Made available in DSpace on 2014-06-11T19:27:25Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-07-23Bitstream added on 2014-06-13T19:14:53Z : No. of bitstreams: 1 piva_e_me_sjc.pdf: 760262 bytes, checksum: 326a357bb943563c3d204bcc238ce3ee (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A maioria das infecções por Candida estão relacionadas com biofilmes microbianos, que muitas vezes são formados por associações de diferentes espécies. O objetivo deste estudo foi avaliar as interações entre as diferentes espécies de Candida em biofilmes formados in vitro e verificar a sensibilidade dos biofilmes monotípicos de C. albicans e heterotípicos à terapia fotodinâmica (PDT). Foram estudadas cepas clínicas de C. albicans, C. tropicalis, C. glabrata e C. krusei. A partir de suspensões padronizadas de cada cepa (107 células/mL), biofilmes monotípicos e heterotípicos (formados por C. albicans e espécies não albicans) foram formados em placas de microtitulação de 96 poços durante 48 horas. A seguir, os biofilmes monotípicos de C. albicans e heterotípicos foram submetidos à PDT com fotossensibilizador eritrosina associado ao diodo emissor de luz (LED) verde. Os biofilmes foram analisados por meio da contagem de unidades formadoras de colônia (UFC/mL) em HiCrome Candida por 48h e pela viabilidade celular através do ensaio colorimétrico XTT (2 metoxi 4 nitro 5 sulfofenil 5 fenilalanina carbonil 2H tetrazolium hidróxido). Os resultados obtidos foram submetidos à ANOVA e teste de Tukey. Tanto na contagem de UFC/mL quanto no ensaio colorimétrico XTT, foi observado que o crescimento de C. albicans em biofilme monotípico e heterotípicos com C. tropicalis e C. glabrata foi semelhante. Entretanto, foi inibido em biofilme heterotípico com C. krusei. Foi demonstrado também que a PDT reduziu a viabilidade celular e a contagem de UFC/mL tanto dos biofilmes monotípicos quanto heterotípicos. Concluiu-se que C. albicans estabeleceu relações favoráveis com C. tropicalis e C. glabrata e relações antagônicas com C. krusei em biofilmes heterotípicos. Além disso, os biofilmes monotípicos e heterotípicos foram sensíveis à PDT mediada por LED e eritrosina / Most Candida infections are related to microbial biofilm, which are often formed by the association of different species. The objective of this study was to evaluate the interactions between different species of Candida biofilms in vitro and investigate the sensitivity of C. albicans monotypic biofilms and heterotypic biofilms to photodynamic therapy (PDT). From standardized suspensions of each strain (107 cells/ml), monotypic and heterotypic biofilms (formed by C. albicans and non-albicans species) were developed on flat-bottom 96-well microtiter plates for 48 hours. After that, C. albicans monotypic biofilms and heterotypic biofilms were subjected to PDT with photosensitizer erythrosine associated with green light emitting diode (LED). Biofilms were analysed by counting colony-forming units (CFU/m)l in Candida HiCrome for 48h and by cell viability using the XTT (2 methoxy 4 nitro 5 sulfophenyl 5 phenylamino carbonyl 2H tetrazolium hydroxide) colorimetric assay. The results were subjected to ANOVA and Tukey test. Both in the counting of CFU/ml as in the XTT colorimetric assay, it was observed that the growth of C. albicans in monotypic and heterotypic biofilm with C. glabrata and C. tropicalis was similar. However, it was inhibited in heterotypic biofilm with C. krusei. It was also demonstrated that PDT reduced cell viability and the number of CFU/mL of both monotypic and heterotypic biofilms. It was concluded that C albicans had favorable interaction with C. glabrata and C. tropicalis and antagonistic interaction with C.krusei in heterotypic biofilms. In addition, both of monotypic and heterotypic biofilms were sensitive to LED- and erythrosine-mediated Photodynamic Therapy

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:23:00Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2012-02-29Bitstream added on 2014-06-13T20:29:37Z : No. of bitstreams: 1 bonsaglia_ecr_me_botib.pdf: 226759 bytes, checksum: ef86655bccf56a9c4ddbb9892ff626f5 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Listeria monocytogenes é uma bactéria frequentemente encontrada em vários alimentos crus, como carne, queijo e legumes. Está amplamente distribuída no ambiente causando a contaminação de alimentos durante seu processamento. Atualmente, a contaminação por L. monocytogenes nas indústrias alimentícias é considerada um dos maiores problemas de segurança alimentar, pois uma vez presente na linha de processamento à bactéria dificilmente é eliminada pela grande capacidade em formar biofilme. A formação de biofilmes em equipamentos pode levar a sérios problemas de higiene e perdas econômicas devido à deterioração dos alimentos e deficiência dos equipamentos. Além disso, a contaminação por patógeno representa um grande risco para saúde. A incidência de listeriose é baixa, mas a taxa de letalidade é alta. Muitos dos focos principais de listeriose têm sido associados ao consumo de alimentos contaminados, especialmente os produtos lácteos. Assim, esse trabalho teve como objetivo analisar a capacidade de formação de biofilme, por 32 cepas de L. monocytogenes isoladas de diferentes alimentos, em diferentes materiais (aço inoxidável, vidro e poliestireno) e temperaturas (4º, 20º, 35ºC) observando a presença do gene luxS e também testar a eficácia de dois sanitizantes alcalino clorado, utilizados para sanitização de planta de processamento de alimentos. Os resultados demonstraram que entre as 32 cepas testadas 25 (78,1%) foram positivas para o gene luxS e a bactéria foi capaz de produzir biofilme em todos os materiais e temperaturas testadas, apresentando maior frequência de cepas produtoras nos materiais hidrofílicos (96,7% vidro e 95,6% inox) do que no hidrofóbico (28%). Os testes com sanitizantes mostraram que as concentrações recomendadas podem ser eficazes desde que utilizados em tempo mínimo... / Listeria monocytogenes is frequently found in many raw foods such as meat, cheese and vegetables, is widely distributed in the environment causing contamination of food during processing. Currently, contamination by L. monocytogenes in food is considered a major food security problems, because once present in the processing line, this bacteria is hardly eliminated by the great ability to form biofilm. The formation of biofilms on equipment can lead to serious health and economic losses due to spoilage and disability equipment. Furthermore, contamination pathogen is a great risk to health. The listeriosis incidence is low, but the fatality rate is high. Many of the main focuses of listeriosis have been linked to consumption of contaminated food, especially dairy products. Thus, this study aimed to analyze 32 strains of L. monocytogenes isolated from different foods to form biofilms on different materials (stainless steel, glass and polystyrene) and temperatures (4 º, 20 º, 35 º C) for the presence of the gene luxS and also test the effectiveness of two sanitizers alkaline chlorine used to sanitize the plant food processing. The results showed that the strains tested 25 (78.1%) were positive for the gene and the bacterium was able to produce biofilm in all materials and temperatures tested, with higher frequency of hydrophilic materials in producing strains (96.7% glass and 95.6% stainless) than in the hydrophobic (12.4%). The tests show that the sanitizing recommended concentrations may be effective if used in minimum time of 30 minutes for the product A and 15 for the product B has led to the elimination of 16 (50%) of the strains tested. We conclude that the gene luxS may be involved in the regulation of biofilm formation, but shouldn’t be the only one, once luxS-negative strains were also producers. We conclude... (Complete abstract click electronic access below)

Submitted by Marcelo Andrade Silva (marcelo.andradesilva@ufpe.br) on 2015-03-09T14:23:51Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Catarina Fernandes de Freitas.pdf: 2589861 bytes, checksum: 3f587b558e8abc1410528aa38d8eeb1a (MD5) / Made available in DSpace on 2015-03-09T14:23:51Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) DISSERTAÇÃO Catarina Fernandes de Freitas.pdf: 2589861 bytes, checksum: 3f587b558e8abc1410528aa38d8eeb1a (MD5) Previous issue date: 2014 / A crescente incidência de isolados de Klebsiella pneumoniae resistentes a carbapenêmicos e outras classes de antibióticos -lactâmicos, em casos de infecções relacionadas a assistência a saúde, tem sido amplamente relacionada com a produção de β-lactamases. A necessidade da utilização de dispositivos invasivos como cateteres, em pacientes hospitalizados pode favorecer a colonização destes por diferentes espécies bacterianas, propiciando a formação de biofilmes, o que pode agravar o estado clínico do paciente prejudicando a eficácia terapêutica. O objetivo deste estudo foi detectar a presença dos genes de resistência blaSHV, blaTEM, blaCTX-M, blaKPC; genes de virulência para produção de cápsula polissacarídica (cps), fímbrias do tipo 1 (fimH) e tipo 3 (mrkD); e a capacidade de formação de biofilme por isolados de K. pneumoniae multidroga-resistente (MDR) na ausência e presença de antibióticos. Foram analisados nove isolados de K. pneumoniae oriundos de pacientes hospitalizados na cidade de Recife-PE. A concentração inibitória mínima dos antibióticos cefotaxima, ceftazidima e amicacina foi determinada pelo método de macrodiluição. Foi feita a tipagem molecular através da técnica de amplificação de sequências intergênicas repetitivas de enterobactérias (ERIC-PCR). A determinação da presença dos genes foi realizada por PCR convencional. A formação de biofilme foi analisada após inoculação e incubação dos isolados em meio de cultura com um fragmento de catéter na presença e neumoni dos antibióticos cefotaxima, ceftazidima e amicacina, além da combinação da ceftazidima e amicacina para os que foram resistentes à amicacina. Os neumonia foram processados para microscopia eletrônica de varredura. A genotipagem por ERIC-PCR demonstrou perfis genéticos distintos para os nove isolados. Sete dos nove isolados foram positivos para os genes blaTEM, blaSHV e blaKPC e seis para o gene blaCTX-M. Todos os isolados foram positivos para o gene cps e mrkD e seis para o gene fimH. Todos os isolados formaram biofilme na ausência de antibióticos. Três isolados não formaram biofilme quando submetidos aos antibióticos testados. Em dois isolados a capacidade de formar biofilme melhorou quando submetidos aos antibióticos. Enquanto que sete dos nove isolados submetidos aos antibióticos, a formação de biofilme foi menor quando comparada com o controle. Embora os isolados sejam resistentes aos antibióticos foi possível observar diminuição do número de células aderidas e a diminuição da formação de biofilme por isolados de K. pneumoniae MDR portadores de diferentes β-lactamases e de fatores de virulência, os quais apresentaram comportamentos distintos em relação a formação de biofilme, dependendo do isolado e do antibiótico, podendo este inibir ou induzir uma melhor formação de biofilme.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo1576_1.pdf: 1438880 bytes, checksum: abad07e4ffff905ffbde5f7819b2accd (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2009 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Staphylococcus, embora presente na microflora da pele e mucosa humana se comporta como patógeno oportunista responsável por complicações infecciosas, principalmente após implantação de dispositivos protéticos. Além disso, possui extraordinária capacidade para adquirir resistência a antimicrobianos. Atualmente, Staphylococcus resistentes à meticilina (MRS) estão dispersos e relacionados com processos infecciosos tanto em âmbito hospitalar como na comunidade. A capacidade de aderir e colonizar materiais inertes por meio da formação de um biofilme confere proteção contra defesas do hospedeiro e a agentes antimicrobianos. A formação de biofilme tem sido associada com o nível de susceptibilidade à meticilina. O presente trabalho visou caracterizar amostras estafilocócicas pela identificação de genes relacionados à produção de biofilme (icaAD) e à regulação da resistência à meticilina (mecI e mecR1) correlacionando com a capacidade para formar biofilme in vitro e a susceptibilidade à oxacilina respectivamente, além de determinar o tipo de recombinase (ccr) presente no SCCmec das amostras e de estabelecer relação genética entre os isolados. As análises realizadas em 46 amostras de Staphylococcus obtidas de infecções nosocomiais de um hospital universitário da cidade de Recife, Pernambuco, Brasil permitiram observar que a habilidade para formar biofilme nem sempre está associada à presença ou mesmo à transcrição dos genes icaAD, principalmente nos MRS. Diante disso os genes icaAD não constituem marcadores moleculares eficazes para diferenciar isolados produtores de biofilme dos não produtores sendo recomendável associar a detecção molecular dos genes ica com a prova fenotípica de determinação da produção de biofilme. Nossos resultados mostram que o alelo tipo ccrA3 é conservado tanto em S. aureus quanto em SCN sugerindo transferência horizontal entre as amostras. Foi observada uma deleção de aproximadamente 700pb no gene mecR1 apontando para um novo arranjo nessa região em MRSA e MRSCN. Essa alteração ainda não havia sido descrita em isolados de origem hospitalar. A avaliação da relação genética dos isolados revelou grande diversidade entre isolados sensíveis e resistentes com a prevalência de alguns clones dentro do hospital. A diversidade dos perfis encontrados sugere uma origem comunitária das amostras. O conhecimento do perfil fenotípico e molecular das amostras de Staphylococcus obtido no nosso estudo pode contribuir para orientar a conduta terapêutica no tratamento e controle de infecções hospitalares

Orientadores: Florencia Cecilia Menegalli, Paulo Jose do Amaral Sobral / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-07-28T09:12:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Souza_SilviaMariaAlmeidade_D.pdf: 36508055 bytes, checksum: 1f3067443e9a985d4caa016bf46324f9 (MD5) Previous issue date: 2001 / Resumo: Pesquisas sobre filmes comestíveis e biodegradáveis a base de biopolímeros surgiram nos últimos tempos devido à considerações ecológicas, aliadas à necessidade de minimização de resíduos sólidos. Estudos com proteínas miofibrilares de peixe demonstraram a capacidade em formar filmes de propriedades funcionais interessantes. O objetivo desse trabalho foi desenvolver uma formulação a base de proteínas miofibrilares de origem bovina (músculo Semitendinosus). As proteínas miofibrilares foram extraídas pelo método de centrifugação diferencial, em soluções tampão salinas e posteriormente foram liofilizadas e caracterizadas segundo as análises de teor protéico e de lipídeo, granulometria (0,125 mm), umidade e cinzas, identificação das frações protéicas (SDSPAGE), identificação das frações protéicas (aminograma), determinação de isotermas de sorção (25°C) e visualização através de microscopia de varredura. As composições das formulações dos filmes testadas foram calculadas segundo um planejamento experimental fatorial completo de dois níveis (23] com quatro repetições no ponto central, sendo compostas de água destilada, glicerol como plasticizante (50 a 75 g/lOO g proteína), ácido acético como ajustador de pH (2,5 a 3,5), além da proteína (1%). As propriedades funcionais utilizadas para verificar os efeitos dos fatores foram as propriedades mecânicas (força e deformação na ruptura), solubilidade em água, opacidade e permeabilidade ao vapor de água. Com a formulação que apresentou as melhores propriedades funcionais foram estudados, inicialmente, os efeitos da espessura e umidade relativa sobre as propriedades mecânicas força-deformação na ruptura e permeabilidade ao vapor de água ...Observação: O resumo, na íntegra poderá ser visualizado no texto completo da tese digital. / Abstract: Researches on biodegrable and edible films based on biopolymers appeared on the Iast years due to environrnental considerations allied to the necessity of solids waste minimizations. Studies on fish myofibrillar proteins verify this capability on film forming with interesting functional properties. The objective of this work was to develop a formulation based on myofibrillar bovine proteins (Semitendinosus muscle). Myofibrillar proteins were extracted with buffers solutions by differential centrifugation method, and afterwards that material was freeze-dried. Samples were characterized according to protein and lipid content analysis, size (0,125 mm), humidity and ash, identification of proteins ftactions (SDS-PAGE), identification of proteins fractions (aminograms), sorption isotherm determination (25°C) and visualization by scanning electronic microscope. Film formulation solutions were tested according to a complete (23)factory experimental design, with four replications on the central point. The composition of the casting solution 1% protein, distilled water, glycerol as plasticizer (50 to 75 g/lOOg protein), and acetic acid for pH control (2,5 to 3,5). Several functional properties were measured to verify the reference of composition: mechanical properties (force and punction force), solubility in water, opacity and water vapor permeability ...Note: The complete abstract is available with the full electronic digital thesis or dissertations. / Doutorado / Doutor em Engenharia de Alimentos

Orientador: Livia Maria Andalo Tenuta / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Odontologia de Piracicaba / Made available in DSpace on 2018-08-11T10:53:13Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Zamataro_ClaudiaBianchi_M.pdf: 2650038 bytes, checksum: 6be1cd9f989e8bbd7776d722dc3d8f62 (MD5) Previous issue date: 2008 / Resumo: A eficiência anticárie dos dentifrícios fluoretados contendo 1000-1500 µg F/g está bem estabelecida, porém eles têm sido considerados fator de risco para fluorose dental. Para reduzir esse risco, dentifrícios contendo baixa concentração de fluoreto (F) (500-550 µg F/g) têm sido recomendados, mas sua eficiência anticárie ainda não foi demonstrada. Assim, o objetivo deste trabalho foi: 1. comparar a disponibilidade de F na saliva após utilização de dentifrício de baixa concentração de F (BC, 500 µg F/g, NaF), ou dentifrício de concentração convencional (CC, 1100 µg F/g, NaF), seguida ou não de enxágüe; e 2: avaliar in situ o potencial anticariogênico desses dentifrícios, estudando o efeito do F disponível no biofilme dental após a escovação, associado ou não aos produtos formados no esmalte pelo tratamento com os dentifrícios. Em ambos os estudos, foi empregado um delineamento cruzado e duplo cego. No estudo 1, amostras de saliva não estimulada de 5 voluntários foram coletadas antes e imediatamente após a escovação e nos tempos 1, 2, 3, 4, 5, 10, 15, 20, 30, 45 e 60 min após a escovação com BC ou CC, seguida ou não de enxágüe. A área sob a curva da concentração de F na saliva versus tempo foi calculada para determinar a biodisponibilidade de F salivar. Esta foi reduzida em 2,5 x pelo enxágüe pósescovação (p<0,05) e foi semelhante quando BC foi utilizado sem enxágüe e CC foi seguido de enxágüe (p>0,05). No estudo 2, doze voluntários realizaram escovação com dentifrícios contendo concentrações de F distintas (placebo (P) ¿ controle negativo, CC ou BC) e utilizaram um dispositivo palatino contendo blocos de esmalte bovino, previamente tratados ou não com suspensão do respectivo dentifrício. Os blocos foram cobertos com uma placa teste de S. mutans IB 1600 e após 30 min in situ, a placa foi coletada e a concentração de F no fluido foi determinada através de técnica microanalítica com eletrodo íon específico. Um bochecho com sacarose foi realizado como desafio cariogênico e após 45 min os blocos remanescentes e a placa teste foram coletados para avaliação, respectivamente, da perda mineral (simulando o efeito de diferentes espessuras de placa) e da concentração de F no fluido. O pré-tratamento dos blocos de esmalte com os dentifrícios fluoretados isoladamente não impediu a perda mineral em relação ao controle (p>0,05), mas causou aumento na concentração de F no fluido da placa (p<0,05). A escovação com os dentifrícios fluoretados aumentou a concentração de F no fluido da placa, sendo encontrada diferença significativa entre BC e CC (p<0,05), além de uma menor perda mineral em relação ao controle (p<0,05). Adicionalmente, embora a perda mineral tenha sido semelhante para BC e CC na simulação de espessura de placa de até 0,5 mm, ela foi maior para BC na placa mais espessa (1 a 1,5 mm) (p<0,05). Os resultados sugerem que o dentifrício de concentração convencional é mais efetivo do que o de baixa concentração na inibição da perda mineral. Adicionalmente, deve-se estimular o enxágüe da boca após o uso do dentifrício de concentração convencional por crianças de pequena idade / Abstract: The anticaries efficiency of fluoride (F) dentifrices containing 1000-1500 µg F/g is well established, but they are considered a risk factor to dental fluorosis. In order to reduce this risk, low-F concentration dentifrices (500-550 µg F/g) have been recommended, but their anticaries efficiency has not been demonstrated. Thus, this study aimed to: 1. compare salivary F availability after brushing with low- F concentration (LC, 500 µg F/g, NaF) or conventional F concentration (CC, 1100 µg F/g, NaF) dentifrices, followed or not by a water rinse and 2: evaluate in situ the anticaries potential of these dentifrices, studying the anticaries effect of F available on the dental biofilm after brushing, associated or not to F products formed on enamel by F dentifrice application was evaluated. In both studies, a crossover, double blind design was used. In study 1, samples of non-stimulated saliva from 5 volunteers were collected before and immediately after brushing with LC or CC, followed or not by a rinse, and after 1, 2, 3, 4, 5, 10, 15, 20, 30, 45 and 60 min. The area under the curve of salivary F concentration versus time was calculated to determine F bioavailability in saliva. F salivary bioavailability was reduced 2.5 X by the post-brushing rinse (p<0.05) and it was similar when LC was used without rinsing and CC was used followed by a rinse (p>0.05). In study 2, twelve volunteers brushed with dentifrices containing distinct F concentrations (placebo (P) ¿ negative control, LC or CC) and used a palatal appliance containing bovine enamel blocks previously treated or not with a slurry of assigned dentifrice. The blocks were covered with a test plaque from S. mutans IB 1600 and after 30 min in situ, F concentration in the fluid of plaque was assessed. A sucrose rinse was performed as a cariogenic challenge and after 45 min the remaining blocks and plaque test were removed to evaluate, respectively, mineral loss (as a function of plaque thickness) and F concentration in plaque fluid. The isolated effect of the pretreatment of enamel blocks with F dentifrices did not reduced mineral loss when compared to the control (p>0.05), but resulted in higher F concentration in the plaque fluid (p<0.05). Brushing with F dentifrices increased F concentration in the plaque fluid, which was significantly different between LC and CC (p<0.05), and resulted in lower mineral loss when compared to the control (p<0.05). Additionally, although LC and CC did not differ when mineral loss was evaluated on a plaque thickness simulation of up to 0.5 mm, CC was more efficient than LC at thicker plaque (1 to 1.5 mm) (p<0.05). The results suggest that conventional F concentration dentifrice is more efficient than the low-F one in the inhibition of mineral loss. Additionally, post-brushing rinse should be recommended after the use of conventional F concentration dentifrices by young children / Mestrado / Cariologia / Mestre em Odontologia

Orientador : Marcos Antonio Machado / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Biologia / Made available in DSpace on 2018-08-02T09:17:29Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Caldana_Camila_M.pdf: 4777195 bytes, checksum: 3b75b91e6c97233cfc8bb424d04196d2 (MD5) Previous issue date: 2002 / Resumo: Xy/ella fastidiosa é uma bactéria Gram-negativa, limitada ao xilema, responsável por doenças em culturas de grande importância econômica, como a clorose variegada dos citros no Brasil e a doença de Pierce em videira. Devido à colonização de micro ambientes específicos sujeitos a uma forte pressão, supõe-se que a bactéria possua mecanismos de agregação entre células e entre essas e a parede dos vasos colonizados. Tal interação pode estar associada com sua patogenicidade. Assim, este trabalho teve por objetivo a avaliação dos genes diferencialmente expressos de X. fastidiosa em resposta a uma condição de simulação de adesão in vitro, através da análise de "microarrays" e do padrão 2D-PAGE de proteínas. A estirpe 9a Sc foi cultivada nas seguintes condições: bactérias planctônicas (C) x bactérias crescidas em suspensão em meio com lâminas de lenho (S) e C x bactérias aderidas às lâminas de lenho (L). Foram realizadas curvas de crescimento para padronização da fase exponencial, determinada de 4 a 6 dias para C e S e de 6 a 8 dias para L. Para a análises de microarranjos, os experimentos C x S, não foram encontradas diferenças significativa na de expressão no conjunto de genes avaliados. Enquanto em C x L , foram encontrados genes do metabolismo intermediários e componentes estruturais, como os que codificam proteínas de membrana e de transporte. No padrão 2D-PAGE, não foi possível a extração de proteínas das células bacterianas aderidas às lâminas de lenho pela presença de contaminante. Na análise C x S, nós identificamos algumas proteínas diferencialmente expressas, duas proteínas de membrana e uma cisteína-protease, esta última em sua forma funcional, ou seja, sem a porção N-terminal, que parecem estar envolvidas na adesão em outros organismos. Os resultados indicaram novos genes e proteínas que podem estar envolvidas no processo inicial de adesão de X. fastidiosa / Abstract: Xy/ella fastidiosa is a gram-negative and xylem-limited bacterium, which is the causal agent of diseases of several important crops, such as the Citrus Variegated Chlorosis in Brazil and the Pierce's disease in grapevine. Due the colonization in environment under high pressure, it is believed that the bacterium presents mechanisms of aggregation among the cells and between the cells and the wall of the colonized vessels. This interaction appears to be associated with its pathogenicity. This work aimed the evaluation of differentially expressed genes of Xy/ella fastidiosa in response to an in vitro adhesion condition through microarrays and pattern of proteins in 2D-PAGE. The strain 9a5c was grown as a planldonic population (C), planktonic population in medium containing pieces of wood (5), and bacteria adhered to the wood (L). Growth curves were done in order to standardize the exponential growth phase, which was determined to be between 4 and 6 days for C and 5 and between 6 and 8 days for L. In the microarray analysis, 5 did not show any significant difference from C in the expression pattern of the pool of genes evaluated. On the other hand, in the experiment L versus C, we identified genes belonging to the intermediary metabolism and structural components like membrane and transport proteins. For 2D-PAGE, the extraction of proteins from cells adhered to the wood was not possible because of a contaminant present in the preparation. In the analysis of C versus 5, we identified some proteins differentially expressed, two membrane proteins and a cysteine protease without the N-terminal portion (functional form), which seem to be involved in adhesion in other organisms. The results uncovered new genes and proteins that could be involved in the initial process of adhesion of X. fastidiosa / Mestrado / Bioquimica / Mestre em Biologia Funcional e Molecular

Orientadores: Florencia Cecilia Menegalli, Paulo Jose do Amaral Sobral / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-03T14:21:57Z (GMT). No. of bitstreams: 1 TapiaBlacido_DeliaRita_M.pdf: 31081064 bytes, checksum: 2f1098b3f83096d6e8dd07a469915cd0 (MD5) Previous issue date: 2003 / Resumo: Nos últimos vinte anos, as pesquisas dedicadas a desenvolver materiais comestíveis e biodegradáveis, para ser usado como material de embalagem e conservação, a partir de biopolímeros naturais têm-se incrementado grandemente. As proteínas, os lipídeos e os polissacarídeos têm sido usados como agentes formadores do filme. As proteínas e os polissacarídeos são bons materiais formadores do filme, mas apresentam baixa barreira ao vapor de água. Os lipídeos oferecem limitadas propriedades de barreira ao oxigênio devido à presença de poros microscópicos, à elevada solubilidade e difusividade. O objetivo deste trabalho foi elaborar filmes a base de farinha de amaranto usando o glicerol como plastificante. Primeiro, foi determinada a metodologia para produzir farinha de amaranto por moagem úmida. O rendimento na produção de farinha de amaranto foi de 67,46%. A farinha de amaranto apresentou teores de 14,21% de proteínas, 8,27% de lipídeos e 68,17% de amido. Foram estudados os efeitos da concentração de glicerol, do pH da solução filmogênica, da temperatura de processo, da temperatura e da umidade relativa do ar na secagem sobre as propriedades mecânicas dos filmes de farinha de amaranto. Os efeitos destas variáveis foram analisados segundo o planejamento fracionado 2(5-1)e foram determinados os fatores que influem significativamente, os quais depois foram considerados no desenvolvimento de um planejamento experimental completo. As variáveis escolhidas foram a concentração de glicerol, o valor do pH e a temperatura de processo. Os efeitos destas variáveis foram analisadas em função das propriedades dos filmes como: solubilidade, força e deformação no teste de perfuração e tensão, elongação e módulo de Young, no teste de tração. Utilizou-se a metodologia de superficie de resposta para obter a formulação ótima, a qual consistiu em: concentração de glicerol 22,5%, pH 10,7 e temperatura de processo 82°C. Os biofilmes apresentaram uma coloração amarelada, moderada opacidade, alta flexibilidade, baixa resistência e excelente propriedade de barreira ao vapor de água. O processo de desnaturação das proteínas e a presença de lipídeos no filme permitiram obter baixa permeabilidade ao vapor de água quando comparados com filmes de amido e proteína encontrados na literatura. / Abstract: For the last twenty years, research interest into the use of natural biopolymers for manufacturing edible or biodegradable materiaIs for packaging and preservation, has greatly increased. Proteins, lipids and polysaccharides have been used as film-forming agents. Proteins and polysaccharides are good film-former materiaIs, but they are poor moisture barriers. Lipids offer limited oxygen barrier properties, due to the presence of microscopic pores and elevated solubility and diffusivity but provide a better moisture barrier. The aim of this work was to developed amaranth fiour films using glycerol as plasticizer. First, the methodology of production of amaranth fiour by humidity milling was defined. The yield of amaranth fiour was 67.46%. The amanth fiour had 14.21% protein, 8.27% fat and 68.17% starch. The effects of glycerol concentration, pH values of the solution to film formation, temperature of process (heat denaturation), drying temperature and drying air humidity on properties mechanical of amaranth fiour films were evaluated. The effect of these variables was analyzed according to a fractional experimental design 2 (5-1), for determination of the statistically significative factors significative factors. With these factors previously chosen a complete experimental desingn was performed. Glycerol concentration, pH values and process temperature were optimized to obtain low solubility and fiexibIe amaranth fiour films, using an experimental design (response surface methodology). The effect of these variables was investigated at film formation conditions analyzing the final properties of the films as solubility, puncture strength, puncture deformation, tensile strength, elongation and modulus of Young. The optimum conditions were reached at 22.5% glycerol, pH 10.7 and 82°C. The biofilms presented a yellowish color, moderate opacity and high fiexibility but low tensile strength. The denaturation of proteins and lipid presence improved water vapor permeability of amaranth fiour films compared to that of other protein and polysaccharide films. / Mestrado / Mestre em Engenharia de Alimentos

Orientadores: Florencia Cecilia Menegalli, Paulo Jose do Amaral Sobral / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-03T21:41:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Colla_Eliane_M.pdf: 8066515 bytes, checksum: c4a6afd68d412edccfe167bd6c79c62d (MD5) Previous issue date: 2004 / Mestrado / Mestre em Engenharia de Alimentos

Orientador : Adilma Regina Pippa Scamparini / Tese (doutorado) - Universidade Estadual de Campinas, Faculdade de Engenharia de Alimentos / Made available in DSpace on 2018-08-03T23:18:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Santos_PricilaVeigados_D.pdf: 34846405 bytes, checksum: ab4909bd78937c989f8dcee238896959 (MD5) Previous issue date: 2004 / Doutorado