Submitted by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2015-11-25T15:10:05Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_EstudoPrevalenciaInfeccao.pdf: 1034341 bytes, checksum: d5f44eda5dbc999dfb2829548d9da662 (MD5) / Approved for entry into archive by Ana Rosa Silva (arosa@ufpa.br) on 2015-11-25T16:27:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_EstudoPrevalenciaInfeccao.pdf: 1034341 bytes, checksum: d5f44eda5dbc999dfb2829548d9da662 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-25T16:27:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 22974 bytes, checksum: 99c771d9f0b9c46790009b9874d49253 (MD5) Dissertacao_EstudoPrevalenciaInfeccao.pdf: 1034341 bytes, checksum: d5f44eda5dbc999dfb2829548d9da662 (MD5) Previous issue date: 2015 / O Papiloma vírus humano (HPV) infecta uma grande parcela da população feminina mundial, aproximadamente, 291 milhões de mulheres sendo a principal causa do câncer de colo uterino. O câncer de colo uterino tem sua maior incidência após 40 anos de idade, o que coincide com a idade do climatério. Sendo assim, investigar a presença da infecção genital pelo HPV e seus fatores de risco em mulheres no climatério é de grande importância para avaliar a susceptibilidade desta população para o desenvolvimento de câncer. Com isso, este estudo teve como objetivo investigar os aspectos epidemiológicos da infecção genital pelo HPV em mulheres da região metropolitana de Belém, no período do climatério Foram avaliadas 213 mulheres entre 35 a 60 anos, atendidas no Ambulatório da Mulher da Fundação Santa Casa do Pará, no período de janeiro de 2009 a dezembro de 2011. Foram coletados dados clínicos e epidemiológicos das pacientes através de um formulário. As amostras para detecção do DNA do HPV também foram colhidas utilizando escova citológica. Para a detecção do HPV foi utilizada Reação em cadeia de polymerase (PCR) com oligonucleotídeos iniciadores MY9/MY11. E para tipagem dos subtipos HPV6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 52 e 58 foi realizada PCR em tempo real com sondas específicas. Entre as 213 mulheres estudadas, a prevalência geral de infecção genital pelo HPV foi de 11,7%. Os fatores de risco que foram associados à infecção por HPV foram o uso irregular do preservativo ( OR 1.11), e a coitarca com idade igual ou inferior a 14 anos ( OR 1). As frequências dos subtipos testados entre as amostras positivas para HPV foram de 4% para HPV 11, 16, 31, 33 e de 8% para HPV 6 e 35. / HPV infects a large proportion of women worldwide. Approximately 291 million women worldwide are carriers of this virus. HPV is the cause of cervical cancer, that the incidence is higher in women after 40 years old, the same age of climacteric. Therefore, it is important to investigate the presence of HPV genital infection and risk factors in climacteric women to evaluate cervical cancer susceptibility. This study is to investigate HPV genital infection in climacteric women in Belém city. We evaluated 213 women between 35 and 60 years old, whose are assistance at Ambulatório da Mulher da Fundação Santa Casa do Pará. Clincal and epidemiologic data were collected using a questionnaire. Cervical cells were collected using cytological brush to detect HPV DNA. HPV DNA was detected using PCR with MY9/MY11 primers. To type HPV 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 52 e 58, it was performed using real time PCR with specific probes. Among 213 women, HPV genital infection was 11,7%. Associated risk factors were irregular use of condom and sexual initiation before 14 years old. Subtypes HPV frequency were 4% to HPV 11, 16, 31, 33 and 8% to HPV 6 e 35.

Made available in DSpace on 2016-03-22T17:26:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gilca Costa Nachtigal.pdf: 1083938 bytes, checksum: ed8ef909e729d1ec7f63cb5239671c25 (MD5) Previous issue date: 2011-07-28 / Introduction-The incidence of cancer increases annually and is considered one of the main causes of mortality worldwide. Sixty-percent of chemotherapics were obtained from natural sources. Objective - this study aimed to assess the antiproliferative activity of extracts from leaves of Jodina rhombifolia Hook. Et Arn. (methanolic and watery) and seeds of Carapa guianensis Aubl. (methanolic and etheric). Methods - The extract activity was assed by sulforhodamine B colorimetric assay (SRB) on human tumor cell lines of acute myeloid leukemia (HL-60), Daudi Lymphoma and mouse embryonic fibroblasts (NIH-3T3), as control cells. The cell lines were grown using microculture plates and were incubated with five different extract concentrations (2.0, 10.0, 60.0, 100.0 e 600.0 mg/mL) for 72 hours. The anti-proliferative effect was determined by the use of a microplate reader spectrophotometer. With the obtained results a doseresponse curve was generated and the IC50 and ICT values were determined. For statistical analysis the was used with linear regression for different concentrations. The p<0.05 values were considered statistically significant. Results The methanolic extract from Carapa guianensis presented the highest anti-proliferative activity on HL-60 line, with IC50 = 12.6 &#956;g/mL and ICT = 80.5 &#956;g/mL (p<0.05). On Daudi Lymphoma line, the aqueous extract of Jodina rhombifolia presented the best effect: CI50 = 41.09 &#956;g/mL and ICT = 55.90 &#956;g /mL (p<0.05). No statistically significant inhibition was found in control cells (p>0.05). Discussion- The results showed that the extracts obtained from the plants Jodina rhombifolia Hook. et Arn. and Carapa guianensis Aubl. have antiproliferative effect on neoplastic cells of hematopoietic origin. Further studies are necessary to obtain new drugs for clinical use / Introdução - A incidência de câncer aumenta anualmente, sendo uma das principais causas de mortalidade em todo o mundo. Sessenta por cento dos quimioterápicos são derivados de fontes naturais. Objetivo - O presente trabalho objetivou avaliar a atividade antiproliferativa de extratos obtidos a partir de folhas da Jodina rhombifolia Hook. et Arn. (metanólico e aquoso) e de sementes de Carapa guianensis Aubl. (metanólico e etérico). Métodos - A atividade dos extratos foi avaliada por ensaio colorimétrico com Sulforodamina B (SRB) sobre as linhagens celulares tumorais humanas de Leucemia Mielóide Aguda (HL-60), Linfoma Daudi e fibroblastos embrionários murinos (NIH-3T3), como células controle. As linhagens celulares foram cultivadas em placas de microculturas, e foram incubadas com cinco concentrações diferentes dos extratos (2.0, 10.0, 60.0, 100.0 e 600.0 mg/mL) por um período de 72 horas. Para determinar o efeito antiproliferativo foi realizada leitura das placas em espectrofotômetro. Com os resultados obtidos a partir das concentrações testadas de cada extrato, foi gerada uma curva dose-resposta e determinadas a CI50 e CIT. Para análise estatística dos resultados, usou-se o teste de regressão linear para as diferentes concentrações. Valores de p<0.05 foram considerados estatisticamente significativos. Resultados O extrato metanólico da Carapa guianensis foi o que apresentou maior atividade antiproliferativa sobre a linhagem HL-60, com CI50=12,6 &#956;g/mL e CIT=80,5 &#956;g/mL (p<0.05). Sobre a linhagem Linfoma Daudi o extrato aquoso da Jodina rhombifolia apresentou melhor efeito, com CI50=41,09 &#956;g/mL e CIT=55,90 &#956;g/mL (p<0.05). Não houve inibição estatisticamente significativa nos controles (p>0.05). Discussão- Esses resultados demonstram que os extratos obtidos das plantas Jodina rhombifolia Hook. et Arn e Carapa guianensis Aubl têm efeito antiproliferativo em células neoplásicas de origem hematopoiéticas, sendo aconselhado expandir essas pesquisas, buscando obter fármaco que venha a ter utilização clínica

Made available in DSpace on 2016-03-22T17:27:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 is2.pdf: 1552188 bytes, checksum: 842b31ea5e16c999c9c802e21d14ccce (MD5) Previous issue date: 2013-07-22 / Tinea nigra is a rare superficial mycosis caused by Hortaea werneckii. This infection presents as asymptomatic brown to black macule mostly in palmo-plantar regions. This study presents dermatoscopy examination of a lesion, which demonstrated a homogeneous nonmelanocytic pigmented pattern with spicules in the macula; scanning electron microscopy (SEM) examination of the fungal culture, showing sympodial conidiogenesis; and SEM examination of a sample of the lesion, that revealed the epidermis with keratinocytes, elimination of fungal filaments and important aggregation of hyphae. SEM s findings correlated with those of dermatoscopic examination and allowed also documenting the mode of dissemination of tinea nigra, showing how hyphae are eliminated on lesion s surface / Tinea nigra é uma rara micose superficial causada pelo fungo Hortaea werneckii. Esta infecção apresenta-se como mancha assintomática acastanhada ou enegrecida, mais frequentemente na região palmo-plantar. Foram realizados neste estudo: dermatoscopia de uma lesão, a qual demonstrou um padrão homogêneo de pigmentação nãomelanocítica com espículas na mácula; microscopia eletrônica de varredura (MEV) da cultura fúngica, mostrando conidiogênese simpodial; e MEV de uma amostra da lesão, a qual revelou epiderme com queratinócitos, eliminação de filamentos fúngicos e importante agregação de hifas. Os achados de MEV se correlacionaram com aqueles do exame dermatoscópico e ainda permitiram documentar o modo de disseminação da tinea nigra, demonstrando como as hifas são eliminadas na superfície da lesão

Submitted by SBI Biblioteca Digital (sbi.bibliotecadigital@puc-campinas.edu.br) on 2017-04-12T13:26:24Z No. of bitstreams: 1 ALEXANDRA APARECIDA DOS REIS.pdf: 2254046 bytes, checksum: bf0291b84101fecae5af414bf1032ff7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-12T13:26:24Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ALEXANDRA APARECIDA DOS REIS.pdf: 2254046 bytes, checksum: bf0291b84101fecae5af414bf1032ff7 (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior - CAPES / INTRODUCTION: Psoriasis, chronic inflammatory skin disease, Characterized by pink or reddish lesions, covered by whitish and dry scales,Its plaque format is the most common type.In all forms of psoriasis, nail involvement may be present in about 50% of cases.Individuals with psoriasis have nail deformities and a tendency to develop psoriatic arthritis.Psoriatic arthritis inflammatory disease of the joints in a divergent way involves the spine and peripheral joints, can affect up to 30% of people with psoriasis between 5 to 12 years after their development as dactylitis, enthesitis and peripheral joints.This complicates the diagnosis because the involvement of the skin can affect before the joint involvement. There is an immunological development in the pathogenesis of this disease immunized by Th1 and Th17 cells.Recently there is evidence that plays a crucial role in the pathology of psoriatic arthritis.The prevalence of 06% to 42% of patients with psoriasis develop a joint disease. Some studies have been analyzing these items in detail, thus giving rise to methods for measuring quality of life, since to obtain a quality life it is necessary to evaluate the individual as a whole in psychological, social and physical aspects. The questionnaires are instruments, in which they collect information and characterize a composite research technique, in the objective form of questions presented in writing in the research, in application of the knowledge of the researcher.PASE-P: developed as a screening tool for PAs more effectively in individuals with Ps and validated by Husni, et al.2007. Its sensitivity is 76% and specificity is 82%. NAPSI instrument that evaluates each nail by dividing them into four quadrants, to be evaluated for the presence of any alteration coming from both the nail matrix and nail bed. PASI: An instrument developed in 1978 to quantify the severity of Ps in order to evaluate the body surface and was segmented into 04 regions of the head, trunk, lower limbs and upper limbs evaluated on a scale of 0 to 72.DLQI: Questionnaire aiming to obtain detailed data on the quality of life of patients with psoriasis.And it consists of 10 questions about symptoms and feelings, daily activities, leisure, work and school, personal relationships and treatment. CASPAR: Investigates the presence of joint manifestations, dermatological diseases or family history, typical nail changes, the existence of joint swelling and radiological changes. OBJECTIVES: To evaluate the presence of arthritis in male and female patients with Ps, aged between 18 and 80 years using a specific questionnaire to evaluate the severity of psoriasis, using PASE-P, NAPSI, PASI, DLQI AND CASPAR. And determine by means of laboratory variables the PCR and FR. OBJECTIVE: To compare and correlate the severity parameters of psoriasis PASE-P, NAPSI, PASI, DLQI and CASPAR in a screening with patients from the dermatology outpatient clinic to identify psoriatic arthritis, seeking correlations with literature content.METHOD: The study used a cross-sectional, longitudinal and prospective study, approved by the Research Ethics Committee (CEP) of the Celso Pierro Hospital and Maternity Hospital (HMCP) in Campinas-SP. RESULTS: During the study, 63 patients did not present withdrawal, 57.1% were men and 42.9% were women. We obtained a statistically significant correlation between PASE-B, which depicts the functionality and the CRP that characterizes the inflammatory activity.Patients with a PASE-P score greater than 44, defined as suspected APs, 15.9% of arthritis. Correlations for PASE-P greater than 44 obtained the following statistically significant correlations PASE-B with PASI r = 0.736, p = 0.037, DLQI with PCR r = 0.900, p = 0.037, PASE-B with PCR; R = 0.360, p-0.021, PASI with NAPSI ML, r = 0.353. There was a statistically significant correlation between PASE-B which depicts functionality and the CRP that characterizes inflammatory activity. DISCUSSION: The choice of PASE-P, NAPSI, DLQI, PASI and CASPAR instruments in psoriasis was to evaluate their applicability in clinical practice. PASE-P has proved to be relevant, since it is a simple and quick and practical resource, and so far there are few studies with the publication in the Portuguese language version. The questionnaire PASS a recent tool to evaluate psoriatic arthritis, developed by Husni, et al, 2007. CONCLUSION: PASE-P as a specific instrument has been shown to be effective in the detection of some PA patients in a group of patients with psoriasis, as seen in the literature. Each case should be individualized and treated according to the association of disease severity parameters. It can be emphasized, therefore, that the association of PASE, CASPAR, NAPSI and DLQI can be of great assistance in clinical practice for both evolutionary follow-up and therapeutic decision-making. Taking into account that according to what was shown in this study the PASE-P is a specific instrument and that in a dynamic and effective way when detecting PAs in patients. / INTRODU??O: Psor?ase doen?a inflamat?ria cr?nica da pele, caracterizada por les?es r?seas ou avermelhadas, recobertas por escamas esbranqui?adas e secas, seu formato em placas ? o tipo mais comum. Em todas as formas de psor?ase o envolvimento ungueal pode estar presente em cerca de 50% dos casos. Os indiv?duos com psor?ase apresentam deformidades nas unhas e tend?ncia a desenvolver artrite psori?sica. A artrite psori?sica doen?a inflamat?ria das articula??es de maneira divergente envolve a coluna vertebral e articula??es perif?ricas, pode afetar at? 30% das pessoas portadoras da psor?ase entre 5 a 12 anos ap?s seu desenvolvimento como dactilite,entesite e articula??es perif?ricas. O que dificulta o diagn?stico pois os envolvimento cut?neo pode acometer antes do comprometimento articular. Existem um desenvolvimento imunol?gico na patog?nese desta doen?a imunodiada por c?lulas Th1 e Th17. Recentemente h? evidencias que desempenham um papel crucial na patologia da artrite psori?sica. A preval?ncia de 06% a 42% dos pacientes com psor?ase desenvolvem uma doen?a articular. Alguns estudos vem analisando minuciosamente estes itens, surgindo assim m?todos para mensurar a qualidade de vida, pois para obter uma vida com qualidade ? necess?rio avaliar o indiv?duo como um todo em aspectos psicol?gicos, social e f?sico. Os question?rios s?o instrumentos, nos quais coletam informa??es e caracterizam uma t?cnica de investiga??o composta, na forma objetiva de quest?es apresentadas por escrito na pesquisa, em aplica??o do conhecimento do pesquisador. PASE-P: desenvolvidos como uma ferramenta de triagem para APs de forma mais eficaz em indiv?duos com Ps e validados por Husni, et al.2007.Sua sensibilidade e de 76% e especificidade de 82%. NAPSI instrumento que avalia cada unha dividindo as em quatro quadrantes, para ser avaliada quanto a presen?a de qualquer altera??o provenientes tanto da matriz da unha quanto leito ungueal. PASI: Instrumento desenvolvido em 1978, para quantificar a gravidade da Ps, com o objetivo de avaliar a superf?cie corporal e para isto foi segmentado em 04 regi?es cabe?a, tronco, membros inferiores e membros superiores, avaliado em uma escala de 0 a 72.DLQI: Question?rio com intuito em obter dados de forma detalhada sobre a qualidade de vida dos portadores da psor?ase. E composto por 10 quest?es sobre sintomas e sentimentos, atividades di?rias, lazer, trabalho e escola, rela??es pessoais e tratamento. CASPAR: Investiga a presen?a de manifesta??es articulares, doen?as dermatol?gicas ou hist?rico familiar, mudan?as ungueais de forma t?pica, exist?ncia de incha?o articular e altera??es radiol?gicas. OBJETIVOS: Avaliar a presen?a da artrite em pacientes do g?nero masculino e feminino com Ps, com idade entre 18 a 80 anos atrav?s de question?rio espec?fico para avalia??o da gravidade da psor?ase, atrav?s de instrumentos de avalia??o e classifica??o PASE-P, NAPSI, PASI, DLQI E CASPAR. E determinar por meio de vari?veis laboratoriais o PCR e FR. OBJETIVO ESPECIFICO: Comparar e correlacionar os par?metros de gravidade da psor?ase PASE-P, NAPSI, PASI, DLQI E CASPAR em uma triagem com pacientes do ambulat?rio de dermatologia afim de identificar a artrite psori?sica, buscando correla??es com conte?do da literatura. M?TODO: A pesquisa utilizou um estudo transversal, longitudinal e prospectivo, aprovado pelo Comit? de ?tica em Pesquisa (CEP) do Hospital e Maternidade Celso Pierro (HMCP) em Campinas-SP. RESULTADOS: Durante a pesquisa fizeram parte da popula??o 63 pacientes n?o havendo desist?ncia, sendo 57,1% eram homens e 42,9% eram mulheres. Obtivemos correla??o estatisticamente significativa entre o PASE-B, que retrata a funcionalidade e o PCR que caracteriza a atividade inflamat?ria. Pacientes com escore de PASE-P maior que 44, definiram se como suspeita de APs, 15,9% de artrite. Correla??es para o PASE-P maior que 44 obtivemos as seguintes correla??es estatisticamente significativas PASE-B com PASI r= 0,736, p=0,037, DLQI com PCR r=0,900, p=0,037, PASE-B com PCR; r=0,360, p- 0,021, PASI com NAPSI ML, r=0, 353.Houve correla??o estatisticamente significativa entre PASE-B que retrata funcionalidade e o PCR que caracteriza atividade inflamat?ria. DISCUSSAO: A escolha dos instrumentos PASE-P, NAPSI, DLQI, PASI E CASPAR, na psor?ase foram para avaliar suas aplicabilidades na pratica cl?nica. O PASE-P mostrou se relevante, pois e um recurso simples r?pido e pr?tico, e at? o momento h? poucos estudos com a publica??o na vers?o da l?ngua portuguesa. O question?rio PASE uma ferramenta recente em avaliar a artrite psori?sica, desenvolvido por Husni, et al,2007. CONCLUS?O: O PASE-P como instrumento especifico se mostrou eficaz na detec??o de alguns pacientes com APs em um grupo de pacientes com psor?ase, como visto na literatura. Cada caso deve ser individualizado e tratado de acordo com a associa??o dos par?metros de gravidade da doen?a. Pode-se ressaltar, portanto, que a associa??o do PASE, CASPAR, NAPSI e DLQI pode servir de grande aux?lio na pr?tica cl?nica tanto para o acompanhamento evolutivo, quanto para a tomada de decis?es terap?uticas. Levando em considera??o que de acordo com o que foi mostrado neste estudo o PASE-P ? um instrumento espec?fico e que de forma din?mica e eficaz ao detectar a APs em pacientes.

Made available in DSpace on 2015-03-04T18:51:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DissertacaoPabloRFreire-Maio2008.pdf: 2235648 bytes, checksum: 9e7612e91a013d00bada5d3d53f0145d (MD5) Previous issue date: 2008-05-29 / Coordenacao de Aperfeicoamento de Pessoal de Nivel Superior / Cancer is a disease originated from mutations in the genome. One of the main types of mutations is the copy number variation, which is defined when a certain region of the genome has a copy number different than two. This variation may alter gene expression and modulate tumor progression. Recent experimental platforms allow the measure of copy number in a genomic scale, however, these aberrations encompass oncogenes and tumor suppressor together with genes that are not related to cancer. The use of set of experiments from several patients is normally used as a solution for this problem, however, this approach lacks adequate mathematical methods for indentifying biologically important regions. In this dissertation, a new method for finding aberrant regions in a set of copy number experiments is presented, using the entropy as a measure for biological aberration, and outperforming other methods with similar propose. Moreover, a graphical tool was developed to visualization and analysis of the data. The new methodology was applied in 167 copy number experiments from glioblastoma multiforme samples generated by The Cancer Genome Atlas project, one of the biggest projects on cancer research. As a result, 31 aberrant regions were found, being 8 of these regions previously known in glioblastoma multiforme, carrying the genes: EGFR , MDM2, MDM4, CDK4, PTEN, PDGFRA, CDKN2A and CHD5. Other oncogenes and tumor suppressors that are important in other types of cancer were also found as well as genes without previously described relation with cancer. / O câncer é uma doença originada a partir de mutações no genoma. Um dos principais tipos de mutação são as variações do número de cópias gênicas, que ocorre quando o número de cópias de uma determinada região genômica difere de dois. Esta variação pode alterar a expressão gênica e contribuir para a progressão tumoral. Recentes plataformas experimentais permitem medir o número de cópias gênicas para todo o genoma. Entretanto, aberrações que contém oncogenes e surpessores tumorais normalmente também possuem genes que não estão relacionado com o câncer. O uso combinado de diversos pacientes têm sido uma estratégia utilizada para solucionar este problema, entretanto, esta aboradagem carece de métodos matemáticos adequados. Nesta dissertação, um novo método para identificar regiões aberrantes em um conjunto de experimentos de medição de número de cópias gênicas é apresentado, utilizando a entropia como medida de aberração biológica. Seu desenpenho superou os outros dois métodos disponíveis para o memso tipo de análise. Adicionalmente, foi desenvolvida uma ferramenta gráfica para a visualização e análise dos dados. A nova metodologia foi aplicada a estimativas de número de cópias gênicas de 167 amostras de glioblastoma multiforme geradas pelo projeto The Cancer Genome Atlas, um dos maiores projetos de câncer da atualidade. Ao total, 31 regiões de interesse foram econtradas, sendo que 8 destas regiões são mutações já descritas em GBM, contendo os genes: EGFR , MDM2, MDM4, CDK4, PTEN, PDGFRA, CDKN2A e CHD5. Oncogenes e supressores tumorais que atuam em outros cânceres também foram encontrados nos resultados, assim como alguns genes sem prévia relação com câncer.

Submitted by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2016-08-17T14:59:38Z No. of bitstreams: 1 dissertaçãoanavalentim.pdf: 1740504 bytes, checksum: 0257fe112e3d027d453ffe7c79d88e00 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2016-08-17T14:59:53Z (GMT) No. of bitstreams: 1 dissertaçãoanavalentim.pdf: 1740504 bytes, checksum: 0257fe112e3d027d453ffe7c79d88e00 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-17T15:00:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertaçãoanavalentim.pdf: 1740504 bytes, checksum: 0257fe112e3d027d453ffe7c79d88e00 (MD5) Previous issue date: 2016-02-29 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / An important problem in Neuroscience is to study models in order to describe qualitatively and quantitatively the neuronal firing. Several the existing models in this area have a deterministic character, failing to take into account some relevant aspects for a more realistic description of the process. In order to model this phenomenon it often is used the Hodgkin and Huxley model. There is a simpler alternative model, despising the coupling and the nonlinearities, called Integrate and Fire. In this work, it was added to the deteministic models some stochastic perturbations in order to obtain more consistent results according to the experiments. Different numerical methods for stochastic equations were adapted to the study of the models above. Thereby, it was verified that the stochastic models reproduce more realistically the neuronal firing. / Um problema importante em Neurociência é o estudo de modelos para descrever qualitativamente o disparo neuronal. Vários dos modelos existentes nesta área é de caráter determinístico, deixando de levar em conta aspectos relevantes para uma descrição mais realista do processo. Para a modelagem deste fenômeno utiliza-se o modelo de Hodgkin e Huxley. Existe um modelo alternativo mais simples chamado Integrate and Fire. Neste trabalho, foram acrescentados aos modelos determinísticos perturbações estocásticas a fim de obtermos resultados mais condizentes com a realidade. Diferentes métodos numéricos para equações estocásticas foram adaptados para o estudo dos modelos supracitados. Com isso, verificou-se que os modelos estocásticos de fato reproduzem de forma mais real o disparo neuronal.

Submitted by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2016-11-10T17:25:47Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - Heber.pdf: 25456808 bytes, checksum: 5a476a5f9ee83b5ce728802389840142 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2016-11-10T17:25:58Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - Heber.pdf: 25456808 bytes, checksum: 5a476a5f9ee83b5ce728802389840142 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-10T17:26:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - Heber.pdf: 25456808 bytes, checksum: 5a476a5f9ee83b5ce728802389840142 (MD5) Previous issue date: 2016-04-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Cancer is a huge world health problem, what is expanding researches on a wide variety of subjects associated with its onset, evolution and treatment. In this work, we perfom a detailed study on the tumor growth mechanisms in order to build a model to describe the evolution of tumors at different scales. We develop a multiscale hybrid model for the avascular tumor growth which integrates phenomena that occur at two scales, the cellular and tissue scales. The cellular scale is described through an agent based model, allowing to deal with each cell individually and to describe the cell behavior in the microenvironment. We represent the nutrient transport in the microenvironment at the tissue scale through a reaction-diffusion partial differential equation. The oxygen is considered the only source of nutrients and its uptake rate plays the role of the bridge between scales. The model encompasses tumor and normal cells, but the latter are kept in homeostasis. Phenotypic states differentiate tumor cells (quiescent, proliferative, apoptotic, hypoxic and necrotic), which may change in accordance with microenvironment conditions. The tumor growth dynamics is ruled by phenotypic transitions, which are mainly deterministic. However, the transitions from quiescent to proliferative and apoptotic states are stochastic. Each cell movement is driven by the force balance among cells, according to Newton's second law. By including normal cells, the tumor growth strongly depends on the mechanical interactions in the microenvironment. To describe these effects, we develop a model to represent the compressive stress accumulation within the growing tumor, which acts by inhibiting further cell proliferation. Computational simulations are conducted to demonstrate that the developed model can adequately describe the complex mechanisms of tumor dynamics, including growth arrest in avascular tumors. / O câncer é um enorme problema de saúde global, o que vem impulsionando pesquisas nas mais diversas áreas associadas ao seu surgimento, evolução e terapias. Neste trabalho realizamos um estudo minucioso acerca do crescimento tumoral a fim de construir um modelo que descreve o crescimento tumoral em diversas escalas. Desenvolvemos um modelo multiescala híbrido para o crescimento tumoral avascular que integra fenômenos que ocorrem em duas escalas, uma escala a nível celular e outra a nível de tecido. A escala celular é descrita através de um modelo baseado em agentes, que possibilita tratar cada célula individualmente e descrever seu comportamento no microambiente. Na escala do tecido representamos a dispersão de nutrientes no meio através de uma equação diferencial parcial de reação-difusão. Consideramos o oxigênio como a única fonte de nutrientes e seu consumo é o mecanismo através do qual o acoplamento entre as escalas é realizado. Consideramos que cada célula no modelo pode ser tumoral ou normal, sendo as células normais mantidas em homeostase. As células tumorais são diferenciadas pelos estados fenotípicos (quiescente, proliferativa, apoptótica, hipóxica e necrótica), que podem ser alterados em função das condições do meio. A dinâmica do crescimento tumoral é regida pelas transições entre estados fenotípicos, as quais, em sua maioria, são consideradas eventos determinísticos. Entretanto, as transições do estado quiescente para o proliferativo e para o apoptótico são assumidas como estocásticas. O movimento de cada célula no meio é determinado por um balanço de forças atuantes nas células, de acordo com a segunda lei de Newton. Com a inclusão de células normais, o crescimento do tumor é fortemente influenciado pelas interações mecânicas no microambiente. Para descrever estes efeitos, desenvolvemos um modelo para representar o acúmulo das tensões de compressão no interior do tumor à medida que o tumor cresce, o qual atua inibindo a probabilidade de proliferação das células tumorais. As simulações realizadas demonstram que o modelo desenvolvido consegue representar qualitativamente a dinâmica de tumores em um microambiente genérico e a estagnação do crescimento típica de tumores avasculares.

Submitted by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2016-11-10T17:47:04Z No. of bitstreams: 1 thesis_anna.pdf: 24876563 bytes, checksum: 86903225a1b681abf9ea16d871b3381a (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Cristina (library@lncc.br) on 2016-11-10T17:47:15Z (GMT) No. of bitstreams: 1 thesis_anna.pdf: 24876563 bytes, checksum: 86903225a1b681abf9ea16d871b3381a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-11-10T17:47:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 thesis_anna.pdf: 24876563 bytes, checksum: 86903225a1b681abf9ea16d871b3381a (MD5) Previous issue date: 2016-04-13 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Mathematical and computational modeling of tumor growth have become valuable tools for learning and understanding various aspects of tumor onset and development. They can also help to generate new hypotheses for experimental testing and to verify the efficiency or optimize clinical therapies. From the computational point of view, a huge challenge is to deal with highly nonlinear and multi-components mathematical models that aim to display multiple types of biological interactions across different biological, temporal and physical scales. Computational and numerical difficulties usually appear. Also, nonlinear interactions may give rise to interesting and unexpected dynamics which make it difficult to anticipate a model's outcome. Here we make a step towards developing a model-building framework to improve the understanding of the model itself and the key issues to drive model modifications and simplifications. We develop a family of deterministic tumor growth models based on a mathematical model built in the literature, which is a continuous model of seven coupled nonlinear partial differential equations that can capture both avascular and vascular phases of the disease. Although simple, this model provides considerable insight about important mechanisms related to tumor progression, as angiogenesis, for example, which is the fundamental strategy tumors acquire to keep and improve growth. Its main assumptions and mathematical formulation are discussed in details, and we propose some modifications to fix ambiguities in the original model. The extension to multidimensional problems is considered, for which we develop reliable approximate finite element solution. We propose in this work a simple framework to build a hierarchical family of tumor growth models by selecting a subset of the most important parameters of our base model with respect to the evolution of the tumor volume. The importance of each parameter is identified through two model-free sensitivity analysis techniques, the construction of scatterplots and the elementary effects, due to their simplicity and low computational costs. This model framework encompasses the essential hypotheses and the limited set of important parameters acquired from the sensitivity analysis. In this way, we are able to create a family of models described by at least the same essential conditions and parameters but with different complexities regarding the number of parameters used. Numerical experiments are conducted to provide a comprehensive understanding of the hierarchical developed family of tumor growth models. Finally, we emphasize that the modeling framework in this manner provides a powerful way for studying a model itself or either its simplification or extension. The framework can also be tailored to form the basis for future models, incorporating new processes and phenomena. / A modelagem matemática e computacional do crescimento tumoral tornou-se uma ferramenta importante para o aprendizado e entendimento de vários aspectos relacionados ao surgimento e desenvolvimento de tumores. Esta ferramenta é também capaz de ajudar a construir novas hipóteses para testes experimentais, verificar a eficiência e até mesmo otimizar terapias. Do ponto de vista computacional, um grande desafio consiste em resolver e entender modelos matemáticos não-lineares com múltiplos componentes que objetivam representar interações que ocorrem em diferentes escalas biológicas, de tempo e espaço. Dificuldades numéricas e computacionais ocorrem frequentemente. Interações não-lineares dão também origem a dinâmicas interessantes e até mesmo inesperadas, dificultando antecipar os resultados de muitos modelos. Neste trabalho, dá-se um passo na direção do desenvolvimento de uma abordagem para a construção de modelos que permite tornar mais claro o entendimento destes e de seus aspectos-chave, auxiliando modificações e simplificações para tornar o processo de modelagem mais simples. Desenvolvemos uma família de modelos determinísticos para o crescimento tumoral baseada em um modelo não-linear e contínuo apresentado na literatura que contém sete equações diferenciais parciais acopladas, capaz de capturar as fases avascular e vascular da doença. Embora simples, este modelo proporciona o entendimento dos importantes mecanismos relacionados à progressão de tumores, como a angiogênese, por exemplo, que é a estratégia utilizada por um tumor para manter e impulsionar seu crescimento. As principais hipóteses e formulação matemática deste modelo-base são discutidas em detalhes, e algumas modificações são propostas para corrigir ambiguidades presentes no modelo original. A extensão para problemas multidimensionais é considerada, para a qual desenvolvemos uma solução robusta de elementos finitos. Neste trabalho, propomos uma abordagem simples para a construção de uma família hierárquica de modelos de crescimento tumoral através da seleção do conjunto de parâmetros mais importantes de um modelo-base com respeito à evolução do volume tumoral. A importância de cada parâmetro é identificada através de duas técnicas de análise de sensibilidade consideradas simples, de baixo custo computacional e independentes do modelo utilizado: a construção de scatterplots e efeitos elementares. A abordagem de modelagem inclui as hipóteses essenciais e um conjunto limitado de parâmetros identificados como importantes na análise de sensibilidade. Deste modo, é possível criar uma família de modelos descrita no mínimo pelas mesmas condições essenciais e parâmetros importantes, mas com diferentes complexidades com relação ao número de parâmetros utilizados na modelagem. Experimentos numéricos são realizados para promover o entendimento sobre a família hierárquica de modelos desenvolvida. Finalmente, enfatizamos que a abordagem de modelagem desenvolvida desta maneira proporciona um potencial mecanismo para estudar um modelo e suas simplificações e extensões. Esta abordagem pode ser ajustada para formar a base para modelos futuros, incorporando novos processos e fenômenos.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-10-18T15:16:47Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AssociacaoVirusHepatite.pdf: 1554172 bytes, checksum: 79bd1f6cb07a5a68c3957404775a1deb (MD5) / Approved for entry into archive by Irvana Coutinho (irvana@ufpa.br) on 2017-11-08T15:15:17Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AssociacaoVirusHepatite.pdf: 1554172 bytes, checksum: 79bd1f6cb07a5a68c3957404775a1deb (MD5) / Made available in DSpace on 2017-11-08T15:15:17Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AssociacaoVirusHepatite.pdf: 1554172 bytes, checksum: 79bd1f6cb07a5a68c3957404775a1deb (MD5) Previous issue date: 2012-06-25 / Vários estudos têm demonstrado associação de sistemas de grupos sanguíneos com diversas patologias. Neste contexto este trabalho teve como objetivo investigar associação entre o vírus HCV e os grupos sanguíneos ABO e Rh em doadores de sangue da Fundação Hemopa no período de 2000 a 2010. Entre janeiro de 2000 a dezembro de 2010 foram analisadas 565.614 amostras de indivíduos que doaram sangue no Hemopa, sendo destes 1064 apresentaram teste reagente para pesquisa sorológica do HCV, 1246 inconclusivos e 563304 negativos. Entretanto, foram incluídos neste estudo somente os doadores de sangue que não possuíam qualquer tipo de co-infecção para nenhuma outra patologia pesquisada, de naturalidade paraense e pele de cor parda. Após, a seleção destes critérios gerou-se um tamanho amostral de 838 (0,15%) soropositivos, 1181 (0,21%) inconclusivos e 551.991 (99,64%) soronegativos de um total de 554.010 doadores de sangue. Para o diagnóstico sorológico da hepatite C foram empregados testes sorológicos de ELISA (Ensaio Imunoenzimático) de 4ª geração para detecção de anticorpos específicos anti-HCV no soro dos doadores e nas amostras de resultado positivo pela sorologia (ELISA) foi realizado extração do RNA viral. Os grupos sanguíneos ABO e Rh foram determinados através das pesquisas de antígenos A e/ou B, de anticorpos anti-A e/ou anti-B e de antígeno Rh(D) na amostra sanguínea do indivíduo. Ao longo destes anos observou-se que a soroprevalência de anticorpos HCV específico nos doadores de sangue vem sofrendo redução, variando de 132 a 38 casos sororeagentes. A maioria dos doadores estavam entre a faixa etária de 30 a 49 anos (57,64%), pertencendo predominantemente ao sexo masculino 74.5% (624/838) e procedentes de Belém 72,5% (607/838). Comparando a distribuição dos fenótipos do sistema de grupo sanguíneo ABO e Rh entre o grupo de doadores sororeagentes e não reagentes ao HCV, verificou-se que não há variação significativa na frequência destes fenótipos entre os doadores reagentes e não reagentes na pesquisa de anticorpos HCV específicos. Dos doadores de sangue que apresentaram resultado de PCR, quando comparado com os grupos sanguíneos ABO e Rh dos pacientes não se observou associação entre eles. / Several studies have demonstrated association of blood group systems with different pathologies. Therefore, this work aimed to investigate the association between HCV and blood groups ABO and Rh blood donors Hemopa Foundation from 2000 to 2010. Between January 2000 and December 2010 were analyzed 565,614 samples from individuals who donated blood in Hemopa, and 1064 showed these test reagent for HCV serologic survey, 1246 inconclusive and 563.304 negative. However, this study included only those blood donors who did not have any kind of co-infection to any other pathology researched, naturally Pará and brown skin. After the selection of these criteria led to a sample size of 838 (0.15%) seropositive in 1181 (0.21%) inconclusive and 551,991 (99.64%) seronegative for a total of 554.010 blood donors. For serological diagnosis of hepatitis C were used serological test ELISA (enzyme immunoassay) 4th generation for detection of specific anti-HCV in the serum of donors and the samples positive by serology (ELISA) was carried out extraction of viral RNA. The ABO and Rh blood groups were determined by the research of antigens A and / or B, anti-A and / or anti-B antibodies and Rh (D) antigens in the blood sample from the individual. Over the years we found that the seroprevalence of HCV-specific antibodies in blood donors has undergone reduction, ranging from 132 to 38 cases reactive serum. Most donors were between the age group 30-49 years (57.64%), belonging to the predominantly male 74.5% (624/838) and coming from Belém 72.5% (607/838). When the distribution of the phenotypes of the ABO and Rh blood groups systems between the donor reactive serum and non-reactive to HCV, it was found that no significant variation in the frequency of these phenotypes donor reagents and reactants in the non-HCV-specific antibodies. Donor blood PCR results showed that when compared to Rh and ABO blood groups of patients there was no association between them.

Submitted by Cássio da Cruz Nogueira (cassionogueirakk@gmail.com) on 2017-10-18T16:04:54Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AvaliacaoFuncoesNeurologicas.pdf: 2607715 bytes, checksum: fc59c0313010dbe1d99be8952a633716 (MD5) / Approved for entry into archive by Edisangela Bastos (edisangela@ufpa.br) on 2017-12-01T13:38:39Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AvaliacaoFuncoesNeurologicas.pdf: 2607715 bytes, checksum: fc59c0313010dbe1d99be8952a633716 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-12-01T13:38:39Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertacao_AvaliacaoFuncoesNeurologicas.pdf: 2607715 bytes, checksum: fc59c0313010dbe1d99be8952a633716 (MD5) Previous issue date: 2016 / Apesar de curável, a hanseníase ainda representa um relevante problema de saúde pública. Trata-se de uma doença infecciosa crônica causada pelo Mycobacterium leprae e caracterizada por acometimento dermatoneurológico, que quando não tratado adequadamente pode levar a graves incapacidades. A avaliação das funções neurológicas do paciente é de relevante importância para o diagnóstico precoce e tratamento das lesões dos nervos periféricos. Tendo em vista a quantidade de exames subjetivos presentes na avaliação neurológica do hanseniano e preocupando-se com a sua consistência em mostrar, de forma fidedigna, a situação dos pacientes, este estudo busca correlacionar as queixas clínicas apresentadas pelos hansenianos com os achados sensitivos e motores de membros superiores e inferiores. Para isso, foi realizado um estudo do tipo transversal analítico composto de duas etapas. A primeira etapa contou com 97 hansenianos, atendidos no serviço entre os anos de 2014 e 2015, neles foi aplicada a avaliação neurológica simplificada, na qual foram feitos o exame de palpação de nervos, teste de força muscular, teste de sensibilidade tátil em mãos e pés com monofilamentos de Semmes-Weinstein, além da coleta da queixa clínica. Para a segunda etapa foram selecionados aleatoriamente 14 pacientes, que foram submetidos também aos testes de sensibilidade superficial (térmica, dolorosa e tátil) no trajeto dos nervos mais comumente afetados. Para análise dos dados foram utilizados o teste de Qui-quadrado, teste G e teste t, quando pertinentes à comparação com o esperado para população ou entre grupos. Para correlação de variáveis ordinais o teste correlação de Spearman, considerando-se o nível alfa de significância igual a 0,05. Dos 97 hansenianos, 77 (79,4%) apresentaram queixas, sendo as mais comuns aquelas relacionadas às fibras sensoriais, entre elas dor e dormência foram as mais referidas. À palpação, o nervo ulnar e o tibial foram os mais acometidos e os pacientes multibacilares apresentaram maiores médias de nervos acometidos e maior dano sensitivo. O dano motor não foi muito comum entre os pacientes, mas os baixos índices de força muscular encontrados foram relacionados com estágios de dano sensitivo mais elevados, maior grau de incapacidade e maior quantidade de nervo acometida. Quando comparados quanto à ocorrência de queixa, os pacientes queixosos apresentaram estágios de dano sensitivo mais avançados, grau de incapacidade mais elevado em membros inferiores e ocorrência de dano motor com maior freqüência, porém o tipo de queixa não influenciou esses resultados. Na avaliação da sensibilidade superficial no trajeto do nervo, observou-se uma maior ocorrência de alterações sensitiva também entre os queixosos, sendo a térmica a mais afetada. Percebe-se, então, que os pacientes queixosos estão mais sensíveis aos danos sensitivo e motor, ao elevado grau de incapacidade, e à alteração de sensibilidade em trajeto de nervo. Portanto, os profissionais de saúde devem ficar atentos com este grupo de paciente, destinando maior atenção no momento da avaliação a fim de evitar as temidas incapacidades. / Although curable, leprosy is still a major public health problem. This is a chronic infectious disease caused by Mycobacterium leprae and characterized by dermatological and neurological involvement. If not treated, this disease can lead to serious disability. The evaluation of the neurological function of the patient is very important for the early dignosis and treatment of nerves damage. The exams in neurological evaluation of leprosy are too subjective. This study, worrying about the consistency of neurological evaluation in showing in a reliable manner the situation of patients, aims to correlate the clinical complaints from leprosy patients with sensory and motor findings in upper and lower limbs. For this, an analytical cross-sectional study was conducted in two steps. The first stage included 97 leprosy patients treated at the service between the years 2014 and 2015, in them was applied the simplified neurological evaluation, which was made the examination of nerve palpation, voluntary muscle strength test, tactile sensitivity test at hand and feet with Semmes-Weinstein, in addition to the collection of clinical complaints. For the second stage were randomly selected 14 patients who were submitted to surface sensitivity tests (thermal, painful and tactile) in the path of the most commonly affected nerves. Data analysis was performed using the chi-square test, G test and t test, when relevant to the comparison with the population or between groups. For correlation ordinal variables the Spearman correlation test, considering the alpha significance level of 0.05. Of the 97 leprosy patients, 77 (79.4%) had complaints, the most common being those related to sensory fibers, including pain and numbness were the most mentioned. On palpation, the ulnar nerve and tibial were the most affected and multibacillary patients had higher averages of affected nerves and most sensitive damage. Engine damage was not very common among patients, but low levels of muscle strength found were related to higher sensory damage stages, higher degree of disability and greater amount of affected nerve. When compared to the occurrence of complaint, the complainants patients had more advanced stages of sensory damage, higher degree of disability in the lower limbs and motor damage occurring more frequently, but the type of complaint did not influence these results. In the evaluation of the surface sensitivity in the nerve pathway, there was a higher incidence of sensory changes also among the plaintiffs, and the heat the most affected. It is clear, then, that the complainants patients are more sensitive to sensory and motor damage, the high degree of disability, and the sensitivity of changes in nerve path. Therefore, health professionals should be alert to this patient group, allocating more attention at the time of evaluation in order to avoid the dreaded disabilities.