Made available in DSpace on 2016-01-07T13:39:49Z (GMT). No. of bitstreams: 2 nilceia_ramos_ioc_2014.pdf: 985413 bytes, checksum: d50610d797598fa42cb546cf07dafa32 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2015-04-14 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O gênero Klebsiella compreende bactérias em forma de bastonete, gram-negativas e imóveis que pertencem à família Enterobacteriaceae. As espécies Klebsiella pneumoniae e Klebsiella oxytoca, patógenos oportunistas, são as mais importantes, sob o ponto de vista da clínica. Estas espécies têm sido relacionadas a um número crescente de infecções hospitalares multirresistentes. K. pneumoniae é classificada em três grupos filogenéticos: KpI, KpII e KpIII e os genes que codificam as \03B2-lactamases de classe A cromossômicas SHV, OKP e LEN, estão relacionadas à estes grupos, respectivamente. Da mesma forma, o gene blaOXY codifica a \03B2\2013lactamase de classe A cromossômica que caracteriza a espécie K. oxytoca. blaSHV é um gene cromossômico e plasmidial que codifica \03B2\2013lactamases de espectro restrito (NSBLs) e estendido (ESBL). Até o momento, 183 alelos de blaSHV foram identificados, mas o espectro de atividade de vários destes alelos ainda não foi determinado. As \03B2-lactamases LEN são codificadas em cromossomos e são NSBLs. Recentemente a espécie K. variicola foi identificada. Esta espécie se caracteriza pela fixação de nitrogênio e nenhum gene constitutivo de \03B2-lactamase foi associado à esta espécie. Este estudo objetivou determinar o espectro de resistência de alelos de blaSHV identificados em K. pneumoniae e também identificar, em nível de espécie, isolados carreadores do gene blaLEN. Por PCR e sequenciamento, alelos de blaSHV e blaLEN foram definidos comparando suas sequências com bancos de dados usando as ferramentas blastN e blastP Estes genes foram clonados e expressos em sistema heterólogo, e o espectro de resistência dos transformantes foi avaliado. A taxonomia genômica dos isolados deste gênero foi realizada com base em sequências de genes recuperados de genomas de espécies de Klebsiella e aplicou-se as abordagens MLSA, rMLST e cgMLST. Identificamos blaSHV-28 (n=2), blaSHV-110 (n=1) e alelos novos de blaSHV (n=3). Os transformantes para estes genes apresentaram resistência à amoxicilina, ampicilina e piperacilina, o que corresponde a um espectro restrito de resistência. Quanto a blaLEN, foram identificados oito novos alelos em nove isolados. Dois deles eram idênticos aos encontrados no genoma de K. variicola AT-22 e todos estes alelos codificam NSBLs. A taxonomia genômica de Klebsiella definiu três grupos: K. variicola, K. pneumoniae e K.oxytoca. Curiosamente, alguns isolados de K. pneumoniae agruparam com o K. variicola AT-22, sugerindo pertencerem à esta espécie. Todos os isolados do grupo K. variicola albergavam o gene blaLEN indicando que esta seria a \03B2-lactamase constitutiva de K. variicola, e, por conseguinte, que o grupo KpIII é composto por isolados de K. variicola. Aqui nós determinamos que alelos de blaSHV cromossômicos, incluindo blaSHV-28 e blaSHV-110, previamente identificados como ESBLs, são NSBLs e concluímos que K. variicola pode estar sendo subestimada em infecções humanas / The genus Klebsiella comprises non - motile, g ra m - negative, rod - shaped bacteria, presenting a polysaccharide - based capsule, belonging to the Enterobacteriaceae family. The two most clinically i mport ant species from the genus are the opportunistic pathogens Klebsiella pneumoniae and Klebsiella oxytoca . These species have been related to an increasing number of multiresistant hospital - acquired infections. K. pneumoniae is classified into three phylogen etic groups: KpI, KpII and KpIII. Three chromosomal class A β - lactamase genes were recognized in K pneumoniae : bla SHV , bla OKP and bla LEN , which are related to KpI, KpII and KpIII groups, respectively. Similarly, the bla OXY gene is the chromosomal class A β - lactamase that characterizes the K. oxytoca species. The bla SHV is a chromosomal - and plasmid - borne gene encoding narrow (NSBLs) and extended spectrum β - lactamases (ESBLs). So far, 183 bla SHV alleles were identified but the activity spectrum of dozen of a lleles remain to be determined. LEN enzymes are chromosomal encoded with restrict activity against β - lactams and confers resistance only to penicillins. More recently, K. variicola species were identified and this species has the ability of fixing nitrogen . There are few studies concerning this species and no constitutive β - lactamase gene has been described in this species. This study aimed to determine the resistance spectrum of bla SHV alleles identified in K. pneumoniae strains and also to identify, at sp ecies level, strains carrying bla LEN chromosomal class A β - lactamase gene. PCR and sequencing were performed and bla SHV , and bla LEN alleles were determined by comparing their sequences with the database using blastN and blastP tools. These genes were clone d and expressed in a heterologous system, and the antibiotic resistance spectrum of the transformants was evaluated by susceptibility test. The genomic taxonomy of strains from this genus were performed based on genes from draft and complete genome sequenc es from Klebsiella species using MLSA, rMLST and cgMLST approaches. Strains harboring bla SHV - 28 (n=2), bla SHV - 110 (n=1) and new bla SHV alleles (n=3) were identified. All the transformants showed resistance to amoxicillin, ampicillin, piperacill in, ticarcil lin , which correspond to a restricted spectrum of resistance. Concerning bla LEN alleles, here were identified eight new alleles in nine strains. Two of them were identical to the one found in K. variicola AT - 22 genome. The antibiotic resistance profile pre sented by the transformants indicated that all these bla LEN alleles encode for NSBLs. The Klebsiella genomic taxonomy revealed three groups corresponding to K. variicola , K. pneumoniae and K. oxytoca species. Curiously, some K. pneumoniae grouped with the K. variicola AT - 22, suggesting that those strains, in fact, belong to K. variicola species and had been misidentified as K. pneumoniae . Moreover, it was observed that all strains from K. variicola cluster harbored the bla LEN gene. This finding indicated th at the bla LEN gene is a constitutive K. variicola β - lactamase, and therefore, the KpIII group is composed by K. variicola strains. Here we determined that different chromosomal bla SHV alleles, including bla SHV - 28 e bla SHV - 110 , previously labeled as ESBLs, and the new ones, are NSBLs. Also, we concluded th at K. variicola can play an underestimated role in human infections .

Submitted by Angelo Silva (asilva@icict.fiocruz.br) on 2016-07-20T13:39:17Z No. of bitstreams: 2 license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) 71861.pdf: 5007629 bytes, checksum: 55da00139dd89620d62ea58fe070c552 (MD5) / Approved for entry into archive by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2016-07-28T16:45:07Z (GMT) No. of bitstreams: 2 71861.pdf: 5007629 bytes, checksum: 55da00139dd89620d62ea58fe070c552 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-07-28T16:45:07Z (GMT). No. of bitstreams: 2 71861.pdf: 5007629 bytes, checksum: 55da00139dd89620d62ea58fe070c552 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2016 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / O vírus dengue infecta um número estimado de 50-100 milhões de pessoas 100 milhões de pessoas anualmente em todo o mundo e no Brasil, dengue foi relatada pela primeira vez em 1981, desde então, a infecção tornou-se hiper-endêmica. As práticas atuais de diagnóstico não detectam o vírus em cerca de 50% dos casos suspeitos. Metagenômica é uma estratégia que pode ser aplicada na identificação de qualquer organismo em uma amostra, uma vez que recupera sequências de ácidos nucléicos que são analisadas contra bases de dados. Neste estudo, o nosso objetivo foi aplicar abordagens de metagenômica para analisar casos fatais de pacientes que apresentaram sintomas similares a dengue, mas com teste negativo para este vírus e também amostras de pacientes com suspeita febre amarela. e também amostras de pacientes com suspeita febre amarela. e também amostras de pacientes com suspeita de febre amarela. DNA e RNA genômico foram extraídos, amplificados com iniciadores randômicos e processados no sequenciador Illumina HiSeq2500. Em seguida, aplicamos um pipeline de bioinformática para filtragem de sequências de baixa qualidade e remoção de sequências humanas. Vários programas foram utilizados para classificar as reads metagenômicas: Kraken, GOTTCHA, SURPI, Metaphlan2, Taxoner e Blastn. As análises in silico identificaram patógenos que foram posteriormente confirmados por ensaios in vitro aplicando reagentes específicos Deste modo, identificamos vírus e bactérias em 13% das amostras. Quatro desses vírus, com potencial de patogenicidade estavam em amostras distintas: Parvovírus B19, vírus da Hepatite A, vírus da Hepatite G e vírus Torque-teno. Todos eles, com exceção do vírus da Hepatite A estavam nos casos fatais. As bactérias identificadas foram N. meningitidis do serogrupo C em duas amostras e S. pneumoniae em duas outras amostras. Esses são patógenos que causam surtos e epidemias no Brasil e têm alta taxa de mortalidade. Particularmente, N. meningiditis sorogrupo C é o determinante de surtos atuais de N. meningiditis no Brasil. Além disso, dois genomas completos foram recuperados, o do Parvovírus B19 de um dos casos fatais (5,6 kb) e o do vírus Chikungunya (12 kb) que estava presente na amostra utilizada como controle positivo para as análises de metagenômica. Aqui, podemos demonstrar a aplicabilidade da metagenômica tanto na identificação quanto recuperação de genomas completos de patógenos a partir de amostras clínicas humanas / Dengue virus infects an estimated 50-100 million people annually worldwide and in Brazil, dengue was first reported in 1981, since then the infection became hyper-endemic. The current diagnostic practices cannot detect the virus around 50% of suspected cases. Metagenomic is a strategy that can be applied to recover any organism in a sample. In this study, our aim was to apply metagenomics approaches to analyse fatal cases of patients presenting dengue-like symptoms, but testing negative for this virus and samples of patients with suspect yellow fever. Genomic DNA and RNA were extracted, amplified with random primers and sequenced in the Illumina HiSeq2500 sequencer. We then followed a bioinformatics filtering pipeline to remove both low-quality sequences and human sequences. Several tools were used to classify the metagenome reads: Kraken, GOTTCHA, SURPI, Metaphlan2, Taxoner and Blastn. The in silico analysis identified pathogens that were further confirmed by in vitro assays applying specific reagents. In this way, we were able to detect viruses and bacteria in 13% of the samples Four viruses, with pathogenicity potential were identified in distinct samples: Parvovirus B19, Hepatitis A virus, Hepatitis G virus and Torque-teno virus. All of them, except Hepatitis A virus were present in fatal cases. The Parvovirus B19 is in fact a pathogen that has been eventually associated to fatal cases. The bacteria identified were N. meningitides serogroup C in two samples and S. pneumoniae in two other samples. Those are pathogens that cause outbreaks and epidemics in Brazil and have high mortality rate. Particularly, N. meningiditis outbreaks in Brazil. Moreover, two complete genomes were recovered, the B19V from one of the fatal cases (5.6 kb) and the Chikungunya virus (12 kb) that was in the sample used as a positive control to the metagenomics approach. Here, we demonstrated th applicability of metagenomics in both the identification and recovery of complete genomes of pathogens from human clinical samples

Made available in DSpace on 2015-09-17T15:24:33Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2014-11-14. Added 1 bitstream(s) on 2015-09-17T15:47:39Z : No. of bitstreams: 1 000845681_20151210.pdf: 189961 bytes, checksum: 626ba3afd7d4464a91e4d466ac13aa2d (MD5) Bitstreams deleted on 2015-12-11T11:22:36Z: 000845681_20151210.pdf,. Added 1 bitstream(s) on 2015-12-11T11:23:15Z : No. of bitstreams: 1 000845681.pdf: 755600 bytes, checksum: c43874dde055a455b691f7d4b7308f0d (MD5) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A seção Setacea foi reconhecida como grupo monofilético na revisão recente da ordem Batrachospermales. Porém, seu status taxonômico não pode ser determinado, porque posicionou-se dentro do grupo denominado Australasica, composto por táxons da Austrália e Nova Zelândia. Estudos anteriores combinando dados moleculares e morfológicos enfocaram apenas as relações filogenéticas entre os grupos maiores (gêneros ou seções) e abordagens visando avaliar o número de espécies só foram iniciadas muito recentemente e são ainda escassas e baseadas em poucas amostras. Dessa maneira, as seguintes hipóteses foram testadas neste estudo: 1) a seção Setacea do gênero Batrachospermum constitui grupo monofilético dentro da ordem Batrachospermales; o reconhecimento desse grupo associado ao fato de Batrachospermum ser parafilético poderá resultar na elevação desta seção para um nível superior (possivelmente um gênero); 2) as espécies atualmente reconhecidas na seção com base em caracteres morfológicos serão confirmadas pelos dados moleculares; além dessas espécies, outras (particularmente espécies crípticas) deverão ser encontradas e reconhecidas dentro da seção. Este estudo teve como objetivos: 1) inferir as relações filogenéticas da seção Setacea com os outros grupos (gêneros e seções) da ordem Batrachospermales, bem como os limites de variação inter e intra-específica das espécies dentro da seção, com base na análise das sequências do gene rbcL e da região de barcode do gene cox1; 2) elaborar estudo de revisão para a seção Setacea por meio da reavaliação dos caracteres taxonômicos diagnósticos para espécies deste grupo, à luz dos novos dados moleculares. Foram analisadas 15 amostras, sendo 13 provenientes das regiões sul e sudeste do Brasil, uma do Japão e outra da Espanha. Os espécimes foram coletados em águas com temperaturas baixas a moderadas, ligeiramente ácidas a neutras, agitadas.. / Section Setacea of the genus Batrachospermum was recognized as a monophyletic group in a recent revision of the order Batrachospermales. However, its taxonomic status was not clearly determined because it was positioned within a group named Australasica composed by taxa from Australia and New Zealand. Previous studies combining molecular and morphological data focused only on the phylogenetic relationships among the major groups (genera or sections), whereas approches aiming to evaluate the number of species were initiated just recently and are still scarce and poorly sampled. Based on this background, the following hypotheses were tested in this study: 1) the section Setacea represents a monophyletic group within the order Batrachospermales; the recognition of the group associated to the fact that the genus Batrachospermum is paraphyletic could result in the raising of the section to a higher taxonomic level (possibly genus); 2) the species presently recognized in the section based on morphological characters will be confirmed by molecular evidence; in addition, other species (particularly cryptic species) are expected to be found and recognized within the section.This study aimed to: 1) infer the phylogenetic relationships of section Setacea with other groups (genera and sections) of the Batrachospermales, as well as the inter and intra-specific limits of variation for the species within the section based on sequence analysis for the rbcL and cox1 barcode region: 2) elaborate a revisionary study by reevaluating the diagnostic taxonomic characters for the species of the sectionin the light of the new molecular data. Fifteen samples were analyzed, thirteen from southern and southeastern Brazil and two from other continents (Asia - Japan; Europe - Spain). The specimens were collected in waters with low to moderate temperatures, slightly acidic, turbulent and mean to moderate oxygen concentrations (oligotrophic and oligosaprobic... / FAPESP: 2012/20134-9 / FAPESP: 2013/03031-4 / FAPESP: 2012/12016-6

Made available in DSpace on 2016-03-15T19:37:42Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jorge Alexandre Alexiou.pdf: 1540498 bytes, checksum: a39add8dab794fcc7ac6b5962e375ff6 (MD5) Previous issue date: 2012-02-07 / This study aimed to compare the product identification technologies; Barcode and Radio Frequency Identification (RFID), in its use in a retail operation from the standpoint of the suitability and performance of supply chain processes in use. The study presents a proposal for a technology assessment based on the development of a computational model as a tool for comparing the performance of these technologies in business processes. A simulator have been developed based on the model for the process of the checkout line at the store, looking at various scenarios such as number of items per customer in the queue, delay in opening the checkout and identification technology used. The performance of both identification technologies was assessed in relation to the customer waiting time and queue length. We also analyzed the percentage of withdrawal (or abandon) of the queue by the client and the financial impact of this abandon was evaluated for various scenarios of average price of items purchased. The results show that the use of RFID tags can both reduce the customer waiting time and queue length in the checkout and have an important effect in reducing the loss of revenue caused by the abandon of the customer. Based on these results we propose the further development of the simulator in order to study the impact of the adoption of RFID in other processes. / Este estudo teve como objetivo comparar as tecnologias de identificação de produtos: Código de Barras (Barcode) e Identificação por Radiofrequência (RFID), em sua utilização numa operação de varejo do ponto de vista da adequação e desempenho dos processos da cadeia de suprimentos em que são utilizadas. O estudo apresenta uma proposta de avaliação das tecnologias baseada no desenvolvimento de um modelo computacional como ferramenta para a comparação de desempenho destas tecnologias nos processos de negócio. Um simulador foi desenvolvido com base no modelo para o processo de fila do caixa da loja, contemplando diversos cenários de quantidade de itens por cliente na fila, atraso na abertura do caixa e tecnologia de identificação. O desempenho de ambas as tecnologias de identificação foi avaliado em relação ao tempo de espera do cliente na fila e o comprimento da mesma. Também foi avaliada a porcentagem de abandono (ou desistência) da fila por parte do cliente bem como de seu impacto financeiro. Foram considerados diversos cenários de preço médio dos itens adquiridos. Os resultados mostram que a utilização de etiquetas RFID pode, além de reduzir o tempo de espera do cliente e o comprimento da fila no caixa, ter um efeito importante na redução da perda de receita causado pela desistência do cliente. Com base nestes resultados propomos a continuidade do desenvolvimento do simulador de forma de estudar o impacto da adoção da Identificação por Radiofrequência nos demais processos.

A sistemática de Cnidaria Anthozoa foi revisada inúmeras vezes e por vários autores, sendo que os Ceriantharia sempre foram avaliados através de dados clássicos e muito pretéritos. O clado Ceriantharia, uma ordem dentre Hexacorallia, apresenta muitos caracteres dúbios e que poderiam colocar os animais em várias posições sistemáticas dentre Cnidaria. Ainda, as revisões de Ceriantharia são sempre derivadas de análises das mesmas espécies, principalmente do Mar Mediterrâneo. O presente trabalho tem como enfoque a discussão dos caracteres taxonômicos (morfológicos e moleculares) de Ceriantharia, sua posição sistemática, levantamento taxonômico de áreas no Oceano Atlântico praticamente inexploradas para o grupo e aspectos da biologia das espécies encontradas. Os resultados apontam para uma nova posição sistemática de Ceriantharia, levando o grupo à base de Anthozoa e como um ramo independente. A utilização de dados moleculares evidenciou o vigor do emprego de DNA barcoding na zoologia comparada de Ceriantharia. Aspectos de especiação e de revisão sistemática resultaram pelas análises moleculares. Ao mesmo tempo, os dados morfológicos são extremamente confusos e muito do que foi utilizado como caractere de delimitação de espécies pela tradição de se assumir homologias com Actiniaria é, aparentemente, inconsistente. O ciclo de vida de Isarachnanthus noturnus foi verificado, sendo que o seu estágio jovem, planctônico, e de dispersão é de longa duração. Dados sobre regeneração em pólipos também foi verificada e com a constatação de mecanismos divergentes entre as espécies. / The Cnidaria Anthozoa systematics was revised several times by a number of authors, and the Ceriantharia always evaluated using very classical and ancient data. The Ceriantharia clade, an Hexacorallia order, has many dubious characters that could place the animals in various systematic positions within Cnidaria. Also, the Ceriantharia reviews are always derived from analysis of the same species, mainly from the Mediterranean Sea. This work focuses on the discussion of taxonomic characters (morphological and molecular) of Ceriantharia, the systematic position, taxonomic survey of virtually unexplored Atlantic Ocean areas for the group and the biology of the observed species. The results suggest a new systematic position of Ceriantharia placing the group at the basis of Anthozoa and as an independent branch. The molecular data comparison showed the force of DNA barcoding use in Ceriantharia comparative zoology. The molecular data allowed the discussion of several aspects of speciation and systematics. At the same time, the morphological data are extremely confusing and much of it was used as delimiting species character by the tradition of assuming homologies with Actiniaria is, apparently, inconsistent. The life cycle of Isarachnanthus noturnus was observed, and the young, planktonic and dispersal stage is long-lived. Data on regeneration of polyps was also verified with the observation that mechanisms differ between species.

A utilização de códigos QR por deficientes visuais e robôs expande o horizonte de emprego dessa tecnologia e viabiliza várias aplicações cogitadas por um número crescente de trabalhos acadêmicos. Para que os códigos QR possam ser decodificados eles precisam ser apropriadamente enquadrados. A detecção desses símbolos em imagens adquiridas ao acaso é a primeira etapa na construção de um sistema de enquadramento assistido. O presente trabalho apresenta uma proposta para a detecção de códigos QR em imagens adquiridas ao acaso. A abordagem proposta é baseada em componentes e dividida em estágios, nos quais primeiramente partes do símbolo são detectadas através da técnica de detecção rápida de objetos proposta por Viola-Jones e em seguida uma análise do conjunto formado por essas partes é realizada para determinar a localização exata do símbolo na cena. A adaptação da técnica proposta por Viola e Jones para esse novo domínio é descrita e detalhada. É realizada uma discussão sobre a influência dos muitos parâmetros de treinamento e detecção presentes na abordagem proposta com base em resultados experimentais detalhados. Por fim é apresentado o desempenho em termos da qualidade dos resultados e tempo de processamento em vídeo e conclui-se que a abordagem proposta aponta um caminho promissor na resolução do problema de detecção de códigos QR em imagens adquiridas arbitrariamente na maioria das situações práticas. / The use of QR codes by visually impaired people and robots expands the applications of this technology and enables many possibilities that are emerging in a crescent number of scientific papers. QR code decoding relies on prior framing of the symbol during image acquisition. The detection of these symbols is the first step in the construction of a system to assist the framing process. This work presents an approach for the detection of QR codes in arbitrarily acquired images. The proposed approach is a component-based one consisting of two stages, where parts of the symbol are first detected through the fast object detection method proposed by Viola-Jones, and then an analysis of the set of detected parts is carried subsequently in order to determine the exact location of the symbol in the scene.The adaptation of the framework proposed by Viola-Jones for this new application domain is described in detail. The influence of various training and detection parameters of the framework in QR code detection is discussed using a series of experiments. The performance of the proposed approach is presented in terms of result quality and processing time and it is concluded that the proposed approach indicates a promising direction in solving the problem of detecting QR codes in arbitrarily acquired images in the majority of real world situations.

Este trabalho foi realizado no período de 06 de abril de 2004 a 21 de julho de 2004, com o objetivo de descrever a estrutura e funcionamento do sistema informatizado para controle da dispensação de medicamentos na Divisão de Assistência Farmacêutica do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo, bem como avaliar os resultados obtidos com a sua implantação em relação aos serviços de enfermagem e farmacêutico. Foi aplicado um formulário padronizado a 58 enfermeiros, 10 farmacêuticos e 15 auxiliares de farmacêutico que participaram da fase de estruturação, para avaliar a sua opinião quanto aos aspectos relativos à requisição de medicamentos, à forma de apresentação dos medicamentos dispensados pela farmácia hospitalar e à operacionalização do sistema. Como resultados observou-se que para estes profissionais, as principais vantagens obtidas foram: a eliminação da transcrição manual para requisição do medicamento prescrito, a rapidez, a melhor identificação das doses prescritas pelo médico, a embalagem dos medicamentos contendo toda a identificação necessária e a conferência do medicamento requisitado e dispensado através da leitura óptica do código de barras. Os resultados deste estudo permitiram-nos concluir que a grande maioria dos entrevistados considerou o sistema informatizado de dispensação de medicamentos de boa qualidade. A análise dos dados aqui descritos, embora possa não englobar algumas dimensões importantes na busca de uma terapia medicamentosa mais racional, forneceu subsídios que podem contribuir para a expansão e o aperfeiçoamento do sistema, visando dar suporte à realização de estudos de utilização de medicamentos e proporcionar novas perspectivas de trabalho e produtividade. / The present study was conducted from April 6 to July 21, 2004 with the objective of describing the structure and functioning of the informatized system for the control of the delivery of medications at the Division of Pharmaceutical Assistance of the University Hospital, Faculty of Medicine of Ribeirão Preto, University of São Paulo, and to assess the results obtained with its implantation regarding the nursing and pharmaceutical services. A standardized form was distributed to 58 nurses, 10 pharmacists and 15 pharmacist assistants who participated in the structuring phase in order to obtain their opinion regarding the requisition of medications, the form of presentation of the medications distributed by the hospital pharmacy, and the operationalization of the system. As a result, we observed that according to these professionals, the major advantages of the system are: the elimination of manual transcription for the requisition of the prescribed medication, the rapidity, the better identification of the doses prescribed by the doctors, the packaging of the medications containing all the necessary identification, and the verification of the requisitioned and distributed medication by optic reading of the bar code. The data collected in this study permitted us to conclude that most of the persons interviewed consider the system of distribution of medications to be of good quality. Analysis of the data reported here, although it may not involve some important dimensions for the search of a more rational medicamentous treatment, provides information that might contribute to the expansion and refining of the system, also providing support for the execution of studies on the use of medications and opening new perspectives of work and productivity.

Este trabalho foi realizado no período de 06 de abril de 2004 a 21 de julho de 2004, com o objetivo de descrever a estrutura e funcionamento do sistema informatizado para controle da dispensação de medicamentos na Divisão de Assistência Farmacêutica do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto da Universidade de São Paulo, bem como avaliar os resultados obtidos com a sua implantação em relação aos serviços de enfermagem e farmacêutico. Foi aplicado um formulário padronizado a 58 enfermeiros, 10 farmacêuticos e 15 auxiliares de farmacêutico que participaram da fase de estruturação, para avaliar a sua opinião quanto aos aspectos relativos à requisição de medicamentos, à forma de apresentação dos medicamentos dispensados pela farmácia hospitalar e à operacionalização do sistema. Como resultados observou-se que para estes profissionais, as principais vantagens obtidas foram: a eliminação da transcrição manual para requisição do medicamento prescrito, a rapidez, a melhor identificação das doses prescritas pelo médico, a embalagem dos medicamentos contendo toda a identificação necessária e a conferência do medicamento requisitado e dispensado através da leitura óptica do código de barras. Os resultados deste estudo permitiram-nos concluir que a grande maioria dos entrevistados considerou o sistema informatizado de dispensação de medicamentos de boa qualidade. A análise dos dados aqui descritos, embora possa não englobar algumas dimensões importantes na busca de uma terapia medicamentosa mais racional, forneceu subsídios que podem contribuir para a expansão e o aperfeiçoamento do sistema, visando dar suporte à realização de estudos de utilização de medicamentos e proporcionar novas perspectivas de trabalho e produtividade. / The present study was conducted from April 6 to July 21, 2004 with the objective of describing the structure and functioning of the informatized system for the control of the delivery of medications at the Division of Pharmaceutical Assistance of the University Hospital, Faculty of Medicine of Ribeirão Preto, University of São Paulo, and to assess the results obtained with its implantation regarding the nursing and pharmaceutical services. A standardized form was distributed to 58 nurses, 10 pharmacists and 15 pharmacist assistants who participated in the structuring phase in order to obtain their opinion regarding the requisition of medications, the form of presentation of the medications distributed by the hospital pharmacy, and the operationalization of the system. As a result, we observed that according to these professionals, the major advantages of the system are: the elimination of manual transcription for the requisition of the prescribed medication, the rapidity, the better identification of the doses prescribed by the doctors, the packaging of the medications containing all the necessary identification, and the verification of the requisitioned and distributed medication by optic reading of the bar code. The data collected in this study permitted us to conclude that most of the persons interviewed consider the system of distribution of medications to be of good quality. Analysis of the data reported here, although it may not involve some important dimensions for the search of a more rational medicamentous treatment, provides information that might contribute to the expansion and refining of the system, also providing support for the execution of studies on the use of medications and opening new perspectives of work and productivity.

Submitted by SAMARA AZEVEDO DE OLIVEIRA null (samaranematologia@gmail.com) on 2016-01-26T15:36:11Z No. of bitstreams: 1 Oliveira, S.A. Dissertação._pdf: 2425906 bytes, checksum: e8dd0c0a0c5a8d3577dc7b76b4e8f071 (MD5) / Approved for entry into archive by Juliano Benedito Ferreira (julianoferreira@reitoria.unesp.br) on 2016-01-28T17:15:59Z (GMT) No. of bitstreams: 1 oliveira_sa_me_bot.pdf: 2425906 bytes, checksum: e8dd0c0a0c5a8d3577dc7b76b4e8f071 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-28T17:16:00Z (GMT). No. of bitstreams: 1 oliveira_sa_me_bot.pdf: 2425906 bytes, checksum: e8dd0c0a0c5a8d3577dc7b76b4e8f071 (MD5) Previous issue date: 2015-12-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / O cultivo de gramas no Brasil está em expansão. O maior mercado consumidor de gramados é a indústria do esporte, principalmente campos de futebol e golfe. A qualidade do gramado nessas áreas esportivas é fundamental, principalmente quando se trata de campos de golfe, nos quais, qualquer imperfeição pode prejudicar o resultado do jogo. Os nematoides parasitos de plantas do gênero Meloidogyne, também conhecidos como nematoides formadores de galhas, são considerados os de maior importância econômica devido à intensidade dos danos que causam às plantas cultivadas. As principais espécies associadas às gramas em campos de golfe são M. graminicola, M. graminis, M. marylandi, M. naasi, M. minor e M. sasseri. No Brasil, a ocorrência de espécies de Meloidogyne associadas a gramas restringe-se aos relatos de Meloidogyne sp. em raízes de grama esmeralda (Zoysia japonica) no Estado do Paraná e M. graminicola em raízes de arroz irrigado no Rio Grande do Sul e Santa Catarina. No ano de 2006, a espécie M. graminis foi detectada pela primeira vez na América do Sul, parasitando raízes de grama Tifdwarf bermuda em campo de golfe na Venezuela. Até o momento esta espécie ainda não foi relatada no Brasil. Assim, o objetivo foi identificar o nematoide das galhas encontrado parasitando raízes de gramas de campos de golfe no Estado de São Paulo. Visando a correta diagnose dessa espécie, foram realizados estudos detalhados englobando o conceito de taxonomia integrativa, que incluiu estudos de morfologia, morfometria, biologia, estudos bioquímicos, moleculares e filogenéticos. Todas as análises realizadas confirmaram que a espécie presente nos campos de golfe das cidades de Araras e São Paulo - SP trata-se de M. graminis, que caracteriza o primeiro relato desta espécie no Brasil. / Currently, the grasses growing in Brazil is expanding. The biggest consumer market for lawns is the industry of sports, especially football and golf courses. The quality of the lawn in these sports areas is crucial, especially when it comes to golf courses, where any imperfection can prejudice the outcome of the game. The nematode parasites of plants of the genus Meloidogyne, also known the root-knot nematodes, are considered the most economically important because of the intensity of the damage they cause to crops. The main species associated with grasses on golf courses are M. graminicola, M. graminis, M. marylandi, M. naasi, M. minor and M.sasseri. In Brazil Meloidogyne sp. has been reported in esmerald grass roots (Zoysia japonica) in the State of Paraná. The species M. graminicola was detected in rice roots in Rio Grande do Sul and Santa Catarina. In 2006 the species M. graminis, was first detected in South America parasitizing grass roots Tifdwarf shorts on golf course in Venezuela. So far this species has not been reported in Brazil. The objective of this project is to identify the root-knot nematodes found parasitizing roots of grasses of golf courses in the state of Sao Paulo. For this were carried out detailed studies of integrative taxonomy, including morphological and morphometric studies, biology, biochemical, molecular and phylogenetic. All analyzes have confirmed that the species in golf courses in São Paulo state is M. graminis, that characterized the first report of the species in Brazil.

Introdução: A área Hospitalar vem sofrendo constantes mudanças organizacionais devido à introdução de novas tecnologias que incentivam a segurança do paciente. Aquelas aplicadas à distribuição de medicamentos podem abreviar o número de erros de distribuição, obter em tempo real um elevado nível de informação sobre todo processo e gerir melhor o tempo do profissional farmacêutico, de forma a aumentar a intervenção deste na prevenção de erros de medicações e consequentemente, os cuidados farmacêuticos ao doente internado. Objetivos: Avaliar o impacto da implantação de novas tecnologias que visam à maior segurança do paciente em um sistema de distribuição de medicamentos de um hospital universitário. A avaliação foi dividida em: 1) individualização de medicamentos por reembalagem, com o uso de código de barras na identificação dos medicamentos; 2) identificação dos pontos críticos no novo processo estabelecido para o Sistema de Distribuição de Medicamentos por Prescrição Individual; 3) identificação e análise de erros de medicação após implantação de sistema de controle por código de barras. Métodos: Foram realizados estudos de delineamento transversal. Para a avaliação do processo de individualização foi desenvolvido um instrumento de avaliação adaptado de recomendações internacionais e estudos anteriores, segundo as boas práticas de reembalagem. Aplicou-se o instrumento de avaliação na rotina escrita e, por meio da técnica de observação participante, verificou-se a adequação de sua execução, conforme o mesmo instrumento. Para a identificação dos pontos críticos do Sistema de Distribuição de Medicamentos foi analisada cada etapa e verificado onde poderia ocorrer erros de medicação. Para a avaliação do processo de Distribuição de Medicamentos por Prescrição Individualizada foi realizado um estudo transversal, no qual utilizou-se a técnica de observação participante e amostragem por conveniência. Foram avaliadas prescrições médicas vinculadas ao Sistema de Distribuição de Medicamentos por Prescrição Individualizada pela tecnologia do código de barras. Resultados: Para avaliação do processo de individualização foi observado o fracionamento de 42 formas farmacêuticas orais e injetáveis onde a rotina escrita do processo de individualização atendeu a 66% dos itens recomendados e a execução da mesma atendeu a 63%. Para a avaliação do processo de Distribuição de Medicamentos por Prescrição Individualizada foram analisadas 290 prescrições médicas vinculadas ao Sistema de Distribuição de Medicamentos por Prescrição Individualizada, destas, 25% apresentaram algum tipo de erro de medicação. O total de itens analisados foi de 2659, com 74 ocorrências de erros de medicação (2,78%). Comparados com os dados anteriores o número de erros por clínica ou em geral teve uma redução estatisticamente significativa. Conclusões: Os resultados obtidos mostram que a utilização de novas tecnologias aumenta a qualidade do serviço prestado prevenindo erros de medicação. Portanto, o sistema de leitura por códigos de barras, associado a mudanças na infra-estrutura e nos processos de trabalho, podem ser apontados como os principais fatores na diminuição nas taxas de erros de dispensação de medicamentos no hospital estudado. / Introduction: The field hospital has been undergoing constant organizational changes due to the introduction of new technologies that encourage patient safety. Those applied to the distribution of drugs can shorten the number of errors distribution, obtain real-time a high level of information about every process and better manage the time of the pharmacist in order to increase the intervention of the prevention of medication errors. A previous study found problems in the repackaging and an average of about 14% of medication errors in Distribution System for Prescription Drugs traveler at a university hospital. Objectives: To evaluate the impact of deployment of new technologies to the largest patient safety in a system of distribution of drugs in a university hospital. The evaluation was divided into: 1) individualization of medication by repackaging, using bar code identification of drugs, 2) identification of critical points in the new process established for the Distribution System for Prescription Drugs traveler, 3) identification and analysis of medication errors after implementation of control system by bar code. Methods: We performed cross-sectional studies. For the evaluation of the individualization process has been developed an assessment tool adapted from recommendations and previous studies, according to the practice of repackaging. We used the assessment tool in routine writing and, through the technique of participant observation, it was found the suitability of its execution, as the same instrument. For the identification of critical points of the Distribution System of Medicines was analyzed and verified every step which could occur from medication errors. For evaluation of the Distribution of Prescription Drugs Individualized was a transversal study, which used the technique of participant observation and convenience sampling. Were evaluated prescriptions linked to the Distribution System for Prescription Drug Individualized technology bar code. Results: To evaluate the process of individualization were observed fractionation of 42 oral dosage forms and injectables where routine writing process of individuation attended 66% of the items recommended and play the same 63% attended. For evaluation of the Distribution of Prescription Drugs Individualized analyzed 290 prescriptions linked to the Distribution System for Prescription Drug Individualized of these, 25% had some type of medication error. The total number of items analyzed was 2659, with 74 occurrences of medication errors (2.78%). Compared with earlier data the number of errors per clinic or in general had a statistically significant reduction. Conclusions: The results show that the use of new technologies increases the quality of service by preventing medication errors. Therefore, the system of reading bar codes associated with changes in the infrastructure and work processes can be described as the major factors in reducing the rates of errors in dispensing drugs in the hospital.