O controle biológico de cigarrinha com Metarhizium (Hypocreales: Clavicipitaceae) na cana-de-açúcar é um exemplo de sucesso da aplicação do manejo sustentável de pragas no Brasil. No entanto, pouco se sabe sobre a riqueza, distribuição e ecologia das espécies de Metarhizium nos agroecossistemas e ambientes naturais no Brasil. Neste trabalho, avaliou-se a diversidade genotípica e realizou-se a identificação específica de 96 isolados depositados na Coleção de Entomopatógenos \"Prof. Sérgio Batista Alves\" da ESALQ-USP pelo sequenciamento da região 5\' do fator de alongamento da tradução 1 alfa (5\'-TEF) e das regiões espaçadoras intergênicas do DNA nuclear MzIGS3 e MzFG543igs. Observou-se a existência de 10, 11 e 17 haplótipos pelas sequências destes genes, respectivamente. Foram ainda obtidos 41 isolados de dois talhões de canavial em Araras-SP que consistiram em 9 haplótipos pela região MzIGS3. Foi observada a existência de cinco espécies de Metarhizium, duas atualmente reconhecidas, M. anisopliae s.l. e M. robertsii s.l., sendo estes os dois clados mais abundantes e três novas linhagens não caracterizadas taxonomicamente, referidas aqui como Metarhizium sp. indet. 1, Metarhizium sp. indet. 2 e Metarhizium sp. indet. 3. Com exceção de um único isolado todos os outros provenientes de insetos, incluindo os isolados de cigarrinha, pertencem a um único clado de M. anisopliae s.l. M. robertsii foi obtido exclusivamente a partir de amostras de solo ou rizosfera. Apesar de proporcionar um maior grau de resolução genética entre os isolados a região MzIGS3 se mostrou incapaz de reconstruir a filogenia consenso para o clado PARB, dificultando a sua utilização como sequência diagnóstica na identificação ou análise filogenética de espécies de Metarhizium. Além disso, foi desenvolvida uma técnica de bioensaio em laboratório para avaliação de patogenicidade de Metarhizium spp. sobre M. fimbriolata com mortalidade da testemunha inferior a 12%, após 28 dias de avaliação. A caracterização da expressão dos genes pr1A, mad1 e mpl relacionados à virulência de três isolados de M. anisopliae (ESALQ 1037, ESALQ 1641 e ESALQ 1204) cultivados em meio mínimo e meio mínimo com cutícula de M. fimbriolata, D. saccharalis e T. molitor não revelou uma associação entre a expressão relativa desses genes ea virulência dos fungos in vivo. As informações contidas neste trabalho poderão contribuir em estudos de identificação e caracterização de Metarhizium em habitats naturais e agrícolas de no Brasil e países vizinhos na América do Sul, assim como auxiliar no contínuo desenvolvimento e acompanhamento do programa de controle biológico de M. fimbriolata com Metarhizium na cultura da cana-de-açúcar. / Biological control of spittlebug with Metarhizium (Hypocreales: Clavicipitaceae) in sugarcane is an example of the successful application of sustainable pest management in Brazil. However little is known about the richness, distribution and ecology of Metarhizium species in agroecosystems and natural environments of Brazil. In this study, the genotypic diversity was accessed and species designation was assigned for 96 Metarhizium strains deposited in the Collection of Entomopathogens \"Prof. Sérgio Batista Alves\" from ESALQ-USP using the sequence variation at 5\'-TEF and the nuclear intergenic loci MzFG543igs and MzIGS3. Sequence diversity at these loci included 10, 11 and 17 sequence haplotypes, according to these loci, respectively. 41 strains were recovered from two sugarcane fields and consisted of 9 haplotypes according to MzIGS3. Five species of Metarhizium were observed, being the two most abundant taxa, Metarhizium anisopliae, Metarhizium robertsii and an additional three taxonomically unassigned lineages are referred to here as Metarhizium sp. indet. 1, Metarhizium sp. indet. 2 and Metarhizium sp. indet. 3. With a single exception, all strains isolated from insects belong to single clade of M. anisopliae, including the isolates infecting spittlebugs in sugarcane agroecosystems. M. robertsii was only recovered from soil or rhizosphere samples. Despite providing a greater degree of genetic resolution among strains, MzIGS3 revealed the inability to recapitulate the consensus phylogeny for the PARB clade and complicates its use as a stand-alone tool for species identification or phylogenetic analysis of Metarhizium. In addition, a laboratory bioassay technique was developed for pathogenicity screening of Metarhizium spp. on M. fimbriolata with low mortality on control group (8-12%) after 28 days of evaluation. The expression of genes pr1A, Mad1 and mpl of three M. anisopliae strains (ESALQ 1037, ESALQ1204 and ESALQ 1641) grown in minimal medium and minimal medium with M. fimbriolata, D. saccharalis or T. molitor cuticle apparently was not related to virulence of the fungi in vivo. Together these data will serve as resources for identification, discovery and communicating about Metarhizium biodiversity for insect biological control applications in Brazil and adjacent countries in South America, as well as assist in the ongoing development and monitoring of the biological control program of M. fimbriolata with Metarhizium in sugarcane fields.

A Mata Atlântica é considerada mundialmente um dos biomas prioritários para conservação, devido à elevada riqueza de sua biodiversidade. A preservação da vegetação natural deve estar associada à restauração florestal, de modo que se possa assegurar a continuidade desta rica biota. No Brasil, grande parte dos projetos de restauração florestal realizados até agora tem se preocupado apenas em buscar diversidade florística, contemplando uma baixa diversidade genética em sua implantação, o que têm criado muitos problemas relativos à viabilidade biológica de suas comunidades. O presente trabalho se propôs a realizar um estudo comparando a diversidade genética (utilizando marcadores SSR, cpSSR e AFLP) da espécie arbórea Piptadenia gonoacantha (Mart.) J. F. Macbr. em duas áreas em processo de restauração florestal e dois remanescentes naturais de floresta estacional semidecidual da Mata Atlântica do estado de São Paulo, Brasil. A partir da biblioteca genômica construída, foram obtidos 12 locos SSR. A heterozigosidade média esperada no equilíbrio de Hardy Weinberg (HE = 0,494) foi maior do que a heterozigosidade observada (HO = 0,251) em todas as populações, indicando taxa relativamente alta de endogamia (FIS = 0,342). Os resultados obtidos com os locos cpSSR mostraram, ao todo, 16 haplótipos, dos quais 10 foram encontrados nos remanescentes de floresta nativa e oito nas áreas restauradas. As análises realizadas com os marcadores AFLP resultaram em 303 marcas polimórficas. Uma estrutura genética muito forte foi encontrada relativa às quatro populações, valores de FST foram 0,283, 0,83 e 0,177 em SSR, cpSSR e AFLP, respectivamente. Dez locos de AFLP que podem estar sujeitos a seleção foram encontrados. As análises de agrupamento delimitam claramente as amostras das quarto populações, evidenciando que não existe fluxo gênico significativo entre elas. P. gonoacantha apresentou auto correlação espacial nas quatro populações. Os três tipos de marcadores detectaram maior diversidade genética nos remanescentes naturais do que nas áreas restauradas. Apesar da menor diversidade apresentada pelas áreas restauradas em comparação com as áreas de remanescentes florestais, o tamanho efetivo populacional estimado para essas áreas permite a manutenção da variabilidade existente a curto prazo. As informações obtidas poderão servir para o manejo sustentado desta espécie, bem como para o planejamento de sua conservação. / The Atlantic Forest is considered one of the world biomes for conservation priority due to the high richness of its biodiversity. The preservation of natural vegetation should be associated to forest restoration, so that the continuity of this rich biota can be ensured. Recent studies and practices of reforestation in degraded areas have taken population genetics as a great ally. Several of the forest restoration projects carried out in Brazil so far has been concerned just with floristic diversity, contemplating low genetic diversity. This fact has created many problems related to the biological viability of their communities. The present project proposes to carry out a study on the diversity genetic structure of the arboreal species Piptadenia gonoacantha (Mart.) J. F. Macbr. In this study, we used six chloroplast simple-sequence repeats (cpSSRs), AFLP markers and the construction of an enriched SSR DNA library to investigate the genetic diversity of P. gonoacantha. This species was evaluated in two areas that are under forest restoration process and compared then with two natural remnants of semideciduous seasonal Atlantic Forest. 12 SSR markers were obtained and the average HO=0.251 was smaller than the average HE=0.494, evidencing a heterozygote deficit (average FIS= 0.342). The samples shows a strong structure with a significant differentiation. FST values were 0.283, 0.83 and 0.177 for SSR, cpSSR and AFLP respectively. The cluster analyzes clearly demarcating the samples of the four populations. cpSSR markers showed 16 haplotypes, ten of them were found in the remaining native forest and eight in the restored areas. Ten AFLP outliers loci were found. The three types of markers detected a higher genetic diversity in natural remnant than in restored areas. Despite the lower diversity presented by the restored areas compared with areas of forest remaining, the effective population size estimated for these areas allows the maintenance of existing variability. The results of this study prove that there is greater genetic diversity in the remaining natural areas than in the areas undergoing a reforestation process. The information obtained may be used for the sustainable management of this species, as well as for conservation planning.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-06T14:16:17Z No. of bitstreams: 1 Adriana Guedes Magalhaes.pdf: 1298691 bytes, checksum: 3170ed2d5c5bb5cad1f2320c4bf432db (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-06T14:16:17Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Adriana Guedes Magalhaes.pdf: 1298691 bytes, checksum: 3170ed2d5c5bb5cad1f2320c4bf432db (MD5) Previous issue date: 2006-02-06 / Lettuce (Lactuca sativa L.) is the most cultivated vegetable in hydroponic system. This work aims to evaluate and characterize genotypes of lettuce grown under two levels of electric conductivity of nutrient solution, as well the genetic variability of these genotypes through the molecular markers of the type ISSR (Inter Simple Sequence Repeat. Four experiments were carried out using nutrient solutions with electric conductivity of 2.0 or 2.5 dS.m-1. Seeds were sown in phenolic foam plates and the seedlings were transferred for the nursling, on which they grew for 10 days receiving diluted nutrient solution. Then, they were transferred to polypropylene hydroponics channels measuring 50 mm of diameter on a growth bench for the initial growth. After 15 days the plants were transferred to others hydroponics channels measuring 75 mm of diameter on which they received the experimental treatments for more 15 days. Plant fresh weight, leaves fresh weight, root and stem fresh weight, stem length, number of leaves and tip-burning index were evaluated. Comparing the reaction of the cvs to the nutrient solutions with electric conductivity of 2.0 and 2.5 dS.m-1, the results showed that the tip-burning index for Babá de Verão and Forest was lesser for those grown on the nutrient solution of 2.0 than 2.5 dS.m-1. The total plant fresh weight and leaves fresh weight were greater for the plants grown on de nutrient solution with electric conductivity of 2.5 than 2.0 dS.m-1. The cvs Tinto, P-76 and P-78 presented higher tip-burning index on the nutrient solution of 2.5 dS.m-1, comparing to 2.0 dS.m-1. There was no significant difference on total plant fresh weight neither leaves fresh weight of the cvs Regina 2000, Tinto, P-44, P-85 and P-89, comparing the two nutrient solutions. For the study of the genetic variability thirty primers of ISSR were used. The data were interpreted with the aid of a matrix of genetic similarity after the construction of a dendrogram. Regarding all genotypes of lettuce studied, ten primers were amplified of a total of 134 fragments of DNA. The average of 13.4 fragments per primer was amplified and the size of fragments varied from 400 (UBC 842) to 2000 bp (UBC 808 and 857). The results showed that ISSR markers can be useful in the studies of genetic diversity of lettuce germplasm. / No sistema hidropônico, a alface (Lactuca sativa L.) é a hortaliça mais cultivada representando 80% da produção. Este trabalho teve como objetivo caracterizar e avaliar o comportamento de acessos de alface sob dois níveis de condutividade elétrica da solução nutritiva, bem como a variabilidade genética desses genótipos através de marcadores moleculares do tipo ISSR (Inter simple sequence repeat). Foram realizados quatro experimentos em dois níveis de condutividade elétrica da solução, 2,5 dS.m-1 e 2,0 dS.m-1. As sementes foram postas para germinar em placas de espuma fenólica e levadas, posteriormente, para a mesa de desenvolvimento, na qual receberam solução nutritiva durante 10 dias, quando foram transferidas para perfis de polipropileno com diâmetro de 50 mm, por mais 15 dias. Passado este período os tratamentos foram distribuídos no delineamento de blocos casualizados com repetições no tempo, em perfis de 75 mm de diâmetro, por mais 15 dias, totalizando o ciclo cultural de 45 dias. Avaliou-se o peso fresco das plantas inteiras, número de folhas, peso das folhas, índice de queima das bordas, comprimento do caule e peso do caule e raiz. Comparando a reação das cultivares, às soluções nutritivas com condutividade elétrica de 2,5 dS.m-1 e 2,0 dS.m-1, observou-se que o índice de queima das bordas das cvs. Babá de Verão e Floresta apresentou diferença, com menor percentual de queima na condutividade elétrica de 2,0 dS.m-1. Com relação ao peso fresco da planta inteira e peso das folhas frescas, as cultivares apresentaram diferenças significativas nas duas variáveis, obtendo os maiores pesos as alfaces cultivadas em solução nutritiva com condutividade elétrica de 2,5 dS.m-1. Comparando-se a reação dos acessos na condutividade elétrica de 2,5 dS.m-1 e 2,0 dS.m-1, observa-se que Tinto, P-76 e P-78 apresentaram alto índice de queima das bordas com a solução de 2,5 dS.m-1. Para o peso fresco da planta inteira e peso das folhas frescas, Regina 2000, Tinto, P-44, P-85 e P-89 não apresentaram diferenças significativas em relação aos dois níveis de condutividade. Para o estudo da variabilidade genética, foram utilizados trinta primers de ISSR. Os dados obtidos foram interpretados com o auxílio de uma matriz de similaridade genética e pela construção de um dendrograma. Destes, dez primers amplificaram um total de 134 fragmentos de DNA nos acessos de alface estudados. A média de fragmentos amplificados por primer foi de 13,4 e o tamanho desses fragmentos variou de 400 (UBC 842) a 2000 pb (UBC 808 e 857). Os resultados indicam que marcadores ISSR podem ser úteis em estudos de diversidade genética em germoplasma de alface.

Submitted by (ana.araujo@ufrpe.br) on 2017-02-06T17:08:37Z No. of bitstreams: 1 Claudio Jose Dias Silva.pdf: 605492 bytes, checksum: c6b8e3cb1d0e465cdaab2051b9d3ea34 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-06T17:08:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Claudio Jose Dias Silva.pdf: 605492 bytes, checksum: c6b8e3cb1d0e465cdaab2051b9d3ea34 (MD5) Previous issue date: 2009-07-31 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The cajazeira (Spondias mombin L.) is distinguished by producing fruit of excellent taste and nutritional properties. Nevertheless, there are no commercial crops and places of occurrences of occurrence are suffering in deletions due to human action. This study aimed to evaluate the genetic diversity among plants Cajazeiras Bank of germplasm of the IPA by ISSR markers. The experiment was conducted at the Laboratório de Plant Biotecnologia Vegetal, Department of Agronomy, of the Federal Rural University of Pernambuco (UFRPE), in Recife-PE, with latitude of 8 10'52''S and longitude 34 ° 54'47'' W, from July 2007 to May 2009. Tender leaves were collected from twelve plants (Charuto, Djalma, Vianey-1, Vianey-2, Vianey-3, EAN-1, EAN-2, Casa Grande, Muribeca, IEE (Estação Experimental de Itapirema), Dr. Moacir e Limão) from Germplasm Bank of the Cajazeiras at the Experimental Station of the Agronomic Institute of Itambé Pernambuco (IPA) (7 ° 24'50 "S and 35 º 06'30" W) in the Municipality of Itambé, Pernambuco, Brazil. Genomic DNA was obtained according to the methodology proposed by Ferreira and Grattapaglia (1998), with modifications.For the amplification of DNA, 18 primers were used (2 UBC, UBC 808, UBC 810, UBC 812, UBC 813, UBC 820, UBC 827, UBC 834, UBC 849, UBC 855, UBC 860, UBC 866, UBC 868, UBC 881, UBC 884, UBC 885, UBC 887, UBC 888 and UBC 891). These amplifications generated 135 fragments, of which 105 polymorphic, ranging from 20 to 620pb. The UBC 834 was more informative, allowing the differentiation between the 12 accessions. The primers that prevails in the sequence of bases GA (2 UBC, UBC 810, UBC 812 and UBC 885) the highest number of amplified fragments and polymorphic fragments. In the construction of the dendrogram was the formation of four distinct groups, from an average similarity of 51.69%. Access Dr. Moacir, comes from Manaus-AM, was isolated from the other accessions, presenting a similarity of 27.45% with access EAN-1, the lowest found among the 12 accessions. Already between 1 and Vianey Vianey 2 there was a greater similarity among all accessions (73.21%). With these data we can see the viability of the use of ISSR markers to study genetic diversity in germplasm of Cajazeiras and high geneticdiversity among accessions of the bank. / A cajazeira (S. mombin L.) destaca-se por produzir frutos de excelente sabor e propriedades nutricionais. Apesar disso, não existem cultivos comerciais e as áreas de ocorrência vêm sofrendo constantes supressões devido à ação antrópica. Este trabalho objetivou avaliar a diversidade genética entre plantas de cajazeiras do banco de germoplasma do IPA, por meio de marcadores ISSR. O experimento foi conduzido no Laboratório de Biotecnologia Vegetal do Departamento de Agronomia, Área de Fitotecnia, da Universidade Federal Rural de Pernambuco (UFRPE), em Recife-PE, com latitude de 8º10’52’’S e longitude de 34º54’47’’W, no período de julho de 2007 a maio de 2009. Foram coletadas folhas tenras de doze plantas (Charuto, Djalma, Vianey-1, Vianey-2, Vianey-3, EAN-1, EAN-2, Casa Grande, Muribeca, IEE (Estação Experimental de Itapirema), Dr. Moacir e Limão) do Banco de Germoplasma de Cajazeiras instalado na Estação Experimental de Itambé do Instituto Agronômico de Pernambuco (IPA) (7º24’50”S e 35º06’30”W), no Município de Itambé, Pernambuco, Brasil. O DNA genômico foi obtido de acordo com a metodologia proposta por Ferreira e Grattapaglia (1998), com modificações. Para aamplificação do DNA, foram Utilizados 18 oligonucleotídeos (UBC 2, UBC 808, UBC 810, UBC 812, UBC 813, UBC 820, UBC 827, UBC 834, UBC 849, UBC 855, UBC 860, UBC 866, UBC 868, UBC 881, UBC 884, UBC 885, UBC 887, UBC 888 e UBC 891). Estas amplificações geraram 135 fragmentos, dos quais 105 polimórficos, variando de 20 a 620 pb. O UBC 834 mostrou-se mais informativo, possibilitando a diferenciação entre os 12 acessos. Os oligonucleotídeos em que prevalece a seqüência de bases GA (UBC 2, UBC 810, UBC 812 e UBC 885) amplificaram o maior número de fragmentos e de fragmentos polimórficos. Na construção do dendrograma houve a formação de quatro grandes grupos distintos, a partir de uma similaridade média de 51,69%. O acesso Dr. Moacir, oriundo de Manaus-AM, foi isolado dos demais acessos, apresentando uma similaridade de 27,45% com o acesso EAN-1, a menor encontrada entre os 12 acessos. Já entre Vianey 1 e Vianey 2 foi verificada a maior similaridade entre todos os acessos (73,21%). Com estes dados pode-se constatar a viabilidade do emprego de marcadores ISSR no estudo de diversidade genética em germoplasma de cajazeiras e a grande diversidade genética existente entre os acessos do banco.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:31:03Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-06-14Bitstream added on 2014-06-13T18:41:34Z : No. of bitstreams: 1 venancio_lpr_dr_sjrp.pdf: 3677720 bytes, checksum: caf55a272febb09ea1321e58569d7009 (MD5) / O objetivo deste estudo foi avaliar o papel da influência da atividade humana, como a contaminação ambiental e modificações do hábitat, como direcionadores de mudanças fisiológicas, bioquímicas e de diversidade genética entre populações de cágado-de-barbelas em uma das bacias hidrográficas mais impactadas do sudeste brasileiro. A fim de analisar o impacto da contaminação química e orgânica na espécie de estudo, foram realizadas análises ecotoxicológicas visando avaliar a ação de alguns dos principais componentes envolvidos com a proteção ao estresse oxidativo e metabolismo de detoxificação de fase I e II, e capacidade antioxidante. Os resultados indicam a influência de efluentes domésticos e industriais no metabolismo de detoxificação e estresse oxidativo. No entanto, apesar do aumento da atividade EROD e o efeito da atividade da GST, os valores médios de GST na área urbana estão dentro daqueles esperados em condição de hipóxia descritos na literatura. Esta observação sugere que o aumento da GST em resposta à produção de ERO pela presença de poluentes, aumenta a rede de defesa antioxidante, controlando os danos oxidativos causados pela hipóxia e pela reperfusão. Com o intuito de estimar a condição, que reflete a aptidão (fitness) individual do animal, foi avaliada a relação matemática entre peso e comprimento, que indicam alterações na forma do corpo e no incremento em peso, que permitem inferências sobre a saúde e o bem-estar animal. Os dados gerados informam diferenças em condição que estão associadas à área de avaliação, mas também ao sexo e período reprodutivo, e gradiente de contaminação indicando forte influência de estressores ambientais na fisiologia dos espécimes analisados. A partir da avaliação da estrutura genética entre populações do rio Preto e do córrego... / The objective of this study was to evaluate the role of human activity influence, such as environmental contamination and habitat changes as drivers for changing physiological, biochemical, and genetic diversity among Geoffroy’s side-necked turtle populations in one of the most impacted watersheds in southeastern Brazil. In order to analyze the impact of chemical and organic contamination, ecotoxicological analyses were performed to assess the action of some of the major components involved in oxidative stress protection and phase I and II of metabolism detoxification, and antioxidant capacity. The results indicate the influence of domestic and industrial effluents in detoxification metabolism and oxidative stress. However, in spite of increased activity and effect of EROD activity of GST, GST-average values in the urban area conform with those expected in hypoxia condition in the literature. This observation suggests that increased GST in response to the ROS production by the presence of pollutants increases the antioxidant defense network, controlling the oxidative damage caused by hypoxia and reperfusion. In order to estimate the condition, which reflects the individual ability (fitness), we evaluated the mathematical relationship between weight and length, indicating that changes in body shape and weight increase, allowing inferences about the health and well animal welfare. The data generated indicate differences in conditions that are associated with the area, but also with sex and reproductive period, and contamination gradient indicating strong influence of environmental stressors on the physiology of the specimens. From the evaluation of genetic structure among populations of the Preto River and Felicidade Stream, based on microsatellites, we found that there is no genetic differentiation, due to... (Complete abstract click electronic access below)

Submitted by ELISA PERIPOLLI null (elisa_peripolli@hotmail.com) on 2017-03-13T10:53:09Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Elisa_Peripolli.pdf: 1486638 bytes, checksum: 15fbc97f7599f86e3e8dcccabf250bab (MD5) / Approved for entry into archive by LUIZA DE MENEZES ROMANETTO (luizamenezes@reitoria.unesp.br) on 2017-03-20T13:45:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 peripolli_e_me_jabo.pdf: 1486638 bytes, checksum: 15fbc97f7599f86e3e8dcccabf250bab (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-20T13:45:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 peripolli_e_me_jabo.pdf: 1486638 bytes, checksum: 15fbc97f7599f86e3e8dcccabf250bab (MD5) Previous issue date: 2017-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / As corridas de homozigose, do inglês “Runs of homozygosity” (ROH), são segmentos homozigóticos contínuos que estão presentes em indivíduos e populações. A habilidade desses segmentos em elucidar sobre eventos genéticos populacionais torna-os uma ferramenta capaz de prover informações valiosas a respeito da evolução demográfica de uma população ao longo do tempo. Além disso, informações amplas do genoma fornecem subsídios relevantes para compreender a constituição genética de um animal por meio da caracterização dos ROH, constituindo uma metodologia acurada para manter a diversidade genética em diversas populações animais. O objetivo deste estudo foi (i) acessar a autozigosidade do genoma de bovinos da raça Gir Leiteiro a fim de caracterizar os padrões de ROH; (ii) prospectar genes em ROH compartilhados por mais de 50% da população, e por fim (iii) comparar as estimativas de endogamia calculadas a partir da proporção genômica em homozigose (FROH), da matriz genômica de parentesco G (FGRM) e do pedigree tradicional (FPED). Animais da raça Gir Leiteiro foram genotipados com o BovineHD BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA) que contêm 777.962 SNPs (n=582), BovineSNP50 BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA) contendo 54.609 SNPs (n=1664) e GGP-LD Indicus (Geneseek® Genomic Profiler Indicus 30K) que contêm 27.533 SNPs (n=662). Todos os genótipos foram imputados para o painel BovineHD BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA). SNPs sem posição definida ou mapeados nos cromossomos sexuais foram removidos do conjunto de dados. Após a edição, 2908 animais e 735,236 SNPs foram mantidos para as análises. Os ROH foram identificados por meio do software PLINK v1.07 considerando os seguintes parâmetros: uma janela deslizante de 50 SNPs, o número mínimo de SNPs consecutivos incluídos em um ROH foi 100, o comprimento mínimo de um ROH foi ajustado para 1 Mb, o intervalo máximo entre SNPs homozigóticos consecutivos foi de 500 kb, uma densidade de 1 SNP por 50 kb, cinco SNPs com genótipos faltantes e um genótipo heterozigoto. O FPED foi estimado por meio do software INBUPGF90. Para cada animal foi calculado um FROH (FROH1-2 Mb, FROH2-4 Mb, FROH4-8 Mb, FROH8-16 Mb e FROH>16 Mb) com base na distribuição de ROH a partir de cinco comprimentos (ROHj): 1-2, 2-4, 4-8, 8-16 e > 16 Mb, respectivamente. O FGRM foi calculado a partir da diagonal da matriz de relação genômica (G). Os ROH foram identificados em todos os animais, apresentando um número médio de 55,12±10,37 segmentos por animal e um comprimento médio de 3,17 Mb. Segmentos curtos (ROH1-2 Mb) foram abundantes nos genomas, representando cerca de 60% de todos os segmentos identificados, no entanto, cobriram apenas uma pequena proporção do genoma. Nossos resultados demonstraram que em média 7,01% (175,28 Mb) do genoma dessa população é autozigótico. As estimativas de FPED variaram de 0,000 a 0,327 e as de FROH de 0,001 a 0,201. Correlações baixas a moderadas foram observadas entre as estimativas de FPED-FROH e FGRM-FROH, com valores entre -0,16 e 0,59. As correlações entre FROH de diferentes comprimentos e FPED aumentaram com comprimento dos ROH. ROH compartilhados por mais de 50% das amostras foram classificados como ilhas de ROH. Quatorze ilhas de ROH foram identificadas e diversos genes contidos nessas ilhas foram associados com o teor de gordura do leite (DGAT1, CYP11B, EEF1D, INSIG2 e STAT1), involução da glândula mamária (IGFBP7), lactação (CHR e TRAPPC9) e adaptação ao calor (HSF1). Nossos resultados sugerem que (i) as baixas correlações (r<0.44) entre FPED-FROH para segmentos pequenos indicam que o FPED não é adequado para capturar eventos remotos de endogamia. As correlações moderadas (r>0.44) entre segmentos grandes indica que os níveis de autozigosidade derivados dos ROH podem ser utilizados como uma estimativa acurada dos níveis de endogamia; e (ii) ROH podem ser utilizados para identificar regiões genômicas sob seleção, uma vez que várias regiões compartilhadas estavam associadas com características de leite e adaptação. / Runs of homozygosity (ROH) are continuous homozygous segments that are common in individuals and populations. The ability of these segments to give insight into a population's genetic events makes them a useful tool to provide information about the demographic evolution of a population over time. Additionally, genome-wide information provides valuable information to comprehend the animal’s genome based on ROH, being and accurate tool to maintain diversity and fitness in livestock populations. The aim of this study was (i) to access genome-wide autozygosity to identify and characterize ROH patterns in Gyr dairy cattle genome; (ii) identify ROH islands for gene content and enrichment in segments shared by more than 50% of the samples, and (iii) compare estimates of molecular inbreeding calculated from ROH (FROH), GRM approach (FGRM), and from pedigree-based coefficient (FPED). Gyr dairy animals were genotyped with the BovineHD BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA), that contains 777,962 bialleleic SNPs markers (n=582); the BovineSNP50 BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA), containing 54,609 SNPs (n=1664); and with the GGP-LD Indicus (Geneseek® Genomic Profiler Indicus 30K), that contains 27,533 bialleleic SNPs markers (n=662). All genotypes were imputed to the BovineHD BeadChip (Illumina Inc., San Diego, CA, USA). SNPs unsigned to any chromosome and mapped to sexual chromosomes were removed from the dataset. After editing, 2908 animals and 735,236 SNPs were retained for the analyses. ROH were identified using PLINK v1.07 considering the following parameters: a sliding window of 50 SNPs, the minimum number of consecutive SNPs included in a ROH was 100, the minimum length of a ROH was set to 1 Mb, the maximum gap between consecutive homozygous SNPs was 500 kb, a density of 1 SNP per 50 kb, and a maximum of five SNPs with missing genotypes and up to one heterozygous genotype were allowed in a ROH. FPED was estimated through the software INBUPGF90. For each animal FROH (FROH1-2 Mb, FROH2-4 Mb, FROH4-8 Mb, FROH8-16 Mb, and FROH>16 Mb) was calculated based on ROH distribution of five minimum different lengths (ROHj): 1-2, 2-4, 4-8, 8-16, and >16 Mb, respectively. FGRM was calculated from the diagonal of the genomic relationship matrix (G). ROH were identified in all animals, with an average number of 55.12±10.37 segments and a mean length of 3.17 Mb. Short segments (ROH1-2 Mb) were abundant through the genomes, accounting for 60% of all segments identified, however, they just covered a small proportion of the genome. Our results suggest that on average 7.01% (175.28Mb) of the genome of this population is autozygous. FPED estimates ranged from 0.000 to 0.327 and FROH from 0.001 to 0.201. Low to moderate correlations were observed between FPED-FROH and FGRM-FROH, with values ranging from -0.16 to 0.59. Correlations between FROH from different lengths and FPED increased with ROH length. ROH shared by more than 50% of the samples were chosen as an indication of a possible ROH islands throughout the genome, and 14 regions were identified. Several genes inside those ROH islands were associated with milk fat content (DGAT1, CYP11B, EEF1D, INSIG2, and STAT1), mammary gland involution (IGFBP7), lactation (CHR and TRAPPC9), and heat adaptation (HSF1). Our results suggest that (i) low correlations (r<0.44) between FPED-FROH for small segments indicate that FPED estimates are not the most suitable method to capture ancient inbreeding. Moderate correlations (r>0.44) between larger ROH indicate that the levels of autozygosity derived from ROH can be used as an accurate estimator of individual inbreeding levels, and (ii) ROH might be used to identify genomic regions under selection as several overlapping regions were associated with dairy and adaptive traits.

Submitted by Celso Magalhaes (celsomagalhaes@ufrrj.br) on 2017-05-17T15:27:59Z No. of bitstreams: 1 2015 - Daniel Zimmermann Mesquita.pdf: 1282998 bytes, checksum: 279462a122004962e8bfed1dd4735013 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-17T15:27:59Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2015 - Daniel Zimmermann Mesquita.pdf: 1282998 bytes, checksum: 279462a122004962e8bfed1dd4735013 (MD5) Previous issue date: 2015-07-09 / The search for renewable energy sources such as biodiesel and ethanol, is a growing trend in Brazil and in the world due to lower environmental impacts. Among the plant species available to search, highlight the physic nut (Jatropha curcas L.), that it is a perennial species, deciduous and with great potential for biodiesel production due to their production characteristics and quality of oil . However, to date there is no available cultivars for planting, so the need for basic and applied research. Therefore, it is important to know the behavior of genotypes and several variables estimated in the culture, among these quotes to the related plant architecture. The objective of this study was a detailed study of the characteristics related to plant architecture, in order to know the diversity within and among 10 families of jatropha half brothers belonging to the Germplasm Collection UFRRJ through digital analysis images. The treatments (families) were arranged in a randomized design, with 15 replications (plants). Made to capture images, in the same measuring scale at the time the plants were in his deciduous period and subsequently through ImageJ software, the images were processed. It estimated the following variables related to plant architecture: plant height (ALT), stem diameter (DBC), crown diameter (DCO), number of branches to 50 cm (NR50), opening angle Canopy (AAB), the total number of forks in the plant (NBI), the average height of the forks (MAB), number of branches above (NRAcmab) and below (NRAbmab) of MAB, the sum length of the branches (SCR), area of the plant (APL). It was estimated also in the field, the number of fruits (NFR) and seeds (NSE), average seed weight (PMS) and grain yield per plant (PGP), and these were used only in correlation analysis with variables related to plant architecture. From these data were carried out analysis of variance, correlation, estimation of genetic parameters and analysis of diversity. Only the variable number of branches to 50 cm (NR50) was not statistically different between the evaluated progenies. ALT variables, DCO, NBI, NRAcmab, NRAbmab, SCR and APL had greater genetic influence at the expense of environmental, justifying the selection of these characteristics. The grain yield per plant (PGP) had low correlation with all variables, with SCR and NRAcmab showed the highest values respectively 0.24 and 0.20. The genetic diversity was estimated between families median ranging between 0.4 and 0.6. The diversity within families was medium to low with estimates families with more than 0.6 and less than 0.4, respectively, to the families 858, 355 and 869, and 346, 383 and 872. The number of bifurcations (NBI ), the flat area of the plant (APL) and the sum of the length of the branches (SCR) were the most important features in the estimation of diversity in this study, with the contribution of respectively 30.55%, 22.29% and 10, 65%. The family 872 showed favorable aspects related to plant architecture, such as the high average number of bifurcations (NBI) and, in general, the greatest genetic distance between the other families. Therefore, prior assessment for evidence of productive potential, family genotypes 872 may be involved in crosses when you want to explore heterosis culture. / A pesquisa por fontes renov?veis de energia, como o biodiesel e o etanol, ? uma tend?ncia crescente no Brasil e no mundo devido aos menores impactos ambientais causados. Dentre as esp?cies vegetais dispon?veis para pesquisa, destaca-se o pinh?o-manso (Jatropha curcas L.), que se trata de uma esp?cie perene, caducif?lia e com grande potencial para produ??o de biodiesel, devido a suas caracter?sticas de produ??o e qualidade de ?leo. Por?m, at? o momento n?o h? cultivares dispon?veis para o plantio, por isso a necessidade de pesquisa b?sica e aplicada. Neste sentido, ? importante conhecer o comportamento de gen?tipos e de diversas vari?veis estimadas na cultura, dentre estas cita-se ?s relacionadas a arquitetura de planta. Assim, o objetivo deste trabalho foi realizar um estudo detalhado das caracter?sticas referentes ? arquitetura de plantas, visando conhecer a diversidade entre e dentro de 10 fam?lias de meios-irm?os de pinh?o-manso pertencentes ? Cole??o de Germoplasmas da UFRRJ, atrav?s da an?lise digital de imagens. Os tratamentos (fam?lias) foram dispostos em delineamento inteiramente casualizado, com 15 repeti??es (plantas). Efetuou-se a captura das imagens, na mesma escala m?trica, no momento em que as plantas encontravam-se em seu per?odo caducif?lio, e posteriormente, atrav?s do Programa ImageJ, as imagens foram processadas. Estimou-se as seguintes vari?veis relacionadas a arquitetura de planta: altura das plantas (ALT), di?metro do caule (DBC), di?metro de copa (DCO), , n?mero de ramos aos 50 cm de altura (NR50), ?ngulo de abertura do dossel (AAB), n?mero de bifurca??es totais na planta (NBI), m?dia da altura das bifurca??es (MAB), n?mero de ramos acima (NRAcmab) e abaixo (NRAbmab) de MAB, somat?rio do comprimento dos ramos (SCR) e ?rea plana da planta (APL). Estimou-se tamb?m, no campo, o n?mero de frutos (NFR) e sementes (NSE), peso m?dio de sementes (PMS) e produ??o de gr?os por planta (PGP), sendo que estas foram utilizadas apenas nas an?lises de correla??o com as vari?veis referentes ? arquitetura de planta. A partir destes dados realizaram-se an?lises de vari?ncia, correla??es, estima??o de par?metros gen?ticos e an?lises da diversidade. Apenas a vari?vel n?mero de ramos a 50 cm (NR50) n?o foi estatisticamente diferente entre as prog?nies avaliadas. As vari?veis ALT, DCO, NBI, NRAcmab, NRAbmab, SCR e APL apresentaram maior influ?ncia gen?tica em detrimento da ambiental, o que justifica a sele??o nestas caracter?sticas. A produ??o de gr?os por planta (PGP) teve baixa correla??o com todas as vari?veis analisadas, sendo que SCR e NRAcmab apresentaram os maiores valores, respectivamente de 0,24 e 0,20. A diversidade gen?tica estimada entre fam?lias foi mediana, variando entre 0,4 e 0,6. A diversidade dentro de fam?lias foi mediana a baixa, havendo fam?lias com estimativas superiores a 0,6 e inferiores a 0,4, respectivamente, para as fam?lias 858, 355 e 869, e 346, 383 e 872. O n?mero de bifurca??es (NBI), a ?rea plana da planta (APL) e o somat?rio do comprimento dos ramos (SCR) foram as caracter?sticas mais importantes na estima??o da diversidade no presente trabalho, com a contribui??o de respectivamente 30,55%, 22,29% e 10,65%. A fam?lia 872 apresentou aspectos favor?veis relacionados ? arquitetura de plantas, como m?dia alta no n?mero de bifurca??es (NBI), bem como, de forma geral, a maior dist?ncia gen?tica entre as demais fam?lias. Portanto, mediante avalia??o pr?via para comprova??o do potencial produtivo, gen?tipos da fam?lia 872 poder?o ser envolvidos em cruzamentos quando se pretende explorar a heterose na cultura.

Submitted by Verena Bastos (verena@uefs.br) on 2015-08-04T00:07:37Z No. of bitstreams: 1 dissertacao.RGV.2015.1.pdf: 1835460 bytes, checksum: 8d5b6650247801f1f7f07285b2eedfe0 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-08-04T00:07:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao.RGV.2015.1.pdf: 1835460 bytes, checksum: 8d5b6650247801f1f7f07285b2eedfe0 (MD5) Previous issue date: 2015-02-27 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / Searches related to evaluation and selection of native forages can contribute to improvement in feeding cattle in the Brazilian semiarid region, highlighting the Stylosanthes gender as an important source of forage species with great potential. This study aimed to perform morphoagronomic and cytogenetics Stylosanthes accessions, to contribute to studies that promote the inclusion of this legume in animal feed, seeking to characterize and select superior genotypes, and also select important in the characterization of germplasm of the species. To characterize morphoagronomic were evaluated 19 descriptors and of these, four were immediately discarded for not having variability among accessions, with the statistical analysis performed in the remaining 15 descriptors. The data were submitted to univariate and multivariate analyzes. Analysis of variance was performed only in quantitative descriptors NRP, CHP, Lfo, Cfo, ECAA, ECAS and CP, as to the qualitative descriptors CC, AC, PC, HC, CF, AF, PF and FF, descriptive analysis was performed. For cytogenetic characterization were obtained root tips used seed access Stylosantes 17, following the method described by War and Souza (2002). Scott and Knott test was performed for the grouping of averages, the descriptors were significant at (p ? 0.01) which allowed the formation of two groups, multivariate analysis was also performed by calculating the Mahalanobis distance using the method original Tocher, there is the formation of two groups. Group 1 consisted of 42 accesses and the group 2 only through access CPAC 4955. We observed the formation of four groups where the dendrogram also be noted that only the access CPAC 4955 did not group with any other access. This access, for long leaves that too, very thick stem and lack of body hair on the sheets. The descriptors evaluated by Singh test is observed that the main contributors to the diversity of genotypes were CP (11,64%) and NRP (10,98%) followed by HC (8,62%) and FF (8, 44%). By cytogenetic analysis were observed hits with 2n = 20 and 2n = 40 chromosomes, allowing differentiation of species S. scabra of S. seabrana with interphase nucleus of semirreticulado type, symmetrical karyotype with chromosome morphology ranging from the metacentric submetac?ntrica and size Average chromosomal around 2,5 microns. Differences were observed in the average length of the chromosomes and the total length of the genome. The analysis with double staining CMA3/DAPI enabled visualization of four CMA+ blocks, two CMA + blocks in subterminal region of the short arm of a chromosome pair submetacentric, and two blocks located in the proximal region of another metacentric pair in S. scabra, and still two blocks in the subterminal region of a metacentric pair in S. seabrana access. It was also possible to visualize DAPI and CMA+ bands in access CPAC 1261 and CPAC 5205. The accessions in this study were, in general, plants with semiereto growth habit, leaves with dark green color and hairiness, stem mostly quite branched. The differential staining of chromosomes, together with other cytogenetic markers, assists in characterizing germplasm collections access Stylosanthes spp. It was observed that there is genetic variability among the accessions studied the collection of Stylosanthes Embrapa Semi-Arid. / Pesquisas relacionadas a avalia??o e sele??o de forrageiras nativas podem contribuir para melhoria na alimenta??o dos rebanhos do Semi?rido brasileiro, destacando-se o g?nero Stylosanthes como uma importante fonte de esp?cies com grande potencial forrageiro. O presente trabalho teve por objetivo realizar caracteriza??o morfoagron?mica e citogen?tica de acessos de Stylosanthes, visando contribuir com estudos que promovam a inser??o desta leguminosa na alimenta??o animal, buscando caracterizar e selecionar gen?tipos superiores, e tamb?m selecionar descritores de import?ncia na caracteriza??o de germoplasma da esp?cie. Para caracteriza??o morfoagron?mica, foram avaliados 19 descritores e destes, quatro foram descartados imediatamente por n?o apresentarem variabilidade entre os acessos, sendo a an?lise estat?stica realizada nos 15 descritores restantes.Os dados foram submetidos ? an?lisesunivariadas e multivariadas. Foi realizada a an?lise de vari?ncia apenas nos descritores quantitativos NRP, CHP, Lfo, Cfo, ECAA, ECAS e CP, j? para os descritores qualitativos CC, AC, PC, HC, CF, AF, PF e FF, foi realizada analise descritiva. Para a caracteriza??o citogen?tica foram utilizadas pontas de ra?zes obtidas de sementes de 17 acessos de Stylosanthes, seguindo a metodologia descrita por Guerra e Souza (2002). O teste de Scott e Knott foi realizado para o agrupamento de m?dias, os descritores foram significativos a (p ? 0,01) o que possibilitou a forma??o de dois grupos, tamb?m foi realizada analise multivariadas pelo c?lculo da dist?ncia de Mahalanobis,utilizando o m?todo de Tocheroriginal,observa-se a forma??o de dois grupos.O grupo 1foi formado por 42 acessos e o grupo 2 apenas pelo acesso CPAC 4955. Observou-se a forma??o de quatro grupos onde no dendogramaobservar-se tamb?m que apenas o acesso CPAC 4955n?o agrupou com nenhum outro acesso.Este acesso apresentou folhas mais compridas que os demais, caule muito espesso e falta de pilosidade nas folhas. Dos descritores avaliados pelo teste de Singh observa-se que os que mais contribu?ram para a diversidade dos gen?tipos foram CP (11,64%) e NRP (10,98%) seguidos por HC (8,62%) e FF (8,44%). Atrav?s da an?lise citogen?tica observaram-se acessos com 2n=20 e 2n=40 cromossomos, permitindo a diferencia??o das esp?cies S. scabra da S. seabrana, com n?cleo interf?sico do tipo semirreticulado, cari?tipo sim?trico com morfologia cromoss?mica variando de metac?ntrica a submetac?ntrica e tamanho cromoss?mico m?dio em torno de 2,5 ?m.Foram observadas diferen?as no comprimento m?dio dos cromossomos e no comprimento total do genoma. A an?lise com dupla colora??o CMA3/DAPI permitiu a visualiza??o de quatro blocos CMA+, sendo dois blocos CMA+ localizados na regi?o subterminal do bra?o curto de um par cromoss?mico submetac?ntrico, e dois blocos localizados na regi?o proximal de outro par metac?ntrico em S. scabra, e ainda dois blocos na regi?o subterminal de um par metac?ntrico nos acessos de S. seabrana.Tamb?m foi poss?vel a visualiza??o de bandas DAPI+ e CMA- nos acessos CPAC 1261 e CPAC 5205.Os acessos avaliados neste estudo apresentaram,em geral,plantas com h?bito de crescimento semiereto, folhas com colora??o verde escura e com pilosidade, caule em sua maioria bastante ramificado. A colora??o diferencial de cromossomos, associados a outros marcadores citogen?ticos, auxilia na caracteriza??o de acessos de cole??es de germoplasma de Stylosanthes spp.Observou-se que h? variabilidade gen?tica entre os acessos estudados da cole??o de Stylosanthes da Embrapa Semi?rido.

<p>Poznavanje genetičke divergentnosti predstavlja osnovni preduslov uspe&scaron;nog oplemenjivačkog programa. Pored poznavanja genetičke divergentnosti, u proizvodnji hibrida &scaron;ećerne repe je od izuzetne važnosti i poznavanje kombinacionih sposobnosti oplemenjivačkog materijala. Svako ukr&scaron;tanje inbred linija nema uvek za posledicu pojavu heterozisa, pa je stoga neophodno ispitati op&scaron;te i posebne kombinacione sposobnosti onih linija koje se planiraju koristiti kao roditeljske komponente hibrida. U ovom istraživanju ispitivane su kombinacione sposobnosti multigermnih opra&scaron;ivača, razvijenih u okviru četiri različita oplemenjivačka programa: programa oplemenjivanja &scaron;ećerne repe Instituta za ratarstvo i povrtarstvo, Novi Sad, i tri programa oplemenjivanja &scaron;ećerne repe istraživačkih stanica Ministarstva poljoprivrede SAD (Michigan, Salinas i Fort Collins). Opra&scaron;ivači su se razlikovali u stepenu homozigotnosti u zavisnosti od prisustva gena autofertilnosti, odnosno autosterilnosti. Kao testeri kori&scaron;ćene su dve citoplazmatski sterilne linije Instituta za ratarstvo i povrtarstvo, Novi Sad. Pored određivanja genetičke divergentnosti i kombinacionih sposobnosti cilj ovog istraživanja je bio utvrđivanje vrednosti kvantitativnih svojstava za najvažnija svojstva korena: masu korena, sadržaj &scaron;ećera, sadržaj suve materije, masu glave korena, obim korena, procenat iskori&scaron;ćenja, prinos kristalnog &scaron;ećera i na osnovu njih određivanje genetičke divergentnosti ispitivanih opra&scaron;ivača. Takođe na osnovu dobijenih vrednosti određen je efekat gena i način nasleđivanja za ispitivana kvantitativna svojstva.Opra&scaron;ivač FC220 se izdvojio kao potencijalno stabilan kombinator u<br />iii<br />obe godine istraživanja, beležeći pozitivne vrednosti op&scaron;tih kombinacionih sposobnosti za sva ispitivana svojstva. Sa druge strane opra&scaron;ivač EL53 je u obe godine istraživanja beležio negativne vrednosti op&scaron;tih kombinacionih sposobnosti za sva ispitivana svojstva. U pogledu načina nasleđivanja mase korena, obima korena i prinosa kristalnog &scaron;ećera superiornost su pokazali autofertilni polinatori u odnosu na populacije slobodne oplodnje. Veći stepen homozigotnosti i uniformnost F1 generacije doveli su do ispoljavanja efekta heterozisa kod hibridnih kombinacija gde su roditelji bili autofertilni polinatori. Na osnovu načina grupisanja multigermnih opra&scaron;ivača u zbirnom klasteru, potvrđena je negativna korelacija između mase korena i sadržaja &scaron;ećera. U okviru jedne grupe su se na&scaron;li opra&scaron;ivači sa velikom masom korena i nižim sadržajem &scaron;ećera, a u drugoj grupi sa malom masom korena i vi&scaron;im sadržajem &scaron;ećera. Analizom međusobnih odnosa multigermnih opra&scaron;ivača &scaron;ećerne repe pomoću SSR markera konstruisan je dendrogram u kome su opra&scaron;ivači podeljeni u četiri grupe, shodno centrima porekla iz kojih su dobijeni. Između genetičke udaljenosti određene pomoću podataka dobijenih SSR markerima i posebnih kombinacionih sposobnosti nisu ustanovljene korelacije.<br />Datum prihvatanja</p> / <p>Information about genetic diversity is basic requirement of every successful breeding program. Beside information about genetic diversity for development of sugar beet hybrids it is very important to know combining abilities of breeding material. Since not all crosses result with appearance of heterosis, it is necessary to test general and specific combining abilities of potential parental lines. In this research were used multigerm pollinators from four different breeding programs: sugar beet breeding program of Institute of Field and Vegetable Crops, Novi Sad, and three programs from different breeding station of the US Department of Agriculture (Michigan, Salinas and Fort Collins). Pollinators differed in the degree of homozygosity, depending on the presence of genes for autofertility or sterility. Testers used in this work were two cytoplasmic sterile lines of the Institute of Field and Vegetable Crops, Novi Sad. In addition to determining the genetic diversity and combining ability, objective of this study was to determine values of quantitative traits for sugar beet root traits: root weight, sugar content, dry matter content, root head weight, root circumference, extractable sugar content, crystal sugar yield and from them a genetic diversity of pollinators. Also on the basis of the obtained values it was determined gene effect and mode of inheritance of studied<br />vi<br />quantitative traits. Pollinator FC220 segregated as a potentially stable combiner, in both years, having positive values of general combining abilities for all traits. On the other hand pollinator EL53 in both years had negative values of general combining abilities for all traits. In terms of the mode of inheritance for root weight, root circumference and crystal sugar yield self-fertile pollinators showed superiority comparing to the population of open pollination. A higher level of homozygosity and uniformity of the F1 generation resulted in the expression of heterosis in hybrid combinations where the parents were self-fertile pollinators. Multigerm pollinators in aggregate cluster confirmed the negative correlation between root weight and sugar content. In one group were found pollinators with a large root mass and lower sugar content, while in the second group were pollinators with a small root mass and higher sugar content. Cluster analysis of multigerm sugar beet pollinators using SSR markers resulted in construction of dendrogram in which pollinators were divided into four groups, according to the centers of origin from which they were obtained. There was no correlation between genetic distance calculated from the data obtained by SSR markers and specific combining ability.</p>

O pinhão manso é uma pequena árvore tropical que adquiriu importância econômica pelo conteúdo de óleo em suas sementes e pela possibilidade de sua utilização para produção de biocombustível. As sementes e o óleo do pinhão manso são tóxicos devido principalmente à presença de ésteres de forbol, o que dificulta a sua utilização direta para o consumo humano e também dos resíduos para a alimentação animal. A falta de programas de melhoramento e cultivares comerciais e problemas com pragas e doenças estão desestimulando o cultivo do pinhão manso pelo mundo. Por se tratar de uma espécie semi-domesticada, a utilização de marcadores moleculares como ITS, PCR-RFLP, microssatélites e TRAP poderia auxiliar nos estudos de diversidade genética, visando o desenvolvimento de variedades adaptadas às necessidades dos agricultores. O objetivo deste estudo foi caracterizar a variabilidade genética de acessos de pinhão manso depositados no Banco de Germoplasma da Universidade Federal de São Carlos, além de possibilitar estudos sobre as relações entre as populações, centros de diversidade e determinar o sistema reprodutivo da espécie. Os resultados são discutidos destacando que a maior parte da diversidade encontra-se entre as populações estudadas. Os resultados derivados dos quatro marcadores utilizados corroboram que o centro de diversidade da espécie possivelmente está na América, com destaque para o México, Brasil e Colômbia. Os resultados apontam também para a diferenciação genética dos acessos atóxicos dos mexicanos quando comparados com os demais acessos tóxicos de pinhão manso. Os marcadores microssatélites desenvolvidos indicam que o pinhão manso apresenta um sistema misto de reprodução, combinando autofecundações, apomixia e cruzamento entre indivíduos aparentados, o que pode explicar a menor diversidade genética encontrada dentro das populações. Devido ao sistema misto de reprodução e aos acasalamentos correlacionados, a coleta de sementes de polinização aberta para fins de melhoramento ou conservação deve ser conduzida em um número de árvores acima de 100, visando garantir uma amostra estruturada / Physic nut (Jatropha curcas L.) is a tropical tree that has acquired economic importance for the content of oil in its seeds and the possibility of its use for biofuel production. However, oil seeds and physic nut are toxic because of the presence of secondary metabolites such as phorbol esters which makes its use directly for human consumption and also its waste for animal feed difficult. The lack of commercial varieties and problems with pests and diseases are making physic nut cultivation in the world unattractive. The use of molecular markers such as ITS, PCR-RFLP, microsatellites and TRAP can help in studies of genetic diversity, aimed at developing varieties adapted to farmers needs. The aim of this study was to characterize the genetic variability of physic nut accessions deposited in the Germplasm Bank of the \'Universidade Federal de São Carlos\', in addition to allowing studies on the relationship among accessions, centers of diversity and reproductive system. Results are discussed highlighting that most diversity is concentrated among populations. The four markers used indicated that the center of diversity of this species is probably in America with emphasis on Mexico, Brazil and Colombia. The microsatellite markers indicate that physic nut has a mixed system of reproduction, combining self-pollinations, apomixis and crossing between related individuals which may explain the small genetic diversity found within populations. Due to the mixed system of reproduction and correlated mating, the collection of open-pollinated seeds for plant breeding or conservation should be conducted in a number of trees above 100 in order to ensure a structured sample