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Identificação e diferenciação do Mycobacterium tuberculosis pela amplificação do DNA das regiões intergênicas dos operons inhA e pIC

Bica, Claudia Giuliano January 2003 (has links)
Entre as doenças causadas por bactérias do gênero Mycobacterium, a tuberculose por M. tuberculosis é a mais conhecida. O diagnóstico da doença é feito utilizando-se um conjunto de exames que possibilitam a identificação da mesma (WATT, 2000). Contudo, sabe-se que o diagnóstico combinado de microscopia direta e com o posterior isolamento em meio de cultivo é o “padrão-ouro”. A principal desvantagem desse método é que tal bactéria possui um crescimento lento (cerca de 8 semanas). Recentemente, a detecção de doenças através da técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) tem proporcionado avanços significativos no diagnóstico. O uso da amplificação específica de genes, para identificar a M. tuberculosis, tais como rDNA 16S, IS6110 ou a região intergênica senX3-regX3, tem apresentado algumas restrições, ao nível de confiabilidade e sensibilidade, para a aplicação da técnica de PCR. O presente estudo mostra a construção e a aplicação de um novo alvo para a aplicação da PCR no diagnóstico da tuberculose, baseado no ensaio da diferença de organização gênica do operon plcA, B e C diferenciando a M. tuberculosis das demais micobactérias. Neste trabalho, foram examinadas 273 amostras de pacientes com suspeita de tuberculose, sendo estas submetidas ao estudo comparativo da técnica de PCR versus cultivo (padrão ouro). A PCR amplificou fragmentos de 439pb. Os resultados mostram 93,7% de acurácia para PCR/Cultivo (p<000,1), 93,1% de sensibilidade com intervalo de confiança de 88,7-96,0 e especificidade de 96,4% com intervalo de confiança de 96,4-99,4. O valor da estatística Kappa (k) foi de 0,82 com erro padrão de 0,041, demonstrando um alinhamento quase perfeito para a verificação do grau de concordância entre os testes. Desta forma, o uso desta nova região para a amplificação da PCR se mostra uma importante e confiável ferramenta no diagnóstico específico da tuberculose. Outra região que compreende parte dos genes mbaA e inhA foi utilizada para diferenciar o Complexo tuberculosis do Complexo avium. Porém, novos experimentos serão necessários para o emprego desta região como uma ferramenta de diagnóstico.
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Bioética e direitos humanos: a proteção da dignidade da pessoa humana na era da genética / Bioethics and human rights: the protection of the human dignity in the genetics era

Elizabeth Alves Fernandes 16 March 2009 (has links)
A bioética e o direito constituem braços de proteção da pessoa humana e dos direitos humanos quando afrontados por questões relacionadas à genética. O primeiro capítulo aborda a afirmação da máxima da dignidade humana e sua importância como princípio estruturante de todo o sistema ético e jurídico. O segundo capítulo introduz a bioética. São expostos os princípios proclamados pela bioética: autonomia, beneficência, não-maleficência e justiça e estabelecida a relação necessária entre a bioética e os direitos humanos, determinando a consubstancialidade entre eles. Uma vez definida a importância da proteção da dignidade humana e a relação existente entre essa, a bioética e os direitos humanos, o trabalho expõe de forma analítica, nos capítulos sucessivos, os dois braços de salvaguarda de tal base. No primeiro deles, a ética é abordada como instrumento de proteção da sociedade que deve ser manejado segundo uma perspectiva universalista e dialógica, pois inserida em contexto democrático. No segundo deles, o direito é exposto no seu âmbito internacional, que tem consagrado declarações de direitos humanos específicas aos temas de bioética, e nacional, seja em relação ao substrato constitucional quanto ao infraconstitucional de proteção dos princípios envolvidos nas discussões bioéticas. / Bioethics and Law are two complementary ways to protect the human being dignity and the human rights, when faced by questions related to genetics. This study discuss about the affirmation of the human dignity as well as its importance as structuring principle to the whole ethical and legal systems. The second chapter introduces the bioethics as well as its principles: autonomy, beneficence and justice, determining the necessary relationship between them and their consubstantiality. Once defined the human dignity importance as well as the relationship between it, bioethics and human rights, this study exposes, in an analytical way, the safeguard basis: ethics and Law. Ethics is exposed as a relevant instrument to protect the society in a universal and dialogic perspective, since inserted in a democratic context. The Law is seen on its international and constitutional spheres of human being protection.
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Hiperfenilalaninemia por deficiência de fenilalanina hidroxilase : avaliação da responsividade ao BH4 em pacientes acompanhados no Serviço de Genética Médica do HCPA e que apresentam controle metabólico adequado

Nalin, Tatiéle January 2011 (has links)
Introdução: Estudos recentes, utilizando vários protocolos, têm demonstrado que pacientes com Hiperfenilalaninemia por deficiência de fenilalanina hidroxilase (HPA-PAH) podem apresentar redução das concentrações plasmáticas de fenilalanina (Phe) mediante a administração de tetrahidrobiopterina (BH4). Objetivo: Determinar, em uma amostra de pacientes brasileiros com HPA-PAH, a responsividade à administração de dose única de BH4 por meio de um protocolo incluindo o teste de sobrecarga simples de Phe e o teste combinado de sobrecarga de Phe+BH4. Métodos: Foram incluídos no estudo pacientes com idade ≥ 4 anos, em tratamento dietético e que possuíam mediana de Phe plasmática inferior a 10mg/dL no ano anterior à inclusão. Foram realizados teste de sobrecarga simples de Phe, utilizando 100mg/kg de L-Phe (Teste 1) e teste combinado de Phe+BH4, utilizando 100mg/kg de L-Phe e 20mg/kg de BH4 (Teste 2), com intervalo de uma semana entre ambos. A ingestão do BH4 ocorreu após três horas da ingestão da Phe. Foram realizadas coletas de sangue no ponto basal e após três, 11 e 27h da ingestão de Phe (T0, T1, T2 e T3 dos testes 1 e 2, respectivamente). Para ser considerado responsivo, o paciente deveria apresentar evidência de redução dos níveis de Phe associada à administração do BH4 de acordo com pelo menos um dos seguintes critérios: critério A – análise das diferenças, em percentual, dos valores de Phe nos pontos T1 e T2 dos Testes 1 e 2; critério B – análise das diferenças, em percentual, dos valores de Phe nos pontos T1 e T3 dos Testes 1 e 2 e critério C – análise da diferença, em percentual, das áreas abaixo da curva de Phe entre os Testes 1 e 2. A classificação de responsividade foi também comparada com quatro critérios adicionais: critério D – análise da diferença, em percentual, dos valores de Phe nos pontos T1 e T2 do Teste 2; critério E – análise da diferença, em percentual, dos valores de Phe nos pontos T1 e T3 do Teste 2; cinco pacientes participaram de estudo anterior do grupo e foram também classificados através do critério F – análise da diferença, em percentual, dos valores de Phe após 8h da sobrecarga simples com BH4 e do critério G – análise da diferença, em percentual, dos valores de Phe após 24h da sobrecarga simples com BH4. Para todos os critérios foi utilizado como ponte de corte redução ≥ 30%. Resultados: Dezoito pacientes, com mediana de idade de 12 anos, participaram do estudo. Dez pacientes apresentavam a forma Leve de HPA-PAH e oito a forma Clássica. Seis pacientes foram considerados responsivos de acordo com os critérios adotados (Clássica: 2; Leve: 4). Houve concordância de responsividade entre os critérios A e B em relação ao C (Índice Kappa=0,557; p=0,017). Dos pacientes com genótipo disponível (n=16), seis possuíam dados de responsividade ao BH4 descritos na literatura, que foram concordantes com os encontrados no presente estudo. Conclusão: Dados relativos à responsividade, tipo de HPA-PAH e genotipagem estão de acordo com descrito na literatura. Haja vista a diferença de responsividade dos pacientes ao BH4 conforme o critério de classificação utilizado, salienta-se a importância de uma definição cautelosa de responsividade e que não seja baseada em um único critério. A comparação entre a sobrecarga simples de Phe e combinada de Phe+BH4 parece ser um critério adequado para avaliar responsividade ao BH4 em pacientes com HPA-PAH que apresentam bom controle metabólico quando em tratamento dietético. / Introduction: Recent studies using different protocols showed that patients with hyperphenylalaninemia due to phenylalanine hydroxylase deficiency (HPA-PAH) may have a reduction in phenilalanine (Phe) plasma concentrations after tetrahydrobiopterin (BH4) administration. Objective: To determine responsiveness to the administration of a single dose of BH4, in a sample of Brazilian patients with HPA-PAH using a protocol that includes the simple Phe loading test and the combined Phe+BH4 loading test. Methods: Patients included in the study were ≥ 4 years of age; their median Phe plasma concentration was ≤ 10mg/dL, and all underwent dietary treatment in the 12 months before inclusion in the study. Participants received a simple Phe loading test using 100mg/kg L-Phe (Test 1) and a combined Phe+BH4 loading test using 100mg/kg L-Phe and 20mg/kg /BH4 (Test 2) at a one-week interval. BH4 was ingested three hours after Phe ingestion. Blood samples were collected at baseline and three, 11 and 27h after Phe ingestion (time points T0, T1, T2 and T3 in Tests 1 and 2). To be classified as responsive, there should be evidence that the patient had a reduction in Phe levels associated with BH4 administration according to at least one of the criteria used: criterion A – analysis of percentage differences of the Phe values at time points T1 and T2 for Tests 1 and 2; criterion B – analysis of percentage differences of Phe values at time points T1 and T3 for Tests 1 and 2; and criterion C – analysis of percentage differences of the areas under the Phe curve for Tests 1 and 2. Responsiveness classifications were also compared according to four additional criteria: criterion D – analysis of percentage differences of the Phe values at time points T1 and T2 for Test 2; criterion E – analysis of percentage differences of Phe values at time points T1 and T3 for Test 2; criterion F – analysis of percentage difference of Phe values 8h after simple BH4 loading used for five patients that participated in a previous study conducted by the same authors; and criterion G – analysis of percentage difference of Phe values 24 h after simple BH4 loading, also used for the patients in the same previous study. The cut-off point for all criteria was a reduction of ≥ 30%. Results: Eighteen patients (median age = 12 years) were included in the study. Ten patients had mild HPA-PAH and eight, classical HPA-PAH. Six patients were responsive according to the criteria used (Classical: 2; Mild: 4). Responsiveness was concordant for criteria A and B when compared with criterion C (kappa=0.557; p=0.017). Of the patients whose genotype was available (n=16), six had data about BH4 responsiveness described in the literature, and these data were in agreement with our findings. Conclusion: Data about responsiveness, HPA-PAH type and genotype were in agreement with those described in the literature. The difference in BH4 responsiveness of patients according to classification criterion emphasizes the importance of a careful definition of responsiveness not based on a single criterion. The comparison of simple Phe loading and combined Phe+BH4 loading seems to be an adequate criterion to evaluate responsiveness to BH4 in patients with HPA-PAH and good metabolic control when following a dietary treatment.
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Identificação e diferenciação do Mycobacterium tuberculosis pela amplificação do DNA das regiões intergênicas dos operons inhA e pIC

Bica, Claudia Giuliano January 2003 (has links)
Entre as doenças causadas por bactérias do gênero Mycobacterium, a tuberculose por M. tuberculosis é a mais conhecida. O diagnóstico da doença é feito utilizando-se um conjunto de exames que possibilitam a identificação da mesma (WATT, 2000). Contudo, sabe-se que o diagnóstico combinado de microscopia direta e com o posterior isolamento em meio de cultivo é o “padrão-ouro”. A principal desvantagem desse método é que tal bactéria possui um crescimento lento (cerca de 8 semanas). Recentemente, a detecção de doenças através da técnica de reação em cadeia da polimerase (PCR) tem proporcionado avanços significativos no diagnóstico. O uso da amplificação específica de genes, para identificar a M. tuberculosis, tais como rDNA 16S, IS6110 ou a região intergênica senX3-regX3, tem apresentado algumas restrições, ao nível de confiabilidade e sensibilidade, para a aplicação da técnica de PCR. O presente estudo mostra a construção e a aplicação de um novo alvo para a aplicação da PCR no diagnóstico da tuberculose, baseado no ensaio da diferença de organização gênica do operon plcA, B e C diferenciando a M. tuberculosis das demais micobactérias. Neste trabalho, foram examinadas 273 amostras de pacientes com suspeita de tuberculose, sendo estas submetidas ao estudo comparativo da técnica de PCR versus cultivo (padrão ouro). A PCR amplificou fragmentos de 439pb. Os resultados mostram 93,7% de acurácia para PCR/Cultivo (p<000,1), 93,1% de sensibilidade com intervalo de confiança de 88,7-96,0 e especificidade de 96,4% com intervalo de confiança de 96,4-99,4. O valor da estatística Kappa (k) foi de 0,82 com erro padrão de 0,041, demonstrando um alinhamento quase perfeito para a verificação do grau de concordância entre os testes. Desta forma, o uso desta nova região para a amplificação da PCR se mostra uma importante e confiável ferramenta no diagnóstico específico da tuberculose. Outra região que compreende parte dos genes mbaA e inhA foi utilizada para diferenciar o Complexo tuberculosis do Complexo avium. Porém, novos experimentos serão necessários para o emprego desta região como uma ferramenta de diagnóstico.
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Percepção, conhecimento e atitude de profissionais de saude e de mães sobre fatores de risco e prevenção do retardo mental / Perceptions, knowledge and attitudes of health professionals and mothers about risk factors and prevention of mental retardation

Moraes, Ana Maria Silveira Machado de 20 February 2006 (has links)
Orientadores: Antonia Paula Marques de Faria, Luis Alberto Magna / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-06T13:15:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Moraes_AnaMariaSilveiraMachadode_D.pdf: 41612973 bytes, checksum: 8855a4185126a5a57c25db1786b2d7b9 (MD5) Previous issue date: 2006 / Resumo: Foi realizado um estudo de levantamento, para averiguar o perfil do atendimento preventivo para retardo mental (RM) na rede de atenção primária do município de Maringá, Paraná. Aplicou-se um questionário a 90 médicos, compreendendo pediatras, ginecologistas-obstetras, clínicos gerais e médicos do Programa de Saúde da Família, e a 66 enfermeiros que trabalham na rede municipal de saúde, e uma entrevista estruturada a 100 mães residentes no município, escolhidas aleatoriamente, a partir do cadastro de nascidos-vivos do ano de 2003. A coleta de dados entre os profissionais de saúde foi realizada no período de agosto a dezembro de 2003 e a entrevista com as mães, entre junho e outubro do mesmo ano. Os dados dos profissionais de saúde foram analisados pela comparação das respostas entre médicos e enfermeiros e entre as especialidades dos médicos. Para o grupo das mães, os dados foram analisados pela comparação do grupo que fez o pré-natal na rede pública com o atendido na rede privada. As variáveis qualitativas foram comparadas pelo teste do qui-quadrado e as quantitativas pelo teste t de Student. Os resultados demonstraram que 69,7% dos médicos e 78,8% dos enfermeiros desconhecem a prevalência do RM (p= 0,011); 63,3% dos médicos e 65,2% dos enfermeiros não sabem qual é a fração de RM evitável (p= 0,764); 16,5% dos médicos e 45,6% dos enfermeiros não têm segurança para orientar sobre o efeito teratogênico do etanol (p= 0,001); 45,7% e 80,3% dos médicos, 77,2% e 96,4% dos enfermeiros não se sentem seguros para orientar sobre a translucência nucal e sobre o teste triplo, respectivamente (p= 0,001 e p= 0,053). Comparando as respostas dos médicos, os pediatras (71,4%) e os clínicos gerais (54,8%) demonstraram maior insegurança para orientar quanto aos efeitos teratogênicos do misoprostol do que os ginecologistas obstetras (11,8%) e sobre as técnicas de diagnóstico pré-natal. Entre as mães, 65% não planejaram a gravidez; a maioria não foi questionada sobre história familial de retardo mental (70%) ou sobre consangüinidade (84%); a maioria desconhece diagnóstico pré-natal (83%) e aconselhamento genético (92%), e 46% desconhecem a associação entre idade materna e risco aumentado de filho com síndrome de Down. Conclui-se que a busca de situações de risco, no que se refere à exposição a fatores deletérios do ambiente e a antecedentes familiais relevantes, não está sendo feita na prática e que a maior parte das mães desconhece informações básicas sobre fatores de risco comuns para RM. Portanto, é necessário que sejam adotadas medidas de educação em genética para que os profissionais de saúde passem a reconhecer a importância dos fatores de risco e da história familial na identificação e prevenção do RM, incluindo a busca desse tipo de informação à sua prática rotineira; sejam desenvolvidos programas educacionais sobre fatores de risco e meios de prevenção dessa condição, no âmbito da saúde pública, de fácil compreensão e incorporação pela população geral, bem como a disponibilização de material de orientação para o manejo dos pacientes com problemas genéticos, incluindo RM e/ou defeitos congênitos / Abstract: This is a survey to verify the preventive attendance profile for mental retardation (MR) in the primary health service in the town of Maringá, Paraná. A questionnaire was applied to 90 physicians, involving pediatricians, gynecologist obstetricians, general practitioners and family physicians, as well as to 66 nurses and a structural interview was also applied to 100 mothers who live in the city. The health professionals work for the health municipal service and the mothers were selected at random based on the official register of born-alive individuals in 2003. Data collection related to the health professionals was carried out from August to December, 2003, and the interviews with the mothers from June to October of the same year. The data of the health professionals had been analyzed by the comparison of the answers between physicians and nurses and among the physicians' specialties. Dates related to mothers were analyzed through the comparison between the group assisted at the health public system and the ones assisted at the private system. The qualitative variables had been compared by the test of the Chi-square and the quantitative variables by the Student's / test. The findings showed that 69.7% of the physicians and 78.8% of the nurses do not know MR prevalence (p= 0.011); 63.3% of the physicians and 65.2% of the nurses do not know the fraction can be avoided (p- 0.764); 16.5% of the physicians and 45.6% of the nurses are not self-confident in order to inform the patients on ethanol teratogenic effect (p= 0.001); 45.7% and 80.3% of the physicians and 77.2% and 96.4% of the nurses are not self-confident in the sense of giving information on the nuchal translucence and about the triple test, respectively (p- 0.001 and p= 0.053). Comparing the physicians, pediatricians (71.4%) and the general practitioners (54.8%) showed higher unsteady behavior to guide on the teratogenic effects of misoprostol instead of the gynecologists obstetricians (11.8%) and about the prenatal diagnostic techniques. Considering the mothers, 65% had not planned pregnancy. Most of them had not been questioned on either the familial MR (70%) or consanguinity (84%) and are not aware of the prenatal diagnosis (83%) and genetic counseling (92%); 46% do not know the association between the maternal age and the increased risk to have a child with Down syndrome. It was concluded that the search for risk situations, regarding the exposure to environmental deleterious factors and the relevant / Doutorado / Genetica Medica / Doutor em Ciências Médicas
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Estudo clinico e sequenciamento direto do gene Twist em individuos com sinais sugestivos da sindrome de Saethre-Chotzen

Nascimento, Sandra Regina Dantas 27 August 2001 (has links)
Orientadores: Vera Lucia Gil da Silva Lopes, Maricilda Palandi de Mello / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-07-31T15:11:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Nascimento_SandraReginaDantas_M.pdf: 26790774 bytes, checksum: ce3306013ced98a59f9c38c685eef04f (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: A Síndromede Saethre-Chotzen(SSC,Acrocefalossindactiliatipo 111) é uma heredopatia autossômica dominante, com alta penetrância e expressividade variável, sendo craniossinostose um de seus principais sinais clínicos. Mutações nos genes FGFR1-FGFR3 e Twist são causas conhecidas de craniossinostoses, a primeira por aumento da expressão e a última por haploinsuficiência. O gene Twist foi mapeado na região 7p21 e algumas deleções e translocações balanceadas, bem como mutações no exon 1 deste gene, têm sido descritas nas formas de craniossinostose associadas a SSC. Quatro famílias brasileiras com ACS 111foram avaliadas do ponto de vista dismorfológico e rastreadas para mutações no gene Twist. O protocolo de investigação incluiu exame dismorfológico dirigido, estudo de imagem (radiografia de crânio, tórax, coluna vertebral, tomografia computadorizada de crânio e ultrassonografia abdominal), estudo citogenético com bandamento G e seqüenciamento direto de DNA dos produtos de PCR amplificados para o exon 1 do gene Twist, nos indivíduos que apresentavam ao menos um sinal clínico desta condição. Ao exame, observou-se importante variabilidade de características faciais, incluindo assimetria facial (20/24), braquicefalia (16/24), orelhas com acentuação do ramo da hélice (15/24) e implantação baixa (13/24), hipoplasia malar (13/24), ponte nasal proeminente (13/24), implantação baixa dos cabelos na fronte (12/24), ptose palpebral (12/24).Achados adicionais incluiram sindactilia cutânea parcial dos artelhos (18/24), clinodactilia do 50 dedo (13/24), háluces alargados (13/24). Somente em umafamília observou-se sindactilia cutânea total, entre o 20 e 30 artelhos. Sete indivíduos apresentaram radiografia de crânio com craniossinostose bicoronal, um, craniossinostose unicoronal e dois com forame parietal bilateral. O sinal da prata batida apareceu nos oito casos. A radiografia de tórax em dois indivíduos mostrou fusão parcial dos 10 e 20 arcos costais à esquerda e na radiografia de coluna lombo-sacra dois casos apresentaram espinha bífida lombar. O exame de cariótipo dos propósitos de cada família foi normal e o estudo molecular nãodetectou alterações no exon 1 do gene Twist. Esse estudo reforça a importância da avaliação dismorfológica em SSC e sugere que o emprego de outras técnicas de biologia molecular poderia contribuir para elucidar o papel do gene Twist nos achados clínicos desta casuística. Além disso, os dismorfismos detectados poderiam, ainda, ser decorrentes de outros genes envolvidos na regulação do desenvolvimento craniofacial e de membros / Abstract: Saethre-Chotzensyndrome(acrocephalosyndactyly type 111)is an autosomal dominant craniosynostosis condition, with high penetrance and variable expressivity. Mutations in the Fgfr1-Fgfr3 and Twist genes are known to cause craniosynostosis, the former by constitutive activation and the latter by haploinsufficiency. The Twist gene maps to 7p21 and mutations in the gene have been reported in the SCS form of craniosynostosis. The aims of this study were characterize the dysmorphological variability and mutations in exon 1 of Twist gene using direct sequencing in four Brazilian famílies presenting SCS. Twenty-four patients were included in our study, diagnosed as having features of Saethre-Chotzen syndrome. The phenotypic characteristics of ali patients were inventoried. Also, a DNA test had been performed and their genotype was noted. Facial features, present were facial asymmetry (20/24), brachycephaly (16/24), small ear with prominent crura (15/24), maxillary hypoplasia (13/24), lowset ears (13/24), and ptosis of the eyelids (12/24), lowset frontal hairline (12/24), ocular hypertelorism (11/24). Additional findings included partial hands and feet cutaneous syndactyly (18/24), clinodactyly (13/24), and broad great toes (13/24); in one family was observed total cutaneous syndactyly in feet. Skull X-rays were abnormal in 8 patients in which it was performed;partiaI fusionof 1st and 2ndribs wasdetectedin 2 individuaisand 2 had lumbar spina bifida. Chromossomal analysis on GTG-banding were normal. The analysis was carried out by direct DNA sequencing of PCR amplified products for exon 1 in the proband of each family. No Twist mutations were found. In conclusion, this four SCS famílies may have mutations in other genes of the same developmental pathway. This study reinforces the importance of the dysmorphological evaluation in patients with craniosynostosis, as well as ali their famílies, especially ACS 111,in which inter and intrafamilial variability make the diagnosis more difficult / Mestrado / Genetica Medica / Mestre em Ciências Médicas
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Avaliação de polimorfismos nos genes IL1A, IL1B e TNFA em pacientes com glaucoma primário de ângulo aberto / Association of IL1A, IL1B and TNFA gene polymorphisms in primary open angle glaucoma patients

Oliveira, Mariana Borges, 1978- 25 August 2018 (has links)
Orientadores: Mônica Barbosa de Melo, José Paulo Cabral de Vasconcellos / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-25T15:53:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_MarianaBorges_M.pdf: 6901699 bytes, checksum: b84b4ac92949fdb082625b01ad6c66a1 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: O glaucoma engloba um grupo de doenças que têm como característica comum a atrofia progressiva do disco óptico com alteração correspondente de campo visual, decorrente da perda de células ganglionares da retina. O aumento da pressão intraocular (PIO) é o principal fator de risco para o desenvolvimento do glaucoma, mas tem sido sugerida a existência de outros aspectos relevantes, tais como alterações no metabolismo do óxido nítrico, na regulação do fluxo vascular, sinais de estresse oxidativo e alterações no sistema imunológico. O glaucoma primário de ângulo aberto (GPAA), a forma mais prevalente entre os glaucomas, está associado a uma série de fatores de risco para sua instalação e desenvolvimento, além da PIO. Os demais fatores de risco são: idade (relação direta), raça (mais frequente e grave em indivíduos da raça negra), miopia e história familiar de glaucoma. A maioria dos casos de GPAA apresenta um padrão complexo de hereditariedade, em que variantes de suscetibilidade contribuem para a gravidade da doença. O objetivo deste estudo do tipo caso-controle foi avaliar o papel de polimorfismos nos genes da interleucina alfa (IL1A), interleucina beta (IL1B) e fator de necrose tumoral alfa (TNFA) em relação à suscetibilidade ao GPAA. Após avaliação oftalmológica, foram recrutados 214 indivíduos não relacionados portadores de GPAA. A análise molecular foi realizada por meio de técnicas de PCR e sequenciamento direto. Neste estudo observou-se que o alelo C do polimorfismo -31 C/T, presente na região promotora do gene IL1B, confere risco para o glaucoma (p=0,002). Este alelo está contido em um "TATA" box, influenciando na transcrição deste gene. Existe um desequilíbrio de ligação entre os SNPs -31 C/T e -511 T/C do gene IL1B e este último também está associado a um risco aumentado para o glaucoma (p=0,006). Com relação aos demais SNPs estudados (+3954 C/T do gene IL1B, -889 C/T e +4845 G/T do gene IL1A e -238 G/A e -308 G/A do gene TNFA), não houve associação com o glaucoma. Este estudo sugere que há relação das variantes "C" do SNP -31 C/T e "T" do SNP -511 T/C do gene IL1B com a etiologia do GPAA em uma amostra da população brasileira / Abstract: Glaucoma comprises a group of diseases characterized by progressive atrophy of the optic disc and corresponding visual field loss, as consequence of retinal ganglion cells death. Augmented intraocular pressure (IOP) is the main risk factor for glaucoma development, but it has been suggested that there are other relevant aspects that may lead to neuronal and trabecular meshwork (TM) damage and contribute to the development of glaucoma, including alterations in nitric oxide metabolism, oxidative stress and vascular and immune system dysregulations. Primary open angle glaucoma (POAG), the most prevalent form of glaucoma, is associated with several risk factors to its initiation and progression besides IOP. The additional risk factors are: age (direct correlation), race (more frequent in black subjects), myopia and family history of glaucoma. The majority of POAG cases presents a complex pattern of heritability, in which susceptibility variants contribute to disease severity. The aim of this case-control study was to evaluate the role of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in the interleukin alpha (IL1A), interleukin beta (IL1B) and tumor necrosis factor alpha (TNFA) genes in relation to POAG susceptibility. After ophthalmologic evaluation, 214 unrelated subjects with POAG were recruited. The molecular analysis was performed by PCR and direct sequencing techniques. In this study it was observed that the C allele of the -31 C/T promoter polymorphism of the IL1B gene confers risk for glaucoma (p=0.002). This allele disrupts a "TATA" box, influencing the transcription of the IL1B gene. There is linkage disequilibrium between the -31 C/T e -511 T/C SNPs, and the latter is also associated with an increased risk for glaucoma (p=0.006). Regarding the others studied SNPs (+3954 C/T of the IL1B gene, -889 C/T and +4845 G/T of the IL1A gene and -238 G/A and -308 G/A of the TNFA gene), there is no association with glaucoma. This study suggests the relationship of the "C" variant of -31C/T and "T" variant of -511T/C of IL1B gene with POAG etiology in a sample of the Brazilian population / Mestrado / Oftalmologia / Mestra em Ciências Médicas
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Caracterização de aspectos relevantes para a avaliação genético-clínica de portadores de fendas orofaciais em Alagoas / Description of relevant aspects for genetic evaluation of patients with orofacial clefts in Alagoas

Fontes, Marshall Italo Barros, 1970- 18 August 2018 (has links)
Orientador: Vera Lúcia Gil da Silva Lopes / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-08-18T17:55:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fontes_MarshallItaloBarros_M.pdf: 3724290 bytes, checksum: a718bf4ec25c48712d910bdb7b259ad5 (MD5) Previous issue date: 2011 / Resumo: As fendas orofaciais (FOF) têm prevalência mundial em torno de 1:600 nascidos-vivos. Trata-se de um grupo heterogêneo, com significativa associação a comorbidades e que demanda assistência multiprofissional, integral e especializada. No Brasil, embora exista a Rede de Referência no Tratamento de Deformidades Craniofaciais (RRTDCF), com atuação na esfera de alta complexidade, não existem propostas para os demais níveis de atenção no Sistema Único de Saúde (SUS). O presente estudo representa uma abordagem pioneira em Alagoas, com o objetivo de contribuir para a atenção em genética de portadores de fendas orofaciais no estado, por meio do reconhecimento das características clínicas e genéticas de seus portadores. Os dados foram coletados entre setembro de 2009 e fevereiro de 2011, por meio de protocolo validado. A casuística foi composta por 104 indivíduos (M1,1:F1). Apenas 11,5% dos pacientes tinham idade inferior a um ano. Do total da amostra, 38/104 (36,5%) ainda necessitam de cirurgia primária para correção da FOF e, destes, 15/38 (39,5%) apresentam idade superior a 2 anos. Quanto ao tipo de FOF, 61,5% apresentavam fenda labiopalatal, 23,1%, fenda labial e 15,4%, fenda palatal. Setenta e cinco por cento dos casos eram de FOF isolada e 25,0%, de FOF sindrômicas. Os defeitos major acometiam os sistemas nervoso central, cardiovascular e esquelético. A taxa de consanguinidade parental foi 9,7% e de recorrência familial, 28,7%. Houve associação preferencial entre deficiência mental e FOF sindrômica (p=0,003). Os resultados retratam a realidade local, relativos ao diagnóstico e ao tratamento de FOF. As características clínicas apresentadas foram similares às descritas na literatura. Detectou-se acesso tardio à cirurgia e avaliação genético-clínica de parte significativa da amostra. Esses resultados poderão ser aplicados na estruturação da atenção à saúde de pessoas com FOF no SUS, de acordo com as necessidades de saúde específicas da população de Alagoas / Abstract: Introduction: Orofacial clefts (OC) occur in approximately 1/600 newborns babies worldwide and are among the most common birth defects. Multidisciplinary, team-based, coordinated and family-centered healthcare is accepted as the state of the art in this field. Public healthcare for patients with orofacial clefts was structured in 1998 in Brazil through 21 units arranged as a network unevenly distributed. Alagoas is a poor state located in the Northeast region of the country in which there is not specialized center for care of patients with OC. Aim: to describe demographic and clinical-genetic characteristics as a subside to structure healthcare for patients with OC in Alagoas. Methods: All patients were systematically seen by two clinical geneticists using a pretested protocol from September 2009 to February 2011. Conventional and molecular cytogenetic analyses were performed in selected patients. Fisher Test was used for statistics with p-value<0.05. Results: majority of patients were males, country side residents, with isolated cleft lip with cleft palate. Ages ranged between 0-37 years. Thirty six percent had never undergone surgery while 100% had never attended to genetic evaluation. Isolated cleft was diagnosed in 75%, syndromes in 14.4%, multiple congenital defects in 9.6% cases and additive randomic defects in 1.0%. Organs systems most affected by major defects were central nervous, cardiovascular and skeletal systems. Recurrence and parental consanguinity were, respectively, 28.7% and 9.7%. Twenty-three individuals without cleft surgery were registered for multidisciplinary treatment. Conclusions: Clinical-genetic characteristics corroborate the literature. Findings revealed high levels of unmet medical needs and provided an evidence base for health care planning / Mestrado / Genetica Medica / Mestre em Ciências Médicas
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Estudo da prevalencia das mutações 677(C-T) e 1298(A-C) no gene da metilenotetrahidrofolato redutase (5,10-MTHFR) em portadores de DFTN e seus pais em uma amostra populacional da região de Campinas

Neri, João Ivanildo da Costa Ferreira 04 November 2002 (has links)
Orientadores : Denise Pontes Cavalcanti, Valder Roberval Arruda / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciencias Medicas / Made available in DSpace on 2018-08-03T11:01:41Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Neri_JoaoIvanildodaCostaFerreira_M.pdf: 41236330 bytes, checksum: 3729551501ea8ce88ce1ecf7a9993ee5 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Dois polimorfismos decorrentes de duas mutações de ponto (C677T e A1298C) no gene da metilenotetrahidrofolato redutase (MTHFR), enzima responsável pela ativação do ácido fólico no principal processo de metilação da homocisteína, vêm sendo referidos como fatores predisponentes à ocorrência de defeitos de fechamento do tubo neural (DFTN). O genótipo 677TT determina uma variante termolábil da MTHFR, com atividade reduzida a cerca de 50% e, consequentemente, aumento da homocisteína plasmática. Quanto ao segundo polimorfismo, apenas a dupla hetrozigosidade (CT/AC) parece estar associada a alterações bioquímicas semelhantes às descritas para o homozigoto 677TT. Embora os DFTNs compreendam três tipos anatomicamente distintos: anencefalia, encefalocele e espinha bífida, a maioria dos trabalhos que estudaram a relação entre as mutações no gene da MTHFR com esses defeitos o fizeram incluindo apenas as espinhas bífidas. Evidências epidemiológicas, por outro lado, sugerem que anencefalia, encefalocele e espinha bífida podem ser defeitos distintos e, possivelmente, eles possam ser classificados como defeitos altos (anencefalia, encefalocele, espinha bífida cervical e torácica) e baixos (espinhas bífidas lombares e sacrais). O presente trabalho investigou, por meio da técnica da PCR, essas duas mutações no gene da MTHFR em recém-nascidos portadores de DFTN e seus pais, compreendendo 119 famílias que foram registradas no Programa de Genética Perinatal (pROGEPE) no período de setembro de 1987 a dezembro de 2000. As fteqüências obtidas nessas famílias foram comparadas com aquelas encontradas numa amostra da população da mesma região formada por amostras de sangue de cordão colhidas, em duas etapas, dentro do período de desenvolvimento do projeto e durante o parto de recém-nascidos vivos e consecutivos que não apresentassem qualquer alteração morfológica diagnosticada até a data de sua alta da maternidade. Observou-se que a fteqüência do homozigoto mutante 677TT entre os propósitos foi de 13,5%, e nos demais grupos de 10,1% nas mães, 11,8% nos pais e 11,3% nos controles, não sendo observadas diferenças estatisticamente significativas entre os quatro grupos (i'(3) = 0,53; P = 0,91). O genótipo mutante 1298CC observado entre os propósitos, mães, pais e controles foram, respectivamente: 5,8%, 5,0%, 3,6% e 5,6%. Todas as fteqüências alélicas, seja para a mutação C677T, seja para a A1298C, em todos os grupos estudados mostraram-se estar em equilíbrio de Hardy- Weinberg. O genótipo duplamente heterozigoto (CT/AC) foi encontrado em 11,8% dos propósitos, 19,OOIÓ das mães, 20,2% dos pais e 13,2% dos controles, não sendo observada diferenças estatisticamente significativas (X:(3)= 3,93; P = 0,27).A distribuiçãodas freqüências dos genótipos homozigoto mutante (TT) e duplo heterozigoto (CT/AC) entre os sexos dos propósitos, bem como entre seus diferentes diagnósticos também não apresentaram diferenças estatisticamente significativas no presente estudo. Apesar desses resultados, a maior concentração do genótipo TT entre as espinhas bífidas lombares e sacrais, sugerem uma possível associação desse genótipo TI com os defeitos anatomicamente mais baixos. Finalmente, as freqüências muito baixas ou nulas das combinações genotípicas CT/CC, TT/AC e TT/CC, inclusive na população de controle, sugerem que tais associações são pouco viáveis / Abstract: Two current polymorphisms of two point mutations (C677T and A1298C) in the gene of the methilenetetrahydrofolate reductase (MTHFR), responsible enzyme for the activation of the folic acid in the main process ofmetylation ofthe homocysteine, come being referred as predisponent factors to the occurrence of neural tube defects (NTD). The genotype 677TT determines a thermolable variant of MTHFR, with reduced activity about 50% and, consequent1y, increase of the plasmatic homocysteine. With relationship to the second polymorphism, just the double hetrozygosity (CT/AC) seems to be associated to biochemical alterations similar to described them for the homozygous 677TT. Although NTD understands three anatomically different types: anencephaly, encephalocele and spina bifida, most of the works that studied the relationship among the mutations in the gene of MTHFR with those defects they made it just including the spina bifida. Epidemiological evidences, on the other hand, suggest that anencephaly, encephalocele and spina bifida can be different defects and, possibly, they can be classified as high defects (anencephaly, encephalocele, cervical and thoracic spina bifida) and low (lumbar and sacrais spina bifida). The present study investigated, using the technique of PCR, those two mutations in the gene ofMTHFR in newbom carriers ofNTD and their parents, understanding 119 families that were registered in the Program of Perinatal Genetics (pROGEPE) in the period of September 1987 to December 2000. The obtained frequencies in those families were compared with those found in a sample of the population of the same area formed by picked samples of cord blood, in two stages, inside of the period of development of the project and during the childbirth of newbom alive and serial that didn't present any morphologic alteration diagnosed untU the date of its discharge of the maternity. It was observed that the ftequency of the homozygote mutant 677TT among the proposals was of 13,5%, and among the other groups of 10,1% in the mothers, 11,8% in the fathers and 11,3% in the controls, not being observed statistically significant differences among the four groups (r:(3)= 0,53;p = 0,91). The mutant genotype1298CCobserved among the proposals, mothers, fathers and controls were, respectively: 5,8%, 5,0%, 3,6% and 5,6%. AlI the allelic ftequencies, be for the mutation C677T, be for the A1298C, in all the studied groups they were shown to be in Hardy-Weinberg equilibrium. The double heterozygote genotype (CT/AC) was found in 11,8% ofthe proposals, 19,0% ofthe mothers, 20,2% of the fathers and 13,2% ofthe controls, not being observed statistically significant differences (i(3) =3,93;p = 0,27).The distributionofthe ftequenciesofthe homozygotemutant (TT) and double heterozygote (CT/AC) genotypes among the sexes of the proposals and their different diagnoses didn't also present statistically significant differences in the present study. In spite of those results, the largest concentration of the genotype TT among the lumbar and sacral spinas bifida, suggests a possible association of that genotype TT with the anatomically lower defects. Finally, the very low or null ftequencies of the genotypic combinations CT/CC, TT/AC and TT/CC, besides in the control population, suggest that such associations are little viable / Mestrado / Genetica Medica / Mestre em Ciências Médicas
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Estudo genetico-clinico de individuos com caracteristicas da Sindrome Kabuki

Oliveira, Gisele Santos de 04 July 2000 (has links)
Orientadores: Antonia Paula Marques-de-Faria, Edi Lucia Sartorato / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Ciências Médicas / Made available in DSpace on 2018-07-25T23:53:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oliveira_GiseleSantosde_M.pdf: 3142351 bytes, checksum: 23845103231aa67432f14b24cd818907 (MD5) Previous issue date: 2000 / Resumo: A síndrome Kabuki (SK), descrita pela primeira vez no Japão, em 1981, por NIIKA W A et ai. e KUROKI et ai., é uma condição rara, de etiologia desconhecida, caracterizada por fades peculiar, com sobrancelhas arqueadas, fendas palpebrais alongadas e evertidas no terço distal, lembrando a maquiagem usada pelos atores do teatro Kabuki, além de retardo mental, baixa estatura, anomalias esqueléticas e de padrão dermatoglífico. Sua incidência no Japão foi estimada em 1:32.000, sendo considerada ainda mais rara fora desse pais, dado que vem sendo contestado pelo registro crescente de casos em populações não orientais. No Brasil, são poucos os relatos a respeito, em geral correspondendo a descrições de casos esporádicos e não ao resultado de um estudo sistemático, o que motivou o presente trabalho. Entre junho de 1998 e dezembro de 1999, 18 indivíduos com características da SK, predominantemente caucasóides, foram examinados seguindo um protocolo específico de avaliação, desenvolvido a partir das principais manifestações da condição. Entre os exames complementares, foi incluída a análise molecular do gene TUBA2, devido à sugestão de que houvesse alguma relação do mesmo com a SK, o que não se confirmou. O diagnóstico foi mantido em 10 pacientes (3 meninas e 7 meninos), enquanto entre os 8 restantes (4 meninas e 4 meninos), 3 receberam diagnóstico de síndrome de Noonan (SN), 2 de síndrome de Turner (ST), 1 de monossomia 18p, e 2 ainda permaneceram sem etiologia definida Entre aqueles com SK, 1000.10 tinham o aspecto fàcial peculiar dessa condição e retardo mental em graus variados, 800.10 mostraram alterações dermatuglíficas, 600.10 apresentaram anomalias vertebrais e a baixa estatura foi evidenciada em 50%. Quando comparada a outros estudos, a presente amostra foi similar à maioria deles, praticamente em todos os aspectos. Não houve desvio da razão de sexo, bem como relato de consangüinidade entre os genitores ou de recorrência familial. O protocolo de investigação utilizado mostrou-se adequado enquanto instrumento de caracterização da amostra, sendo sugerida sua aplicação sistemática na investigação diagnóstica de indivíduos com hipótese inicial de SK Merece destaque o fato das características faciais ocorrerem ainda em outras entidades, apontando para um possível fenótipo Kabuki determinado pela associação de fenda palpebral alongada, eversão de terço distal de pálpebra inferior e sobrancelhas arqueadas. Ficou mais evidente a concomitância de sinais com relação à ST, em especial nos casos associados a anéis do cromossomo X, bem como com a SN, reforçando a necessidade de uma avaliação criteriosa que considere tais diagnósticos diferenciais. Estudos mis detalhados, envolvendo diferentes centros e levando em conta esses aspectos, poderiam contribuir para uma melhor caracterização da SK / Abstract: The Kabuki (Niikawa- Kuroki) syndrome (KS), first and independent1y described in Japan in 1981 by Niikawa et a!. and Kuroki et ai., is a multiple congenital anomaly/mental retardation syndrome. This syndrome is characterized by a peculiar facies which resembles the Kabuki theatre make-up, with long palpebral fissures and eversion of lower lids, arched eyebrows, depressed nasal tip and prominent ears, mild to moderate mental retardation, postnatal growth retardation, skeletal abnormalities and dermatoglyphic anomalies. The incidence in Japan was estimated around 1 :32,000 newboms; the frequency of non-Japanese patients is not available, although the number of cases has been increasing each year. The etiology remains undetermined and most cases have been sporadic. In Brazil there have been a few reports of this condition, all of them corresponding to isolated descriptions. In order to better characterize KS among the children referred to the Department of Genetics, we applied strict clinical and laboratory criteria. Between June, 1998 and December, 1999, 18 patients were found to have KS. The molecular analysis of TUBA2 gene was included because some investigators have suggested that it could be related to this syndrome. Of 17 patients examined all of them did not have mutations of the TUBA2 gene, which had not confirmed the previous suggestion. Three females and seven males, most1y Caucasians, fulfilled the clinical criteria for KS. The remaining four females and four males were considered to have Noonan syndrome (3), Tumer 'syndrome (2), monosomy 18p (1). Two patients did not complete their clinical evaluation. Among the KS patients, 100% presented the peculiar facial aspect, besides mental retardation in different degrees, 80% had dermatoglyphic abnormalities, 60% had vertebral anomalies and 50% presented with short stature. There was no sex predilection, family history of other cases, parental consanguinity or familial recurrences suggesting that these cases occur sporadically. Taken together these data support the hypothesis that the etiology of KS results from a de novo mutation in a dominant gene. The clinical and laboratory assessment developed in our study is useful by characterizing patients with KS and should be applied to patients with clinical features suggestive of KS. The high degree of overlapping clinical features between KS and Noonan and Tumer syndrome, especially in patients with chromosome X rings, reinforces the necessity of a thorough evaluation when one of these conditions are contemplated as a possible diagnosis. Until a specific genetic marker is available, multicenter studies might contribute to a better characterization of KS / Mestrado / Genetica Medica / Mestre em Ciências Médicas

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