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Effects of thermal environment and dietary phosphorus levels in pig gene expression / Efeitos da temperatura ambiente e níveis de fósforo dietético na expressão gênica de suínosWeller, Mayara Morena Dél Cambre Amaral 16 February 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-02-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O objetivo do estudo foi identificar genes codificantes para os complexos enzimáticos da cadeia tranpostadora de elétrons (CTE) que apresentam-se diferencialmente expressos no músculo Longissimus dorsi (LD) de suínos bem como seus padrões de expressãos de acordo níveis de fósforo disponíveis (Pd) na dieta e ambientes térmicos em duas fases de crescimento. Dois experimentos foram realizados utilizando-se 48 suínos de alto potencial genético para deposição de carne em duas diferentes fases de crescimento: a fase 1 de 15 a 30 kg e fase 2 de 30 a 60 kg. Estas experimentos foram construidos em modelo fatorial 2 X 3 (2 diferentes temperaturas ambientais X 3 níveis de Pd na dieta) constituindo 6 tratamentos em cada fase de crescimento. Vinte e quatro suínos da fase da 1 (15 a 30 kg) com peso inicial de 15 ± 0,41 kg, foram distribuídos em delineamento inteiramente casualizado, com 6 tratamentos e 6 repetições. Estes animais foram alojados ou no ambiente termoneutro (24,5 ± 1,2 º C e umidade relativa em 76,3 ± 8,5%) ou no ambiente de calor (34,1 ± 0,8 º C e umidade relativa em 70,1 ± 8,1%) e, em seguida, distribuídos para um dos 3 níveis de Pd na dieta (0.107, 0.321 ou 0.535%). Vinte e quatro suínos da fase de 2 (30 a 60 kg) com peso inicial de 30,19 ± 0,30 kg, foram distribuídos em delineamento inteiramente casualizado com 6 tratamentos e 6 repetições. Estes animais foram alojados ou ambiente termoneutro (21,9 ± 1,4 º C e umidade relativa em 76,9 ± 5,7%) ou ambiente de calor (31,6 ± 0,7 º C e umidade relativa em 72,8 ± 5,9%) e, em seguida, distribuídos para um dos 3 níveis de Pd na dieta (0.116 , 0.306 ou 0.496%). Os perfis de expressão dos genes ND1, ND2, SDHD, CYTB, COX1, COX2, COX3, ATP5J2 e ATP6 foram analisados pelo PCR quantitativo em tempo real (qRT-PCR) a partir de amostras de LD. Os genes ND1, ND2, CYTB, COX1, ATP5J2 e ATP6 foram menos expressos (P< 0.05) nos suínos da fase 1 mantindo em estresse por calor em relação aqueles mantidos no ambiente termoneutro. Nos suíno da fase 2 de crescimento que estavam mantidos em estresse por calor apresentaram redução (P < 0.05) na expressão dos genes ND2, SDHD, CYTB, COX1, COX2, COX3, ATP5J2 e ATP6, em relação aqueles submetido ao ambiente termoneutro. A menor expressão desses genes nos suínos estressados por calor, prove evidências dos efeitos das altas temperaturas sob o metabolismo oxidativo a fim de reduzir a produção de calor o que refletiu na redução da exigência de consumo diário de fósforo. Parte desse efeito pode estar associado a concomitante redução do consumo vonlutário e outra parte é sugerido ser devido ao aumento da produção de espécies reativas de oxigênio (ROS) nas mitocôndrias induzido pelo estresse por calor. Quanto a mudança nos padrões de expressão desses genes entre os níveis de Pd, verificou-se que nos suínos da fase 1, os genes ND1, ND2, CYTB, COX1, ATP5J2 e ATP6 mostraram-se diferencialmente expressos (P<0.05) entre os níveis de Pd no ambiente termoneutro e o gene ND2 no ambiente de calor (P<0.05). Nos suínos da fase 2, os genes COX3 e ND2 foram diferencialmente expressos (P<0.05), respectivamente, entre os níveis de Pd no ambiente termoneutro e ambiente de calor. Os dados apresentados revelam uma forte evidência de que o nutriente fósforo é um dos fatores chave que regulam a fosforilação oxidativa com implicação direta sobre a performance animal. Para a confirmação dessa hipótese de que suínos estressados por calor apresentam aumento na produção de ROS, foi realizado um segundo experimento que objetivou avaliar o perfil de expressão dos genes associados sistema antioxidante (manganes- superóxido dismutase, glutathiona peroxidase e catalase) em suínos de 2 diferentes fases de crescimeto submetido à ambientes de termoneutralidade e estresse por calor. Baseado em análises de qRTPCR, estes genes foram significativamente mais expressos em suínos expostos ao estresse de calor. Em geral, os dados deste estudo são os primeiros a revelar os efeitos de diferentes níveis de fósforo disponível na expressão de genes relacionados com a fosforilação oxidativa e suas implicações sobre o desempenho de suínos. Além disso, é demonstrado que elevadas temperaturas não só induzem a redução da capacidade metabólica oxidativa, como também, estimulam a produção de ROS em mitocôndrias de músculo LD o que leva a danos oxidativos mitocondriais, tais como, repressão da transcrição e provavelmente redução na atividade dos complexos da cadeia transportadora de elétrons, o que refletiu na piora da performance animal. Tais informações irão contribuir para melhor compreensão do papel do fósforo no metabolismo energético e maior entendimento sobre as mudanças no metabolismo e funcionamento mitocondrial em resposta à altas temperaturas. / The purpose of this study was to identify genes encoding the electron transport chain (ETC) complexes that are present differentially expressed in the Longissimus dorsi (LD) of pigs and their expression patterns according to levels available of
phosphorus (aP) in the diet and thermal environment in the two different growth phase. Two experiments were carried out using 48 higher-lean growth pigs from two different growth phases: phase 1 from 15 to 30 kg and phase 2 from 30 to 60 kg. These experiments were designed as a 2 x 3 (2 different environment temperatures X 3 levels of dietary aP) factorial treatments comprising of 6 treatments and each
growth phase. Twenty -four pigs from growth phase 1 (15 to 30 kg) with initial weight of 15 ± 0.41kg, distributed in a completely randomized design with 6 treatments and 6 replications. These pigs were allotted to either thermoneutral (24.5 ± 1.2ºC and RH at 76.3 ± 8.5% or heat stress (34.1 ± 0.8ºC and RH at 70.1 ± 8.1%) and then allotted to one of the 3 levels of dietary aP (0.107, 0.321 or 0.535%). Twenty-four pigs from growth phase 2 (30 to 60 kg) with initial weight of 30.19 ± 0.30 kg, distributed in a completely randomized design with 6 treatments and 6 replications. These pigs were allotted to either thermoneutral ( 21.9 ± 1.4ºC and RH at 76.9 ± 5.7%) or heat stress (31.6 ± 0.7ºC and RH at 72.8 ± 5.9%) and then allotted to one of the 3 levels of dietary aP (0.116, 0.306 or 0.496%). The expression profiles of ND1, ND2, SDHD, CYTB, COX1, COX2, COX3, ATP5J2 and ATP6 genes were analyzed by quantitative real-time PCR from samples of LD. The ND1, ND2, CYTB, COX1, ATP5J2 and ATP6 genes showed reduce expression (P<0.05) in phase 1 pigs maintained under heat stress compared to those kept in thermoneutral environment. In pigs from growth phase 2 maintained under heat stress, the ND2, SDHD, CYTB, COX1, COX2, COX3, ATP5J2 and ATP6 genes showed reduce expression (P<0.05) compared to those kept in thermoneutral environment. The lower expression of these genes in pigs exposed to high temperatures provides evidence of the effect of heat stress by decreasing oxidative metabolism (oxidative phosphorylation) in order to reduce heat production, which reflecting on reduction of requirement for daily aP intake. Part of this effect is associated with concomitant reduction in voluntary feed intake and another part is suggested to be due to an increased production of reactive oxygen species in the mitochondria induced by heat stress resulting in downregulation of these genes. Significant different levels of expression were observed across aP levels. In pigs from growth phase 1, the ND1, ND2, CYTB, COX1, ATP5J2 and ATP6 genes were differentially expressed across aP levels (P<0.05) in the thermoneutral and ND2 gene in the hot environments. In pigs from growth phase 2, COX3 and ND2 genes were respectively differentially expressed across aP levels (P<0.05) in the thermoneutral and hot environments. These data revealed strong evidence that phosphorus is one of the key factors that regulates oxidative phosphorylation with direct implications on animal performance. To confirm the hypothesis that heat-stressed pigs have enhanced production of ROS, we performed a second experiment focused to identify changes in expression of genes encoding antioxidant systems (manganese superoxide dismutase, glutathione peroxidase e catalase) in pigs from high lean meat deposition at 2 different growth phases (15 to 30kg and 30 to 60kg) submitted to hot and thermoneutral environments. Based on qRT-PCR analyses, these genes were significantly upregulated in heat-exposed pigs. In general, data from this study are the first to reveal the effects of dietary phosphorus levels on gene expression related to oxidative phosphorylation and its implications on animal performance. Moreover, it is shown that high temperatures not only causes reduction in oxidative metabolic capacity, but also stimulate the ROS production in LD mitochondria which leading to oxidative damages, such as, repression of transcription of ETC complexes and likely reducing their activity in the mitochondria, which resulted in worse pig performance. The results obtained with this study will contribute to better understand the role of phosphorus in energy metabolism and will bring new insights into the comprehension of the changes metabolism and mitochondrial functioning in response to high temperature.
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Variabilidade genética de Partamona helleri Friese, 1900 (Hymenoptera, Apidae) / Genetic variability of Partamona helleri Friese, 1900 (Hymenoptera, Apidae)Borges, Andreia Arantes 13 March 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-03-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / The genetic variability of 66 colonies of Partamona helleri collected in five locations of Minas Gerais state was estimated using ten microsatellites loci. Low levels of polymorphism were detected, getting 40% of polymorphic loci and 1,5 alleles/Iocus. The expected average heterozygosity for all the analyzed colonies was 0.180 and the observed average heterozygosity was 0.107. The analyzed subpopulations were well structured, with significant genetic variation (FST = 0.552). The analysis of molecular variance (AMOVA) revealed that 81.23% of the total genetic variability is explained by variation among populations, what confirms the structure observed. The grouping analysis of the colonies, did not reveal the formation of groups corresponding to their geographic origin. However, when grouping colonies according to localities, it was verified that the population of Viçosa was more genetically different from the others, and that populations of São Miguel do Anta, Teixeiras and Porto Firme were closer to that collected in Rio Vermelho, than to population of Viçosa, although Rio Vermelho was geographically more distant. More detailed studies, analyzing a larger number of colonies and using microsatellites primers specific for P. helleri, must be carried out in order to supply more conclusive information about the genetic variability of these bees. / A variabilidade genética de 66 colônias de Partamona helleri coletadas em cinco localidades do Estado de Minas Gerais foi estimada utilizando dez locos microssatélites. Baixos níveis de polimorfismos foram detectados, obtendo-se 40% de locos polimórficos e 1,5 alelos/loco. A heterozigosidade média esperada para todas as colônias analisadas foi 0,180 e a heterozigosidade média observada foi de 0,107. As subpopulações analisadas apresentaram forte estruturação, com significativa diferenciação genética (FST = 0,552). A análise de variância molecular (AMOVA) revelou que 81,23% da variabilidade genética total é explicada pela variação existente entre as populações, o que confirma a forte estruturação detectada. A análise de agrupamento de todas as colônias em conjunto, não revelou a formação de grupos correspondentes à origem geográfica das mesmas. Porém, ao agrupar as colônias por localidade, verificou-se que a população de Viçosa mostrou-se mais geneticamente diferente das demais, e que as populações de São Miguel do Anta, Teixeiras e Porto Firme mostraram-se geneticamente mais próximas daquela coletada em Rio Vermelho, do que da população de Viçosa, apesar de ser geograficamente mais distante. Estudos mais detalhados, analisando um maior número de colônias e utilizando primers microssatélites específicos para P. helleri, devem ser realizados a fim de fornecerem dados mais conclusivos sobre a variabilidade genética destas abelhas.
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Desempenho inicial e digestibilidade aparentes de nutrientes de diferentes linhagens de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus)Tachibana, Leonardo [UNESP] 20 December 2002 (has links) (PDF)
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000193724.pdf: 352627 bytes, checksum: d1284698c1060be4521ec89ab53ed846 (MD5) / O experimento utilizou quatro linhagens de tilápias do Nilo (Oreochromis niloticus) chamadas de CESP, Pernambuco, Santa Catarina, Ttailandesa. O objetivo do projeto foi comparar o desempenho e a sobrevivência dessas deferentes linhagens de tilápia do Nilo na fase de reversão sexual. As póslarvas foram estocadas em aquários de 4,5L em sistema de recirculação e com temperatura constante. O delineamento foi inteiramente casualizado com quatro tratamentos (linhagens) e sete repetições. Os parâmetros avaliados foram: comprimento total, ganho de peso, taxa de crescimento específico, taxa de sobrevivência e eficiência de reversão sexual. Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Tukey. A análise de reversão foi submetida ao teste de qui-quadrado. Os resultados médios de comprimento total final demonstraram que a linhagem Pernambuco obteve os menores valores em relação às linhagens CESP, Tailandesa e não diferiu da linhagem Santa Catarina. Para o ganho de peso pôde-se observar que a Pernambuco apresentou menor ganho de peso em relação às demais linhagens (P<0,05). A taxa de crescimento específico demonstrou melhores resultados para as linhagens Tailandesa e Santa Catarina. A sobrevivência foi menor nas linhagens CESP (63,33%) e Pernambuco (60,95%) que na Santa Catarina (88,10%) e Tailandesa (92,86%). Os resultado de reversão sexual demonstraram alta eficiência para as linhagens Santa Catarina e Pernambuco e baixa para CESP e Tailandesa. As linhagens Tailandesa e Santa Catarina obtiveram maior taxa de sobrevivência e desempenho satisfatório durante a fase de reversão sexual, portanto, apresentam-se como as mais propícias para a criação em sistema de recirculação na fase de reversão sexual / This experiment aimed to compare growth performance and survival of four Nile tilapia (Oreochromis niloticus) strains from CESP, Pernambuco, Santa Catarina and Thailandese in sex reversal phase. Thirty fry were stocked in 4.5L aquaria (6.66 fry/L) in a recirculation system with controlled temperature. The experimental design was completely at random with four treatment (strains) and seven replicates. Total length, weight gain, specific growth rate, survival rate and sexual reversion efficiency were submitted to ANOVA and means compared trough Tukey test and sex reversion by qui-square. The results (Table 1) has shown that Pernambuco strain presented smaller final total length and did not differ from Santa Catarina strain. Pernambuco strain presented also worse values of weight gain. Better specifc growth rate were presented by Thailand and Pernambuco strains. The survival rate was better in Thailandese (88.1%) and Santa Catarina (92.86%) strains than CESP (63,33%) and Pernambuco (39,05%). Sex reversal analises demonstrated high efficiency rate to Santa Catarina and Pernambuco strains. This study revealed that CESP and Pernambuco strains presented lower survival rate and similar growth when compared with Thailand and Santa Catarina ones, which demonstrate that the latter ones are better for culture during the sex reversal phase
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Desenvolvimento e identificação de mirossatélites para pirarara - Phractocephalus hemioliopterus (Siluriformes, Pimelodidae) : para análise de variabilidade genética /Souza, Caroline Araújo de. January 2012 (has links)
Orientador: Fábio Porto-Foresti / Banca: Diogo Teruo Hashimoto / Banca: Fernanda Simões de Almeida / Resumo: A pirarara (Phractocephalus hemioliopterus) é um bagre nativo das bacias do rio Amazonas e Tocantins-Araguaia que pode atingir na sua fase adulta cerca de 60 kg. A pirarara é comercializada como peixe ornamental e é um peixe atrativo para a pesca esportiva. A espécie pertence à família Pimelodidae e tem sido ameaçada em seu habitat devido à crescente interferência antrópica nas últimas décadas. O acesso aos dados sobre a situação destas populações constitui um importante meio para o delineamento de projetos de manejo, a fim de conservar a espécie e manter os estoques de reprodutores para piscicultura. Para este fim, os marcadores microssatélites são interessantes para estudos genéticos devido a sua natureza codominante e multialélica, características ideais para serem utilizados em estudos de mapeamento genético, identificação e elucidação de questões sobre a genética de populações de diferentes organismos. Neste contexto, o presente projeto teve por objetivo a identificação e seleção de marcadores moleculares tipo microssatélites para indivíduos da espécie Phractocephalus hemioliopterus, coletados nos Rios Araguaia e Rio das Mortes,e avaliar a estrutura e os níveis de diversidade genética nessas duas localidades. Inicialmente, foram seqüenciadas 67 colônias recombinantes, dos quais apenas 32 continham sequências repetitivas do tipo microssatélite. Destas, 62,5% eram repetições dinucleotídicas e o restante composto por trinucleotídeos e tetranucelotídeos repetidos de forma imperfeita. Deste total, foi possível desenhar primers para 26 loci. Após a amplificação por PCR, 9 loci se mostraram polimórficos e informativos, e foram testados em seis espécies próximas, para a investigação de regiões no DNA altamente conservadas, com sucesso de amplificação de 81,4%. A heterozigosidade observada... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The catfish pirarara (Phractocephalus hemioliopterus) is a native Amazonas and Tocantins-Araguaia basin fish, which can weigh up to about 60 kg in its adult form. The pirarara is marketed as an ornamental fish and it is an attraction for sport fishing. The species belongs to the family Pimelodidae and it has been threatened in its habitat due to increasing human interference in recent decades. Access to data on the situation of these populations is an important means for the design of management projects in order to conserve the species and maintaining the stocks of fish breeding. The microsatellite markers for genetic studies are interesting because of their codominant and multiallelic nature, ideal characteristics for use in studies of gene mapping, identification and elucidation of questions about population's genetics of different organisms. In this context, this project aimed to identify and select microsatellite markers on Phractocephalus hemioliopterus individuals, collected in the Araguaia and das Mortes Rivers, and to evaluate the structure and levels of genetic diversity. Initially, 67 recombinat colonies were sequenced, of which only 32 contained repetitive sequences of the microsatellite type. Of these, 62.5% were dinucleotide repeats, and the remainder consisted of trinucelotide and tetranucleotide imperfect repeats. Of this total, it was possible to design primers for 26 loci. After PCR amplification, nine loci showed to be polymorphic and informative, and were tested on six related species for the investigation of highly conserved DNA regions, with a successful amplification of 81.4%. The observed heterozygosity ranged from 0.421 to 0.947. The two sites showed significant deviations from Hardy-Weinberg equilibrium (HWE) (p<0.01) for some loci, which may be due to the presence of null alleles or even problems... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Diversidade genética e estrutura populacional da anta (Tapirus terrestris) na Serra do Mar, São Paulo, BrasilRamírez, José Fernando Moreira [UNESP] 21 June 2013 (has links) (PDF)
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ramirez_jfm_me_rcla.pdf: 458482 bytes, checksum: 1820e46ce1c16cfd82a24544cbbd844f (MD5) / A implementação de corredores tem sido sugerida para atenuar os efeitos negativos da fragmentação de habitat, por restaurar ou manter a conectividade entre as populações. No entanto, o papel dos corredores para grandes mamíferos raramente tem sido avaliada objetivamente. Nesta pesquisa usei uma amostragem não-invasiva (análises genéticas de fezes), análise de microssatélites e o método Bayesiano para avaliar a eficácia da Serra do Mar como corredor para grandes mamíferos na Mata Atlântica. As localidades amostradas dentro da Serra do Mar foram o Parque Estadual Intervales e o Núcleo Caraguatatuba, as quais estão separadas por aproximadamente 300 km de distância em linha reta. A anta (Tapirus terrestris, Linnaeus 1758) é um dos maiores membros sobreviventes da megafauna neotropical, tendo sua distribuição em regiões de terras baixas do norte e do centro da América do Sul nos países da Argentina, Bolívia, Brasil, Colômbia, Equador, Guiana Francesa, Guiana, Paraguai, Peru, Suriname e Venezuela. É considerada o maior mamífero terrestre nativo do Brasil, sendo bastante caçada como fonte de proteína. Esta espécie é um ótimo modelo para testar a efetividade da Serra do Mar como corredor para grandes mamíferos porque está presente em todo esse contínuo, pode ter grandes deslocamentos e tem a capacidade de atravessar a matriz em paisagens fragmentadas. No Parque Estadual Intervales foram coletadas 55 amostras fecais em um gradiente altitudinal entre 302 até 976 metros, em um esforço percorrido de 258,9 km. No Núcleo Caraguatatuba foram coletadas 76 amostras fecais em um gradiente altitudinal entre 530 até 865 metros, em um esforço percorrido de 351,6 km. Para o Parque Estadual Intervales e Núcleo Caraguatatuba foram identificados 16 e 23 indivíduos, com sucesso de amplificação... / The implementation of corridors has been suggested as a means of mitigating the negative effects of fragmentation by restoring or maintaining connectivity between populations. However, the role of corridors in facilitating the movement of large mammals has rarely been evaluated objectively. In this study, we used non-invasive techniques (genetic analysis of feces), microsatellite analysis and the Bayesian method to evaluate the effectiveness of the Serra do Mar as a corridor for large mammals in the Atlantic Forest. Two locations were sampled in the Serra do Mar - Intervales State Park and the Caraguatatuba Nucleus - and were separated by a distance of 300 km. The lowland tapir (Tapirus terrestris, Linnaeus 1758) is one of the largest surviving members of neotropical megafauna. The tapir is found in northern and central lowland regions of South America, encompassing Argentina, Bolivia, Brazil, Colombia, Ecuador, French Guiana, Guyana, Paraguay, Peru, Suriname and Venezuela. This species, the largest mammal native of Brazil, is an ideal model to test the effectiveness of the Serra do Mar as a corridor for large mammals because it has a large displacements, has the ability to cross the matrix in fragmented landscapes and is hunted for its meat. At Intervales State Park, 55 fecal samples were collected along an altitudinal gradient of 302 to 976 meters, while 76 fecal samples were collected along an altitudinal gradient of 530 to 865 meters at the Caraguatatuba Core (Serra do Mar State Park). The sampling effort consisted of 258.9 km and 351.6 km traversed at Intervales State Park and Caraguatatuba, respectively. Similarly, 16 and 23 individuals were identified with an amplification success of 31% and 33%, respectively. We estimated the population density at Intervales State Park between 0,20-0,57 individuals per km2. For... (Complete abstract click electronic access below)
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Avaliação genética da longevidade em vacas da raça Holandesa usando um modelo de riscos proporcionais Weibull / Genetic evaluation of longevity in holstein cows using a weibull proportional hazard modelKern, Elisandra Lurdes January 2017 (has links)
A longevidade é uma característica relacionada à lucratividade da atividade leiteira. Contudo, sua seleção em rebanhos de vacas Holandesas no Brasil ainda é pouco considerada. Objetivou-se determinar os fatores não genéticos que influenciam a longevidade funcional em vacas Holandesas no Brasil, bem como estimar os parâmetros genéticos e conhecer a contribuição das características de tipo e da contagem de células somáticas (CCS) sobre o risco relativo de descarte das vacas. Utilizou-se um modelo de riscos proporcionais Weibull estratificado. Os efeitos fixos foram independentes do tempo, como a idade ao primeiro parto, e dependentes do tempo, como o efeito da região por ano de parto, classes de produção de leite por ano de parto dentro de rebanho, classes de percentagem de proteína e gordura dentro de rebanho, classes de produção de leite por número de lactações dentro de rebanho e variação nas classes de tamanho de rebanho. Os efeitos aleatórios foram: rebanho-ano, touro e de touro-avô materno. O risco de descarte aumentou com a idade ao primeiro parto, com o tamanho do rebanho, com o número de lactações e com o estágio de lactação. A produção de leite apresentou maior efeito sobre o risco de descarte. Vacas de baixa produção de leite, gordura e proteína apresentaram maior probabilidade de descarte em comparação à classe mediana. Vacas pertencentes às regiões do Paraná e São Paulo permaneceram mais tempo no rebanho do que as vacas de outras regiões. Os valores de h² variam de 7,8% a 6,1% para a h² equivalente e a efetiva, respectivamente. Observou-se tendência genética positiva para a longevidade. As características de tipo, escore final, angularidade, nivelamento da linha superior, textura do úbere e ligamento suspensório foram as características que se apresentaram mais relacionadas com a longevidade funcional. Foram observadas diferenças no risco de descarte dependendo do número de vacas classificadas para tipo dentro de rebanho. Até a 4ª lactação, o risco de descarte foi menor para vacas com baixa CCS em comparação a vacas da classe mediana. Já para vacas na 5ª lactação, a alta CCS conduziu ao menor risco de descarte. A rotina de avaliação genética é necessária para melhorar a duração da vida produtiva de vacas da raça Holandesa no Brasil. Características preditivas, tais como escore final, angularidade, nivelamento da linha superior, textura do úbere, ligamento suspensório e a CCS podem ser utilizadas para aumentar a confiabilidade dos valores genéticos dos touros para longevidade funcional. / Longevity is a trait related to the profitability of dairy activity. However, its selection in Brazilian Holstein herds is still little considered. The aim of this study was to determine the non-genetic factors that influence functional longevity in Holstein cows in Brazil, as well as to estimate the genetic parameters and the contribution of somatic cell score (SCS) and type traits on the relative culling risk of cows. A piecewise Weibullproportional hazard model was used. The fixed effects were time-independent, as age at first calving, and time-dependent, as the interaction effects of region by year of calving, milk production class by year of calving within herd, within herd milk production class by lactation number, within herd fat and protein content, and variation in herd size class. The random effects were herd-year effect, additive genetic contribution from the sire and maternal grandsire of the cow. The relative risk increased with age at first calving, lactation number by stage of lactation, and herd size but lower risks were observed when herd size was increasing or decreasing, compared to stable herds. Milk production had a greater effect on the risk of culling. The relative risk increased as milk production, protein and fat decreased, but to a lesser extent for protein and fat compared to milk yield. Cows from Paraná and São Paulo regions remained longer in the herd than cows from the other regions. The h² values varied from 7.8% to 6.1% for equivalent and effective h², respectively. A positive genetic trend of functional longevity was observed. The type traits, final score, angularity, top line, udder texture and suspensory ligament showed the strongest relationship with productive life. Differences in risk of culling were observed depending on the fraction of type-scored animals within a herd. The absence of type trait phenotypes was associated with a strong increase of culling risk for the cows. The impact of SCS on longevity was high in cows from 1st to 4th lactation with high SCS. Interestingly, for 5th lactation, cows with lower SCS have higher culling risk compared to cows with higher SCS. A routine of genetic evaluation is necessary to improve length of productive life of Brazilian Holsteins under local conditions. The use of early predictors correlated with longevity, as final score, angularity, top line, udder texture, suspensory ligament and SCS, may be recommended to increase the reliability of sires’ estimated breeding values for functional longevity.
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Análise da comercialização de bezerros em leilões no Estado de Santa Catarina / Analysis of calves in commercialization of auctions in Santa Catarina stateFornari, Giordano Bruno January 2016 (has links)
A produção de bezerros de corte que atenda ao mercado consumidor é de extrema importância, uma vez que existem fatores capazes de influenciar o preço dos animais durante a sua comercialização. Desta maneira, foi desenvolvido o presente trabalho com o objetivo de avaliar a variação no preço de bezerros em relação ao preço do boi gordo, bem como os efeitos do grupo genético e do sexo de bezerros sobre os preços praticados em leilões no estado de Santa Catarina (SC). Foram avaliados 33.143 animais, constituindo 3.587 lotes em 47 leilões realizados entre os anos de 2009 e 2014. Os lotes de bezerros eram separados em machos (M) e fêmeas (F) e foram classificados em cinco grupos genéticos de acordo com o biotipo racial: britânicos e seus cruzamentos (BX); continentais e seus cruzamentos (CX); cruzamento entre britânicos e continentais (BC); zebuínos e seus cruzamentos (ZX) e cruzamento entre Bos taurus taurus e Bos taurus indicus (TI). Todos os preços nominais de comercialização foram deflacionados pelo índice geral dos preços – disponibilidade interna (IGP-DI), para maio de 2014. Os dados não atenderam aos pressupostos da análise de variância, sendo então, realizada uma análise não paramétrica a partir do teste de Friedman e Kruskall-Wallis (post-hoc de Dunn) com o auxílio do software SPSS 20.0. O preço pago pelos bezerros acompanhou a variação ocorrida no preço do boi gordo, sendo que no ano de 2014 o preço do bezerro atingiu seu maior valor nominal (R$ 5,36/kg; P<0,05). Os M são comercializados a preços 7,8% superiores ao das F, porém essa diferença foi influenciada pelo ano de análise, onde a menor diferença entre sexos ocorreu nos períodos de redução no preço do boi gordo em SC (2012 e 2013). Os M pertencentes ao grupo genético ZX e TI foram os que receberam menores preços (R$ 4,49/kg e R$ 4,64/kg, respectivamente) quando comparados aos outros grupos (P<0,05). Por outro lado, as bezerras do grupo BX receberam maiores preços a partir de 2011, em comparação aos grupos CX, BC, TI e ZX (8,1, 8,5, 14,7 e 16,5%, respectivamente). Assim, conclui-se que o preço dos bezerros acompanha a variação ocorrida no preço do boi gordo. Além disso, o sexo e diferentes grupos genéticos são fatores capazes de influenciar no preço de comercialização de bezerros na região de SC. Desta forma, os fatores que afetam o preço dos bezerros podem ser ajustados através da seleção genética. / The production of calves that attend consumer market is of utmost importance, as there are factors that can influence the price of animals during their marketing. This manner, it developed this study with the objective to investigate variation in calves price in relation to the price of cattle and the effects of genetic group and calves sex on prices at auctions in the state of Santa Catarina (SC). We evaluated 33.143 animals, representing 3.587 lots in 47 auctions from 2009 to 2014. The calves were classified according to genetic group: British breed or cross-breeding (BX); Continental breed or cross-breeding (CX); Zebu breed or cross-breeding (ZC); British and Continental cross-breeding (BC); Bos taurus taurus and Bos taurus indicus cross-breeding (TI). The lots were composed of male (M) and females (F) calves. Nominal sales prices were deflated for May 2014. The data did not meet the assumptions of analysis of variance and non-parametric analysis was performed from the Friedman test and Kruskal-Wallis test (post-hoc Dunn) with the SPSS 20.0 software. The years presenting low and high changes in the price of calves were similar to the variation in the price of beef cattle, and in 2014 the calf price reached its highest value (R$ 5.36; P<0.05). The M are sold at prices higher than F (average 7.8%) calves, but this difference was driven by year of analysis, where the closest approach occurred during periods of reduction in the price of live cattle in SC (2012 and 2013). The M of genetic group ZX and TI received on average lower prices (R$ 4.49 and R$ 4.64, respectively) compared to the other groups (P<0.05). On the other hand, the F heifers from BX group received higher average prices in 2011 compared to the CX group, BC, IT and ZX (8.1, 8.5, 14.7 and 16.5%, respectively). Thus, it was concluded that the price of calves accompanies the variation in the price of cattle. In addition, sex and different genetic groups are factors that impact on the market price of calves in the SC region. This way, the factors that affect the price of calves can be adjusted through genetic selection.
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Vitrificação de tecido ovariano de Zebrafish (Danio rerio) utilizando uma cápsula de metal / Vitrification of zebrafish (Danio rerio) ovarian tissue using a metal capsuleMarques, Lis Santos January 2014 (has links)
O zebrafish (Danio rerio) tem se destacado na pesquisa biomédica por sua homologia fisiológica e genética aos humanos. No entanto, há poucos relatos sobre a criopreservação ovariana desta espécie. Assim, pesquisamos a utilização de um recipiente de metal na vitrificação de tecido ovariano de zebrafish. O objetivo foi avaliar a sobrevivência e o desenvolvimento in vitro de folículos de zebrafish após a vitrificação de fragmentos ou ovários inteiros usando a cápsula de metal. Primeiro, testamos quatro soluções de vitrificação (VS1 – 1,5 M metanol + 4,5 M propilenoglicol; VS2 – 1,5 M metanol + 5,5 M Me2SO; VS3 – 1,5 M metanol + 4,5 M propilenoglicol + 0,5 M sacarose; VS4 – 1,5 M metanol + 5,5 M Me2SO + 0,5 M sacarose) e cinco estágios de desenvolvimento folicular utilizando o teste de coloração supravital iodeto de propídio combinado com diacetato de fluoresceína. Estes resultados mostraram que os folículos em estágio I, imaturos, apresentaram as maiores taxas de sobrevivência celular e que VS1 foi a melhor solução em termos de viabiidade. No Experimento 2, utilizou-se VS1 para vitrificar o tecido ovariano em diferentes dimensões (fragmentos ou ovários inteiros) e em dois diferentes recipientes (palheta de plástico ou cápsula de metal). Para avaliar a sobrevivência e o crescimento folicular dos folículos em estádio I, o diâmetro dos folículos foi mensurado antes e depois de cultivo in vitro por 24 horas. A morfologia folicular foi analisada por microscopia de luz após vitrificação utilizando a cápsula de metal. Os dados mostraram que a morfologia de folículos imaturos foi bem preservada após a criopreservação. A taxa de sobrevivência folicular foi maior (P <0,05) em fragmentos vitrificados, quando comparados com a vitrificação de ovários inteiros. Não houve diferenças significativas na sobrevivência e crescimento folicular entre os dois recipientes de vitrificação, palheta de plástico ou cápsula de metal. No entanto, a cápsula de metal diminui os riscos de contaminação, pois é hermeticamente fechada evitando contato com nitrogênio líquido e poder ser esterilizada, em vista que é manufaturada em aço inoxidável. Por essas razões, acreditamos que a cápsula de metal tem um uso potencial em reprodução humana para a vitrificação em grau clínico de tecido ovariano. / Zebrafish (Danio rerio) has excelled in biomedical research for its physiological and genetic homology to humans. However, there are few reports on ovarian cryopreservation of this specie. Thus, we studied the use of a metal capsule to vitrify zebrafish ovarian tissue. The aim of this study was to assess the survival and in vitro development of zebrafish follicles after vitrification of fragmented or whole ovaries using the metal capsule. First, we tested four vitrification solutions (VS1 - 1.5 M methanol + 4.5 M propylene glycol; VS2 - 1.5 M methanol + 5.5 M Me2SO; VS3 - 1.5 M methanol + 4.5 M propylene glycol + 0.5 M sucrose; VS4 - 1.5 M methanol + 5.5 M Me2SO + 0.5 M sucrose) and five follicular developmental stages using fluorescein diacetate and propidium iodide supravital staining test. These results showed that immature follicles, stage one, presented the highest survival rates and VS1 the best vitrification solution in terms of viability. In Experiment 2, we used VS1 to vitrify ovarian tissue in different dimensions (fragments or whole ovaries) and tested two different carriers (plastic straw or metal capsule). To evaluate follicular survival and growth of stage I, we measured follicle diameter before and after twenty-four-hour in vitro culture. The follicular morphology was analyzed by light microscopy after vitrification using the metal capsule. Data showed that the immature follicles morphology was well preserved after cryopreservation. Follicular survival rate was higher (P<0.05) on vitrified fragments, when compared to whole ovaries. There were no significant differences on follicular survival and growth between the two vitrification devices, plastic straw or metal capsule. However, the metal capsule being tightly sealed and manufactured in stainless steel avoids contact with liquid nitrogen and can be sterilized reducing contamination risk. These reasons lead us to believe that the metal capsule has a potential use in human reproduction for the clinical grade vitrification of ovarian tissue.
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Vitrificação de tecido ovariano de Zebrafish (Danio rerio) utilizando uma cápsula de metal / Vitrification of zebrafish (Danio rerio) ovarian tissue using a metal capsuleMarques, Lis Santos January 2014 (has links)
O zebrafish (Danio rerio) tem se destacado na pesquisa biomédica por sua homologia fisiológica e genética aos humanos. No entanto, há poucos relatos sobre a criopreservação ovariana desta espécie. Assim, pesquisamos a utilização de um recipiente de metal na vitrificação de tecido ovariano de zebrafish. O objetivo foi avaliar a sobrevivência e o desenvolvimento in vitro de folículos de zebrafish após a vitrificação de fragmentos ou ovários inteiros usando a cápsula de metal. Primeiro, testamos quatro soluções de vitrificação (VS1 – 1,5 M metanol + 4,5 M propilenoglicol; VS2 – 1,5 M metanol + 5,5 M Me2SO; VS3 – 1,5 M metanol + 4,5 M propilenoglicol + 0,5 M sacarose; VS4 – 1,5 M metanol + 5,5 M Me2SO + 0,5 M sacarose) e cinco estágios de desenvolvimento folicular utilizando o teste de coloração supravital iodeto de propídio combinado com diacetato de fluoresceína. Estes resultados mostraram que os folículos em estágio I, imaturos, apresentaram as maiores taxas de sobrevivência celular e que VS1 foi a melhor solução em termos de viabiidade. No Experimento 2, utilizou-se VS1 para vitrificar o tecido ovariano em diferentes dimensões (fragmentos ou ovários inteiros) e em dois diferentes recipientes (palheta de plástico ou cápsula de metal). Para avaliar a sobrevivência e o crescimento folicular dos folículos em estádio I, o diâmetro dos folículos foi mensurado antes e depois de cultivo in vitro por 24 horas. A morfologia folicular foi analisada por microscopia de luz após vitrificação utilizando a cápsula de metal. Os dados mostraram que a morfologia de folículos imaturos foi bem preservada após a criopreservação. A taxa de sobrevivência folicular foi maior (P <0,05) em fragmentos vitrificados, quando comparados com a vitrificação de ovários inteiros. Não houve diferenças significativas na sobrevivência e crescimento folicular entre os dois recipientes de vitrificação, palheta de plástico ou cápsula de metal. No entanto, a cápsula de metal diminui os riscos de contaminação, pois é hermeticamente fechada evitando contato com nitrogênio líquido e poder ser esterilizada, em vista que é manufaturada em aço inoxidável. Por essas razões, acreditamos que a cápsula de metal tem um uso potencial em reprodução humana para a vitrificação em grau clínico de tecido ovariano. / Zebrafish (Danio rerio) has excelled in biomedical research for its physiological and genetic homology to humans. However, there are few reports on ovarian cryopreservation of this specie. Thus, we studied the use of a metal capsule to vitrify zebrafish ovarian tissue. The aim of this study was to assess the survival and in vitro development of zebrafish follicles after vitrification of fragmented or whole ovaries using the metal capsule. First, we tested four vitrification solutions (VS1 - 1.5 M methanol + 4.5 M propylene glycol; VS2 - 1.5 M methanol + 5.5 M Me2SO; VS3 - 1.5 M methanol + 4.5 M propylene glycol + 0.5 M sucrose; VS4 - 1.5 M methanol + 5.5 M Me2SO + 0.5 M sucrose) and five follicular developmental stages using fluorescein diacetate and propidium iodide supravital staining test. These results showed that immature follicles, stage one, presented the highest survival rates and VS1 the best vitrification solution in terms of viability. In Experiment 2, we used VS1 to vitrify ovarian tissue in different dimensions (fragments or whole ovaries) and tested two different carriers (plastic straw or metal capsule). To evaluate follicular survival and growth of stage I, we measured follicle diameter before and after twenty-four-hour in vitro culture. The follicular morphology was analyzed by light microscopy after vitrification using the metal capsule. Data showed that the immature follicles morphology was well preserved after cryopreservation. Follicular survival rate was higher (P<0.05) on vitrified fragments, when compared to whole ovaries. There were no significant differences on follicular survival and growth between the two vitrification devices, plastic straw or metal capsule. However, the metal capsule being tightly sealed and manufactured in stainless steel avoids contact with liquid nitrogen and can be sterilized reducing contamination risk. These reasons lead us to believe that the metal capsule has a potential use in human reproduction for the clinical grade vitrification of ovarian tissue.
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O ensaio cometa e a espécie Hypsiboas albopunctatus (Spix, 1824) como ferramentas de avaliação de qualidade ambiental em uma unidade de conservação federal inserida no Cerrado goianoVieira, Tiago Quaggio 31 March 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-03-31 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / A região Sudoeste do estado de Goiás, originalmente coberta pelo Cerrado, é hoje caracterizada pela presença de grandes propriedades rurais produtoras de algodão, soja e milho. As monoculturas, em especial as de grãos, causam sérios impactos ao meio ambiente: empobrecimento e dano genômico, erosão do solo, contaminação por agrotóxicos, compactação do solo, queimadas e desmatamento. O último grande remanescente de vegetação nativa de Cerrado na região está protegido pelo Parque Nacional das Emas, que possui uma área de 132 mil hectares. A proposta deste estudo é avaliar o dano no DNA em girinos de Hypsiboas albopunctatus submetidos a diferentes níveis de exposição às pressões antrópicas do sistema de produção agrícola predominante na região. Tal avaliação foi realizada por meio de ensaio cometa, a partir de amostras sanguíneas obtidas desses girinos, coletados no Parque Nacional das Emas e entorno, tais coletas foram feitas ao longo do primeiro trimestre de 2016. Essa espécie de anuro possui ampla distribuição geográfica e é considerada abundante, características importantes para eleger um organismo como bioindicador de qualidade ambiental. As amostras foram coletadas em ambiente de veredas, com solo encharcado e presença de poças temporárias e permanentes. A amostragem foi dividida em dois tipos de ambiente: a) dentro do Parque Nacional, onde os impactos antrópicos são significativamente menores, não havendo pulverização direta de agrotóxicos ou qualquer tipo de alteração física da paisagem natural, e, b) fora dos limites da unidade de conservação, onde a vegetação nativa foi quase totalmente suprimida e a exposição direta a agrotóxicos é frequente. Dessa forma foi comparado o DNA dos girinos por meio de ensaio cometa, para verificar se no ambiente protegido do Parque Nacional das Emas o dano no material genético difere significativamente em relação ao ambiente antropizado, externo à Unidade de Conservação. Após a realização das análises foi possível constatar que o dano encontrado no DNA de girinos da espécie Hypsiboas albopunctatus foi maior nas amostras provenientes de áreas externas ao parque, intermediário nas áreas internas mais próximas da borda do Parque Nacional das Emas e reduzidos nas áreas centrais e mais próximas do centroide, corroborando a hipótese de que os impactos intermediate in the internal areas closer to the edge of the Emas National Park and reduced in the central areas and closer to the centroid, corroborating the hypothesis that environmental impacts, which are severe outside the protected area boundaries, would have a detrimental effect on biodiversity, including at the molecular level. / A região Sudoeste do estado de Goiás, originalmente coberta pelo Cerrado, é hoje caracterizada pela presença de grandes propriedades rurais produtoras de algodão, soja e milho. As monoculturas, em especial as de grãos, causam sérios impactos ao meio ambiente: empobrecimento e dano genômico, erosão do solo, contaminação por agrotóxicos, compactação do solo, queimadas e desmatamento. O último grande remanescente de vegetação nativa de Cerrado na região está protegido pelo Parque Nacional das Emas, que possui uma área de 132 mil hectares. A proposta deste estudo é avaliar o dano no DNA em girinos de Hypsiboas albopunctatus submetidos a diferentes níveis de exposição às pressões antrópicas do sistema de produção agrícola predominante na região. Tal avaliação foi realizada por meio de ensaio cometa, a partir de amostras sanguíneas obtidas desses girinos, coletados no Parque Nacional das Emas e entorno, tais coletas foram feitas ao longo do primeiro trimestre de 2016. Essa espécie de anuro possui ampla distribuição geográfica e é considerada abundante, características importantes para eleger um organismo como bioindicador de qualidade ambiental. As amostras foram coletadas em ambiente de veredas, com solo encharcado e presença de poças temporárias e permanentes. A amostragem foi dividida em dois tipos de ambiente: a) dentro do Parque Nacional, onde os impactos antrópicos são significativamente menores, não havendo pulverização direta de agrotóxicos ou qualquer tipo de alteração física da paisagem natural, e, b) fora dos limites da unidade de conservação, onde a vegetação nativa foi quase totalmente suprimida e a exposição direta a agrotóxicos é frequente. Dessa forma foi comparado o DNA dos girinos por meio de ensaio cometa, para verificar se no ambiente protegido do Parque Nacional das Emas o dano no material genético difere significativamente em relação ao ambiente antropizado, externo à Unidade de Conservação. Após a realização das análises foi possível constatar que o dano encontrado no DNA de girinos da espécie Hypsiboas albopunctatus foi maior nas amostras provenientes de áreas externas ao parque, intermediário nas áreas internas mais próximas da borda do Parque Nacional das Emas e reduzidos nas áreas centrais e mais próximas do centroide, corroborando a hipótese de que os impactos intermediate in the internal areas closer to the edge of the Emas National Park and reduced in the central areas and closer to the centroid, corroborating the hypothesis that environmental impacts, which are severe outside the protected area boundaries, would have a detrimental effect on biodiversity, including at the molecular level.
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