Tese (Doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-23T00:33:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 248347.pdf: 4746322 bytes, checksum: 3a0e7a7e223770d8cd93b91e7b2c61d9 (MD5)

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-23T11:22:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 246205.pdf: 14530401 bytes, checksum: 583659e70642e6324d5b10900b31c74b (MD5) / A ocorrência de espécies reófitas está vinculada à presença de corredeiras nos rios. Devido à perda destes hábitats, principalmente pela construção de represas, e a inexistência de estudos com reófitas, a geração de dados é imprescindível para dar embasamento à conservação deste grupo. Assim, o presente estudo objetivou gerar informações sobre a reófita Dyckia brevifolia Baker (Bromeliaceae), bem como propor estratégias para sua conservação. A determinação da distribuição geográfica da espécie foi feita por meio de caminhamento ao longo das margens do Rio Itajaí-Açu, Santa Catarina, Brasil. Para caracterizar sua estrutura demográfica foi realizado um censo em 12 locais, onde as rosetas foram classificadas quanto ao seu estádio de desenvolvimento (plântulas, imaturas ou reprodutivas). As rosetas também foram classificadas em isoladas ou agrupadas. Em cinco locais foi avaliada a emissão clonal e a mortalidade de indivíduos, exceto plântulas. Para caracterizar o sistema reprodutivo foram conduzidos cinco tratamentos: agamospermia, autopolinização espontânea, autopolinização manual, polinização cruzada e controle. As características florais, a produção de néctar e os visitantes florais também foram estudados. A caracterização da diversidade genética (oito populações) e da taxa de cruzamento (quatro populações) foi feita através de marcadores alozímicos. A extensão de ocorrência de D. brevifolia corresponde a cerca de 80 km ao longo do Rio Itajaí-Açu, desde Lontras até Blumenau. Porém, as populações são disjuntas e nos 12 locais estudados sua área de ocupação correspondeu a menos de um hectare, o que se deve a alta seletividade ambiental apresentada pela espécie. O número de rosetas por local variou de 204 a 7.185, havendo uma correlação positiva entre a área ocupada pela espécie e o número total de rosetas (r = 0,82; p<0,05). A densidade média encontrada foi de 3,5 rosetas por m2 (s ± 1,9). Apenas 2,4% das rosetas ocorreram isoladas e 97,6% ocorreram agrupadas, em 2.254 grupos. Nos 12 locais avaliados foram registradas 30.443 rosetas, destas 1.789 (5,9%) eram plântulas, 24.426 (80,2%) eram imaturas e 4.228 (13,9%) eram reprodutivas. A taxa média de mortalidade foi de 5,3%. As plântulas corresponderam, em média, a 3,7% dos indivíduos, enquanto os clones a 6%. A propagação vegetativa foi considerada a principal forma de recrutamento. Cada inflorescência apresentou, em média, 60,4 flores (s ± 14,5; n = 30) e 58,3 frutos (s ± 13,3; n = 30), sendo a relação fruto/flor de 0,97. O número médio de sementes por fruto foi de 129,6 (s ± 24,3; n = 90). A abertura das flores ocorreu no sentido da base para o ápice da inflorescência e o número de flores abertas/dia por inflorescência foi, em média, de 6,8 (s ± 1,2; n = 30). Suas flores apresentaram antese ao longo do dia e duração de um dia e meio. Com relação ao sistema reprodutivo, os resultados indicaram que D. brevifolia é autocompatível e que a agamospermia pode ocorrer. O volume e a concentração médios do néctar (n = 30) foram de 30,5µl e de 25,7%, respectivamente. O beija-flor Amazilia versicolor Vieillot e as abelhas Xylocopa brasilianorum Linnaeus e Bombus spp. foram considerados os principais polinizadores de D. brevifolia. A taxa de cruzamento foi de 8,2%, indicando que a espécie é predominantemente autógama. Com relação à diversidade genética, as populações apresentaram, em média, 1,4 alelos por loco, 27% de polimorfismo e heterozigosidade esperada foi de 0,067, em 13 locos analisados. O valores médios encontrados para a relação e para a diversidade genotípica foram de 0,22 e 0,612, respectivamente. As populações a jusante no Rio Itajaí-Açu apresentaram os maiores índices de diversidade, o que foi atribuído à hidrocoria visto que o rio apresenta fluxo unidirecional. Grande parte da diversidade genética está distribuída entre suas populações ( =0,376) e a espécie apresenta, ainda, alelos raros e exclusivos. Com a construção da represa da Hidrelétrica Salto Pilões, Lontras, algumas populações poderão ser atingidas, sendo recomendada a conservação ex situ. Desta forma, no percurso de ocorrência da reófita D. brevifolia, a instalação de outras hidrelétricas não é recomendada, pois poderia inviabilizar a conservação in situ desta espécie.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos e Vegetais. / Made available in DSpace on 2012-10-23T20:56:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 262737.pdf: 1706935 bytes, checksum: 54f9fff0c585dcd97d8a4fb9f1e67209 (MD5) / A queima de turcicum do milho (Zea mays L.), causada por Exserohilum turcicum, é uma das principais doenças desta cultura. Em vista dos danos causados, buscam-se estratégias que minimizem as perdas nos campos de cultivo. Uma das formas mais eficientes de controle dessa doença é a utilização de variedades com resistência genética. Pelo fato das variedades locais apresentarem variabilidade genética, são consideradas fontes potenciais de genes capazes de isentar ou minimizar os impactos dessa doença nas lavouras de milho. A utilização de variedades locais com maiores níveis de resistência à queima de turcicum permite ao agricultor de pequenas propriedades maior autonomia sobre sua produção. O objetivo deste trabalho foi avaliar a reação de nove variedades locais de milho frente a diferentes isolados de Exserohilum turcicum quanto aos componentes que determinam a resistência quantitativa e qualitativa à queima de turcicum. Os experimentos foram realizados na Fazenda da Ressacada da Universidade Federal de Santa Catarina, em Florianópolis/SC. Foram testadas nove variedades locais procedentes do município de Anchieta/SC - Mato-Grosso (39), Palha-Roxa (18), Roxo (30), Roxo (29), Composto São Luiz (13), MPA1 (26), Língua de Papagaio (19), Mato Grosso # Palha Roxa (37) e Rajado 8 Carreiras (31) - frente a 3 isolados de Exserohilum turcicum coletados nos municípios de Anchieta, Florianópolis e Xaxim # SC. Foram realizadas avaliações para período de incubação, severidade e incidência, em um experimento conduzido no esquema de parcelas subdivididas, no delineamento de blocos ao acaso, com quatro repetições, tendo os isolados como parcelas e as variedades como subparcelas. O período de incubação correspondeu ao número de dias transcorridos entre a inoculação e o surgimento dos sintomas. A severidade foi medida em quatro etapas fenológicas distintas (15, 25, 35 e 45 dias após a inoculação), considerando a percentagem de área do tecido lesionado em folhas individuais e na planta inteira, a partir de uma amostra de 5 plantas de cada subparcela. Com base nos dados de severidade obtidos nas quatro avaliações, foi calculada a área abaixo da curva de progresso da doença (AACPD) para as avaliações feitas em folhas e em plantas inteiras. A incidência de doença foi quantificada aos 15 e 25 dias após a inoculação. Os resultados apresentaram diferenças significativas entre variedades, em todas as variáveis analisadas. O menor período de incubação foi verificado na variedade Rajado 8 Carreiras (31) (média de 10,6 dias), enquanto que a variedades Palha-Roxa (18) apresentou o maior período de incubação (média de 12,86 dias), sendo que as variedades Mato-Grosso (39), Roxo (30), Roxo (29), Composto São Luiz (13), MPA1 (26), Língua de Papagaio (19) e Mato Grosso # Palha Roxa (37) apresentaram valores intermediários a estes e não diferiram entre si estatisticamente. As avaliações de severidade para a folha individual e para a planta inteira foram bastante semelhantes. A menor AACPD calculada com base na severidade medida em folha e planta inteira foi observada na variedade MPA1 (26), enquanto que a variedade Roxo (29) apresentou a maior severidade. As variedades Mato-Grosso (39), Palha-Roxa (18), Roxo (30), Composto São Luiz (13), Língua de Papagaio (19), Mato Grosso # Palha Roxa (37) e Rajado 8 Carreiras (31) apresentaram valores intermediários de severidade, não diferindo entre si estatisticamente. Estes resultados são semelhantes aos observados para a incidência. Os menores valores de incidência, nas avaliações realizadas aos 15 e 25 dias após a inoculação, foram observados nas variedades Mato-Grosso (39) (23,61%) e MPA1 (26) (71,53%), respectivamente. A variedade Roxo (29) apresentou a maior incidência aos 15 e 25 dias, com 48,61% e 90,97% de plantas doentes, respectivamente. De maneira geral, a variedade MPA1 (26) apresentou maior resistência à queima de turcicum, enquanto que a variedade Roxo (29) apresentou maior suscetibilidade. O conhecimento da diversidade, complexidade e evolução da população de Exserohilum turcicum, através do monitoramento das raças predominantes nas regiões produtoras de Santa Catarina é indispensável para a recomendação de cultivares que possam reduzir os prejuízos causados por Exserohilum turcicum. The Northern leaf blight of the corn (Zea mays L.), caused by Exserohilum turcicum, is one of the main diseases of this crop. In view of the damage, is seeking strategies to minimize losses in fields of crops. One of the most efficient ways of controlling this disease is the use of varieties with genetic resistance. Because of the local varieties have genetic variability, are considered potential sources of genes able to exempt or minimize the impact of the disease in crops of maize. The use of local varieties with higher levels of resistance to Northern leaf blight allows burning of the properties of small farmers more autonomy over their production. The objective was to evaluate the reaction of nine local varieties of maize to different isolates front to exserohilum turcicum on the components that determine the qualitative and quantitative resistance to Northern leaf blight. The experiments were taken at the Fazenda da Ressacada at Universidade Federal de Santa Catarina in Florianópolis. Nine local varieties from Anchieta # Santa Catarina, were tested: Mato-Grosso (39), Palha-Roxa (18), Roxo (30), Roxo (29), Composto São Luiz (13), MPA1 (26), Língua de Papagaio (19), Mato Grosso # Palha Roxa (37) and Rajado 8 Carreiras (31) - confronting three isolates of Exserohilum turcicum from Anchieta, Florianópolis and Xaxim, in the state of Santa Catarina. There were performed assessments for the incubation period, severity and incidence in an experiment with four repetitions conducted in split plot in a randomized block design having the varieties as subplots and the different isolates as plots. The incubation period corresponded to the number of days passed between the inoculation and the appearance of symptoms. The Severity was measured in four distinct fenologic stages (15, 25, 35 e 45 days after inoculation), considering the percentage of the area of injured tissue in individual leaves and whole plant, from a sample of five plants of each subplot. The area under the disease progress curve (AUDPC) was calculated based on data obtained in four of severity ratings for the assessments made in leaves and whole plants. The incidence of the disease was quantified 15 and 25 days after the inoculation. The results showed significant differences between varieties in all variables. The shorter period of incubation was observed in variety Rajado 8 Carreiras (31) (average of 10,6 days), while the varieties Palha Roxa (18) showed the longest period of incubation (average of 12,86 days), and the varieties, Mato Grosso (39), Roxo (30), Roxo (29), Composto São Luiz (13), MPA1 (26), Língua de Papagaio (19) and Mato Grosso - Palha-Roxa (37) had intermediate values for these and did not differ tatistically. The ratings of severity for individual leaves and the whole plant were very similar. The lowest AUDPC based on the severity measured in leaf and whole plant was observed in variety MPA1 (26), while the variety Roxo (29) showed the highest severity. The varieties, Mato Grosso (39), Palha-Roxa (18), Roxo (30), Composto São Luiz (13), Língua de Papagaio (19), Mato Grosso # Palha Roxa (37) and Rajado 8 Carreiras (31) had intermediate values of severity, not differing statistically. These results are similar to those observed for incidence.The lowest values of incidence in the evaluations performed at 15 and 25 days after inoculation were found in the varieties Mato-Grosso (39) (23,61%) and MPA1 (26) (71,53%), respectively. The variety Roxo (29) had the highest incidence at 15 and 25 days, with 48,61% and 90,97% of diseased plants, respectively. In a generalized manner, the variety MPA1 (26) showed higher resistance to Northern leaf blight, while the variety Roxo (29) showed greater susceptibility. The knowledge of the diversity, complexity and evolution of the population of Exserohilum turcicum, by monitoring the predominant races in the producing regions of Santa Catarina is essential to the recommendation of cultivars that can reduce the damage caused by Exserohilum turcicum.

Dissertação (Mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2009. / Made available in DSpace on 2012-10-24T10:31:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 273252.pdf: 5915107 bytes, checksum: 963fe31249a8a38551c38591dcb712db (MD5) / A manutenção dos remanescentes de Floresta Atlântica é de grande importância, justificando-se por aspectos econômicos e sociais palpáveis, que envolvem desde a manutenção e regularização de mananciais hídricos, conservação de solos e conservação da biodiversidade existente para o uso e manejo dos recursos florestais múltiplos. O manejo de plantas medicinais nativas é uma alternativa capaz de promover um incremento de renda aos produtores, ao mesmo tempo em que pode representar uma opção para a viabilização da conservação do ambiente natural e para o resgate e difusão do conhecimento tradicional. Entre essas plantas, Bromelia antiacantha é uma espécie nativa da Mata Atlântica, e da qual os frutos são utilizados tradicionalmente no Planalto Norte Catarinense para a confecção de um xarope expectorante. Além disso, a espécie é amplamente utilizada como cerca - viva na região. Neste contexto o principal objetivo do trabalho foi fundamentar estratégias de manejo sustentável de populações naturais de Bromelia antiacantha contribuindo na ampliação do conhecimento de espécies tradicionalmente utilizadas. O estudo foi desenvolvido na Floresta Nacional de Três Barras, SC e na comunidade da Campininha, vizinha à FLONA. Foi avaliada a estrutura demográfica de uma população natural de B. antiacantha sob cobertura de floresta ombrófila mista bem como a dinâmica de regeneração natural dessa população. Para tal, foram realizados acompanhamentos mensais (de Setembro/07 a Agosto/08) do desenvolvimento vegetativo de 88 indivíduos amostrados aleatoriamente (genets e ramets). Foram avaliados comprimento médio da folha, número de folhas emitidas e o recrutamento entre classes baseadas no comprimento da folha. Além disso, foram realizadas avaliações demográficas envolvendo todos os individuos existentes em cinco parcelas permanentes de 600 m2 cada. Foram avaliados o comprimento da folha, e recrutamento e estádio fenológico em cinco avaliações (2001, 2002, 2003, 2005 e 2008) ao longo de sete anos. Os resultados obtidos indicaram uma tendência dos indivíduos mais jovens, destacando os brotos (ramets) de possuirem as maiores taxas de incremento tanto em comprimento quanto em número de folhas sendo também como conseqüência deste incremento os indivíduos que recrutaram/ trocaram de classe de tamanho mais rapidamente.O baixo número de plântulas observados e o fato dos indivíduos genets demorarem mais tempo para serem recrutados evidenciam que a população pode estar sendo mantida principalmente pela reprodução clonal. Indivíduos reprodutivos (39) foram acompanhados quinzenalmente, e destes foram caracterizadas as infrutescências quanto ao número de frutos, comprimento e diâmetro dos frutos, comprimento da infrutescência, comprimento médio da folha e número total de folhas, número de brotos emitidos, tamanho médio, incremento em tamanho e número de folhas do broto. Os resultados obtidos evidenciaram que o tamanho médio dos frutos foi de 3,7cm de comprimento e 1,9cm de diâmetro, sendo que o peso médio das infrutescências foi 3,6 Kg Estimou-se ainda a produção de frutos de até 146kg ha-1 sendo que a renda bruta com a confecção de xarope pode chegar a R$1168,00 ha-1. Caracterizou-se ainda as formas de uso e manejo de B. antiacantha na comunidade da Campininha através de entrevistas semi estruturadas onde os principais usos da espécie são a cerca-viva, a confecção do xarope e a utilização do "palmito" na alimentação.Verificou-se que a espécie faz parte do cotidiano da comunidade estando presente em ambientes diversificados: como matas mais fechadas, caívas e em locais com início de colonização pela espécie. Verificou-se também que pode estar em curso um possível processo de domesticação do caraguatá.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2013-07-16T02:55:31Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Os mapas genéticos de ligação foram gerados a partir da seleção de 90 indivíduos obtidos de um cruzamento entre as cultivares de ameixeira japonesa Chatard e Santa Rosa. Os mapas foram desenvolvidos separadamente, um para cada parental de acordo com a estratégia de pseudo-cruzamento teste. Um total de 115 marcadores (98 AFLPs, 11 microssatélites e 6 RAPDs) foram incluídos em 8 grupos de ligação da cv. Chatard, cobrindo um total de 2149,1 cM. Para a cv. Santa Rosa foram mapeados 140 marcadores (130 AFLPs, 9 microssatélites e 1 RAPD) em 11 grupos de ligação cobrindo um total de 2395,9 cM. Sete microssatélites permitiram a ancoragem de 4 grupos de ligação entre as cvs. genitoras. A análise dos dados obtidos nos sete anos (1998 - 2004) de avaliação quanto à incidência da escaldadura das folhas (Xylella fastidiosa), mostraram a evolução e a severidade da doença na cultura da ameixeira, principalmente após as plantas cessarem a fase de crescimento (juvenil). Os resultados destas avaliações fenotípicas e os dados da característica de vigor do ano de 2004, foram utilizados para identificar QTLs putativos para estas duas características, com base na estratégia de mapeamento de intervalo. Os QTLs encontrados explicaram de 11,3% a 19,5% da variação fenotípica. Na cv. Chatard foram localizados 6 QTLs com LOD = 2,0 e na cv. Santa Rosa foram localizados 2 QTLs. O maior QTL (LOD 3,19) relacionado à resistência à escaldadura das folhas foi localizado no grupo de ligação SR1 do parental suscetível. Porém os QTLs não se mantiveram na mesma região genômica ao longo dos anos de avaliação. A combinação AFLP 6f670 localizado no mapa da cv. Santa Rosa foi a que apresentou a maior associação com a característica de incidência a escaldadura das folhas avaliada em 2002 com R2 igual a 0,388. Este marcador deveria ser submetido a outras populações segregantes à escaldadura das folhas, para verificar se está realmente relacionado à resistência. Como 110 e 121 marcadores das cvs. Chatard e Santa Rosa ainda não foram mapeados em nenhum grupo de ligação, há necessidade de submeter à população a novos marcadores, especialmente microssatélites, para que os mapas possam ser saturados e assim permitirem a resolução de características quantitativas e facilitar estudos genéticos e a seleção assistida por marcadores.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2012-10-22T08:15:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 231712.pdf: 1687513 bytes, checksum: 82f8ab4716346b6104b4d7291a61433f (MD5) / A viticultura no Brasil hoje é uma atividade consolidada e de grande importância sócio-econômica para os Estados do Rio Grande do Sul e Santa Catarina. Nestes ainda se constitui numa exploração agrícola fixadora do homem ao ambiente rural. A partir de 1998, com o empenho da indústria vitivinícola houve um aumento da área plantada e da demanda de uva, tanto para vinho quanto para mesa e suco. Mesmo assim verifica-se de forma acentuada que o grande problema do setor vitícola, principalmente o Catarinense é a falta de mudas com garantia de qualidade e livres de doenças e pragas, ofertadas aos produtores. Para isso, diversas metodologias de propagação in vitro foram e vem sendo desenvolvidas para a multiplicação em larga escala de plantas de videira sadias e com características agronômicas especiais desejadas. Assim, o objetivo deste trabalho foi estudar metodologias de propagação via desenvolvimento de gemas axilares, calogênese/organogênese e embriogênese somática a fim de contribuir para processos de multiplicação in vitro. Para isto, foram selecionados os portaenxertos Paulsen 1103 e VR 043-43 e a variedade vinífera Cabernet Sauvignon. Constatou-se que a metodologia de gemas axilares, sem o uso de reguladores de crescimento, é uma técnica eficiente para propagação in vitro e apropriada para seleção, multiplicação e conservação de germoplasma in vitro. No entanto, a metodologia para calogênese e organogênese, através de explantes foliares não mostrou resultados animadores na produção de gemas, brotos e raízes. Para a embriogênese somática, a variedade Cabernet Sauvignon apresentou calos com aspecto embriogênico, mas não foi possível a obtenção de todas as fases de embriogênese somática. O Paulsen 1103 respondeu bem aos estímulos dos meios de cultura, principalmente quando enriquecidos com vitaminas e aminoácidos. Já o VR 043-43 e Cabernet Sauvignon apresentaram-se mais seletivos aos meios mais leves ou menos ricos em nutrientes. Os resultados dos três trabalhos permitiram estabelecer diferenças genotípicas in vitro entre as três variedades avaliadas. The Brazilian viticulture is an activity consolidate with meaningful social and economical importance to Rio grande do Sul and Santa Catarina States. In these States, the viticulture maintains the people in the field. Since 1998 the industry of grape and wine increased the planted area and the demand of juice. But is know that the problem of Santa Catarina is the lack of elite plants with genetic fidelity and high sanitary quality. The objective of this work was to develop methodologies of micropropagation of axillary buds, callogenesis/organogenesis and somatic embryogenesis of rootstocks Paulsen 1103 and VR043-43 and cultivar Cabernet Sauvignon in vitro. The methodologie of axillary buds, without plant growth regulators is appropriate to propagation in vitro and conservation of germoplasm. However, callogenesis and organogenesis, from leaves, didn't showed good results on the formation of buds, shoots and roots. Somatic embryogenesis to Cabernet Sauvignon related callus with embriogenic aspect, but the others levels of somatic embryogenesis wasn't possible. Paulsen 1103 behaved as eneralist in the rich culture medium. However VR 043-43 and Cabernet Sauvignon behaved as selectives in he soft médium. The results of three reports showed genotipics differences in vitro to the three cultivars appraised.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-22T08:52:10Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / O. catharinensis Mez. é uma árvore nativa, monóica, com flores hermafroditas, dispersão zoocórica e ameaçada de extinção, que ocorre na Floresta Ombrófila Densa nos Estados da região Sul e Sudeste do Brasil. Estudos demográficos e o entendimento da distribuição da variabilidade genética entre e dentro de populações permitem melhor orientação das práticas de restauração, conservação e manejo de uma espécie. Este trabalho teve por objetivo contribuir para a definição de estratégias de conservação em populações naturais de O. catharinensis a partir da avaliação da estrutura demográfica, estrutura genética e estrutura genética interna. Para isto, foram amostrados indivíduos reprodutivos (DAP 5cm) em quatro populações naturais de O. catharinensis no Estado de Santa Catarina: Parque Estadual da Serra do Tabuleiro (PEST), Santo Amaro da Imperatriz, SC (27o44'43"S, 48o49'13"W), Parque Botânico do Morro Baú (PMB), Ilhota, SC (26o47'56"S, 48o55'49"W), Área Particular da MOBASA (CP), Corupá, SC (26º25'06"S, 49º22'02"W) e Área Particular do Produtor Antônio Alberton (GP), Grão Pará, SC (28º14'17"S, 49º17'40"W). O estudo da estrutura demográfica foi realizado a partir do georeferenciamento destes indivíduos nas populações. Obteve-se para a O. catharinensis uma densidade média para o Estado de Santa Catarina de 7 indivíduos por hectare, densidade inferior a registrada para a espécie em estudos realizados na década de 1950. Foi encontrada para a O. catharinensis uma distribuição espacial agregada e similar nas quatro populações estudadas. Sugere-se que esta distribuição agregada nos indivíduos adultos seja conseqüência da possível dispersão e deposição de sementes de maneira agrupada realizados pela fauna, especialmente por primatas (Cebus apella e Alouatta spp). A estrutura genética das quatro populações de O. catharinensis foi investigada utilizando-se 18 locos alozímicos. As estimativas do número médio de alelos por loco (2.2), percentagem de locos polimórficos (83.3%) e a diversidade genética (0.4265), foram similares às obtidas para outras espécies de Lauraceae. A endogamia detectada nas populações ( = -0.0114) e a endogamia total ( = 0.1330) sugerem estrutura nas populações; foi encontrada uma alta divergência entre as populações ( = 0.1428). Sugere-se que a divergência populacional está relacionada à migração e dispersão de sementes realizadas pelos dispersores da O. catharinensis, e associado com a paisagem e as distâncias entre as populações. O resultado obtido da estimativa do tamanho mínimo viável de cada população revelou a possibilidade de sobrevivência de 10 gerações de O. catharinensis, nos locais amostrados. Contudo, a área atual dos fragmentos amostrados mostrou-se insuficiente quando comparada a área mínima viável para conservação destas populações (64ha) por mais de 10 gerações. A análise de autocorrelação espacial evidenciou a presença de uma estrutura interna nas primeiras classes (até 100m), sugerindo a presença de uma estrutura familiar. Os resultados do presente estudo sugerem que a dispersão das sementes da espécie, que ocorre de forma zoocórica, também seja o principal fator responsável pela estruturação dentro das populações. Os presentes resultados sugerem que as estratégias para a conservação in situ da O. catharinensis devem ser intensificadas em diferentes populações localizadas em floresta climáxica entre cotas de 300 a 900m de altitude e que a conectividade dos fragmentos de floresta climáxica tem que ser restabelecida para a manutenção do fluxo gênico e para contrapor um futuro aumento da divergência entre as populações.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:56:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 326995.pdf: 1891845 bytes, checksum: 01f58062253976899df2c994526165dd (MD5) Previous issue date: 2014 / O elevado uso de fertilizantes na agricultura vem ocasionando diversos problemas ambientais, tais como eutrofização de rios e mananciais, volatilização e escoamento superficial. Com o objetivo de diminuir a utilização de fertilizantes na agricultura, principalmente os nitrogenados, tem-se utilizado as bactérias promotoras de crescimento vegetal (BPCV), as quais quando em associação com as plantas, promovem o crescimento através da produção e secreção de fitormônios, proteção do hospedeiro contra fitopatógenos e realizam a fixação biológica de nitrogênio. São encontradas atualmente diversas espécies de BPCV capazes de estabelecer associação com plantas, dentre estas destaca-se Herbaspirillum seropedicae como um importante microrganismo endofítico capaz de estabelecer associação com diversas culturas de importância econômica, tais como milho, arroz, sorgo, trigo e cana de açúcar. A bactéria H. seropedicae cepa SmR1 é um mutante espontaneamente resistente ao antibiótico estreptomicina e teve seu genoma sequenciado e publicado em 2011. Com o avanço na utilização destas bactérias como promotoras de crescimento, métodos para detectar e quantificar a presença destes organismos endofíticos são necessários. Neste sentido, este trabalho teve por objetivo o desenvolvimento de iniciadores específicos para identificação e quantificação da BPCV H. seropedicae cepa SmR1 em plantas de milho inoculadas, através da técnica de PCR em Tempo Real. Foram desenhados dois iniciadores, HERBAS1 e HERBAS2, que foram testados quanto a sua especificidade contra 12 espécies diferentes de bactérias. Após, foram realizadas dez curvas padrões utilizando o iniciador HERBAS1 e diluições seriadas de DNA genômico de H. seropedicae SmR1. Foi obtida eficiência de 91% e coeficiente de correlação de 0,99. O limite de detecção observado foi de 101 cópias (correspondendo a 60,3 fg de DNA bacteriano) de H. seropedicae SmR1. O iniciador HERBAS1 foi utilizado para detecção e quantificação de H. seropedicae SmR1 em raízes de plântulas de milho inoculadas, as quais foram cultivadas in vitro e em potes, e coletadas 1, 4, 7 e 10 dias após a inoculação (DAI). Foi observado para as amostras in vitro um incremento no número de cópias nas amostras analisadas, variando de 107 cópias (um DAI) até 109 (dez DAI). Para o experimento em potes foi observado aproximadamente 106 cópias de H. seropedicae SmR1 nas amostras analisadas. Deste modo, o iniciador HERBAS1 mostrou-se específico para detectar e quantificar H. seropedicae SmR1, e este iniciador poderá ser utilizado para monitorar a interação entre planta-bactéria.<br> / Abstract : The elevated use of fertilizers in agriculture is leading to several environmental problems, such as eutrophication of rivers and lakes, volatilization and run off. Aiming to reduce the amount of fertilizers used in agriculture, mainly the nitrogenous, the plant growth promoting bacteria (PGPB) has been employed, which when associated with crops, promote growth through the production and secretion of phytohormones, protect the host against phytopathogens and perform nitrogen biological fixation. Several PGPB species are found today, which are capable to establish an association with plants, however, Herbaspirillum seropedicae is the one that stands out as an important endophytic microorganism able to create an association with sereval economic importance crops, such as maize, rice, sorghum, wheat and sugar cane. The H. seropedicae bacteria strain SmR1 is a mutant spontaneously resistant to streptomycin antibiotic and had its genome sequenced and published in 2011. With the progress in the utilization of those bacteria as growth promoters, methods to detect and quantify the presence of these endophytic organisms are needed. In this sense, this study aimed the development of specific primers to identification and quantification of the PGPB H. seropedicae strain SmR1 in maize plants inoculated, through the Real Time PCR. Two primer pairs were designed, HERBAS1 and HERBAS2. They were tested regarding its specificity against 12 different species of bacteria. Afterwards, ten standard curves were performed using the HERBAS1 primer pair and serial dilutions of H. seropedicae SmR1 genomic DNA. Efficiency of 91% and correlation coefficient of 0.99 were obtained. The detection limit of 101 copies was observed (corresponding to 60.3 fg of bacterial DNA) of H. seropedicae SmR1. The HERBAS1 primer was used for detection and quantification of H. seropedicae SmR1 in inoculated maize roots, which were cultivated in vitro and in pots, and collected after 1, 4, 7 and 10 days after inoculation (DAI). Was observed for in vitro samples an increase in the copy number in the analyzed samples, ranging from 107 copies (one DAI) until 109 copies (ten DAI). In the pots experiment, was observed approximately 106 copies of H. seropedicae SmR1 in the analyzed samples. Therefore, the primer pair HERBAS1 proved to be sensitive enough to detect and quantify H. seropedicae SmR1, thus this primer pair could be used to monitor the plant-bacteria interaction.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T18:10:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 326781.pdf: 1818742 bytes, checksum: c9fcf683a62e94042b732ee609e236e5 (MD5) Previous issue date: 2014 / As rizobactérias promotoras de crescimento vegetal (RPCV) são um grupo de micro-organismos benéficos às plantas devido à sua capacidade de estimular o crescimento vegetal através de vários processos. Uma das mais importantes e estudadas RPCV é a Azospirillum brasilense, uma diazotrófica associada com importantes culturas tais como milho e trigo, a qual possui ampla distribuição geográfica e tem sido usada como organismo modelo para investigar a promoção do crescimento vegetal associativo. Vários mecanismos estão envolvidos na promoção do crescimento vegetal por A. brasilense, entre eles: capacidade de fixação biológica de nitrogênio e à produção de fitormônios, os quais levam à formação de raízes laterais e, consequentemente, à melhor adsorção de água e minerais e, à maior tolerância a estresses, promovendo efeitos positivos sobre os mecanismos de defesa. Neste trabalho foram avaliados parâmetros de crescimento de duas variedades de milho Dekalb 240 (DKB240) e Pioneer 30F53 (P30F53), crescimento bacteriano nas raízes e perfil de proteínas em uma variedade (P30F53) quando as plântulas foram crescidas in vitro. Realizou-se a detecção e quantificação por PCR em tempo real de A. brasilense em plântulas de duas variedades de milho. Os iniciadores foram desenhados e sua especificidade foi verificada usando DNA de 12 diferentes espécies de bactérias. Os resultados dos experimentos de qPCR apresentaram valores dentro da variação aceitável para qPCR, eficiência média de 95% e coeficiente de correlação de 0,98, indicando que o gene nifA é adequado para a análise quantitativa do genoma alvo bacteriano. O número de cópias de DNA bacteriano por grama de massa fresca de raiz aumentou de 3,3 x 106 (1 DAI) para 5,3 x 109 (10 DAI) quando raízes inoculadas de milho da variedade DKB240 foram analisadas e, da mesma maneira, variando de 6 x 106 (1 DAI) para 6,8 x 109 (10 DAI) na variedade P30F53 quando cultivadas in vitro. Os iniciadores desenvolvidos visando nifA serão úteis para monitorar Azospirillum brasilense FP2 em culturas no sistema solo-planta. Comparando-se plântulas da variedade P30F53, controle e inoculadas com A. brasilense FP2, foram encontradas diferenças significativas 7 dias após a inoculação (DAI) em 7 dos 8 parâmetros avaliados (massa fresca e tamanho da folha, massa fresca e tamanho da raiz principal, número de raízes laterais, massa fresca e número de raízes adventícias e massa fresca total das raízes). A observação de raízes através da microscopia eletrônica de varredura (MEV) mostrou que A. brasilense FP2 se liga à superfície radicular, tanto na região do ápice quanto do terço médio, e podem ser encontradas como células simples ou agregadas. A análise do perfil de proteínas, obtido através da técnica de eletroforese bidimensional (2DE), revelou 46 spots diferencialmente acumulados em raízes de milho da variedade Pioneer 30F53 inoculadas com A. brasilense FP2. Os spots foram analisados por espectrometria de massa e três proteínas apresentaram homologia com proteínas hipotéticas de milho e arroz.<br> / Abstract : The plant growth promoting bacteria (PGPB) are a group of microbes beneficial to plants due to its ability to stimulate plant growth by various processes. One of the most important and studied PGPB Azospirillum brasilense is a diazotrophic associated with major crops such as corn and wheat, which widely spread and has been used as a model organism to investigate the associative plant growth promotion. Several mechanisms are involved in the promotion of plant growth by A. brasilense, including: the ability of biological nitrogen fixation and production of phytohormones, which leads to the formation of lateral roots and thus the better absorption of water and minerals, greater tolerance to stress, have positive effects on the mechanisms of defense. In this work, the growth parameters of two varieties of corn Dekalb 240 (DKB240) and Pioneer 30F53 (P30F53), bacterial growth in roots and protein profile in a variety (P30F53) when seedlings were grown in vitro were evaluated. We carried out the detection and quantification by real time PCR A. brasilense seedlings in the two varieties of corn. Primers were designed and their specificity was verified using DNA from 12 different bacterial species. qPCR efficiency and correlation coefficient presented values within the acceptable range for qPCR, average efficiency of 95% and a correlation coefficient of 0.98, indicating that the nifA gene is suitable for the quantitative analysis of target bacterial genome. Bacterial DNA copy number per gram of fresh root increased from 3.3 x 106 (one DAI) to 5.3 x 109 (ten DAI) when inoculated maize roots of DKB 240 variety were analyzed and, in the same way, it ranged from 6 x 106 (one DAI) to 6.8 x 109 (ten DAI) in P30F53 variety when cultured in vitro. The primers developed targeting nifA gene will be useful for monitoring Azospirillum brasilense growth in crops. Comparing control seedlings (variety Pioneer 30F53) inoculated with A. brasilense FP2, significant differences were observed 7 days after inoculation (DAI) in 7 out to 8 evaluated parameters (fresh weight and leaf size, fresh weight and size of the main root, lateral root number, fresh weight and number of adventitious roots and total fresh weight of roots). The observation of roots by scanning electron microscopy (SEM) showed that A. brasilense FP2 binds to the root surface, both in the region of the apex and the middle third, and may be found as single cells or aggregated. Analysis of the protein profile obtained using the technique of two-dimensional electrophoresis (2DE) revealed 46 proteins differentially accumulated in roots of maize (variety Pioneer 30F53) inoculated with A. brasilense FP2. The spots were analyzed by mass spectrometry and three proteins presented homology with hypothetic proteins from corn and rice.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2013. / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:22:10Z (GMT). No. of bitstreams: 1 324026.pdf: 4385011 bytes, checksum: 63d289db13a3d1c06cf620d32f266109 (MD5) / Os recursos genéticos de um país, com rica diversidade biológica como o Brasil, possuem expressivo potencial de uso para a alimentação humana e animal, obtenção de fibras, pigmentos, condimentos, energia, princípios ativos para produção de medicamentos, além de representarem um reservatório de adaptabilidade genética frente às mudanças ambientais. As Mirtáceas nativas destacam-se como fonte potencial para diversos usos, por isso, existe a necessidade de melhor estudar esses recursos. Neste sentido, o presente trabalho buscou elucidar aspectos ligados à biologia reprodutiva da Guabirobeira (Campomanesia xanthocarpa O. Berg.) associados ao desenvolvimento estrutural dos botões florais, elucidar os aspectos estruturais da fecundação cruzada e de um possível mecanismo de autoincompatibilidade atuante, bem como estudar o desenvolvimento de frutos, sementes e embriões. Os resultados mostraram que a etapa de florescimento dura, em média, 18 dias podendo-se dividir os estádios de desenvolvimento dos botões florais em B, C, D1, D2, E (estádio balão) e F (antese). O desenvolvimento dos andrófitos mostrou que os mesmos são capazes de emitir o tubo polínico a partir do estádio D1. Em relação ao desenvolvimento dos rudimentos seminais, a partir do estádio D1 ocorreu a intensificação da formação das estruturas de proteção e a formação do saco embrionário, embora este se complete somente no estádio E. A espécie investe em estruturas de proteção nas sépalas (cutícula, glândulas de óleo e tricomas) e em mecanismos ligados à rota transpiratória estomática e à fotossíntese (abundância de complexos estomáticos e cloroplastos). As pétalas servem de mecanismo de proteção ao androceu e ao gineceu até a antese, devido à presença de glândulas de óleo e ao formato convexo das células. O androceu polistêmone provavelmente assume papel de atração aos polinizadores pela abundância de pólen e material proteico que produz, além de desenvolver as anteras que garantem a produção de gametas funcionais e facilitam a sua dispersão no momento da antese, favorecendo a polinização cruzada. O gineceu estrutura-se de forma a facilitar a adesão e a germinação dos grãos de pólen compatíveis, o crescimento dirigido dos tubos polínicos, a cópula e a descarga dos gametas nos rudimentos seminais, com a consequente singamia, promovendo, assim a fecundação. As glândulas de óleo e os tricomas secretores são estratégias extras adotadas pela espécie, no sentido de preservar as partes florais dos estresses ambientais, bióticos e abióticos, a fim de garantir a perpetuação e a ocupação de novos espaços em seu hábitat natural. O pólen coletado na fase balão de desenvolvimento dos botões florais pode ser utilizado em polinizações controladas e esta espécie apresenta alta eficiência reprodutiva, pois os tubos polínicos germinam duas horas após a polinização cruzada, crescendo rapidamente e de forma organizada, do estigma ao ovário, com a penetração nos rudimentos seminais três dias depois. Devido ao comportamento dos tubos polínicos depois da polinização geitonogâmica pode-se concluir que existe barreira à autofecundação, sendo a Incompatibilidade Homomórfica Gametofítica o mecanismo que melhor explica este comportamento. Os frutos levam, cerca de, 42 dias para se desenvolverem num padrão sigmoidal que pode ser dividido em 5 estádios. Devido às estruturas ovarianas formadoras do fruto já estarem presentes na pré-antese, esta fase de desenvolvimento da flor foi incluída como estádio I. O estádio II é o mais longo (30 dias) e abrange eventos como a fecundação e a embriogênese (proembriões, embriões globulares, embriões nos estádios cordiforme e de torpedo, até sua forma mirtóide definitiva). O estádio III marca o início do amadurecimento perceptível dos frutos através da mudança de coloração e aumento em diâmetro. O estádio IV é um período de 2 dias com amadurecimento pleno dos frutos e aprimoramento de padrões sensoriais. O estádio V é o início da rápida senescência dos frutos da espécie. Os frutos apresentam estruturas de proteção desde a epiderme (tricomas e glândulas de óleo) até as regiões mais internas. Para garantir a dispersão das sementes, a espécie investiu na região mediana do pericarpo, formada por tecido parenquimático rico em substâncias nutritivas que garantem a recompensa para os dispersores. As sementes estão estruturadas de modo a proteger o embrião (cobertura com mucilagem e substâncias oriundas das glândulas de óleo, reserva alimentar no eixo hipocótilo-radicular e na hipóstase), mas a característica recalcitrante e o curto período de viabilidade dificultam sua utilização.<br> / Abstract: Genetic resources of a rich biodiversity country such as Brazil, have high use potential for human and animal consumption, obtaining fibers, pigments, spices, active principles for drug production, and represent a pool of genetic adaptability in relation to environmental changes. Native Mirtaceae species stand out as a potential source for several uses. Taking this into account the present work seeks to elucidate aspects of the reproductive biology of Guabirobeira (Campomanesia xanthocarpa O. Berg) associated to the structural development of the flower buds, as well as to elucidate the structural aspects of cross-fertilization and a possible mechanism of self-incompatibility active and to follow the development of fruits, seeds and embryos. The results showed that the flowering stage takes about 18 days, dividing the development of floral buds in B, C, D1, D2, E (balloon stage) and F (total opening of the flower) stages. The pollen grains are able to emit the pollen tube starting from D1 stage. After the stage D1 it takes place the intensification of protective structures and the formation of the embryo sac, although this is complete only in E stage. The species invests in protective structures on the sepals (cuticle, oil glands and trichomes) and mechanisms related to transpiratory, photosynthetic and stomatal routes (stomatal complexes and chloroplasts). The petals are protection mechanisms for the androecium and the gynoecium until the complete flower opening, due to the presence of the oil glands and the convex shape of the cells that form a barrier around the reproductive organs. The androecium poly-staminate probably assumes the role of pollinator attraction due to the abundance of pollen and protein material, in addition to developing anthers which guarantee the production of functional gametes and facilitate their dispersion at the anthesis, favoring cross pollination. The gynoecium is structured to facilitate the adhesion and the germination of the compatible pollen grains, directing the growth of pollen tubes, thus facilitating coupling and the discharge of the gametes in the seminal rudiments with consequent syngamy and fertilization. Oil glands and trichomes are other strategies adopted by the C. xanthocarpa in order to preserve the flowers of environmental, biotic and abiotic stresses, to ensure the perpetuation of this species and the occupation of new spaces in their natural habitat. The pollen collected in the balloon stage of flower buds can be used in controlled pollinations. This species shows high reproductive efficiency because the pollen tubes germinate two hours after cross-pollination, growing rapidly and in an organized manner, the stigma to the ovary with penetration, three days later, in the seminal rudiments. Due to the behavior of pollen tubes after self-pollination, it can be concluded that there is a barrier to self-fertilization and homomorphic gametophytic incompatibility is the mechanism that best explains this behavior. The fruits take approximately 42 days to develop, following a sigmoid pattern that can be divided into 5 stages. The pre anthesis already had ovarian structures formative of the fruit and thus this phase of flower development was adopted as stage I. The stage II is the longest (30 days) and encompasses events like as fertilization and embryogenesis (pro embryos, globular embryos, the embryos in the cordate and torpedo stages, until its final form mirtóide). The III stage marks the beginning of the perceptible ripening of fruits by changing color and increase in diameter. The stage IV is a rapid period (2 days) for full ripening of fruits with enhancement of sensory patterns. The V is the beginning stadium of rapid senescence of the fruits of this species. The fruits have protective structures from the epidermis (trichomes and oil glands) to the more internal regions of the pericarp. In order to ensure seed dispersion, this species has invested in the median region of the pericarp, through the presence of the parenchymal tissue rich in nutrients, ensuring rewards for dispersers. The seeds are structured to protect the embryo (covering it with mucilage and substances contained in the oil glands and through the food reserves in the root-hypocotyl axis and hypostasis) but the recalcitrant characteristic and short viability of the seeds, hinders its use.