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Deriva genética de caracteres quantitativos em milho / Genetic drift of quantitative traits in maize

Zancanaro, Paolo Orlando 15 April 2016 (has links)
A obtenção de genótipos superiores no melhoramento de plantas depende da existência de variabilidade genética. A existência de coleções de germoplasma representativas e a utilização de um tamanho adequado de amostra são fundamentais para a preservação das frequências alélicas e genotípicas, diminuindo a perda de variabilidade genética e postergando o aparecimento dos efeitos da deriva genética. Assim, teve-se como objetivo avaliar os efeitos da deriva genética em caracteres quantitativos em subpopulações de milho. Este estudo foi realizado a partir das populações originais BR-105 e BR-106, das quais 10 subpopulações foram obtidas em cada um dos cinco ciclos sucessivos de amostragem com tamanho efetivo reduzido, totalizando 50 subpopulações para cada população original, as quais foram posteriormente autofecundadas, gerando um nível a mais de endogamia. Os tratamentos foram constituídos de 10 amostras da população original sem autofecundação, 10 amostras com autofecundação, 50 subpopulações obtidas da população original e 50 subpopulações autofecundadas, totalizando 120 tratamentos para cada população, avaliados separadamente. Utilizou-se o delineamento em blocos casualizados no esquema de parcelas subdivididas em faixas hierárquico, em quatro ambientes com duas repetições por ambiente. Os caracteres avaliados foram produção de grãos (PG), prolificidade (PROL), comprimento e diâmetro de espigas (CE e DE), número de fileiras por espiga (NFE), número de grãos por fileira (NGF), altura de planta e espiga (AP e AE), florescimento masculino e feminino (FM e FF) e número de ramificações do pendão (NRP). Foram estimados os efeitos da deriva genética entre as médias das subpopulações nos dois níveis de endogamia e os efeitos da depressão por endogamia nas subpopulações dentro dos ciclos. Posteriormente, realizaram-se análises de regressão linear para as subpopulações nos dois níveis de endogamia, separadamente, e em conjunto. Foi verificada uma grande variação nas médias das subpopulações ao longo dos ciclos, indicando que a deriva genética causou diferenciação entre as mesmas e que estas se diferenciaram das populações originais. Detectaram-se efeitos significativos da deriva genética nas populações não autofecundadas para todos os caracteres avaliados, em maior número para PG, já que este caráter é mais sensível à deriva genética por possuir maior grau de dominância que os demais. Houve diminuição no número de estimativas de deriva significativas para as populações autofecundadas, incluindo mudanças na magnitude e no sinal das mesmas em relação às populações não autofecundadas. Para as estimativas de depressão por endogamia, os caracteres PG, NGF, FM e FF apresentaram maior quantidade de estimativas significativas que os demais. Para a maioria dos caracteres, a regressão linear explicou a maior parte da variação encontrada com o aumento dos coeficientes de endogamia. As populações BR-105 e BR-106, por terem estruturas genéticas distintas, apresentaram performances diferentes quanto aos efeitos da deriva genética. Enfim, como a deriva genética interfere na integridade genética das populações, torna-se importante considerar seus efeitos na coleta e manutenção dos bancos de germoplasma e nas populações utilizadas no melhoramento genético de plantas. / Obtaining superior genotypes in plant breeding depends on the existence of genetic variability. The existence of representative germplasm collections and the use of appropriate sample size are essential for preserving allelic and genotypic frequencies, reducing loss of genetic variability and delaying genetic drift effects. This study aimed to evaluate the effects of genetic drift in quantitative traits in subpopulations of maize. The original populations used were BR-105 and BR-106, of which 10 subpopulations were obtained in each five successive sample cycles with reduced effective size, accounting 50 subpopulations for each original population that were subsequently selfed to generate an additional level of inbreeding. The treatments consisted in 10 samples of the original population, 10 samples of the selfed original population, 50 non selfed subpopulations obtained from the original population and 50 selfed subpopulations, accounting 120 treatments for each population evaluated separately. It was used the randomized block strip-plot design, in four environments with two replications. The traits assessed were grain yield (GY), prolificacy (PROL), ear length and ear diameter (EL and ED), number of rows per ear (NRE), kernel-row number (KRN), plant and ear height (PH and EH), days to anthesis and silking (DA and DS), and number of tassel branches (NTB). It was estimated the effects of genetic drift between subpopulations means at both inbreeding levels, and the effect of the inbreeding depression in subpopulations within cycles. It was also performed linear regression analysis for subpopulations at both levels of inbreeding separately and together. A large variation was observed in the subpopulations means over cycles, indicating that genetic drift caused differentiation between them, and that they differed from the original populations. The effects of genetic drift were significant for all traits in the non selfed subpopulations, especially for GY, which is more sensitive to genetic drift effects by having a greater degree of dominance than the other traits. There was a decrease in the number of significant genetic drift estimates for selfed populations, including changes in magnitude and signs, compared to the non selfed populations. GY, KRN, DA and DS had higher number of significant inbreeding depression estimates than the other traits. Linear regression analysis explained most of the variation found with increasing homozygosity. As BR-105 and BR-106 populations have distinct genetic structures, they showed different performances regarding the effects of genetic drift. Therefore, genetic drift interferes in the genetic integrity of populations and it is important to consider its effect on the collection and maintenance of germplasm banks and populations used in plant breeding.
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Envelhecimento Populacional e Sustentabilidade: novos desafios para prote??o social em Campinas (SP) p?s 1990 / Population Aging and Sustainability: new challenges for social protection in Campinas (SP) post 1990

Gon?alves, Anderson 16 February 2018 (has links)
Submitted by SBI Biblioteca Digital (sbi.bibliotecadigital@puc-campinas.edu.br) on 2018-04-06T19:11:53Z No. of bitstreams: 1 ANDERSON GON?ALVES.pdf: 1411644 bytes, checksum: 3bd3026d048d31654ebef404968dc96b (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-06T19:11:53Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ANDERSON GON?ALVES.pdf: 1411644 bytes, checksum: 3bd3026d048d31654ebef404968dc96b (MD5) Previous issue date: 2018-02-16 / The aim of this dissertation is to apply the concept of sustainability in the analysis of social protection addressed to the elderly in the Municipality of Campinas. The aging of the Brazilian population is influencing different studies about social protection and providing arguments pro-reform of the Brazilian State, especially a reform in the Social Security System. It is a relevant national issue but population aging also imposes different challenges for sustainable development at the local level. To study this problem, it is necessary to rescue the concept of sustainability from the economic arguments, bringing social protection as an inherent right of the elderly citizen into the discussion. To do so, sustainability must be recognized as an intrinsic "value" to the social dimension, along with the economic and environmental dimensions. The study starts with a literature review on sustainability, from the one-dimensional view of the economic development to sustainable development in its multiple dimensions. Then, the study focuses on the relationship between population aging and conquest of rights, specifically, comparing the demographic data of Brazil, S?o Paulo State and the Municipality of Campinas, and describing the evolution of the legal framework aimed to the elderly in Brazil. Finally, an analysis of the social assistance services and benefits directed to the elderly population of Campinas is presented, as well as the interaction between national and local legislation. This qualitative and quantitative analysis highlights the incompatibility between the criterion of sustainable development in the social dimension and the social protection for the elderly in Campinas. The documentary research and analysis were benefited from the works published by the Instituto Brasileiro de Geografia e Estat?stica (IBGE), the Funda??o Sistema Estadual de An?lise de Dados (SEADE), the N?cleo de Estudos de Popula??o da Universidade Estadual de Campinas (NEPO-UNICAMP) and from the Instituto de Pesquisa Econ?mica Aplicada (IPEA). The analysis of the social assistance services and benefits was possible thanks to the annual report of the social assistance department of Campinas and to the data from the Ministry of Social Development (MDS). / Esta disserta??o visa aplicar o conceito de sustentabilidade na an?lise da prote??o social dirigida aos idosos no Munic?pio de Campinas. O envelhecimento da popula??o brasileira tem influenciado diferentes estudos acerca da seguridade social e instrumentalizado argumentos pr?-reforma do Estado brasileiro, em especial, a reforma no Sistema de Seguridade Social. N?o obstante a relev?ncia desse tema no ?mbito nacional, o envelhecimento populacional imp?e diferentes desafios para o desenvolvimento sustent?vel tamb?m na esfera local. Diante desta problem?tica, torna-se necess?rio resgatar o conceito de sustentabilidade dos argumentos puramente econ?micos, trazendo a prote??o social como direito inerente ao cidad?o idoso. Para tanto, a sustentabilidade precisa ser reconhecida como um ?valor? intr?nseco ? dimens?o social, equilibrando a rela??o desta dimens?o com as dimens?es econ?mica e ambiental. O estudo abarca uma revis?o bibliogr?fica acerca da sustentabilidade, partindo do desenvolvimento estritamente econ?mico at? o desenvolvimento sustent?vel nas suas m?ltiplas dimens?es. Inclui tamb?m uma an?lise da rela??o entre envelhecimento populacional e conquista de direitos sociais, comparando os dados demogr?ficos do Brasil, do Estado de S?o Paulo e do Munic?pio de Campinas e descrevendo a trajet?ria da legisla??o pertinente ao idoso no Brasil. Por fim, apresenta-se uma an?lise dos servi?os e benef?cios socioassistenciais voltados ? popula??o idosa de Campinas, observando tamb?m as interela??es entre as legisla??es nacional e municipal. Atrav?s da an?lise qualitativa e quantitativa ficou evidente a incompatibilidade entre o crit?rio de desenvolvimento sustent?vel na dimens?o social e a prote??o social realizada aos idosos em Campinas. A pesquisa e a an?lise documental foram beneficiadas pelas publica??es do Instituto Brasileiro de Geografia e Estat?stica (IBGE), da Funda??o Sistema Estadual de An?lise de Dados (SEADE), do N?cleo de Estudos de Popula??o da Universidade Estadual de Campinas (NEPO-UNICAMP) e do Instituto de Pesquisa Econ?mica Aplicada (IPEA). A an?lise dos servi?os e benef?cios socioassistenciais se deu a partir dos relat?rios de execu??o anual da pol?tica de assist?ncia social em Campinas e pelos dados do Minist?rio do Desenvolvimento Social (MDS).
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Caracterização demográfica de Phrynops hilarii (Testudines, Chelidae) em um ambiente urbano de Porto Alegre, RS, Brasil

Peres, Lísia Cristina Naud 09 July 2010 (has links)
Submitted by Mariana Dornelles Vargas (marianadv) on 2015-03-17T19:15:15Z No. of bitstreams: 1 caracterizacao_demografica.pdf: 744506 bytes, checksum: 42673cbee87c239733082fd6c361167a (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-17T19:15:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 caracterizacao_demografica.pdf: 744506 bytes, checksum: 42673cbee87c239733082fd6c361167a (MD5) Previous issue date: 2010 / Nenhuma / No presente estudo são apresentados os primeiros parâmetros populacionais para a população de Phrynops hilarii do Lago dos Pedalinhos no Parque Farroupilha (30º02'13"S; 51º13'03"W), Porto Alegre, Brasil. Esta população foi analisada quanto a sua estrutura, abundância, razão sexual e existência de dimorfismo sexual em tamanho. As capturas dos espécimes foram realizadas semanalmente entre 8:30h e 15:00h, em dois dias consecutivos, entre maio e dezembro de 2009. Todos os indivíduos capturados foram pesados, sexados (sempre que possível) e marcados com um número individual de identificação. Em adição, em cada espécime capturado foram realizadas nove medidas lineares externas. Após o fim do procedimento, todos os indivíduos capturados foram liberados no mesmo local onde foram coletados. A abundância da população foi estimada através do método para populações abertas de Jolly-Seber e a razão sexual foi obtida através da divisão do número total de machos pelo total de fêmeas. A existência de dimorfismo sexual nas medidas externas foi testada pelo teste-t, apenas para os indivíduos sabidamente adultos e de sexo conhecido. Como resultados foram capturados 53 espécimes de P. hilarii durante o período de estudo, dos quais 16 eram machos, 25 eram fêmeas e 12 indivíduos tiveram o sexo não determinado. Além disso, 77% eram adultos e 22% subadultos. A abundância populacional de P. hilarii no Lago dos Pedalinhos foi estimada em 282,67 indivíduos e a razão sexual foi significativamente diferente de 1:1 e inclinada a favor das fêmeas, com a existência de um macho para cada 1,56 fêmeas. O resultado do teste-t indicou a existência de um acentuado dimorfismo sexual no tamanho, sendo as fêmeas, de uma maneira geral, maiores que os machos, à exceção das medidas da distância máxima da base da cauda ao orifício cloacal e da distância máxima da base à ponta da cauda. Nos quelônios o dimorfismo sexual no tamanho é comum e isto poderia ser um dos fatores que influenciam na maturação e no crescimento diferencial entre os sexos de uma mesma espécie. Acredita-se que a população de P. hilarii do Lago dos Pedalinhos é resultante, principalmente, de indivíduos descartados pela comunidade local, após terem sido mantidos em cativeiro (como animais de estimação) por algum período. Os dados obtidos no presente estudo demonstram que apesar das populações de quelônios de parques urbanos estarem vivendo em áreas altamente antropizadas, elas ainda seriam capazes de manter parâmetros populacionais semelhantes aos das populações naturais de vida livre, sugerindo que estes animais seriam extremamente resistentes às pressões antrópicas. A maior causa de mortalidade dos quelônios em parques urbanos é em decorrência de maus-tratos, atropelamentos, predação e ataque de animais domésticos, bem como por poluição e competição com espécies afins que ocupam o mesmo ambiente (Trachemys dorbigni e T. scripta elegans). Por fim, as populações de P. hilarii de parques urbanos também poderiam servir de modelo na compreensão dos reais efeitos da atividade humana sob quelônios de vida livre em outras áreas impactadas. / In this study is presented the first population parameters to the population of Phrynops hilarii from “Lago dos Pedalinhos” (30º02'13"S; 51º13'03"W), an urban lake from the city of Porto Alegre – Brazil. The population structure, size, abundance, and sex ratio as well sexual dimorphism in size were analyzed. The captures and data collection were conduced weekly, between May and December 2009. All the captured specimens were weighed, sexed (whenever possible) and marked with a number of identification. In order to evaluate the differences in size between sexes nine body measurements were taken from adult males and females. After completed the procedure, all individuals captured were released in the same place that they were caught. The population abundance was estimated by Jolly-Seber method for open populations and the sex ratio was calculated by the division between the total number of males and females. The sexual dimorphism in body measurements were tested between sexes using t-test, just for adult individuals with known sex. As a result, 53 specimens of P. hilarii were captured, which 77% were adults and 22% subadults. From this total, 16 were males, 25 females and 12 were of unknown sex. The population abundance of P. hilarii in the study area was estimated in 282.67 specimens. The sex ratio was statistically different from the expected ratio 1:1 and was biased in favor of females (1 male to 1.56 females). The t-test results revealed pronounced sexual dimorphism in body size, with females being larger than males, with the exception of the tail’s measurements (CCD1 and CCD2). In chelonians the sexual dimorphism in size is common and it may be one of the factors that influence the maturation and differential growth between the sexes. It is believed that studied population is formed, mainly, by animals released by the local co mmunity, after being kept in captivity, like pets. The observed results suggest that the ch elonian populations that live in urban parks are able to keep the regular population parameters similar to the wild populations of the species, even living in highly impacted areas. In addition, it indicates that this population is extremely resistant to anthropogenic pressure. The mortality of chelonians in urban parks generally is due to direct human actions, such as maltreatment, running over, predation and by the attack of domestic animals, as well pollution and competition with related species that live in the same area (Trachemys dorbigni and T. scripta elegans). Finally, the study of chelonians from urban parks could be used as a model for under standing the real effects of the human activity on the wild populations of freshwater turtles
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Avaliação do Estoque de Caranguejo-uça, Ucides cordatus (LINNAEUS, 1763) na Zona Estuarina do Rio Pacoti, Estado do Ceará / Stock Evaluation of land crab, Ucides cordatus (Linnaeus, 1763) in the estuarine zone of Rio Packington, State of Ceará

Marques, Douglas Ferreira Marques January 2008 (has links)
MARQUES, Douglas Ferreira. Avaliação do Estoque de Caranguejo-uça, Ucides cordatus (LINNAEUS, 1763) na Zona Estuarina do Rio Pacoti, Estado do Ceará. 2008. 61 f. : Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do Ceará, Centro de Ciências Agrárias, Departamento de Engenharia de Pesca, Fortaleza-CE, 2008 / Submitted by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-07-12T14:02:04Z No. of bitstreams: 1 2008_dis_dfmarques.pdf: 990841 bytes, checksum: 24a0b10c6f0bfd72432f65da6fa87d85 (MD5) / Approved for entry into archive by Nádja Goes (nmoraissoares@gmail.com) on 2016-07-12T14:02:35Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_dis_dfmarques.pdf: 990841 bytes, checksum: 24a0b10c6f0bfd72432f65da6fa87d85 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-12T14:02:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_dis_dfmarques.pdf: 990841 bytes, checksum: 24a0b10c6f0bfd72432f65da6fa87d85 (MD5) Previous issue date: 2008 / The mangrove crab Ucides cordatus is the main fishing resource explored in North and Northeast mangrove areas in Brazil. The mangrove crab capture provide the main income form many families living along the estuaries in these areas. The U. cordatus populations have suffered intense predatory capture, coupled with high mortality rates during transport and distribution. The demand for crabs in the city of Fortaleza are steadily increasing in the last three decades, and natural populations of crabs in Ceará state’s mangroves have diminished considerably, forcing the importation of crabs from other producing centers, such as Piauí and Maranhão. This work presents information on the population structure and reproductive dynamics of U. cordatus population from the Pacoti river estuary, in the metropolitan region of Fortaleza, Ceará. Data was gathered monthly from May 2006 until July 2007, through random sampling the mangrove area. The size structure analysis showed that the largest portion of individuals were in the 35,4 --| 38,4mm and 42,1 --| 45,0mm class intervals of carapace length (CC). Males were significantly larger than females regarding carapace length and width. The CC/LC ratio of males and females, on the other hand, were not different. The determination coefficients of allometric growth (b) were tested and showed a negative allometric growth for both sexes (b<1). The reproductive period started in December and ended in May, with highest intensity in January. The smallest ovigerous females measured 30,3 mm in carapace length. The molt period began in June, ending in December with a maximum and minimum in July and September respectively, for the males, and two maximum peaks and a minimum in October, December and July, respectively, for the females. The analyses of the sex ratio by trimester showed predominance of males in the 4th trimester of 2006, whereas the females were more numerous in the 1st trimester of 2007. The mean density of mangrove crab was estimated in 2,2 crabs/m2 / O caranguejo-uçá, Ucides cordatus, é o principal recurso pesqueiro estuarino explorado nas áreas de manguezal das regiões Norte e Nordeste do Brasil tendo um grande valor sócio-econômico devido à geração de emprego e renda que o mesmo promove para as comunidades ribeirinhas. A captura predatória e alta taxa de mortalidade que os estoques regionais vêem sofrendo diminuem drasticamente as populações de U. cordatus nos principais centros produtores. O estado do Ceará há muito tempo não possui um estoque que atenda a demanda local, e a manutenção do comércio em Fortaleza só é possível devido à importação de caranguejo de grandes centros produtores, mais notadamente do Piauí e Maranhão. Este trabalho apresenta informações sobre a estrutura populacional e dinâmica reprodutiva do caranguejo-uçá que habita a região estuarina do rio Pacoti no estado do Ceará. Para a estrutura populacional observou-se que a maior concentração de indivíduos encontrava-se nos intervalos de classes de comprimento de cefalotórax de 35,4 --| 38,4 mm e 42,1 --| 45,0 mm com os machos sendo mais compridos e mais largos que as fêmeas. As análises das relações CC/LC de machos e fêmeas não mostraram diferenças significativamente estatísticas, tendo dessa forma sido comprovado que essa relação não exibiu padrões de dimorfometria sexual para essa espécie. Os coeficientes angulares de crescimento alométrico (b) foram testados e exibiram uma taxa de crescimento alométrico negativo para ambos os sexos (b<1). Em relação à determinação do período reprodutivo observou-se que o mesmo ocorre no período compreendido entre dezembro e maio com maior intensidade em janeiro e com a presença de fêmeas ovígeras a partir de 30,3 mm de comprimento de cefalotórax. O período de muda teve sua ocorrência determinada nos meses de junho a dezembro com um máximo e um mínimo em julho e setembro para os machos, respectivamente, e com dois picos máximos e um mínimo em outubro e dezembro e em julho para as fêmeas, respectivamente. As análises da proporção sexual trimestral no estuário do rio Pacoti (CE) revelaram haver predomínio dos machos no 4º trimestre de 2006 e no total de 2006, enquanto que as fêmeas prevaleceram no 1º trimestre de 2007 e no total de 2007, assim como para todo o período do estudo. A densidade média de caranguejos-uçá foi estimada em 2,2 caranguejos/m2 com uma abundância de 3,16 x 106 caranguejos
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Dinâmica populacional e distribuição vertical dos nematóides dos citros no estado de São Paulo e efeito da aplicação de aldicarb no verão

Campos, Anderson Soares de [UNESP] 31 May 2007 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-05-31Bitstream added on 2014-06-13T20:02:59Z : No. of bitstreams: 1 campos_as_dr_jabo.pdf: 498974 bytes, checksum: dae48689919324588323831a05899897 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Bayer Crop Science / Esta pesquisa foi conduzida com os objetivos de estudar a dinâmica populacional dos nematóides dos citros em duas áreas edafoclimáticas distintas de São Paulo, conhecer a distribuição dessas pragas no perfil do solo e avaliar o efeito da aplicação de aldicarb no período mais quente do ano. Os testes foram conduzidos em pomares dos Municípios de Monte Alto e de Palestina. Amostras de solo e raízes foram coletadas mensalmente por um período superior a um ano, em ambos os locais, e foram processadas no Laboratório de Nematologia da UNESP/FCAV. As curvas de tendência da flutuação de Tylenchulus semipenetrans e Pratylenchus jaehni foram traçadas. Para o estudo da distribuição vertical, foram abertas trincheiras de até 2 m de profundidade ao lado de plantas adultas e coletadas amostras em faixas de 20 cm de profundidade nos perfis. A aplicação de aldicarb no período mais quente e chuvoso do ano também foi avaliada. Os dados evidenciaram que a temperatura e a pluviosidade são os dois fatores do ambiente que regulam as populações dos nematóides dos citros em São Paulo, sendo que as curvas de tendência da flutuação de ambos os nematóides se ajustam a um modelo quadrático com os níveis de população mais baixos, nos meses mais quentes e chuvosos do ano, enquanto os picos ocorrem nos meses mais frios e secos. A maior densidade dos nematóides dos citros ocorre nos primeiros 60 cm, com maior concentração entre 20 e 40 cm. Em pomares não irrigados, a aplicação de nematicidas no final do período das chuvas é mais adequada para o controle dos nematóides que as outras épocas do ano. Aldicarb aplicado no período de janeiro a março não reduz a população dos nematóides nos pomares paulistas. / This research was carried out with the objectives of studying the population dynamics of the citrus nematodes in two distinct crop environmental conditions in São Paulo State, the distribution of these pests in the soil profile and to evaluate the effect of the application of aldicarb in the hottest period of the year. The tests were carried out in orange orchards of Monte Alto and Palestina Counties. Samples of soil and roots were monthly collected during a period of more than one year in both places and were processed in the Laboratório de Nematologia of the UNESP/FCAV. The curves of fluctuation of Tylenchulus semipenetrans and Pratylenchus jaehni were draw prepared. For the study of vertical distribution trenches of up to 2 m deep in the soil were opened at the side of plants adults and samples were collected at the profile in 20 cm bands. The application of aldicarb in the hottest and rainy period of the year was also evaluated. The data evidenced that temperature and rainfall are the two environmental factors that regulate nematode populations on citrus in São Paulo. The fluctuation curves of both nematodes adjust to a quadratic model with the lower levels of the populations in hottest and rainy months, while the peaks occur during the coldest and driest months. The highest density of the citrus nematodes occurs in the first 60 cm of the soil profile, with higher concentration between 20 and 40 cm deep. In mom irrigated orchards, nematicide application at the end of the rainfall period is more suited for nematode control than the other months of times during) the year. Aldicarb applied in the period from January to March does not reduce the nematode populations in São Paulo orchards.
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Din?mica populacional do caranguejo-u??, Ucides cordatus (Linnaeus, 1763) (CRUSTACEA, BRACHYURA, UCIDIDAE) no munic?pio de Porto do Mangue, litoral norte do estado do Rio Grande do Norte

Alencar, Carlos Eduardo Rocha Duarte 28 February 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2015-03-03T14:46:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CarlosERDA_DISSERT.pdf: 4195226 bytes, checksum: 5ab122e15dffde5c01a2861020cc4eef (MD5) Previous issue date: 2010-02-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico / Decapod crustaceans are one of the most important portions of megafaunal of coastal waters, playing a role as modifier of the environment and controlling populations of other organisms. Among the Decapoda, crab (brachyuran) constitutes the dominant macrofauna of mangroves. Among brachyuran is the mangrove crab (Ucides cordatus, Linnaeus, 1763), which represents the main component of the macrofauna of mangroves, particularly in Northern and Northeastern Brazil. In Brazil, its distribution is known from the state of Amap? to the north of Santa Catarina. This species is distinguished by its economic importance, being one of the main fishing resources in Brazil, generating a significant impact on their natural populations. This reduction would result in loss of value to the product, preventing its commercialization. Although it?s great ecological and economic importance, there are few articles about the biological aspects of U. cordatus, mainly in the state of Rio Grande do Norte. This work aimed to study the population dynamics of the mangrove crab, Ucides cordatus (Linnaeus, 1763), in Conchas estuary, Porto do Mangue, northern coast of Rio Grande do Norte. During the period November 2009 to October 2010 the crabs were collected monthly, obeying predetermined lunar periods (new moon or full moon) in a mangrove area in Porto do Mangue - RN. With the aid of a steel caliper (0.01 mm) and a precision balance (0.01 g) were measured biometric variables related to the animal's carapace, major propodus chela, width of abdomen (female), length of gonopodium ( males) and total weight. In addition, it was recorded, the gonads and molt stages, for males and females. In total, 476 crabs were collected, with 338 males and 138 females. Males were larger, heavier and in greater proportion than females. The reproductive period for the species in this location was limited during the months November to May, suggesting a change in current environmental legislation for the closure period. Synchrony was observed between the morphological and physiological maturity with females maturing earlier, possibly, a reproductive strategy adopted, compared to the low fishing pressure in the area. The molting period occurred in the dry season peaking in October. The analysis of growth, based on the parameters of von Bertalanffy was calculated using the nonlinear fit using modes (AJMOD). High growth rates for both males (L = 7.54 cm, k = 0.95, t0 =- 00:08; tmax = 4.84) and females (L = 6.50, k = 1 , 2, t0 =- 0008; tmax = 3.28) were found, contrasting with data from the literature, using other techniques. Males had higher asymptotic width size and longevity, but a lower growth constant when compared with females. The estimated age, for males and females, reaching the minimum capture size was 1.82 years and 1.63 years respectively. The size of physiological maturity, when individuals are able to reproduce, was estimated at 1.4 years and 1.05 years, for males and females, respectively. The recruitment period for this species is seasonal, with two peaks of occurrence, one in the rainy season and one in the dry season. This work represented the first effort on understanding the ecology of the mangrove crab, to the northern coast of Rio Grande do Norte. However, further studies on its biology should be undertaken, especially those related to growth, and recruitment, where observed that literature is more scarce / Os crust?ceos dec?podos constituem uma das parcelas mais importantes da megafauna b?ntica de ?guas costeiras, visto que desempenham papel modificador do ambiente e controlador de popula??es de outros organismos. S?o tanto abundantes como diversos. Entre os Decapodas, os caranguejos (Braqui?ros) constituem a macrofauna predominante dos manguezais. Dentre os braqui?ros, encontra-se o caranguejou?? (Ucides cordatus, Linnaeus, 1763), que representa o principal componente da macrofauna dos manguezais, principalmente nas regi?es norte e nordeste brasileira. No Brasil sua distribui??o ? compreendida desde o estado do Amap? at? o norte de Santa Catarina. Esta esp?cie destaca-se por sua import?ncia econ?mica, sendo um dos principais recursos pesqueiros no Brasil, gerando um expressivo impacto sobre suas popula??es naturais. Esta diminui??o resultaria na perda do valor agregado ao produto, inviabilizando a sua comercializa??o. Embora seja uma esp?cie de grande import?ncia ecol?gica e econ?mica, poucos s?o os artigos que tratam de aspectos biol?gicos de U. cordatus, principalmente no estado do Rio Grande do Norte. O presente trabalho teve por objetivo estudar a din?mica populacional do caranguejo Ucides cordatus (Linnaeus, 1763) no estu?rio do Rio das Conchas, pertencente ao munic?pio de Porto do Mangue, litoral norte do Estado do Rio Grande do Norte. Durante o per?odo de novembro de 2009 a outubro de 2010 foram realizadas coletas mensais de exemplares da esp?cie U. cordatus, sempre sobre os mesmos per?odos lunares estabelecidos previamente (Lua Nova/Lua Cheia) em uma ?rea de manguezal localizada no munic?pio de Porto do Mangue ? RN. Com o aux?lio de um paqu?metro de a?o (0,01mm) e de uma balan?a de precis?o (0,01g) foram medidas vari?veis biom?tricas referentes ? carapa?a do animal, pr?podo da quela maior, largura do abd?men (f?meas), comprimento do gonop?dio (machos) e peso total. Al?m disso, tamb?m foi registrado os est?gios de muda e de g?nadas para machos e f?meas. No total, foram coletados 476 caranguejos, sendo 338 machos e 138 f?meas. Os machos foram maiores, mais pesados e em maior propor??o que as f?meas. O per?odo reprodutivo para a esp?cie nesta localidade foi limitado entre os meses de novembro a maio, sugerindo uma mudan?a na legisla??o ambiental atual para o per?odo de defeso. Foi observada uma sincronia entre a maturidade morfol?gica e fisiol?gica com as f?meas amadurecendo precocemente, possivelmente, uma estrat?gia reprodutiva adotada, frente ? baixa press?o de pesca na ?rea. O per?odo de ocorr?ncia de mudas ocorreu na esta??o seca com pico em outubro. A an?lise de crescimento, baseado nos par?metros de Von Bertalanffy, foi calculada utilizando o ajuste n?o-linear usando-se modas (AJMOD). Evidenciaram-se altas taxas de crescimento tanto para machos (L =7,54cm; k=0,95; t0=-0.08; tm?x=4,84), como para f?meas (L =6,50; k=1,2; t0=-0.008; tm?x=3,28), contrastando com dados obtidos na literatura, utilizando outras t?cnicas. Os machos obtiveram maior tamanho de largura assint?tico e longevidade, por?m uma menor constante de crescimento, quando comparados com as f?meas. A idade estimada para machos e f?meas atingindo o tamanho m?nimo de captura foi de 1,82anos e 1,63anos, respectivamente. O tamanho de maturidade fisiol?gica, quando os indiv?duos est?o aptos a reprodu??o, foi estimado em 1,4anos e 1,05anos para machos e f?meas, respectivamente. O per?odo de recrutamento para a esp?cie ? sazonal, com dois picos de ocorr?ncia, um no per?odo chuvoso e outro no per?odo seco. Este trabalho representou o primeiro esfor?o sobre o entendimento da ecologia do caranguejo-u??, para o litoral norte do Estado do Rio Grande do Norte. No entanto, mais estudos sobre a sua biologia devem ser realizados, sobretudo os referentes ao crescimento, e ao recrutamento, onde se observou que a literatura ? mais escassa
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Deriva genética de caracteres quantitativos em milho / Genetic drift of quantitative traits in maize

Paolo Orlando Zancanaro 15 April 2016 (has links)
A obtenção de genótipos superiores no melhoramento de plantas depende da existência de variabilidade genética. A existência de coleções de germoplasma representativas e a utilização de um tamanho adequado de amostra são fundamentais para a preservação das frequências alélicas e genotípicas, diminuindo a perda de variabilidade genética e postergando o aparecimento dos efeitos da deriva genética. Assim, teve-se como objetivo avaliar os efeitos da deriva genética em caracteres quantitativos em subpopulações de milho. Este estudo foi realizado a partir das populações originais BR-105 e BR-106, das quais 10 subpopulações foram obtidas em cada um dos cinco ciclos sucessivos de amostragem com tamanho efetivo reduzido, totalizando 50 subpopulações para cada população original, as quais foram posteriormente autofecundadas, gerando um nível a mais de endogamia. Os tratamentos foram constituídos de 10 amostras da população original sem autofecundação, 10 amostras com autofecundação, 50 subpopulações obtidas da população original e 50 subpopulações autofecundadas, totalizando 120 tratamentos para cada população, avaliados separadamente. Utilizou-se o delineamento em blocos casualizados no esquema de parcelas subdivididas em faixas hierárquico, em quatro ambientes com duas repetições por ambiente. Os caracteres avaliados foram produção de grãos (PG), prolificidade (PROL), comprimento e diâmetro de espigas (CE e DE), número de fileiras por espiga (NFE), número de grãos por fileira (NGF), altura de planta e espiga (AP e AE), florescimento masculino e feminino (FM e FF) e número de ramificações do pendão (NRP). Foram estimados os efeitos da deriva genética entre as médias das subpopulações nos dois níveis de endogamia e os efeitos da depressão por endogamia nas subpopulações dentro dos ciclos. Posteriormente, realizaram-se análises de regressão linear para as subpopulações nos dois níveis de endogamia, separadamente, e em conjunto. Foi verificada uma grande variação nas médias das subpopulações ao longo dos ciclos, indicando que a deriva genética causou diferenciação entre as mesmas e que estas se diferenciaram das populações originais. Detectaram-se efeitos significativos da deriva genética nas populações não autofecundadas para todos os caracteres avaliados, em maior número para PG, já que este caráter é mais sensível à deriva genética por possuir maior grau de dominância que os demais. Houve diminuição no número de estimativas de deriva significativas para as populações autofecundadas, incluindo mudanças na magnitude e no sinal das mesmas em relação às populações não autofecundadas. Para as estimativas de depressão por endogamia, os caracteres PG, NGF, FM e FF apresentaram maior quantidade de estimativas significativas que os demais. Para a maioria dos caracteres, a regressão linear explicou a maior parte da variação encontrada com o aumento dos coeficientes de endogamia. As populações BR-105 e BR-106, por terem estruturas genéticas distintas, apresentaram performances diferentes quanto aos efeitos da deriva genética. Enfim, como a deriva genética interfere na integridade genética das populações, torna-se importante considerar seus efeitos na coleta e manutenção dos bancos de germoplasma e nas populações utilizadas no melhoramento genético de plantas. / Obtaining superior genotypes in plant breeding depends on the existence of genetic variability. The existence of representative germplasm collections and the use of appropriate sample size are essential for preserving allelic and genotypic frequencies, reducing loss of genetic variability and delaying genetic drift effects. This study aimed to evaluate the effects of genetic drift in quantitative traits in subpopulations of maize. The original populations used were BR-105 and BR-106, of which 10 subpopulations were obtained in each five successive sample cycles with reduced effective size, accounting 50 subpopulations for each original population that were subsequently selfed to generate an additional level of inbreeding. The treatments consisted in 10 samples of the original population, 10 samples of the selfed original population, 50 non selfed subpopulations obtained from the original population and 50 selfed subpopulations, accounting 120 treatments for each population evaluated separately. It was used the randomized block strip-plot design, in four environments with two replications. The traits assessed were grain yield (GY), prolificacy (PROL), ear length and ear diameter (EL and ED), number of rows per ear (NRE), kernel-row number (KRN), plant and ear height (PH and EH), days to anthesis and silking (DA and DS), and number of tassel branches (NTB). It was estimated the effects of genetic drift between subpopulations means at both inbreeding levels, and the effect of the inbreeding depression in subpopulations within cycles. It was also performed linear regression analysis for subpopulations at both levels of inbreeding separately and together. A large variation was observed in the subpopulations means over cycles, indicating that genetic drift caused differentiation between them, and that they differed from the original populations. The effects of genetic drift were significant for all traits in the non selfed subpopulations, especially for GY, which is more sensitive to genetic drift effects by having a greater degree of dominance than the other traits. There was a decrease in the number of significant genetic drift estimates for selfed populations, including changes in magnitude and signs, compared to the non selfed populations. GY, KRN, DA and DS had higher number of significant inbreeding depression estimates than the other traits. Linear regression analysis explained most of the variation found with increasing homozygosity. As BR-105 and BR-106 populations have distinct genetic structures, they showed different performances regarding the effects of genetic drift. Therefore, genetic drift interferes in the genetic integrity of populations and it is important to consider its effect on the collection and maintenance of germplasm banks and populations used in plant breeding.
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Análise populacional genética de Larus dominicanus através do uso de microssatélites / Population genetic analysis of Larus dominicanus using microsatellites

Fernanda de Almeida Santos 07 February 2012 (has links)
As alterações que a ação antrópica vem causando nos ambientes costeiros tem provocado impactos sobre as espécies a eles associadas. Larus dominicanus é uma espécie de ave marinha amplamente distribuída ao longo do Hemisfério Sul. Por possuir um hábito alimentar generalista, os resíduos da ação antrópica tem beneficiado a espécie, que, assim como outras gaivotas, vem apresentando um crescimento demográfico acelerado. O presente estudo, através do uso de marcadores de microssatélites, mostra que, apesar disso, a espécie possui uma baixa variabilidade genética, com fraca estruturação populacional, que provavelmente são o reflexo da origem recente da espécie e de uma diferenciação recente entre as populações. Múltiplas forças atuam para determinar a estruturação populacional, sendo elas o isolamento por distância, as barreiras físicas e a filopatria. Os sinais de gargalo populacional encontrados em algumas das colônias levantam a possibilidade de efeitos fundadores por colonização recente nas colônias mais ao norte da costa brasileira e redução populacional nas colônias da Argentina e da Antártica como conseqüência da última glaciação. Estes dados chamam a atenção para a necessidade de considerar as informações genéticas para a implantação de planos de manejo. Uma vez que a diferenciação entre as populações é recente, a variabilidade dentro de cada uma delas deve ser mantida. O controle populacional da espécie através de métodos diretos deve ser também acompanhado por planos de manejo ambiental, visando reduzir ou eliminar as condições que propiciam o crescimento desequilibrado dos gaivotões. / The changes in the coast that has been caused by human action has led to impacts on species associated with this environment. Larus dominicanus is a seabird species widely distributed throughout the Southern Hemisphere. The generalist feeding habits allow this species take advantage from human action, leading to population growth, which is also observed in other species of gulls. This study, through the use of microsatellite markers, shows that, despite of the population growth, Larus dominicanus has a low genetic variability, with low population structure, which probably reflects the recent origin of species and a recent differentiation among populations. Multiple forces act to determine the population structure, among them the isolation by distance, physical barriers and philopatry. Some colonies presents a bottleneck sign, raising the hypothesis of recent founder effects in the colonies to the north of Brazil and population reduction of colonies of Argentine and Antarctic as consequence of the last glaciation. These data show the need to consider genetic information for the implementation of management plans. The variability within populations must be maintained, since the differentiation between them is recent. Furthermore, the species population control by direct methods must also be accompanied by environmental management plans, to reduce or eliminate the conditions that favor the unbalanced growth of the gulls
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Modelos de previsão de ocorrência de adultos de diatraea saccharalis (Fabricius, 1794) (Lepidoptera: Crambidae) em cana-de-açúcar (Saccharum spp.) /

Carbognin, Éllen Rimkevicius. January 2016 (has links)
Orientador: Odair Aparecido Fernandes / Coorientador: Cláudia Pio Ferreira / Banca: Leila Luci Dinardo Miranda / Banca: Daniel Junior de Andrade / Resumo: A broca-da-cana, Diatraea saccharalis, é considerada uma das principais pragas da cana-de-açúcar e tem causado sérios prejuízos em novas fronteiras agrícolas brasileiras que abrangem o oeste do estado de São Paulo e a região centro-oeste do país. Desta forma, este trabalho teve por objetivo avaliar a dinâmica populacional de adultos de Diatraea saccharalis em diferentes regiões canavieiras e sua relação com os fatores meteorológicos, bem como estabelecer modelo de previsão de ocorrência com base em graus-dia e equações de diferenças. Os adultos foram avaliados semanalmente durante duas safras (2013/2014 e 2014/2015) em cultivos localizados nos estados de São Paulo (Pradópolis e Valparaíso) e Goiás (Quirinópolis). Em cada localidade foram utilizados um ou dois talhões de 25 ha, próximos (< 2 km) a estações climáticas. Em uma área central (1 a 1,5 ha) de cada talhão foram instaladas quatro armadilhas delta contendo fêmeas virgens e piso colante para captura dos adultos. O número de adultos coletados e os dados climáticos foram submetidos à análise de regressão múltipla e correlação. Modelos matemáticos baseados em graus-dia e equações de diferenças foram elaborados. Verificou-se maior ocorrência de adultos no período das chuvas, principalmente, de janeiro a abril. Não houve correlação entre os fatores climáticos e a flutuação populacional; com exceção de Quirinópolis, onde a umidade foi fator abiótico limitante para o crescimento populacional desta espécie. Os modelos de graus-... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The sugarcane borer, Diatraea saccharalis, is considered one of the main pest of sugarcane and has caused serious losses in new Brazilian agricultural frontiers including the western region of São Paulo state and the Midwest region of the country. Thus, this study aimed to assess the population dynamics of D. saccharalis adults in different sugarcane regions and its relationship with meteorological factors, as well as to establish a forecasting model based on degree days and difference equations. The adults were evaluated weekly for two growing seasons (2013/2014 and 2014/2015) in areas located in the states of São Paulo (Pradópolis and Valparaiso) and Goiás (Quirinópolis). In each location we used one or two plots of 25 ha, near (<2 km) to meteorological stations. In a central area (1 to 1.5 ha) of each block, four delta traps with virgin females and sticky floor were installed to capture adults. The number of collected adults and weather data were submitted to analysis of multiple regression and correlation. Mathematical models based on degree days and difference equations were developed. A higher occurrence of adults was observed during the rainy season, mainly from January to April. There was no correlation between climatic factors and population dynamics; except for Quirinópolis where the relative humidity was a limiting abiotic factor for population growth of this species. Models of degree days and difference equations are complementary and have shown effectiveness in f... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre
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Caracterização de polimorfismos e assinaturas de seleção em genótipos de cana-de-açúcar (Saccharum spp.) através de genotipagem-por-sequenciamento / Characterization of polymorphisms and selection signatures in sugarcane genotypes (Saccharum spp.) by genotyping-by-sequencing

Menegatto, Leonardo Sartori 24 February 2017 (has links)
A cana-de-açúcar (Saccharum ssp.) é uma cultura valiosa na produção de alimento, fibra e energia para o Brasil e, especialmente, para o estado de São Paulo. Com o advento da biotecnologia, alternativas de melhoramento genético têm despertado a atenção da comunidade científica, sendo etapas cruciais para tais avanços o sequenciamento e a caracterização do genoma das espécies cultivadas. Dada sua natureza poliploide, com frequente aneuploidia, a cana-de-açúcar apresenta dificuldades às práticas convencionais em genômica, de maneira que é vantajoso fazer uso de recursos de sequenciamento de nova geração e de espécies próximas para elucidar de forma mais efetiva o genoma da gramínea. Uma contribuição interessante, nesse sentido, é a caracterização funcional de polimorfismos genéticos existentes entre genótipos do gênero Saccharum, auxiliando investigações relacionadas à genômica de poliploides complexos, desenvolvendo um recurso a ser utilizado futuramente por melhoristas. Esse trabalho realizou a caracterização da variabilidade genômica a partir de dados genotípicos de indivíduos do Painel Brasileiro de Genótipos de Cana-de-Açúcar, obtidos via genotipagem-por-sequenciamento, utilizando como referência o genoma já sequenciado do sorgo. Os sítios variantes (sobretudo polimorfismos de nucleotídeo único) foram detectados com o software FreeBayes e suas possíveis funções e posições foram anotadas com o programa SnpEff. Utilizaram-se estatísticas de genética de populações, como a frequência alélica para várias classes de polimorfimo, o Teste de McDonald & Kreitman (busca de evidêcias de evolução adaptativa) e a heterozigosidade combinada (busca de regiões genômicas com assinatura de seleção), de modo a identificar regiões genômicas potencialmente envolvidas em eventos evolutivos. Os resultados demonstraram a perda de variabilidade entre os genótipos melhorados em relação aos ancestrais, com evidências de assinaturas de seleção, envolvendo questões sensíveis ao funcionamento da maquinaria celular (como respiração e fotossíntese) e a características valoradas para a cultura (destacando-se a resistência a patógenos e a biossíntese da sacarose). Tais indícios fornecem subsídios à compreensão do genoma e ao melhoramento genético desse poliploide. / Sugarcane (Saccharum ssp.) is a valuable crop for food, fiber and energy production in Brazil, especially to the São Paulo State. With the advent of biotechnology, alternatives to breeding have enticed attention of the scientific community, with genome sequencing and characterization being crucial steps to these advances. Because sugarcane is polyploid, with frequent aneuploidy, it presents difficulties to the application of standard practices in genomics, such that it is advantageous to make use of next generation sequencing alternatives and resources from related species to more effectively elucidate the genome of this grass. Thus, an interesting contribution is the functional characterization of genetic polymorphisms from the Saccharum genus, aiding investigations related to genomics of complex polyploids, developing a resource to be used in the future by breeders. Our goal was to perform this characterization with genotypic data from individuals of the Brazilian Panel of Sugarcane Genotypes, obtained by genotyping-by-sequencing (GBS), using as reference the previously sequenced sorghum genome. We called the variants (mainly single nucleotide polymorphisms) with FreeBayes and annotated their functions and positions with SnpEff. We used population genetics statistics, such as the allele frequency, the McDonald & Kreitman Test and the pooled heterozygosity, to identify genomic regions potentially involved in evolutionary events. The results showed a loss of variability between bred genotypes in relation to the ancestors, with evidences of selective sweeps, involving regions related to the cellular machinery (such as respiration and photosynthesis) and specific crop traits (especially disease resistance and sucrose biosynthesis). These results support understanding of the genome and breeding efforts in this polyploid grass.

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