a função linear discriminante gerada, não permite uma sexagem segura dos espécimes. A razão de as três espécies de Turdus mostrarem-se monomórficas ou cripticamente dimórficas talvez esteja associada ao seu comportamento pré-reprodutivo. Durante o período de acasalamento, a vocalização seria um instrumento mais importante de atração de fêmeas e determinação do território do que a plumagem ou o tamanho. Assim, existiria forte pressão seletiva sobre a vocalização dos machos é fraca ou inexistente pressão seletiva sobre o tamanho do corpo. Sugere-se a realização de mais estudos de dimorfismo sexual em outras espécies de Turdus e de análise filogenética deste gênero, para se esclarecer a evolução dos padrões de dimorfismo sexual em sabiás. / Three species of Brazilian thrushes replace one another ecologlcally along the primary and secondary forests of the Eastern Amazonian Region, Turdus T fumigatus and T. leucomelas. These three species are monochromatic, i. e., me and female have similar plumages. Whether these species are monomorphic (i.e., if males and females are of similar size) or not has not been previously investigated. Studies in Mexican forests indicated that some monochromatic birds from the Neotropical Region are in fact cryptically dimorphic, i. e., males and females differ statistically in size when suitable statistic techniques are appiled. This work has three main objectives: (a) to evaluate the pattern of sexual dimorphism in size in T. albicollis phaeopygus, T. fumigatus fumigatus and T. ieucomelas albiventer, (b) to contribute to the study of the sexual dimorphism in size of Neotropical monochromatic birds, and (c) to provide subsidies for evolutionary and ecological studies on the genus Turdus, and also on the family Turdidae as a whole. The working hypothesis here was the three species of Turdus studied would be cryptically dimorphic in a pattern similar to the passeriform forest birds previously studied in the Mexican forests. Of the three species studied, two were found to be monomorphic (T. f fumigatus and T. a. phaeopygus) and one cryptically dimorphic (T. 1. albiventer). In the only cryptically dimorphic species, males differ significantly from females in the length of the wing, tad, tarsus and fourth toe claw. However, a reliable sexual identification cannot be performed from the discriminant linear function obtained. The reason the three species of Turdus are monomorphic or cryptically dimorphic may be associated with their pre-reproductive behavior. During the mating season. vocalization seems to be more important to attract females and for territorial defense than plumage or size. Thus, there is a strong selective pressure for vocalization of males and weak or non-existent pressure for body size. It is suggested that more research for the evaluation of sexual dimorphism in other species of Turdus and. a phylogenetic analysis of this large genus are indispensable in clarifying the evolution of patterns of sexual dimorphism in thrushes.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-08-22T12:13:37Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ConsideracoesAnatomiaFuncional.pdf: 35442591 bytes, checksum: ca22561190a0acde2defc2b3b2017f68 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-08-22T15:24:48Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ConsideracoesAnatomiaFuncional.pdf: 35442591 bytes, checksum: ca22561190a0acde2defc2b3b2017f68 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-22T15:24:48Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_ConsideracoesAnatomiaFuncional.pdf: 35442591 bytes, checksum: ca22561190a0acde2defc2b3b2017f68 (MD5) Previous issue date: 2002 / Entre os mamíferos, os pequenos roedores compõem um grupo singular. Devido sua grande capacidade reprodutiva e adaptabilidade aos diferentes hábitats tornaram-se animais em plena explosão evolutiva. Filogeneticamente, o grupo ainda não está bem caracterizado e apresenta fortes similaridades morfológicas para os roedores Sigmodontinae da Serra dos Carajás. Através de estudos das características externas e de alguns ossos do pós-crânio relacionados ao hábito locomotor observamos que: 1) a preferência de habitat dentro da região da Serra dos Carajás entre os roedores estudados, parece não está relacionada a um padrão filogenético; 2) não foi possível estabelecer uma correlação entre as características ecológicas e as principais feições morfológicas do pós-- crânio ligadas ao desenho corporal entre os Sigmodontinae; 3) a morfologia do úmero e fêmur contém forte sinal filogenético característico de subfamília Sigmodontinae 4) os índices intermembral, crural e braquial não foram eficazes na caracterização dos vários modos de locomoção entre os roedores Sigmodontinae. / Among the mammals, the little rodents makes up a singular group. These animals have been in full evolutive process due to their capacity of reproducing and adapting to different habitats. Philogeneticly, the group still hasn't a sure characteristic and is very similar morphologically to rodents Sigmodontinae from Serra dos Carajás. Through this study of external features and some banes from post-cranium related to motions habit, we beheld: 1) The choice of the habitat in Serra dos Carajás area among the rodents seems not to be related to a phylogenetic standard; 2) It wasn't possible to set a relationship between ecological features and main morphological shape from post-cranium related to body-shape among Sigmodontinae; 3) the morphology of úmero and femur have a strong Phylogenetic sign which is another feature of subfamily Sigmodontinae; 4) the signs intermembal, crural e branquial weren't effective to identify the many way of motions among the rodents Sigmodontinae.

Submitted by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2013-08-23T15:39:48Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_VariacaoGeograficaZonas.pdf: 18570156 bytes, checksum: 1ea272ee8894a0800ddd66920fb7dc72 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva(arosa@ufpa.br) on 2013-08-30T14:39:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_VariacaoGeograficaZonas.pdf: 18570156 bytes, checksum: 1ea272ee8894a0800ddd66920fb7dc72 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-08-30T14:39:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Dissertacao_VariacaoGeograficaZonas.pdf: 18570156 bytes, checksum: 1ea272ee8894a0800ddd66920fb7dc72 (MD5) Previous issue date: 2003 / O complexo Icterus cayanensis-chtysocephalus apresenta um intrincado padrão de variação em plumagem e tamanho corpóreo. São reconhecidos, tradicionalmente, para o grupo seis táxons: Icterus chtysocephalus, I. cayanensis cayanensís. I. cayanensis tibialis, I. cayanensis tibialis, I. cayanensis valenciobuenoi, I. cayanensis periporphyrus e I. cayanensis pyrrhopterus, que se substituem geograficamente ao longo de grande parte da América do Sul. Neste estudo foi feita a descrição dos padrões de variação geográfica. Foram diagnosticadas quatro espécies, à luz do conceito filogenético de espécie: Icterus cayanensis (Amazônia Meridional), Icterus chrysocephalus (Amazônia Setentrional), Icterus tibialis (Caatinga) e Icterus pyrrhopterus (Chaco); os táxons I. cayanensis valenciobuenoi e I. cayanensis periporphyrus foram sinonimizados. Entre as formas amazonicas (chrysocephalus e cayanensis) foi detectada a presença de uma zona híbrida mais extensa do que aquela reportada na literatura. No Brasil Central foi diagnosticada a maior zona de intergradação conhecida para aves, com aproximadamente 2.300 km de extensão, produto do intercruzamento entre Icterus tibialis e Icterus pyrrhopterus, formas distribuídas pela Caatinga e Chaco, respectivamente. Postula-se que as zonas de intergradação diagnosticadas neste estudo são produto do intercruzamento de populações previamente diferenciadas em isolamento geográfico. / The Icterus cayanensis-chrysocephalus species complex shows an intricate pattern of geographic variation in body measurements and plumage. Traditionally, six taxa have been recognized in this group: Icterus chrysocephalus, I. cayanensis cayanensis, I. cayanensis tibialis, I. cayanensis valenciobuenoi, I. cayanensis periporphyrus and I. cayanensis pynhopterus, which replace each other geographically in South America. In this work, the geographic pattern of plumage and size variation was described for this species complex, and inferences were made about the evolutionary processes behind those pattern. Under the phylogenetic species concept (PSC), four species are diagnosed; Icterus cayanensis (Southern Amazon), I. chrysocephalus (Northern Amazon), I. tibialis (Caatinga) and I. pyrrhopterus (Chaco). The taxa lcterus cayenansis vaienciobuenoi lhering (1902) and Icterus cayanensis periporphyrus (Bonaparte 1950) were synonymizied. A hybrid zone more extensive than hitherto reported in the literature was detected between two Amazonian taxa: I. chrysocephalus and I. cayanensis. In Central Brazil, it was recognized one of the widest zones of intergradations known for birds to date, approximately 2.300 km wide, between I. tibialis and I. pyrrhopterus. R is postulated here that those hybrid zones were formed by secondary contact, after a period of differentiation in geographic isolation.

Submitted by Erika Demachki (erikademachki@gmail.com) on 2014-09-23T21:19:16Z No. of bitstreams: 2 Peixoto, Franciele Parreira-Dissertação-2013.pdf: 995120 bytes, checksum: 365969ffce47a58af2a011eb0370ed04 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Approved for entry into archive by Jaqueline Silva (jtas29@gmail.com) on 2014-09-23T21:58:54Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Peixoto, Franciele Parreira-Dissertação-2013.pdf: 995120 bytes, checksum: 365969ffce47a58af2a011eb0370ed04 (MD5) license_rdf: 23148 bytes, checksum: 9da0b6dfac957114c6a7714714b86306 (MD5) / Made available in DSpace on 2014-09-23T21:58:54Z (GMT). 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Methods: Using the global distribution of bats and a supertree available for most species, we calculated PBD using the complement of phylosor index. We used a null model to test if two assemblages were more or less phylogenetically dissimilar than expected by chance. In addition, we decoupled PBD into turnover and nestednessresultant components, providing information about two factors that produce differences in assemblage phylogenetic composition. We also performed a Mantel analysis to analyze the distance-decay patterns of PBD and its two components. Results: The most striking difference in PBD was found between the Old and New World “phylogenetic composition”. We found the lowest values of PBD between adjacent regions (i.e., Neotropical/Neartic; Indo-Malay/Paleartic), revealing a strong geographical structure in PBD. These values were even lower when the turnover component was analyzed, demonstrating the differences in the role of regional processes in shaping regional diversity. On the other hand, we found out that for some adjacent regions (e.g., Afrotropical/Paleartic), the observed PBD was higher than expected by chance and comparatively different from expected by the distance decay relationship. This value remained high, even when we analyzed just the PBD turnover component. This demonstrates that although these regions are relatively close in space, there are other factors driving phylogenetic differences between them (e.g. an environmental barrier). Main conclusions: Our analyses revealed differences in the expected patterns of bat PBD among regions, suggesting that at broad scales, besides the effects of distance and geographic barriers, we also have to consider the importance of environmental gradients when studying the phylogenetic origin of bat assemblages. / A abordagem mais comum no uso de PD (diversidade filogenética) para conservação é selecionar locais com maior diversidade evolutiva. Essa estratégia parte do pressuposto de que locais com maior quantidade de PD indicam maior potencial para respostas evolutivas a mudanças ambientais futuras. No entanto, há um crescente debate sobre se as prioridades de conservação deveriam também ser voltadas para locais com baixo valor de PD, que podem representar centros de diversificação de espécies ou “berçários de diversidade”. Alguns trabalhos têm testado se os hotspots globais de biodiversidade, baseados em riqueza, também representam locais de desproporcional concentração de história evolutiva. Nós testamos aqui se os hotspots contêm mais, menos ou igual diversidade filogenética (PD) que o esperado por uma amostragem ao acaso de espécies em qualquer posição na filogenia, para a ordem Chiroptera. Buscamos responder qual a real contribuição de cada hotspot para a conservação de padrões e processos relacionados à diversidade filogenética. Nós utilizamos uma supertree disponível para a maioria das espécies da ordem, e dados de distribuição das espécies. Nós calculamos o PD para cada hotspot separadamente e utilizamos um modelo nulo para obter os valores esperados dado a riqueza. De 34 hotspots, apenas um apresentou maior PD do que o esperado, treze apresentaram valores menores e o restante valores iguais ao esperado. Nós demonstramos que a relação entre PD e riqueza varia entre regiões biogeográficas, de modo que não há como fazer generalizações acerca da contribuição dos hotspots para a conservação de diversidade evolutiva. De modo geral nossos resultados demonstram que devido ao fato da história evolutiva variar regionalmente, também devem ser estabelecidas as prioridades de conservação nessa escala.