Orientador: Marcelo Fabio Gouveia Nogueira / Resumo: Além de permitir a produção em larga escala de embriões, a maturação in vitro (MIV) não utiliza hormônios superestimulatórios, evitando prejuízos econômicos e efeitos iatrogênicos da superestimulação. Entretanto, a MIV ainda está aquém das expectativas devido à incapacidade em simular eventos fisiológicos que ocorrem in vivo. Um artefato da MIV consiste na retomada espontânea da meiose após a remoção do oócito do ambiente folicular. Sem o aparato molecular que retém a meiose, a maturação nuclear ocorre sem o estímulo hormonal fisiológico, impedindo a reorganização adequada das organelas durante a maturação citoplasmática, o que pode comprometer a competência oocitária in vitro. A temática primordial desta tese foi testar um sistema de pré-maturação oocitária (Pré-MIV), no qual dois fármacos (forskolin e 3-isobutil- metilxantina) são utilizados antes da MIV para retardar a meiose. O desempenho da Pré-MIV foi comparado à MIV convencional, em contexto comercial e de pesquisa. Em um primeiro momento, comparamos os sistemas convencional e Pré-MIV de forma holística, ou seja, testamos os sistemas comerciais completos. Aqui, o critério avaliativo foi a análise ultraestrutural de oócitos e blastocistos, e a análise da expressão de 96 genes relacionados à qualidade embrionária. Na segunda abordagem, adaptamos os fármacos da Pré- MIV em nossa MIV rotineira. Por estes fármacos afetarem o metabolismo lipídico, e, frente a importância deste no metabolismo energético celular, a segunda inv... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Doutor

Orientador: Antonio Leão Castilho / Resumo: A seleção sexual e o modelo Chave-Fechadura apoiaram a evolução genital dos artrópodes, principalmente em insetos; mas esta abordagem nunca foi testada em crustáceos decápodes. O objetivo desta investigação foi identificar padrões de seleção sexual e testar o modelo Chave-Fechadura utilizando diferentes espécies de camarões peneóideos. Além disso, identificamos o quão diferentes as espécies são em relação à sua visão da morfologia genital e descrevemos o télico e o petasma de cinco diferentes camarões peneóideos e determinamos algum grau de complexidade do petasma ao longo das tendências de evolução. Duas espécies de télico aberto (Litopenaeus schmitti e Pleoticus muelleri) e sete espécies de télico fechado (Xiphopenaeus kroyeri, Artemesia longinaris, Rimapenaeus constrictus, Farfantepenaeus brasiliensis, F. paulensis, Sicyonia dorsalis e S. typica) foram selecionadas. Os indivíduos foram coletados com um barco camaroeiro equipado com redes de arrasto nas costas do sudeste e sul do Brasil. Petasma e télico foram destacados e fixados em Karnovsky e foram conduzidos aos procedimentos de ultraestrutura na Microscopia Eletrônica de Varredura (MEV), e algumas partes de sua genitália foram medidas. Os dados medidos foram analisados por meio de regressões lineares simples e análise discriminante. O modelo de Chave-Fechadura foi identificado em seis espécies (L. schmitti, P. muelleri, X. kroyeri, A. longinaris, R. constrictus e F. brasiliensis) evidenciando uma coevolução sexualmente... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: Sexual selection and lock-and-key model supported the arthropod’s genital evolution, mainly on insects; but this approach has never been tested on decapod crustaceans. The aim of this investigation was identify sexual selection patterns and test lock-and-key model using different species of penaeoideans shrimps. In addition, we identified how different the species are with respect to their genital morphology view and describe thelycum and petasma of five different penaeoidean shrimps and determine some degree of complexity of the petasma along the evolution trends. Two open thelycum species (Litopenaeus schmitti and Pleoticus muelleri) and seven closed thelycum species (Xiphopenaeus kroyeri, Artemesia longinaris, Rimapenaeus constrictus, Farfantepenaeus brasiliensis, F. paulensis, Sicyonia dorsalis and S. typica) were selected. The individuals were collected with a fishery shrimp boat equipped with double-rig nets in the Southeastern and Southern Brazilian coasts. Petasma and thelycum were dissected and fixed in Karnovsky and it were conducted to the ultrastructure procedures in the Scanning Electron Microscopy (SEM), and some parts of their genitalia were measured. The measured data was analysed by means simple linear regressions and discriminant analysis. The lock and key model was identified in six species (L. schmitti, P. muelleri, X. kroyeri, A. longinaris, R. constrictus and F. brasiliensis) evidencing a sexually antagonistic coevolution of the genitalia between males a... (Complete abstract click electronic access below) / Doutor

Os crustáceos de água doce, confrontados com um gradiente elevado de NaCl entre a hemolinfa e o meio externo tendem a perder sal e ganhar água através das superfícies corporais. Os seus órgãos osmorreguladores, tais como as brânquias e a glândulas antenais, são responsáveis por manterem a homeostase de sal e água contra esse elevado gradiente. Para isso capturam e reabsorvem NaCl compensando as perdas difusivas de sal. Essa habilidade foi fundamental para a invasão da água doce pelos camarões palemonídeos. O objetivo deste trabalho foi investigar a biologia comparada do transporte iônico transepitelial nas brânquias camarões e caranguejos. No camarão diádromo de água doce Macrobrachium rosenbergii, as brânquias posteriores foram perfundidas com diversas salinas para experimentação eletrofisiológica. As manipulações com substituição de íons e adição de alguns inibidores do transporte iônico nas salinas perfundidas, simétricas no lado externo e interno do epitélio, demonstraram que o epitélio produz uma voltagem que pode englobar a absorção ativa (sensível ao inibidor metabólico NaCN) de Na+, que ocorre provavelmente por intermédio de um canal de Na+ ou um trocador Na+/H+ apicais sensíveis à amiloride, e é dependente da atividade de uma Na+/K+-ATPase. Uma pequena voltagem decorrente da captura de Cl- foi também medida, e se mostrou sensível à acetazolamida, um inibidor da anidrase carbônica. Esta voltagem também era sensível ao inibidor de uma V(H+)-ATPase, concanamicina, mostrando que esta bomba de prótons também desempenha um papel no transporte iônico transepitelial. Os resultados corroboram um modelo semelhante de captura de Na+ dependente de canais apicais de sódio em série com uma Na+/K+-ATPase proposto anteriormente por este laboratório. O gradiente eletroquímico produzido pela atividade desta ATPase permite a captura de Na+ na água doce. O acoplamento elétrico entre as células pilares e as células do septo branquial permite a passagem do Na+ ao longo da rota de captura até a hemolinfa. Análises das brânquias posteriores e anteriores do caranguejo de água doce Dilocarcinus pagei também foram feitas no intuito de se revelar a ultraestrutura do epitélio branquial e marcar a atividade p-NPPásica de uma Na+/K+-ATPase. Os experimentos envolvendo ultraestrutura das brânquias do caranguejo de água doce Dilocarcinus pagei mostraram, ao nível ultraestutural, uma diferenciação entre os dois lados da lamela branquial nas brânquias posteriores, aonde um lado distal apresenta características de um epitélio ionotransportador, menos desenvolvido do que no lado proximal, apesar dos dois lados mostrarem uma marcação ultracitoquímica para a Na+/K+-ATPase, indicando a ubiqüidade desta enzima. Os resultados indicam que existem dois processos fundamentais de transporte, um de Cl- e outro de Na+, demonstrados de modo eletrofisiológico e estrutural e que tal separação de processos possibilitou aos dois crustáceos estudados a invasão do ambiente dulcícola. / The freshwater crustaceans confronted with a high gradient of NaCl between the blood and the external media tend to lose salt and to gain water through the corporal surfaces. Its osmorregulatory organs, such as the gills and the antennal glands, are responsible for they maintain salt and water homeostasis against that elevated gradient. For that they capture and reabsorb NaCl compensating the difusive losses of salt. That ability was fundamental for the invasion of the freshwater by the palemoníds shrimps. The aim of this work was to investigate the compartive biology of the transepithelial ionic transport in the gills and antennal glands of shrimps and crabs. In the diadramous freshwater shrimp Macrobrachium rosenbergii, the posterior gills were perfused with several salines for electrophysiologic experimentation. The manipulations with ions replacement and addition of some ionic transport inhibitors in the perfused salines, symmetrical on the external and internal sides of the epithelium, demonstrated that the epithelium produces a voltage that can include the active absorption (sensitive to the metabolic inhibitor NaCN) of Na+, that probably occurs through a apical channel of Na+ or a Na+/H+ exchanger sensitive to the amiloride, and it is dependent of the activity of a Na+/K+-ATPase. A small voltage due to the capture of Cl- was also measured, and it was shown sensitive to the acetazolamide, an inihibitor of the carbonic anhidrase. This voltage was also sensitive to the inhibitor of a V(H+)-ATPase, concanamicine, showing that this protons pump also plays a role in the transepithelial ionic transport. The results corroborate a model similar of capture of dependent Na+ of apical channels of sodium in series with a Na+/K+-ATPase proposed previously by this laboratory. The electrochemical gradient produced by the activity of that ATPase allows the capture of Na+ in the freshwater. The electric coupling between the pillar cells and the gill septal cells allows the passage of Na+ along the capture route to the haemolymph. Analyses of the anterior and posterior gills of the freshwater crab Dilocarcinus pagei were also done in the intend to reveal the ultrastructure of the gill epithelium and to locate the p-NPPasic activity of a Na+/K+-ATPase. The experiments involving ultrastructure of the gills of the freshwater crab Dilocarcinus pagei showed, from an ultrastructural level, a differentiation among the two sides of the gill lamela in the posterior gills, where a side distal presents characteristics of an ionotransporting epithelium, more developed than the proximal side, in spite of the two sides show ultracitochemical location for Na+/K+-ATPase.

Avaliou-se a estrutura e a ultra-estrutura do plexo subpericárdico (PS) de ratos desnutridos com uma dieta hipoprotéica (5% de caseína) durante os períodos pré-natal e pós-natal com 21 dias (D) e 42 dias (DD). Animais com as mesmas idades e submetidos à dieta normal (20% de caseína) formaram os respectivos controles (N, NN). Animais do grupo D submetido à dieta normal do 22º ao 42º dias formaram o grupo RN. Preparados totais de membrana foram obtidos dos átrios cardíacos e corados por técnicas histoquímicas (NADH, NADPH, AChE). Fibras colágenas e elásticas dos gânglios foram analisadas em cortes histológicos corados por métodos rotineiros em histologia. A ultra-estrutura dos componentes neuronais foi avaliada em todos os grupos (N, D, NN, DD e RN). A desnutrição promoveu alteração ultra-estrutural nos grupos D e DD, bem como no peso do animal, no número de neurônios reativos à NADH e no tamanho dos neurônios reativos à NADPH. Concluiu-se que há um atraso no desenvolvimento nas estruturas do PS com a desnutrição. / The structure and ultra structure of the subepicardic plexus (SP) of undernourished rats with a hypoproteic diet (5% of casein) during pre and postnatal periods with 21 days (D) and 42 days (DD) were evaluated. Animals at the same age groups and submitted to a normal diet (20% of casein) formed the respective controls (N, NN). Group D animals, which were submitted to a normal diet from the 22nd to the 42nd day, established Group RN. The whole mount was taken from cardiac atria and stained by histochemical techniques (NADH, NADPH, AChE). Ganglia collagen and elastic fibers were analysed in histological sections stained by regular methods of histology. The neuron components ultra-structure was analysed in all groups (N, D, NN, DD and RN). The protein deprivation promoted ultra-structural alteration in groups D and DD animal weight, number of NADH reactive neurons and size of NADPH reactive neurons. It was concluded that there is a delay in SP structure development with protein deprivation.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2006-04-20Bitstream added on 2014-06-13T19:01:03Z : No. of bitstreams: 1 lisboa_lco_dr_rcla.pdf: 650724 bytes, checksum: 95fb2a1a2dad2bd0de9a5e34f0e6d402 (MD5) / Entre as abelhas altamente eussociais, o estudo de aspectos da morfologia e da ultra-estrutura tem ajudado a esclarecer uma série de questões sobre a sua biologia. A divisão de trabalho distingue as fêmeas em duas castas, sendo uma com função reprodutiva (rainha) e outra que desempenha as mais diversas tarefas dentro da colônia (operária). Espécies do gênero Frieseomelitta mostram esta divisão de forma mais clara, uma vez que suas operárias nunca põem ovos; começando um processo degenerativo nos ovários ainda no final de sua diferenciação. Porém, nas diferentes espécies e em diferentes condições, as operárias podem desenvolver seus ovários e realizar postura de ovos tróficos que são comidos pelas rainhas, ou dar origem a machos. O primeiro caso mostra que além da contribuição dada pelas operárias na produção de alimento para a cria com suas secreções glandulares, elas contribuem também com seus ovos para produzir alimento. Já o segundo caso pode ser um indicativo de que a divisão do trabalho reprodutivo ainda não está totalmente definida. A fertilidade das rainhas também parece se manifestar de diferentes formas. Em Apis mellifera, é evidenciada pela enorme diferença no número de ovaríolos, bem maior nas rainhas do que nas operárias. Esta diferença é devido a uma redução sofrida pelas operárias durante o desenvolvimento pós-embrionário. Já nos 9 meliponíneos o número de ovaríolos de rainhas e operárias é, para a maioria das espécies, igual e em número de quatro por ovário. Em Trigona spinipes, o número de ovaríolos dos ovários das operárias é sempre igual a quatro, enquanto que nas rainhas pode variar entre oito e quinze, entre as rainhas e entre os ovários da mesma rainha... . / The survey of morphological and ultrastructural aspects of highly eusocial bees, have cleared and supported many questions about their biology. The division of labour discern the females in to two castes, being one with reproductive function (queen) and other that perform differents tasks within the colony (worker). Frieseomelitta shows this division clearly. The workers never lay eggs; starting a degenerative process in the ovaries yet in the ending your differentiation. However, in different species and in different conditions, the workers can develop their ovaries and lay eggs that can be trophic and be eaten by the queens, or give rise males. The first condition show that further of the contribution given by the workers in the food production for the brood with yours glandular secretions, they contribute also with yours eggs for to produce food. The second condition can be an evidence that division of reproductive labour is not entirely solved yet. Queen's fertility also seems to be expressed in different ways. In honey bees Apis mellifera, there is a large difference in ovarioles number, which are bigger in queens than workers. This difference is due to the decrease in workers ovarioles number during the post-embryonic development. In Meliponini the ovarioles number of queens and workers is, for most of the species, the same; four per ovary. 11 In Trigona spinipes, the ovarioles number in workers is always four, while in queens can vary from eight to fifteen among queens and among the ovaries of the same queen. Anyway, the ovariole number present in the ovary of queens in Meliponini is very small if compared to Apis mellifera; that suggest that their efficience in egg production can be higher and attached to the ovarioles lengh... (Complete abstract, click electronic address below).

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:30:56Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2010-08-31Bitstream added on 2014-06-13T20:01:10Z : No. of bitstreams: 1 berger_b_dr_rcla.pdf: 1800024 bytes, checksum: b803c12973aa74cd00fe939959c8d1f1 (MD5) / Os ovários das rainhas diferem dos de operárias de Apis mellifera quanto ao número e comprimento dos ovaríolos. Tanto o número, como o comprimento destes, é muito maior na rainha que nas operárias. No entanto, em ambos os casos os ovários são funcionais, isto é, capazes de produzir óvulos maduros. Apesar disso, operárias e rainhas diferem muito quanto à fertilidade e aos mecanismos controladores/estimuladores da vitelogênese, ou seja, da maturação dos óvulos. Em condições normais da colônia, nas rainhas a vitelogênese é desencadeada pelo acasalamento e nas operárias, pela ausência da rainha ou do recebimento de informações sobre sua presença na colônia. Passada a ocasião própria para o acasalamento no caso da rainha, e em idade avançada das operárias, os ovários entram em degeneração. O objetivo do presente trabalho foi o de avaliar como se comporta o desenvolvimento do ovário em rainhas e operárias mantidas fora dos condicionamentos da colônia e o efeito do tratamento destas com CO2, prática corrente na apicultura. Para tanto, operárias e rainhas foram mantidas aprisionadas em caixas com candy e água durante 15 dias e seguida a seqüência de desenvolvimento de seus ovários. O efeito do não acasalamento na época própria e do tratamento com CO2 foi feito estudando a morfologia do desenvolvimento da ovogênese, usando TUNEL e reação de fosfatase acida para caracterizar possíveis alterações celulares. As células do filamento terminal apresentaram-se empilhadas em fila única. Na transição para o germário as células tornam-se piramidais com a base apoiada sobre a lâmina própria e o ápice voltado para o centro do ovaríolo. São encontradas células esféricas, provavelmente ovogônias. No germário estão presentes células somáticas e germinativas, sendo da linhagem germinativa, os cistoblastos, os cistócitos, os ovócitos e as futuras... / The ovaries of queens and workers of Apis mellifera differs in number and length of the ovarioles. Length and number of ovarioles are larger in queen than in workers. However, in both cases, the ovaries are functional, i.e., it is able of produce mature eggs. Despite of that, workers and queens differ very in fertility and mechanisms of controlling/inducing vitellogenesis. In colony conditions, queen’s vitellogenesis is triggered by the matting and in workers by the absence of the queen or of the receipt of information about its presence in the colony. After the age proper to mate or in workers advanced age, the ovaries enter in degeneration. The objective of the present work was the evaluating of the ovary development in queens and workers maintained caged outside of the colony conditionings and the effect of the narcosis with CO2, practice current in the beekeeping. Newly emerged queens and workers were caged with candy and water during 15 days. For the queens the effect of the mate delay and CO2 narcosis were studied using TUNEL and acid fosfatase reaction to evaluate cell damages. The cells of the terminal filament appear as rows of one single cell, with a rectangular shape, poor in organelles and with a big central nucleus. In the transition for the germarium the cells present a pyramidal form with their base widened resting on tunica propria and the apex directed to center of the ovariole. Below the region of transition to the germarium are spherical cells, probably the oogonia. In the germarium are found somatic (pre-follicular cells) and germinative (cystoblasts, the cystocists, the oocytes and the future nurse cells) cells. The queen’s ovaries develop normally until the mating age, 5 days old queens. About the 10 days, the virgin queen beginning to presents an ovariolar disorganization with big incidence of injured cells with characteristics of apoptosis and autofagic death... (Complete abstract click electronic access below)

O gênero Aulacoseira Thwaites é exclusivo de águas continentais e possui ampla distribuição mundial. As espécies do gênero vêm sendo estudadas, principalmente para regiões temperadas da América do Norte e Europa. Atualmente, Aulacoseira conta com aproximadamente 60 espécies, dentre fósseis e atuais. No Brasil, apenas 17 espécies foram registradas e poucos trabalhos apresentaram informações sobre a ultra-estrutura da frústula. Desta forma, o presente estudo teve por objetivos analisar as características morfológicas e estruturais das espécies de Aulacoseira do Brasil e a distribuição geográfica das espécies em ambientes aquáticos brasileiros. O estudo baseou-se em 286 amostras de plâncton e perifíton, procedentes de diversos tipos de ambientes, como rios, lagos, lagoas e reservatórios, abrangendo 24 estados brasileiros. Exemplares de Aulacoseira foram analisados sob microscopia óptica e eletrônica de varredura e transmissão. Os táxons encontrados foram descritos, mensurados, ilustrados e comentados. Uma chave dicotômica foi providenciada para auxiliar na determinação das espécies e glossário para compreensão das estruturas. A análise do material permitiu a identificação de 23 táxons infragenéricos de Aulacoseira, sendo 18 espécies, três variedades não típicas e duas formas taxonômicas. Dentre estas, seis constituíram novas espécies para ciência (A. brasiliensis, A. calypsi, A. minuscula, A. pantanalensis, A. samariana e A. simoniae) e duas não foram determinadas em nível específico. Aulacoseira pseudoamericana e A. herzogii var. minor constituíram citação pioneira para o Brasil e A. gessneri teve sua ultra-estrutura documentada pela primeira vez. Dos 29 táxons infragenéricos de Aulacoseira já registrados para o Brasil, apenas 13 foram encontrados durante o estudo, alguns táxons foram reidentificados e outros puderam ser revistos devido há ausência de informações complementares nas publicações. Aulacoseira calypsi, A. gessneri, A. pantanalensis, A. pseudoamericana, A. samariana e A. herzogii var. minor apresentaram distribuição restrita à áreas de clima tropical enquanto que Aulacoseira cf. alpigena, A. granulata var. angustissima f. spiralis e Aulacoseira sp.2 ocorreram exclusivamente em regiões subtropicais. O elevado número de novas espécies encontradas ressalta a importância de estudos taxonômicos mais aprofundados para melhor conhecimento das características diacríticas das espécies que ocorrem em ambientes continentais brasileiros. Palavras-chave: ambientes continentais, diatomáceas cêntricas, taxonomia, ultra-estrutura. / The genus Aulacoseira Thwaites is exclusive of continental waters and has worldwide distribution. The species of this genus have been widely studied, mainly to temperate regions of North America and Europe, and the taxa that occur in South America are poorly known. Currently, Aulacoseira has approximately 60 species, among fossil and recent. In Brazil, only 17 species were recorded and few studies presents data on the ultrastructure of the frustule. Thus, this study aimed to analyze the structural and morphological features of the Aulacoseira genus and geographical distribution of species in aquatic environments in Brazil. The study was based on 286 samples of plankton and periphyton, collected in different types of environments such as rivers, lakes, ponds and reservoirs distributed in 24 states. Specimens of Aulacoseira were examined under light and electron microscopy. The taxa were described, measured, illustrated and discussed. Dichotomous key was provided to assist in determining the species and glossary for understanding the structures described. The analysis allowed the identification of 23 infrageneric taxa of Aulacoseira, with 18 species, three varieties and two non typical taxonomic forms. Among these, six new species for science were found (A. brasiliensis, A. calypsi, A. minuscula, A. pantanalensis, A. samariana e A. simoniae) and two were not determined at specific level. Aulacoseira pseudoamericana and A. herzogii var. minor were first recorded in Brazil and A. gessneri its ultrastructure was first revealed. Of the 29 taxa of Aulacoseira already recorded in Brazil, only 13 were found during the study, some taxa were reidentified and others could not be revised because there is no additional information in publications. Aulacoseira calypsi, A. gessneri, A. pantanalensis, A. pseudoamericana, A. samariana and A. herzogii var. minor present distribution restricted to tropical areas while Aulacoseira cf. alpigena, A. granulata var. angustissima f. spiralis and Aulacoseira sp.2 occurred exclusively in the subtropics.The high number of new species found highlights the importance of more detailed taxonomic studies to improve knowledge of diacritical features of the species occurring in Brazilian environments.

Yang, Hao. / Thesis (M.Phil.)--Chinese University of Hong Kong, 2009. / Includes bibliographical references (leaves 53-57). / Abstract also in Chinese. / Title Page --- p.i / Thesis Committee --- p.ii / Abstract (English version) --- p.iv / Abstract (Chinese version) --- p.vi / Acknowledgment --- p.vii / Table of Contents --- p.viii / List of Tables --- p.xi / List of Figures --- p.xii / List of Abbreviations and Symbols --- p.xv / Chapter 1 --- Introduction --- p.1 / Chapter 1.1 --- DNA Methylation --- p.1 / Chapter 1.2 --- DNA Methylation Repair --- p.2 / Chapter 1.3 --- Objectives of This Work --- p.2 / Chapter 1.4 --- DNA Structure --- p.3 / Chapter 1.4.1 --- Nomenclature Scheme for DNA --- p.3 / Chapter 1.4.2 --- Base Pair Scheme --- p.4 / Chapter 1.4.3 --- Sugar Conformation --- p.5 / Chapter 1.4.4 --- Backbone Conformation --- p.5 / Chapter 2 --- Materials and Methods --- p.7 / Chapter 2.1 --- Sample Design --- p.7 / Chapter 2.2 --- Sample Preparation --- p.7 / Chapter 2.3 --- UV Optical Melting Study --- p.8 / Chapter 2.4 --- NMR Study --- p.9 / Chapter 2.4.1 --- NMR Melting Study --- p.10 / Chapter 2.4.2 --- Resonance Assignment --- p.10 / Chapter 2.4.3 --- Determination of Sugar Conformation --- p.12 / Chapter 2.4.4 --- Determination of Backbone Conformation --- p.13 / Chapter 3 --- Effect of 1-Methyladenine on Double-Helical DNA Structures --- p.14 / Chapter 3.1 --- NMR Resonance Assignments --- p.14 / Chapter 3.1.1 --- TA-oligo Resonance Assignments --- p.14 / Chapter 3.1.2 --- TmlA-oligo Resonance Assignments --- p.16 / Chapter 3.2 --- DNA Double-Helical Structures upon 1-Methylation of Adenine --- p.18 / Chapter 3.2.1 --- Base Pairing Mode --- p.18 / Chapter 3.2.2 --- Sugar Puker --- p.21 / Chapter 3.2.3 --- Backbone Conformation --- p.22 / Chapter 3.3 --- Summary --- p.24 / Chapter 4 --- Effect of 1-Methyladenine on Double-Helical DNA Stabilities --- p.25 / Chapter 4.1 --- Thermodynamic Studies --- p.26 / Chapter 4.1.1 --- Influence of m6A on UV Melting Studies --- p.26 / Chapter 4.1.2 --- Thermodynamics by NMR Melting Studies --- p.28 / Chapter 4.2 --- "NMR Structural Studies on Gm1A-, Am1A- and Cm1A-oligo" --- p.33 / Chapter 4.2.1 --- Gml A-oligo --- p.33 / Chapter 4.2.1.1 --- Gm1A-oligo Resonance Assignments --- p.33 / Chapter 4.2.1.2 --- Base Pair Structures of Gm1A-oligo --- p.35 / Chapter 4.2.2 --- AmiA-oligo --- p.37 / Chapter 4.2.2.1 --- Am1A-oligo Resonance Assignments --- p.37 / Chapter 4.2.2.2 --- Base Pair Structures of Am1A-oligo --- p.39 / Chapter 4.2.3 --- Cm1A-oligo --- p.43 / Chapter 4.2.3.1 --- Cm1A-oligo Resonance Assignments --- p.43 / Chapter 4.2.3.2 --- Base Pair Structures of Cm1A-oligo --- p.45 / Chapter 4.3 --- Summary --- p.46 / Chapter 5 --- Conclusion and Future work --- p.47 / Appendix I Proton chemical shift values of TA-oligo --- p.48 / Appendix II Proton chemical shift values of TmlA-oligo --- p.49 / Appendix III Proton chemical shift values of GmlA-oligo --- p.50 / Appendix IV Proton chemical shift values of Am1A-oligo --- p.51 / Appendix V Proton chemical shift values of CmlA-oligo --- p.52 / References --- p.53

Os padrões de estocagem de esperma e as variações morfológicas cíclicas do trato reprodutivo feminino constituem táticas reprodutivas muito pouco estudadas em serpentes neotropicais, se comparadas às serpentes de regiões temperadas. Assim, o presente estudo teve por objetivo caracterizar e compreender as estratégias reprodutivas empregadas por fêmeas de quatro espécies de serpentes brasileiras da subfamília Xenodontinae. Amostras de gônadas e vias genitais foram coletadas em diferentes estações do ano e relacionadas aos estágios reprodutivos da fêmea. Os resultados indicaram que as serpentes estudadas possuem dois locais de estocagem de esperma distribuídos no infundíbulo posterior e na junção útero-vaginal. Liophis miliaris, Oxyrhopus guibei e Philodryas patagoniensis apresentaram estocagem por meio de glândulas túbulo-alveolares ramificadas e glândulas tubulares ciliadas no infundíbulo posterior. Das quatro espécies estudadas, apenas Tomodon dorsatus e P. patagoniensis apresentaram grupos de espermatozóides armazenados nos sulcos da junção útero-vaginal. No entanto, unicamente P. patagoniensis parece ter a capacidade de produzir várias ninhadas com esperma estocado proveniente dessa região. Em ambos os locais de estocagem as células secretoras aumentaram a produção de carboidratos neutros na presença de esperma, o que sugere um processo de nutrição. Em fêmeas vitelogênicas o aumento da atividade secretora do epitélio ovidutal com produção de vacúolos eletrodensos parece estar sobre controle hormonal. Durante o ciclo reprodutivo as glândulas uterinas de espécies ovíparas e vivíparas também mostraram um aumento da secreção em fêmeas vitelogênicas. No entanto, as glândulas uterinas das espécies ovíparas apresentaram uma maior atividade do retículo endoplasmático rugoso, o que indicou produção de proteínas para formação da membrana da casca. O ciclo reprodutivo e a época de acasalamento variaram entre as populações das diferentes espécies. Em L. miliaris, O. guibei e P. patagoniensis essas variações estiveram ligadas a mudanças na temperatura e pluviosidade, já T. dorsatus não apresentou variações no ciclo reprodutivo, provavelmente influenciada pela inércia filogenética. / Sperm storage patterns and cyclic morphological variations in the female reproductive tract are poorly studied reproductive tactics in Neotropical snakes if a comparison to snakes from temperate regions is established. Therefore, the aim of this study is to characterize and understand the female reproductive strategies of four species of Xenodontinae snakes from Brazil. Samples of the gonads and genital ducts were collected during the different seasons of the year and a correlation with female reproductive stages was established. Results show that these snakes have two sperm storage sites in the posterior infundibulum and uterovaginal junction. Liophis miliaris, Oxyrhopus guibei and Philodryas patagoniensis store sperm by means of branched tubuloalveolar glands and tubular ciliated glands in the posterior infundibulum. Only Tomodon dorsatus and P. patagoniensis showed sperm stored in the furrows of the uterovaginal junction. Anyway, only P. patagoniensis seems to be capable of producing multiple clutches using sperm stored in this portion. Secretory cells increased the production of neutral carbohydrates in the presence of sperm in both sperm storage sites, which suggests the existence of a nutrition process. In vitellogenic females, the increase of the secretory activity in the oviductal epithelium with production of eletrodense vacuoles seems to be under hormonal control. During the reproductive cycle, uterine glands of oviparous and viviparous species also showed an increase in secretion in vitellogenic females. However, uterine glands of oviparous species showed more intense activity of the rough endoplasmic reticulum, which indicates the production of proteins for the formation of the egg shell. Reproductive cycles and timing of mating varied between different populations. In L. miliaris, O. guibei and P. patagoniensis, these variations were linked to the changes in temperature and rainfall patterns, but T. dorsatus did not show any variation in the reproductive cycles between populations, probably influenced by phylogenetic inertia.

O Callithrix penicillata (sagui-de-tufo-preto) mesmo sendo utilizado em algumas pesquisas e também mantido tanto em zoológicos como animal de estimação, possui ainda diversas lacunas acerca de sua anatomia. Assim, utilizamos 10 animais somente para o estudo da topografia, do padrão de irrigação vascular e de alguns índices biométricos do estômago, e outros cinco animais para estudos microscópicos. Ambos tendo com o objetivo caracterizar a anatomia do estômago e comparar as variações entre os sexos e eventualmente com outras espécies. Para o padrão vascular realizamos injeção de neoprene látex corado na aorta torácica com posterior dissecação dos ramos abdominais e no caso do estudo biométrico o mesmo foi realizado com o uso de um paquímetro digital, fita métrica e transferidor. E procedimentos tanto para a microscopia de luz com colorações de Hematoxilina-Eosina e Tricrômio de Masson quanto para a microscopia eletrônica de varredura foram efetuados. Com base no estudo ora realizado verificamos que o estômago localizava-se medialmente da 9° a 12° costelas e os aspectos biométricos revelam os padrões primários para este órgão, não se registrando diferenças entre machos e fêmeas. A artéria celíaca surge como o primeiro ramo da aorta abdominal, ocorrendo maior prevalência (70%) de trifurcação a partir desta artéria, com a emissão da artéria lienal, artéria gástrica esquerda e artéria hepática. A artéria lienal acompanhou a curvatura maior do estômago dando origem à artéria gastroepiplóica esquerda. A artéria gástrica esquerda no seu trajeto acompanhava a região da cárdia e do esôfago abdominal, cedendo-lhes contribuições. Já a artéria hepática originava a artéria gástrica direita e a artéria gastroduodenal. E esta por sua vez fornecia a artéria gastroepiplóica direita e a artéria pancreático-duodenal. Quanto aos aspectos microscópicos observamos a presença de quatro camadas: mucosa, submucosa, muscular e serosa e a presença de pregas da mucosa. Desta forma nesta oportunidade visamos contribuir para o estudo da anatomia comparativa, o que procuramos por vezes realizar neste trabalho, a fim também de oferecer subsídios indispensáveis em procedimentos clínico-cirúrgicos nesta espécie. / The Callithrix penicillata (black-tufted-ear-marmoset), have being used in some research and also kept both in zoos and pet. There are still many questions to be answered about their anatomy. Then to study the topography, the vascular pattern of irrigation and some biometric indices of the stomach, we used 10 animals and five other animals to microscopic studies. Both group of animals were studied in order to characterize the anatomy of the stomach and compare the variations between the sexes and possibly other species. To perform the vascular standard thoracic aorta was stained with injection of neoprene latex. Subsequently, we performed the dissection of the abdominal branches and in the case of the same biometric study was conducted using a digital caliper, tape measure and protractor. Procedures for both light microscopy with hematoxylin-eosin staining and Massons Trichrome as for scanning electron microscopy were perfomed. Based on our study we verified that the stomach was located medially from 9° to 12° ribs and biometric aspects reveal the primary standards body for this, not registering differences between males and females. The celiac artery arises as the first branch of the abdominal aorta, causing a higher prevalence (70%) from the trifurcation of the artery, originating the lienal artery, left gastric artery and the hepatic artery. Lienal artery accompanied the greater curvature of the stomach giving rise to the left gastroepiploic artery. The left gastric artery in its course follow and irrigate the region of the abdominal esophagus and cardia, originating new branches for that region. In its turn the hepatic artery originated the right gastric artery and gastroduodenal artery which gives rise to the right gastroepiploic artery and pancreatic-duodenal artery. In regards to the microscopic aspects we observed the presence of four layers: mucosa, submucosa, muscle and serosa and the presence of mucosal folds. Thus we aim to contribute to the study of comparative anatomy, in order to offer indispensable subsidies in clinical and surgical procedures in this specie.