Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2016-08-05T10:36:05Z No. of bitstreams: 2 Tese - Herika Xavier da Costa - 2015.pdf: 2103590 bytes, checksum: f8dd254901af7084719caef9647c0af2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-08-05T15:01:18Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Herika Xavier da Costa - 2015.pdf: 2103590 bytes, checksum: f8dd254901af7084719caef9647c0af2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-05T15:01:18Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Herika Xavier da Costa - 2015.pdf: 2103590 bytes, checksum: f8dd254901af7084719caef9647c0af2 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2015-04-23 / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de Goiás - FAPEG / Anaplasma platys and Ehrlichia canis are obligate intracellular rickettsial organisms of dogs. A. platys appear to parasitize only platelets causing canine infectious cyclic thrombocytopenia (CICT), whereas E. canis has tropism for circulating mononuclear cells causing canine monocytic ehrlichiosis (CME). Clinical signs of CME and CICT are nonspecific and common to many other diseases transmitted by ticks. Definitive diagnosis of A. platys and E. canis is made by specific diagnostic tests; however, two new real time PCR protocols (qPCR) for the detection of A. platys and E. canis were developed from reference sequences for the 16S rRNA gene of A. platys and E. canis. New primers and probes were able to detect A. platys and E. canis. Identification of natural infections in dogs by A. platys and E. canis, previously confirmed by conventional PCR, showed high correlation sensitivity (100% for A. platys and E. canis) and epidemiological specificity (100% for A. platys and 98,41% for E. canis) with new qPCR using hydrolyses probe (TaqMan) protocols Analytical specificity tests produced species-specific results, not occurring DNA amplification of the following blood parasites Babesia vogeli, Hepatozoon canis and Mycoplasma haemofelis. R. sanguineus DNA. Two new qPCR protocols described were able to detect 0,14 fg of E. canis DNA and 0,9 fg of A. platys DNA and represent alternative as a diagnostic tool for the specific detection of A. platys and E. canis being useful for diagnosis of these canine hemoparasitosis. Ocular abnormalities are among the clinical signs found in dogs infected with E. canis and cases of uveitis have been attributed to infection with A. platys, but the frequency of eye injuries in cases of infection with A. platys is still unknown. After searching the frequency of infections by A. platys and E. canis in 100 dogs with ocular (OA) and 100 dogs without ocular alterations (WOA), using the PCR as a diagnostic method, we found that among the hemoparasites, A. platys and E. canis detected and identified by PCR, E. canis was the most frequent, both in the group of OA dogs (33%; 33/100) and in the group of WOA dogs (24%; 24 / 100). The frequency of A. platys was 5% (5/100) for the group of OA dogs and 4% (4/100) for the group of WOA dogs. Ocular changes associated with infection by E. canis were bilateral uveitis and retinal detachment. It was not possible to verify the relationship of ocular manifestations with infection by A. platys due to the low number of dogs with ocular abnormalities infected with this rickettsia. / Anaplasma platys e Ehrlichia canis são riquétsias intracelulares obrigatórias de cães. A. platys parasita plaquetas causando a trombocitopenia cíclica infecciosa canina (TCIC), enquanto que E. canis possui tropismo por células mononucleares circulantes, causando a erliquiose monocítica canina (EMC). Os sinais clínicos da EMC e TCIC são inespecíficos e comuns a inúmeras outras enfermidades transmitidas por carrapatos. O diagnóstico definitivo de E. canis e A. platys é firmado através do emprego de testes de diagnóstico específicos. Dessa forma, dois novos protocolos de ensaios de PCR em tempo real (qPCR) para o detecção de A. platys e E. canis foram desenvolvidos a partir de sequências de referência para o gene 16S rRNA de A. platys e E. canis. Os novos iniciadores e sondas desenhados foram capazes de detectar A. platys e E. canis. Identificação de infecções naturais em cães por A. platys e E. canis, previamente confirmada por PCR convencional demonstrou alta correlação na sensibilidade (100% para A. platys e E. canis) e especificidade epidemiológicas (100% para A. platys e 98,41% para E. canis) com os novos protocolos de qPCR utilizando sondas de hidrólise TaqMan. Os testes de especificidade analítica produziram resultado espécie específicos, não ocorrendo amplificação de DNA dos seguintes hemoparasitos: Babesia vogeli, Hepatozoon canis e Mycoplasma haemofelis. DNA de Rhipicephalus sanguineus também não foi amplificado. Os dois novos protocolos de qPCR descritos aqui foram capazes de detectar até 0,14 fg de DNA de E. canis e 0,9 fg de DNA de A. platys e representam alternativas como ferramenta de diagnóstico para a detecção específica de A. platys e E. canis, sendo útil para o diagnóstico dessas hemoparasitoses em cães. As alterações oculares estão entre os sinais clínicos encontrados em cães infectados com Ehrlichia canis e casos de uveítes já foram atribuídos a infecção por A. platys, porém a frequência de lesões oculares em casos de infecção por A. platys ainda é desconhecida. Após pesquisar a frequência de infecções por E. canis e A. platys em 100 cães com alterações oculares (CAO) e 100 cães sem alterações oculares (SAO), utilizando-se a PCR como método de diagnóstico, verificou-se que dentre os hemoparasitos, E. canis e A. platys, detectados e identificados por PCR, E. canis foi o de maior frequência, tanto no grupo de cães CAO (33%; 33/100) quanto no grupo de cães SAO (24%; 24/100). A frequência de A. platys foi de 5% (5/100) para o grupo de cães CAO e 4% (4/100) para o grupo de cães SAO. As alterações oculares que apresentaram relação com a infecção por E. canis foram uveíte bilateral e descolamento de retina. Não foi possível verificar a relação das alterações oculares com a infecção por A. platys devido ao baixo número de cães com alterações oculares infectados com esta riquétsia.

Heterotaxy refers to the abnormal arrangement of internal organs in relation to each other. Model organism studies have shown that functions of more than eighty genes are required for normal asymmetric left-right organ development. CRELD1 has been shown to be necessary for proper heart development and mutations in CRELD1 are known to increase risk of cardiac atrioventricular septal defects (AVSD). AVSD is the most common form of heart defect associated with heterotaxy, and we have previously shown that some individuals with heterotaxy-related AVSD have mutations in CRELD1. Therefore, we propose to examine the CRELD1 gene in a large sample of patients with heterotaxy syndrome. Our goal was to determine if mutations in CRELD1 are associated with other manifestations of heterotaxy or if they only coincide with AVSD. To achieve this aim, a sample size of 126 patients with heterotaxy collected by Dr. Belmont, Baylor college of Medicine, Texas, with approximately 66% of the heterotaxy population with different types of heart defects, were used for this study. Ten exons, promoter regions, and regulatory elements in the introns of CRELD1 gene were sequenced and analyzed. In this study three different heterozygous missense mutations in CRELD1 were identified in three unrelated individuals. These three individuals were diagnosed with different forms of heart defects in addition to AVSD. All three mutations were identified in highly conserved regions of CRELD1 possibly altering the CRELD1 properties. This demonstrates that mutations in CRELD1 may increase the susceptibility of AVSD in heterotaxy population. This information can help us to find factors effecting disease susceptibility in heterotaxy patients since the heart defects are a complex trait with incomplete penetrance.

Hereditary Colorectal Carcinomas – Reflection on Preventive Surgery Hereditary Nonpolyposis Colorectal Cancer (HNPCC) accounts for about 5% of all colorectal cancers and is the most frequent familial form; familial adenomatous polyposis coli accounts for about 1%. Prerequisitive for individually tailored surveillance is the identification of the pathogenic germline mutation. In classical FAP, surgical standard is a restorative proctocolectomy while in HNPCC there is no surgical standard other than standard oncological resection due to missing evidence. In HNPCC, prophylactic colectomy before the onset of the first colorectal cancer is not recommended. Main arguments for the extension of the resection in the case of the first colorectal carcinoma in HNPCC are the rate of metachronous colorectal carcinomas of 40–45% in a 10-year interval and rapid tumor progression. In HNPCC, in the case of first colon cancer a subtotal colectomy seems to be indicated. A proctocolectomy or, if indicated, a restorative proctocolectomy may be considered in the case of carcinomas in the lower rectum. These considerations should be evaluated in a prospective clinical trial. Counselling, molecular diagnosis and surgery in patients with hereditary colorectal cancers should only be performed in interdisciplinary centers. / Das «Hereditary Nonpolyposis Colorectal Cancer» (HNPCC)-Syndrom bildet mit zirka 5% aller kolorektalen Karzinome die größte Gruppe der familiären Formen; die familiäre adenomatöse Polyposis coli (FAP) macht zirka 1% aus. Voraussetzung für die Indikationsstellung zu individuellen Vorsorgeprogrammen ist die Identifizierung der pathogenen Keimbahnmutation. Bei der klassischen FAP ist die Durchführung einer restaurativen Proktokolektomie die Therapie der Wahl, beim HNPCC-Syndrom gibt es aufgrund fehlender Daten klinischer Studien noch keinen Operationsstandard, der über eine Resektion entsprechend den onkologischen Resektionsprinzipien hinausgeht. Eine prophylaktische Kolektomie vor Manifestation eines kolorektalen Karzinoms bei HNPCC kann bei der gegenwärtigen Datenlage nicht empfohlen werden. Hauptargumente für die Erweiterung des Eingriffs bei manifestem kolorektalem Karzinom bei HNPCC-Patienten sind das Risiko metachroner kolorektaler Karzinome von 40–45% in einem Zeitraum von 10 Jahren und die rasche Tumorprogression. Bei Erstmanifestation eines Kolonkarzinoms erscheint die Durchführung einer subtotalen Kolektomie indiziert. Bei Erstmanifestation des Karzinoms im unteren Rektumdrittel ist die Durchführung einer Proktokolektomie bzw. unter entsprechenden onkologischen und funktionellen Voraussetzungen eine Kolektomie mit Proktomukosektomie und Ileum-Pouch zu erwägen. Die Evaluierung dieser Überlegungen sollte im Rahmen einer prospektiven klinischen Studie erfolgen. Die Beratung, molekulare Diagnostik und chirurgische Therapie von Patienten mit hereditären kolorektalen Karzinomen sollte zunächst nur entsprechenden interdisziplinären Zentren vorbehalten bleiben. / Dieser Beitrag ist mit Zustimmung des Rechteinhabers aufgrund einer (DFG-geförderten) Allianz- bzw. Nationallizenz frei zugänglich.

The objective of this thesis research is to develop microelectronic acoustic technology towards biosensor applications. The development of a simple and robust resonator that employs simple microelectronic fabrication techniques for its construction could provide the foundation for a cost-effective sensor platform. Subsequent development of an appropriate surface chemistry treatment would functionalize the resonator as a biosensor. Implementation of this design in an array configuration allows for the development of ligand microarrays, which subsequently allows for multi-ligand recognition signatures as well as testing redundancy. The applications for such a tool extend to a myriad of applications, but the focus of this research is to develop this technology towards an early cancer detection capability. Specifically, I develop a solidly-mounted resonator with thin-film ZnO as my active piezoelectric layer. These resonators undergo an extensive development process to arrive at a final device design and are fully characterized throughout by X-ray diffraction and scattering analysis. Employing silane chemistry, these resonators are functionalized as immunosensors by covalently binding antibodies to the surface of the device. The quality of the surface chemistry is fully assessed using water contact angle, atomic force microscopy and confocal laser scanning microscopy. Functionalized biosensors are then used to quantify the concentration of known proteins marker in both a purified medium and a physiologically-relevant medium.

Thesis (M.S.)--Mississippi State University. Forest Products Department. / Title from title screen. Includes bibliographical references.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:21Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-07-06Bitstream added on 2014-06-13T20:16:37Z : No. of bitstreams: 1 piza_vmt_me_jabo.pdf: 496784 bytes, checksum: 8e82f3b02d746dfe3daa52fd23b8be9e (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Nesse estudo foi desenvolvido e aplicado o procedimento de imunocaptura para realizar a reação de transcrição reversa seguida pela reação em cadeia da polimerase (IC-RT-PCR) a fim de ser amplificada uma região 5'_ proximal do gene 81 do vírus da bronquite infecciosa (VBI) com 228 pb e de forma a fazer a detecção e a diferenciação desse vírus, comparando-se os resultados dessa metodologia com os obtidos na técnica convencional de RT-PCR. Todas as 11 estirpes do VBI testadas foram amplificadas pelas duas técnicas moleculares, enquanto que nenhum dos vírus heterólogos (Pneumovírus Aviário do grupo A e B, Vírus da Doença de Gumboro e o Vírus da Doença de Newcastle) ensaiados levaram a amplificação específica do gene 81. O limiar de detecção para a técnica de IC-RT-PCR foi idêntico ao do método de RT-PCR e correspondeu a 102.8 Doses Infectantes Embrionárias 50%. Para um total de 35 amostras de tecidos do trato respiratório testadas e provenientes de aves infectadas experimentalmente, 32 foram positivas pela técnica de IC-RT-PCR e também pela RT-PCR convencional, enquanto que o isolamento viral foi obtido para 22 dessas amostras. A análise do produto amplificado do gene 81 na IC-RT-PCR através da técnica de RFLP (restriction fragment length polymorphism), com as enzimas Alul e Mboll, permitiu a diferenciação das 5 estirpes de referências e dos 6 isolados de campo analisados em 4 diferentes genótipos, correspondentes às estirpes de referência M41, Connecticut, ou 8E-17, ou a um isolado de campo. Portanto, a técnica de IC¬RT -PCR demonstrou um grande potencial para ser aplicada no diagnóstico direto do VBI, apresentando vantagens sobre a técnica convencional de RT-PCR, as quais foram derivadas da combinação da especificidade da imunocaptura em fase sólida com a sensibilidade da reação de PCR, o que pode proporcionar ganho de tempo e menor custo para a manipulação de um maior número de amostras. / In this study, the immunocapture procedure followed by reverse transcription and polymerase chain reaction (IC-RT-PCR) technique was standardized and applied for the amplification of 5'- proximal pari of 81 gene of infectious bronchitis virus (IBV) in infected f1uid or tissue samples, which were collected from embryonating chicken eggs or experimentally infected birds. The results of this technique were compared with those obtained in conventional RT-PCR. Ali eleven IBV strains tested were amplified, while none of the heterologous avian viral pathogens (Groups A and B Avian Pneumovirus, Newcastle Disease Virus and Gumboro Disease Vírus) gave positive results. The limit of detection for IC-RT¬PCR was identical to the common RT-PCR and corresponded to 102.8 50% embryonic infectious doses. Thirty two out of thirty five respiratory tissue samples collected from experimentally infected chickens were positive by both molecular techniques (IC-RT-PCR I common RT-PCR), whereas the vírus isolation test detected IBV in twenty two of these samples. The AluL and Mobll RFLP analysis of the 228 bp amplicon generated from IC-RT-PCR led to the discrimination of the 5 reference strains and 6 field IBV isolates in four genotypes; which were associated to the M41, to Connecticut, ar to 8E-17 strain, or to a field isolate. Therefore, the IC-RT-PCR demonstrated in this study a high potential for the application in the direct diagnosis of IBV and has relevant advantages over the conventional RT¬PCR, because it combines the specificity of the immunocapture in a solid phase with the sensitivity of the PCR, providing simplicity, rapidity and low cost for the manipulation of a high number of samples.

Orientador: Hélio José Montassier / Banca: Liana Brentano / Banca: Maria da Glória Buzinaro / Resumo: Nesse estudo foi desenvolvido e aplicado o procedimento de imunocaptura para realizar a reação de transcrição reversa seguida pela reação em cadeia da polimerase (IC-RT-PCR) a fim de ser amplificada uma região 5'_ proximal do gene 81 do vírus da bronquite infecciosa (VBI) com 228 pb e de forma a fazer a detecção e a diferenciação desse vírus, comparando-se os resultados dessa metodologia com os obtidos na técnica convencional de RT-PCR. Todas as 11 estirpes do VBI testadas foram amplificadas pelas duas técnicas moleculares, enquanto que nenhum dos vírus heterólogos (Pneumovírus Aviário do grupo A e B, Vírus da Doença de Gumboro e o Vírus da Doença de Newcastle) ensaiados levaram a amplificação específica do gene 81. O limiar de detecção para a técnica de IC-RT-PCR foi idêntico ao do método de RT-PCR e correspondeu a 102.8 Doses Infectantes Embrionárias 50%. Para um total de 35 amostras de tecidos do trato respiratório testadas e provenientes de aves infectadas experimentalmente, 32 foram positivas pela técnica de IC-RT-PCR e também pela RT-PCR convencional, enquanto que o isolamento viral foi obtido para 22 dessas amostras. A análise do produto amplificado do gene 81 na IC-RT-PCR através da técnica de RFLP (restriction fragment length polymorphism), com as enzimas Alul e Mboll, permitiu a diferenciação das 5 estirpes de referências e dos 6 isolados de campo analisados em 4 diferentes genótipos, correspondentes às estirpes de referência M41, Connecticut, ou 8E-17, ou a um isolado de campo. Portanto, a técnica de IC¬RT -PCR demonstrou um grande potencial para ser aplicada no diagnóstico direto do VBI, apresentando vantagens sobre a técnica convencional de RT-PCR, as quais foram derivadas da combinação da especificidade da imunocaptura em fase sólida com a sensibilidade da reação de PCR, o que pode proporcionar ganho de tempo e menor custo para a manipulação de um maior número de amostras. / Abstract: In this study, the immunocapture procedure followed by reverse transcription and polymerase chain reaction (IC-RT-PCR) technique was standardized and applied for the amplification of 5'- proximal pari of 81 gene of infectious bronchitis virus (IBV) in infected f1uid or tissue samples, which were collected from embryonating chicken eggs or experimentally infected birds. The results of this technique were compared with those obtained in conventional RT-PCR. Ali eleven IBV strains tested were amplified, while none of the heterologous avian viral pathogens (Groups A and B Avian Pneumovirus, Newcastle Disease Virus and Gumboro Disease Vírus) gave positive results. The limit of detection for IC-RT¬PCR was identical to the common RT-PCR and corresponded to 102.8 50% embryonic infectious doses. Thirty two out of thirty five respiratory tissue samples collected from experimentally infected chickens were positive by both molecular techniques (IC-RT-PCR I common RT-PCR), whereas the vírus isolation test detected IBV in twenty two of these samples. The AluL and Mobll RFLP analysis of the 228 bp amplicon generated from IC-RT-PCR led to the discrimination of the 5 reference strains and 6 field IBV isolates in four genotypes; which were associated to the M41, to Connecticut, ar to 8E-17 strain, or to a field isolate. Therefore, the IC-RT-PCR demonstrated in this study a high potential for the application in the direct diagnosis of IBV and has relevant advantages over the conventional RT¬PCR, because it combines the specificity of the immunocapture in a solid phase with the sensitivity of the PCR, providing simplicity, rapidity and low cost for the manipulation of a high number of samples. / Mestre

Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2018-07-16T11:25:09Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Adailton Pereira dos Santos - 2018.pdf: 2470326 bytes, checksum: b19858377cb05cc2abd767e4560cd12a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Cláudia Bueno (claudiamoura18@gmail.com) on 2018-07-17T13:12:23Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Adailton Pereira dos Santos - 2018.pdf: 2470326 bytes, checksum: b19858377cb05cc2abd767e4560cd12a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-07-17T13:12:23Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Adailton Pereira dos Santos - 2018.pdf: 2470326 bytes, checksum: b19858377cb05cc2abd767e4560cd12a (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-06-29 / β-lactamases are enzymes that hydrolyze the β-lactam ring, inactivating the action of β-lactam antibiotics. The objective of this work was to diagnose phenotypically and molecularly 14 β- lactamase resistance genes expressed in Pseudomonas aeruginosa and to correlate the results found. A total of 99 samples of Pseudomonas aeruginosa were selected and the antibiogram was performed. Real-time PCR is being performed using the Sybr Green system to amplify the genes corresponding to the resistances found in phenotyping. Three/14 (21.4%) genes blaSME, blaOXA, blaGIM were found simultaneously in three samples. According to the statistical test, when evaluating the amplification results obtained for PPT, the molecular method was more sensitive for the detection of the gene coding for multidrug resistance, presenting values of (p <0.05). This information suggests that gene research is more sensitive and specific compared to the antibiogram. / As β-lactamases são enzimas que hidrolisam o anel β-lactâmico, inativando a ação de antibióticos β-lactâmicos. O objetivo deste trabalho foi diagnosticar fenotipicamente e molecularmente 14 genes de resistência à β-lactamases expressos em Pseudomonas aeruginosa e correlacionar os resultados encontrados. Um total de 99 amostras de Pseudomonas aeruginosa foi selecionado e o antibiograma foi realizado. A PCR em tempo real foi realizada usando o sistema Sybr Green para amplificar os genes correspondentes às resistências encontradas na fenotipagem. Das 99 amostras, 14 foram identificadas como fenotipicamente resistentes ao ATM antimicrobiano. Três/14 (21,4%) genes blaSME, blaOXA, blaGIM foram encontrados simultaneamente em três amostras. De acordo com o teste estatístico, ao avaliar os resultados de amplificação obtidos para o PPT, o método molecular foi ma s sensível para a detecção do gene que codifica a resistência a múltiplos fármacos, apresentando valores de (p <0,05). Esta informação sugere que a pesquisa genética é mais sensível e específica em comparação com o antibiograma.

Doenças tireoideanas são bastante comuns, sendo sua maioria benigna. A relação entre os diversos tipos de doenças tireoideanas, bem como seus aspectos moleculares, são pouco conhecidos. O bócio (hiperplasia), por exemplo, é descrito por alguns como relacionado com carcinoma (tumor maligno) papilífero, enquanto que outros afirmam não haver relação causal entre as duas doenças. A questão mais desafiante, porém, refere-se à distinção entre adenoma (tumor benigno) e carcinoma folicular, que atualmente é feita apenas após à cirurgia, não permitindo tratamento diferenciado para os dois tipos de tumor. Este trabalho buscou identificar genes diferencialmente expressos entre tecido tireoideano normal, bócio, adenoma e carcinoma papilífero utilizando microarrays. Carcinomas foliculares não foram incluídos devido ao número e tamanho reduzidos das amostras. Dois tipos de array foram utilizados: arrays em membranas de nylon, contendo 213 clones obtidos por DDRT-PCR de amostras de tireóide, e arrays em vidro, contendo 3800 clones ORESTES. Experimentos utilizando o primeiro tipo de array identificaram três genes diferencialmente expressos, cuja expressão foi analisada por RT-PCR em 10 amostras de cada tipo de tecido. Dois deles foram capazes de diferenciar carcinomas papilíferos de tecido normal e bócio com 89% de precisão para o tumor maligno e 80% para os tecidos não malignos. Os arrays em vidro foram utilizados para avaliar o perfil de expressão de aproximadamente 10 amostras de cada tipo de tecido tireoideano. Foram identificados 160 clones diferencialmente expressos entre quaisquer dois tipos de tecido, cujas seqüências foram determinadas e comparadas com as dos bancos de dados. Dentre os genes mais interessantes destacam-se o correspondente à ATPase Na/K, cuja expressão está reduzida nos carcinomas em relação a tecidos normais e adenomas, o da proteína PDCD4, envolvida em morte celular programada, mais expresso em adenomas e tecidos normais em comparação com carcinomas e bócios, e os da calgizzarin (S100A11) e da &#945;1-anti-tripsina, ambos mais ativos nos carcinomas do que nos demais tecidos. Todos esses genes já foram descritos como diferencialmente expressos em algum tipo de tumor. Este trabalho levou à padronização da metodologia de microarray em lâminas de vidro em nosso laboratório, bem como à identificação de genes que podem elucidar as alterações envolvidas na formação do bócio, adenoma e carcinoma papilífero. A implantação da técnica de amplificação de mRNA em nosso laboratório viabilizou a utilização de 10 amostras de carcinoma folicular, cuja massa de RNA total era insuficiente para as hibridizações. Essas amostras serão hibridizadas, juntamente com 10 amostras de adenoma, com microarrays contendo 4800 genes humanos conhecidos para a busca de genes diferencialmente expressos, de grande interesse diagnóstico. / Thyroid diseases are very common and are usually benign. The causal relationships among the different types of disease, as well as their molecular aspects, are not well understood. The goiter (hyperplasia), for instance, is described by some as related to papillary carcinoma (a malignant tumor), while others say there is no causal relationship between the two diseases. The most defying question, however, concerns the distinction between adenoma (benign tumor) and follicular carcinoma, which is currently made only after surgery, not allowing distinct treatments for the two kinds of tumor. This work aimed to identify differentially expressed genes among normal thyroid tissue, goiter, adenoma and papillary carcinoma using microarrays. Follicular carcinomas were not included due to the reduced number and size of the samples. Two kinds of array were used: arrays in nylon membranes, with 213 clones isolated from thyroid samples by differential display (DDRT-PCR); and glass slide arrays containing 3800 ORESTES clones.Experiments using the first type of array identified three differentially expressed genes, whose expression was analyzed by RT-PCR in 10 samples of each kind of tissue. Two of these genes were able to differentiate papillary carcinomas from goiters and normal tissues with precisions of 89% for the malignant tumor and 80% for the non-malignant tissues. Glass slide arrays were used to evaluate gene expression profile of approximately 10 samples of each type of thyroid tissue. 160 clones differentially expressed between any two tissues were identified, and their sequences were determined and compared with databases. Among the most interesting genes are Na/K ATPase gene, whose expression is reduced in carcinomas compared to normal tissues and adenomas, the gene corresponding to PDCD4 protein, involved in program cell death, with elevated expression in adenomas and normal tissues than carcinomas and goiters, and the genes of calgizzarin (S100A11) and &#945;1-antitrypsin, both more active in carcinomas than the other tissues. All these genes have already been described as differentially expressed in at least one type of human cancer. This work led to the standardization of glass slide microarray technology in our laboratory, and to the identification of genes that may clarify the alterations involved in the formation of goiter, adenoma and follicular carcinoma. The implementation of mRNA amplification technique in our laboratory allowed the utilization of 10 samples of follicular carcinoma, whose mass was insufficient for microarray hybridizations. These samples will be hybridized along with 10 samples of adenomas, with microarrays containing 4800 known human genes to search for differentially expressed genes, of great diagnostic interest.

Orientador: Márcio Garcia Ribeiro / Resumo: A leptospirose permanece como uma das zoonoses mais prevalentes de origem bacteriana em todo o mundo, particularmente em países de clima tropical. Devido às características peculiares das leptospiras, a doença é negligenciada ou subdiagnosticada em animais de produção. A maioria dos estudos com bovinos têm focado a doença apenas em vacas. Neste cenário, em virtude dos riscos de infecção do trato reprodutivo de touros e da eliminação do patógeno pelo sêmen, o presente estudo investigou a soroaglutinação microscópica (SAM) com antígenos vivos em 203 touros bovinos adultos em idade reprodutiva, em regime de monta natural, sem sinais aparentes de orquite ou inflamação de glândulas acessórias. Simultaneamente, o sêmen dos touros foi submetido ao exame andrológico e a reação em cadeia pela polimerase (PCR) convencional utilizando o gene 16S rRNA. Resultados positivos na PCR convencional foram confirmados por sequenciamento. A sêmen plasma aglutinação (SPA) modificada foi realizada substituindo o soro sanguíneo pelo plasma seminal no teste da SAM. O ejaculado de oito (8/203=3,9%) touros foi considerado inapto à reprodução (necrospermia e azoospermia). Não foram identificadas aglutininas anti-Leptospira na SPA. Foi observada alta frequência (132/203=65%) de títulos na SAM, particularmente para sorovares do sorogrupo Sejroe, e.g., Hardjo CTG (100/203=49,3%), Wolffi (74/203=36,4%), Guaricura (72/203=35,5%) e Hardjoprajitno (56/203=27,6%). O sêmen de três (3/203=1,5%) touros foram posit... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor