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Avaliação da percepção de dor, incapacidade e depressão em indivíduos com dor lombar crônica / Evaluation of pain perception, disability and depression in individuals with chronic low back pain

Márcia de Oliveira Sakamoto Silva Garbi 27 September 2013 (has links)
O objetivo geral deste estudo foi avaliar a dor percebida, em indivíduos com dor lombar crônica, e as correlações existentes entre a variável intensidade de dor, incapacidade e depressão. Os objetivos específicos foram caracterizar sociodemograficamente os indivíduos com dor lombar crônica, mensurar a intensidade de dor percebida, identificar a incapacidade relacionada às atividades de vida diária, identificar os níveis de depressão, estabelecer correlações entre as variáveis estudadas e identificar os descritores de maior e menor atribuição na caracterização da dor. Trata-se de estudo transversal descritivo-exploratório. Utilizou-se um questionário contendo os itens para a coleta de dados sociodemográficos e econômicos e perguntas relacionadas à percepção da dor, a Escala Multidimensional de Avaliação de Dor, o Questionário Roland-Morris de Incapacidade e o Inventário de Depressão de Beck. A coleta de dados ocorreu na Clínica para o Tratamento da Dor do Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina de Ribeirão Preto, Universidade de São Paulo, Brasil. O estudo foi aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa da Escola de Enfermagem de Ribeirão Preto, USP. Foi realizada uma análise exploratória dos dados e aplicado o coeficiente de correlação de Spearman para correlacionar as variáveis de interesse. A amostra foi composta por 60 sujeitos que apresentavam dor lombar crônica com idade média de 54,8 anos e prevalência do sexo feminino (63,33%). A média da intensidade de dor encontrada foi de 7,38 pontos, da incapacidade foi 19,87 e da depressão, 24,98, portanto, os participantes apresentaram alta intensidade de dor, incapacidade e depressão. Os cinco descritores de dor de maior atribuição, considerando as médias aritméticas e o desvio-padrão, foram: desconfortável, enjoada, dolorosa, terrível e prejudicial, sendo os sensitivos (desconfortável e dolorosa), afetivos (enjoada e terrível) e cognitivo (prejudicial) e os cinco descritores de menor atribuição foram: angustiante, desgraçada, assustadora, desastrosa e deprimente, e todos indicam componente afetivo. Os resultados mostraram uma correlação positiva fraca entre intensidade de dor e incapacidade e entre intensidade de dor e depressão, já as variáveis incapacidade e depressão apresentou correlação positiva moderada. Ao considerar a complexidade do fenômeno estudado, ressalta-se que os achados do presente estudo mostram- se consistentes com os resultados de outras pesquisas, portanto, considera-se adequado conhecer as variáveis inter-relacionadas, a fim de propiciar adequado manejo da dor lombar crônica demonstrando a sua multidimensionalidade / The general purpose of this study was to evaluate the perception of pain in individuals with chronic low back pain and existing correlation among pain intensity, disability and depression in such individuals. The specific purpose was to characterize socio-demographic individuals with such diagnosis, measuring the intensity of chronic low back pain felt, identifying the disability related to daily activity in them, identify levels of depression, to establish correlation among variables studied and identify descritptors of major and minor attribution to characterize pain. This is a transverse descriptive exploratory study. It was used a questionnaire containing the items for socio-demographic and economic data collection as well as the questions related to pain perception, the Multidimentional Scale for Pain Evaluation, the Roland-Morris Disability Questionnaire and the Beck Depression Inventory. The data collection took place at the Clinic for Pain Treatment at Hospital das Clínicas - Faculdade de Medicina in Ribeirão Preto from Universidade de São Paulo, Brazil. The study was approved by the Ethic Committee for Research of Escola de Enfermagem in Ribeirão Preto, USP. It was performed an exploratory analysis of the data and it was applied the coefficient of correlation from Spearman to correlate the variables of interest. The sample was composed by 60 individuals who showed chronic low back pain and their age was about 54.8 years old average, they were predominantly women (63.33%). The average intensity of pain was 7.38 points, of disability was 19.87 and of depression 24.98. Therefore, participants showed high intensity of pain, disability and depression. The five descriptors of pain of larger attribution within arithmetical average and standard deviation were: uncomfortable, nauseous, painful, terrible and harmful, considering sensitive (uncomfortable and painful); affective (nauseous and terrible) and cognitive (harmful) and the five descriptors of lesser attribution were: anguised, disgraceful, scary, disastrous and depressing and all of them indicate an affective component. The results showed one positive weak correlation between the intensity of pain and disability and between the intensity of pain and depression, although the variables: disability and depression showed a moderated positive correlation. When considering the complexity of the studied phenomena it is highlighted that the findings of the present study are consistent with the results of other researches, therefore, it is appropriate to know the interrelated variables in order to propitiate suitable dealings of the chronic low back pain demonstrating its multidimensionality.
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Feature extraction from 3D point clouds / Extração de atributos robustos a partir de nuvens de pontos 3D

Carlos André Braile Przewodowski Filho 13 March 2018 (has links)
Computer vision is a research field in which images are the main object of study. One of its category of problems is shape description. Object classification is one important example of applications using shape descriptors. Usually, these processes were performed on 2D images. With the large-scale development of new technologies and the affordable price of equipment that generates 3D images, computer vision has adapted to this new scenario, expanding the classic 2D methods to 3D. However, it is important to highlight that 2D methods are mostly dependent on the variation of illumination and color, while 3D sensors provide depth, structure/3D shape and topological information beyond color. Thus, different methods of shape descriptors and robust attributes extraction were studied, from which new attribute extraction methods have been proposed and described based on 3D data. The results obtained from well known public datasets have demonstrated their efficiency and that they compete with other state-of-the-art methods in this area: the RPHSD (a method proposed in this dissertation), achieved 85:4% of accuracy on the University of Washington RGB-D dataset, being the second best accuracy on this dataset; the COMSD (another proposed method) has achieved 82:3% of accuracy, standing at the seventh position in the rank; and the CNSD (another proposed method) at the ninth position. Also, the RPHSD and COMSD methods have relatively small processing complexity, so they achieve high accuracy with low computing time. / Visão computacional é uma área de pesquisa em que as imagens são o principal objeto de estudo. Um dos problemas abordados é o da descrição de formatos (em inglês, shapes). Classificação de objetos é um importante exemplo de aplicação que usa descritores de shapes. Classicamente, esses processos eram realizados em imagens 2D. Com o desenvolvimento em larga escala de novas tecnologias e o barateamento dos equipamentos que geram imagens 3D, a visão computacional se adaptou para este novo cenário, expandindo os métodos 2D clássicos para 3D. Entretanto, estes métodos são, majoritariamente, dependentes da variação de iluminação e de cor, enquanto os sensores 3D fornecem informações de profundidade, shape 3D e topologia, além da cor. Assim, foram estudados diferentes métodos de classificação de objetos e extração de atributos robustos, onde a partir destes são propostos e descritos novos métodos de extração de atributos a partir de dados 3D. Os resultados obtidos utilizando bases de dados 3D públicas conhecidas demonstraram a eficiência dos métodos propóstos e que os mesmos competem com outros métodos no estado-da-arte: o RPHSD (um dos métodos propostos) atingiu 85:4% de acurácia, sendo a segunda maior acurácia neste banco de dados; o COMSD (outro método proposto) atingiu 82:3% de acurácia, se posicionando na sétima posição do ranking; e o CNSD (outro método proposto) em nono lugar. Além disso, os métodos RPHSD têm uma complexidade de processamento relativamente baixa. Assim, eles atingem uma alta acurácia com um pequeno tempo de processamento.
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Reconhecimento de padrões em imagens por descritores de forma / Pattern recognition in images via shape descriptors

Erpen, Luis Renato Cruz January 2004 (has links)
A idéia de capacitar uma máquina a reconhecer o ambiente em que atua tem motivado pesquisadores a investir esforços no estudo do mais complexo dos sentidos humanos, a visão. A visão é, antes de tudo, uma tarefa de representação e processamento de informações, sendo portanto adequada ao tratamento computacional. Visto que ainda não se possuem métodos que tenham resultados equivalentes ao que seria obtido com um usuário humano, tem-se estudado intensamente a utilização de feições para um melhor aproveitamento de seu potencial. Dentre estas feições, a forma de um objeto proporciona um poderoso indício de sua identidade e funcionalidade, podendo ser utilizada para seu reconhecimento. Isso distingue a forma de outras feições visuais elementares, como a cor, o movimento ou a textura, que, apesar de igualmente importantes, normalmente não revelam a identidade de um objeto. Assim sendo, a possibilidade de avaliar a robustez e a estabilidade de técnicas alternativas para a representação de forma é vital para prever o desempenho de cada técnica na presença de alguma incerteza ou discrepância. Neste trabalho, alguns descritores de forma descritos na literatura foram implementados e utilizados em estudos de caso para avaliar sua eficácia. Estes estudos de caso foram realizados utilizando-se caracteres, todavia, com finalidades bastante distintas. O primeiro estudo de caso é voltado para aplicações como a robótica móvel, com reconhecimento de comandos localizados no ambiente por parte do robô. Já o estudo de caso principal está direcionado para aplicações de reconhecimento de placas de automóveis, que poderia tanto ser utilizado para monitoramento e controle do fluxo de trânsito, quanto para controle de infrações. Muitas aplicações, incluindo aquelas que envolvem a recuperação e indexação de objetos visuais, são apropriadas para a utilização de feições de forma. Outra característica importante do presente trabalho é a de realçar que a seleção de um bom descritor reduz o esforço necessário na etapa de classificação, o qual é computacionalmente elevado. / The idea of enabling a machine to recognize the environment with which it interacts has motivated researchers to dedicate efforts in studying the most complex of the human senses: vision. Vision is essentially a task of information representation and processing, what makes it suitable for computational treatment. Given that currently there are no methods that perform equivalently to humans, the use of features has been intensively studied in order to improve the performance of the existing methods. Among these features, the shape of an object provides a powerful sign of its identity and functionality, what enables the exploitation of this feature with the purpose of recognition. This evidence distinguishes shape from other visual features, such as color, motion or texture, which, although equally important, normally do not reveal the identity of an object. As a result, the possibility of evaluating the robustness and stability of alternate techniques for shape representation is essential in order to measure the performance of each technique in the presence of uncertainty. In this work, some shape descriptors available in the literature were implemented and used in case studies aiming at evaluating their effectiveness. These case studies were carried out using characters, although, with very different purposes. The first case study is geared towards applications such as mobile robotics, where the robot recognizes commands available in the environment. The main case study is focused on applications of license plate recognition, which could be used both in situations of surveillance and traffic control and in situations of infraction. Many applications, including those that involve the search and indexing of visual objects, are suited for the use of shape features. Another important characteristic of this work is that it emphasizes that the selection of a good shape description reduces the effort during the classification step, which is computationally elevated.
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Estrutura da comunidade de macroinvertebrados bentônicos na bacia hidrográfica do Rio Forqueta (RS, BRASIL) em múltiplas escalas espaciais

Strohschoen, Andreia Aparecida Guimarães January 2011 (has links)
Os macroinvertebrados bentônicos constituem uma importante comunidade em riachos, pois participam do fluxo de energia, sendo um importante recurso alimentar para níveis tróficos adjacentes e superiores. Formam uma fauna bastante diversificada e a estrutura desta comunidade pode ser influenciada por diversos fatores ambientais, os quais variam no tempo, no espaço e na escala analisada. O presente estudo objetivou: a) analisar a estrutura da comunidade de macroinvertebrados bentônicos em uma bacia hidrográfica gaúcha, a saber bacia do rio Forqueta (RS, Brasil) em nível taxonômico e de grupos funcionais; b) investigar a variação sazonal (verão e inverno) e a variação espacial da estrutura da comunidade em função de diferenças espaciais nas características morfo-fisiográficas dos trechos amostrados; c) identificar a variabilidade da comunidade de macroinvertebrados bentônicos em três escalas espaciais (rio, segmento de rio e mesohábitat), enfatizando quais escalas espaciais melhor explicam a estrutura da comunidade nesta bacia; d) investigar quais os descritores ambientais mensurados influenciam na estrutura da comunidade e e) qual a porcentagem da variabilidade na riqueza de organismos pode ser explicada pelos descritores ambientais locais mensurados. Realizou-se amostragens de macroinvertebrados bentônicos e descritores ambientais nos períodos de inverno de 2007 e verão de 2008 em oito sítios de amostragem na bacia do rio Forqueta (RS, Brasil). A estrutura da comunidade de macroinvertebrados bentônicos foi caracterizada por uma baixa diversidade, presença de muitas famílias raras e poucas abundantes. Houve predomínio do grupo funcional de coletores nos ambientes analisados. Observou-se maior diversidade nos locais amostrados localizados na unidade geomorfológica Serra Geral, denotando a importância da geomorfologia na estruturação das comunidades aquáticas. Para a análise da estrutura da comunidade em escalas espaciais, as amostragens seguiram um delineamento amostral hierárquico. Foram analisados oito segmentos de rio, considerando os mesohábitats: corredeira e remanso, no verão de 2008. A análise nested Anova mostrou que a comunidade de macroinvertebrados bentônicos varia nas escalas analisadas, sendo que a comunidade está estruturada principalmente de acordo com a escala de mesohábitat. 46,5% da variação na riqueza foi explicada pelas diferenças entre os mesohábitats. Nesta escala houve maior variação na estrutura da comunidade, segundo a Permanova. A Análise de Redundância parcial (pRDA) evidenciou pH, largura do leito do rio, velocidade da corrente e alcalinidade como os descritores que mais contribuiram para explicar a estrutura espacial da comunidade. A partilha da variância mostrou que 12,5% da variabilidade da comunidade foi explicada puramente pelos descritores ambientais. Os resultados mostraram a correspondência entre a distribuição das comunidades de macroinvertebrados bentônicos e os descritores ambientais, demonstrando a importância das variações em mesoescala para o estudo da distribuição destes organismos nesta bacia. / The benthic macroinvertebrate constitute an important community in streams, as part of the flow of energy, being an important food resource for adjacent and higher trophic levels. Form a very diverse fauna and the structure of this community can be influenced by several environmental factors, which vary in time, in space and on the scale considered. This study aimed to: a) analyze the community structure of benthic macroinvertebrate in Forqueta river basin (RS, Brazil) in level taxonomic and functional groups, during winter 2007 and summer 2008, b) investigate the seasonal variation (summer and winter) and the spatial variation of community structure due to spatial differences in morpho-physiographic, d) identify the variability of the macroinvertebrate community at three spatial scales (river, river segment and mesohabitat), emphasizing spatial scales which best explain the community structure in this basin, e) investigate the descriptors which measured environmental influences on community structure and f) what percentage of the variability in the richness of organisms can be explained by local environmental descriptors. The structure of the benthic macroinvertebrate community was characterized by a low diversity, the presence of many rare and few abundant families. There was a higher of the functional group of collectors in the environments analyzed. There was greater diversity in Serra Geral geomorphological unit, emphasizing the importance of geomorphology in structuring aquatic communities. For the analysis of community structure in spatial scales, the sampling followed a hierarchical sampling design. We analyzed the eight segments of the river, considering the mesohabitats: riffles and pools, in the summer of 2008. The nested ANOVA showed that the benthic macroinvertebrate community changes in scales, and that the community is organized mainly according to the scale of mesohabitat. 46.5% of the variation in richness was explained by differences between the mesohabitats. This scale was greater variation in community structure, according to Permanova. Partial Redundancy Analysis (pRDA) showed pH, width of the river bed, flow and alkalinity as the descriptors that contributed most to explain the spatial structure of the community. The partition of variance showed that 12.5% of the variability of community was explained by purely environmental descriptors. The results showed the correlation between the distribution of benthic macroinvertebrate communities and environmental descriptors, demonstrating the importance of variations in mesoscale to study the distribution of these organisms in this basin.
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Caracterização morfológico reprodutiva de acessos de Jureminha (Desmanthus virgatus (L.) Willd.) nativa de Sergipe / Morphological-reproductive characterization of jureminha (Desmanthus virgatus L. (Willd) accessions natives of Sergipe

Fontenele, Ana Consuelo Ferreira 29 March 2007 (has links)
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Among the most representative families of the world flora, the Legumonosae (Fabaceae) is one of most expressive her the capacity in fixing nitrogen in the soil and its releasing for the agroecosystems, presence in many agricultural systems, aggressive characteristic of seed dispersion, and by the considerable forage potential. The present work aimed to characterize accessions of the native legume Jureminha, collected in different ecological- geographic regions of Sergipe state, using morphological reproductive descriptors. Two-hundred and twelve accessions of Desmanthus were cultivated the Embrapa Tabuleiros Costeiros Experimental Station in Nossa Senhora das Dores, SE. The experiment was carried out in a completely randomized block design with 2 replications and 3 representative plants per plot, spaced by 2x2 m from each other. The characters of fertilization percentage (Ft), flowering after pruning (Flo), pods per flower (Vi), pod length (CpV), pod width (LgV), seeds per pod (SV), locus per pod (LoV), weight of 100 seeds (PS) were evaluated. Analysis of variance was processed by the GENES statistical program (Cruz, 2001), estimating for each characteristic the average genetic inheritance (h2 m), the experimental variation (CVe%) and genetic (CVg%) coefficients, and the correlation between such coefficients. Grouping multivariate techniques by the method of Tocher Optimization and Hierarchic Closest Neighbor and the Plane Distance Projections, utilizing the Mahalanobis generalized distance as the dissimilarity measurements were also applied. Significant genetic variability for the characters VI. PS, CpV, and LoV were found between the studied accessions, indicating a genetic potential to be used in breeding programs. Largest genetic inheritance were found for the CpV and LoV characters with respectively 59.59% and 50.61%. Such characters also showed the highest degree of correspondence between the genetic value and phenotypic value with respectively 0.72 % and 0,859 %. The SV and LoV characters had the greatest contribution for the divergence with respectively 37.20% and 14.39% of the variation. Seven divergent groups were formed. There was concluded that there are not a large genetic divergence among the accessions considering the majority of the accessions composed the first group and two groups were composed by four accessions and three groups were composed by two accessions each one, and one group by only one accessions. / Entre as famílias mais representativas da flora no mundo, a Leguminosae (Fabaceae) é uma das mais expressivas, pela fixação de nitrogênio no solo e seu repasse ao agroecossistema, presença em vários sistemas agrícolas, pela sua agressividade na dispersão de sementes, além de possuir relevante potencial forrageiro. Nesse sentido, este trabalho objetivou caracterizar através de descritores morfológicos reprodutivos acessos de jureminha, leguminosa nativa, coletadas em várias regiões ecogeográficas do Estado de Sergipe. Foram implantados 212 acessos no Campo Experimental em Nossa Senhora das Dores, SE, pertencente a Embrapa Tabuleiros Costeiros. O delineamento utilizado foi de blocos ao acaso com duas repetições e três plantas úteis por parcela, separadas entre si e entre linha por 2 m, além de uma linha de bordadura externa em cada bloco. Os caracteres avaliados foram percentual de fertilização (Ft), florescimento após o corte (Flo), número de vagens por inflorescência (VI), comprimento de vagem (CpV), largura de vagem (LgV), número de sementes por vagem (SV), número de locos por vagem (LoV) e peso de 100 sementes (PS). A análise de variância foi realizada utilizando o programa GENES, Cruz (2001), o qual estimou para cada característica, a herdabilidade média (h2 m), os coeficientes de variação experimental (CVe%) e genético (CVg%) e a relação entre esses coeficientes. Foram realizadas também, técnicas multivariadas de agrupamento pelo método de Otimização de Tocher e Hieráquico do Vizinho Mais Próximo e a Projeção das Distâncias no Plano, utilizando-se a distancia generalizada de Mahalanobis (D²) como medida de dissimilaridade. Existe variabilidade genética significativa entre os acessos avaliados, para os caracteres VI, PS, CpV e LoV, indicando como um potencial genético a ser explorado em programas de melhoramento. Sendo os caracteres CpV e LoV os que apresentaram maiores herdabilidades, 59,59% e 50,61%, e os maiores graus de correspondência entre o valor genético e o valor fenotípico 0,72% e 0,86%, respectivamente. Já os caracteres que mais contribuíram para a divergência foram SV com 37,20% da variação, seguido por LoV com 14,39%. No entanto, houve formação de sete grupos divergentes, concluindo-se que a divergência genética entre os acessos não é grande, pois o primeiro grupo formado englobou a maioria dos acessos, dois grupos foram formados por quatro acessos, três grupos com dois acessos e um grupo com apenas um acesso.
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Caracterização morfoagronômica da coleção de germoplasma de jatobá-do-cerrado (Hymenaea stigonocarpa Mart. ex Hayne) da UFG / Morpho-agronomic characterization of UFG germplasm collection of “jatobá-do-cerrado” (Hymenaea stigonocarpa Mart. ex Hayne)

Gonzaga, Lamartine Nogueira 22 February 2017 (has links)
Submitted by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-20T14:07:53Z No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lamartine Nogueira Gonzaga - 2017.pdf: 2017508 bytes, checksum: 1af67174911634205aaa1738758578cd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2017-04-20T14:08:10Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lamartine Nogueira Gonzaga - 2017.pdf: 2017508 bytes, checksum: 1af67174911634205aaa1738758578cd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-20T14:08:10Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Lamartine Nogueira Gonzaga - 2017.pdf: 2017508 bytes, checksum: 1af67174911634205aaa1738758578cd (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-22 / Hymenaea stigonocarpa is classified as a priority for research and sustainable exploitation, with potential for fruit production. There is a phenotypic variation in the species that allows the distinction of three botanical varieties based on leaf characters. The present study aimed to characterize and evaluate the magnitude and distribution of the genetic variability of a germplasm collection of the species. The experimental material consisted of 336 accessions of 120 maternal families, from 24 subpopulations sampled in the Brazilian Cerrado. Plant height, stem diameter, number of branches and number of leaves were measured. Later, they were measured the morpho-agronomic variables: leaf length, leaf width, petiole length, petile diameter, leaf angle, leaflets angle and chlorophyll index. Growth dynamics and analysis of variance were performed to estimate genetic and statistical parameters and selection gain, for growth traits. Data from 113 progenies were used to estimate phenotypic and genetic correlation coefficients. It was also determined the relative importance of the variables for genetic divergence. The dynamics of growth were different in different periods, which is attributed to the formation of the root system in the initial phase of growth. The effects of progeny and subpopulation explain considerably part of the total variation, being significant between and, predominantly, not significant within subpopulations for the growth variables. The morpho-agronomic traits showed significant variation within subpopulations. The cluster analysis showed the formation of two distinct groups which corroborates a population study previously carried out with molecular markers. There is significant variation between subpopulations for growth trais, with possibility of selection for these variables. Based on morphological agronomic variables, the genetic variability is structured among subpopulations. Plants with high growth rates in height have a high growth rate of stem diameter. The variables petiole length (CP), petiole diameter (DP) and final stem diameter (DF) were the most determinant in the discrimination of accessions. / O jatobá-do-cerrado é uma espécie nativa do Cerrado, classificada como prioritária para a pesquisa e exploração sustentada em médio prazo, para produção de frutos. Há variação fenotípica na espécie que permite a distinção de três variedades por caracteres das folhas. O presente estudo teve como objetivo caracterizar e avaliar a magnitude e distribuição da variabilidade genética de uma coleção de germoplasma da espécie. O material experimental foi constituído por 336 acessos de 120 progênies maternas, de 24 subpopulações amostradas no Cerrado. Foram realizadas leituras das variáveis de crescimento: altura da planta, diâmetro do caule, número de ramificações e número de folhas. Posteriormente foram mensuradas as variáveis morfoagronômicas: comprimento do entrenó, comprimento do folíolo, largura do folíolo, comprimento do pecíolo, diâmetro do pecíolo, ângulo da folha, ângulo dos folíolos e índice de clorofila. Foi avaliada a dinâmica do crescimento e estimados componentes de variância para obtenção de parâmetros genéticos, estatísticos e ganho de seleção para os caracteres do crescimento. Dados de 113 progênies foram utilizados na estimativa de coeficientes de correlação. Foi determinada, ainda, a importância relativa das variáveis para a divergência genética. A dinâmica do crescimento foi diferente em períodos distintos, o que é atribuído à formação do sistema radicular na fase inicial de crescimento. Os efeitos de progênie e subpopulação explicam consideravelmente parte da variação total captada, sendo significativa entre e, predominantemente, não significativa dentro de subpopulações para as variáveis do crescimento. Com os caracteres morfoagronômicos houve significativa variação dentro de subpopulações. A análise de divergência por agrupamento mostrou a formação de dois grupos distintos o que corrobora estudo populacional realizado anteriormente com marcadores moleculares. Existe variação significativa entre subpopulações para os caracteres de crescimento, com possibilidade de seleção para estas variáveis. Há, com base em variáveis morfoagronômicas, estruturação da variabilidade genética entre subpopulações. Plantas com elevadas taxas de crescimento em altura apresentam elevada taxa de crescimento do diâmetro do caule. As variáveis avaliadas comprimento do pecíolo (CP), diâmetro do pecíolo (DP) e diâmetro final do caule (DF) foram as mais determinantes na discriminação dos acessos.
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Diversidade genética entre acessos de batata-doce (Ipomoea batatas L.Lam.) avaliada através de marcadores microssatélites e descritores morfoagronômicos / Genetic diversity among accessions of sweet potato (Ipomoea batatas L. Lam.) assessed with microsatellite markers and morphoagronomic descriptors

Eliane Gomes Fabri 10 June 2009 (has links)
O estudo de 135 acessos de batata-doce (Ipomoea batatas L. Lam), do Banco de Germoplasma da Embrapa-CNPH, constituída com materiais oriundos de todas as regiões brasileiras, materiais do CIP-Peru e materiais dos Estados Unidos, Japão e Peru, com marcadores microssatélites e descritores morfoagronômicos, permitiu obter informações sobre a diversidade genética e a distribuição desta diversidade dentro e entre regiões geográficas. O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genética destes 135 acessos de batata-doce, a partir de oito locos de microssatélites, de 21 descritores morfológicos, que totalizaram 124 caracteres diferentes entre parte aérea e raiz tuberosa, e de caracteres agronômicos através da porcentagem de matéria seca, porcentagem de umidade e produtividade por planta. Podemos ressaltar que mesmo com o elevado número de acessos (135) e o elevado número de caracteres morfológicos (97) para a parte aérea avaliados neste trabalho, houve a expressão de 77% e dos (69) caracteres morfológicos da raiz, houve a expressão de 80% desses caracteres. A ausência de 23% e 20% dos caracteres avaliados para parte aérea e raiz, respectivamente, pode ser decorrente da sua não ocorrência no material avaliado, e em parte pela dificuldade de identificá-los na planta, por ser subjetivo ou qualitativo, uma vez que o resultado varia com o avaliador, principalmente para as características relacionadas à cor e forma. O grau de similaridade morfológica foi de 0,13 a 0,83, e o grau de similaridade molecular foi de 0,23 a 1,0 obtidos pelo coeficiente de Jaccard (J). Conclui-se que os materiais da Coleção do Banco de Germoplasma do CIP-Peru e dos demais países (Estados Unidos, Japão e Peru) não são geneticamente distintos dos materiais do Brasil, ou seja, não foram agrupados separadamente. Existe alta variabilidade entre os materiais estudados, que se verifica pelo coeficiente de similaridade de Jaccard para ambos os dados moleculares e morfológicos. Para ambos os marcadores, morfológicos e moleculares, a maior parte da variação ocorre dentro das regiões. / The study of 135 accessions of sweet potato (Ipomoea batatas L. Lam), from the Germplasm Bank of Embrapa-CNPH, constituted by materials from all Brazilian regions, from CIP-Peru and from the United States, Japan and Peru, with microsatellite markers and morphoagronomic descriptors, provided information about the genetic diversity and distribution of this diversity within and among geographic regions. The objective of this study was to characterize the genetic diversity of 135 accessions of sweet potato with eight microsatellite loci, 21 morphological descriptors, which totaled 124 different characters among the aerial vegetative and tuberous roots traits, and agronomic characters such as the dry matter percentage, moisture percentage and plant yield. We emphasize that even with the high number of accessions (135) and the large number of morphological characters (97) among to aerial vegetative traits assessed in this study, 77% of these traits were expressed and of the tuberous roots (69) morphological traits, 80% of these were expressed. The absence of 23% and 20% of the characters evaluated for aerial vegetative and tuberous roots traits, respectively, may be due to their non-occurrence in the material evaluated, and in part by the difficulty of their identification in the plants, considering that due to the fact of being subjective or qualitative, the results vary with the evaluator, especially for the characteristics related to color and shape. The degree of morphological similarity varied from 0.13 to 0.83, and the degree of molecular similarity varied from 0.23 to 1.0, both obtained by the Jaccards coefficient. It is concluded that the materials from the Germplasm Bank of CIP-Peru and other countries (United States, Japan and Peru) are not genetically distinct from the materials from Brazil, or were not grouped separately. There is high variability among the studied materials, verified by the Jaccards similarity coefficient for both molecular and morphological data. Also, for both markers, morphological and molecular, most of the variation occurs within regions.
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Real-time human action recognition based on motion shapes / Reconhecimento de ações humanas em tempo real baseado em figuras de movimento

Moreira, Thierry Pinheiro, 1990- 25 August 2018 (has links)
Orientador: Hélio Pedrini / Dissertação (mestrado) - Universidade Estadual de Campinas, Instituto de Computação / Made available in DSpace on 2018-08-25T12:27:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Moreira_ThierryPinheiro_M.pdf: 1679150 bytes, checksum: 2bd22b1849bd7a34a85e6b5ba649bbf2 (MD5) Previous issue date: 2014 / Resumo: Reconhecimento de ações humanas em vídeos é uma área de conhecimento em expansão. Há uma vasta gama de possíveis aplicações, incluindo interface de usuários, vigilância, casas inteligentes e monitoramento de saúde. A maioria delas requer respostas em tempo real. No entanto, há um equilíbrio entre tempo de processamento e eficácia do reconhecimento, sendo que eficácia compreende acurácia e robustez em múltiplas situações. Duas contribuições são apresentadas neste trabalho. A primeira é um método de obtenção de informação relevante de movimento em vídeos, mesmo usando uma subtração de fundo simples, por meio da união de uma janela deslizante de figuras. A segunda é um descritor simples e rápido, baseado em silhuetas ou, genericamente, em figuras de movimento, que alcança o estado da arte na acurácia em tempo real. Ele é construído a partir das posições relativas de pontos de interesse escolhidos como pontos extremos nas figuras de movimento. O método foi testado em três bases de dados públicas e os resultados experimentais são comparados com outros da literatura. Algumas bases possuem disponíveis silhuetas segmentadas manualmente, permitindo a análise de cada contribuição separadamente. Em todos os casos, as características foram extraídas em altas taxas de quadros por segundo / Abstract: Human action recognition in videos is an expanding area of knowledge. There is a wide range of possible applications, including user interface, surveillance, smart homes and health monitoring. Most of them require real time responses, however, there is a trade-off between processing time and effectiveness of the recognition, where effectiveness comprises accuracy and robustness in a number of situations. Two main contributions are presented in this work. The first one is a method for obtaining relevant motion information from videos, even by making use of poorly extracted foreground, by joining a temporal window of shapes. The second one is a simple and fast descriptor, based on silhouettes or, generically, on motion shapes, that achieves state-of-the-art accuracy in real time. It is built from the relative positions of interest points chosen as extreme points on the motion shapes. The method is tested on three public data sets and the experimental results are compared against others from the literature. Some data sets have manually segmented silhouettes available, allowing to analyze each contribution separately. In all cases, the features are extracted at high frame rates / Mestrado / Ciência da Computação / Mestre em Ciência da Computação
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Recursos genéticos de pimentas (Capsicum, Solanaceae): diversidade genética, resistência à antracnose e produção de metabólitos especializados / Genetic resources of peppers (Capsicum, Solanaceae): genetic diversity, resistance to anthracnose and production of secundary metabolites

Padilha, Henrique Kuhn Massot 21 February 2017 (has links)
Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2017-03-13T14:15:35Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) TESE HENRIQUE PADILHA!.pdf: 2745123 bytes, checksum: 6c3cc4bc0855288de567f8b22b28debe (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2017-03-17T21:15:43Z (GMT) No. of bitstreams: 2 TESE HENRIQUE PADILHA!.pdf: 2745123 bytes, checksum: 6c3cc4bc0855288de567f8b22b28debe (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-17T21:15:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 TESE HENRIQUE PADILHA!.pdf: 2745123 bytes, checksum: 6c3cc4bc0855288de567f8b22b28debe (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2017-02-21 / O consumo de pimentas (Capsicum, Solanaceae) vem aumentando progressivamente, devido à diversidade, multiplicidade dos usos e propriedades funcionais dos seus frutos. Um dos problemas que limita a produtividade de pimentas é a antracnose, doença fúngica recorrente na região sul do Brasil, que resulta em prejuízos ao produtor e ao consumidor. Frente a esse problema, a ampla diversidade genética encontrada nas pimentas representa uma importante fonte para novas alternativas. O objetivo geral deste trabalho foi contribuir para a caracterização de recursos genéticos de pimentas do gênero Capsicum. A tese está apresentada na forma de três capítulos, cujos objetivos foram caracterizar morfologicamente acessos de pimentas do Banco Ativo de Germoplasma de Capsicum da Embrapa Clima Temperado, avaliar a divergência genética e estimar a entropia dos caracteres avaliados; avaliar a reação de acessos de pimentas à antracnose e identificar possíveis fontes de resistência; e realizar a avaliação metabolômica de acessos de pimentas contrastantes para resposta à antracnose. No primeiro capítulo, foram caracterizados 21 acessos de pimentas (C. baccatum e C. chinense) com o uso de 47 descritores morfológicos. Foi verificada ampla diversidade genética para os caracteres avaliados. Os descritores posição da flor, posição do estigma, cor de fruto maduro, pungência e comprimento de planta apresentaram elevada entropia. No segundo capítulo, os mesmos acessos foram avaliados quanto à resposta à antracnose. Os frutos foram colhidos e inoculados em duas fases de maturação. Foi possível diferenciá-los a partir da inoculação com um isolado do fungo Colletotrichum acutatum. Os acessos avaliados não apresentaram resistência total à antracnose. Foi observada variação para resposta à antracnose. A resistência de pimentas à antracnose se expressa de forma diferente de acordo com a fase de maturação do fruto. Dentre os acessos avaliados, P27 apresentou maior resistência à doença e P175 maior suscetibilidade. No terceiro capítulo, foi realizada a avaliação metabôlomica dos frutos dos acessos contrastantes para a resistência à antracnose. Para as análises foram utilizadas técnicas de cromatografia líquida, gasosa e espectrometria de massas. A concentração de metabólitos especializados em frutos de pimentas varia conforme a fase de maturação. A concentração de capsaicinoides e capsinoides dos frutos não influencia a resistência à antracnose. A produção dos compostos butano-2,3-diol, L-threitol, D-frutose e α-D-glucopyranoside nos frutos foi alterada pela incidência da antracnose. O estudo da relação dos compostos dos frutos de pimenta em resposta ao ataque do patógeno gera informações sobre o processo de resistência e suscetibilidade, assim como desperta novos estudos que busquem elucidar a compressão da interação planta-patógeno e uso de recursos genéticos para obtenção de genótipos resistentes. / The consumption of peppers (Capsicum, Solanaceae) increases progressively, due to diversity, multiplicity of usage and the functional properties of the fruits. One of the problems that limit the peppers produtivity is anthracnose, a recurrent fungal disease in South of Brazil, results in losses to producers and consumers. Facing this problem, the wide genetic diversity found in peppers represents an important source of new alternatives. The general objective of this work was to contribute to the characterization of genetic resources of Capsicum peppers. The thesis is presented in form of three chapters, whose objectives were to perform morphological characterization of peppers accessions from the Capsicum Genebank of Embrapa Temperate Agriculture, to evaluate the genetic divergence and estimate the entropy of descriptors; we performed the evaluation of peppers accessions reaction to anthracnose, as well as to identify possible new sources of resistance; and to perform the metabolomic evaluation of contrasting peppers accessions to anthracnose response. In the first chapter, 21 accessions of peppers (C. baccatum and C. chinense) were characterized using 47 morphological descriptors. A wide genetic diversity was verified for the evaluated characters. The descriptors flower positon, stigma position, ripe fruit color, pungence and plant length presented high entropy. In the second chapter, the same accessions were evaluated for anthracnose response. It was possible to differentiate them through inoculation of Colletotrichum acutatum isolate. The fruits were detached and inoculated in two maturation stage. Accessions did not present complete resistance to anthracnose. Great genetic diversity was observed to anthracnose response. Anthracnose resistance of peppers was expressed differently according to fruit maturation stage. Among evaluated accessions, P27 presented greater resistance to the disease and P175 more susceptibility. In the third chapter, metabomic evaluation of contrasting accessions for anthracnose resistance was performed. Liquid chromatography, gas chromatography and mass spectrometry were used for analyzes. Different metabolomic responses were observed for pepper accessions. The concentration of specialized metabolites in peppers fruits varies according to maturation stage. Capsaicinoids and capsinoids content in fruits did not influence resistance to anthracnose. The production of butane-2,3-diol, L-threitol, D-fructose and α-Dglucopyranoside in fruits was affected by anthracnose. The study of relationship of pepper fruit compounds in response to pathogen's attack, generates information about resistance and susceptibility process, as well as instigates new studies that aim to understand the plant-pathogen interaction and the usage of genetic resources to obtain resistant genotypes.
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Recursos genéticos de arroz (Oryza sativa L.) no sul do Brasil. / Rice genetic resources (Oryza sativa L.) in southern Brazil.

Magalhães Júnior, Ariano Martins de 17 April 2007 (has links)
Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese_Ariano_Martins_Magalhaes.pdf: 871444 bytes, checksum: 19f2ef1b5a219328a4f47b41290ddc87 (MD5) Previous issue date: 2007-04-17 / The worldwide adaptability of rice, allied to constant research efforts, reassures its grain a place among the major staple foods for humankind. The influence of natural selection resulted in a wide diversity in the Oryza genus, which is currently composed by 23 species. On the other hand, only O. sativa L. (asian cultivated rice) and O. glaberrima (african cultivated rice) have been used for human consumption, therefore, subjected to artificial selection. The process of domestication in rice has selected important agronomic characters for better plant performance in specific environments, resulting in a bottleneck effect on the genetic diversity. This effect makes a change in the initial gene pool, keeping some selected genes and eliminating others. Thus, the objective of this work was to amplify the genetic basis of rice in southern Brazil, through collections and introductions, characterization of accessions and estimation of genetic distances between accessions. The results revealed a limited number of rice landraces in the state of Rio Grande do Sul. These landraces are found in small farms that still keep these genotypes for their own consumption. A large area of the state is cultivated with modern phillipine-type varieties. However, the rescued landrace genotypes present genetic variability for a large number of the evaluated characters, and may serve as source of genes for breeding programs. The descriptors used for the multivariate analysis were efficient to distinguish the collected accessions, to identify duplicated genotypes in the collection as well as for phenotyping the whole collection. The estimate of genetic distance was obtained using Mahalanobis (D2), distance, which indicated a tight clustering of cultivars released by Embrapa Temperate Climate. The genetic distance matrices based on field- and greenhouse-measured qualitative characters as well as on the joint analysis showed high degree of association, indicating that many characters can be selected based on only one of these criteria. Similar results were obtained for quantitative characters. / A ampla adaptabilidade do arroz, aliada ao continuado esforço da pesquisa no mundo, assegura que o seu grão permaneça sendo um importante produto de consumo pelo homem. A influência da seleção natural resultou em uma ampla diversidade encontrada no gênero Oryza, que, atualmente, é composta por 23 espécies. No entanto, apenas O. sativa L. (arroz cultivado asiático) e O. glaberrima (arroz cultivado africano) vem sendo exploradas na alimentação humana, portanto, sob forte efeito da seleção artificial. O processo de domesticação do arroz resultou na seleção de caracteres agronômicos importantes para o melhor desempenho das plantas em determinado ambiente. Isto resultou no chamado efeito de afunilamento em termos de diversidade genética, ou seja, a partir de um background genético bastante rico, alguns grupos de genes de interesse vão sendo mantidos na população e outros eliminados. Assim sendo, o objetivo deste trabalho foi ampliar a base genética do arroz no Sul do Brasil, através de coletas e introduções, caracterização dos acessos e estudo da distância genética existente entre eles. Os resultados revelaram um número limitado de coletas de genótipos de arroz no Rio Grande do Sul, sendo esta, basicamente, restrita a pequenos produtores que ainda mantém genótipos antigos para sua subsistência. Grande área do Estado é cultivada com variedades modernas do tipo filipina. No entanto, os genótipos resgatados apresentaram variabilidade genética para um grande número de caracteres avaliados, podendo servir como fonte de genes aos programas de melhoramento genético da cultura. Os descritores utilizados na análise multivariada foram eficientes para separar os acessos coletados, identificar duplicações na coleção, bem como na fenotipagem da coleção. O método de estimativa da distância genética utilizado, baseado na matriz de distâncias de Mahalanobis (D2), indicou um agrupamento das cultivares lançadas pela Embrapa Clima Temperado, sendo revelada pouca variabilidade genética entre estas. As matrizes de distância genética entre os genótipos com base nos caracteres qualitativos aferidos a campo, em casa-devegetação e a conjunta de ambos os ambientes, evidenciaram associação elevada entre si, indicando que possivelmente a avaliação destes caracteres poderá ser realizada efetivamente sob apenas um dos critérios. Esta mesma afirmativa foi observada para os caracteres quantitativos.

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