La microscopie optique est un outil indispensable pour la recherche de la neurobiologie et médecine qui permet l’étude des cellules dans leur environnement natif. Les processus sous-cellulaires restent néanmoins cachés derrière les limites de la résolution optique, ce qui rend la résolution des structures plus petites que ~300nm impossible. Récemment, les techniques de la localisation des molécules individuelles (SML) ont permis le suivi des protéines de l’échelle nanométrique grâce à l’ajustement des molécules uniques à la réponse impulsionnelle du système optique. Ce processus dépend de la quantité de lumière recueilli et rend ces techniques très sensibles aux imperfections de la voie d’imagerie, nommé des aberrations, qui limitent l’application de SML aux cultures cellulaires sur les lamelles de verre. Un système commercial d’optiques adaptatives est implémenté pour compenser les aberrations du microscope, et un flux de travail est défini pour corriger les aberrations dépendant de la profondeur qui rend la 3D SML possible dans les milieux biologiques complexes. Une nouvelle méthode de SML est présentée qui utilise deux objectifs pour détecter le spectre d’émission des molécules individuelles pour des applications du suivi des particules uniques dans 5 dimensions (x,y,z,t,λ) sans compromis ni de la résolution spatiotemporelle ni du champ de vue. Pour faciliter les analyses de manière quantitative des Go de données générés, le développement des outils biochimiques, numériques et optiques est présenté. Ensemble, ces approches ont le but d’amener l’imagerie quantitative des molécules uniques dans les échantillons biologiques complexes / Optical microscopy is an indispensable tool for research in neurobiology and medicine, enabling studies of cells in their native environment. However, subcellular processes remain hidden behind the resolution limits of diffraction-limited optics which makes structures smaller than ~300nm impossible to resolve. Recently, single molecule localization (SML) and tracking has revolutionized the field, giving nanometer-scale insight into protein organization and dynamics by fitting individual fluorescent molecules to the known point spread function of the optical imaging system. This fitting process depends critically on the amount of collected light and renders SML techniques extremely sensitive to imperfections in the imaging path, called aberrations, that have limited SML to cell cultures on glass coverslips. A commercially available adaptive optics system is implemented to compensate for aberrations inherent to the microscope, and a workflow is defined for depth-dependent aberration correction that enables 3D SML in complex biological environments. A new SML technique is presented that employs a dual-objective approach to detect the emission spectrum of single molecules, enabling 5-dimensional single particle imaging and tracking (x,y,z,t,λ) without compromising spatiotemporal resolution or field of view. These acquisitions generate ~GBs of data, containing a wealth of information about the localization and environment of individual proteins. To facilitate quantitative acquisition and data analysis, the development of biochemical, software and hardware tools are presented. Together, these approaches aim to enable quantitative SML in complex biological samples.

Cette thèse permet de porter l'attention à quelques caractéristiques fondamentales de l'école catholique et de chercher dans quelle mesure sa navigation professionnelle permettrait de tirer la garantie de sa capacité de rénover le système de gestion et de mesure des performances, entre son pilotage des compétences et son renforcement stratégique de la qualité. Dans l'histoire de l'école catholique, plusieurs chercheurs ont présenté l'importance des défis qui l'interpellent et qui l'invitent à trouver des réponses adaptées non seulement au niveau des contenus des méthodes didactiques (choix de la pédagogie adaptée aux besoins des élèves) mais aussi au niveau du travail administratif. Dans la recherche, nous avons donc pris en considération ces réalités qui incitent l'école catholique d'une part à faire une adaptation de ses structures et de son mode d'agir, pour continuer à être une présence efficace et incisive dans le secteur éducatif tout en vivant sa vocation, et d'autre part. à mesurer sa performance globale et piloter ses décisions de façon professionnelle. Dans ce sens, nous avons innové « MAR_BEL S.M.D » (un système de gestion et de mesure de la performance globale d'une école catholique) pour proposer des structures de modélisation d'une école apprenante, qualifiante et en quête de professionnalisation d'une part, et d'autre part pour améliorer ses décisions stratégiques. En effet, ce système de modélisation et de décisions a permis à travers une enquête de vérifier les liens entre des concepts théoriques et des réalités professionnelles vécues dans un contexte complexe sur le territoire libanais. / This thesis makes it possible to pay the attention to some fundamental characteristics of the Catholic school and up to what point to seek its professional navigation would allow drawing the guarantee from its capacity to renovate the system of management and measurement of the performances, between its piloting of competences and its strategic reinforcement of quality. In the history of the Catholic school, several researchers had the importance of the challenges which defy it and which invite it to find answers adapted not only to the level of the contents of the didactic methods (choice of the pedagogy adapted the needs of the pupils) but also to the level of administrative work. In research, we thus took into account these realities which encourage the Catholic school on the one hand to make an adaptation of its structures and its mode to act, to continue to be an effective presence and incisor in the educational sector while living its vocation, and on the other hand, to measure its total performance and to control its decisions in a professional way. ln this direction, we innovated "MAR_BEL S.M.D" (system of management and measurement of the total performance of a Catholic school) to propose structures for the modeling of a learning school, qualifying and in search of professionalisation on the one hand, and on the other hand to improve its strategic decisions. lndeed, this system of modeling and decisions made it possible through an investigation to check the bonds between theoretical concepts and the professional realities lived in a complex context into the Lebanese territory .

La présente thèse vise à comprendre les ressorts sociaux de la conversion politique d’un pionnier de la Résistance, le journaliste Emmanuel d’Astier (1900-1969). Issu de l’aristocratie catholique et conservatrice, proche de l’Action française et journaliste bohême auteur d’articles antisémites et antirépublicains dans l’entre-deux-guerres, d’Astier est en 1940 lefondateur d’une des premières organisations de résistance à l’occupation nazie. Á l’avant-garde de l’antivichysme sous l’Occupation, haut dirigeant de la Résistance, d’Astier devient à la Libération député et compagnon de route du Parti communiste. Son engagement dans la Résistance joue un rôle majeur dans sa conversion politique. Pour comprendre la trajectoire d’Emmanuel d’Astier, il convient d’entrer dans la fabrique sociale de l’acteur, c’est-à-dire de décortiquer les mécanismes et processus continus de la construction sociale de sa personne. Dans cette perspective, il s’agit d’abord de considérer le temps long biographique au cours duquel l’individu est socialement façonné par les multiplesexpériences qu’il est amené à vivre. Il s’agit ensuite d’analyser comment le temps court de l’engagement résistant s’articule au temps long de l’expérience biographique. Ainsi, l’un des enjeux de ce travail est de comprendre à la fois les conditions sociales de possibilité et les incidences biographiques de l’engagement contestataire en contexte autoritaire et critique.Articulant sociologie de la socialisation et sociologie de l’action collective, cette thèse interroge in fine les multiples façons dont histoires sociales individuelles et histoires sociales collectives se percutent, et comment les cheminements des trajectoires individuelles dépendent de ces rencontres. / This thesis questions the social causes of the political conversion of a pioneer of Resistance, the journalist Emmanuel d’Astier (1900-1969). Born in a family of the catholic and conservative aristocracy, Emmanuel d’Astier act during the 1930’s as a bohemian journalist and the author of anti-Semitic and anti-republican articles. In 1940, he is the former of one of the first collective organizations whici fight against the Nazi occupation of France. A great opponant of the regime of Vichy during the Second World War, he becomes a deputy and a friend of communism after the Liberation. His activism in the Resistance plays a major role in his political conversion.To understand the social path of Emmanuel d’Astier, we must analyze the mechanisms and the processes of his social construction. First, we must examine the long-term temporality during which the actor is formed by his biographical experiences. Secondly, we must examine how the short-term temporality of activism articulates with the biographical long-termtemporality. We must understand the social conditions and the biographical consequences of high-risk activism.Ultimately, this thesis articulates a sociology of the socialization with a sociology of collective action. It questions the many ways in which individual paths and collective paths meet, and how individual paths stems from these confluences.

Le domaine de recherche dans lequel s'inscrit ce travail de thèse est la théorie de la prédiction des suites individuelles. Cette dernière considère les problèmes d'apprentissage séquentiel pour lesquels on ne peut ou ne veut pas modéliser le problème de manière stochastique, et fournit des stratégies de prédiction très robustes. Elle englobe aussi bien des problèmes issus de la communauté du machine learning que de celle de la théorie des jeux répétés, et ces derniers sont traités avec des méthodes statistiques, incluant par exemple les techniques de concentration de la mesure ou de l'estimation adaptative. Les résultats obtenus aboutissent, entre autres, à des stratégies de minimisation des regrets externe et interne dans les jeux à information incomplète, notamment les jeux répétés avec signaux. Ces stratégies s'appliquent au problème d'ajustement séquentiel des prix de vente, ou d'allocation séquentielle de bande passante. Le regret interne est ensuite plus spécifiquement étudié, d'abord dans le cadre de l'investissement séquentiel dans le marché boursier, pour lequel des simulations sur des données historiques sont proposées, puis pour l'apprentissage des équilibres corrélés des jeux infinis à ensembles de stratégies convexes et compacts.

Cette thèse analyse les parcours individuels de Validation des Acquis de l'Expérience (VAE), dirigés vers une certification de niveau V. Visant à lutter contre les inégalités d'accès à la certification, nous supposons que la création d'un tel droit individuel, confortant la responsabilité de l'individu quant à la valorisation de son expérience, ne fait pas de ce droit une réalité pour tous. L'objectif est d'observer les phénomènes de différenciation du déploiement de la VAE. Nous avons enrichi les hypothèses ressourcistes et utilitaristes empruntées aux théories du marché du travail (Théories du Capital Humain et du Signal), en soulevant la question de la mise en oeuvre réelle de ce droit, et en interrogeant autrement la notion d'expérience. En conséquence, dans la perspective de l'Approche par les Capabilités, nous construisons un modèle d'analyse original qui permet d'examiner dans quelle mesure les parcours individuels en VAE dépendent, non pas seulement d'une évaluation de l'expérience exprimée en nombre d'années, comme on l'entend au sein des Théories du Capital Humain et du Signal, mais également de facteurs personnels, environnementaux et sociaux, objectifs et subjectifs. Ces facteurs de conversion environnementaux, sociaux et individuels déterminent la mise en oeuvre des ressources et des droits, dont dispose le candidat au sein du dispositif. Cet ensemble forme une structure de contraintes et d'opportunités et dessine le parcours des candidats. L'expérience est multidimensionnelle et diffuse à travers l'ensemble de ces éléments ; on parle d'ensemble expérientiel. Les estimations de la probabilité de validation (versus abandon ou aucune validation) à l'issue du parcours VAE, réalisées à partir de l'enquête DARES-DREES, tendent à confirmer notre modèle et met en exergue des inégalités qui étaient jusque là invisibles, sur-estimées ou sous-estimées, dans le cadre d'une analyse en terme de Capital Humain et de Signal.

Les enquêtes préférences déclarées (EPD) reposent sur des mises en situation hypothétiques. Face à une situation de choix construite de toute pièce par l'analyste, chaque répondant doit déclarer le choix qu'il ferait s'il y était confronté en réalité. Chaque situation se présente comme la combinaison de plusieurs paramètres. Face à chacune des diverses situations qui lui sont présentées successivement, l'enquêté va devoir faire le choix de celles lui convenant le mieux. Au fil du questionnaire, ses réponses révèleront l'importance qu'il donne à chaque paramètre et contribueront à une meilleure appréhension de ses préférences et de ses choix. Ce travail s'articule autour de trois études de cas mises en œuvre dans le cadre d'études menées par des opérateurs de transport (SNCF - thème : réforme de tarification sociale), des gestionnaires d'infrastructure (RFF - thème : effets du cadencement sur l'attractivité du train) ou des organismes de recherche (LET et PREDIT - thème : impact de politiques de rationnement du carburant sur la mobilité automobile). L'objet de ces études nécessitait la mise en œuvre d'enquêtes préférences déclarées. La conception, la mise en œuvre et l'analyse des EPD ont été réalisées dans le cadre de cette thèse avec un soucis permanent de contrôle de chacun des paramètres en vue de garantir la qualité des résultats obtenus. Selon les objectifs de l'étude, des traitements économétriques divers ont été utilisés pour analyser les données récoltées. Finalement, chacune de ces mises en place a contribué à renforcer notre conviction que les EPD constituent un outil complet. Ce travail contribue finalement, à son échelle, à crédibiliser un peu plus les méthodes de préférences déclarées et invite à repositionner cet outil d'analyse comme pivot de toute réflexion complexe dont le protocole est à réinventer lors de chaque construction, plutôt que tel qu'un procédé connu, livré clé en main, dont l'application suit une logique mécanique.

Des progrès récents dans la détection et la manipulation des molécules individuelles offrent de nouveaux outils pour étudier les molécules biologiques et leurs assemblages en conditions physiologiques. Ces outils permettent d'observer la dynamique, les états<br />conformationnels, et l'activité de molécules biologiques individuelles, non masqués par une moyenne d'ensemble. Dans ce cadre, je présente trois études que j'ai réalisées de 1998 à 2006.<br />La première concerne l'étude d'une protéine du cytosquelette, la spectrine. A l'aide d'un microscope à force atomique, nous suivons les états et les transitions de dépliement de protéines polymériques constituées de domaines identiques de la spectrine et montrons que le dépliement d'un domaine de spectrine peut se produire par étapes pendant son étirement.<br />Le second sujet porte sur l'organisation et la dynamique des membranes des cellules vivantes. Nous exposons une méthode fondée sur la spectroscopie de corrélation de fluorescence permettant de détecter des domaines membranaires. Nous revisitons les questions controversées dʹorganisation membranaire en étudiant une grande variété de marqueurs membranaires. Nous<br />montrons que les analogues fluorescents des sphingolipides et les protéines ancrées par un<br />glycosylphosphatidylinositol sont seulement confinés par des microdomaines dʹorigine lipidique.<br />En revanche, le récepteur à la transferrine est compartimenté à la fois par lʹorganisation lipidique et<br />le réseau du cytosquelette. Nous confirmons ainsi lʹexistence dʹune micro‐architecture dʹorigine<br />lipidique par des mesures sur cellules vivantes.<br />Pour améliorer la détection de molécules fluorescentes individuelles et réduire les volumes d'observation sous la limite de diffraction optique, nous utilisons des structures photoniques tels que des miroirs diélectriques ou des trous de taille sub‐longueur d'onde percés dans des films métalliques. A l'aide de ces structures, nous examinons la diffusion membranaire à l'échelle<br />nanométrique et en inférons la structure fine des membranes.<br />Enfin, je présente un projet de recherche sur la géométrie et la mécanique de l'épithélium<br />de l'embryon de drosophile lors de la morphogenèse. Ce projet vise en particulier à développer des<br />méthodes spécifiques pour mesurer et déterminer le rôle des forces de tension corticale du réseau<br />dʹacto‐myosine dans le remodelage des interfaces cellulaires.

Cette thèse permet de porter l'attention à quelques caractéristiques fondamentales de l'école catholique et de chercher dans quelle mesure sa navigation professionnelle permettrait de tirer la garantie de sa capacité de rénover le système de gestion et de mesure des performances, entre son pilotage des compétences et son renforcement stratégique de la qualité. Dans l'histoire de l'école catholique, plusieurs chercheurs ont présenté l'importance des défis qui l'interpellent et qui l'invitent à trouver des réponses adaptées non seulement au niveau des contenus des méthodes didactiques (choix de la pédagogie adaptée aux besoins des élèves) mais aussi au niveau du travail administratif. Dans la recherche, nous avons donc pris en considération ces réalités qui incitent l'école catholique d'une part à faire une adaptation de ses structures et de son mode d'agir, pour continuer à être une présence efficace et incisive dans le secteur éducatif tout en vivant sa vocation, et d'autre part. à mesurer sa performance globale et piloter ses décisions de façon professionnelle. Dans ce sens, nous avons innové " MAR_BEL S.M.D " (un système de gestion et de mesure de la performance globale d'une école catholique) pour proposer des structures de modélisation d'une école apprenante, qualifiante et en quête de professionnalisation d'une part, et d'autre part pour améliorer ses décisions stratégiques. En effet, ce système de modélisation et de décisions a permis à travers une enquête de vérifier les liens entre des concepts théoriques et des réalités professionnelles vécues dans un contexte complexe sur le territoire libanais.

Mémoire numérisé par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal

Les cancers des voies aérodigestives supérieures (VADS) représentent la 5e cause de cancer en France. Ils sont fréquemment découverts à un stade avancé, et leur mauvais pronostic a conduit à l'élaboration de traitements intensifiés. De nombreux essais randomisés ont évalué l'apport de la chimiothérapie et de modifications du fractionnement de la radiothérapie. Leurs résultats ont été synthétisés dans deux méta-analyses sur données individuelles coordonnées par l'Institut Gustave Roussy. Cependant ces méta-analyses génèrent des questions cliniques et méthodologiques, qui constituent le socle de cette thèse. Ainsi nous avons exploré par différents moyens l'étude de l'interaction entre des covariables de niveau individuel, le site tumoral, et l'effet du traitement. Nous avons adapté la méthodologie des méta-analyses en réseau pour les données de survie afin réaliser une analyse globale de l'ensemble de ces essais randomisés et classer les traitements selon leur efficacité sur la survie. Certains de ces traitements n'avaient pas fait l'objet de comparaison directe, et nos résultats se sont vérifiés dans des essais publiés ultérieurement. Nous avons passé en revue les avantages et les limites de la méta-analyse en réseau. Nous avons enfin engagé la mise à jour de ce corpus de méta-analyses pour produire des résultats en accord avec les pratiques actuelles, avec un suivi long, et en explorant des problématiques variées, telles que l'efficacité, la toxicité et l'adhérence au protocole thérapeutique. Les résultats finaux de la méta-analyse sur la chimiothérapie d'induction avec taxanes sont présentés dans cette thèse.