Submitted by Alessandra Portugal (alessandradf@ioc.fiocruz.br) on 2013-09-24T19:51:20Z No. of bitstreams: 1 Caroline Xavier de Carvalho.pdf: 1397999 bytes, checksum: 57b7d91be020cd16df021ebfb76326ef (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-24T19:51:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Caroline Xavier de Carvalho.pdf: 1397999 bytes, checksum: 57b7d91be020cd16df021ebfb76326ef (MD5) Previous issue date: 2012 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A dengue, que é considerada pela Organização Mundial da Saúde (OMS) como um dos maiores problemas de saúde pública das áreas tropicais urbanas, é causada por quatro sorotipos virais (DENV-1,-2,-3,e -4) e pode se manifestar de formas assintomáticas, brandas até formas muito graves, que podem levar ao óbito. Hipóteses para a gravidade da dengue baseadas em infecções secundárias não explicam inteiramente o fenômeno. Mais recentemente uma hipótese alternativa tem sugerido a contribuição de outros fatores para o desfecho das infecções graves, dentre eles a constituição genética dos pacientes. No presente trabalho, foi realizado um estudo caso-controle, com 88 pacientes com dengue muito grave (com ocorrência de choque) e 335 controles residentes na vizinhança dos casos. Foram selecionados polimorfismos em genes candidatos, como TNF, MIF, IL-10, CLEC5A, DC-SIGN, MRC-1, CCR5 e NOD2 a fim de encontrar uma possível associação destes com o desenvolvimento de dengue grave. Foram encontradas associações estatisticamente significativas para os SNPs rs1285933 no gene do receptor CLEC5A (OR=2,25; p=0,03) e rs4804803 no gene do receptor DC-SIGN (OR=0,12; p=0,04). Posteriormente, nós testamos a produção de TNF em pacientes (brandos e graves incluindo os com choque) que tiveram o sangue coletado na fase crítica da doença (5-7 dias da infecção) e que foram genotipados para os SNPs rs1285933/CLEC5A e rs4804803/DC-SIGN. Foram observados níveis mais elevados de TNF no soro de pacientes carreadores dos genótipos TT/ CT para o SNP rs1285933/CLEC5A comparados aos carreadores do genótipo CC ou pacientes recuperados (mais de 15 dias após os sintomas) que foram usados como controles. Não foram observadas diferenças significativas nos níveis de TNF entre os diferentes genótipos para o SNP rs4804803/DC-SIGN. De forma geral, polimorfismos em genes da resposta imune podem modificar os níveis ou a funcionalidade desses mediadores contribuindo para as diferentes formas de infecção observadas. / The Dengue is reported by the World Health Organization (WHO) as a major public health problem in tropical urban areas, this infection is caused by four serotypes (DENV-1,-2,-3,e -4) and its clinical manifestations are vast: ranging from asymptomatic and mild to severe cases, can lead the patient to death. Hypothesis for the severity based on secondary infections do not fully explain the phenomenon. More recently, an alternative hypothesis has suggested the contribution of other factors, as the genetic background of the patients, in the outcome of infection. Here, we performed a case control study enrolled 88 patients with severe dengue (with the occurrence of shock) and 335 controls neighbors of the cases. We selected polymorphisms in candidate genes, such as TNF, MIF, IL-10, CLEC5A, DC-SIGN, MRC-1, CCR5 e NOD2, in order to find associations between these SNPs and severe dengue. Significant association was found for SNPs rs1285933 in the CLEC5A gene (OR=2.25; p=0.03) and rs4804803 in the DC-SIGN gene (OR=0.12; p=0.04). TNF production was then assessed in a second sample of patients who had their blood collected between days 5 -7 of infection (critical phase) and their DNA genotyped for SNPs rs1285933/CLEC5A and rs4804803/DCSIGN. Results demonstrated an increased TNF production in serum of individuals, only among severe cases, presenting the CT/TT genotypes when compared to the CC genotype for SNP rs1285933 or recovered patients (blood samples collected after 15th day of infection) used here, as controls. No significant difference was observed in TNF levels among the different genotypes for the SNP rs4804803/ DCSIGN. Overall, polymorphisms in genes involved in immune response can modify the functionality or the levels of these mediators contributing to different outcomes of the infection.

Submitted by Alessandra Portugal (alessandradf@ioc.fiocruz.br) on 2013-10-03T12:22:15Z No. of bitstreams: 1 Esther Miranda.pdf: 149849 bytes, checksum: 9111b41a656c85945e355cd442bed3b1 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-10-03T12:22:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Esther Miranda.pdf: 149849 bytes, checksum: 9111b41a656c85945e355cd442bed3b1 (MD5) Previous issue date: 2008 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A hepatite C constitui um grave problema de saúde pública no Brasil. A maioria dos dados de prevalência disponível provém de grupos específicos. Em doadores de sangue, a prevalência da infecção pelo HCV varia de 0,65% (região Sul) a 3,5% (região Norte). A distribuição dos genótipos do HCV no Brasil é heterogênea entre as diferentes regiões geográficas e, até, entre diferentes estados da mesma região. Dados sobre a distribuição dos genótipos de HCV na região Norte são escassos. O principal objetivo deste estudo foi descrever aspectos clínicos, histopatológicos e laboratoriais de diferentes categorias de pacientes com hepatite C crônica, atendidos em um centro de referência para atendimento e tratamento de pacientes com doença hepática crônica, em Belém, Pará. Um estudo de corte transversal foi conduzido em 345 indivíduos infectados pelo HCV (163 pacientes com hepatite crônica, 56 doadores de sangue, 32 hemofílicos, 73 hemodialisados e 22 pacientes com carcinoma hepatocelular), procedentes de diferentes municípios do estado do Pará. Foram avaliados os seguintes aspectos demográficos, clínicos e epidemiológicos: idade, sexo, apresentação clínica, fatores de risco de aquisição de infecção por HCV e grau de lesões hepáticas de acordo com o sistema de classificação METAVIR. Amostras de soro foram analisadas para determinação do RNA e dos genótipos do HCV. A média de idade dos 345 pacientes com hepatite C crônica foi 47,7 anos (± 13,9). A maioria dos pacientes, neste estudo, era do sexo masculino (74.8%) e as mulheres apresentaram média de idade mais elevada (p=0.00115) do que os homens (51,9 ± 12,9 anos e 48,6 ± 13,7 anos, respectivamente). Os fatores de risco associados à infecção por HCV mais freqüentes foram: história prévia de transfusão sangüínea (50,1%), cirurgia (36.4%), hemodiálise (31.2%) e compartilhamento de agulhas não descartáveis (16.8%). As manifestações extra-hepáticas mais freqüentes nestes pacientes foram: astenia, hipertensão, diabetes mellitus, artralgia, prurido, hipotireoidismo e trombocitopenia. Da população estudada, 98% dos pacientes estavam infectados pelo genótipo 1 (77,1%) ou 3 (20,9%) do HCV. A distribuição dos genótipos do HCV foi similar entre os cinco grupos de pacientes. Não foram observadas diferenças significativas entre os genótipos do HCV e fatores de risco, aspectos clínicos e demográficos, exceto idade. Indivíduos infectados pelo HCV genótipo 3 apresentaram média de idade mais baixa (44,5 ± 13,6 anos) quando comparados àqueles infectados pelo HCV genótipo 1 (48,6 ± 13,7 anos) (p= 0.0273). Os seguintes aspectos clínicos e histopatológicos parecem estar associados com o genótipo de HCV: maior prevalência de diabetes mellitus tipo 2 (p= 0,0425) nos pacientes infectados pelo genótipo 1 do HCV; maior freqüência de esteatose em indivíduos infectados pelo genótipo 3. A intensidade da fibrose foi associada a idade elevada, grau de atividade e esteatose, níveis séricos elevados de ALT e AST e plaquetopenia. A presença de esteatose foi associada a graus de atividade e fibrose. Os maiores percentuais de resposta virológica sustentada (RVS) ao tratamento foram observados nos pacientes tratados com Interferon-α peguilado combinado com ribavirina. / Hepatitis C virus (HCV) infection is a major concern of public health worldwide. In Brazil, available data on HCV prevalence are mainly from selected groups. In blood donors, HCV seroprevalence ranges from 0.65% (Southern) to 3.5% (Northern). The distribution of HCV genotypes in Brazil varies greatly among different geographic regions. However, data on HCV genotypes are scarce in Northern region. Therefore, the main objective of this study was to describe clinical, histopathological and laboratorial features of different categories of patients with chronic hepatitis C, attended at a public reference center for management and treatment of chronic hepatic diseases in Belém, Pará. A cross sectional study was conducted among 345 HCV infected individuals (56 blood donors, 32 hemophiliac, 73 hemodialysis, 22 hepatocellular carcinoma, and 163 chronic hepatitis C patients) living in different counties of state of Pará, Eastern Amazon, Brasil. The following demographic, clinical, and epidemiological data were evaluated: gender, age, clinical presentation, and risk factors for acquiring HCV infection. Histopathological features were also evaluated by METAVIR system. Serum samples were analysed for determining HCV RNA and genotypes. The mean age of the 345 chronic hepatitis C patients, was 47.7 years old (± 13.9). Two hundred fifty eight (74.8%) were male. HCV infected women were older than men (p=0.00115), with average ages of 51.9 ± 12.9 years and 48,6 ± 13.7 years, respectively. Previous history of blood transfusion (50,1%), surgery (36.4%), hemodialysis (31.2%), and sharing non-disposable needles (16.8%) were the most frequently related risk factors associated with acquiring infection. Asthenia, blood hypertension, diabetes mellitus, arthralgia, itching, hypothyroidism and thrombocytopenia were the main extra-hepatic clinical manifestations observed. Overall, 98% of the patients were infected by HCV genotype 1 (77.1%) or genotype 3 (20.9%). The distribution of HCV genotypes was similar between the five patient groups. There were not significant differences between genotypes according to risk factors, clinical and demographic features, except for age. Individuals infected by HCV genotype 3 had a lower average age (44.5 ± 13.6 years) when compared to those infected by genotype 1 (48.6 ± 13.7 years) (p= 0.0273). The following clinical and histopathological features seem to be associated to HCV genotypes: higher prevalence (p= 0,0425) of diabetes mellitus type 2 among patients infected with HCV genotype 1; higher frequency of steatosis in individuals infected with HCV genotype 3. The intensity of fibrosis was associated with elevated age, activity index and steatosis, elevated levels of ALT and AST e low level of platelets. The presence of steatosis was associated to severity (activity index and fibrosis degree). Higher rates of sustained virological response (SVR) to treatment were achieved by patients treated with Interferon-α peguilado plus ribavirin.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2013-11-18T11:36:43Z No. of bitstreams: 1 marcelle_f_m_silva_ioc_bcm_mest_2009.pdf: 2789273 bytes, checksum: 9eec02b2cff5e8b7d0e13273295ee5ea (MD5) / Approved for entry into archive by Gentil Jeorgina(jeorgina@icict.fiocruz.br) on 2013-11-26T11:00:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 marcelle_f_m_silva_ioc_bcm_mest_2009.pdf: 2789273 bytes, checksum: 9eec02b2cff5e8b7d0e13273295ee5ea (MD5) / Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2014-09-25T13:20:16Z No. of bitstreams: 1 marcelle_f_m_silva_ioc_bcm_mest_2009.pdf: 2789273 bytes, checksum: 9eec02b2cff5e8b7d0e13273295ee5ea (MD5) / Approved for entry into archive by Gentil Jeorgina (jeorgina@icict.fiocruz.br) on 2014-10-01T16:29:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 marcelle_f_m_silva_ioc_bcm_mest_2009.pdf: 2789273 bytes, checksum: 9eec02b2cff5e8b7d0e13273295ee5ea (MD5) / Made available in DSpace on 2014-10-01T19:12:19Z (GMT). No. of bitstreams: 1 marcelle_f_m_silva_ioc_bcm_mest_2009.pdf: 2789273 bytes, checksum: 9eec02b2cff5e8b7d0e13273295ee5ea (MD5) Previous issue date: 2009 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Nas décadas de 80 e início de 90 os rotavírus A (RV-A) de genótipo G5, comum em suínos, equinos e bovinos eram detectados com frequência em amostras fecais de crianças brasileiras. Após 1996, deixou de circular em caráter endêmico, tornando-se apenas esporadicamente detectado, enquanto o genótipo G9 começou a ser detectado com frequência. Esta situação leva a crer que houve a substituição do genótipo G5 pelo G9. Tendo em vista a escassez de dados moleculares a respeito de amostras de genótipo G5 de RV-A, no presente estudo foi realizada a análise filogenética para os genes que codificam para as proteínas VP1, VP2, VP3, VP4, e VP7 de vinte e oito amostras de RV-A humano de genótipo G5P[8], coletadas em diferentes estados brasileiros entre 1986 e 2005. A análise filogenética do gene que codifica para a proteína VP7 demonstrou que as mesmas agrupam juntamente com amostras humanas brasileiras de genótipo G5 (IAL28, Br 1054 e Br H8), no entanto a análise do gene que codifica para a proteína VP4 demonstrou que circularam três linhagens do genótipo P[8] (P[8]-1, P[8]-2, e P[8]-3) no Brasil entre 1986 e 2005 em associação com G5. As análises filogenéticas para os genes que codificam para VP1, VP2, e VP3 demonstraram que os mesmos pertencem ao genogrupo Wa-Like, comum a humanos, o que sugere que estas amostras possam ter se originado de uma amostra de RV-A humano. As análises filogenéticas dos genes de VP1, VP2 e Vp3 revelaram que todas as amostras foram classificadas dentro dos genótipos R1, M1 e C1, respectivamente Os resultados do presente estudo enfatizam a importância do monitoramento contínuo e a caracterização molecular das amostras de RV-A circulantes, principalmente para prever a possível emergência e/ou re-emergência de genótipos após a introdução de uma vacina contra RV-A nos diferentes continentes do mundo e para se melhor entender a dinâmica e o padrão de evolução dos RV-A de genótipo G5. / The group A rotavirus (RV-A) genotype G5, which is common in pigs but also detected in horses and cattle was frequently detected in stool samples collected in the 1980s and the early 1990s in Brazil. After 1996, the G5 has disappeared as an endemic/epidemic strain, becoming only sporadically detected. On the other hand the RV-A G9 has showed a broad geographic distribution. Recently, the G5 was reported in children with severe diarrhea in Argentina, Brazil, Cameroon, Paraguay, People’s Republic of China, and Vietnam. It suggests that the G5, although uncommon overall in humans, is found worldwide. Twenty-eight G5P[8] human RV-A strains isolated from a 19-year long sample collection (from 1986 to 2005), representing four different Brazilian states, was analyzed, and the genetic variability for VP1, VP2, VP3, VP4 and VP7 genes was determined. The nucleotide sequencing and phylogenetic analyses were performed. Based on VP7 gene phylogenetic analysis, all the analyzed sequences were clustered with other Brazilian G5 strains. The VP4 genes analyzes showed that three P[8] genetic lineages (P[8]-1, P[8]-2 and P[8]-3) circulated in Brazil between 1986 and 2005 in association with genotype G5. The analyzed partial sequences of VP1, VP2 and VP3 showed high identity with RV-A Wa-like strains, which suggests that they might have originated from a human RV-A strain. The phylogenetic analysis revealed that all Brazilian strains were classified as genotype R1, M1 and C1 for VP1, VP2 and VP3 genes, respectively. Our results show that the inner RV-A genotype G5 proteins have been adapted in humans for at least 20 years, emphasizing the importance of continuous virological surveillance of circulating RV-A to detect new variants and possible antigenic changes with potential effect on vaccine effectiveness and contribute to a better understanding of the dynamics and pattern of RV-A G5 evolution.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-08T17:29:59Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 809231 bytes, checksum: ff7e81a4e0f11f718885f140ac5d8017 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-08T17:29:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 809231 bytes, checksum: ff7e81a4e0f11f718885f140ac5d8017 (MD5) Previous issue date: 2016-07-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os diversos usos do girassol e o potencial energético de suas sementes vêm sendo de crescente interesse na pesquisa a fim de potencializar ganhos genéticos com a cultura. O estabelecimento satisfatório da cultura de girassol depende grandemente da utilização de genótipos adaptados às regiões de cultivo, necessitando-se detectar e quantificar as interações entre genótipos e ambientes, fazendo uso de análises posteriores de adaptabilidade e estabilidade. Os objetivos deste trabalho são, em primeiro lugar, a proposta de uma nova metodologia de avaliação de redes ambientais (método do número ótimo de ambientes por busca exaustiva), além de estimar adaptabilidade e estabilidade de 16 genótipos potenciais de girassol, lançando mão de três metodologias para tal, incluindo o método ainda pouco difundido do centroide, visando assim, a recomendação de cultivares. Ao fim das análises espera-se que as metodologias empregadas se mostrem eficazes em recomendar cultivares específicos para variados ambientes. Foram utilizados dados de genótipos de girassol obtidos nas segundas safras de 2012 e 2013 em diversos estados sob a coordenação da Embrapa Soja. A condução dos experimentos foi feita se considerando 16 genótipos e 16 locais, e o delineamento experimental foi conduzido em blocos casualizados, com quatro repetições. As características agronômicas avaliadas foram o rendimento de grãos e o rendimento de óleo. Nas análises da rede de ambientes, nas quais foi utilizado o novo método proposto da busca exaustiva, foi possível concluir que este se mostrou eficiente em eliminar ambientes da rede sem afetar substancialmente os valores de correlação entre as análises. Neste trabalho, pôde-se perceber que a redução de, no máximo um ambiente foi apontada como viável para a condução dos experimentos para ambas as características mensuradas. Em relação às estimativas de adaptabilidade e estabilidade dos genótipos avaliados, foram utilizadas as metodologias de Eberhart e Russell, Lin e Binns e centroide, que se mostraram concordantes na recomendação de cultivares, incluindo a do centroide, ainda pouco difundida, que se mostrou de grande potencial pela facilidade de intepretação de resultados. Dos resultados obtidos, pôde-se concluir que os genótipos 12 (BRSG39) e 16(BRSG36) se mostraram propícios a ambientes favoráveis, o genótipo 2(HELIO358(T)) se destacou na recomendação a ambientes desfavoráveis e os genótipos 8(BRSG37), 4(MG341) e 13(BRSG37) se mostraram como sendo de adaptabilidade geral, com destaque para o primeiro. / The various sunflower uses and the energy potential of the seeds have been of growing interest in research in order to maximize genetic gain with culture. Satisfactory establishment of the sunflower crop depends greatly on the use of genotypes adapted to growing regions, need to detect and quantify the interactions between genotypes and environments, making use of further analysis of adaptability and stability. The objectives of this work are, first, the proposal of a new methodology for evaluating environmental networks (great number of method environments by exhaustive search), and estimate adaptability and stability of 16 potential genotypes of sunflower, making use of three methodologies for such, including the still little widespread method of centroid, thus aiming at the recommendation of cultivars. After the analysis is expected that the methodologies employed prove effective in recommending specific cultivars for different environments. sunflower genotypes Data was obtained in the second harvests of 2012 and 2013 in several states under the coordination of Embrapa Soja. The conduct of the experiments was made considering genotypes 16 and 16 places, and the experimental design was a randomized block design with four replications. The agronomic traits were grain yield and oil yield. In the analysis of network environments in which we used the proposed new method of exhaustive search, it was concluded that this proved effective in eliminating network environments without substantially affecting the correlation values between the analysis. In this paper, it could be seen that the reduction of maximum an environment has been identified as viable for conducting experiments for both measured characteristics. In the estimates of adaptability and stability of genotypes, methodologies Eberhart were used and Russell, Lin and Binns and centroid, who were concordant on the recommendation of cultivars, including the centroid, still little known, which proved of great potential for ease of results Interpretation. From the results, it could be concluded that the genotypes 12 (BRSG39) and 16 (BRSG36) proved conducive to favorable environment, genotype 2 (HELIO358 (T)) stood out in the recommendation to unfavorable environments and genotypes 8 (BRSG37) , 4 (MG341) and 13 (BRSG37) proved to be of general adaptability, especially the first.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-02-10T15:27:44Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 777562 bytes, checksum: 11f688a1703ac8135b33f98491793bf3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-10T15:27:44Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 777562 bytes, checksum: 11f688a1703ac8135b33f98491793bf3 (MD5) Previous issue date: 2016-07-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A seleção genômica tornou-se ferramenta bastante útil no auxílio ao melhoramento animal e vegetal, contudo este cenário tem requerido modelos com alta capacidade de predição. Neste contexto a inclusão de efeitos não aditivos e também de interação GxA em modelos GBLUP desponta como possível fonte de melhoria de capacidade predição em estudos de seleção genômica. Em conformidade com esta demanda, o objetivo com este trabalho foi verificar se a inclusão do efeito de dominância e seu respectivo efeito de interação com o ambiente aumentaria a habilidade de predição do modelo G-BLUP. Foram comparados modelos com e sem inclusão de efeitos de dominância sob interação GxA. Para as análises foram utilizados dados reais e simulados. Os dados simulados consistiram de 923 indivíduos avaliados em três ambientes sob diferentes herdabilidades no sentido amplo, herdabilidades no sentido restrito, níveis de dominância e correlações genéticas e residuais. Os dados reais provêm de 923 indivíduos de Pinus taeda L. genotipados e fenotipados para característica altura em quatro localidades dos Estados Unidos da América. Os resultados demonstraram haver ligeiro incremento na habilidade de predição (em validações entre e dentro de ambientes) quando utilizado o modelo com inclusão do efeito de dominância e também o efeito de interação dominância por ambiente, contudo conclui-se que o modelo aditivo dominante teve performance estatisticamente igual ao modelo aditivo sob interação GxA. / Genomic selection has become very useful tool in helping to animal and plant breeding, however this scenario has required models with high predictive ability. In this context the inclusion of non-additive effects and GxE interaction in GBLUP models is emerging as a possible source for improve the predictions of genomic selection. In line with this demand, the aim of this study was to evaluate the effect of inclusion of dominance effect and also the additive and dominance by environment interaction in genomic prediction. We compared models with and without inclusion of dominance effects in GxE interaction. For the analyzes, real and simulated data were used. The simulated data consisted in 923 individuals evaluated in three environments under different broad-sense heritability, narrow-sense heritability, dominance levels and genetic and residual correlations. The real data comes from 923 individuals of Pinus taeda L. genotyped and phenotyped to hight in four locations of United States. The results demonstrated a slight increase in predictive ability (in validations within and across environments) when using model with inclusion of dominance effect and the interaction effect dominance by environment, but we concluded that the additive and dominance model had a performance statistically equal to the additive model under GxE interaction.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T12:12:15Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 817945 bytes, checksum: 6059141ae362003700d54ee3a0e7bb21 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T12:12:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 817945 bytes, checksum: 6059141ae362003700d54ee3a0e7bb21 (MD5) Previous issue date: 2004-03-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A avaliação de cultivares e a identificação de mega-ambientes são os objetivos mais importantes em ensaios de avaliação de cultivares. Com este propósito foram avaliados, nas safras 1998/1999 e 1999/2000, os dados de produtividade de milho precoce do Ensaio Nacional no Estado de Minas Gerais, objetivando não apenas o conhecimento do desempenho dos cultivares comerciais e pré-comerciais, mas, principalmente, avaliar por meio da comparação das metodologias multivariadas AMMI (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction) e SREG (Sites Regression) de análise de interação genótipos x ambientes. Estas metodologias também possuem propriedades de estratificação de ambientes e de avaliação de adaptabilidade. Realizou-se comparação com outras metodologias tradicionais e com metodologia multivariada recém-proposta por Murakami (2001), com base na análise de fatores. O desempenho dos cultivares foi analisado mediante a utilização de análises de variância, metodologias de adaptabilidade e estabilidade. As análises AMMI e SREG apresentaram como vantagens o fato de explicarem uma maior parcela das soma de quadrados da interação G x A e possibilitar uma fácil interpretação gráfica dos resultados da análise estatística. Apesar de possuírem propriedades metodológicas de análise semelhantes, os resultados diferiram, na maioria das vezes, entre as análises AMMI e SREG. A análise SREG por incorporar o efeito de genótipo e por este na maioria dos casos estar altamente correlacionado com os escores do primeiro componente principal, possui a vantagem de permitir a avaliação gráfica direta do efeito de genótipo. O desenho de setores no biplot apresentado por Yan et al. (2000) e a análise SREG identificam com melhor propriedade a existência de mega-ambientes graficamente, prestando-se ao zoneamento agronômico. Como limitações das análises AMMI e SREG podem-se citar o requisito de dados balanceados, a explicação de apenas uma pequena porção da total da soma de quadrados G ou G + G x A, respectivamente, e a perda da medida de incerteza, pois não permitem o cálculo de uma hipótese em particular. A metodologia para estratificação de ambientes com base na técnica multivariada de análise de fatores mostrou-se eficiente em reunir locais pela similaridade de desempenho dos cultivares. Os agrupamentos de ambientes formados pela estratificação ambiental e a capacidade de discriminação de genótipos foram em parte coincidentes pelas metodologias utilizadas na avaliação dos dados. Dadas as condições de realização dos ensaios, alguns cultivares se destacaram por sua produtividade média, por seus resultados nas análises de estabilidade e pela adaptabilidade. Na safra 1998/1999, os genótipos P 30F33 e P 3041 se notabilizaram pelas suas produtividades e estabilidade através dos ambientes de avaliação. Na safra 1999/2000, o destaque foi o genótipo 98 HS 16B. Os ambientes Patos de Minas 2 e Uberlândia 2 de destacaram pela coincidência no agrupamento pela unanimidade das metodologias utilizadas, levando a inferir o forte caráter de homogeneidade edafoclimática pela proximidade geográfica, altitudes semelhantes e de localização nos Cerrados. Também a homogeneidade de manejo agrícola, praticada para estes dois ambientes, teve importância. As análises AMMI e SREG apresentaram propriedades importantes e adequadas ao estudo da interação genótipo x ambientes, sendo recomendadas suas utilizações pelos melhoristas de plantas. / The evaluation and identification of mega-environments are the major objectives in cultivar evaluation trials. Thus, the Minas Gerais National Trials data on early maize productivity were evaluated during 1998/1999 and 1999/2000, aiming not only to understand the performance of commercial and pre-commercial cultivars but especially to evaluate them by comparing the multivariate AMMI methodologies (Additive Main Effects and Multiplicative Interaction) and SREG (Sites Regression) of genotype x environments interaction analysis. Such methodologies also have environment stratification and adaptability evaluation properties. Comparison was made to other traditional methodologies and to the multivariate methodology recently proposed by Murakami (2001), based on factor analysis.Cultivar performance was analyzed by using variance analyses, and adaptability and stability methodologies. The AMMI and SREG analyses had the advantages of explaining a greater portion of the square sum of G x A interaction and allowing an easy graphic interpretation of the statistical analysis results. Despite having similar analysis methodological properties, the AMMI and SREG analyses xresults differed most of the times; the latter for incorporating the genotype effect and since, in most cases, it is highly correlated with the scores of the principal first component, having the advantages of allowing the direct graphic evaluation of the genotype effect. The sector design in the biplot presented by Yan et al. (2000) and the SREG analysis could better identify the existence of mega- environments graphically, being suitable for agronomical zoning. The AMMI and SREG analyses presented the following disadvantages: the requirement of balanced data, the explanation of only a small portion of the total sum of the squares G or G + G x A, respectively, and loss of uncertainty measurement, since it did not allow the calculation of a hypothesis in particular. The methodology applied for environment stratification based on factor analysis multivariate technique was found to be efficient in grouping locations based on cultivar performance similarity. The environment groupings formed by environmental stratification and genotype discrimination capacity coincided in part with the methodologies applied to data evaluation. Given the assay performance conditions, some cultivars stood out for their average productivity and stability and adaptability analysis results.In the 1998/1999 harvests, the genotypes P 30F33 and P 3041 presented outstanding productivities and stability in the evaluated environments. In the1999/2000 harvest, the genotype 98 HS 16B was the most outstanding. The environments Patos de Minas 2 and Uberlândia 2 stood out for coinciding in the grouping for unanimous methodology application, leading to infer the strong character of edaphoclimatic homogeneity due to geographic proximity, similar altitudes and locations in the cerrados. Homogeneity of the agricultural management practiced in these two environments was also important. The AMMI and SREG analyses presented important properties adequate to the study of genotype x environment interaction, their application being thus recommended by plant breeders.

Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-06-02T17:53:07Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 890077 bytes, checksum: 999497f0478b4bdfa7f6a21fbb16de86 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-02T17:53:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 890077 bytes, checksum: 999497f0478b4bdfa7f6a21fbb16de86 (MD5) Previous issue date: 2004-02-06 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os objetivos deste trabalho foram avaliar a representatividade dos locais de ensaios por meio de estratificação ambiental em Minas Gerais e Mato Grosso, e estudar a adaptabilidade e estabilidade de genótipos de soja nos Estados de Minas Gerais, Mato Grosso e São Paulo. Para verificar a representatividade dos locais, foram utilizados o método tradicional de estratificação ambiental e análise de fatores. Foram utilizados dois métodos de análise de adaptabilidade e estabilidade: EBERHART e RUSSELL (1966) e LIN e BINNS (1988), modificado por CARNEIRO (1998). O trabalho foi realizado com dados de produtividade de grãos obtidos de ensaios finais de avaliação de genótipos de soja. Em todos os Estados, os ensaios foram delineados em blocos ao acaso com três repetições. Em Minas Gerais, avaliaram-se 18 genótipos de ciclo semiprecoce/médio e 17 de ciclo semitardio/tardio, em seis ambientes (Capinópolis em duas épocas de plantio, Tupaciguara, Florestal, Paracatú e Unaí), na safra 2001/2002. Foram consideradas duas safras em Mato Grosso. Em 2000/2001 avaliaram-se 11 genótipos de ciclo semiprecoce/médio e 10 de ciclo semitardio/tardio em seis ambientes (Itiquira em três épocas de plantio, Primavera do Leste em duas épocas de plantio e Lucas do Rio Verde). Na safra 2001/2002, foi estudado o comportamento de 16 genótipos de ciclo semiprecoce/médio em 5 ambientes (Itiquira em três épocas de plantio, Primavera do Leste e Nova Mutum) e 14 genótipos de ciclo semitardio/tardio em três ambientes (Itiquira em duas épocas de plantio e Nova Mutum). Em São Paulo, foram avaliados 20 genótipos de soja em três ambientes (Nuporanga, Morro Agudo e Guaíra), na safra 2001/2002. Os genótipos foram provenientes do Programa de Melhoramento Genético de Soja do Departamento de Fitotecnia da Universidade Federal de Viçosa. Verificou-se que em Minas Gerais e Mato Grosso, apesar de existir interação genótipo x ambiente significativa na análise de variância conjunta, foi possível verificar padrões de similaridades de resposta dos cultivares e linhagens avaliados nos diferentes locais. A estratificação pela análise de fatores mostrou resultados semelhantes ao método tradicional. Os estudos de adaptabilidade e estabilidade, revelaram a existência de genótipos de diferentes grupos de maturação com ampla adaptabilidade e estabilidade, como os padrões de ciclo semitardio, Monarca e Conquista, os padrões de ciclo tardio DM-339 e UFV-18 (Patos de Minas) e as linhagens UFV98-267FRC11, UFV98-1640CRR73 e UFV98-U16-53, em Minas Gerais. Em Mato Grosso, na safra 2000/2001, destacaram- se o padrão de ciclo semiprecoce Conquista, o padrão CAC-1 e os cultivares UFV-17 (Minas Gerais) e UFVS-2002 de ciclo médio, o cultivar de ciclo semitardio/tardio UFV-18 (Patos de Minas) e a linhagem UFV95-370A 604. Na safra 2001/2002, as linhagens UFV98-9391140 e UFV97-61297212, de ciclo semiprecoce, o padrão Uirapurú e o cultivar UFVS-2003 de ciclo semitardio/tardio, apresentaram adaptabilidade geral e estabilidade. Foi possível, em São Paulo, indicar cultivares e linhagens com ampla adaptabilidade e estabilidade, se destacando os cultivares UFV-16 (Capinópolis), o padrão Conquista e as linhagens UFV98-833994 e UFV97-64322605. / The objective of this work was to evaluate the representativity of local essays using environmental stratification in Minas Gerais and Mato Grosso, and also to study the adaptability and stability of soybean genotypes in three States: Minas Gerais, Mato Grosso and São Paulo. The traditional method for environmental stratification and the factors analysis were used in order to verify the representativity of locals. For the evaluation of the adaptability and stability two methods were used: a) the EBERHART and RUSSELL (1966), and b) the LIN and BINNS (1988) modified by CARNEIRO (1998). This work was developed based on the grain production data obtained from final essays with soybean genotypes. In all locations, essays were designed in plots established randomly and three repetitions were carried out. In Minas Gerais, 18 genotypes with semi early/medium cycle and 17 with semi later/later cycle were evaluated in six environments: Capinópolis (planted in two different periods), Tupaciguara, Florestal, Paracatú and Unaí, in the harvest of 2001/2002. In Mato Grosso two harvest times were considered. In the harvest of 2000/2001, 11 genotypes with the semi early/medium cycle and 10 with the semi later/later cycle were evaluated in six environments: Itiquira (planted in three different periods), Primavera do Leste (planted in two different periods) and Lucas do Rio Verde. In the harvest of 2001/2002 the behavior of 16 genotypes with the semi early/medium was studied in five environments: Itiquira (planted in three different periods), Primavera do Leste and Nova Mutum. It was also evaluated in the same harvest year, 14 genotypes with semi later/later cycle in three environments: Itiquira (planted in two different periods) and Nova Mutum. In São Paulo 20 genotypes of soybean in three environments (Nuporanga, Morro Agudo e Guaíra) were analyzed in the harvest of 2001/2002. All genotypes were provided by the Program of Genetic Improvement of Soybean of the Fitotecnia Department of the Federal University of Viçosa. According to results, in Minas Gerais and Mato Grosso it was possible to verify patterns of similarity in the cultivars and lineages evaluated at different localities, despite the existing interaction of genotype x environment detected in the analysis of variance. The stratification using the Factors Analysis was similar to the Traditional Method. Studies of the adaptability and stability indicated the existence of genotypes with different maturation periods and large adaptability and stability, such as: the Monarca and Conquista pattern with semi later cycle, the DM-339 and UFV-18 (Patos de Minas) patterns with semi later cycle; and the lineages UFV98-267FRC11, UFV98-1640CRR73 and UFV98-U16-53 in Minas Gerais. In Mato Grosso, at the harvest of 2000/2001, best results were verified in the patterns: Conquista with semi early cycle and CAC-1; in the cultivars: UFV-17 (Minas Gerais), UFVS-2002, both with average cycle, and UFV-18 (Patos de Minas) with semi later/later cycle; and the lineage UFV95-370A 604. At the harvest year of 2001/2002, the lineages UFV98-9391140 and UFV97-61297212 with semi early cycle; the Uirapurú pattern and the cultivar UFVS-2003 with semi later/later cycle showed general adaptability and stability. In São Paulo it was possible to indicate the cultivars and lineages that showed large adaptability and stability, such as: the cultivar UFV-16 (Capinópolis); the Conquista pattern, and the lineages UFV98-833994 and UFV97-64322605.

Submitted by Amauri Alves (amauri.alves@ufv.br) on 2015-12-03T12:15:30Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 594381 bytes, checksum: 78003bc43c8f85c2a92e37c856c8f191 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-12-03T12:15:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 594381 bytes, checksum: 78003bc43c8f85c2a92e37c856c8f191 (MD5) Previous issue date: 2015-07-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Os objetivos deste estudo foram obter estimativas do progresso genético para produtividade de grãos e outras características agronômicas, bem como, os parâmetros de adaptabilidade e estabilidade fenotípica em cultivares de feijão do tipo carioca recomendados no Brasil entre os anos de 1970 e 2013. Os experimentos foram conduzidos nos municípios de Viçosa/MG e Coimbra/MG nas safras da seca e de inverno de 2013. Foram avaliados 40 cultivares de feijão carioca recomendados pelos principais programas de melhoramento do Brasil entre 1970 a 2013. O delineamento experimental utilizado foi o de blocos casualizados, com três repetições. As características avaliadas para o estudo do progresso genético foram: produtividade de grãos (Prod); aspecto de grãos (AG); arquitetura de planta (Arq); número de vagens por planta (NVP); número de grãos por vagem (NGV) e massa de 1000 grãos (MMG). Para o estudo de adaptabilidade e estabilidade fenotípica, foi utilizada apenas a característica produtividade de grãos. O progresso genético foi estimado com base nas médias das características por meio da análise de regressão bissegmentada. As estimativas dos parâmetros de adaptabilidade e estabilidade foram obtidas por meio da metodologia de Eberhart e Russell (1966). As médias das caraterísticas foram agrupadas pelo método de agrupamento de Scott e Knott (1974). Observou-se expressivo progresso genético dos programas de melhoramento de feijão carioca para a produtividade de grãos, e esse progresso passou a ser significativo a partir de 1990, com um ganho de 68,15 kg ha -1 ou 6,74% ao ano. Melhorias também foram observadas no aspecto de grãos (1,36% ao ano), no número de vagens por planta vii(5,62% ao ano), no número de grãos por vagem (4,59 % ao ano) e na massa de mil grãos (2,08% ao ano). Embora tenham sido recomendadas algumas cultivares de feijão carioca de arquitetura ereta, não foi observado progresso genético significativo proporcionado pelo melhoramento genético de feijão no Brasil para esta característica. Além disso, com a análise de adaptabilidade e estabilidade foi possível verificar, que os cultivares recomendados após 2005 foram as que apresentaram o fenótipo proposto por Eberhart e Russell, ou seja, alta produtividade de grãos, ampla adaptabilidade e alta previsibilidade de comportamento. Palavras-Chave - Phaseolus vulgaris L.; interação genótipos x ambientes; ganho genético; regressão bissegmentada, componentes do rendimento. / We aimed to estimate genetic progress for grain yield and other agronomic traits, as well as the adaptability and stability parameters using carioca beans cultivars recommended in the Brazil between 1970 and 2013. The experiments were carried out in the cities of Viçosa/MG and Coimbra/MG at crops seasons of drought and winter of 2013. Forty cultivars recommended by the main breeding programs in Brazil were evaluated by using randomized block design with three replications. The evaluated traits for the study of genetic progress were: grain yield (Prod.); grain aspect (AG); plant architecture (Arq), number of pods per plant (NVP); number of seeds per pod (NGV) and 1000-seeds weight (MMG). To study the stability and adaptability was considered only the characteristic grain yield using the Eberhart and Russell method. The genetic progress was estimated for all traits based on the average over the year using the bi-segmented regression analysis. Being the means grouped by Scott and Knott method. Significant genetic progress in carioca cultivars beans was observed to the trait grain yield, and this progress became significant from the year 1990, with an increase of 68.15 kg ha -1 or 6.74 % per year. Improvements were also seen in the other traits (0.29 or 5.62% per year for number of pods per plant, 0.09 or 4.59% per year for number of grains per pod, 2.95 or 2, 08% per year for thousand grain weight and -0.07 or 1.36% per year for grain aspect). Although erect cultivars have been recommended, significant genetic progress was not observed for this trait. The cultivars indicated after 2005 showed the genotypic suggested by Eberhart and Russell, i.e. jointly submitted high grain yield, wide adaptability and high predictability of behavior. ixKeywords - Phaseolus vulgaris L.; interaction GxE; genetic gain; bi-segmented regression; yield components.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2016-11-04T16:55:24Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 531131 bytes, checksum: e2985a6a6ee19e9ea57b67a3efdd030a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-04T16:55:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 531131 bytes, checksum: e2985a6a6ee19e9ea57b67a3efdd030a (MD5) Previous issue date: 2004-04-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Avaliou-se a influência de cinco grupos genéticos de caprinos (1⁄2 Moxotó + 1⁄2 Boer; 1⁄2 Boer + 1⁄2 SRD; 1⁄2 Savanna + 1⁄2 SRD; 1⁄2 Anglo Nubiano + 1⁄2 SRD, e 1⁄2; Kalahari + 1⁄2 SRD) sobre a qualidade química e os compostos aromáticos da carne. De cada grupo genético foram analisados músculos da perna de seis animais, machos inteiros, criados juntos com as mães a campo até os quatro meses de idade e a seguir, confinados por mais 60 a 65 dias, quando foram abatidos com peso vivo entre 18 e 28 kg. Nos músculos semimembranoso + semitendinoso + adutor determinou-se a composição centesimal e o perfil de ácidos graxos da gordura intramuscular. Nos músculos quadríceps avaliou-se os componentes aromáticos da carne caprina. Os resultados indicaram que o grupo genético não influenciou (P>0,05) a composição centesimal da carne caprina. Na fração lipídica foram identificados 18 ácidos graxos, sendo o ácido oléico (C18:1) o mais abundante em todos os grupos genéticos estudados, seguido dos ácidos palmítico (C16:0), esteárico (C18:0) e linoléico (C18:2). Entre os ácidos graxos identificados, os ácidos caprílico (C8:0), cáprico (C10:0), undecanóico (C11:0), isomerístico (C13:0), mirístico (C14:0), margárico (C17:0) e AGS, apresentaram diferença (P < 0,05) devido a grupo genético. O grupo genético 1⁄2 Kalahari + 1⁄2 SRD foi o que apresentou a razão ω6/ω3 mais próxima do limite recomendado (ω6/ω3 < 4). No perfil aromático da carne caprina foram identificados 51 substâncias voláteis, sendo quatorze aldeídos, dez álcoois, nove hidrocarbonetos, sete cetonas, cinco ésteres, dois furanos, dois aromáticos e dois terpenóides. O número de substâncias voláteis identificados diferiu em função dos grupos genéticos avaliados, sendo que, nas condições experimentais utilizadas, grupos genéticos envolvendo a raça Boer apresentaram um maior número de compostos, em especial de aldeídos, álcoois, hidrocarbonetos e cetonas, independente do teor de gordura da carne. / This study evaluated the influence of five genetic groups (1⁄2 Moxotó + 1⁄2 Boer; 1⁄2 Boer + 1⁄2 SRD; 1⁄2 Savannah + 1⁄2 SRD; 1⁄2 Anglo Nubiano + 1⁄2 SRD; and 1⁄2 Kalahari + 1⁄2 SRD) upon the chemical quality and aromatic compounds of goat meat. The animals were grown with their mothers until they were four- months old, under field conditions. Afterwards, they were subjected to feedlot for another 60 to 65 days, reaching a live weight of 18 to 28 kg. The leg muscles of 6 slaughtered animals of each genetic group were excised and the chemical composition and fatty acid profiles of the intramuscular fat were determined in the semimembranosus + semitendinosus + adductor muscles. The aromatic components of the goat meat were evaluated in the quadriceps muscles. Genetic group did not affect (P>0.05) the chemical composition of the goat meat. A total of 18 fatty acids (FA) were identified in the lipid fraction. Oleic acid (C18:1) was the most abundant FA in all genetic groups, followed the palmitic (C16:0), stearic (C18:0) and linoleic (C18:2) acids. Among the identified fatty acids, the caprilic (C8:0), capric (C10:0), undecanoic (C11:0), isomeristic (C13:0), myristic (C14:0), margaric (C17:0), as well as the saturated fatty acids (SFA), showed significant differences (P < 0.05) due to genetic group. The genetic group 1⁄2 Kalahari + 1⁄2 SRD was the one showing a π6/π3 ratio closest to the recommended limit (π6/π3 < 4). A total of 51 volatile substances were identified in the meat aromatic profile. Of them, fourteen were identified as aldehydes, ten as alcohols, nine as hydrocarbons, seven as cetones, five as esters, two as furans, two as aromatic compounds and two as terpenoids. The number and type of aromatic substances differed between the genetic groups. Under the experimental conditions the genetic groups carrying the Boer gene showed a higher number of compounds, specially aldehydes, alcohols, hydrocarbons and cetones, independent of the meat fat content. / Não foi localizado o cpf do autor.

O presente trabalho teve como objetivo geral caracterizar a variabilidade genética existente em um grupo de genótipos de arroz irrigado do banco de germoplasma disponível no programa de melhoramento do Instituto Rio Grandense do Arroz (IRGA) e como objetivos específicos identificar marcadores morfológicos que separem os dois grupos de arroz índica e japônica, avaliar a amplitude da base genética desse germoplasma e comparar o padrão de agrupamento obtido pelos marcadores morfológicos e moleculares.