Made available in DSpace on 2015-03-13T17:08:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RenataCLA.pdf: 1406363 bytes, checksum: c23d0993b7ed86a192397c6e7f6d9580 (MD5) Previous issue date: 2004-10-14 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Objective to establish a methodology for the oil spill monitoring on the sea surface, located at the Submerged Exploration Area of the Polo Region of Guamar?, in the State of Rio Grande do Norte, using orbital images of Synthetic Aperture Radar (SAR integrated with meteoceanographycs products. This methodology was applied in the following stages: (1) the creation of a base map of the Exploration Area; (2) the processing of NOAA/AVHRR and ERS-2 images for generation of meteoceanographycs products; (3) the processing of RADARSAT-1 images for monitoring of oil spills; (4) the integration of RADARSAT-1 images with NOAA/AVHRR and ERS-2 image products; and (5) the structuring of a data base. The Integration of RADARSAT-1 image of the Potiguar Basin of day 21.05.99 with the base map of the Exploration Area of the Polo Region of Guamar? for the identification of the probable sources of the oil spots, was used successfully in the detention of the probable spot of oil detected next to the exit to the submarine emissary in the Exploration Area of the Polo Region of Guamar?. To support the integration of RADARSAT-1 images with NOAA/AVHRR and ERS-2 image products, a methodology was developed for the classification of oil spills identified by RADARSAT-1 images. For this, the following algorithms of classification not supervised were tested: K-means, Fuzzy k-means and Isodata. These algorithms are part of the PCI Geomatics software, which was used for the filtering of RADARSAT-1 images. For validation of the results, the oil spills submitted to the unsupervised classification were compared to the results of the Semivariogram Textural Classifier (STC). The mentioned classifier was developed especially for oil spill classification purposes and requires PCI software for the whole processing of RADARSAT-1 images. After all, the results of the classifications were analyzed through Visual Analysis; Calculation of Proportionality of Largeness and Analysis Statistics. Amongst the three algorithms of classifications tested, it was noted that there were no significant alterations in relation to the spills classified with the STC, in all of the analyses taken into consideration. Therefore, considering all the procedures, it has been shown that the described methodology can be successfully applied using the unsupervised classifiers tested, resulting in a decrease of time in the identification and classification processing of oil spills, if compared with the utilization of the STC classifier / Objetiva o estabelecimento de uma metodologia para monitoramento de derramamento de ?leo no mar, na ?rea de Explora??o Submersa do P?lo de Guamar?, no Estado do Rio Grande do Norte, utilizando imagens orbitais de radares de abertura sint?tica (SAR) integradas aos produtos meteoceanogr?ficos. A aplica??o do modelo metodol?gico foi composto pelas seguintes etapas: (1) a cria??o de um mapa base da ?rea de Explora??o; (2) o processamento de imagens NOAA/AVHRR e ERS-2 para gera??o de produtos meteoceanogr?ficos; (3) o processamento de imagens RADARSAT-1 para monitoramento das manchas de ?leo; (4) a integra??o da imagem RADARSAT-1 com os produtos de imagens NOAA/AVHRR e ERS-2; e (5) a estrutura??o de um banco de dados. A Integra??o da imagem RADARSAT-1 da Bacia Potiguar do dia 21.05.99 com o mapa base da ?rea de Explora??o do P?lo de Guamar? para a identifica??o das prov?veis fontes das manchas de ?leo, foi utilizada com sucesso na detec??o da prov?vel mancha de ?leo detectada pr?xima ? sa?da do emiss?rio submarino na ?rea de Explora??o do P?lo de Guamar?. Para subsidiar a integra??o da imagem RADARSAT-1 com os produtos de imagens NOAA/AVHRR e ERS-2, desenvolveu-se uma metodologia para a classifica??o das manchas de ?leo identificadas em imagens RADARSAT-1. Nesta metodologia, testou-se os seguintes algor?tmos de classifica??o n?o-supervisionada: K-means, Fuzzy k-means e Isodata, que s?o parte integrante do software PCI Geomatics, o qual foi utilizado para a filtragem das imagens RADARSAT-1. Para a avalia??o dos resultados, as manchas de ?leo submetidas ? classifica??o n?o-supervisionada foram comparadas aos resultados do Classificador Textural por Semivariograma (STC), o qual foi desenvolvido especificamente para esta finalidade e requer a utiliza??o do software PCI Geomatics para efetuar parte do processamento das imagens RADARSAT-1. Por fim, os resultados das classifica??es foram analisados atrav?s de An?lise Visual; C?lculo de Proporcionalidade de Grandezas e An?lise Estat?stica. Dentre os tr?s algoritmos de classifica??o testados n?o houve significantes altera??es em rela??o as manchas classificadas pelo STC, em nenhuma das an?lises efetuadas. Os procedimentos adotados demonstraram que a metodologia descrita aqui poder? ser aplicada com sucesso, utilizando os classificadores n?o supervisionados testados, o que acarretaria em diminui??o de tempo no processo de identifica??o e classifica??o de manchas de ?leo, em compara??o ? utiliza??o do classificador STC

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:56:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DaniloLS.pdf: 2499617 bytes, checksum: 328b5ce6d56f5a92a61ad220565411c7 (MD5) Previous issue date: 2006-07-24 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior / Oil spill on the sea, accidental or not, generates enormous negative consequences for the affected area. The damages are ambient and economic, mainly with the proximity of these spots of preservation areas and/or coastal zones. The development of automatic techniques for identification of oil spots on the sea surface, captured through Radar images, assist in a complete monitoring of the oceans and seas. However spots of different origins can be visualized in this type of imaging, which is a very difficult task. The system proposed in this work, based on techniques of digital image processing and artificial neural network, has the objective to identify the analyzed spot and to discern between oil and other generating phenomena of spot. Tests in functional blocks that compose the proposed system allow the implementation of different algorithms, as well as its detailed and prompt analysis. The algorithms of digital image processing (speckle filtering and gradient), as well as classifier algorithms (Multilayer Perceptron, Radial Basis Function, Support Vector Machine and Committe Machine) are presented and commented.The final performance of the system, with different kind of classifiers, is presented by ROC curve. The true positive rates are considered agreed with the literature about oil slick detection through SAR images presents / Derramamentos de ?leo sobre o mar, mesmo que acidentais, geram enormes conseq??ncias negativas para a ?rea afetada. Os preju?zos s?o ambientais e econ?micos, principalmente com a proximidade dessas manchas de ?reas de preserva??o e/ou zonas costeiras. O desenvolvimento de t?cnicas autom?ticas para a identifica??o de manchas de ?leo sobre a superf?cie marinha, capturadas atrav?s de imagens de Radar, auxiliam num completo monitoramento dos oceanos e mares. Contudo, manchas de diferentes origens podem ser visualizadas nesse tipo de produ??o de imagem, tornando o monitoramento dif?cil. O sistema proposto neste trabalho, baseado em t?cnicas de processamento digital de imagens e redes neurais artificiais, tem o objetivo de identificar a mancha analisada e discernir entre ?leo e os demais fen?menos geradores de mancha. Testes nos blocos funcionais que comp?em o sistema proposto permitem a implementa??o de diferentes algoritmos, assim como sua an?lise detalhada e pontual. Os algoritmos que tratam do processamento digital de imagem (filtragem do ru?do speckle e gradiente), assim como o de classifica??o (Perceptron de M?ltiplas Camadas, rede de fun??o de Base Radial, M?quina de Vetor de Suporte e M?quina de comit?) s?o apresentados e comentados.O desempenho final do sistema, com diferentes tipos de classificadores, ? apresentado atrav?s da curva ROC. As taxas de acertos s?o consideradas condizentes com o que a literatura de detec??o de manchas de ?leo na superf?cie oce?nica atrav?s de imagens de SAR apresenta

The green tea is considered a functional food with antioxidant activity, and this delays the process of old age and helps in the prevention of chronicle and degenerative diseases, such as cancer and heart affections. Of catechins, present in green tea, may is extremely important in the inactivation of free radicals, which provoke damages to the DNA molecules and to the cell membranes prevent the cytotoxicity induced by the oxidative stress in different tissues, by actuating in the process of chemoprevention. In this study two crosses, ST and HB aimed at evaluating the protective effects of green tea in three different concentrations (25, 50 e 75mg/mL), combined with the antitumor agent, doxorrubicin (DXR), of the genotoxic action; by the of wing spot test (SMART) of Drosophila melanogaster. The results obtained demonstrated that in MH descendants there was not a statistically significant increase in the frequencies of spots, in the individuals treated with green tea, in standard cross (ST) as well as in the high bioactivation cross (HB - characterized by a high constitutive level of cytochrome P450) . However we could observe a statistically significant decrease in the sum of mutant spots, in MH descendants of both crossings (ST and HB), in all concentrations of green tea associated to DXR. These results suggest that green tea does not present genotoxic effect, but presents protective affect against the mutagenic and recombinagenic action of DXR in the somatic cells of D. melanogaster, in the experimental concentrations used in this study. / O chá verde (CV) é considerado um alimento funcional com atividade antioxidante, que retarda o processo de envelhecimento e auxilia na prevenção de doenças crônicas e degenerativas, como o câncer e doenças cardiovasculares. As catequinas, presentes neste chá, podem inativar os radicais livres que causam danos na molécula de DNA e dessa maneira, prevenir a citotoxicidade induzida pelo estresse oxidativo, em diferentes tecidos, atuando no processo de quimioprevenção. Neste estudo dois diferentes cruzamentos, ST e HB foram utilizados para avaliar o efeito do CV em três diferentes concentrações (25, 50 e 75mg/mL) combinados com um agente tumoral, doxorrubicina (DXR), de comprovada ação genotóxica; através do teste para detecção de manchas (SMART) na asa de Drosophila melanogaster. Os resultados obtidos demonstram que para os descendentes MH não houve aumento, estatisticamente significativo, nas freqüências de manchas, nos indivíduos tratados apenas com CV, tanto no cruzamento padrão (ST) quanto no cruzamento de alta bioativação (HB - caracterizado pelo alto nível constitutivo de citocromo 450). Contudo, foi observada uma redução, estatisticamente significativa, no total de manchas mutantes, nos descendentes MH, de ambos os cruzamentos (ST e HB), em todas as concentrações do CV quando associadas com a DXR. Estes resultados sugerem que o CV não possui efeito genotóxico, e, apresenta efeito protetor contra a ação mutagênica e recombinogênica induzida pela DXR em células somáticas de D. melanogaster, nas concentrações experimentais utilizadas neste estudo. / Mestre em Genética e Bioquímica

O Mato Grosso é o estado responsável pela maior área plantada e elevada produtividade de caroço e fibra de algodão do país. Apesar das terras que possuem fertilidade entre as melhores do Brasil e das condições climáticas que propiciaram sua soberania como produtor de algodão, algumas pragas, condições climáticas atípicas e doenças como a mancha de ramulária contribuem para a queda de produtividade e, por conseguinte, de área plantada ano após ano. Os programas de melhoramento são a melhor forma, em longo prazo, de resolver ou pelo menos amenizar esses problemas. Além da resistência às doenças, o desempenho quanto ao rendimento e à qualidade da fibra e a adaptabilidade do material à região são importantes. A mancha de ramulária, até meados de 2007, era uma doença secundária que não incomodava os produtores; porém, com o advento de variedades resistentes a outras de enfermidades que até então eram primárias, houve uma diminuição da necessidade de aplicação de fungicidas na lavoura. Com a migração da cultura para outros estados além de São Paulo e Paraná, essa doença encontrou condições mais favoráveis ao seu surgimento e começou a incomodar os produtores e interferir de forma bastante negativa na produtividade. O objetivo deste trabalho foi analisar o comportamento de três variedades comerciais de algodão no que concerne à severidade causada pela mancha de ramulária durante três safras no estado do Mato Grosso – 2011-12, 2013-14 e 2014-15 – e sua influência na produção, no rendimento e na qualidade de fibra. Foram testadas três variedades comerciais (DeltaOPAL, FM993 e FMT705) em três fazendas situadas nos municípios de Campo Verde, Sapezal e Primavera do Leste. As avaliações para quantificação da mancha de ramulária foram realizadas aproximadamente 100 dias após a emergência. Além da colheita para avaliar a produção de algodão em caroço por parcela, uma amostra de 30 capulhos foi utilizada, com vistas a realizar os testes de porcentagem e qualidade de fibra. De acordo com os resultados observados, a safra 2011-12, que historicamente obteve melhores condições climáticas (beneficiando tanto a cultura quanto a doença), apresentou os maiores valores de produção do algodão em caroço e de severidade à mancha de ramulária. Os índices de porcentagem e qualidade de fibra estudados tiveram certas diferenças entre variedades e localidades, mas se mantiveram dentro dos valores aceitáveis de mercado. No que tange à resposta a essa moléstia, foi possível observar, durante as três safras, um comportamento estável das variedades testadas, sendo a FMT705 a mais resistente e a DeltaOPAL de maior suscetibilidade à mancha de ramulária. / Mato Grosso is the Brazilian state responsible for the largest planted area and greatest productivity of cotton seed and fiber in the country. Although Mato Grosso has the best fertility areas of the country and favorable weather conditions for cotton development and production, some pests, atypical climatic conditions and diseases, such as Ramularia, have contributed to the decrease of yield and planted area. Breeding programs are the best way, in the long term, to solve these problems. In addition to resistance to disease, improving performance in terms of yield and fiber quality, and adaptability of the germplasm to the region are very important. Ramularia was considered a secondary disease until 2007; however, with the advent of other varieties resistant to diseases that were previously primary ones - Ramulose, for example – a decreased need for fungicide application occurred and, furthermore, the migration of the crop to other states besides São Paulo and Paraná, with more favorable conditions for disease, it began to bother producers and interfere negatively on productivity. This study analyzed the behavior of three commercial cotton varieties in relation to the severity caused by Ramularia during 3 crops in Mato Grosso state: seasons 2011-12, 2013-14 and 2014-15, and its influence on production, yield and fiber quality. Three commercial cotton varieties, DeltaOpal, FM993 and FMT705, were tested in three farms located in Campo Verde, Sapezal and Primavera do Leste. The evaluations to quantify Ramularia were performed approximately 100 days after emergence. A sample of 30 bolls was used to perform tests of lint percent, fiber quality, and the production per plot was quantified through weighing plot production. According to results observed, the 2011-12 season - historically presented the best weather, benefiting both the culture and the disease - was the one with the greatest cotton production values and also the greatest severity values for Ramularia. The values of lint percent and fiber showed some differences among cultivars and locations, but still remained within acceptable market values. Regarding the response to the disease, it was observed during the three seasons a stable behavior of the tested varieties, FMT705 performed as the most resistant, while DeltaOPAL was the most susceptible to Ramularia. / Dissertação (Mestrado)

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:29:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-07-17Bitstream added on 2014-06-13T19:39:07Z : No. of bitstreams: 1 campos_aps_me_ilha.pdf: 533716 bytes, checksum: a6a41f1f3c5a72bb618808187efbaa15 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O fungo Thanatephorus cucumeris é responsável por várias doenças foliares em culturas de importância agrícola ou em espécies nativas na região Amazônica do país. Entre as doenças relatadas, a mancha areolada de Thanatephorus é considerada uma das mais importantes para a região. Neste estudo, baseando-se na ausência de informações sobre quais os grupamentos de anastomose (AG) de Rhizoctonia solani estão associados a plantas hospedeiras na Amazônia, foi testada a hipótese de que os isolados de T. cucumeris oriundos de seringueira e citros e outras espécies cultivadas ou nativas pertencem a grupamentos de anastomose distintos. Assim, os isolados de T. cucumeris foram caracterizados citomorfologicamente, por meio da caracterização cultural, grupamento de anastomose e molecular. Esta última baseou-se na observação da variação associada a seqüências da região ITS-5,8S do rDNA. Também não há informação sobre a patogenicidade cruzada, à seringueira, de isolados provenientes de outras espécies de plantas da Amazônia. Então, por meio do teste de patogenicidade cruzada foi testada uma segunda hipótese, a de que isolados de T. cucumeris de hospedeiros distintos são patogênicos também à seringueira. O estudo teve como objetivo elucidar aspectos importantes sobre a etiologia do patógeno, que podem ser relevantes para o manejo da doença. De forma importante, concluiu-se que a seringueira hospeda não apenas um, mas sim vários grupos de anastomose de R. solani como agente causal da mancha areolada. / The fungus Thanatephorus cucumeris is responsible for causing several foliar diseases on important agricultural crops or on native species in the Amazonian area of the country. Among the diseases, Thanatephorus aerial blight is considered one of the most important in that region. In this study, based on the lack of information on which anastomosis groups (AG) of R. solani are associated with distinct hosts in the Amazon, we tested the hypothesis that T. cucumeris isolates from rubber tree, citrus and other cultivated or native species from the area belong to distinct AGs. So, T. cucumeris isolates were characterized based on cytomorphology, cultural characteristics, by anastomosis grouping, and molecularly. This last one was based on the observation of the variation associated with sequences of the ITS-5.8S region of the rDNA. There is no information about the cross pathogenicity (to rubber tree) of isolates from other Amazonian plant species. Based on cross-pathogenicity tests, a second hypothesis was tested stating that T. cucumeris isolates from distinct hosts are also pathogenic to rubber tree. This study had as objective to elucidate important aspects of the aetiology of the pathogen that can be relevant for managing the disease. We have found that the rubber tree hosts not only one, but several anastomosis groups of R. solani as causal agent of the aerial blight.

Submitted by (edna.saturno@ufrpe.br) on 2016-07-28T12:35:54Z No. of bitstreams: 1 Alessandra Santos Alencar.pdf: 4687289 bytes, checksum: 69f920d7a8dc062fcb65629d8888441f (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-28T12:35:54Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Alessandra Santos Alencar.pdf: 4687289 bytes, checksum: 69f920d7a8dc062fcb65629d8888441f (MD5) Previous issue date: 2010-02-26 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Researchers and veterinarians who work in swine production in Brazil have a good idea of existing health problems, especially in your own area of expertise. Due to the short production cycle and the clinical or subclinical character in many of the diseases that affect pigs, there was the possibility of using the slaughterhouse as an important source of epidemiological data on the incidence and prevalence of disease in flocks, making the monitoring of animals in slaughter houses one of the most important sources of information to obtain data to assess the health situation of production systems for pigs with the aim of obtaining statistics on incidence or prevalence of limiting diseases affecting pigs. Thus, this work was developed to analyze the association between the frequency of infection with helminths and coccidia and property characteristics, and evaluate lesions in organs of pigs in slaughterhouses of the metropolitan area of Recife and of the (“Zona da Mata”) of Pernambuco, Brazil. The work was done in three slaughterhouses of the inspection system state, located in the metropolitan area of Recife and in the (“Zona da Mata”) of Pernambuco state, from July 2008 to May 2009. A total of 715 pigs were analyzed, from eight industrial farms and three of subsistence. The count of eggs / oocysts in the feces was calculated and larval culture for diagnosis of infection by gastrointestinal parasites in fecal samples was performed. Inspection of the viscera for examination of lesions and collection of material for histopathological examination were carried out. A questionnaire was used to ascertain the situation of the farms. The positivity for helminths was 2.7%(12/447), predominantly Strongyloidea type eggs. The presence ofoocysts was detected in 6.5% (29/447),including Eimeria spp and Isospora suis. The gross lesions predominated in lung with 43.8% (313/715), followed by 4.7% (35/715) for liver and kidneys with 2.6% (19/715), with higher frequencies respectively for pneumonia, milk spots and hydronephrosis. Histopathologically, granulomatous pneumonia predominated; in the livers with milk spots it was observed sinusoidal congestion, granulomatous inflammatory foci, peri-granulomatous hepatitis, and eosinophilic infiltration in the interlobular spaces, and in kidney, chronic interstitial nephritis. There was a significant association (p <0.05) with the variables related to management of facilities, particularly sanitary aspects, both the rates of parasitism by helminths and coccidia as to the frequency of milk spots and lung lesions. / Os pesquisadores e veterinários que atuam na suinocultura brasileira possuem uma boa idéia dos problemas sanitários existentes, especialmente na sua própria região de atuação. Em função do curto ciclo de produção e do caráter clínico ou subclínico de muitas das enfermidades que acometem os suínos, a utilização do matadouro surgiu como importante fonte de dados epidemiológicos sobre a incidência e prevalência de doenças nos rebanhos, tornando-se a monitoria de animais em abatedouros uma das mais importantes fontes de informações para a obtenção de dados para avaliação da situação da saúde de sistemas de produção de suínos, com a finalidade de obter estatística sobre incidências ou prevalências de doenças limitantes que afetam os suínos. Desta forma, desenvolveu-se este trabalho com o objetivo de analisar a associação entre a frequência de infecção por helmintos e coccídios e características das propriedades, e avaliar as lesões em órgãos de suínos em abatedouros da Região Metropolitana de Recife e Zona da Mata do estado de Pernambuco, Brazil. O trabalho foi realizado em três abatedouros inscritos no sistema de inspeção estadual, localizados na Região Metropolitana de Recife e Zona da Mata do estado Pernambuco, no período de julho de 2008 a maio de 2009. Analisaram-se 715 suínos, oriundos de oito granjas tecnificadas e três de subsistência. Realizou-se a contagem de ovos/oocistos nas fezes e coprocultura para diagnóstico da infecção por parasitos gastrintestinais em amostras fecais coletadas na linha de inspeção, além da inspeção das vísceras para verificação de lesões e coleta de material para exame histopatológico. Um questionário investigativo foi utilizado para conhecer a situaçãodas granjas. A positividade para helmintos foi de 2,7% (12/447), predominando ovos tipo Strongyloidea. A presença de coccídios foi detectada em 6,5% (29/447), incluindo Eimeria spp e Isospora suis. Dentre os achados macroscópicos predominaram as de pulmão com 43,8% (313/715), seguidas de 4,7% (35/715) para fígado e rins com 2,6% (19/715), com frequências respectivamente maiores para pneumonia, manchas leitosas e hidronefrose. Histologicamente, predominaram as pneumonias granulomatosas; nos fígados com manchas leitosas foram observados congestão sinusoidal, focos inflamatórios granulomatosos, perihepatite granulomatosa, e infiltração eosinofílica nos espaços interlobulares. Nos rins, nefrite intersticial crônica. Observou-se associação significativa (p < 0,05) com as variáveis relacionadas ao manejo das instalações, particularmente os aspectos higiênicos, tanto para as taxas de parasitismo por helmintos e coccídios quanto para a frequências de manchas leitosas e lesões pulmonares

The purpose of this work was to evaluate biometric, metabolic and physiological four of the most promising varieties of RIDESA s sugar cane at 150 and 240 days, where in this second period, under the influence of the fungus Curvularia inaequalis, causal agent of the Curvularia s spot.The gas exchange, fluorescence, chlorophyll content and biometry of varieties of sugar cane (Saccharumofficinarum) RB 872552, RB 962962, RB 98710 and RB 92579 were assessed under controlled conditions in vessels, maintained in a greenhouse. The measurements of gas exchange were made at 8:00 am using the following parameters: photosynthetic assimilation of CO2 (A), stomatal conductance (gS), the internal concentration of carbon (Ci), transpiration (E) and vapor pressure deficit between leaf and air (DPVairleaf). Fluorescence measurements were performed at 9:00 am being used the initial fluorescence (Fo), maximum (Fm), variable (Fv), the ratio between variable and maximum fluorescence (Fv / Fm), photochemical quenching (qP) and quenching non-photochemical (qN). The content of chlorophyll a, b and total was collected after elapsed previous analyzes. The quantification of the PAL enzyme was subsequently performed in the laboratory using the leaf +1 of sugar cane.At 150 days of gas exchange, the parameters of photosynthetic CO2 assimilation and transpiration showed abnormalities, and the variety 98710 presented the best results. The same tendency was repeated in the data of chlorophyllous pigments and biometrics. The data of chlorophyll fluorescence did not change.At 240 days of the gas exchange showed difference for the parameters of photosynthetic assimilation CO2, stomatal conductance and internal carbon, and the varieties 872552 and 962962 had values that indicate infection by the fungus.The same tendency occurred in fluorescence of chlorophyll a, in the parameters minimal fluorescence, maximal fluorescence, maximum quantum yield (Fv / Fm), photochemical quenching and non-photochemical quenching. The chlorophyllous pigments showed no change.Confirming the trend, quantified the enzyme phenylalanine ammonia-lyase showed variation, with varieties RB 872552 and 962962 with the major activity of this enzyme in the inoculated treatment.Biometrically varieties RB 92579 and 98710 showed the best development in both treatments. We conclude that under optimal conditions, the varieties generally had the same trends at 150 and 240 days after transplanting, already under the influence of the fungus Curvularia inaequalis, the varieties RB 92579 and 98710 were resistant, the varieties and RB 872552 and 962962 presented symptoms. / O presente trabalho teve como objetivo avaliar biométrica, metabólica e fisiologicamente quatro variedades de cana-de-açúcar (Saccharumofficinarum)da RIDESA aos 150 e 240 dias. Sendo as avaliações conduzidas aos 240 dias sob a influência do fungo Curvularia inaequalis, agente causal da mancha de curvularia. As trocas gasosas, a fluorescência, o teor de clorofila e a biometria das variedades de cana-de-açúcarRB 872552, RB 962962, RB 98710 e RB 92579 foram avaliadas em vasos, mantidos em casa de vegetaçãosob condição controlada. As medições de trocas gasosas foram realizadas às 8:00 horas da manhã utilizando os parâmetros: assimilação fotossintética de CO2 (A), condutância estomática (gS), concentração interna de Carbono (Ci), transpiração (E) e déficit de pressão de vapor entre a folha e o ar (DPVfolha-ar). As medições de fluorescência foram realizadas às 9:00 horas sendo utilizadas a fluorescência inicial (Fo), máxima (Fm), variável (Fv), razão entre as fluorescências variável e máxima (Fv/Fm), quenching fotoquímico (qP) e quenching não-fotoquímico (qN). O teor de clorofila a, b e total foi coletado depois de decorridas as análises anteriores. A quantificação da enzima fenilalanina amônia-liase(PAL) foi realizada posteriormente em laboratório, utilizando a folha +1 da cana-de-açúcar. Aos 150 dias para as trocas gasosas, os parâmetros assimilação fotossintética de CO2 e transpiração apresentaram alteração, sendo a variedade 98710 a que apresentou os maioresvalores. A mesma tendência se repetiu para os dados de pigmentos clorofilados e biometria. Os dados de fluorescência da clorofila a não variaram. Aos 240 dias, as trocas gasosas apresentaram diferença para os parâmetros assimilação fotossintética de CO2, condutância estomática e carbono interno, sendo que as variedades RB 872552 e RB 962962 apresentaram valores que indicam infecção pelo fungo. A mesma tendência ocorreu na fluorescência da clorofila a, nos parâmetros fluorescência mínima, fluorescência máxima, rendimento quântico potencial (Fv/Fm), quenching fotoquímico e não-fotoquímico. Os pigmentos clorofilados não apresentaram nenhuma alteração. Confirmando a tendência, a enzima quantificada fenilalanina amônia-liase (PAL) apresentou variação, sendo as variedades RB 872552 e RB 962962 caracterizadas com maior atividade dessa enzima nos tratamentos inoculados. Biometricamente as variedades RB 92579 e 98710 apresentaram o maior desenvolvimento em ambos os tratamentos. Conclui-se que em condições ótimas, as variedades em geral tiveram tendências iguais aos 150 e 240 dias após o transplantio, já sob a influência do fungo Curvularia inaequalis, as variedades RB 92579 e RB98710 não apresentaram sintomas e as variedades RB 872552 e RB 962962 apresentaram sintomas.

Orientadores: Luciana Lasry Benchimol, Anete Pereira de Souza / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-13T09:26:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Oblessuc_PaulaRodrigues_M.pdf: 2069238 bytes, checksum: 9bb655ec20a8c552a66d533e2467aa51 (MD5) Previous issue date: 2009 / Resumo: O feijão comum (Phaseolus vulgaris L.) é o legume mais consumido em todo o mundo. O melhoramento do feijoeiro busca ferramentas robustas de transferência de genes de resistência à doenças para cultivares de interesse. A doença da mancha angular, causada pelo fungo Pseudocercospora griseola (Sacc.) Crous & U. Braun, é responsável por grandes prejuízos aos produtores de feijão. Novo mapa genético para feijão utilizando marcadores microssatélites foi desenvolvido a partir de uma população segregante de 380 linhagens endogâmicas. A população foi gerada pelo cruzamento entre a variedade 'IAC-UNA' (Mesoamericana/suscetível) e a linhagem 'CAL 143' (Andina/resistente). O mapa UC foi gerado com 198 microssatélites ligados, distribuídos nos onze grupos de ligação, usando LOD mínimo de 3,0 e fração de recombinação máxima de 0,40. O comprimento total de mapa encontrado foi de 1.864,2 cM. Os dados fenotípicos das linhagens da população UC quanto à resistência à mancha angular foram obtidos em condições naturais de infecção por P. griseola, em campo, e em condições controladas de casa de vegetação (raça 60.54). Onze QTLs (Quantitative Trait Loci) associados à resistência a mancha angular foram mapeados por mapeamento por intervalo composto. Sete QTLs foram identificados a partir dos dados fenotípicos de campo e outros quatro QTLs, obtidos dos dados de casa de vegetação. Os efeitos dos QTLs foram quantificados. O total da variação fenotípica explicada foi de 34% no experimento de campo, no qual foi identificado o QTL de maior efeito sobre o fenótipo (9,1%). No experimento de casa de vegetação, foi possível explicar 18% do total da variação fenotípica, sendo obtido o segundo QTL de maior efeito, sendo de 7,2%. Os resultados obtidos neste trabalho indicam um padrão de herança poligênico de resistência à mancha angular, sendo necessária a realização de experimentos fenotípicos com repetições para reduzir os efeitos ambientais e com isso, isolar melhor os efeitos genéticos. / Abstract: Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the most consuming legume worldwide. Common bean breeding is seeking alternatives to transfer resistance genes to cultivars of interest. The angular leaf spot disease caused by the fungus Pseudocercospora griseola (Sacc.) Crous & U. Braun is responsible for great losses for common bean producers. A new genetic map for common bean using microsatellites was obtained from a segregating population of 380 endogamic lines. This population was generated from the 'IAC-UNA' (Mesoamerican/ susceptible) x 'CAL 143' (Andean/resistant) cross. The UC map was generated with 198 microsatellites assigned to eleven linkage groups, using a minimum LOD of 3.0 and a maximum recombinant ratio of 0.40. Total map length found was 1864.2 cM. The angular leaf spot resistance phenotypic data from UC lines was obtained under natural infection condition with P. griseola, on the field, and with controlling greenhouse conditions (race 60.54). Eleven QTLs (Quantitative Trait Loci) were mapped for angular leaf spot resistance using compositive interval mapping. Seven QTLs were identified from field condition and other four QTLs, obtained from greenhouse data. The QTL effects were quantified. Total phenotypic variance explained was 34% on field experiment, in which the major QTL involved on phenotype was identified (9.1%). On the greenhouse experiment it was possible to explain 18% of total phenotypic variance, with the second major QTL, being of 7.2%. The results obtained in this work indicate a polygenic inheritance for angular leaf spot resistance, and it is necessary to carry out new phenotypic experiments with repetitions in order to reduce the environmental effects and, thus, better isolate the genetic effects. / Mestrado / Genetica Vegetal e Melhoramento / Mestre em Genética e Biologia Molecular

Os cogumelos Lentinula edodes (shiitake) e Agaricus blazei (cogumelo-do-sol) apresentam substâncias no corpo de frutificação (basidiocarpo) e no micélio com atividades antibióticas e imuno-regulatórias, havendo uma série de relatos sobre a atuação das mesmas no controle de doenças em animais. Em vegetais, não há informações sobre o efeito protetor do cogumelo-do-sol contra fitopatógenos. No caso de shiitake, embora pouco numerosos, os estudos mostraram o potencial do cogumelo para o controle de doenças de plantas, tais como a murcha bacteriana do tomateiro, a murcha de feijão-lima, além de doenças fúngicas em sorgo e da bacteriose do maracujazeiro. Os objetivos do presente trabalho foram o de avaliar o efeito de diferentes preparações obtidas a partir de L. edodes e de A. blazei em patossistemas agrícolas, visando o controle de moléstias de interesse econômico como a antracnose do pepineiro, a mancha bacteriana do tomateiro e o endurecimento dos frutos do maracujazeiro. Obtida a proteção, os estudos buscaram elucidar o modo de ação das preparações de interesse, bem como purificá-las parcialmente, na tentativa de se concentrar o princípio ativo. Em plantas de pepino, extratos aquosos de basidiocarpos, obtidos a partir de diferentes isolados dos cogumelos, reduziram a severidade da antracnose, na dependência da concentração do extrato. Os extratos não afetaram adversamente o agente causal da doença, Colletotrichum lagenarium, mas provocaram o acúmulo de peroxidases e quitinases nas folhas tratadas e sistemicamente. Utilizando-se precipitação fracionada do extrato aquoso bruto de basidiocarpos de shiitake com sulfato de amônio e cromatografia de troca aniônica, obteve-se uma fração de proteínas, apresentando massa molecular de 29 a 35 kDa, com atividade elicitora de peroxidases em cotilédones de pepino. Em plantas de tomate, o isolado ABL 99/28 de A. blazei foi quem, em média, conferiu maior proteção contra Xanthomonas vesicatoria, a qual foi dependente das concentrações de extrato do cogumelo e de células bacterianas empregadas nos testes. Novamente, o extrato aquoso de basidiocarpos do isolado efetivo não atuou diretamente sobre o patógeno, mas desencadeou o aumento na atividade de b-1,3- glucanases nas folhas tratadas, sugerindo que o mecanismo de ação em pepineiro e tomateiro envolveu a indução de resistência. Já no caso do maracujazeiro, os extratos de basidiocarpos, obtidos a partir de diferentes isolados de ambos os cogumelos, protegeram localmente plantas inoculadas mecanicamente com o Passion fruit woodiness vírus (PWV), por reduzirem a infectividade viral, o que foi comprovado em testes conduzidos com Chenopodium quinoa, hospedeiro de lesão local do vírus. Entretanto, não houve proteção sistêmica em plantas de maracujá, nos experimentos de inoculação mecânica, reduzindo as possibilidades do uso dos cogumelos para o controle dessa virose no campo. De forma geral, os resultados mostraram que os cogumelos L. edodes e A. blazei apresentam compostos que ativam as respostas de defesa em plantas e podem auxiliar no controle de doenças vegetais, dependendo da natureza do agente causal. / The mushrooms Lentinula edodes and Agaricus blazei have substances in the fruiting body and in the mycelia exhibiting antibiotic activity and others able to stimulate the immune system in animals. There are many reports about the performance of these substances in the control of animal diseases. In vegetables, there are no information about the protecting effect of the royal mushroom against plant pathogens. In the case of shiitake, although few in number, the studies showed the potential of the mushroom for the control of plant diseases, such as tomato bacterial wilt, sorghum leave spots and bacterial disease of the passion fruit plant. The objectives of the present work were to evaluate the effect of different preparations from L. edodes and A. blazei to control the diseases cucumber anthracnose, tomato bacterial spot and passion fruit woodiness. As the protection of the plants was obtained, the studies tried to elucidate the way of action of the preparations, as well as partially purify them, in an attempt to concentrate the active compound. In cucumber plants, fruiting body aqueous extracts, from different mushroom isolates, reduced anthracnose severity, depending upon the extract concentration. The extracts did not affect adversely the disease causal agent, Colletotrichum lagenarium, but induced the peroxidase and quitinase accumulation in the treated leaves and systemically. By using fractional precipitation of the shiitake fruiting body aqueous extracts with ammonium sulfate, and anion exchange chromatography, a protein fraction exhibiting molecular mass around 29 to 35 kDa and peroxidase elicitor activity in cucumber cotyledons was obtained. In tomato plants, the isolate ABL 99/28 of A. blazei was the one that, on average, gave higher protection against Xanthomonas vesicatoria, which was dependent upon the extract and bacterial cell concentrations. Again, the fruiting body aqueous extract of ABL 99/28 did not act directly onto the pathogen, but it caused an increase in b-1,3-glucanase activity in the treated leaves, suggesting that the mushroom action in cucumber and tomato plants involved the induced resistance. On the other hand, the fruiting body extracts, obtained from different isolates of both mushrooms, protected locally passion fruit plants inoculated mechanically with the Passion fruit woodiness virus (PWV) by reducing viral infectivity, what was proven through tests carried out with Chenopodium quinoa, a PWV local lesion host. However, there was no systemic protection in passion fruit plants against the virus in the experiments involving mechanical inoculation, reducing the possibilities of the mushroom use for the PWV control in the field. In a general way, the results showed that the mushrooms L. edodes and A. blazei have substances that activate the plant defense mechanisms and they show some potential in the control of vegetable diseases, depending upon the nature of the pathogen.

A soja é a cultura de grãos mais importante no Brasil. Na safra de 2010/11 ocupou uma área de 24 milhões de hectares, se destacando como principal oleaginosa produzida e consumida no mundo. Alguns fatores podem limitar a produção da soja, entre eles as doenças. A mancha- alvo (Corynespora cassiicola) é frequente nas em todas as regiões produtoras de soja no Brasil e nos últimos anos tem se atribuído prejuízos crescentes à doença. Os objetivos deste trabalho foram: determinar a faixa ideal de temperatura para o crescimento micelial de diferentes isolados de C. cassiicola; verificar a esporulação em função do meio de cultura; avaliar a germinação de conídios sob diferentes períodos de molhamento foliar; estudar o efeito da temperatura e molhamento foliar nos componentes monocíclicos e realizar estudos de quantificação de danos. Para avaliar o efeito da temperatura no crescimento micelial, diferentes isolados foram mantidos nas temperaturas de 5°C, 10°C, 15°C, 20°C, 25°C, 30°C e 35°C. A temperatura mínima e máxima estimada pela função beta generalizada para o crescimento micelial foi de 6,9°C e 33°C, respectivamente. A esporulação foi estudada nos meios de cultura BDA e Czapek. Os dados obtidos foram comparados por meio do teste Scott-Knott (P<0,05). A produção de conídios foi variável em função do isolado, tanto em meio BDA como Czapek. O ensaio de germinação foi feito em folhas de soja utilizando-se diferentes períodos de molhamento foliar (2, 6, 12, 24, 48 e 72 horas). A contagem de conídios germinados foi feita em microscópio eletrônico de varredura. A germinação de conídios na superfície das folhas foi verificada a partir do período de 6 horas. Para o estudo dos componentes monocíclicos as temperaturas testadas foram 10ºC, 15ºC, 20ºC, 25 ºC e 30ºC e os períodos de molhamento foliar foram 12, 24, 48 e 72 horas. As variáveis quantificadas foram a severidade, o número e o diâmetro das lesões. Os dados foram ajustados às funções beta generalizada e monomolecular. A temperatura mínima, máxima e ótima capazes de promover o desenvolvimento da mancha-alvo foram de 18°C, 32°C e 27°C, respectivamente. O período de molhamemto foliar de 48 horas resultou em maior desenvolvimento da doença. No ensaio de quantificação de danos, cultivares comerciais foram semeadas em duas épocas. Os componentes avaliados em campo foram: a severidade, a área foliar, o indice vegetativo da diferença normalizada (NDVI) e a produtividade (kg ha-1). Com o uso destes dados foram calculadas a área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD), a área abaixo da curva de progresso do índice de área foliar (AULIAPC), o indice de área foliar (LAI), o indice de área foliar sadia (HLAI), a duração da área foliar sadia (HAD) e a absorção da área foliar sadia (HAA). Neste ensaio verificou-se que valores de severidade de até 37% no dossel inferior não causam danos no patossistema C.cassicola - soja. As variáveis HLAI e AULAIPC se correlacionaram com a produtividade e podem ser úteis para estudos futuros de quantificação de danos para este patossistema. / Soybean is the most important grain crop in Brazil. The production of 2010/11 occupied an area of 24 million hectares, becoming the most important oilseed produced and consumed worldwide. Some factors, such as diseases, may limit soybean production. The target spot caused by Corynespora cassiicola is frequent in all soybean producing regions in Brazil and in the past years, an increasing loss has been assigned to it. The aims of the present study were to determine the ideal temperature range for mycelial growth of different isolates of C. cassiicola; verify the sporulation in relation to the culture medium; evaluate the conidia germination under different periods of leaf wetness; study the effect of the temperature and the leaf wetness on the monocyclic components and carry out studies of crop loss in the field. In order to evaluate the effect of the temperature on the mycelial growth, different isolates were cultivated at the temperatures of 5°C, 10°C, 15°C, 20°C, 25°C, 30°C and 35°C. The minimum and maximum estimated temperature by the beta function to provide C.cassiicola mycelial growth was 6.9 °C and 33 °C, respectively. The sporulation was analyzed in PDA and Czapek culture media. The results obtained were compared through the Scott-Knott test (P <0.05). The conidia production varied according to each isolate on both PDA and Czapek medias. The germination test was carried out in soybean leaves using different leaf wetness periods (0, 12, 24, 48 and 72 hours). The germinated conidia measurement was done in a scanning electron microscope. The conidia germination on the leaves surface was observed from 6 hours. The temperatures used to study the monocyclic components were 10 º C, 15 º C, 20 º C, 25 º C and 30 º C and the leaf wetness periods were 12, 24, 48 and 72 hours. The variables quantified were severity, number and diameter of lesions. The data were adjusted to the generalized beta and monomolecular functions. The minimum, maximum and optimum temperature able to promote the development of target spot in soybean leaves were 18 ° C, 32 ° C and 27 ° C, respectively. The 48- hour leaf wetness resulted in greater development of the disease. For damage quantification, commercial cultivars were sown in two sowing times. The components evaluated in the field were: severity, leaf area, normalized difference vegetation index (NDVI) and grain yield (kg ha-1). Using these data, it was calculated the area under disease progress curve (AUDPC), area under the leaf area index progress curve (AULIAPC), leaf area index (LAI), healthy leaf area index (HLAI), healthy area duration (HAD) and healthy area absorption area (HAA). The severity values up to 37% in the lower canopy do not cause crop loss in C.cassicola - soybean pathosystem .The variables HLAI and AULAIPC correlated with grain yield and may be useful for future studies of crop loss for this pathosystem.