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Diário de uma península: arqueologia das paisagens sensoriais de Maraú, Bahia / Diary of a península: archaeology of the sensory landscapes in Maraú, Bahia

Araujo, Girleney Santos 30 August 2016 (has links)
Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Is it possible to understand how people who lived in the Peninsula of Marau were related to the environment through the senses? This is the central question that prompted this research. Based on the understanding that the landscapes are intimate meetings with the world we experience with all senses, this narrative aimed to present an interpretation of how the past residents elaborated their understanding of the world around them through the sensory experience arranged by the material culture they produced, taking into consideration that the landscape itself can be understood as a material and symbolic production. To achieve a consistent interpretation, it was necessary to deepen the criticism that the Phenomenology does about the science based on the sight and recognize that Archeology also supports the sight as a main way of analysis in its research. Sensory Archaeology attempts to correct this by bringing all the senses as ways to seek understanding of the human groups in the past. With the identification of six archaeological areas for prospecting, focus on two of them to set up my review and discuss the Sensory Landscapes in Marau, Bahia. / É possível entender como as pessoas que viviam na Península de Maraú se relacionavam com o meio através dos sentidos? É esse o questionamento central que estimulou essa pesquisa. Partindo do entendimento que as Paisagens são encontros íntimos com o mundo que experimentamos com todos os sentidos, essa narrativa teve como objetivo apresentar uma interpretação de como seus moradores pretéritos elaboravam o entendimento do mundo a sua volta por meio da experiência sensorial disposta pela Cultura Material que produziram, levando em consideração que a própria paisagem pode ser entendida como uma confecção material e simbólica. Para se chegar a uma interpretação coerente, antes foi preciso se aprofundar nas críticas que a Fenomenologia faz a Ciência baseada no visual e reconhecer que a Arqueologia também se apoia na visão como principal meio de análise em suas pesquisas. A Arqueologia Sensorial tenta corrigir isso, trazendo todos os sentidos como formas de se buscar entender os grupos humanos do passado. Com a identificação de seis áreas arqueológicas pela prospecção, foco em duas delas para montar a minha análise e discorrer sobre as Paisagens Sensoriais de Maraú, Bahia.
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A respeito dos mortos: remanescentes humanos do Max e suas implicações éticas

Almeida, Thaís Vaz Sampaio de 24 August 2018 (has links)
Human bone remnants have always aroused a great deal of interest from the academic community and the community at large, above all by the possibility of access to the information inherent to the already extinct populations. Such information brings great enrichment to several areas of knowledge, especially Archeology, since they allow the systematic study of biological, social and cultural factors, among other aspects of these human groups. However, for the most part, this type of vestige is still regarded as a mere object in the service of science. This dissertation seeks to explore this theme, presenting ethical reflections in the proceeding with osteological collections of archaeological origin and brings our attention to the proposed case study: the collection of burials from the Museu de Arqueologia de Xingó, Canindé de São Francisco, SE. In addition to the ethical analysis that permeates the treatment of these traces, we propose a new approach for a sample of this collection, composed of 88 individuals buried that were under surveillance of the Bioarchaeology Laboratory of the Federal University of Sergipe, in Laranjeiras, always seeking to arouse respect for the individuals worked and guided by the notions of conservation and documentation inherent in the area of Museology, the work throws new glances for the conditions of these collections and proposes an interdisciplinarity between this and Archeology. Such interaction will bring great benefits in respect to the memory of human groups, while it will contribute to the sedimentation of reflections about the notions of belonging to these individuals, contributing to the legal delineations of the theme. / Os remanescentes ósseos humanos sempre suscitaram um grande interesse da comunidade acadêmica e da comunidade em geral, sobretudo pela possibilidade de acesso às informações inerentes às populações já extintas. Tais informações trazem grande enriquecimento para diversas áreas do conhecimento, com destaque para a Arqueologia, uma vez que permitem o estudo sistemático acerca dos fatores biológicos, sociais, culturais, dentre outros aspectos destes grupos humanos. Entretanto, em sua maioria, este tipo de vestígio é encarado ainda como mero objeto a serviço da ciência. Esta dissertação busca explorar esta temática, apresentando reflexões de cunho ético no proceder com coleções osteológicas de origem arqueológica e traz nossas atenções ao estudo de caso proposto: a coleção de sepultamentos do Museu de Arqueologia de Xingó, em Canindé de São Francisco, SE. Além da análise ética que permeia o tratamento destes vestígios, propomos uma nova abordagem para uma amostra desta coleção, composta de 88 indivíduos sepultados e que estavam sob a guarda do Laboratório de Bioarqueologia da Universidade Federal de Sergipe, em Laranjeiras, sempre buscando suscitar o respeito pelos indivíduos trabalhados e balizado pelas noções de conservação e documentação inerentes à área da Museologia, o trabalho lança novos olhares para as condições destes acervos e propõe uma interdisciplinaridade entre esta e a Arqueologia. Tal interação trará grandes benefícios no que tange o respeito à memória dos grupos humanos, ao passo que contribuirá para a sedimentação das reflexões acerca das noções de pertencimento para com estes indivíduos, contribuindo para os delineamentos legais da temática. / Laranjeiras
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A variabilidade espacial no sítio Osvaldo : estudo de um assentamento da Tradição Barrancóide na Amazônia Central / Spatial variability in the Osvaldo site : study of a settlement of the Barrancoid Tradition in Central Amazonia

Ricardo Andres Chirinos Portocarrero 11 April 2007 (has links)
O presente trabalho é uma tentativa de desenvolvimento de novas metodologias para o entendimento do uso do espaço interno em sítios arqueológicos de terra firme da Amazônia Central. Há décadas diversos investigadores vêm debatendo sobre a variabilidade destes assentamentos (Meggers, Lathrap, Myers, Roosevelt, Heckenberger e Neves, entre outros). Nosso caso de estudo é o sítio Osvaldo, localizado na área de interfúvio dos rios Negro e Solimões, na margem sul do Lago do Limão. Este sítio apresenta internamente áreas heterogêneas, com variabilidade de profundidade de terra preta antropogênica de densidade de fragmentos cerâmicos, estes afiliados culturalmente à Tradição Barrancóide/fase Manacapuru e à fase Paredão. A análise de agrupamento espacial e padrão composicional mostram similitudes e diferenças entre as áreas mencionadas, evidenciando uma complexidade social interna, cujo entendimento, a partir de analogias etnográficas, tem relevância não apenas para a problemática intra-sítio, mas também para a discussão sobre as relações entre sítios a nível regional e sobre os movimentos migratórios de populações pré-coloniais. / The present work is an attempt to develop new methodologies for the understanding of the use of the internal space in archeological hinterland (terra firme) sites in Central Amazon. For decades, several investigators have debated the variability of these settlements (Meggers, Latrhap, Myers, Roosevelt, Heckenberger and Neves, among others). Our case study is the Osvaldo site, located between Solimões and Negro rivers at the South margin of Limão lake. This site internally displays heterogeneous areas with different depths of anthropogenic terra preta and variable density of pottery fragments culturally linked to the Barrancoid Tradition / Manacapuru phase and Paredão phase. The spatial clustering analysis and the composítional pattern show similarities and differences among the mentioned areas, presenting internal social complexity, of which the observation, from ethnographical analogies, is relevant not only for the intra-site problematic but also for the discussion on the relations among sites at regional level and for understanding the migratory movements of pre-columbian populations.
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Crescimento e produção de Tectona Grandis Linn F., em povoamentos jovens de duas regiões do estado de Mato Grosso - Brasil / Growth and yield of tectona Grandis Linn F. for the state of Mato Grosso Brazil

Drescher, Ronaldo 29 January 2004 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The Tectona grandis Linn F. was introduced in Mato Grosso in the end of the sixties and new planting is made each year in the State with the aim of replacing native woods of noble use. Beyond the expectation of great future gains the teak plantations are, most of the time, made in the mosaic system. This system is certainly the greatest advantage of this wood species, which is conquering more space each year in the Mato Grosso economical set. For this project, information about teak was acquired from the cities of Santo Antonio do Leverger and Brasnorte. In this places, the plantations are the propriety of Brasteca e Berneck companies, respectively. These plantations were young - less than 11 years old. And the possibility of short crop allows the discussion of the importance of processing wood in small dimensions. Since there was no production planning of Tectona grandis in Mato Grosso, which would allow rapid wood stock determination, the need to study the structuring of production for this species arose. This project also aimed at establishing: the study of hypsometric relationship; the study of the site and the determination of the site index; the study of diameter, height, base area and volume growth by year and by hectare; the development of the artificial form factor; the making of volume tables, form factor tables and yield tables for regional use. The results achieved in this work were the followings: to model the growth, the Chapman-Richard s equation described efficiently the dominate height variable evolution within the time span analyzed. The model h = 1,390 − 0,063 ⋅ d + 0,448 ⋅ ln 2 d , was selected to explain the relationship between height and diameter. The volume was modeled with the equation log(v) = −4,141 + 1,781 ⋅ log(d ) + 0,974 ⋅ log(h). The following equation was that showed the best adjustment for artificial form factor ( ) ⎟⎠ ⎞ ⎜⎝ ⎛ ⋅ ⋅ + ⎟ ⎟⎠ ⎞ ⎜ ⎜⎝ ⎛ ⋅ − ⎟ ⎟⎠⎞⎜⎜⎝ ⎛= + ⋅d h ddddln f 0,774 0,697 ln 0,647 ln 0,199 ln 1 20,120,51,3 Finally, six curves of site index, between 10 and 20, was needed to describe the variation of the dominate height growth over the age in the index-age of 10 years. As a conclusion it was verified a greater growth of teak in the state of Mato Grosso in comparison with other countries. This demonstrates the importance of teak not only for the state of Mato Grosso but for the whole country. / A Tectona grandis Linn F. foi introduzida em Mato Grosso no final da década de sessenta e, a cada ano, novos plantios são realizados no estado com o intuito de substituir as madeiras nativas de uso nobre. Os plantios de teca são realizados, na sua maioria, em sistemas de mosaico, sendo este o maior ganho dessa espécie madeireira que, a cada ano, vem conquistando mais espaço no cenário econômico do estado de Mato Grosso. Para este estudo, foram realizados levantamentos em plantios de teca nos municípios de Santo Antônio do Leverger e Brasnorte, em propriedade das Empresas Brasteca e Berneck, respectivamente. Pode-se considerar os plantios estudados jovens, possuindo não mais que 11 anos de idade, com a possibilidade de rotações curtas que permitem a discussão da importância de se processar madeira com dimensão pequena. Tendo em vista a inexistência de tabelas de produção da Tectona grandis para o Mato Grosso que possibilitasse determinações rápidas do estoque de madeira e o planejamento da produção, originou-se a necessidade de estudar o crescimento e a produção para a espécie. Este estudo também teve por objetivo determinar: relação hipsométrica; estudo do sítio e determinação do índice de sítio; estudo do crescimento em diâmetro, altura, área basal e volume por hectare e idade; confecção de tabelas de volume, fator de forma artificial, produção para uso regional e comparar crescimento e produção com os de outros locais. Como resultados obtidos neste trabalho têm-se que: a equação de Chapman Richard s, testada para modelar o crescimento, descreveu de forma adequada e eficiente a evolução da variável altura dominante dentro do intervalo de idade analisado; para descrever a variação do crescimento da altura dominante sobre a idade, foram necessárias seis curvas de índice de sítio de 10 a 20, na idadeíndice de 10 anos; o modelo h = 1,390 − 0,063 ⋅ d + 0,448 ⋅ ln 2 d , foi o selecionado para explicar a relação entre altura e diâmetro; para estimar o volume, o modelo selecionado foi log(v) = −4,141 + 1,781 ⋅ log(d)+ 0,974 ⋅ log(h); para fator de forma artificial, ( ) ⎟⎠ ⎞⎜⎝⎛⋅⋅ + ⎟⎟⎠⎞⎜ ⎜⎝⎛⋅ − ⎟ ⎟⎠⎞⎜ ⎜⎝⎛= + ⋅d h ddddln f 0,774 0,697 ln 0,647 ln0,199 ln 1 20,120,51,3, foi a equação que apresentou melhor ajuste; Neste estudo foi verificado maior crescimento da teca em Mato Grosso quando comparado a outros países. Isso demonstra a importância dessa espécie não só para o estado, mas também para o país.
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Mapeamento dos subsítios de α-amilase de Xanthomonas axonopodis pv citri envolvidos na interação com o substrato / Subsite mapping of Xanthomonas axonopodis pv citri α-amylase involved in substrate binding

Pinho, Jean Marcel Rodrigues 20 December 2004 (has links)
Mapeamento dos subsítios de α-amilase de Xanthomonas axonopodis pv. Citri envolvidos na interação com o substrato A família das enzimas α-amilases é um modelo experimental interessante para o estudo das interações entre os aminoácidos e seus ligantes, já que estas enzimas apresentam especificidade variável, são frequentemente alvos de estudos por mutagênese e há estruturas cristalinas disponíveis para alguns membros da família. A proposta deste trabalho foi o mapear subsítios da α-amilase de Xanthomonas axonopodis pv. citri (AXA) envolvidos na interação com substratos, através de comparações estruturais, mutagêneses sítio-dirigidas, análises de parâmetros cinéticos sobre amido e do padrão de clivagem sobre p-nitrofenil malto-oligossacarideos (PNPG7, PNPG5, PNPG4). Foi criado um modelo estrutural para AXA a partir da estrutura tridimensional da α-amilase de Alteromonas haloplanctis (Aghajari et al., 1998). O modelo de AXA foi sobreposto na estrutura da α-amilase pancreática de porco (Qian et al., 1994) e 11 resíduos foram selecionados e mutados para alanina. As α-amilases recombinantes mutantes e selvagem foram secretadas pela levedura Pichia pastoris GS115, apresentando uma massa molecular aparente de 45 kDa. Todos os mutantes analisados reduziram em maior ou menor grau a atividade catalítica da enzima sobre amido e p-nitrofenil maltooligossacarideos. Mutações dos resíduos H88, F136, D196, E223, D295 e N299, deletaram a atividade enzimática, indicando que suas cadeias laterais são essenciais para o desempenho catalítico da enzima. As análises cinéticas e estruturais sugerem fortemente que D196, E223 e D295 são os resíduos catalíticos. Substituições das cadeias laterais de C157, H200, G227, T230 e H294 reduziram a eficiência catalítica (kcat/Km) da α-amilase sobre o substrato amido para, respectivamente, 28%, 41%, 84%, 81% e 51%. As mutações em G227 e T230 foram menos importantes para a atividade da enzima e afinidade pelo amido, entretanto, estes resíduos mostraram-se importantes para a estabilização de complexos com substratos curtos (pNPG4). Os resultados indicam que o sítio ativo de AXA é formado por, no mínimo, seis subsítios. As interações dos anéis de glicose com os subsítios +2 e -2 são favorecidas em relação às interações nos subsítios -3 e +3, respectivamente, e a interação do anel de glicose no subsítio -3 é favorecida em relação à interação no subsítio +3. A enzima selvagem diva preferencialmente a terceira ligação glicosídica de p-nitrofenil maltooligossacarideos. Como produtos de hidrólise a enzima libera maltopentaose, maltotetraose, maltotriose, maltose e glicose. / The α-amylase family is an interesting group for structure/function relationship investigation, as this family exhibits a variable deavage patterm, several crystal structures are available, and its members were studied by mutagenesis. The aim of this study was the mapping of Xanthomonas axonopodis pv. Citri α-amylase (AXA) subsites involved in substrate binding, using structural comparison, site-directed mutagenesis and lcinetics analyses. A structural model for AXA was created from the three-dimensional structure of the α-amylase from Alteromonas haloplanctis (Aghajari et al., 1998). This model was superimposed on the structure ofthe pig pancreatic α-amylase, PPA (Qian et. al., 1994), and 11 residues were selected and changed to alanine. Wild type and mutant AXA were secreted by Pichia pastoris strain GS115 cells and showed apparent molecular mass of 45 kDa. All mutants have reduced α-amylase activity on starch and 4-nitrophenyl maltooligosaccharides (pNPG7, PNPG5 and PNPG4) at different levels. Mutation of residues H88, F136, D196, E223, D295 and N299 indicate their essential role by complete loss of activity. Kinetic and structural analyses strongly suggested that D196, E223 and D295 are the catalytic residues. The substitution of the side chain of C157, H200, G227, T230 and H294 reduced the catalytic efficiency (kcat/Km) of α-amylase on starch to respectively 28%, 41%, 84%, 81% and 51%. Although G227 and T230 were not much important for activity and binding on starch, these residues were important for stabilization of complexes with short substrates (PNPG4). The results indicate that AXA\'s active site is composed of at least six sugar binding subsites. The binding of the glucoses at subsites +2 and -2 are favored against binding at subsites -3 and +3, respectively. The binding of glucose at subsite -3 is favored against binding at subsite +3. The wild type enzyme primarily hydrolyzes the third glucosidic bond in PNPG7, PNPG5 and PNPG4 and the products of hydrolysis were maltopentaose, maltotetraose, maltotriose, maltose and glucose.
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Louzeiro: a invenção de uma mata. 1960 - 2013. Campina Grande: espaço, paisagem e território. / Louzeiro: the invention of a forest. 1960 - 2013. Campina Grande: space, landscape and territory.

LIMA, Rozeane Albuquerque. 11 October 2018 (has links)
Submitted by Johnny Rodrigues (johnnyrodrigues@ufcg.edu.br) on 2018-10-11T14:31:12Z No. of bitstreams: 1 ROZEANE ALBUQUERQUE LIMA - DISSERTAÇÃO PPGH 2014..pdf: 2117189 bytes, checksum: 397e50002aa551c9144bc2e49c5324f4 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-11T14:31:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 ROZEANE ALBUQUERQUE LIMA - DISSERTAÇÃO PPGH 2014..pdf: 2117189 bytes, checksum: 397e50002aa551c9144bc2e49c5324f4 (MD5) Previous issue date: 2014 / O Louzeiro, na década de 1960 um sítio de Campina Grande - Paraíba adquire o status de floresta protegida em 1990, e posteriormente, em 2013 é escolhido para abrigar o Jardim Botânico de Campina Grande. Esta pesquisa visou compreender quais as transformações ocorridas na construção imagético-discursiva e nas práticas dos seus moradores e frequentadores ao longo deste período, e as razões pela qual uma mancha verde de 60 hectares, localizada a 10 minutos do Centro da cidade, se invisibiliza, sendo desconhecida da população. Para tal buscamos perceber como a paisagem e a identidade campinenses foram construídas dialogando com os discursos emergentes e as intencionalidades quando das apropriações destes. As fontes utilizadas foram principalmente a legislação vigente ao longo deste recorte, entrevistas temáticas, mapas diversos, inventário de fauna e flora do local, acervo do Jornal da Paraíba e do site jusnavigandi, além de vídeos e fotos disponibilizados na internet, símbolos de Campina Grande, principalmente a bandeira, o brasão e o hino; o livro História de Campina Grande, de Elpídio de Almeida e documentos disponibilizados pelas Secretarias de Cultura, Meio Ambiente e Planejamento do Município. Verificamos que a emergência do discurso ambiental e da legislação por ele alimentada depois de 1970, trouxe à tona a necessidade de preservação das fontes de água doce localizadas no Louzeiro e por isso a sua transformação em zona de proteção. No entanto, apesar de ser um ecótono, o espaço tem por paisagem a Caatinga e esta mata branca ia de encontro a toda uma construção imagética de natureza alimentada pela mídia e também à construção de progresso, de cidade predestinada ao sucesso, fato ilustrado inclusive pelos seus “elementos naturais”, feita sobre Campina Grande na época do centenário da cidade, em 1964. A estes discursos soma-se a construção negativa que da Caatinga se fez desde o início do século XX e compreendemos o porquê da invisibilidade do Louzeiro, também agravada pelo uso da paisagem como elemento cênico, como algo a embelezar a cidade, belo que, em se tratando da natureza, foi alimentado pela mídia com imagens das florestas tropicais, com árvores altas e copas sempre verdes e fechadas. A historicização dos conceitos sobre natureza que dialogavam com o trabalho foi de grande importância para a compreensão do que a comunidade campinense esperava da construção da paisagem da cidade. / This research has as a proposal to understand how the Louzeiro, in the 1960´s a site in Campina Grande-Paraíba, acquires a status of protected forest in 1990, and later, in 2013,it is chosen to shelter the Botanical Garden of Campina Grande. Which transformations occurred during the imagetic-discursive construction of this space and in the actions of its inhabitants and visitors throughout this period. Moreover, what were the reasons for a green spot of 60 acres, located 10 minutes from downtown, to turn invisible, being unknown by the majority of the populatio. For that, we intended to perceive how the landscapes and the identity of the “Campinenses” were imageticdiscursively built, dialoging with the emerging speeches and the willfulness related to its appropriation. The sources used were mainly the current legislation throughout this research, thematic interviews, various maps, fauna and flora inventory, collection from “Jornal da Paraíba” and from the “jusnavigandi”. Furthermore, it was used videos and pictures from the internet, symbols of Campina Grande, specially the flag, coat of arms, anthem; the book “História de Campina Grande” of Elpídio de Almeida and documents provided by the Departments of Culture, Environment and Planning of the city. We verified that the emergency of the environmental speech and the legislation fed by it after 1970, brought up the need for the preservation of the fresh water fountains located in the Louzeiro, and because of that, the transformation into a protection zone was necessary. However, despite being an ecotone, the area has as its main landscape the “Caatinga”. This white jungle was opposite to all the imagetic construction of nature fed by the media and also to the construction of progress, of a city predestined to success, fact that was illustrated by the “natural elements”, done about Campina Grande in the time of its hundredth anniversary in 1964. Along with these speeches, we add the negative construction of the “Caatinga” which has been done since the beginning of the 20th century, making it possible to understand the invisibility of the Louzeiro. This invisibility was aggravated by the use of the landscape as a scenic element, as something to beautify the city, aspect that has been fed by the media with rain forest images, with tall trees and evergreen and dense tops. The historicization of the concepts about nature that dialoged with the work was of great importance for the understanding of what the community awaited with the construction of the city´s landscape.
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Mapeamento dos subsítios de α-amilase de Xanthomonas axonopodis pv citri envolvidos na interação com o substrato / Subsite mapping of Xanthomonas axonopodis pv citri α-amylase involved in substrate binding

Jean Marcel Rodrigues Pinho 20 December 2004 (has links)
Mapeamento dos subsítios de α-amilase de Xanthomonas axonopodis pv. Citri envolvidos na interação com o substrato A família das enzimas α-amilases é um modelo experimental interessante para o estudo das interações entre os aminoácidos e seus ligantes, já que estas enzimas apresentam especificidade variável, são frequentemente alvos de estudos por mutagênese e há estruturas cristalinas disponíveis para alguns membros da família. A proposta deste trabalho foi o mapear subsítios da α-amilase de Xanthomonas axonopodis pv. citri (AXA) envolvidos na interação com substratos, através de comparações estruturais, mutagêneses sítio-dirigidas, análises de parâmetros cinéticos sobre amido e do padrão de clivagem sobre p-nitrofenil malto-oligossacarideos (PNPG7, PNPG5, PNPG4). Foi criado um modelo estrutural para AXA a partir da estrutura tridimensional da α-amilase de Alteromonas haloplanctis (Aghajari et al., 1998). O modelo de AXA foi sobreposto na estrutura da α-amilase pancreática de porco (Qian et al., 1994) e 11 resíduos foram selecionados e mutados para alanina. As α-amilases recombinantes mutantes e selvagem foram secretadas pela levedura Pichia pastoris GS115, apresentando uma massa molecular aparente de 45 kDa. Todos os mutantes analisados reduziram em maior ou menor grau a atividade catalítica da enzima sobre amido e p-nitrofenil maltooligossacarideos. Mutações dos resíduos H88, F136, D196, E223, D295 e N299, deletaram a atividade enzimática, indicando que suas cadeias laterais são essenciais para o desempenho catalítico da enzima. As análises cinéticas e estruturais sugerem fortemente que D196, E223 e D295 são os resíduos catalíticos. Substituições das cadeias laterais de C157, H200, G227, T230 e H294 reduziram a eficiência catalítica (kcat/Km) da α-amilase sobre o substrato amido para, respectivamente, 28%, 41%, 84%, 81% e 51%. As mutações em G227 e T230 foram menos importantes para a atividade da enzima e afinidade pelo amido, entretanto, estes resíduos mostraram-se importantes para a estabilização de complexos com substratos curtos (pNPG4). Os resultados indicam que o sítio ativo de AXA é formado por, no mínimo, seis subsítios. As interações dos anéis de glicose com os subsítios +2 e -2 são favorecidas em relação às interações nos subsítios -3 e +3, respectivamente, e a interação do anel de glicose no subsítio -3 é favorecida em relação à interação no subsítio +3. A enzima selvagem diva preferencialmente a terceira ligação glicosídica de p-nitrofenil maltooligossacarideos. Como produtos de hidrólise a enzima libera maltopentaose, maltotetraose, maltotriose, maltose e glicose. / The α-amylase family is an interesting group for structure/function relationship investigation, as this family exhibits a variable deavage patterm, several crystal structures are available, and its members were studied by mutagenesis. The aim of this study was the mapping of Xanthomonas axonopodis pv. Citri α-amylase (AXA) subsites involved in substrate binding, using structural comparison, site-directed mutagenesis and lcinetics analyses. A structural model for AXA was created from the three-dimensional structure of the α-amylase from Alteromonas haloplanctis (Aghajari et al., 1998). This model was superimposed on the structure ofthe pig pancreatic α-amylase, PPA (Qian et. al., 1994), and 11 residues were selected and changed to alanine. Wild type and mutant AXA were secreted by Pichia pastoris strain GS115 cells and showed apparent molecular mass of 45 kDa. All mutants have reduced α-amylase activity on starch and 4-nitrophenyl maltooligosaccharides (pNPG7, PNPG5 and PNPG4) at different levels. Mutation of residues H88, F136, D196, E223, D295 and N299 indicate their essential role by complete loss of activity. Kinetic and structural analyses strongly suggested that D196, E223 and D295 are the catalytic residues. The substitution of the side chain of C157, H200, G227, T230 and H294 reduced the catalytic efficiency (kcat/Km) of α-amylase on starch to respectively 28%, 41%, 84%, 81% and 51%. Although G227 and T230 were not much important for activity and binding on starch, these residues were important for stabilization of complexes with short substrates (PNPG4). The results indicate that AXA\'s active site is composed of at least six sugar binding subsites. The binding of the glucoses at subsites +2 and -2 are favored against binding at subsites -3 and +3, respectively. The binding of glucose at subsite -3 is favored against binding at subsite +3. The wild type enzyme primarily hydrolyzes the third glucosidic bond in PNPG7, PNPG5 and PNPG4 and the products of hydrolysis were maltopentaose, maltotetraose, maltotriose, maltose and glucose.
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Determinação da estrutura local de sítios do íon Eu3+ com alta simetria em cristais

Matos, Heveson Luís Lima de 24 February 2014 (has links)
A study of the local structure of the Eu3+ ion with high symmetry in crystals was carried out using the crystal field theory by the method of nearest neighbours (MENN). The crystals studied were: M2O3, SnO2, BaliF3 and XMgF3 doped with very low concentrations of Eu3+ ion. From equations of the crystal field parameters, the maximum splitting of 7F1 multiplet and the electrostatic equilibrium of luminescent site was possible to predict the interatomic distance Eu-O ions in the luminescent site. For the M2O3 crystal, the overlap between the 4f orbitals and 2p in the range 0.07. Ïj.0.1 and the charge factor between 0.55.gj.0.9 gave better predictions for the indication of the local structure of luminescent site. The electrical neutrality of the luminescent site was satisfied. The Batista-Longo Improved Model (BLIM) was used to show that the Eu3+ ion charge may be greater than its own valence. The predictions give an indication of a point symmetry S6 or D3d. For the SnO2 oxide two sets of charge factors were used. Both were related by the equation of the electrostatic equilibrium of luminescent site. A P = 1.0029 proportionality constant related non equivalent interatomic distances. The overlap between the 4f orbitals and 2p in the range 0.05. Ïj.0.1 and the charge factor 0.5.gj.0.75 gave better predictions for the indication of the local structure of luminescent site. The predictions indicate that the Eu3+ ion replaces the Sn4+ ion in a point symmetry C2h or D2h. For the BaliF3 and XMgF3 crystals is suggested that the Eu3+ ion occupies a lowest symmetry D4d with coordination number eight. The experimental splitting was reproduced with gj = 0.402 and Ïj = 0.05. The signal of the B2 0 was reproduced. This study was done based on the emission spectrum of Eu3+ ion and structure calculations based on molecular dynamics. The predictions of the Eu-PV interatomic distance and local symmetry of the luminescent site is in good agreement with experimental data. / Um estudo da estrutura local do sitio luminescente do ion Eu3+ com alta simetria em cristais foi realizado utilizando a teoria de campo cristalino atraves do metodo dos vizinhos equivalentes (MENN). Os cristais estudados foram: M2O3, SnO2, BaLiF3 e XMgF3 dopados com baixissimas concentracoes do ion Eu3+. A partir das equacoes dos parametros de campo cristalino, do desdobramento maximo do multipleto 7F1 e do equilibrio eletrostatico do sitio luminescente foi possivel fazer previsoes da distancia interatomica entre os ions Eu-O no sitio luminescente do ion Eu3+. Para o cristal M2O3, o recobrimento entre os orbitais 4f e 2p no intervalo entre 0.07. Ïj.0.1 e o fator de carga entre 0.55.gj.0.9 apresentaram as melhores previsoes para a indicacao da estrutura local do sitio luminescente. A neutralidade eletrostatica do sitio luminescente foi satisfeita com o MENN. O Batista-Longo Improved Model (BLIM) foi utilizado como comparativo para mostrar que a carga do ion Eu3+ pode ser maior que sua propria valencia. As previsoes dao indicacao de uma simetria pontual S6 ou D3d. Para o oxido SnO2 dois conjuntos de fatores de cargas foram utilizados. Ambos foram relacionados pela equacao do equilibrio eletrostatico do sitio luminescente. Uma constante de proporcionalidade P=1.0029 relacionou as distancias interatomicas nao equivalentes. O recobrimento entre os orbitais 4f e 2p no intervalo entre 0.05. Ïj.0.1 e o fator de carga entre 0.5.gj.0.75 apresentaram as melhores previsoes para a indicacao da estrutura local do sitio luminescente. As previsoes indicam que o ion Eu3+ substitui o ion Sn4+ em uma simetria pontual C2h ou D2h. Para os cristais BaLiF3 e XMgF3 e sugerido que o ion Eu3+ ocupe uma simetria mais baixa D4d com numero de coordenacao 8. O desdobramento experimental foi reproduzido com gj = 0.402 e Ïj = 0.05. O sinal do B2 0 foi reproduzido. Este estudo foi feito baseado no espectro de emissao do ion Eu3+ e de calculos de estrutura local baseado em dinamica molecular. As previsoes da distancia interatomica Eu-PV e simetria local do sitio luminescente estao em trostatico do sitio uminescente foi possivel fazer previsoes da distancia interatomica entre os ions Eu-O no sitio luminescente do ion Eu3+. Para o cristal M2O3, o recobrimento entre os orbitais 4f e 2p no intervalo entre 0.07. Ïj.0.1 e o fator de carga entre 0.55.gj.0.9 apresentaram as melhores previsoes para a indicacao da estrutura local do sitio luminescente. A neutralidade eletrostatica do sitio luminescente foi satisfeita com o MENN. O Batista-Longo Improved Model (BLIM) foi utilizado como comparativo para mostrar que a carga do ion Eu3+ pode ser maior que sua propria valencia. As previsoes dao indicacao de uma simetria pontual S6 ou D3d. Para o oxido SnO2 dois conjuntos de fatores de cargas foram utilizados. Ambos foram relacionados pela equacao do equilibrio eletrostatico do sitio luminescente. Uma constante de proporcionalidade P=1.0029 relacionou as distancias interatomicas nao equivalentes. O recobrimento entre os orbitais 4f e 2p no intervalo entre 0.05. Ïj.0.1 e o fator de carga entre 0.5.gj.0.75 apresentaram as melhores previsoes para a indicacao da estrutura local do sitio luminescente. As previsoes indicam que o ion Eu3+ substitui o ion Sn4+ em uma simetria pontual C2h ou D2h. Para os cristais BaLiF3 e XMgF3 e sugerido que o ion Eu3+ ocupe uma simetria mais baixa D4d com numero de coordenacao 8. O desdobramento experimental foi reproduzido com gj = 0.402 e Ïj = 0.05. O sinal do B2 0 foi reproduzido. Este estudo foi feito baseado no espectro de emissao do ion Eu3+ e de calculos de estrutura local baseado em dinamica molecular. As previsoes da distancia interatomica Eu-PV e simetria local do sitio luminescente estao em bom acordo com dados experimentais.

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