Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:44Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005-03Bitstream added on 2014-06-13T18:51:15Z : No. of bitstreams: 1 zulim_rmi_me_botfmvz.pdf: 186590 bytes, checksum: 76b4d0e38bacf42eb7c8353a96dfa6c9 (MD5) / Universidade Estadual Paulista (UNESP) / O tamanho adulto influencia a eficiência do sistema de produção, bem como as doenças metabólicas, que prejudicam e atrasam o desenvolvimento do animal. Maturidade precoce pode ser buscada para as fêmeas, que são mais eficientes que animais de maior porte em condições de escassez e/ou limitação de alimentos, e para macho, que atingem o acabamento de gordura na carcaça mais rapidamente. A avaliação do grau de maturidade óssea correlacionada com a densidade mineral óssea pode ser uma ferramenta para seleção desses animais. O grau de maturidade óssea reflete a maturidade do esqueleto como um todo. O padrão geral de crescimento pode ser descrito como disto-proximal com amadurecimento mais rápido dos ossos na extremidade. O experimento tem por objetivo, estabelecer a curva de maturidade óssea, correlacionando peso, altura, densidade mineral óssea e adaptando metodologia desenvolvida por Oishi, Hamada e Sakamoto (1996) em bovinos Nelore, com o intuito de utilização no diagnóstico preventivo de doenças metabólicas ósseas que acometem animais em desenvolvimento, proporcionando uma forma de monitorar as alterações ósseas destes animais criados em sistema extensivo. Dez machos e dez fêmeas foram analisados, mensalmente, através de radiografias, pesagem e altura de cernelha até os 24 meses ou até o fechamento do disco epifisário dos ossos estudados. Foram feitas radiografias da porção distal do metacarpo e de falange proximal (desenvolvimento rápido e de fácil acesso), utilizando as vistas látero-medial esquerda e dorsopalmar. As radiografias foram escaneadas e lidas através de um programa computacional específico. O grau de maturação óssea foi avaliado através da escala de mudanças morfológicas da epífise dos ossos longos, em escala de zero (epífise ausente) e dez (fechamento completo do disco epifisário) desenvolvida por Oishi, Hamada e Sakamoto (1996)... / The adult size influences the efficiency of the production system, like the metabolics disease that prejudices and retard the animal desenvolviment. Precocity maturity may be obtained to females that are more efficient that biggest animals in conditions of lack or food limitations, and for males that attain carcass fat faster. The evaluation of the maturity degree correlated with bone mineral density can be the key to select these animals. The bone maturity degree reflects the all-skeletal maturity. The general standard of bone growth may be descript like disto-proximal with faster bone maturation in extremities. The experiment has like objective to stabilize the curve of bone maturity, correlating weight, height, bone mineral density and to adapting OISHI, Hamada and Sakamoto (1996) bovine Nelore methodology with the finality of utilization in the prevent diagnostic of bone metabolic disease that occur in growth animals, giving a way to monitore the bone alteration of these animal living in extensive system. Ten males and ten females were studied, monthly, througth radiographies, weight, and height until 24 months old or until the epiphyseal disc closure of studied bones. Were taken radiographies of distal metacarpal and distal left falangeal extremity (fast growth and easy access) utilizing mediolateral and dorsopalmar view. Those radiographic images were scanned and read througth computer program. The bone maturity degree was available througth morphologic changes scale of epiphysis long bones, zero scale (absent epiphysis) and ten (completely closure) development by Oishi, Hamada and Sakamoto (1996). Was establish for radiographics exams like the prevent of bones metabolics disease.

Conselho Nacional de Desenvolvimento CientÃfico e TecnolÃgico / In addition to high yield, the cowpea breeding programs have been based on the development of cultivars that erect associate and early cycle. This is because in addition to minimizing the risk of losses because the plants spend less time in the field, makes it easy to harvest, either manually or mechanically. For this purpose, are generally employed methods involving hybridization to give segregating populations, these, in turn, are driven by several generations of inbreeding. This process is costly and time consuming, and early identification of populations with potential for extraction lines, can greatly reduce the costs of a breeding program. For this, the methodology m + a, which estimates the concentration of favorable alleles in two consecutive generations, is a good indicator. Subsequently, it should identify the best genotypes within those potential people to compose the final testing lines, conditioning to obtain cultivars that meet the objectives of breeding programs. Thus, the aim of the first study (Chapter 1): (i) estimate the genotypic values (BLUPs) to agronomic important traits, and (ii) to investigate the potential use of the methodology m + a for the early selection of lines. In the second study (Chapter 2), aimed to verify the existence of genetic variability in the population and identify promising lines to compose the final rehearsals. To estimate the genetic potential of populations for early extraction lines were evaluated generations F3:4 and F3:5 ten progenies. These were evaluated in a randomized block design with three replications. To identify the best individuals to compose EFL, we used seeds from 119 genotypes originated ten progenies F3:4, and two witnesses, Sempre Verde and BRS Tumucumaque. It was used for this design in a 11 x 11 square lattice with two replications. The trials of the two studies were conducted in Marco-CE council and evaluated characters: number of days to flowering (NDF); number of days to maturity (NDM); plant height (ALT); pod length (CPV); number of seeds per pod (NGV); weight of 100 grains (M100G), and total mass (MTOT). We identified high heritability values in terms of average and accuracy for most of the characters, as well as low coefficients of variation, except for MTOT character. Positive and negative genotypic values of the progenies showed the potential to increase the expression of those characters related to productivity and reduce the expression of those associated with size and precocity. The estimate m + a more expressive for ALT was presented by the progeny obtained from the crossing of the EC-796 and MNC03-737E-5-10. And for NDF and NDM the progeny obtained from the crossing of the EC-796 and EC-954. The estimate the m + a was viable for identification of populations with potential for extraction lines in cowpea culture. In the second study, the genotypes 5, 7, 14, 15, 25, 27, 31, 42, 47, 57, 85 and 113 were those which showed greatest genetic potential for composing EFL. / AlÃm de elevadas produtividades, os programas de melhoramento do feijÃo-caupi tÃm se baseado no desenvolvimento de cultivares que associem porte ereto e ciclo precoce. Isto porque alÃm de minimizar os riscos de perdas, pelo fato das plantas passarem menos tempo em campo, facilita o processo de colheita, tanto manualmente como mecanicamente. Para tanto, geralmente sÃo empregados mÃtodos que envolvem hibridaÃÃo para originar populaÃÃes segregantes, estas, por sua vez, sÃo conduzidas por vÃrias geraÃÃes de endogamia. Esse processo à custoso e moroso e, identificar precocemente populaÃÃes com potencial para extraÃÃo de linhagens, pode reduzir consideravelmente os custos de um programa de melhoramento. Para isso, a metodologia m + a, que estima a concentraÃÃo de alelos favorÃveis em duas geraÃÃes consecutivas, à um bom indicador. A posteriori, cabe identificar os melhores genÃtipos dentro daquelas potenciais populaÃÃes para compor os ensaios finais de linhagens, condicionando a obtenÃÃo de cultivares que atendam aos objetivos dos programas de melhoramento. Assim, objetivou-se no primeiro estudo (capÃtulo 1): (i) estimar os valores genotÃpicos (BLUPs) para caracteres de interesse agronÃmico, e (ii) verificar o potencial do uso da metodologia m + a para a seleÃÃo precoce de linhagens. No segundo estudo (capÃtulo 2), objetivou-se verificar a existÃncia de variabilidade genÃtica na populaÃÃo e identificar linhagens promissoras para compor os ensaios finais. Para estimaÃÃo do potencial genÃtico das populaÃÃes para extraÃÃo precoce de linhagens foram avaliadas as geraÃÃes F3:4 e F3:5 de dez progÃnies. Estas foram avaliadas no delineamento em blocos casualizados com trÃs repetiÃÃes. Para identificaÃÃo dos melhores indivÃduos para compor EFL, utilizaram-se sementes provenientes de 119 genÃtipos oriundos de dez progÃnies F3:4, e de duas testemunhas, Sempre Verde e BRS Tumucumaque. Utilizou-se para isso delineamento em lÃtice quadrado 11 x 11 com duas repetiÃÃes. Os ensaios dos dois estudos foram conduzidos no municÃpio de Marco-CE e avaliados os caracteres: nÃmero de dias para floraÃÃo (NDF); nÃmero de dias para maturaÃÃo (NDM); altura de planta (ALT); comprimento de vagem (CPV); nÃmero de grÃos por vagem (NGV); massa de 100 grÃos (M100G), e massa total (MTOT). Foram identificados elevados valores de herdabilidade a nÃvel de mÃdia e acurÃcia para a maioria dos caracteres, assim como baixos coeficientes de variaÃÃo, com exceÃÃo para o carÃter MTOT. Valores genotÃpicos positivos e negativos evidenciaram o potencial das progÃnies para aumentar a expressÃo daqueles caracteres relacionados a produtividade e reduzir a expressÃo daqueles associados a porte e precocidade. A estimativa m + a mais expressiva para ALT foi apresentada pela progÃnie obtida do cruzamento entre CE-796 e MNC03-737E-5-10. E para NDF e NDM pela progÃnie obtida do cruzamento entre CE-796 e CE-954. A estimativa m + a foi viÃvel para a identificaÃÃo de populaÃÃes com potencial para extraÃÃo de linhagens na cultura do feijÃo-caupi. No segundo estudo, os genÃtipos 5, 7, 14, 15, 25, 27, 31, 42, 47, 57, 85 e 113 foram aqueles que demonstraram maior potencial genÃtico para compor EFL.

Os genes dos receptores do hormônio luteinizante (LHR) e folículo estimulante (FSHR), conhecidos por sua influência na manifestação da puberdade, foram avaliados por análise PCR-RFLP em uma população de 370 novilhas de corte compostas, de diferentes composições raciais Europeu-Zebu. Os objetivos foram caracterizar geneticamente a população investigada, utilizando-se de freqüências genotípicas e alélicas e estimativas de variabilidade e diversidade gênica; avaliar o efeito dos marcadores sobre a precocidade sexual, caracterizada pela probabilidade de prenhez por ocasião da primeira estação de monta (PP), e estimar a proporção da variância genética total da variável PP atribuída aos marcadores investigados, bem como a herdabilidade da característica pelo método de Máxima Verossimilhança Restrita (REML) sob modelo animal e sob modelo touro. Contatou-se elevada freqüência de animais heterozigotos em quase todas as composições raciais investigadas, para ambos os genes, com um valor médio de heterozigosidade de 57%, resultados estes que refletem a elevada variabilidade genética desta população híbrida. As novilhas heterozigotas apresentaram maiores taxas de prenhez (67 e 66% respectivamente, para os genes do LHR e FSHR), entretanto não se constataram efeito dos polimorfismos RFLP LHR (P=0,9188) e FSHR (P=0,8831) sobre a manifestação deste evento. As estimativas de herdabilidade obtidas para a PP foram de 0,21 e 0,41, respectivamente sob modelo animal e sob modelo touro. A magnitude das estimativas dos componentes de (co)variância atribuídas aos efeitos dos marcadores se mostrou muito baixa, constatando-se a pequena contribuição destes marcadores na proporção da variância total da prenhez, indicando ser esta uma característica de herança poligênica. Os resultados aqui demonstrados indicam que a seleção de novilhas para a precocidade sexual, com base em sua informação genotípica para os marcadores RFLP LHR e FSHR, não se justifica em programas de melhoramento genético animal, sugerindo-se a investigação de outros genes igualmente importantes, envolvidos na manifestação deste evento. Contudo, os marcadores avaliados se mostraram informativos, sendo indicados em estudos de caracterização genética em outras populações bovinas. A elevada heterozigosidade verificada na população composta estudada viabiliza a exploração destes animais em cruzamentos / The luteinizing hormone receptor (LHR) and follicle-stimulating receptor (FSHR) genes, known for their influence on the onset of puberty were evaluated by PCR-RFLP analysis in a population of 370 European-Zebu composite beef heifers from different breed contributions. The objectives were to genetically characterize the investigated population using genotype and allelic frequencies values besides on variability and gene diversity estimates; to evaluate the effect of markers on sexual precocity, characterized as the probability of pregnancy during the first breeding season (PP); and to estimate the proportion of total genetic variance in the PP related to the investigated markers, as well as the heritability estimate for PP by the Restricted Maximum Likelihood (REML) method for animal and sire models. The high number of heterozygous animals observed in almost all breed compositions studied for both loci, with average heterozigosity values of 57%, showed the high genetic variability on this hybrid population. Higher pregnancy rates were observed in heterozygous heifers (67% and 66% for LHR and FSHR genes, respectively), however, no effect of RFLP polymorphism for LHR (P=0.9188) and FSHR (P=0.8831) on pregnancy rate was observed. The heritabily estimates for PP were 0.21 and 0.41, using the animal and sire model, respectively. The small magnitude of the (co)variance components estimates related to random effects of LHR and FSHR, showed their small contribution in the proportion of total variance of pregnancy, indicating a polygenic inheritance for this trait. The results found in this work indicate that selection of beef heifers in animal genetic breeding programs for sexual precocity based on the inclusion of genotype information on RFLP for LHR e FSHR markers is not recommended. The investigation of other important genes related to puberty onset in heifers is necessary. However, the evaluated markers were informative and may be indicated for genetic characterization studies in other bovine populations. The high heterozigosity observed on the studied composite population maximizes the exploration of these animals in crossbreeding

Foram avaliadas as concentrações plasmáticas de leptina e IGF-I do 8° ao 16° mês de idade de 36 novilhas Nelore e comparadas com a idade à primeira ovulação e precocidade sexual. Para a quantificação da leptina, foi validado um radioimunoensaio (RIA) utilizando anticorpo produzido contra leptina recombinante eqüina após inoculação em coelho. A especificidade, estabilidade, taxa de recuperação e efeito matriz indicaram que o ensaio foi adequado para a quantificação de leptina plasmática bovina. O IGF-I foi quantificado por Kit comercial (DSL). As amostras de sangue foram colhidas em intervalos de 4 dias e avaliadas nos 60 dias retrospectivos à primeira ovulação e de amostras mensais do 8° ao 16° mês de idade. A maioria das novilhas (83,3%) ovulou até o final do experimento e foram divididas em prenhes até os 16 meses de idade (33,3%), formando o grupo precoce (P), e não prenhes (50%), formando o grupo Não Precoce (NP) 16,7% das novilhas não ovularam (chamadas de NO) até o final do experimento. Não houve diferença (P > 0,05) na idade à primeira ovulação entre os grupos P (439±27,9 dias) e NP (445±36,8 dias). O peso aumentou (P < 0,01) nos 3 grupos, não diferiu (P > 0,05) entre as novilhas P e NP durante o experimento, mas as NO apresentaram peso inferior aos outros grupos a partir do 12°mês (P < 0,01). Nos 60 dias que antecederam a primeira ovulação, a concentração de leptina plasmática aumentou (P < 0,01) no grupo P, mas não nos grupos NP e NO (P > 0,5), porém não houve diferença entre os grupos (P > 0,5). Houve correlação entre a concentração de leptina plasmática e o peso corporal nos grupos P (r=0,36; P < 0,01) e NP (r=0,4313; P < 0,01), mas não no grupo NO (r=0,095; P > 0,5). A concentração plasmática de IGF-I aumentou (P < 0,01) nos 3 grupos do 8° ao 16° mês de idade, mas foi maior no grupo P (P < 0,01) do que nos NP e NO, que não diferiram entre si. Antes da primeira ovulação, não foi verificado aumento (P > 0,1) na concentração de IGF-I em nenhum dos grupos, porém a concentração foi maior no grupo P (P < 0,05). Pode-se concluir que a concentração de leptina, junto com o peso corporal foram importantes na primeira ovulação, enquanto o IGF-I, na determinação da precocidade sexual. / Plasmatic leptin and IGF-I were quantified from 36 Nelore heifers, and compared to age at first ovulation and sexual precocity. For leptin quantification, a radioimmunoassay, using antibody against recombinant equine leptin inoculated in rabbit was validated. The specificity, stability, recuperation tax and matrix effect showed that the assay was able to quantify for plasmatic bovine leptin quantification. The IGF-I was quantified with a commercial Kit (DSL). Blood samples were taken every 4 days and analyzed retrospectively 60 days before first ovulation and from mensal samples from 8th to 16th month of age. Most of the heifers ovulated (83.3%) until the end of experiment, those were divided in heifers that became pregnant until the 16° month of age (33.3%), named Precocious group (P), 50% that did not became pregnant were the non precocious group (NP) 16% of the heifers did not ovulated and were named NO. There was no difference (P > 0.05) in the first ovulation age between P (439±27.9 days) and NP (445±36.8 days) groups. The weight of the 3 groups increased (P < 0.01), but did not differ (P > 0.05) between P and NP heifers but NO showed lower weight (P < 0.01) after the 12th month (P < 0.01). Sixty days before first ovulation, plasmatic leptin concentration increased (P < 0.01) in P group, but did not in NP or NO (P > 0.5), and there were no difference between groups. (P > 0.5). There was correlation between plasmatic leptin and body weight in P (r=0.36; P < 0.01) and NP (r=0.4313; P < 0.01), but did not in NO group (r=0.095; P > 0.5). Plasmatic IGF-I concentration increased (P < 0.01) in the 3 groups, from 8th to 16th month of age, but was higher in P (P < 0.01) than NP and NO, that did not differ among themselves. Before first ovulation there was, no increase (P > 0.1) in IGF-I in none of groups, but concentration was higher in P (P < 0.05) group. It could be concluded that leptin concentration as well as body weight were important in first ovulation, while IGF-I, in the sexual precocity determination.

Entre as raças bovinas utilizadas comercialmente para produção de carne no Brasil, a Nelore e o cruzamento Nelore x Angus são de destaque pela adaptação que possuem às condições tropicais. No entanto, é comum que as fêmeas da raça Nelore produzam o primeiro bezerro entre os 44 a 48 meses de idade, fato que reduz a vida útil das matrizes no sistema de produção. Pesquisas desenvolvidas no Laboratório de Nutrição e Reprodução Animal (LNRA) da Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ/USP) e no Laboratório de Fisiologia e Endocrinologia Molecular (LFEM) da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia na (FMVZ/USP), mostram que esta realidade pode ser eventualmente alterada por meio do desenvolvimento de novas técnicas que visam precocidade em alguns eventos da vida produtiva das fêmeas bovinas, como a puberdade e o diagnóstico da gestação. Objetiva-se com a presente pesquisa determinar o efeito na viabilidade econômica de unidades produtivas comerciais dedicadas à produção de bezerros de: i) reduzir o tempo ao qual as fêmeas Nelore e Nelore x Angus chegam à puberdade, oferecendo dois ritmos de crescimento (500 e 1000 g dia-1) em duas fases de crescimento (dos três aos sete meses de idade e dos sete meses de idade até a puberdade); e ii) realizar o diagnóstico da gestação de forma convencional pela ultrassonografia transretal ou de forma precoce a través da quantificação de genes ISGs em células mononucleares do sangue periférico ou utilizando ultrassom com Doppler colorido. Após realizar análise de investimento por período de 16 anos (803 semanas), foram calculados os indicadores econômicos Valor Presente Líquido (VPL), Taxa Interna de Retorno (TIR) e o tempo de recuperação do capital (payback). O VPL foi utilizado para determinar a viabilidade econômica dos sistemas, por meio de regressões múltiplas. Em tais regressões, a variável dependente foi o VPL e o conjunto de variáveis explicativas foram a genética, a nutrição, o tipo de diagnóstico da gestação e os níveis de preços relativos de insumos e produtos. O fato de algumas variáveis explicativas serem qualitativas justificou o uso de variáveis do tipo dummy (0 ou 1). De acordo com os resultados obtidos, realizar o diagnóstico da gestação uma semana antes do tempo normalmente utilizado, elevaria o VPL do empreendimento em, aproximadamente, R$ 2,7 milhões. Após confinamento das novilhas Nelore e Nelore x Angus foi observado nos cenários onde foi oferecido Alto GMD nas duas fases do confinamento melhor desempenho econômico. No entanto, entre os dois grupos genéticos, as novilhas Nelore x Angus apresentaram maior VPL. Finalmente, foi realizado um levantamento do histórico de preços pagos e recebidos pelo produtor rural nos últimos 10 anos. Esta análise permitiu observar que são os preços dos insumos os que mais influenciam a viabilidade dos sistemas. / Among the bovine breeds commercially used for meat production in Brazil, the Nelore and Nelore x Angus crosses are prominent for the adaptation that are useful to tropical conditions. However, it is common for Nelore females to produce the first calf between 44 and 48 months of age, to reduce the useful life of the matrices in the production system. (LNRA) of the Luiz de Queiroz College of Agriculture (ESALQ / USP) and not Laboratory of Physiology and Molecular Endocrinology (LFEM) of the Faculty of Veterinary Medicine and Animal Science at (FMVZ / USP)), show that this reality can be altered by Means of developing new techniques aimed at precocity in some events of life produced by females, such as puberty and diagnosis of gestation. The objective of this study is to investigate the effect of the Nelore and Nelore x Angus females on the economic viability of vegetable production units dedicated to the production of calves. Growth (500 and 1000 g day-1) in two growth stages (from three to seven months of age and two months of age until puberty); And ii) perform the diagnosis of pregnancy in a conventional manner by transrectal ultrasonography or early by quantifying ISG genes in peripheral blood mononuclear cells or using color Doppler ultrasound. After the investment analysis for a period of 16 years (803 weeks), the calculations of economic indicators Net Present Value (NPV), Internal Rate of Return (IRR) and payback time. The NPV was used to determine the economical viability of the systems, through multiple regressions. In such regressions, a dependent variable for the NPV and the set of explanatory variables for a genetics, a nutrition, a type of pregnancy diagnosis and the price levels of inputs and products. The fact that some explanatory variables are qualitative justified for the use of dummy variables (0 or 1). According to the results obtained, carry out the diagnosis of gestation a week before the time used, raise the NPV ventures in about R $ 2.7 million. After confinement of the Nelore and Nelore news x Observations on the scenarios in which the High GMD in the two phases of the confinement was carried out better economic performance. However, between the two genetic groups, such as Nelore x Angus heifers presented higher NPV. Finally, a survey of the price history paid and received by the rural producer in the last 10 years was carried out. This analysis showed that it is the input prices that most influence the systems viability.

Considerando a importância econômica da precocidade sexual no sistema de produção de bovinos de corte, o objetivo deste estudo foi identificar regiões genômicas associadas a características reprodutivas tais como a prenhez precoce e número de folículos antrais em novilhas da raça Nelore, identificando processos biológicos envolvidos para um melhor entendimento da variabilidade fenotípica destas características. O banco de dados foi composto por 2.283 novilhas, filhas de 78 touros, provenientes de três fazendas comerciais do Brasil. Destas, 1.267 foram genotipadas com aproximadamente 74 K SNPs. Após análises de controle de qualidade, permaneceram informações de 1.255 animais e 64.800 marcadores. A informação genotípica de 42 touros também estava disponível e touros não genotipados com mais de 5 progênies genotipadas foram imputados para a mesma densidade de marcador das novilhas. Análises de associação genômica ampla (GWAS) foram utilizadas considerando uma metodologia Bayesiana (BayesB) para identificar potenciais janelas genômicas (~ 1 Mb) responsáveis pela explicação de &ge; 1% da variância genética das características. Essas regiões foram utilizadas para a pesquisa de genes bem como nas análises de enriquecimento utilizando os termos MeSH. Ainda, blocos haplotípicos dessas regiões genômicas foram ajustados como efeitos classificatórios no modelo BayesB, com o objetivo de estimar a influência de cada alelo dos touros heterozigotos sobre os fenótipos. Os coeficientes de herdabilidade preditos foram 0,28 ± 0,07 e 0,49 ± 0,09 para PP e NF, respectivamente, com correlação genética de -0,21 ± 0,29. Os resultados do GWAS apontaram janelas genômicas significativas nos cromossomos 5, 14 e 18 para PP e 2, 8, 11, 14, 15, 16 e 22 para NF. As análises de enriquecimento revelaram termos significativos (p &LT; 0,05) associados com PP: Munc-18 Proteins, Fucose e Hemoglobins, e com NF: Cathepsin B, Receptors-Neuropeptide e Palmitic Acid. Um total de 15 alelos haplotípicos tiveram efeitos diferentes (p &LT; 0,10) de sua cópia alternativa para PP e 16 para NF. As análises genômicas contribuíram para uma melhor compreensão da estrutura genética das características reprodutivas PP e NF, podendo colaborar com estratégias de seleção para melhoria dos índices reprodutivos de bovinos da raça Nelore. / Considering the economic importance of sexual precocity in beef cattle production system, the objective of this study was to explore genomic regions associated with heifer pregnancy (HP) and total number of antral follicle (NF) in a population of Nellore (Bos indicus) heifers. The dataset was composed by 2,283 animals, which were daughters of 78 sires, coming from three different commercial farms in Brazil. From these, 1,267 were genotyped with around 74 K SNP markers. After quality control analyses, the remained dataset was formed by 1,255 animals and 64,800 markers. Genotypic information of 42 sires was also available, and non-genotyped sires with more than five genotyped progenies in the dataset were imputed for the same marker density of the heifers. A Genome-wide Association Study (GWAS) was performed under a BayesB method to identify potential genomic windows (~1 Mb) that explained at least 1% of the total additive genetic variance of the traits. The pointed genomic regions were used in MeSH enrichment analyses as well as for genes searching. Haplotype blocks that span these potential genomic regions were fitted as classificatory effects in the BayesB model, aiming to estimate the effect of each allele of the heterozygous sires for these regions. The estimated heritabilities coefficients were 0.28 ± 0.07 and 0.49 ± 0.09 for HP and NF, respectively, with genomic correlation of -0.21 ± 0.29. The GWAS results pointed to significant genomic windows on chromosomes 5, 14 and 18 for HP and 2, 8, 11, 14, 15, 16 and 22 for NF. The MeSH enrichment analyses revealed significant (p &LT; 0.05) terms associated with HP: Munc-18 Proteins, Fucose and Hemoglobins, and with NF: Cathepsin B, Receptors-Neuropeptide and Palmitic Acid. The pointed regions by GWAS harbored important genes that can help explain the genetic basis of the considered traits. A total of 15 haplotype alleles obtained better results (p &LT; 0,10) than their alternative copy for HP and 16 for NF. The genomic analyses contributed to a better understanding of the genetic control of the reproductive traits HP and NF and can be useful to selection strategies in improving reproductive indices in Nellore cattle.

Os programas de melhoramento genético objetivam a seleção de animais geneticamente e fenotipicamente superiores. Dentre as características selecionadas para aumentar o ganho genético do rebanho, o perímetro escrotal destaca-se por sua alta herdabilidade e correlação com precocidade sexual, peso do animal e morfologia espermática. A seleção fenotípica para perímetro escrotal pode ser auxiliada pela junção da DEP PE 365 (diferença esperada na progênie para perímetro escrotal aos 365 dias) com a biotecnologia reprodutiva PIVE (produção in vitro de embriões), e tecnologias moleculares como o uso de marcadores do tipo SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) e marcadores bioquímicos (proteínas). Desta forma, o presente trabalho teve por objetivo: verificar se os SNPs presentes nos genes atuantes na maturação sexual B4GALT1 (Beta 1,4- galactosyltransferase), FSHR (Follicle-stimulating hormone), LHR (Luteinizing hormone receptor) e IGF2 (Insulin-like growth factor 2) podem estar associados a maiores valores de DEP PE 365 em touros da raça Nelore; fazer o estudo global de proteínas no sêmen de touros da raça Nelore que possam ser indicativas de maior DEP PE 365 e verificar se a DEP PE 365 interfere negativamente ou positivamente nos resultados da PIVE. Para as análises de SNP, 178 touros foram divididos em dois grupos, sendo um com 104 animais de DEP PE 365 negativa e outro com 74 animais com DEP positiva. O DNA foi extraído do sangue destes animais e a região genômica de interesse foi amplificada e analisada por RFLP (restriction fragment lengh polymorphism). No caso da proteômica, dois pools de sêmen foram comparados entre si quanto aos seus perfis protéicos por LCMS (Liquid chromatographymass spectrometry): um proveninete de três touros que produzem em média 17,6% de embriões/oócito in vitro e DEP PE 365 média de -0,3 (inferiores) e outro pool proveniente de três touros que produzem em média 34,25% de embriões/oócito, com DEP PE 365 média de 1,07 (superiores). Para verificar se a DEP PE 365 de touros utilizados na PIVE influencia na quantidade e cinética de embriões produzidos, 48 touros foram divididos em três grupos (superior, neutro e inferior) por meio da amplitude total de suas DEPs PE 365 e então utilizados na PIVE. Então, observou-se a quantidade e os tipos de blastocistos gerados por cada um dos grupos. Os resultados do presente trabalho mostraram: o genótipo CC no SNP analisado no gene LHR, e o genótipo TT no SNP analisado no gene IGF2 podem estar relacionados a animais de maiores DEP PE 365 (p 0.05); proteínas envolvidas em vias metabólicas foram predominantes no grupo dos touros superiores e portanto podem ser prováveis marcadores bioquímicos de reprodutores com maiores DEP PE 365; touros com maiores DEPs PE 365 resultam na maior PIV de embriões favoráveis para serem transferidos para vacas receptoras (Bl e Bx; blastocisto e blastocisto expandido; p 0.05). Tais resultados apresentam informações que podem auxiliar na seleção de animais com melhores dados fenotípicos de DEP PE 365 e, portanto, melhores reprodutores. / The breeding programs aim the selection of phenotypically and genetically superior animals . Among the selected characteristics to increase genetic gain in the herd, scrotal circumference stands out for its high heritability and correlation with sexual precocity, animal weight and morphology . Phenotypic selection for scrotal circumference may be aided by the addition of EPD SC 365 (expected progeny difference for scrotal circumference at 365 days ) to IVPE (in vitro production of embryos) reproductive biotechnology and molecular technologies such as the use of molecular markers like SNPs (Single Nucleotide Polymorphism ) and biochemical markers (proteins). Thus, this study aimed to: determine whether the SNPs present in genes B4GALT1 (Beta 1,4 - galactosyltransferase), FSHR (Follicle - stimulating hormone), LHR (Luteinizing hormone receptor) and IGF2 (Insulin- like growth factor 2) may be associated with higher values of EPD SC 365 in Nelore bulls; make global study of proteins in semen from Nelore bulls that may be indicative of greater EPD SC 365 and check if EPD SC 365 interferes negatively or positively on the results of IVPE. For the analysis of SNP, 178 bulls were divided into two groups, one with 104 animals of 365 negative EPD SC 365 and another with 74 animals with positive EPD SC 365. DNA was extracted from blood of these animals and genomic region of interest was amplified and analyzed by RFLP (restriction fragment polymorphism lengh). In the case of proteomics, two pools of semen were compared in respect to their protein profiles by LCMS (Liquid chromatography - mass spectrometry): One from three bulls that produce on average 17.6 % of in vitro embryo/oocyte and with EPD SC 365 average -0.3 (lower) and another pool from three bulls that produce on average 34.25% of in vitro embryo/oocyte with EPD SC 365 average of 1.07 (upper). To check if EPD SC 365 bulls used in IVPE influences the amount and kinetics of embryos, 48 bulls were divided into three groups (upper, lower and neutral ) through the full range of their EPDs SC 365 and then used in IVPE. Then, it was observed the amount and types of blastocysts generated by each group. The results of this study showed: the CC genotype at SNP analyzed in LHR gene, and the TT genotype at SNP analyzed in the IGF2 gene may be related to larger EPD SC 365 animals (p 0.05); proteins involved in metabolic pathways were predominant in group of senior bulls and can therefore be likely biochemical markers of breeding with larger EPD SC 365; bulls with larger EPD SC 365 used in IVPE result in greater favor of embryos to be transferred to recipient cows (Bl and Bx; blastocyst and expanded blastocyst, p 0:05). These results provide information that can assist in the selection of animals with improved phenotypic data EPS SC 365 and, therefore, the best breeders.

Made available in DSpace on 2015-03-26T13:39:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5375296 bytes, checksum: c7ea1e4a6904287d34cf3114d66369d3 (MD5) Previous issue date: 2013-03-18 / Brazil is the largest producer of passion fruit, with 920.158 million tonnes achieved during the year 2010, an area of 62,243 ha (IBGE, 2012). The passion fruit is the most cultivated in Brazil, with over 90% of the planted area and volume sold across the country, 60% of this production is intended for the fresh market. However, the soil diseases reduces the life crop, forcing the crop traveling into practice. The genetic resistance may prevent the premature death of the plants, providing training to healthier crops, uniform and enduring. Among the alternatives to be fetched, we highlight the use of wild species as resistant rootstocks. This study aimed to quantify the influence on the agronomic characteristics of yellow passion fruit (Passiflora edulis Sims) rootstocks of wild P. mucronata and P. gibertii. The characteristics evaluated were: percentage of graft survival, plant height, height of first flowering, number of leaves, number of nodes, diameter of the rootstock and grafting, histological analysis of the graft region, rate of occurrence of us days to flowering, gas exchange and physical and chemical qualities of the fruit. It was observed that the rootstock P. mucronata showed better conformation anatomical and histological region exertia and positively influenced the number of leaves, number of nodes, the time of first flowering, number of flowers and the rate of occurrence of us. When wild species were used as rootstock, developed these early buds and fruits originated more elongated than the non-grafted, but within the standards of marketing. The species P. mucronata showed the best performance as a rootstock. / O Brasil é o maior produtor mundial de maracujá, com 920.158 mil toneladas alcançadas durante o ano de 2010, numa área de 62.243 ha (IBGE, 2012). O maracujá amarelo é o mais cultivado no Brasil, com mais de 90% de área plantada e volume comercializado em todo o país; 60% dessa produção se destinam ao mercado in natura. No entanto, as doenças do solo reduzem a vida útil das lavouras, forçando à prática do cultivo itinerante. A resistência genética pode evitar a morte prematura das plantas, fornecendo formação de lavouras mais sadias, uniformes e longevas. Entre as alternativas a serem buscadas, destaca-se a utilização de espécies silvestres resistentes como porta-enxertos. Este trabalho buscou quantificar a influência sobre as características agronômicas do maracujazeiro-amarelo (Passiflora edulis Sims) dos porta-enxertos silvestres P. mucronata e P. gibertii. As características avaliadas foram: porcentagem de sobrevivência dos enxertos, altura da planta, altura da primeira floração, número de folhas, número de nós, diâmetros do porta-enxerto e do enxerto, análise histológica da região do enxerto, taxa de ocorrência de nós, dias até a floração, trocas gasosas e qualidades físicas e químicas dos frutos. Foi observado que o porta enxerto P. mucronata apresentou melhor conformação anatômico-histológica da região da exertia e influenciou positivamente o número de folhas, o número de nós, a altura da primeira floração, o número de flores e a taxa de ocorrência de nós. Quando as espécies silvestres foram empregadas como porta-enxerto, essas desenvolveram botões florais mais precocemente e originou frutos mais alongados que os pés-francos, porém dentro dos padrões de comercialização. A espécie P. mucronata foi a que apresentou o melhor desempenho como porta-enxerto.

Os programas de melhoramento genético objetivam a seleção de animais geneticamente e fenotipicamente superiores. Dentre as características selecionadas para aumentar o ganho genético do rebanho, o perímetro escrotal destaca-se por sua alta herdabilidade e correlação com precocidade sexual, peso do animal e morfologia espermática. A seleção fenotípica para perímetro escrotal pode ser auxiliada pela junção da DEP PE 365 (diferença esperada na progênie para perímetro escrotal aos 365 dias) com a biotecnologia reprodutiva PIVE (produção in vitro de embriões), e tecnologias moleculares como o uso de marcadores do tipo SNPs (Single Nucleotide Polymorphism) e marcadores bioquímicos (proteínas). Desta forma, o presente trabalho teve por objetivo: verificar se os SNPs presentes nos genes atuantes na maturação sexual B4GALT1 (Beta 1,4- galactosyltransferase), FSHR (Follicle-stimulating hormone), LHR (Luteinizing hormone receptor) e IGF2 (Insulin-like growth factor 2) podem estar associados a maiores valores de DEP PE 365 em touros da raça Nelore; fazer o estudo global de proteínas no sêmen de touros da raça Nelore que possam ser indicativas de maior DEP PE 365 e verificar se a DEP PE 365 interfere negativamente ou positivamente nos resultados da PIVE. Para as análises de SNP, 178 touros foram divididos em dois grupos, sendo um com 104 animais de DEP PE 365 negativa e outro com 74 animais com DEP positiva. O DNA foi extraído do sangue destes animais e a região genômica de interesse foi amplificada e analisada por RFLP (restriction fragment lengh polymorphism). No caso da proteômica, dois pools de sêmen foram comparados entre si quanto aos seus perfis protéicos por LCMS (Liquid chromatographymass spectrometry): um proveninete de três touros que produzem em média 17,6% de embriões/oócito in vitro e DEP PE 365 média de -0,3 (inferiores) e outro pool proveniente de três touros que produzem em média 34,25% de embriões/oócito, com DEP PE 365 média de 1,07 (superiores). Para verificar se a DEP PE 365 de touros utilizados na PIVE influencia na quantidade e cinética de embriões produzidos, 48 touros foram divididos em três grupos (superior, neutro e inferior) por meio da amplitude total de suas DEPs PE 365 e então utilizados na PIVE. Então, observou-se a quantidade e os tipos de blastocistos gerados por cada um dos grupos. Os resultados do presente trabalho mostraram: o genótipo CC no SNP analisado no gene LHR, e o genótipo TT no SNP analisado no gene IGF2 podem estar relacionados a animais de maiores DEP PE 365 (p 0.05); proteínas envolvidas em vias metabólicas foram predominantes no grupo dos touros superiores e portanto podem ser prováveis marcadores bioquímicos de reprodutores com maiores DEP PE 365; touros com maiores DEPs PE 365 resultam na maior PIV de embriões favoráveis para serem transferidos para vacas receptoras (Bl e Bx; blastocisto e blastocisto expandido; p 0.05). Tais resultados apresentam informações que podem auxiliar na seleção de animais com melhores dados fenotípicos de DEP PE 365 e, portanto, melhores reprodutores. / The breeding programs aim the selection of phenotypically and genetically superior animals . Among the selected characteristics to increase genetic gain in the herd, scrotal circumference stands out for its high heritability and correlation with sexual precocity, animal weight and morphology . Phenotypic selection for scrotal circumference may be aided by the addition of EPD SC 365 (expected progeny difference for scrotal circumference at 365 days ) to IVPE (in vitro production of embryos) reproductive biotechnology and molecular technologies such as the use of molecular markers like SNPs (Single Nucleotide Polymorphism ) and biochemical markers (proteins). Thus, this study aimed to: determine whether the SNPs present in genes B4GALT1 (Beta 1,4 - galactosyltransferase), FSHR (Follicle - stimulating hormone), LHR (Luteinizing hormone receptor) and IGF2 (Insulin- like growth factor 2) may be associated with higher values of EPD SC 365 in Nelore bulls; make global study of proteins in semen from Nelore bulls that may be indicative of greater EPD SC 365 and check if EPD SC 365 interferes negatively or positively on the results of IVPE. For the analysis of SNP, 178 bulls were divided into two groups, one with 104 animals of 365 negative EPD SC 365 and another with 74 animals with positive EPD SC 365. DNA was extracted from blood of these animals and genomic region of interest was amplified and analyzed by RFLP (restriction fragment polymorphism lengh). In the case of proteomics, two pools of semen were compared in respect to their protein profiles by LCMS (Liquid chromatography - mass spectrometry): One from three bulls that produce on average 17.6 % of in vitro embryo/oocyte and with EPD SC 365 average -0.3 (lower) and another pool from three bulls that produce on average 34.25% of in vitro embryo/oocyte with EPD SC 365 average of 1.07 (upper). To check if EPD SC 365 bulls used in IVPE influences the amount and kinetics of embryos, 48 bulls were divided into three groups (upper, lower and neutral ) through the full range of their EPDs SC 365 and then used in IVPE. Then, it was observed the amount and types of blastocysts generated by each group. The results of this study showed: the CC genotype at SNP analyzed in LHR gene, and the TT genotype at SNP analyzed in the IGF2 gene may be related to larger EPD SC 365 animals (p 0.05); proteins involved in metabolic pathways were predominant in group of senior bulls and can therefore be likely biochemical markers of breeding with larger EPD SC 365; bulls with larger EPD SC 365 used in IVPE result in greater favor of embryos to be transferred to recipient cows (Bl and Bx; blastocyst and expanded blastocyst, p 0:05). These results provide information that can assist in the selection of animals with improved phenotypic data EPS SC 365 and, therefore, the best breeders.

A cultivar Hass detém cerca de 90% do comércio de abacate para exportação. Em contrapartida, são descritas diversas cultivares de abacateiro protegidas por patentes em vários países, sendo menos da metade delas estabelecidas comercialmente. Ampliar o período de oferta de abacates do tipo \'Hass\' no mercado é de interesse para os exportadores brasileiros, pois impulsiona melhores negociações frente à demanda do fruto no mercado externo, sobretudo com países do Hemisfério Norte, em épocas em que o mercado se encontra num período crítico de alta demanda e baixa oferta. Este estudo objetivou avaliar variáveis que caracterizaram o desenvolvimento, a produção e os atributos de qualidade dos frutos das cultivares de abacateiros \'Hass\', \'Carmen\' e \'Gem\' nas condições edafoclimáticas da região Centro-Oeste do estado de São Paulo durante os anos de 2016 e 2017, visando ampliar o período de oferta dos frutos do tipo \'Hass\' no mercado internacional. No primeiro capítulo dessa dissertação, são apresentados os resultados relativos à comparação entre a cultivares Hass e Carmen, quanto às variáveis de crescimento de ramos de verão e de final de inverno/primavera, número de panículas por ramo, intensidade e tipo de florescimento, tamanho da planta (altura, diâmetro paralelo e perpendicular à linha de plantio e volume de copa), produção (Kg por planta, número de frutos por planta, eficiência produtiva e índice de alternância produtiva) e qualidade dos frutos (massa, diâmetro, comprimento, relação C:D, calibre e variáveis pós-colheita). Os resultados apontaram que \'Carmen\' apresentou maior crescimento dos ramos de verão, enquanto o mesmo foi observado para \'Hass\' nos ramos de final de inverno/primavera. No ano de 2016, \'Carmen\' produziu um número maior de panículas por ramo, em contrapartida, em 2017, a intensidade de florescimento foi maior para \'Hass\'. Nos dois anos, \'Carmen\' produziu mais inflorescências indeterminadas e menos determinadas em relação a \'Hass\'. Quanto à maturação dos frutos, \'Carmen\' mostrou-se mais precoce em cerca de quinze dias, embora ambas as cultivares tenham florescido na mesma época. \'Carmen\' apresentou superioridade em todas as variáveis produtivas analisadas, no entanto, mostrou-se mais alternante. Em ambos os anos, os frutos de \'Hass\' foram maiores em todas as variáveis que caracterizam o seu tamanho. As variáveis de pós-colheita apresentaram a mesma tendência em frutos de ambas as cultivares. No segundo capítulo, objetivou-se caracterizar o hábito vegetativo e reprodutivo da cultivar Gem na mesma região de cultivo. As avaliações foram executadas conforme as descritas no primeiro capítulo. \'Gem\' apresentou crescimento dos ramos de final de inverno/primavera mais acentuado, maior porcentagem de flores indeterminadas nos dois anos, maturação tardia, atingindo o percentual mínimo de matéria seca no final do mês de junho que evolui até o mês de outubro. As árvores possuem hábito de crescimento vertical, sendo indicada para pomares adensados. Os frutos produzidos são de tamanho grande. \'Carmen\' e \'Gem\' são promissoras para a região de cultivo, podendo ser indicadas como novas opções na produção de abacates do tipo \'Hass\'. / The Hass variety holds about 90% of the world avocado production. In contrast, within a wide range of several other avocado cultivars available in different countries, less than half of them had established commercially. Expanding the period of supply of \'Hass\' and \'Hass\'-type avocados is of interest to Brazilian exporters, because it facilitates fruit commercialization in the external markets of the Northern Hemisphere, in critical periods of high demand and low supply. The objective of this research was to evaluate plant growth, production and fruit quality attributes of \'Hass\', \'Carmen\' and \'Gem\' avocado cultivars in the edaphoclimatic conditions of the central-western region of the São Paulo State during the years of 2016 and 2017, aiming to extend the period of supply of \'Hass\' type fruits in the international market. In the first chapter of this dissertation, the results of the comparison between Hass and Carmen avocado cultivars are presented, regarding growth variables of summer and late winter/spring shoots, the number of panicles per shoot, the intensity and flowering type, tree size (height, diameter parallel and perpendicular to the planting line and canopy volume), yield (kg per plant, number of fruits per plant, yield efficiency and alternate bearing index) and fruit quality (mass, diameter, length and post-harvest quality variables). The results showed that \'Carmen\' avocado trees have higher growth of summer shoots, while \'Hass\' trees show larger growth of the shoots flushing by the end of winter/spring. In 2016, the \'Carmen\' trees yielded a larger number of panicles per shoot, while in 2017, the flowering intensity of \'Hass\' trees was higher. In both years, the \'Carmen\' trees produced a larger percentage of indeterminate inflorescences in comparison with \'Hass\' trees. In terms of fruit maturity, the \'Carmen\' fruit ripened about fifteen days earlier than \'Hass\' fruit in, although both cultivars flowered at the same time. The \'Carmen\' cultivar was superior than \'Hass\' in all the production variables analyzed in this study, despite of having a stronger tendency to alternate bearing. In both years, Hass\' yielded larger fruit size. Fruit post-harvest variables showed a similar tendency in both cultivars. In the second chapter, the objective was to characterize the vegetative and reproductive habit of the Gem cultivar in the same region of cultivation. The \'Gem\' trees have a vertical growth habit, being indicated for densified orchards, and showed stronger vigor of the winter/spring vegetative flush, with higher percentage of indeterminate flowers large fruit size and late maturation in both evaluated years. Both the \'Carmen\' and \'Gem\' avocado cultivars are promising for the growing region and may be indicated as new options for production of \'Hass\'-type avocados.