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Characterization of P.falciparum histone methyltransferases : biological role and possible targets for new intervention strategies / Caractérisation des histones méthyltransférases de P.falciparum : rôle biologique et cibles possibles pour de nouvelles stratégies d'interventionDing, Shuai 15 December 2016 (has links)
On a montré que les PTM jouaient un rôle significatif de P. falciparum dans l'année de contrôle de la régulation transcriptionnelle, de l'expression monoaléique et de la différenciation sexuelle. Dix SET contenant des HKMTs contenant du domaine-ont été prédits; Six d'entre eux être essentiels pour le développement de stages de sang asexués. Le projet de thèse est centré sur la caractérisation biologique de PfSET7 et PfSET6. Nous avons observé l'échange de localisation cellulaire dynamique Pendant le cycle de vie: PfSET7 se trouvent dans de multiples foyers cytoplasmiques dans les stades érythrocytaires asexués et le stage de foie, et plus frappante, dans la membrane du parasite enrichie en gamétocytes. PfSET6 EXPOSÉ une localisation nucléaire dans les anneaux et un modèle ponctué dans le cytoplasme des trophozoites matures et schizontes, et est enrichi dans les structures de foyers dans le cytoplasme des gamétocytes. Pris ensemble, notre étude suggère que la méthylation non histone est beaucoup plus significative chez P. falciparum que précédemment attendu. La méthylation à médiation par PfSET7 Peut être une extension du code histone à - d'autres protéines cytosoliques; Partiellement PfSET6 s'associe à des voies de répression transcriptionnelle dans le noyau et des régulateurs post-transcriptionnels dans le cytoplasme. Une étude plus approfondie vise à identifier des cibles de domaine SET contenant des protéines dans le gène inducible knockout mutant parasite lignes. Le fait que PfSET7 et PfSET6 sont exprimés à différents stades du cycle de vie, les fait comme de nouvelles cibles pour le développement de médicaments contre cette maladie grave et de bloquer la transmission. / In P. falciparum, PTMs have been shown to play an important role in the control of transcriptional regulation, monoallelic expression, and sexual differentiation. Ten SET domain-containing HKMTs have been predicted; six of them appear to be essential for asexual blood stage development. My lab has expressed and purified two enzymatically active recombinant methyltransferase PfSET7 and PfSET6. In vitro enzyme kinetics assays shows they can methylate histones. The dissertation project is centered around the biological characterization of PfSET7 and PfSET6. We observed the dynamic changes of cellular localization during life cycle: PfSET7 are found in multiple cytoplasmic foci in asexual erythrocytic stages and liver stage, and more strikingly, enriched in parasite membrane in gametocytes. PfSET6 exhibited a nuclear localization in rings and a punctuated pattern in the cytoplasm of mature trophozoites and schizonts, and is enriched within foci-like structures in the cytoplasm of gametocytes. Taken together, our study suggests that non-histone methylation is much more important in P. falciparum than previously anticipated. PfSET7-mediated methylation may be an extension of the histone code to other cytosol proteins; PfSET6 partially associates with transcriptional repression pathways in the nucleus and post-transcriptional regulators in the cytoplasm. Further study aims to identify targets of SET domain containing proteins within the inducible gene knock out mutant parasite lines. The fact that PfSET7 and PfSET6 are expressed in different life cycle stages, makes them as novel targets for drug development that could against severe disease and to block pathogen transmission.
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Dynamique collective de l'entreprise à vocation sociale : représentations de la finalité et évaluation du système de pilotage / Collective dynamics of social purpose project : purpose representations and evaluation of the piloting systemNkok, Luc 23 November 2015 (has links)
Notre recherche porte sur l’évaluation du « satisficing organisationnel » du système de pilotage des entreprises à vocation sociale (EVS). Pour cela, nous mobilisons une méthodologie qualitative centrée sur deux études cas enchâssés, dont une en longitunale. Il s’agit de Sos Maintien à Domicile et l’Eveil, deux entreprises associatives dans le champs institutionnel du médico-social. Nous mettons en évidence trois niveaux de résultats. Tout d’abord, nous évaluons, à travers les cartes cognitives, le système de représentations partagées permettant d’évaluer le sentiment d’efficacité organisationnelle. Ensuite , à travers les comptes de surplus de productivité global, nous mesurons la performance économique et sociale. La convergence des deux premiers niveaux de résultats permet de statuer sur l’état positif ou négatif du satisficing organisationnel. Enfin, l’analyse des cas et leur confrontation avec le modèle conceptuel et la revue de littérature, nous permet de définir des variables essentielles dont le système de pilotage de l’EVS, représenté par le pouvoir managérial ,peut s’en servir dans les différentes modes de régulation du projet. / Our research focuses on the evaluation of the "organizational satisficing" of social purpose business (EVS). For this, we mobilize a qualitative methodology centered on two embedded case studies, including one in longitunale way. "Sos Maintien à Domicile" and "Eveil" are both two associative enterprises in the institutional medico-social care field. We highlight three levels of results. First, we evaluate, through the cognitive maps, the system of shared representations to assess the sense of organizational effectiveness. Then, through the global productivity surplus accounts, we measure the economic and social performance. The convergence of the first two levels of results allows to rule on the positive or negative state of organizational satisficing. Finally, the analysis of cases and confrontation with the conceptual model and the literature review, allows us to identify key variables with the EVS control system, represented by the managerial authority, can be used in various project control modes.
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Influence de la lumière et de l'horloge circadienne sur la gestion de la carence en fer chez Ostreococcus sp. / Influence of light and circadian clock on iron deficiency management in Ostreococcus speciesBotebol, Hugo 11 December 2014 (has links)
Le fer est un élément présent en abondance dans la croûte terrestre, indispensable à la quasi-totalité des êtres vivants. Cependant, en milieu marin la biodisponibilité du fer est souvent faible et sporadique. Les micro-algues du phytoplancton ont développé des stratégies pour faire face à cette limitation en fer et s’adapter à des niches écologiques variables. Les micro-algues vertes du genre Ostreococcus (Prasinophyceae) présentent une large distribution géographique dans l’océan mondial, et de nombreux écotypes venant de milieux contrastés ont été isolés. L’objectif principal de ma thèse était d’étudier les différentes stratégies mises en place par le genre Ostreococcus, et notamment l’influence de la lumière et de l’horloge circadienne, dans la gestion de la carence en fer. Mon travail s’est focalisé sur l’étude d’Ostreococcus tauri, écotype lagunaire (Clade C), que de récentes techniques de transformation par insertion et recombinaison homologue ont promu comme un organisme modèle pour des approches de génétique fonctionnelle. J’ai étudié la ferritine, une protéine impliquée dans la gestion de la réserve en fer chez de nombreux organismes, et mis en évidence sa régulation par l’alternance jour/nuit et l’horloge circadienne. J’ai montré son rôle dans l’assimilation du fer, la régulation de l’homéostasie du fer et le recyclage du fer intracellulaire lors d’une carence. Enfin, j’ai caractérisé les stratégies d’acclimatation et d’adaptation à la carence en fer chez plusieurs écotypes d’Ostreococcus, dont O. tauri, RCC 802 (Clade A), RCC 809 (Clade B) et un mutant de taille/biomasse. Une stratégie d’acclimatation par réduction de la biomasse cellulaire a été mise en évidence. / Iron is an abundant element in the earth crust and is essential for almost organisms. In the marine environment, however, its bioavailability is often low and the iron supplies sporadic. Phytoplanktonic species have developed various strategies to face iron limitation and adapt to different ecological niches. Green picoalgae from the genus Ostreococcus (Prasinophyceae) are widespread in the global ocean and numerous ecotypes have been isolated from contrasted environments. The main objective of my thesis was to identify the strategie(s) used by the genus Ostreococcus in response to iron starvation and in particular the influence of the day/night cycle and the circadian clock in the regulation of iron homeostasis. I focused my work on the lagoon ecotype, Ostreococcus tauri (Clade C), which has emerged as a model organism for functional genomics approaches thanks to the development of genetic transformation by random insertion and homologous recombination. I have studied ferritin, a protein involved in iron storage which is present throughout the tree of life. I showed that ferritin is regulated by the light/dark cycle and the circadian clock and that it is a key player in the regulation of iron uptake and the recycling. Finally, I characterized the acclimation and adaptation strategies to iron limitations of several Ostreococcus ecotypes including O.tauri, RCC802 (Clade A), RCC809 (Clade B) and a cell biomass mutant of O.tauri. The reduction of cell biomass appears to be a main mechanism of acclimation in response to iron limitation.
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Optimisation et réduction de la variabilité d’une nouvelle architecture mémoire non volatile ultra basse consommation / Optimization and reduction of the variability of a new nonvolatile memory architecture ultra-low power consumptionAgharben, El Amine 05 May 2017 (has links)
Le marché mondial des semi-conducteurs connait une croissance continue due à l'essor de l'électronique grand public et entraîne dans son sillage le marché des mémoires non volatiles. L'importance de ces produits mémoires est accentuée depuis le début des années 2000 par la mise sur le marché de produits nomades tels que les smartphones ou plus récemment les produits de l’internet des objets. De par leurs performances et leur fiabilité, la technologie Flash constitue, à l'heure actuelle, la référence en matière de mémoire non volatile. Cependant, le coût élevé des équipements en microélectronique rend impossible leur amortissement sur une génération technologique. Ceci incite l’industriel à adapter des équipements d’ancienne génération à des procédés de fabrication plus exigeants. Cette stratégie n’est pas sans conséquence sur la dispersion des caractéristiques physiques (dimension géométrique, épaisseur…) et électriques (courant, tension…) des dispositifs. Dans ce contexte, le sujet de ma thèse est d’optimiser et de réduire la variabilité d’une nouvelle architecture mémoire non volatile ultra basse consommation.Cette étude vise à poursuivre les travaux entamés par STMicroelectronics sur le développement, l’étude et la mise en œuvre de boucles de contrôle de type Run-to-Run (R2R) sur une nouvelle cellule mémoire ultra basse consommation. Afin d’assurer la mise en place d’une régulation pertinente, il est indispensable de pouvoir simuler l’influence des étapes du procédé de fabrication sur le comportement électrique des cellules en s’appuyant sur l’utilisation d’outils statistiques ainsi que sur une caractérisation électrique pointue. / The global semiconductor market is experiencing steady growth due to the development of consumer electronics and the wake of the non-volatile memory market. The importance of these memory products has been accentuated since the beginning of the 2000s by the introduction of nomadic products such as smartphones or, more recently, the Internet of things. Because of their performance and reliability, Flash technology is currently the standard for non-volatile memory. However, the high cost of microelectronic equipment makes it impossible to depreciate them on a technological generation. This encourages industry to adapt equipment from an older generation to more demanding manufacturing processes. This strategy is not without consequence on the spread of the physical characteristics (geometric dimension, thickness ...) and electrical (current, voltage ...) of the devices. In this context, the subject of my thesis is “Optimization and reduction of the variability of a new architecture ultra-low power non-volatile memory”.This study aims to continue the work begun by STMicroelectronics on the improvement, study and implementation of Run-to-Run (R2R) control loops on a new ultra-low power memory cell. In order to ensure the implementation of a relevant regulation, it is essential to be able to simulate the process manufacturing influence on the electrical behavior of the cells, using statistical tools as well as the electric characterization.
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Distribution des Légionelles dans le bassin versant du Lac du Bourget : Cas particulier des sources contaminées du réseau aixois. / Occurency of the bacteria legionella pneumophila in lake Bourget tributaries : Efficiency of self regulation process downstream the junction with hot spring waterMaurice-Blanc, Cécile 25 October 2011 (has links)
L'étude s'intéresse à la bactérie Legionella pneumophila (Lpn) dans les biofilms des affluents du lac du Bourget. Elle confirme le caractère ubiquiste de cette bactérie, principalement sous sa forme non cultivable. Elle met aussi en évidence, le caractère local des facteurs naturels de régulation : seule la température de l'eau intervient dans la majorité des sites. Ce déterminisme local a aussi été mis en évidence avec l'étude du réseau hydrographique aixois qui reçoit à la fois des eaux thermales et celles de la rivière Le Tillet. Les perturbations thermique et chimique liées aux arrivées d'eau chaude sont détectables jusqu'à la partie aval du réseau. L'effet d'enrichissement des apports en Lpn qui leur correspondent reste localisé ce qui peut être la manifestation de processus naturels d'autoépuration. Nos résultats montrent également un comportement différent des organismes du groupe des Pseudomonas et des bactéries apparentées vis-à-vis des caractéristiques physico-chimiques. Des expériences effectuées en réacteurs biologiques ont montré qu'une augmentation de la vitesse ou de la température de l'eau est favorable à la présence de Lpn. Un modèle de transport de charges a été construit à partir duquel une gestion de l'utilisation du jet d'eau situé à proximité de la plage municipale d'Aix-les-Bains pourrait être faite pour tenir compte des périodes durant lesquelles des fragments de biofilms susceptibles de contenir des Lpn sont transportés en masse par le réseau aixois en direction de la plage. / The study concerns the occurrence of the bacteria Legionella pneumophila (Lpn) in biofilms from Lake Bourget tributaries. It confirms the ubiquity of the bacteria in flowing waters, but mainly as viable but non culturable state. It highlights that main environmental control factors are local, at the exception of water temperature which is involved in most studied sites. Local control of biofilms development has also been demonstrated in the study of the Aix-les-Bains hydrological network which receives hot springs water and water from the Tillet river. Thermal and chemical disturbances induced by hot waters entrances could still be detected at the farthest downstream part of the network. Biofilms enrichment in Lpn related to theses incomings kept localized possibly due to self-purification processes. Our results depict different answers of microorganisms like Pseudomonas and related bacteria towards physicochemical characteristics. Two experiments were performed based on biological reactors, showing that increases of water temperature or water flow, both enhance Lpn concentration. An hydrological transport model has been designed to serve the management of a waterspout sited by the Aix-les-Bains beach. It is written especially to address periods where biofilms transport holding high Lpn concentrations should be avoided.
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Réseaux de régulation chez Escherichia coli / Gene regulatory network in Escherichia coliBaptist, Guillaume 29 August 2012 (has links)
L'adaptation d'une bactérie aux changements de son environnement est contrôlée par un réseau de régulation large et complexe, faisant intervenir de nombreux acteurs et modules différents. Dans ce travail, nous avons étudiés un module de régulation spécifique, contrôlant l'adaptation de la bactérie Escherichia coli à un changement de sources de carbone. Dans un milieu contenant du glucose et de l'acétate, la croissance est divisée en deux phases : les bactéries utilisent préférentiellement le glucose et commencent à métaboliser l'acétate qu'après l'épuisement du glucose. En effet, la présence du glucose réprime la transcription d'un gène nécessaire à la croissance sur acétate, le gène acs (codant pour l'acétyl-CoA synthétase). Le mécanisme régulateur fait intervenir le facteur de transcription Crp-AMPc et le système de transfert de phosphate (PTS), qui permet l'import du glucose. Plusieurs modèles décrivent en détail la cascade de réactions moléculaires à l'origine de cette « répression catabolique ». Cependant, certaines de nos observations expérimentales ne sont pas correctement prédites par les modèles actuels. Ces modèles doivent être révisés ou complétés. L'outil majeur que nous employons pour les expériences est la fusion transcriptionnelle : une région promotrice fusionnée en amont d'un gène rapporteur (GFP, luciferase). Avec ces constructions, nous mesurons la dynamique de l'expression génique dans différentes souches (mutants) et différentes conditions environnementales. Les observations à l'échelle de la population sont corroborées par des mesures similaires à l'échelle de la cellule unique. Nous utilisons cette même technologie pour construire de petits systèmes synthétiques qui sondent davantage le phénomène de répression catabolique. Nous avons ainsi créé un interrupteur génétique dont le fonctionnement est contrôlé par le flux glycolytique et nous avons construit un petit système de communication intercellulaire basé sur la molécule AMPc. Enfin, nous proposons une manière originale de mesurer l'état métabolique des cellules en utilisant la dépendance énergétique de la luciferase. / The adaptation of bacteria to changes in their environment is controlled by a large and complex regulatory network involving many different actors and modules. In this work, we have studied a specific module controlling the adaptation of Escherichia coli to a change in carbon sources. In a medium containing glucose and acetate, growth is divided into two phases : the bacteria preferentially use glucose and start to metabolize acetate only after glucose exhaustion. Indeed, the presence of glucose represses the transcription of a gene needed for growth on acetate : the acs gene (coding for acetyl-CoA synthetase). The regulatory mechanism involves the Crp-cAMP regulator and the phosphate transfer system (PTS), which is responsible for glucose import. Several models describe the cascade of molecular reactions responsible for this « catabolite repression ». However, our work shows that many of our experimental observations are incorrectly predicted by current models. These models have to be amended.We use transcriptional fusion, i.e., the fusion of a promoter region upstream of a reporter gene (GFP, luciferase), to measure the dynamics of gene expression in different genetic backgrounds and environmental conditions. Observations at the population level are corroborated by similar measurements at the single cell level. We use this same technology to construct small synthetic systems that probe further aspects of the phenomenon of catabolite repression. We have thus created a genetic toggle switch controlled by the glycolytic flux and we have built an inter-cellular communication system mediated by cAMP. Finally, we propose a novel way to measure the metabolic state of cells by using the energy dependence of the luciferase enzyme.
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Les politiques d'éradication du travail des enfants dans l'Etat du Karnataka : l'Inde entre modernité, dérégulation et développement. / Eradication politiques in Karnataka : India between modernity, deregulation and developmentMartin, Pierrick 29 March 2012 (has links)
La thèse étudie un paradoxe apparent, à savoir l'évolution des politiques indiennes à l'égard du travail des enfants de démarches « régulationnistes » vers des stratégies abolitionnistes alors même que ces démarches sont critiquées pour leur inefficacité. La démarche adoptée articule l'approche segmentationniste à la démarche régulationniste de l'Etat. La première permet d'identifier le développement rural comme le cœur de la question sociale. La seconde étudie la synchronie de la dynamique des politiques publiques aux exigences de la question sociale. La généralisation des politiques abolitionnistes est interprétée comme un mécanisme supposé nécessaire à la construction des structures sociales nécessaires à la dynamique économique des zones rurales. Or, le tropisme moderniste des formations éducatives proposées nourrit la désarticulation des cursus aux besoins socioéconomiques ruraux. Ce faisant, les politiques abolitionnistes ne favorisent pas la dynamique des zones rurales ; pis encore, elles participent de l'accroissement tendanciel de la segmentation économique indienne. Partant de ce résultat intermédiaire, la thèse nourrit une analyse en termes de modernisation de l'Etat indien. Les politiques abolitionnistes sont alors entendues comme un corollaire à la construction d'une économie capitaliste. En accroissant la segmentation de l'économie, la modernité indienne dérégule le système socioéconomique. Les contestations politiques grandissantes témoignent de l'instabilité de la trajectoire politique indienne. / The thesis analyzes why Indian child labor policies have evolved to programs that aim at the eradication of child labor, however inefficiently. In order to get there, the adopted approach links segmentationnists and regulationnists theories. The first one analyses rural Indian growth as the heart of the social question. The second one studies the synchrony between policies and social question. The dynamic of child labor policies is seen as a step towards the social construction of an institutional architecture for Indian rural growth. But, given their modernism, these policies have proven unsuitable for Indian rural spaces. Hence, child labor elimination policies increase the spatial segmentation. The thesis considers this dynamic as a revelation of the Indian State modernization. Child labor policies are analyzed in the way of the construction of a capitalist economy in rural spaces. By increasing the spatial segmentation, the Indian state modernization deregulates the Indian path. This dynamic is dangerous for the Indian political system.
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Vers un domaine émotionnel du phénomène d'intolérance à l'incertitude / Towards an emotional model of the phenomenon of intolerance of uncertaintRoche, Jeanette 04 December 2017 (has links)
Cette recherche ancrée dans la réalité subjective de sujets tout venant, est une exploration des réactions émotionnelles en situation d’incertitude, dans le contexte du phénomène d’intolérance à l’incertitude. Deux contributions qui seront complémentaires l’une de l’autre, vont être présentées afin d’en proposer une modélisation. La première, quantitative, selon l’éclairage apporté par les modèles cognitifs de l’émotion, les modèles multiniveaux et dimensionnels et à l’aide de questionnaires traités par des analyses statistiques, a mis en évidence le rôle de l’attachement, de la régulation émotionnelle et de l’intensité affective dans le mode de fonctionnement émotionnel des sujets intolérants à l’incertitude.La seconde contribution, qualitative, à partir d’entretiens semi-directifs, dans une approche fonctionnelle et relationnelle des émotions, dans une première analyse sémio-pragmatique nous a amenée à proposer une modélisation dans laquelle nous observons deux voies : l’une qui semble plus couteuse pour le sujet intolérant à l’incertitude avec des manifestations somatiques, des difficultés à prendre des décisions, l’autre plus courte, permettant une maîtrise de la situation, par un traitement cognitif dans une recherche active de solution, ou par une acceptation des évènements, dans une certaine mise à distance. Une seconde analyse des entretiens à l’aide du logiciel Tropes, a permis de montrer les différences de modes d’adaptations en situation d’incertitude, entre les sujets intolérants vs tolérants et notamment le rôle du stress. Nous avons pu montrer que le stress semble occuper une place d’actant dans la problématique du sujet intolérant. / This research, anchored in the subjective reality of a random sample of individuals, is an exploration of emotional reactions in situations of uncertainty, in the context of the phenomenon of intolerance to uncertainty. Two contributions which will be complementary to each other, will be presented in order to propose a model. The first, quantitative, was founded on multi-level and dimensional cognitive models of emotion, and used data from questionnaires. The statistical analyses of the results highlighted the role of attachment, emotional regulation and emotional intensity in the emotional functioning of subjects intolerant of uncertainty.The second qualitative contribution was based on semi-directive interviews, in a functional and relational approach to emotions. A first semio-pragmatic analysis led us to propose a model in which we observe two paths: one that seems more emotionally costly for those intolerant to uncertainty, leading to physical symptoms and difficulties to make decisions, the other shorter, allowing more control over the situation, through cognitive procesing in an active search for solutions, or by the acceptance of events, which creates a distancing of the individual from the situation. A second analysis of the interviews using the Tropes software package, showed the differences in subjects’ adjustement styles in situations of uncertainty, between intolerant vs tolerant subjects and notably the role of stress. We were able to show that stress seems to occupy a place of actant in the problematic of the intolerant subject.
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Trois problèmes sur le marché d'un produit vert : évitement fiscal, signal et différenciation verticale / Three problems in the market of a green product : fiscal avoidance, signal, and vertical differentiationChistyakova, Maria 30 November 2017 (has links)
La qualité environnementale ayant des caractéristiques d'un bien public fait l'objet de cette thèse. Dans un cadre théorique, on étudie d'abord les moyens de régulation d'une entreprise polluante et ensuite le choix décentralisé de la qualité environnementale. Pour une entreprise capable d'esquiver le fisc, la conformité à la taxation est déterminée en fonction du niveau de la taxe. Lorsqu'elle augmente, la non-conformité devient plus attractive. L'échappement fiscal modifie la composition de la taxe : elle prend en compte l'effet d'un comportement de passager clandestin de la firme et l'effet de l'érosion de l'assiette fiscale. La taxe optimale du second rang doit équilibrer ces deux effets opposés. Le comportement de passager clandestin rend le régulateur soit impuissant, soit inéquitable en fonction de la sévérité du dommage environnemental et de l'efficacité de l'entreprise. Dans un second temps, on étudie l'impact de la taxe environnementale sur la politique de prix d'un monopole qui utilise le signal en prix afin de communiquer aux consommateurs le haut niveau de qualité environnementale inobservable. On applique deux critères de sélection de l'équilibre : le critère intuitif et le critère d'invincibilité. L'asymétrie d'information place le niveau de la taxe au-dessous du niveau Pigouvien ajusté selon l'exercice du pouvoir du marché. En cas de sélection par le critère d'invincibilité la taxe peut basculer un équilibre séparateur dans un équilibre mélangeant ce qui rétablit le problème d'asymétrie d'information. Enfin, on montre que le choix de qualité environnementale de la part de l'entreprise est sous-optimale même si elle internalise le dommage environnemental. / Environmental quality having features of a public good is the subject of the thesis. In a theoretical framework, we study a means of environmental regulation of a polluting firm endowed with market power and then determine the optimal decentralized choice of environmental quality. We start with examining how tax avoidance affects the optimal second-best tax on polluting emissions in a monopoly setting. The firm is owned by shareholders who differ in their cost of tax dodging. The optimal tax should correct two negative externalities of avoidance: the firm's free-riding effect and a tax base erosion effect. This free-riding makes the regulator either impotent or unfair, depending on the severity of the environmental damage and the firm's efficiency. Next, we analyze the impact of an environmental tax on the signaling price strategy of a monopoly that communicates to consumers the unobservable information about firm's highenvironmental performance. We use the intuitive and undefeated criteria of equilibrium selection. Asymmetric information places the optimal second-best tax below the level required under complete information. In the case of undefeated equilibria selection, the tax may induce a "migration" from separating equilibrium to pooling making the firm prefer to conceal the private information about environmental quality. Finally, we show that market choice of environmental quality by a firm that internalizes environmental damage from polluting emissions is yet suboptimal.
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Studying the posttranslational modifications of transcription factor Ikaros and their role in its function / Etude des modifications post-traductionnelles de facteur de transcription Ikaros et leur rôle pour son fonctionnementApostolov, Apostol 28 September 2012 (has links)
Le but de mon travail était d’étudier les modifications post-traductionnelles et plus précisément la sumoylation d’Ikaros. Mes études ont montré que le facteur de transcription Ikaros est modifié non seulement par SUMO-1 mais aussi par SUMO-2/3 sur plusieurs sites consensus. Cette modification est conditionnelle et dépendante du stade de développement des cellules T. J’ai trouvé un site consensus en plus des sites déjà décrits dans l’étude de Gómez-del Arco et al., 2005. En accord avec les résultats publiés, dans mon système expérimental, l’absence de sumoylation augmente les propriétés anti-prolifératives d’Ikaros, car ses mutants qui ne peuvent pas être sumoylés inhibent mieux la prolifération des cellules leucémiques. Un effet surprenant est l’absence d’un effet cumulatif de l’absence de sumoylation sur la prolifération des cellules. Par exemple, des mutants ponctuels qui ne perdent pas complètement leur sumoylation sont les meilleurs répresseurs de la prolifération, comparés avec le mutant où tous les sites modifiés sont mutés. Ce résultat est en contradiction avec les données publiées, parce qu’il suggère un rôle différent de la sumoylation, et non seulement comme un interrupteur physique des complexes Ikaros – NURD. J’ai fait des expériences utilisant l’expression d’un gène rapporteur comme un moyen de révéler des différences subtiles entre les propriétés répressives d’Ikaros et ses mutants sumo-déficients. Pour ces essais j’ai utilisé des cellules HeLa, un type cellulaire qui n’exprime pas Ikaros endogène et qu’il est donc théoriquement convenable pour étudier son effet sur l’expression d’un gène rapporteur. Mes résultats ont démontré que dans des cellules HeLa, il n’y pas de différence significative entre les propriétés répressives d’Ikaros et ses mutants sumo-déficients. Ces différences par rapport aux résultats obtenues avec la lignée de cellule T suggèrent une grande importance de contexte du système utilisé et que certains effets peuvent être observés uniquement dans des cellules T. Pour mieux comprendre le rôle de la sumoylation dans le fonctionnement d’Ikaros, j’ai analysé les transcriptomes des lignées cellulaires T qui surexpriment IK1-ER ou ses mutants. L’analyse des puces d’ADN a démontré un phénotype de dérégulation d’expression des gènes cibles d’Ikaros, différent entre la protéine WT et les mutants, ainsi qu’entre les mutants mêmes. Ce résultat suggère un rôle de la sumoylation d’Ikaros beaucoup plus complexe que l’interruption mécanique de son interaction avec le complexe NURD. Mes résultats ont aussi démontré que les autres membres de la famille d’Ikaros (Helios, Aiolos et Eos) sont également sumoylés, un événement qui pourrait être important pour la régulation de leurs fonctions. / The main topic of my PhD studies was to investigate the role of sumoylation in the function of Ikaros transcription factor, that regulates the lymphocyte differentiation and function. Sumoylation is a posttranslational modification that can change the properties and regulate the function of a given protein. Up to now, one study addressed the question of how sumoylationmodulates Ikaros function. It shows that Ikaros is sumoylated in total primary thymocytes, and that this dynamic event modulates Ikaros' repressive function. It also describes two consensus sumoylation sites on Ikaros (K58 and K240), the sumoylation of which leads to loss of Ikaros repressive function in ectopic reporter gene assays. The final conclusion of the study is that sumoylation does not alter the nuclear localization of Ikaros but acts as a mechanism disrupting its participation in both histone deacetylase (HDAC) dependent and independent repression. My work shows the presence of additional sumoylation site on Ikaros and demonstrates that sumoylation does not significantly alter its interaction with the nucleosome remodelling and histone deacetylase (NURD) complex in T-cell lines. The functional analysis of sumo-deficientmutants indicates a complex role of this modification in regulating Ikaros' transcriptional properties. The identification of this new sumoylation site contributes to a better understanding of Ikaros' dual repressive - activating function and suggests the existence of conditional Ikaros' interacting partners. Moreover, the different Ikaros splicing isoforms would have differentsumoylation profiles, which would complete the knowledge of their functional diversity.
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