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Genética aplicada à ecologia de estradas: um estudo na estrada municipal Guilherme Scatena (São Carlos, SP) e potencial impacto na biodiversidade local.

Castro, Karen Giselle Rodriguez 25 April 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T20:21:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4439.pdf: 2006623 bytes, checksum: 21bda32fc532bf7d57753bbd03222990 (MD5) Previous issue date: 2012-04-25 / Universidade Federal de Sao Carlos / Roads generate a large ecological impact to wildlife by raising barriers among ranges of species originally continuous and for causing road-kills. After road-killing, a morphological identification becomes impossible for the loss of diagnostic features, especially in the case of small vertebrates. Use of molecular tools for identification is an alternative that has shown successful results, especially when looking towards the species level. We identified samples from animals road-killed, collected on Guilherme Scatena road, through the use of DNA barcode markers, contributing to the local biodiversity knowledge. Another objective was to know the places that have a higher incidence of road kill and the type of landscape coverage in them. During 20 weeks we collected 123 vertebrates: six mammals (5% of total), 30 birds (24%), 38 amphibians (30%) and 49 reptiles (40%), which meant an average of 0.051 animals/Km road-killed. Through morphological characteristics and molecular (mitochondrial genes cox1 and 16S) we identified 111 samples until species status. Analyses among taxonomic classes showed significant differences, confirming that the effects of roads on biodiversity are taxon-specific. We found 19 different types of landscape around the road, being the most common farm buildings and pasture, showing the strong anthropic pressure on environments of this region. The results shown in this study are intended to be an important basis for planning future actions that provide the best management of this area rich in endemic biodiversity of the Brazilian cerrado, as well as mitigation measures to lessen the impact caused by the road. / As estradas geram um grande impacto ecológico à fauna por criar barreiras que separam áreas originalmente contínuas da distribuição das espécies e por ocasionar atropelamentos. Após os atropelamentos, a identificação morfológica dos animais tornase impossível pela perda de caracteres diagnósticos, sobretudo, nos vertebrados pequenos. A utilização de ferramentas moleculares para a identificação é uma alternativa que tem apresentado resultados bem sucedidos, principalmente quando se pretende conhecer a espécie. Neste contexto, o presente trabalho identificou as amostras de animais mortos por atropelamentos, coletados na estrada Guilherme Scatena, mediante o uso de marcadores de DNA barcode, contribuindo assim para o conhecimento da biodiversidade local. Também foi objetivo do mesmo conhecer os locais de maior incidência de atropelamentos e o tipo de coberturas da paisagem desses. Durante 20 semanas de coleta foram encontrados 123 vertebrados: seis mamíferos (5% do total); 30 aves (24%); 38 anfíbios (30%) e 49 répteis (40%), para uma média de atropelamentos de 0,051 animais/Km. Por meio de caraterísticas morfológicas e moleculares (genes mitocondriais cox1 e 16S) foi possível identificar o status de espécie de 111 amostras do total coletado. As análises realizadas entre classes taxonômicas mostraram diferenças significativas, corroborando que os efeitos das estradas sobre a biodiversidade são táxon-específico. Foram encontrados 19 tipos diferentes de cobertura da paisagem em torno da estrada, sendo mais comuns as construções rurais e as pastagens, evidenciando a forte pressão antrópica sobre os ambientes naturais desta região. Os resultados mostrados neste trabalho pretendem ser uma base importante para o planejamento de ações futuras que prevejam o melhor manejo desta região rica em biodiversidade endêmica do cerrado brasileiro, assim como medidas mitigatórias para diminuir o impacto da estrada.
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Revis?o do g?nero Lycoperdon Pers. (Lycoperdaceae, Agaricales) mediante an?lises morfol?gicas e moleculares

Alfredo, D?nis da Silva 30 March 2017 (has links)
Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2017-07-17T13:30:06Z No. of bitstreams: 1 DonisDaSilvaAlfredo_TESE.pdf: 10703319 bytes, checksum: 2a0e83dae0526396b51ee03f2edc8b39 (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2017-07-19T14:52:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 DonisDaSilvaAlfredo_TESE.pdf: 10703319 bytes, checksum: 2a0e83dae0526396b51ee03f2edc8b39 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-19T14:52:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 DonisDaSilvaAlfredo_TESE.pdf: 10703319 bytes, checksum: 2a0e83dae0526396b51ee03f2edc8b39 (MD5) Previous issue date: 2017-03-30 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Em uma estimativa sobre a biodiversidade da terra acredita-se haver entorno de 50 milh?es de esp?cies e para os fungos acredita-se que essa estimativa gira em torno de 5,1 milh?es de esp?cies, o que levaria cerca de 1000 anos para os taxonomistas identificassem todas essas esp?cies. Os taxonomistas t?m empregado muito esfor?o para identificar essas esp?cies de fungos, incluindo o g?nero representante dos chamados ?puffballs? -Lycoperdon Pers. Durante um longo per?odo, a taxonomia do g?nero Lycoperdon se baseou fundamentalmente em caracteres morfol?gicos, e muitos conceitos adotados para nomear esp?cies tem se mostrado divergentes entre os taxonomistas. At? o final da d?cada de 80, diversos trabalhos de taxonomia morfol?gica foram publicados e ajudaram a ampliar o conhecimento sobre a diversidade de esp?cies de Lycoperdon em quase todos os continentes, no entanto, em muitos casos a morfologia n?o ? suficiente para segregar esp?cies cr?pticas, ou esclarecer problemas de diverg?ncia quanto a sinonimiza??o de t?xons. No in?cio da d?cada de 90 houve uma revolu??o na taxonomia de fungos com o uso de ferramentas moleculares na classifica??o de esp?cies, relac?es filogen?ticas e identifica??o novos t?xons. Representantes do g?nero Lycoperdon foram estudados por meio dessa nova ferramenta somente no in?cio do s?culo 21, e logo em seguida em 2008, com os trabalhos de Larsoon e Jeppson, sendo que alguns g?neros como Morganella e Vascellum foram reconhecidos como subg?neros de Lycoperdon. Durante esse per?odo outra ferramenta passou a ganhar espa?o na identifica??o de esp?cies por meio de um c?digo de barras molecular, e essa ferramenta passou a ser usada na identifica??o de animais, plantas e fungos, usando dentre outra, a regi?o espa?adora transcrita interna (ITS), embora, at? o presente momento, nenhum trabalho de DNA ?barcoding? havia sido realizado com as esp?cies do g?nero Lycoperdon. O presente trabalho teve o objetivo de revisar as esp?cies do g?nero Lycoperdon para Am?rica do Sul, identificando-as com base nos caracteres morfol?gicos e no uso da regi?o ITS como DNA ?barconding? de fungos e, posteriormente, adicionando a regi?o da subunidade maior (LSU) do nrDNA para avaliar se ao adicionar as esp?cies sul-americanas, Morganella seguiria como subg?nero de Lycoperdon. Para isso, foram realizados empr?stimos de herb?rios nacionais e internacionais; usando literatura especializada na taxonomia do g?nero Lycoperdon e com ajuda de renomados especialistas do grupo, as esp?cies de Lycoperdon foram identificadas. Posteriormente, foi extra?do o DNA de pequenas por??es internas do basidiomas; logo em seguida o produto extra?do foi amplificado e sequenciado; as sequ?ncias foram editadas e submetidas ? busca por similaridade no GenBank utilizando o programa BLAST para checar se as sequ?ncias se assemelhavam as regi?es comparadas; uma vez realizado esse processo as sequ?ncias foram corridas em an?lises de M?xima Parcim?nia e dist?ncia (K2P) utilizando o programa PAUP; a ?rvore de dist?ncia se obteve por Neighbor-Joining. Al?m disso, foi realizada a an?lise Bayesiana no programa MrBayes; as ?rvores geradas foram visualizadas no FigTree e editadas no programa InkScap. Com base somente no ITS como DNA barcoding do g?nero Lycoperdon, obteve-se os seguintes resultados: 65% das amostras obtiveram sucesso de amplifica??o; foram identificadas 19 esp?cies, excluindo aquelas que estavam sob Morganella, para Am?rica do Sul e Central; quatro t?xons s?o primeiros registros para o continente sul-americacano: Lycoperdon calvescens, L. endotephrum, L. ericaeum e L. eximium; e foi erguido um novo subg?nero: Lycoperdon subg. Arenicola. Com base nas an?lises de morfol?gia e DNA barcoding foi poss?vel identificar 43 esp?cies do g?nero Lycoperdon, sendo que destas, 30 esp?cies s?o reportadas para Am?rica do Sul e Central; poucas esp?cies se encontram nos dois hemisf?rios (aprox. 30 %). Com estes resultados, conclu?mos que ITS como DNA ?barcoding? de Lycoperdon ? promissor, embora alguns grupos necessitem incluir mais esp?cimes e marcadores. A taxonomia morfol?gica continua sendo crucial na interpreta??o de dados geradas pela taxonomia molecular.
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Identificação de gêneros arbóreos de Fabaceae, Lauraceae e Myrtaceae do Estado de São Paulo utilizando o marcador molecular rbcL / Identification of Fabaceae, Lauraceae and Myrtaceae São Paulo State\'s tree genera using the molecular marker rbcL

Renata Moreira Barroso 28 July 2017 (has links)
O Brasil, como país detentor da maior biodiversidade mundial de plantas, possui um importante papel no desenvolvimento de pesquisas que auxiliem ou viabilizem a identificação de sua diversidade vegetal, como o estudo de marcadores moleculares adequados a esta tarefa. Fabaceae, Lauraceae e Myrtaceae são as famílias mais importantes da Flora Brasileira por apresentarem grande diversidade de gêneros e espécies e serem consideradas de difícil identificação pela taxonomia tradicional. Tendo em vista o potencial do rbcL na identificação molecular de plantas, este trabalho propôs estudar a eficiência deste marcador em identificar gêneros e espécies das três principais famílias de árvores da Flora do Estado de São Paulo. Foi criado um banco de sequências de rbcL contendo 160 espécies, o qual foi testado quanto sua eficiência de identificação através de um teste cego contendo as sequências inteiras (maior que 400 pares de base) e as sequências de tamanho reduzido em 300, 200 e 100 pb. O teste cego também foi realizado no banco de sequências mundial Boldsystems. Para a análise dos resultados foi utilizado o programa BLAST que busca similaridades entre as sequências. Os resultados evidenciaram a viabilidade do método ao mostrar que o rbcL identificou 100% dos gêneros arbóreos de Fabaceae e Myrtaceae, porém não podemos dizer o mesmo para identificar gêneros de Lauraceae e nem em nível específico para qualquer uma das famílias, já o teste de identificação com as sequências reduzidas mostrou que a sequência de rbcL da espécie a ser analisada deve conter mais que 400 pares de base para não comprometer a correta identificação de gênero. / Brazil, as the country with the greatest biodiversity in the world, has an important role in the development of research to help or enables the identification of its plant diversity, such as the study of suitable molecular markers for this task. Fabaceae, Lauraceae and Myrtaceae are the most important families of the Brazilian Flora because they present a large diversity of genera and species and are considered difficult to identify by the traditional taxonomy. Considering the potential of rbcL in the molecular identification of plants, this work aims to study the efficiency of this marker in identifying genera and species of the three main tree families of São Paulo State\'s Flora. A rbcL sequence Bank containing 160 tree species was created in order to test its efficiency through a blind test with whole and reduced sequences using the BLAST program that searches for similarities between sequences. The blind identification test was also performed using the Boldsystems database. The results showed that the rbcL can´t be indicated to identify Lauraceae tree genera, but can be indicated to successfully identify tree genera of Fabaceae and Myrtaceae. The test identification with reduced sequences showed that the analized specie must have at least 400pb to not compromise the correct genera identification.
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Estudo comparativo de tecnologias de identificação: avaliação em uma operação de varejo

Alexiou, Jorge Alexandre 07 February 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-03-15T19:37:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jorge Alexandre Alexiou.pdf: 1540498 bytes, checksum: a39add8dab794fcc7ac6b5962e375ff6 (MD5) Previous issue date: 2012-02-07 / This study aimed to compare the product identification technologies; Barcode and Radio Frequency Identification (RFID), in its use in a retail operation from the standpoint of the suitability and performance of supply chain processes in use. The study presents a proposal for a technology assessment based on the development of a computational model as a tool for comparing the performance of these technologies in business processes. A simulator have been developed based on the model for the process of the checkout line at the store, looking at various scenarios such as number of items per customer in the queue, delay in opening the checkout and identification technology used. The performance of both identification technologies was assessed in relation to the customer waiting time and queue length. We also analyzed the percentage of withdrawal (or abandon) of the queue by the client and the financial impact of this abandon was evaluated for various scenarios of average price of items purchased. The results show that the use of RFID tags can both reduce the customer waiting time and queue length in the checkout and have an important effect in reducing the loss of revenue caused by the abandon of the customer. Based on these results we propose the further development of the simulator in order to study the impact of the adoption of RFID in other processes. / Este estudo teve como objetivo comparar as tecnologias de identificação de produtos: Código de Barras (Barcode) e Identificação por Radiofrequência (RFID), em sua utilização numa operação de varejo do ponto de vista da adequação e desempenho dos processos da cadeia de suprimentos em que são utilizadas. O estudo apresenta uma proposta de avaliação das tecnologias baseada no desenvolvimento de um modelo computacional como ferramenta para a comparação de desempenho destas tecnologias nos processos de negócio. Um simulador foi desenvolvido com base no modelo para o processo de fila do caixa da loja, contemplando diversos cenários de quantidade de itens por cliente na fila, atraso na abertura do caixa e tecnologia de identificação. O desempenho de ambas as tecnologias de identificação foi avaliado em relação ao tempo de espera do cliente na fila e o comprimento da mesma. Também foi avaliada a porcentagem de abandono (ou desistência) da fila por parte do cliente bem como de seu impacto financeiro. Foram considerados diversos cenários de preço médio dos itens adquiridos. Os resultados mostram que a utilização de etiquetas RFID pode, além de reduzir o tempo de espera do cliente e o comprimento da fila no caixa, ter um efeito importante na redução da perda de receita causado pela desistência do cliente. Com base nestes resultados propomos a continuidade do desenvolvimento do simulador de forma de estudar o impacto da adoção da Identificação por Radiofrequência nos demais processos.
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Decoding Book Barcode Images

Tao, Yizhou 01 January 2018 (has links)
This thesis investigated a method of barcode reconstruction to address the recovery of a blurred and convoluted one-dimensional barcode. There are a lot of types of barcodes used today, such as Code 39, Code 93, Code 128, etc. Our algorithm applies to the universal barcode, EAN 13. We extend the methodologies proposed by Iwen et al. (2013) in the journal article "A Symbol-Based Algorithm for Decoding barcodes." The algorithm proposed in the paper requires a signal measured by a laser scanner as an input. The observed signal is modeled as a true signal corrupted by a Gaussian convolution, additional noises, and an unknown multiplier. The known barcode dictionaries were incorporated into the forward map between the true barcode and the observed barcode. Unlike the one proposed by Iwen et al., we take dictionaries of different patterns into account, specifically for decoding book barcodes from images which are captured with smartphones. We also presented numerical experiments that examined the performance of the proposed algorithm and illustrated that the unique determination of barcode digits is possible even in the presence of noise.
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Uma proposta de ensino de matemática para o EJA a partir dos códigos de barras

Marques, Rodrigo de Almeida 22 April 2015 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-01-13T14:40:31Z No. of bitstreams: 1 rodrigodealmeidamarques.pdf: 822736 bytes, checksum: 9ebcc57668d13b087d7183712c92cd12 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Oliveira (adriana.oliveira@ufjf.edu.br) on 2016-01-25T17:33:36Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rodrigodealmeidamarques.pdf: 822736 bytes, checksum: 9ebcc57668d13b087d7183712c92cd12 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-25T17:33:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rodrigodealmeidamarques.pdf: 822736 bytes, checksum: 9ebcc57668d13b087d7183712c92cd12 (MD5) Previous issue date: 2015-04-22 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Este trabalho visa apresentar uma visão geral dos Códigos de Barras, e associá-los a conceitos matemáticos como: produto escalar e divisão euclidiana. A partir daí evidenciar uma matemática básica aplicada nos códigos de barras, com o principal objetivo de atração e motivação, essencialmente dos estudantes do Educação dos Jovens e Adultos (EJA), uma proposta relacionada a atividades em sala de aula. Nossas expectativas com este trabalho é que possamos motivar mais os alunos, e assim contribuir para melhorar o processo de ensino aprendizagem. / This paper presents an overview of bar codes , and associate them with mathematical concepts such as dot product ; Euclidean division. From then show a basic math applied to bar codes, with the main objective of attraction and motivation, mainly students of the Youth Education and Adults (EJA) , a proposal related to activities in the classroom . Our expectations with this work is that we can encourage more students , and thus contribute to better the teaching and learning process.
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Optimalizace vedení logistiky skladového hospodářství ve velké firmě / Logistic process leadership optimization in big enterprise

Přichystal, Tomáš January 2008 (has links)
The Master’s thesis deals with logistics and resources monitoring area, which is inseparable part of every production oriented economic activity. It uses electronic monitoring systems for more effective dealing with stock records in a production company that has many stores. The monitoring utilizes modern technologies, that are burgeoning and finding its use in all branches of market.
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Systém pro rozpoznávání čárových kódů / Barcode recognition system

Pribula, Wojciech January 2015 (has links)
This thesis describes barcodes which are used in postal services. Specifically, it is concerned with Intelligent Mail Barcode, the GS1-128 code, the C128 code of Ceska posta (Czech Postal Services) and the QR code. The thesis attempts to analyze methods of encoding information into barcodes and error detection algorithms used for error correction during the decoding processes. Most importantly, there is described Reed-Solomon error correction in the QR code. There are presented and evaluated different methods of code detecting which are suggested by authors of various academic articles. The thesis also describes the method of creating test sets of images and proposed appearances of the scanning scene. Additionally, there are described algorithms for detection and decoding barcodes GS1-128, C128 and IMB in the image which was created during the work on this thesis. Finally, there is the evaluation of the percentage success of algorithms.
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Investigating the Implementation of Augmented Reality in Logistics

Thomas, Telbin, Alex, Jestin January 2020 (has links)
The rise of the new industrial era has brought about the need for adopting new technologies, digitization, automation, and improving the industrial internet of things. With the introduction of Industry 4.0, there have been a lot of changes that transformed the way of understanding how technologies have evolved and helped to improve productivity in various sectors. Through this thesis, we try to discuss how Augmented Reality (AR), which is one the main pillar of Industry 4.0 plays a vital role in industrial innovation and development. It is important to simplify the execution of logistics operations and make them more reliable where human resources are involved to decrease the error rate and decision-making time. The report provides information about the technologies that are currently used in the logistic industries such as barcode and RFID. A brief description of AR components, barriers, and its applications are discussed in the theoretical background. It follows a case study to understand common problem areas in the production system and find out how AR can improve these conditions by comparing them with data gathered from literature and interviews conducted. The thesis was performed in collaboration with one of the main logistic firms particularly focusing on the topic “Investigating the Implementation of Augmented Reality in Logistics”. This report will help to find out the critical problems that are present in the current processes and how augmented reality can help the industries to improve their system.
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Barcode Structure of Persistence Modules via Local Structure

Sultan, Sami A. 08 October 2020 (has links)
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