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The association between immune response genes and apolipoprotein E (ApoE) related genes in the predisposition for Alzheimer's disease.January 2003 (has links)
by Ma Suk Ling. / Thesis (M.Phil.)--Chinese University of Hong Kong, 2003. / Includes bibliographical references (leaves 106-129). / Abstracts in English and Chinese. / Abstract --- p.i / 摘要 --- p.iii / Acknowledgements --- p.v / Publications --- p.vi / Abbreviations --- p.vii / Chapter Chapter 1 --- General Introduction --- p.1 / Chapter 1.1 --- Epidemiology of AD --- p.2 / Chapter 1.2 --- Clinical and pathological features of AD --- p.3 / Chapter 1.2.1 --- Clinical features of AD --- p.3 / Chapter 1.2.2. --- Pathological features of AD --- p.3 / Chapter 1.3 --- Diagnosis of AD --- p.4 / Chapter 1.4 --- Classification of AD --- p.5 / Chapter 1.5 --- Causes of AD --- p.5 / Chapter 1.6 --- Risk factors --- p.5 / Chapter 1.6.1 --- Age --- p.5 / Chapter 1.6.2 --- Family history --- p.6 / Chapter 1.6.3 --- Genetics --- p.6 / Chapter 1.6.3.1 --- Autosomal dominant mutations --- p.6 / Chapter 1.6.3.2 --- Genotypes of Apolipoprotein E --- p.6 / Chapter 1.6.4 --- Environmental factors --- p.7 / Chapter Chapter 2 --- Pathology in Alzheimer's disease --- p.8 / Chapter 2.1 --- Overview of Alzheimer's disease pathology --- p.8 / Chapter 2.2 --- Amyloid plaques --- p.8 / Chapter 2.2.1 --- Amyloid precursor protein --- p.8 / Chapter 2.2.2 --- Processing ofAPP --- p.9 / Chapter 2.2.3 --- Amyloid β (Aβ) --- p.12 / Chapter 2.2.4 --- APP mutations and AD --- p.12 / Chapter 2.3 --- Neurofibrillary tangles (NFT) --- p.15 / Chapter 2.3.1 --- Tau --- p.15 / Chapter 2.3.2 --- Tau mutation and neurodegeneration --- p.17 / Chapter 2.4 --- Hypotheses for AD pathology --- p.18 / Chapter 2.4.1 --- Amyloid cascade hypothesis --- p.18 / Chapter 2.4.2 --- Inflammatory hypothesis --- p.20 / Chapter 2.4.2.1 --- Microglia and astrocytes --- p.21 / Chapter 2.4.2.2 --- Inflammatory cytokines --- p.23 / Chapter 2.4.2.3 --- Inflammation and AD --- p.25 / Chapter 2.4.3 --- ApoE hypothesis --- p.27 / Chapter 2.4.3.1 --- Apolipoprotein E --- p.27 / Chapter 2.4.3.2 --- ApoE and AD --- p.28 / Chapter 2.5 --- Theory towards the pathology of AD --- p.30 / Chapter Chapter 3 --- ApoE genotyping --- p.32 / Chapter 3.1 --- Introduction --- p.32 / Chapter 3.2 --- Materials and methods --- p.32 / Chapter 3.2.1 --- Patients and control subjects --- p.32 / Chapter 3.2.2 --- Blood sampling --- p.33 / Chapter 3.2.3 --- DNA genotyping --- p.34 / Chapter 3.2.4 --- Statistical analysis --- p.35 / Chapter 3.3 --- Results --- p.35 / Chapter 3.. --- Discussion --- p.38 / Chapter Chapter 4 --- IL-1β polymorphism in relation to the risk of ADin Chinese --- p.39 / Chapter 4.1 --- Introduction --- p.39 / Chapter 4.2 --- Materials and methods --- p.44 / Chapter 4.2.1 --- Patients and control subjects --- p.44 / Chapter 4.2.2 --- Blood sampling --- p.44 / Chapter 4.2.3 --- DNA genotyping --- p.44 / Chapter 4.2.4 --- Statistical analysis --- p.48 / Chapter 4.3 --- Results --- p.48 / Chapter 4.4 --- Discussion --- p.53 / Chapter Chapter 5 --- TNFα polymorphism in relation to the risk of ADin Chinese --- p.63 / Chapter 5.1 --- Introduction --- p.63 / Chapter 5.2 --- Materials and methods --- p.66 / Chapter 5.2.1 --- Patients and control subjects --- p.66 / Chapter 5.2.2 --- Blood sampling --- p.66 / Chapter 5.2.3 --- DNA genotyping --- p.66 / Chapter 5.2.4 --- Haplotype determination --- p.70 / Chapter 5.2.5 --- Statistical analysis --- p.70 / Chapter 5.3 --- Results --- p.70 / Chapter 5.4 --- Discussion --- p.75 / Chapter Chapter 6 --- LRP8 polymorphism in relation to the risk of ADin Chinese --- p.81 / Chapter 6.1 --- Introduction --- p.81 / Chapter 6.2 --- Materials and methods --- p.87 / Chapter 6.2.1 --- Patients and control subjects --- p.87 / Chapter 6.2.2 --- Blood sampling --- p.87 / Chapter 6.2.3 --- DNA genotyping --- p.87 / Chapter 6.2.4 --- Statistical analysis --- p.89 / Chapter 6.3 --- Results --- p.91 / Chapter 6.4 --- Discussion --- p.98 / Chapter Chapter 7 --- Conclusions and prospects for future work --- p.102 / Chapter 7.1 --- Conclusion --- p.102 / Chapter 7.2 --- Prospects for future work --- p.105 / Reference --- p.106
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Identificação e genótipos de giardia intestinalis em humanos e animais no noroeste do estado de São Paulo, BrasilGodoy, Elenir Alves Macedo de 29 May 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-05-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Introduction: Giardia duodenalis is the protozoan frequently found in the intestinal infection causing gastroenteritis worldwide. The G. duodenalis is complex specie with at least seven different assemblages. The A and B assemblages have been associated with infections in human as well as in other mammals, while the other assemblages have demonstrated to prefer different animal species. Genotypes C and D was include isolated of dogs; E is related to production animals, such as, goats, pigs, sheeps and bovines and genotypes F and G are exclusive of domestic felines and rats, respectively. Molecular studies had also disclosed that the genotype presents two sub-groups; A-I and A-II and B; BIII and BIV. Objective: The present study objectified to study domestic, the epidemiology of the G. intestinalis genotypes in human beings, canines, domestic felines, ovines, bovines and caprines, specifically in relation to the standards of transmission in the Northwestern region of the São Paulo State, Brazil, and to evaluate the hypothesis of zoonotic infection. Methods: During the period of July 2009 to October 2010 they had been studied fecal samples of 61 animals and 154 human beings proceeding from the city of Araçatuba, State of São Paulo. The feaces samples of the animals had been gotten in the Control center of Zoonoses of the city and in the Veterinarian Hospital of Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho . The human fecals specimens had been collected in day-care centers in the periphery of the city and laboratories of Clinical Analysis of the private net of the city. The parasitologic diagnosis was made by optic microscopy, by the techniques of Faust and Hoffmann, Pons & Janer. The genotypes of G. intestinalis had been characterized by PCR-RFLP and confirmed by sequencing analysis of the ß-giardin gene. Results: The human beings samples had shown a positivity of 25.3% (39/154), of these, the percentage in children was of 26.8% (36/134), and in adults got 15% of positive samples (3/20). The frequency of G. intestinalis between the studied animals was of 23% (14/61). A total of 32 isolated of G. intestinalis obtained from human beings feces and 6 of the dogs and cats had been characteristic only of the genotype A (AI and AII/AIII). Conclusions: Regarding the Giardíase frequency, our results are similar to the majority of described percentages in children and adults from São Paulo State and other States of Brazil. The prevalence observed in the animal population is in accordance with the described worldwide. The present study was made possible the detention of the considered genotypes zoonotics of G. intestinalis, circulating between the domestic and human animals of the city of Araçatuba, inferring the possibility of zoonotic transmission of the parasite in the northwest region of the State of São Paulo. The absence of these genotypes in production animals offers the perspective that those are not involved in the chain of transmission to the man in the same locality. / Introdução: Giardia intestinalis tem sido associada a episódios diarréicos em inquéritos epidemiológicos. Pesquisas moleculares evidenciaram que G. intestinalis apresenta sete genótipos: A, B, C, D, E, F e G. Somente os genótipos A e B foram detectados em humanos, mas também em outros hospedeiros mamíferos, sendo considerados, portanto zoonóticos. Genótipos C e D incluem isolados de cães; E é relacionado a animais de produção; porcos, ovelhas, bovinos e caprinos e os genótipos F e G são exclusivos de felinos domésticos e ratos, respectivamente. Estudos moleculares também revelaram que o genótipo A apresenta dois subgrupos; A-I e A-II e B; BIII e BIV. Objetivo: O presente trabalho objetivou estudar a distribuição dos genótipos de G. intestinalis em humanos, caninos, felinos domésticos, ovinos, bovinos e caprinos, especificamente em relação aos padrões de transmissão no noroeste do Estado de São Paulo, Brasil, e avaliar a hipótese de infecção zoonótica. Métodos: No período de julho de 2009 a outubro de 2010 foram estudadas amostras fecais de 61 animais e 154 humanos provenientes do município de Araçatuba, Estado de São Paulo. As amostras de fezes dos animais foram obtidas no Centro de Controle de Zoonoses do município e no Hospital Veterinárío da Universidade Estadual Paulista Julio de Mesquita Filho . Os espécimes fecais humanos foram coletados em creches na periferia da cidade e em laboratórios de Análises Clínicas da rede privada do município. O diagnóstico parasitológico foi feito por microscopia óptica, pelas técnicas de Faust e Hoffmann, Pons & Janer. Os genótipos de G. intestinalis foram caracterizados por PCR-RFLP e confirmado por seqüenciamento do gene ß-giardina. Resultados: As amostras humanas mostraram uma positividade de 25.3% (39/154), destas, a percentagem em crianças foi de 26.8% (36/134), já em adultos obteve-se 15% de amostras positivas (3/20). A frequência de G. intestinalis entre os animais estudados foi de 23% (14/61). Um total de 32 isolados de G. intestinalis obtidos a partir de fezes humanas e seis de cães e gatos foram característicos apenas do genótipo A (AI e AII/AIII). Conclusão: Com relação à frequencia da Giardíase, nossos resultados são semelhantes à maioria das porcentagens descritas em crianças e adultos do Estado de São Paulo e de outros Estados do Brasil. A prevalência observada na população animal está de acordo com as taxas de infecção mundiais descritas. Foram detectados genótipos considerados zoonóticos de G. intestinalis, circulando entre os animais domésticos e humanos da cidade de Araçatuba, inferindo a possibilidade de transmissão zoonótica do parasito na região noroeste do Estado de São Paulo. A ausência destes genótipos em animais de produção oferece a perspectiva de que os mesmos não estão envolvidos na cadeia de transmissão ao homem na mesma localidade.
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Avaliação agronômica de genótipos de bananeira no Vale do Rio Siriji, Pernambuco / Agronomic evalution of banana genotypes in the Siriji River Valley, Pernambuco state, BrazilXAVIER, Flávio Ricardo Simeão 31 August 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-08-31 / The productivity of the banana plantations located in the “Zona da Mata” of Pernambuco is considered extremely reduced and banana crop, in exception of a few big growers, is still in a low level of technology and uses inappropriate cultivars with low yield, high plants, and are susceptible to the main pests and diseases, besides the primitive handling techniques. The most cultivated varieties planted are Pacovan and Pome, both corresponding to about 90% of the total and the remaining 10% are composted by other cultivars Plantain, Silk, Dwarf Cavedish and Giant Cavendish. With the purpose of improvement in the production system, by technological alternatives, Embrapa Coastal Tablelands carried out trial on the Siriji River Valley, in Pernambuco, Brazil. This experiment had the objective of evaluating seven types of superiors banana genotypes during the first and the second cycle of production in this region. Phenotypic descriptors were used to reflect the interaction between the genotype and the environment, important to identification and selection of individuals with superior characteristics suitable to increase the banana production in that region. The evaluated genotypes were the Pacovan/Pome types: PV 42-53, PV 79-34, Japira, Preciosa and ST 12-31, and the silk types: YB 42-03 and YB 42-07, supplied and multiplied by Embrapa Cassava and Tropical Fruits, in Cruz das Almas, Bahia, Brazil. The trial was carried out using randomized complete blocks with seven treatments, four 12 useful plants in the plot. Spacing used was 3.00 m X 3.00 m and the holes had the dimension of 0.40 m X 0.40 m X 0.40 m. The plants, irrigated by microaspersion, were submitted to the usual recommended treatment for the banana. The following characteristics were evaluated: number of days between the first and the second harvest; number of days from the planting to the inflorescence, from the inflorescence to the harvest, and from the planting and the harvest; plant height, pseudostem circumference; number of alive leafs in the in florescence and in the harvest; bunch weight; number of hands/bunch and fingers/hand; and the fruit weight, length diameter and skin thickness. The statistical analysis was done by using the SAS-Statistical Analysis System program, and the averages were grouped by the Scott-Kott test under 5% of probability. In the first cycle there was difference in the observed fruit length and skin thickness which resulted in two distinct groups. The other characteristics did not present difference, although the Pacovan hybrids presented excelent prodution characteristics, which is the case of the Japira cultivar that stood out in its bunch weight (19.52 kg), number of hands (7.4) and the fruit weight(104,95 kg). However, in the second cycle, there was significant difference to the most observed characteristics where the bunch weight, the hybrid ST 12-31 had the biggest value (19.3 kg), ahead of the Preciosa (17.4 kg) and the PV 42-53 (16.7 kg). Other important characteristics such as weight and length of the fruit show that Pacovan hybrids had the best values: 137.92 to 152,83 g of weight and 145.01 to 163.04 cm of length. The Preciosa, Japira and PV 42-53 hybrids had an outstanding performance and better exploration potential on the Siriji River Valley in comparision to the other genotypes due to the observed vegetative characteristics and production, allied to the local growers acceptation because of their agronomical characteristics. / A produtividade dos bananais da Zona da Mata de Pernambuco é considerada extremamente reduzida e a bananicultura praticada, à exceção de alguns poucos grandes produtores, ainda é de baixo nível tecnológico, utilizando-se de cultivares inadequadas com baixo rendimento, porte alto e suscetibilidade às principais pragas e doenças, além do uso de um rudimentar manejo fitotécnico e fitossanitário. As cultivares mais plantadas são ‘Pacovan’ e ‘Prata’, ambas correspondendo a cerca de 90% dos plantios existentes, sendo os 10% restantes compostos por outras variedades como ‘Comprida’, ‘Maçã’, ‘Anã’ (Nanica) e ‘Anã do Alto’ (Nanicão). A necessidade de incrementar o sistema de produção com alternativas tecnológicas, fez com que a Embrapa Tabuleiros Costeiros instalasse no Vale do Rio Siriji, PE, um experimento em área de agricultor, com o objetivo de avaliar sete genótipos superiores de bananeira durante o primeiro e o segundo ciclo de produção nessa região, mediante o uso de descritores fenotípicos que refletem a interação genótipoambiente, relevantes para a identificação e seleção de indivíduos com características superiores, que possam ser recomendados com fins de aumentar a produtividade média da bananicultura regional. Os genótipos avaliados foram os tipos Pacovan/Prata: PV 42-53, PV 79-34, Japira, Preciosa e ST 12-31, e os tipos Maçã: YB 42-03 e YB 42-07, fornecidas e multiplicadas pela Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical, em Cruz das Almas, BA. O experimento foi conduzido em delineamento de blocos ao acaso com sete tratamentos, quatro repetições de blocos e parcelas com 12 plantas úteis. O espaçamento utilizado foi o de 3,00 m x 3,00 m, e as covas tiveram a dimensão de 0,40 m x 0,40 m x 0,40 m. As plantas, conduzidas sob irrigação por microaspersão, foram submetidas aos tratos culturais recomendados para a bananeira. Foram considerados os caracteres: número de dias entre à primeira à segunda colheita; do plantio à emissão da inflorescência; da emissão da inflorescência à colheita; e do plantio a colheita; altura da planta; circunferência do pseudocaule; n° de folhas vivas no florescimento e colheita; peso do cacho; n° de pencas/cacho e de frutos/penca; peso, comprimento e diâmetro do fruto; e espessura da casca. As análises de variância foram realizadas com a utilização do programa SASStatistical Analysis System, e as médias foram agrupadas pelo teste Scott-Knott a 5% de probabilidade. No primeiro ciclo, houve diferença para os caracteres comprimento do fruto e espessura da casca, com a formação de dois grupos, entre os demais não houve diferença, embora os híbridos de Pacovan tenham apresentado excelentes características de produção, entre eles a cultivar Japira se destacou em relação ao peso do cacho (19,52 kg), número de penca (7,4) e o peso do fruto (104,95 g). No entanto, no segundo ciclo, houve diferença significativa para a maioria dos caracteres avaliados, sendo que para o peso do cacho, o híbrido ST 12-31 se destacou com o maior valor (19,3 kg), seguida da Preciosa (17,4 kg) e da PV 42-53 (16,7 kg). Outras características importantes como peso e comprimento do fruto apontam os híbridos de Pacovan entre os que apresentaram os melhores valores: de 137,92 a 152,83 g, para peso do fruto e de 145,01 a 163,04 cm, para comprimento do fruto. Os híbridos ‘Preciosa’, ‘Japira’ e ‘PV 42-53’ apresentam os melhores desempenhos em relação aos demais genótipos e potencial para exploração no Vale do Rio Siriji, em virtude das vantagens observadas nas características vegetativas e de produção, além da boa aceitação entre os agricultores locais, quanto às características agronômicas.
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Avaliação e repetibilidade de caracteres agroindustriais de genótipos RB de cana-de-açúcar no litoral norte de Pernambuco / Evaluation and repeattability of agroindustrial character of sugarcane genotypes RB in nortthern coast of PernambucoSILVA, Hudsonkléio da Costa 28 June 2012 (has links)
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Previous issue date: 2012-06-28 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The sugarcane (Saccharum spp.) presents itself as a culture of great social and economic importance for Brazil. The breeding programs have contributed to increasing productivity in sugarcane areas of the country, due to the replacement and renewal of sugarcane, this increase amounted to thirty percent increases in the last three decades. However, the efficiency of the breeding programs of sugarcane depends on the spatial and temporal repeatability of traits under selection. Thus, assessment surveys genotype x environment interaction and repeatability of characters is crucial to the selection result in success. The objective of this study was to evaluate the behavior of agroindustrial genotypes sugarcane in all three cutting times and reliably determine the number of evaluations needed to select new genotypes based on their production components. The experiments were conducted: in Santa Teresa Mill (Goiana) in the years 2006/2007, 2007/2008, 2008/2009, evaluating 25 genotypes; in São José Mill (Igarassú) in the years 2005/2006, 2006/2007, 2007 / 2008 and 2008/2009, to evaluate the repeatability of characters in 16 genotypes, located on the northern coast of Pernambuco, both in a randomized block design, with plots consisting of five eight-meter grooves and spaced one meter. In each section were measured variables: ton of pol per hectare (TPH), ton of cane per hectare (TCH) pol in cane corrected (PCC), fiber (FIB), purity (PZA), soluble solids (° BRIX ) and total recoverable sugar (TRS). Data were subjected to analysis of variance, the group averages by testing Skott & Knott and repeatability of the experiment than those we used: ANAVA, principal component analysis (variance and covariance) and structural analysis. Based on the results of gross income, the best genotypes for beginning and middle of harvest were RB86 7515, RB92 579 and SP81 3250, to end of season highlight for genotypes RB86 7515, SP78 4764 and SP81 3250. To select new genotypes based on the coefficient of repeatability, methods of structural analysis and principal components were equivalent, and depending on the variable in the analysis and reliability stipulated, the number of assessments varied: for TPH and TCH were needed for reliability of 2 reviews 90% for FIB, PCC, PZA, BRIX and ATR were 3-4 consecutive assessments. / A cana-de-açúcar (Saccharum spp.) apresenta-se como uma cultura de grande importância social e econômica para o Brasil. Os programas de melhoramento genético vêm contribuindo para o aumento da produtividade nas áreas canavieiras do país, graças à substituição e renovação dos canaviais, esse incremento atingiu aumentos de trinta por cento nas três últimas décadas. No entanto, a eficácia dos programas de melhoramento de cana-de-açúcar depende da repetibilidade espacial e temporal dos caracteres sob seleção. Com isso, pesquisas de avaliação de interação genótipo x ambiente e repetibilidade de caracteres é de fundamental importância para a seleção resultar em sucesso. Objetivou-se com esse trabalho avaliar o comportamento agroindustrial de genótipos de cana-de-açúcar nas três épocas de corte e determinar com confiabilidade o número de avaliações necessárias para selecionar novos genótipos baseado em seus componentes de produção. Os experimentos foram instalados: na Usina Santa Teresa (Goiana) nos anos agrícolas 2006/2007, 2007/2008, 2008/2009, avaliando 25 genótipos; na Usina São José (Igarassú) nos anos agrícolas 2005/2006, 2006/2007, 2007/2008 e 2008/2009, avaliando-se a repetibilidade de caracteres em 16 genótipos, localizados no Litoral Norte de Pernambuco, ambos em delineamento experimental de blocos casualizados, com parcelas composta de cinco sulcos de oito metros e espaçadas de um metro. Em cada corte foram mensuradas as variáveis: tonelada de pol por hectare (TPH), tonelada de cana por hectare (TCH), pol na cana corrigido (PCC), fibra (FIB), pureza (PZA), teor de sólidos solúveis (ºBRIX) e açúcar total recuperável (ATR). Os dados foram submetidos à análise de variância conjunta, o agrupamento de médias através do teste de Skott & Knott e para o experimento de repetibilidade além desses utilizou-se: ANAVA, análise de componentes principais (variância e covariância) e análise estrutural. Com base nos resultados obtidos de renda bruta, os melhores genótipos para início e meio de safra foram RB867515, RB92579 e SP813250; para final de safra destaque para os genótipos RB867515, SP784764 e SP813250. Para selecionar novos genótipos baseado no coeficiente de repetibilidade, os métodos de componentes principais e análise estrutural se equivaleram, sendo que dependendo da variável em análise e da confiabilidade estipulada, o número de avaliações variou: para TPH e TCH foram necessárias 2 avaliações para confiabilidade de 90%, para FIB, PCC, PZA, BRIX e ATR foram de 3 a 4 avaliações consecutivas.
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Avaliação de genótipos de arroz de terras altas na Zona da Mata de PernambucoSILVA, Vaubam Antônio Carvalho da 10 October 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-10-10 / Rice (Oryza sativa L.) is one of the most cultivated and consumed crop in all continents. In Brazil, it is one of the basic sources of food, but the Brazilian productivity average is considerad low. That is due to inappropriate cultivation practices in some regions and mainly because there is not a sufficient number of evaluated and recommended cultivars for different systems of cultivation in several producing regions. In this context, theevaluations of genotype performance in different environments, the determination of genetics phenotype variability and the evaluation of implications arising from the interaction effects of genotype x environments allow to evaluate the genetic control of characters. Also, this evaluation makes possible the selection of genotypes with favorable characters for cultivation and enables the indication of genotypes for using in genetic breding programs. The objective of this work was to evaluate the upland rice genotypes in Zona da Mata of Pernambuco,Brazil. Two experiments were carried out in 2006, at the Agricultural School of Palmares,South of Zona da Mata, and at Agrotechnical School of Vitória de Santo Antão, Center of Zona da Mata. Twelve genotypes were used in both experiments according to randomized plots with four replicates.In each plot there were 4m-rows, separated 50 cm from each other in which 75 seeds were distributed per linear meter.Data collection was done in three central lines of each plot. Planting was accomplished in the second half of April so that the greater pluviometric index and the regularity of rainfall at each place coincided with the critical period of the culture, which is the flowering phase. The Zona da Mata of Pernambuco has climatic components such as luminosity, temperature and precipitation suitable for upland rice culture. The genotypes evaluated were IAC 47, Bonança, Rio Parnaíba, Maravilha,Caiapó, BRA 1506,BRA 1600, CNAs 9045, CNAs 9025,BRSMG curinga, BRS primavera and PB 5. It was observed that the genotypes Bonança, BRA 1506, BRA 1600, CNAs 9045 and BRSMG curinga had adequate performances for cultivation on upland conditions in the Zona da Mata of Pernambuco. / O arroz (oryza sativa L.) é um dos cereais mais cultivados e consumidos emtodos os continentes. No Brasil é uma das fontes básicas de alimento, porém a produtividade média brasileira é considerada baixa. Isto se deve ao manejo inadequado da cultura em algumas regiões e, principalmente, à carência de um número maior de cultivares avaliadas e recomendadas para os diversos sistemas de cultivo nas diferentes regiões produtoras.Neste contexto, a avaliação do comportamento de genótipos em diferentes ambientes, e as implicações dos efeitos da interação genótipo x ambiente permitem conhecer o controle genético dos caracteres e selecionar genótipos que apresentam caracteres favores à cultura,tornando possível a indicação de cultivares tanto para uso comercial como para serem utilizados em programas de melhoramento genético. O objetivo deste trabalho foi avaliar o comportamento de genótipos de arroz de terras altas na Zona da Mata do Estado de Pernambuco,Brasil.Dois experimentos foram conduzidos em 2006 na referida região, mais especificamente, na Escola Agrícola de Palmares, Zona da Mata Sul e na Escola Agrotécnica de Vitória de Santo Antão, Zona da Mata Centro.Foram avaliados 12 genótipos em ambos experimentos, em 4 blocos, de acordo com o delineamento experimental de blocos ao acaso.As parcelas foram constituídas de 5 linhas paralelas de 5m, espaçadas em 50 cm, nas quais foram distribuídas 75 sementes por metro linear. Todas as observações foram feitas nas três linhas centais de cada parcela.O plantio foi realizado na segunda quinzena do mês de abril para que o maior índice pluviométrico e a regularidade das chuvas coincidissem com o período crítico da cultura, que é a fase de emborrachamento.A Zona da Mata de Pernambuco apresenta condições climáticas como, luminosidade, temperatura e índice pluviométrico compatível com esta cultura. Os genótipos avaliados foram IAC 47, Bonança, Rio Parnaíba, Maravilha, Caiapó, BRA 1506, BRA 1600, CNAs 9045, BRASMG curinga, BRS primavera e PB5. Sendo que o Bonança, BRA 1506, BRA 1600, CNAs 9045 e BRSMG Curinga mostraram promissores para serem explorados em cultivo de terras altas na Zona da Mata de Pernambuco.
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Produtividade de genótipos de gergelim sob a influência de fitoestimulanteCOSTA, Djayran Sobral 24 July 2015 (has links)
Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-03-16T13:33:25Z
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Previous issue date: 2015-07-24 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The Sesame (Sesamum indicum L.) is one of the oldest cultivated plant species by man. The locality of its origin is somewhat uncertain and may be between Africa and Asia. Sesame arrived in Brazil, mainly in the Northeast, brought by the Portuguese in the sixteenth century and its cultivation used traditionally as a backyard crop or small areas of plots of separation more known with terraces. Exploration attempts in the Northeast has always been an obstacle to the expansion of sesame in this region, because the lack of incentive is great making the culture remain only at subsistence level, with the need to test inputs and more apt to local cultivars production. The plant growth regulators produced in research labs focused on improving production, while similar plant hormones (cytokinins, gibberellins, auxin and ethylene), is an option to stimulate the growth and development of sesame. Given the constant search of the population by edible oil which will benefit human health and the lack of technical information to improve the management of sesame culture, aimed to evaluate four sesame cultivars productivity gap, in two growing seasons under the influence of the application of Stimulate® plant hormone. The experiment was carried out in crop years 2014 and 2015 in areas belonging to the Academic Unit of Garanhuns, located in Garanhuns. The experiment was conducted in a randomized block design, using four genotypes (BRS SEDA, CNPA G4, Lineage 1 and Lineage 2) and four sesame lines with and without fitoestimulante (Stimulate®). Data were subjected to analysis of variance and means compared by Tukey test at 5% probability. Upland condition (2014) are recommended for planting genotypes in launching Lineage 1 and Lineage 2 with application fitoestimulante. With use of irrigation (2015) plants of the genotypes BRS SEDA and CNPA G4 with fitoestimulante employment are more productive. Productivity of genotypes is influenced by the application of fitoestimulante. / O Gergelim (Sesamum indicum L.) é uma das espécies vegetais mais antigas cultivadas pelo homem. O gergelim chegou ao Brasil, principalmente no Nordeste, trazido pelos portugueses por volta do século XVI, tendo seu cultivo empregado tradicionalmente, como cultura de fundo de quintal ou em pequenas áreas de separação de glebas mais conhecidos com terreiros. As tentativas de exploração no Nordeste sempre foi um entrave para a expansão do gergelim nesta região, pois a falta de incentivo é grande fazendo com que a cultura permaneça apenas a nível de subsistência, havendo a necessidade de se testar insumos e cultivares mais aptas aos locais de produção. Os reguladores vegetais produzidos em laboratórios de pesquisas voltados para a melhoria da produção, quando similar os hormônios vegetais (citocininas, giberelinas e auxinas), é uma opção para estimular o crescimento e desenvolvimento do gergelim. Em vista da constante busca da população por óleo comestível que venha trazer benefícios a saúde humana e a falta de informações técnicas de melhorar o manejo da cultura do gergelim, objetivou-se avaliar a produtividade de quatro genótipos de gergelim, em duas épocas de cultivo, sob a influência da aplicação do hormônio vegetal Stimulate®. O experimento foi realizado nos anos agrícolas 2014 e 2015, em áreas pertencentes à Unidade Acadêmica de Garanhuns, localizada na cidade de Garanhuns. O experimento foi conduzido em blocos casualizados, com a utilização de quatro genótipos (BRS SEDA, CNPA G4, Linhagem 1 e Linhagem 2) e quatro linhas de gergelim com e sem fitoestimulante (Stimulate®). Os dados foram submetidos à análise de variância e as médias comparadas pelo teste de Tukey, a 5% de probabilidade. Em condição de sequeiro (2014) são recomendados para plantio os genótipos em lançamento Linhagem 1 e Linhagem 2 com aplicação de fitoestimulante. Com uso da irrigação (2015) as plantas dos genótipos BRS SEDA e CNPA G4 com emprego do fitoestimulante são mais produtivos. A produtividade dos genótipos é influenciada pela aplicação do fitoestimulante.
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Perfil genético de Enteroccocus faecalis isolados de infecção endodôntica primária no Brasil comparados a isolados orais e não-orais do Reino Unido e do Japão / Genetic profile of Enterococcus Faecalis isolated from primary edndodontic infecyion in Brazil compared to isolates from oral and non-oral infection from United Kingdom and JapanRenata Ximenes Lins 25 January 2013 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Enterococcus faecalis (E. faecalis), conhecidamente patógeno oportunista, tem sido frequentemente associado a infecções sistêmicas graves. É também encontrado na cavidade oral, com destaque em infecção endodôntica refratária. O objetivo deste estudo foi avaliar características moleculares de E. faecalis isolados de infecção endodôntica primária no Brasil e comparar com isolados orais e não orais de pacientes do Reino Unido e do Japão, assim como E. faecalis resistentes à vancomicina. O presente estudo também investigou o relacionamento entre E. faecalis de diferentes origens (oral e não oral) e de diferentes áreas geográficas para obter uma melhor compreensão do envolvimento dos diferentes reservatórios no surgimento e propagação de clones virulentos, aqueles que possuem genes que conferem infectividade e virulência, assim como resistência aos antibióticos. Para tal, foram estudados E. faecalis isolados em infecções endodônticas no Brasil (n = 20) e orais no Reino Unido (n = 10), e em infecções não orais no Japão (n = 9). Além disso, 20 E. faecalis isolados ambientais do Hospital Universitário de Gales (Cardiff, Reino Unido), classificados como Enterococcus resistentes à vancomicina (VRE) também foram examinados. A Concentração Inibitória Mínima (CIM) dos isolados do Brasil foi obtida pelo método de diluição em agar de acordo com as recomendações do Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Reação em cadeia da polimerase (inglês - PCR) foi a técnica empregada para detectar os genes de virulência e aqueles associados à resistência aos antibióticos, enquanto Reação de Amplificação Aleatória de DNA Polimórfico (inglês - RAPD-PCR) foi escolhida para a tipagem molecular. Dentre os genes de virulência examinados, o gene que codifica a gelatinase gelE foi o mais prevalente entre os isolados (77-100%). Entre isolados orais, foram detectados os genes agg de substâncias de agregação, esp de proteína de evasão imune, cylB de citolisina, genes de resistência à tetraciclina tetM e tetL e à eritromicina ermB com diferentes prevalências. Os isolados clínicos hospitalares do Japão apresentaram perfil genético similar aos isolados orais, mas com maior prevalência de ermB e cylB. Todas as amostras de VRE foram positivas para os genes gelE, esp, agg, vanA, ermB e tetM, 95% foram positivos para cylB e 17% positivo para tetL. Todas as amostras foram negativas para ermA, asa373, vanB, vanC1 e vanC2/3. RAPD-PCR revelou agrupamento de VRE em comparação com outros isolados. Neste estudo, os isolados de E. faecalis de infecções orais apresentaram genes de resistência à tetraciclina, um antimicrobiano frequentemente usado no tratamento local de infecções dentárias, abrindo um debate muito importante sobre o papel e a eficácia desta droga para infecções orais. Claramente, são necessários mais estudos nesta área principalmente em relação à expressão de fatores de virulência entre isolados endodônticos para melhor nortear as estratégias de tratamento. As pressões externas no microambiente dos canais radiculares podem ser responsáveis pela seleção de espécies mais resistentes e virulentas. Por fim, embora isolados orais apresentem genes de virulência fundamentais para a patogenicidade, estes foram detectados em menor incidência em comparação com os isolados não-orais e VRE. / Enterococcus faecalis is an opportunistic pathogen known to cause serious systemic infection. It is also encountered in the oral cavity and has been implicated in persistent root canal infection. The aim of this study was to evaluate a range of molecular characteristics of E. faecalis isolated from primary endondontic infections in Brazil and compare to isolates from oral and non-oral infections in patients from UK and Japan, as well as isolates of vancomycin resistant E. faecalis, VRE, from a hospital environment. The present study was undertaken to explore the relatedness of E. faecalis from different origins, oral and non oral, and from different geographic areas to gain a better understanding of the involvement of the different reservoirs in the emergence and spread of virulent clones, those that acquired a number of genes conferring infectivity and virulence and in addition antibiotic resistance. To do this, E. faecalis from oral infections in Brazilian (n=20) and UK patients (n=10), and non-oral infection in japanese patients (n=9) were studied. In addition, 20 environmental VRE isolates from the University Hospital of Wales (Cardiff, UK) were also examined. For braziliam isolates, antimicrobial susceptibility was ascertained by agar dilution, using the recommendations of the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). For all isolates, PCR with validated primers was used to detect genes associated with antibiotic resistance and virulence, whilst RAPD-PCR was used to fingerprint isolates. Of the virulence genes examined, gelatinase gene gelE was most prevalent amongst isolates (77-100%). In the case of oral isolates, the genes of aggregation substances agg, immune evasion protein esp, cytolysin cylB, tetracycline resistance tetM and tetL and erythromycin resistance ermB were detected with varying prevalence. Japanese hospital isolates had a similar genetic profile to oral isolates but with higher prevalence of ermB and cylB. All VRE strains were positive for gelE, esp, agg, vanA, ermB and tetM, 95% were positive for cylB and 17% positive for tetL. All isolates were negative for ermA, asa373 vanB, vanC1 and vanC2/3. RAPD-PCR revealed clustering of VRE compared with other isolates. In this study, isolates of E. faecalis from oral infections showed antibiotic resistance genes for tetracycline, an agent used in the local treatment of dental infection. This opens up a much-needed debate on the role and efficacy of this antibiotic for oral infections. Clearly, more research in this area is required particularly in relation to the possession and expression of virulence factors in the root canal environment, to better inform our management strategies. Environmental pressures in root canals may be responsible for the selection of more resistant species and the possession of virulence determinants. This knowledge is important in guiding procedures for controlling the increasing problem of antibiotic resistance amongst clinically relevant bacteria. Furthermore, whilst oral isolates had genes that could contribute to pathogenicity, these were detected at lower incidence compared with non-oral and VRE isolates.
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O significado das variantes do eritrovírus em pacientes com citopenias de origem desconhecida / The significance of the variants of the erythrovius in patients with cytopenias of unknown origensSheila de Oliveira Garcia 24 September 2010 (has links)
O eritrovírus humano (parvovírus), gênero Erytrovírus, é o único representante da família Parvoviridae responsável por um amplo espectro de doenças. Estudos recentes têm demonstrado variações entre o eritrovírus e orientam a reclassificação destas variantes em três genótipos distintos: genótipos 1, 2 e 3. O papel do eritrovírus na etiopatogenia de doenças hematológicas em humanos permanece incerto. Este estudo teve como objetivo principal avaliar a relação etiopatogênica dos genótipos do eritrovírus e as citopenias de origem desconhecida. Materiais e Métodos: Participaram do estudo 285 indivíduos procedentes do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo. Destes, 120 apresentavam citopenias de origem desconhecida (grupo 1 Casos), 45 eram doadores de medula óssea (grupo 2 Controles Saudáveis) e 120 eram pacientes com doenças oncohematológicas crônicas (grupo 3 Controles com Neoplasias Hematológicas). A pesquisa do vírus foi realizada pelo método de semi-nested PCR (Reação em Cadeia da Polimerase) em amostras de medula óssea e de sangue periférico. As fitas complementares foram seqüenciadas diretamente do produto da PCR. Amostras de plasma de todos os indivíduos incluídos no estudo foram testadas para presença de anticorpos IgG e IgM específicos contra o eritrovírus por ensaio imunoenzimático. Resultados: Dos 40 indivíduos com resultado positivo na PCR em amostra da medula óssea, o genótipo 1 foi encontrado em 22 (55%), o genótipo 2 em 5 (12,5%), o genótipo 3 em 13 (32,5%). Quando comparadas as freqüências de positividade entre os casos e controles (Grupo 1 VS Grupos 2 e 3), não encontramos diferença significativa com relação ao genótipo 1 (p=0, 192) nem com relação aos genótipos 2 e 3 (p= 0.143). A soroprevalência encontrada na amostra foi de 71%. Conclusão: Concluímos que a infecção isolada pelo eritrovírus, independente do genótipo encontrado, não tem relação etiopatogênica com as citopenias de origem desconhecida, uma vez que o vírus foi encontrado com a mesma freqüência nos casos e nos controles estudados / The human erythrovirus (parvovirus), genus Erytrovirus, is the only representative of the family Parvoviridae responsible for a broad spectrum of diseases. Recent studies have shown variations within the erythrovirus and guide the classification of these variants in three distinct genotypes: genotypes 1, 2 and 3. The role of the erythrovirus in the etiopathogenesis of hematological diseases in humans remains uncertain. This studys main objective was to evaluate the etiopathogenic relationship between the genotypes of the erythrovirus and the cyptopenias of unknown origins. Methods and Materials: 285 individuals coming from the Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo participated in the study. Of these, 120 represented cytopenias of unknown origins (group one Cases), 45 were bone marrow donors (group two - Healthy Controls), and 120 were patients with chronic oncohematological diseases (group three Controls with Hematological Disorder). The research of the virus was done through the semi-nested PCR method (polymerase chain reaction) in bone marrow and peripheral blood samples. The complementary strands were sequenced directly from the product of the PCR. Plasma samples from all of the individuals included in the study were tested through immunosorbent assay for the presence of lgG and IgM antibodies specific to the eritrovírus. Results: Of the 40 individuals that had positive PCR bone marrow results, the genotype 1 was found in 22 (55%), the genotype 2 in 5 (12.5%), and genotype 3 in 13 (32.5%). When the frequency of positivity was compared between the cases and the controls (Group 1 vs. Groups 2 and 3), we did not find a significant difference in relation to genotype 1 (p=0.192), nor did we find a significant difference in relation to genotypes 2 and 3 (p=0.143). The overall seroprevalence found in the samples was 71%. Conclusion: We conclude that the infection isolated by the erytrovirus, independent of the genotype found, does not have a etiopathogenic relationship with the cytopenias of unknown origins, hence the virus was found with the same frequency in the cases and the controls studied
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Profundidades de semeadura na emergência de cártamo (Carthamus tinctorius L.) / Sowing depths in emergence of safflower (Carthamus tinctorius L.) emergenceGalant , Natasha Barchinski 23 March 2017 (has links)
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Previous issue date: 2017-03-23 / Fundação Araucária (FA) / There is a demand for alternative energies, especially for a substitution of the fossil fuels. In this sense there are several options, such as photovoltaic, wind, geothermal, hydraulic and energy crops. The safflower, a new culture in the market that has high oil content in its seeds. Its oil is rich in oleic and linoleic oxides and can be approved for therapeutic purposes, food and still be used for a biofuel production. Although a plant known for many years by ancient civilizations, there are not many studies on its physiology especially with regard to germinative tests. For this purpose, this work aims to evaluate the germination of four different types of safflower at six seeding depths. The experiment was carried out in the experimental field of the Western Paraná State University, in Cascavel, being divided in two stages: in protected environment and field. In protected environment the experimental units were constituted of vessels with diameter of 0.10 m and with 0.20 m of height, maintaining 0.05 m of water sheet. Using 10 seeds per pot, being filled with substrate composed of vermiculite and macronutrients. For the field, the experimental units were divided into 3 blocks consisting of lines with 1.50 m, with 30 seeds spaced at 0.05 m, with 0.30 m of spacing between rows, totaling 6.0 m by 1.8 m blocks. In the analyzes, a 5x4 factorial was performed, with four replicates of 5 depths (0.02, 0.04, 0.06, 0.08 and 0.10 m) and 4 genotypes. Having analyzed the percentage, speed index, mean time, means of emergence and morphometric characteristics of the plant. High emergence rates were observed for smaller seeding depths, ranging from 60 to 80%. At the deepests seedings, the averages were below 50%. At the depth of 0 m there was no emergency for both sites. For IVE the averages ranged from 0.47 to 1.34 seeds per day for the protected environment and 2.26 to 16.42 seeds per day for the field experiment. For genotypes the IMA-2103 68% and 60%, for protected environment and field. The IVE was 1.12 and 9.69 seeds per day. Thus, for both sites, the IMA-2103 had the best performance for the indices evaluated. The depths indicated for planting are 2 and 4cm. / Há uma procura por energias alternativas, principalmente para a substituição dos combustíveis fósseis. Neste sentido existem diversas opções, como energia fotovoltaica, eólica, geotérmica, hidráulica e uso de culturas energéticas. Quanto a isso existe uma cultura nova no mercado o cártamo que tem alto teor de óleo em suas sementes. O seu óleo é rico em ácidos oleico e linoleico e pode ser aproveitado com fim terapêutico, alimentício e ainda ser usado para a produção de biocombustíveis. Embora seja uma planta conhecida há muitos anos pelas civilizações antigas, não existem muitos estudos sobre sua fisiologia principalmente no que se refere a testes germinativos. Com este fim, este trabalho tem como objetivo avaliar a germinação de quatro diferentes genótipos de cártamo em seis profundidades de semeadura. O experimento foi realizado no campo experimental da Universidade Estadual do Oeste do Paraná, em Cascavel, sendo divido em duas etapas: em ambiente protegido e a campo. Em ambiente protegido as unidades experimentais constituíam-se de vasos com diâmetro de 0,10 m e com 0,20 m de altura, mantendo lamina de água 0,05 m. Utilizando 10 sementes por vaso, sendo preenchidos com substrato composto com vermiculita e macronutrientes. Para o campo, as unidades experimentais foram divididas em 3 blocos, nestes blocos constituíam-se de linhas com 1,50 m, alocadas com 30 sementes espaçadas em 0,05 m, com espaçamento entre linhas de 0,30 m, totalizando blocos de 6 m por 1,8 m. Para as análises fora realizado um fatorial de 5x4, com quatro repetições sendo 5 profundidades (0,02, 0,04, 0,06, 0,08 e 0,10 m) e 4 genótipos. Tendo analisados porcentagem, índice de velocidade, tempo médio e velocidade média de emergência e características morfométricas da planta. Altas taxas de emergência foram observadas para as menores profundidades de semeadura, tendo variação de 60 a 80%. Nas maiores profundidades as médias ficaram abaixo de 50%. Na profundidade de 0 m não houve emergência para ambos os locais. Para o IVE as médias variaram de 0,47 a 1,34 sementes por dia para o ambiente protegido e 2,26 para 16,42 sementes por dia para o experimento em campo. Para os genótipos o IMA-2103 68% e 60%, para ambiente protegido e campo. O IVE ficou em 1,12 e 9,69 sementes ao dia. Sendo assim para ambos os locais o genótipo IMA-2103 teve o melhor desempenho para os índices avaliados. As profundidades indicadas para plantio são 2 e 4cm.
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Estudo farmacogenético do metabolismo do tamoxifeno : avaliação genotípica e fenotípica da CYP2D6Antunes, Marina Venzon January 2012 (has links)
Introdução: As variações da CYP2D6 estão associadas com o desfecho clínico das pacientes na terapia adjuvante do câncer de mama com tamoxifeno (TAM). Esta associação deve-se principalmente a hidroxilação do N-desmetiltamoxifeno (NDT) pela CYP2D6 a endoxifeno (EDF) que, por sua alta potência antiestrogênica, é o principal responsável pela eficácia terapêutica. O objetivo deste estudo foi avaliar a relação entre o genótipo e o fenótipo da CYP2D6 com os níveis de EDF e a razão metabólica [NDT]/[EDF] em uma população do Sul do Brasil. Métodos: Foram obtidas amostras de plasma em vale de 97 pacientes em terapia com o tamoxifeno. A genotipagem da CYP2D6 foi realizada com ensaio Luminex, com determinação de escores de atividade genotípica (EAG). As concentrações do TAM e seus metabólitos foram determinados por CLAE-DAD e classificadas em metabolizadores lentos (ML), intermediários (MI), rápidos com atividade diminuída (MR-D), rápidos com atividade rápida (MR-R) e ultra-rápidos (UR). A fenotipagem foi realizada através da determinação do dextrometorfano (DMT) e do dextrorfano (DTF) por CLAE-FL nas amostras de plasma coletadas três horas após administração oral de 33 mg de DMT. A atividade da CYP2D6 foi avaliada pela razão metabólica [DMT]/[DTF]. Resultados: A genotipagem da CYP2D6 mostrou prevalência de 4,1% de ML, 4,1% de MI, 49,5% de MR-D, 39,2% de MR-R e 3,1% de UR. O genótipo (EAG) foi significativamente correlacionado com o fenótipo ([DMT]/[DTF]), com uma associação moderada (rs= -0,463; p<0,001). As medianas das concentrações plasmáticas do TAM e seus metabólitos (ng mL-1) foram: TAM 57,17; HTF 1,01; EDF 6,21; NDT 125,50. Os níveis de EDF foram inferiores nos ML em comparação aos MR (p<0,05). O fenótipo apresentou maior associação, porém ainda moderada, com os níveis de EDF e [NDT]/[EDF] em comparação ao genótipo (r= -0,507 r=0,625, p<0,001 versus r= 0,356 r=0,516; p<0,01). Ao fenótipo da CYP2D6 foram atribuídas 26% da variabilidade dos níveis de EDF e 38 % das razões metabólicas [NDT]/[EDF], enquanto que ao genótipo foram atribuídas 12% e 27 %, respectivamente. Conclusão: A genotipagem e/ou fenotipagem da CYP2D6 não foram capazes de predizer completamente as concentrações de EDF. Desta forma, sugerimos que estudos futuros utilizem o monitoramento dos níveis de EDF durante a terapia com TAM, com o objetivo de avaliar a sua efetividade. / Background: An association between CYP2D6 variation and clinical outcomes among women with breast cancer treated with tamoxifen (TAM) has been demonstrated, such that the presence of 2 functional CYP2D6 alleles was associated with better clinical outcomes. This association is mainly due the CYP2D6 mediated hydroxylation of N-desmethyltamoxifen (NDT) to yield endoxifen (EDF), which because of its high antiestrogenic potency, is the main responsible for the therapeutic efficacy of TAM. The aim of this study was to evaluate the relation of CYP2D6 genotyping and phenotyping with EDF levels and [NDT]/[EDF] metabolic ratio in breast cancer patients from South of Brazil under TAM therapy. Methods: Trough blood samples were collected from 97 patients. CYP2D6 genotyping was performed with a Luminex assay and calculation of Genotypic activity scores (GAS). Tamoxifen and metabolites EDF, NDT and 4-hidroxy-tamoxifen (HTF) were measured in plasma by HPLC-PDA. CYP2D6 phenotyping was performed by determination of dextromethorphan (DMT) and dextrorphan (DTF) by HPLC-FL at plasma collected three hours after oral administration of 33 mg of DMF. Phenotypes were given according to [DMT]/[DTF] metabolic ratio. Results: CYP2D6 genotyping indicated a prevalence of 4.1% PM, 4.1% IM, 49.5% EM-S, 39.2% EM-F and 3.1% UM. Genotype (GAS), was significantly correlated with phenotype ([DMT]/[DTF]), with a moderate association (rs= -0.463; p<0.001). Median plasma concentrations (ng mL-1) (N=97) were: TAM 57.17; HTF 1.01; EDF 6.21; NDT 125.50. EDF levels were lower in PM than in EM (p<0.05). Phenotype showed stronger, but still moderate, association with EDF and [NDT]/[EDF] than genotype (r= -0.507 r=0.625, p<0.001 versus r= 0,356 r=0.516, p<0.01). Phenotype accounted for 26% of the variability in EDF levels and 38 % of [NDT]/[EDF], while genotype for 12% and 27 %, respectively. Conclusion: CYP2D6 genotyping and/or phenotyping could not fully predict EDF concentrations. Monitoring EDF itself could be considered in further studies during TAM therapy in order to evaluate its efficacy
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