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Anticorpos virusneutralizantes para o genótipo 1 e 2 do vírus da diarréia viral bovina em vacas gestantes abatidas em frigorífico e respectivos fetosOliveira, Mônica Costa [UNESP] 16 February 2009 (has links) (PDF)
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oliveira_mc_me_jabo.pdf: 308908 bytes, checksum: 64bbc47e580df30ef60b342b4c429d6c (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / O Vírus da Diarréia Viral Bovina (BVDV) é um dos patógenos mais importantes na pecuária bovina em todo mundo, principalmente por desencadear manifestações clínicas relacionadas à esfera reprodutiva. A infecção em fêmeas gestantes pode resultar em abortamentos, reabsorções embrionárias, mumificações fetais, má formações e nascimento de bezerros fracos além do aparecimento de animais persistentemente infectados e imunotolerantes ao vírus, que são a principal fonte de infecção e disseminação da doença nos rebanhos. Atualmente, a complexidade do diagnóstico e consequentemente a patogenia, estão relacionados às diferenças genotípicas do agente. Por isso, a presente pesquisa teve como objetivo verificar a ocorrência dos genótipos BVDV-1 (Singer) e BVDV-2 (VS-253) em vacas, e respectivos fetos, abatidas em um frigorífico no Estado de São Paulo por meio da análise do soro sanguineo por meio da técnica de virusneutralização. No contexto geral, 52,51% (115/219) das vacas testadas foram reagentes, mas nenhum feto (0/219) reagiu na virusneutralização. Pela análise cruzada conforme a estirpe viral, observou-se que 42% (92/219) das vacas foram reagentes tanto para o genótipo BVDV-1 como para o genótipo do BVDV-2. Por outro lado 4,10% (9/219) reagiram apenas para o genótipo BVDV-1 e 6,39% (14/219) reagiram apenas para o genótipo do BVDV 2. Notou-se portanto que ambas as estirpes estão disseminadas nas regiões estudadas, fato que justifica o emprego de antígenos diferentes para evitar diagnóstico falso-negativo. Por fim, não foi observado qualquer alteração nos fetos que pudessem ser caracterizada como patologia da enfermidade. / The Bovine viral diarrhea virus (BVDV) is one of the pathogens in bovine livestock worldwide most important mainly triggered by clinical manifestations related to the reproductive sphere. The infection in pregnant females may result in abortions, embryonic resorptions, fetal mummification, poor training, birth of weak calves in addition to persistently infected and virus immunotolerant animals, which are the main source of infection and spread of the disease. Currently, the complexity to diagnosis and consequently to the pathogenesis are related genotypic differences that he presents. Therefore, this research aimed to verify the occurrence of BVDV- 1 (Singer) and BVDV-2 (VS-253) genotypes in cows and their respective fetuses slaughtered in a abattoir at the state of São Paulo by analyzing the blood serum using virusneutralization technique. In the general context, 52.51% (115/219) of cows were reagents, but no fetus (0/219) reacted in virusneutralization. After a cross-examination we observed that 42% (92/219) of cows reacted for both BVDV-1 and BVDV-2 genotype. Furthermore 4,10% (9/219) reacted only to the genotype BVDV-1 and 6,39% (14/219) responded only to the genotype 2 of BVDV. It was noted therefore that both strains are widespread in the regions studied, which also justifies the use of different antigens to avoid false-negative diagnosis. Finally, there was no change in fetuses that could be characterized as a pathology of the disease.
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epidemiologia das doenças entéricas bacterianas em suínos nas diferentes faixas etárias e caracterização fenotipica dos isolados de Escherichia coli / Epidemiology of the enteric bacterial diseases in swine in the different age groups and phenotyoic characterization of isolated of Escheria coliMenin, álvaro 28 February 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-02-28 / To know the enteropathogenic bacteria present in the production system of
swine can be an important tool to understand the sanitary challenges and to establish
with success sanitary programs. The objective of this study was to diagnose effectivy
enteropathogenic (s) bacterial (s) associate the pathogenese of the enteritis in
newborn piglets, postweaning, growing and finish and to do the phenotypic
characterization and of resistance the antimicrobials of the isolated of Escherichia
coli. The main species of diagnosed bacterial enteropatógenos were Escherichia coli,
Clostridium sp., Salmonella sp, Brachyspira hyodysenteriae, Brachyspira pilosicoli
and Lawsonia intracellularis. The E. coli it was the bacteria more frequently isolated
as primary agent or in an associated, of the diarrhea between second and 81st days
of life of the pigs. Analyze the phenotypic of isolated of E. coli, considering the age
group, its revealed that the serotypes of E. coli potentially pathogenic, prevalence
more until the third week of age, were F5 (K99) 29%, F41 10%, F42 11% and F6
(987P) 23%, already in pigs with more than 21 days, stumps prevailed with fimbrials
F4 (K88) 27%. Using the test of CIM, the largest resistance indexes were observed
for oxytetracycline (84%), gentamicin (76%), and smaller resistance index for
ceftiofur (37%) and enrofloxacin (39%). In the resistance test the antimicrobials, for
disk - diffusion, the samples of Salmonella sp., they presented high sensibility to the
gentamicin (3,5%) amoxicillin (4,8%) and larger resistance the oxytetracycline (77%),
tetracycline (42,1%) / Conhecer as bactérias enteropatogênicas presentes no sistema de produção
de suínos é uma importante ferramenta para compreender os desafios sanitários e
estabelecer com sucesso programas sanitários voltados ao tratamento, controle e
profilaxia. O objetivo deste estudo foi diagnosticar efetivamente o (s)
enteropatógeno (s) bacteriano (s) associado (s) a patogênese da enterite nas fases
de maternidade, creche, recria e terminação e fazer a caracterização fenotipica e de
resistência a antimicrobianos dos isolados de Escherichia coli. Os principais gêneros
/ espécies de enteropatógenos bacterianos diagnosticados foram Escherichia coli,
Clostridium sp., Salmonella sp, Brachyspira hyodysenteriae, Brachyspira pilosicoli e
Lawsonia intracellularis. A E. coli foi o enteropatógeno mais frequentemente isolado
como agente primário ou de forma associada, dos quadros clínicos de diarréia entre
segundo e 81º dias de vida dos leitões. A análise fenotípica dos isolados de E. coli,
considerando a faixa etária, revelou que os sorotipos de E. coli potencialmente
patogênicos, mais prevalentes até a terceira semana de idade, foram F5/K99 29%,
F41 10%, F42 11% e F6/987P 23%, já em leitões com mais de 21 dias,
predominaram cepas com fimbrias F4/K88 27%. Utilizando o teste da concentração
inibitória mínima (CIM), os maiores índices de resistência foram observados para
oxitetraciclina (84%), gentamicina (76,0 %), e menor índice de resistência para
ceftiofur (37%) e enrofloxacina (39 %). No teste de resistência a antimicrobianos, por
disco difusão, as amostras de Salmonella sp., apresentaram alta sensibilidade à
gentamicina (3,5%) amoxicilina (4,8%) e maior resistência a oxitetraciclina (77%),
tetraciclina (42,1%)
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Diarréia nosocomial em unidade de terapia intensiva: incidência e fatores de riscoBorges, Sérvulo Luiz 30 July 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-07-30 / Racional - A diarréia nosocomial é uma das infecções mais comuns entre pacientes
internados em Unidades de Terapia Intensiva (UTI), embora sua epidemiologia, bem
como causas e conseqüências sejam raramente documentadas em estudos de
vigilância de infecções hospitalares. Objetivo - Estudar a incidência e os fatores
risco entre os pacientes adultos acometidos com diarréia em uma UTI clínico
cirúrgica, no período de 12 meses. Pacientes e métodos – Foram estudados
prospectivamente, após exclusão, 457 pacientes quanto ao desfecho de diarréia e
os fatores de risco, no período de outubro de 2005 a outubro de 2006. Considerou
se como diarréia nosocomial o quadro clínico de diarréia com início após 72 h da
admissão hospitalar, com pelo menos duas evacuações líquidas ou pastosas por
mais de dois dias consecutivos. A coleta de dados foi realizada diariamente na UTI
até a alta ou óbito do paciente no setor. As variáveis analisadas foram: idade, sexo,
tempo de internação hospitalar antes da admissão na UTI, tempo de internação na
UTI, o escore APACHE II, comorbidades, insuficiência orgânica, história cirúrgica
nos últimos 30 dias, uso corrente de antimicrobianos (incluindo o número de dias e
número total de antibióticos), antisecretores, nutrição enteral, parenteral, fleet
enemas, duração total da diarréia (em dias), tempo do início da diarréia em relação à
internação, presença de caso similar de diarréia na UTI na última semana ou na
mesma ocasião, albumina sérica e taxa de hemoglobina em pelo menos uma
ocasião durante a internação. Para análise dos dados, os pacientes foram divididos
em grupos com e sem diarréia nosocomial. O nível de significância foi de 5%
(P < 0,05). As variáveis significativas na análise univariada foram analisadas, de
forma multivariada, através da estimação de um modelo de regressão logística.
Resultados - Diarréia ocorreu em 135 (29,5%) pacientes, durando em média 5,4
dias. O tempo do seu início em relação à internação foi de 17,8 dias e casos
similares no período foram registrados em 113 (83,7%) pacientes. Na análise
multivariada através de modelo de regressão logística, apenas o número de
antibióticos (OR 1,65; I.C. 95% = 1,39 – 1,95) e o número de dias de
antibioticoterapia (OR 1,16; I.C. 95% = 1,12 – 1,20) associaram-se estatisticamente
com a ocorrência de diarréia (P = 0.000). Cada dia de acréscimo a mais da
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antibioticoterapia aumentou em 16% o risco de diarréia (I.C. 12% a 20%), enquanto
a adição de um antibiótico a mais ao esquema antimicrobiano aumentou as chances
de ocorrência de diarréia em 65% (I.C. 39% a 95%). Conclusão – A incidência de
diarréia nosocomial na UTI é elevada (29,5%). Os principais fatores de risco para
sua ocorrência foram número de antibióticos prescritos e duração da
antibioticoterapia. Além das precauções entéricas, a prescrição judiciosa e limitada
de antimicrobianos, provavelmente reduzirá a ocorrência de diarréia neste setor. / Background - Nosocomial diarrhea is one of the most common infection diseases
among patients admitted at Intensive Care Units (ICUs), although its epidemiology as
well as its causes and consequences are rarely documented in hospital infections
surveillance studies. Objective - To study the incidence and the risk factors for
diarrhea among adult patients admitted at a clinical-surgical ICU for a 12-months
period. Patient and methods – Four-hundred-fifty-seven patients were studied
prospectively, after application of exclusion criteria, to determine diarrhea incidence
and risk factors from October 2005 to October 2006. Nosocomial diarrhea was
defined as clinical picture of diarrhea beginning 72 hours from hospital admission,
with at least two watery or pasty bowel movements for more than two consecutive
days. Data acquisition was done on a daily basis at ICU until patient discharge or
death in the unit. Variables analyzed were the following: age, sex, days of
hospitalization before admission at the ICU, days of hospitalization at the ICU,
APACHE II score, comorbidities, organic insufficiency, surgical history for the last 30
days, current use of antimicrobials (including number of days and total number of
antibiotics), antisecretories, enteral nutrition, parenteral, fleet enemas, total duration
of diarrhea (in days), period of time between patient admission and beginning of
diarrhea, presence of similar case of diarrhea in ICU during the last week or at the
same time, serum albumin and hemoglobin levels in at least one occasion during
admission. For data analysis, the patients were divided into groups with and without
nosocomial diarrhea. The level of significance was 5% (P <0.05). The significant
variables in univariate analysis were analyzed, in a multivariate form, through
estimation of a logistic regression model. Results - Diarrhea occurred in 135 (29.5%)
patients and lasted for a mean of 5.4 days. The period of time between patient
admission and beginning of diarrhea was 17.8 days and similar cases during the
period were recorded in 113 (83.7%) patients. In multivariate analysis using logistic
regression model only the number of antibiotics (OR 1.65; C.I. 95% = 1.39 – 1.95)
and the number of days of antibiotic therapy (OR 1.16; C.I. 95% = 1.12 – 1.20) were
statistically associated with the occurrence of diarrhea (P <0.05). Each day added of
antibiotic therapy increased in 16% the risk of diarrhea (C.I. 12% to 20%), while the
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addition of one more antibiotic to the scheme increased the chances of occurring
diarrhea in 65% (C.I. 39% to 95%). Conclusion - The incidence of nosocomial
diarrhea in ICU is high (29.5%). The main risk factors were number of prescribed
antibiotics and duration of antibiotic therapy. Besides the enteric precautions,
judicious and limited prescription of antimicrobials will probably decrease the
incidence of diarrhea at this unit.
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Ocorrência de Escherichia coli comensal e diarreiogênica na microbiota fecal de crianças com e sem diarréia aguda e seu perfil de susceptibilidade a antimicrobianosGarcia, Patrícia Guedes 20 November 2009 (has links)
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Previous issue date: 2009-11-20 / Diarréia aguda é um problema de saúde pública, causa importante de morbidade e mortalidade, sobretudo, em países em desenvolvimento. A etiologia das doenças diarréicas é variada e entre os patógenos bacterianos destacam-se as linhagens diarreiogênicas ou patotipos de Escherichia coli. Foi investigada a ocorrência de E. coli comensal ou diarreiogênica em 141 amostras fecais de crianças de zero até cinco anos de idade de origem comunitária em Juiz de Fora, MG. Dos espécimes, 84 foram provenientes de doadores com manifestação clínica de diarréia aguda (CD) e 57 de doadores clinicamente saudáveis, sem diarréia (SD). Após identificação e caracterização microbiana, foi determinado o seu perfil de susceptibilidade a antimicrobianos. As linhagens bacterianas foram identificadas fenotípica e genotipicamente por métodos bioquímicos clássicos e moleculares, respectivamente, e a caracterização dos patotipos de interesse no trato gastrintestinal foi feita por metodologia molecular. O perfil de susceptibilidade a antimicrobianos foi determinado pelo método de Kirby-Bauer, segundo recomendações do CLSI (2007). Considerando-se todo o grupo amostral, 136 linhagens de E. coli foram recuperadas de fezes CD (36,8% diarreiogências) e 84 de fezes SD (30,9% diarreiogênicas). A confirmação da identificação bioquímica por metodologia molecular mostrou uma correlação de 97,3% entre as duas metodologias. E. coli enteroagregativa (EAEC) foi o patotipo mais freqüentemente recuperado no grupo CD (16,2%) e o único isolado no grupo SD (30,9%). E. coli enteropatogênica (EPEC) atípica foi o segundo patotipo mais isolado no grupo CD (10,3%), seguido de E. coli produtora de toxina Shiga (STEC) (7,4%) e E. coli enterotoxigênica (ETEC) (2,9%). Nenhuma linhagem de EPEC típica e E. coli enteroinvasiva (EIEC) foi recuperada. A investigação do perfil de susceptibilidade aos antimicrobianos demonstra elevada resistência a fármacos, como ampicilina, tetraciclina e sulfametoxazol-trimetoprim, enquanto que resistência intermediária foi observada contra a ampicilina/sulbactam, cefalotina, tetraciclina e amicacina e gentamicina. Os antimicrobianos mais eficazes foram ceftazidima, ceftriaxona, imipenem e piperacilina/tazobactan, para os quais não foi verificada resistência bacteriana. A diferenciação entre os patotipos de E. coli é de grande importância, uma vez que estes microrganismos estão implicados em diarréias agudas em
crianças e, quase sempre, necessitarão de tratamento medicamentoso. De maneira geral, nossos resultados indicam a relevância da participação de agentes bacterianos diarreiogênicos na gênese da diarréia aguda na infância, em crianças de 0 a 5 anos. A alta resistência a antimicrobianos observada em nosso trabalho suscita uma ampla discussão sobre uso indiscriminado/indevido de antibióticos e os riscos inerentes da automedicação. / Acute diarrhea is a public health problem, important cause of morbidity and mortality, especially in developing countries. The etiology is varied and considering the bacterial pathogens, the diarrheagenic Escherichia coli pathotypes are among the most important. In this study we have investigated the occurrence of commensal or diarrheagenic E. coli in 141 fecal samples from children of zero to five years of age in Juiz de Fora, MG. Of the specimens, 84 were obtained from clinically injured donors with acute diarrhea (CD) and 57 from clinically healthy donors without diarrhea (SD). After microbial identification and characterization the bacterial antimicrobial susceptibility patterns were determined. The bacterial strains were phenotipically and genotipically indentified by conventional biochemical methods and molecular approach, respectively. The E. coli pathotypes were also genetically characterized by molecular methodology. The antimicrobial susceptibility patterns were determined by the Kirby-Bauer method, according to the CLSI guidelines (2007). Considering all fecal specimens, 136 E. coli strains were isolated and identified (36.8%, CD) and 84 (30.9%, SD). Confirmation of identification by molecular approach showed 97,3% of correlation between the two methodologies. Enteroaggregative E. coli (EAEC) was the most frequently recovered pathotype identified in the acute diarrhea group (16.2%) whereas the only recovered pathotype identified in the feces from healthy donors (30.9%). Enteropathogenic E. coli (EPEC) was the second most isolated pathotype group (10.3%), followed by STEC (7.4%) and ETEC (2.9%). No typical EPEC or EIEC strains were recovered. The antimicrobial susceptibility patterns shown high antimicrobial resistance rates against ampicillin, tetracycline, and sulfamethoxazole-trimethoprim. Intermediary resistance was observed against ampicillin/sulbactam, cefalotin, tetracycline, amikacin and gentamicin. The most effective antimicrobials were ceftazidime ceftriaxone, imipenem and piperacillin/tazobactam, for which no bacterial resistance was observed. The differentiation between the diarrheagenic E. coli pathotypes is of great importance, since they are involved in acute diarrheal diseases in children and, almost often will require antimicrobial chemotherapy. Overall, our results may indicate the importance of the bacterial agents in the etiology of diarrheic diseases in childhood, mainly
considering children of 0 to 5 years. The high antimicrobial resistance observed in our study raises a broad discussion on the indiscriminate or improper use of antimicrobials, besides the risks of self-medication.
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Conseqüências nutricionais a longo prazo das doenças infecciosas agudas na infância : estudo de coorte / Long-term nutritional consequences of acute infectious diseases in childhood: cohort studyVerdun, Maria Angelica Barbosa 23 February 2007 (has links)
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Previous issue date: 2007-02-23 / This study was aimed to assess the relationship between hospital admission for diarrhea and pneumonia in the first three years of life and anthropometry and body composition in 18-year-old men. In 1982, all live births in the city s hospital were identified and followed-up several times. In 2000, males were identified and examined when enrolling in the national Army, were evaluated 2250 individuals of the original members of the cohort. Multiple linear regression models were used in multivariable analyses. When analyses were adjusted, admission for pneumonia in the first two years of life was negatively associated with later height. Boys with two or more admissions, were 2.40 cm shorter (IC95% -4.19;-0.61 cm) at age 18 compared to those without admissions. Admission for diarrhea and pneumonia in infancy did not have an impact on weight, body mass index or body composition, suggesting that later recovery of weight deficit in infancy did not occur at expense of fat mass accumulation. / O presente estudo teve por objetivo avaliar a associação entre as hospitalizações por diarréia e pneumonia nos primeiros três anos de vida com a antropometria e a composição corporal em homens com 18 anos de idade. Em 1982, todos os nascimentos ocorridos nas maternidades da cidade foram identificados e acompanhados inúmeras vezes. Em 2000, os homens foram identificados e examinados no momento do alistamento militar, avaliou-se 2250 indivíduos pertencentes à coorte original. Modelos de regressão linear múltipla foram utilizados nas análises multivariadas. Logo após as analises ajustadas, somente as hospitalizações por pneumonia ocorridas nos dois primeiros anos de vida estiveram
negativamente associadas à altura aos 18 anos de idade. Os meninos com >2 hospitalizações, tiveram -2,40cm (IC 95% -4,19; -0,61cm) aos 18 anos comparados aos meninos sem
antecedentes de hospitalizações. As hospitalizações por diarréia e pneumonia na infância não tiveram impacto sobre o peso, o índice de massa corporal e a composição corporal, sugerindo que a recuperação posterior do déficit de peso na infância não ocorreu às custas de um acúmulo de massa gorda.
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Avaliação de causas de diarréia em pacientes submetidos a transplante autólogo de células tronco hematopoéticasCastro, Marcelo Dias de 06 June 2014 (has links)
Submitted by Renata Lopes (renatasil82@gmail.com) on 2016-01-21T17:23:47Z
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marcelodiasdecastro.pdf: 35449715 bytes, checksum: 86414e568f3ffb10fc5fe7e10b848a83 (MD5) / Made available in DSpace on 2016-01-25T18:47:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Previous issue date: 2014-06-06 / Diarréia é a maior causa de morbidade em pacientes submetidos a quimioterapia em
altas doses e a transplante autólogo de células tronco hematopoéticas. Existem
muitas causas de diarréia em pacientes que são transplantados, incluindo o efeito
dos agentes quimioterápicos e as infecções. Neste estudo, foram avaliados 47
pacientes que receberam transplante no HU-UFJF entre maio de 2011 e maio de
2013. Todos os pacientes que apresentaram diarréia tiveram suas amostras de
fezes enviadas para análise e pesquisa de agentes etiológicos através de exames
específicos para fungos, coccídios, Strongyloides, parasitas intestinais, Clostridium
difficile, e bactérias patogênicas. Trinta e nove pacientes (83%) tiveram diarréia,
sendo que, destes, 35% tiveram diarréia induzida por quimioterapia, sete (17,5%)
apresentaram coccídios, três (7,5%) tiveram Cândida sp, um (2,5%) Clostridium
difficile e um paciente (2,5%) apresentou Giardia lamblia. Outros 30% apresentaram
diarréia por outras causas. Houve uma tendência a mais diarréia em pacientes com
mais de 50 anos (p=0.09), naqueles que receberam condicionamento com
lomustina, etoposide, citarabina e melfalam (p=0.083) e houve um maior número de
dias de neutropenia nos pacientes com diarréia (p=0.06). Porém nenhum fator de
risco foi encontrado. Os dados apontam para a importância da correta identificação
dos agentes etiológicos e da alta probabilidade de variações destes agentes em
populações distintas. / Diarrhea is a major cause of morbidity for the patients undergoing high-dose
chemotherapy and autologous hematopoietic stem cell transplantation (ASCT).
There are multiple causes of diarrhea in patients undergoing transplantation incluing
antineoplastic chemotherapy and infections. In this study, 47 patients underwent
ASCT at the HU-UFJF between May 2011 and May 2013. All patients who presented
with diarrhea consented to stool sample analysis for identification of the etiological
agents through specific exams in search of fungi, coccidia, intestinal parasites,
Strongyloides, C. difficile, and other pathogenic bacteria. Thirty-nine patients (83%)
had diarrhea, among whom 35% had diarrhea induced by chemoterapy, seven
(17.5%) presented with coccidia, three (7.5%) with Candida sp., one (2.5%) with C.
difficile, and one (2.5%) with Giardia lamblia. Other 30% had diarrhea for other
causes. There was a tendency toward a higher incidence of diarrhea in oldest 50
years (p=0.09) and those who received lomustine, etoposide, cytarabine, and
melphalan conditioning (p=0.083) and a higher number of days of neutropenia in
patients with diarrhea (p=0.06); however, no risk factors were identified. The results
shows the importance of correctly identifying the etiological agent and highlights the
possible varieties of agents in specific populations.
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Padronização e avaliação de PCR multiplex para o diagnóstico de Escherichia coli enteroagregativa típica e atípica / Standardization and evaluation of multiplex PCR for the diagnostic of typical and atypical enteroaggregative Escherichia coli.Fernanda Batista de Andrade 02 September 2013 (has links)
O patótipo de Escherichia coli diarreiogênica denominado E. coli enteroagregativa (EAEC) é caracterizado pela expressão do padrão de adesão agregativo (AA) em células epiteliais cultivadas. Amostras de EAEC são classificadas como típicas ou atípicas, dependendo da presença ou não do gene aggR, respectivamente. O padrão AA no teste de adesão em células epiteliais é o diagnóstico padrão para a classificação de EAEC. Técnicas moleculares, como a PCR multiplex, são alternativas a esse teste. No presente estudo foi desenvolvida uma PCR multiplex para o diagnóstico molecular de EAEC típica e atípica, baseada na detecção dos genes aatA, aggR, aaiA e aaiG. A partir de colônias isoladas de E. coli de origem fecal o teste apresentou sensibilidade de 94,8%, especificidade de 94,7%, valor preditivo de teste positivo de 74,3% e valor preditivo de teste negativo de 99,1%. O teste desenvolvido mostrou-se uma alternativa diagnóstica sensível e específica para EAEC e permite um acréscimo significativo na detecção de EAEC atípica. / The diarrheagenic Escherichia coli pathotype known as enteroaggregative E. coli (EAEC) is characterized by the expression of the aggregative adherence pattern (AA) on cultured epithelial cells. EAEC strains are classified as typical or atypical, depending on the presence or absence of the aggR gene, respectively. The AA pattern in the adherence assay with epithelial cells is the gold standard diagnostic for EAEC. Molecular techniques, such as multiplex PCR, are alternatives to this test. In the present study we developed a multiplex PCR for the molecular diagnostic of typical and atypical EAEC, based on the detection of aatA, aggR, aaiA and aaiG genes. The test presented 96.5% of sensitivity, 94.8% of specificity, 74.3% of positive predictive value and 99.1% of negative predictive value, when tested in isolated colonies of E. coli from feces. The test developed is a sensitive and specific diagnostic alternative for EAEC and allows a significant increase in atypical EAEC detection.
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Caracterização genotípica de amostras de Clostridium perfringens provenientes de suínos através da eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE) / Genotypic characterization of Clostridium perfringens from swine by pulsed field gel electrophoresis (PFGE)Ferreira, Thaís Sebastiana Porfida 30 January 2007 (has links)
Clostridium perfringens é um importante patógeno envolvido em doenças entéricas dos animais domésticos e quadros de toxinfecção alimentar em humanos. Embora as infecções causadas por C. perfringens biotipo C e A em suínos sejam amplamente estudadas, existem poucos relatos que descrevem as reais correlações genéticas existentes na cadeia epidemiologia das clostridioses para esta espécie animal, assim como a transmissão do agente através da fêmea lactante, e a eliminação e perpetuação do agente no momento do abate. O presente estudo teve como objetivo o isolamento e a caracterização genotípica através da eletroforese em gel de campo pulsado (PFGE) de cepas de C. perfringens isoladas a partir de fezes e de carcaças de suínos no momento do abate, fezes de fêmeas suínas e seus leitões e de amostras de farinha de carne e ossos. Foi ainda realizada a comparação dessas cepas com cepas isoladas a partir de leitões com enterite. A freqüência de isolamento do agente em carcaças, em fezes de leitões terminados e a partir de farinha de carne e osso foram, 44,2%, 52,5%, e 32,2% respectivamente. De acordo com a reação em cadeia pela polimerase (PCR) foram detectadas somente as toxinas alfa e beta 2, sendo esta ultima detectada somente nos casos de enterite. Por meio da PFGE as amostras foram caracterizadas em 97 perfis genéticos com um alto índice discriminatório. As amostras isoladas de carcaça apresentaram alta similaridade em relação às de origem fecal, os isolados de farinha de carne apresentaram perfis similares aos obtidos em isolados de fezes de fêmeas, leitões sadios e leitões com enterite. E os isolados de leitões com e sem enterite apresentaram baixa similaridade em relação aos isolados de fêmeas. / Clostridium perfringens is an important enteric disease pathogen of domestic animals and foodborne diseases of human beings. Although infections caused by C. Perfringens type C and A in swine are well studied, just few reports describe genetic relationship among strains in the epidemiological chain of Swine Clostridioses, as well as the transmission of the microorganism by the nursing female its elimination and maintenance at slaughterhouses. The aim of the present study was the isolation and genotypic characterization by Pulsed-Field gel eletrophoresis (PFGE), of C. Perfringens strains from feces and carcasses from at slaughterhouse pigs, feces from sows and their piglets, and samples of meat and bone meal. The microorganism isolation frequencies in carcasses, finishing pig feces, and meat and bone meal were 44.2%, 52.5%, 32.2%, respectively. According to Polymerase Chain Reaction (PCR) assay, only the alfa and beta 2 toxins were detected; whereas beta 2 toxin was detected barely in cases of enteritis. By means of the PFGE assay techinique the samples were characterized in 97 genetic profiles with a high discriminatory level. Strains from carcasses samples presented high similarity to strains from fecal origin. strains from meat and bone meal samples showed similar profiles to strains from sow feces samples; of sows, assimptomatic piglets and piglets with enteritis. And strains isolated from piglets (assimptomatic and with enteritis) presented low similarity to strains from sow feces samples.
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Espécies do grupo Bacteroides fragilis em bezerros com e sem diarréia aguda: ocorrência, fatores de virulência e caracterização molecular / Species of the Bacteroides fragilis group in calves with and without diarrhea: occurrence, virulence factors and molecular characterization.Almeida, Fernanda dos Santos 27 June 2007 (has links)
Em nosso estudo foi avaliada a presença das bactérias do grupo Bacteroides fragilis em 108 amostras fecais de bezerros com e sem diarréia, além de fatores de virulência e a similaridade genética entre as cepas de B. fragilis. Hemolisinas foram observadas em 36,3% e em 83,7% dos bezerros com e sem diarréia, respectivamente. Apenas 7,4% dos isolados foram hemaglutinantes. De todos os isolados, grande parte resistiu à ação do soro e 100% foram sensíveis ao imipenem e metronidazol. Houve resistência aos metais pesados utilizados. Plasmídios foram detectados em 7,4% dos isolados. Dentre 58,8% produtores de ß-lactamase, em 19,7% e em 26,0% de bezerros com e sem diarréia, respectivamente detectou-se o gene cepA, que foi observado também em plasmídios de 5,5 kb. O gene cfiA foi observado em 16,5% dos isolados diarréicos e em 12,6% de não diarréicos, mas não em plasmídios. O gene nanH foi detectado em 21,8% dos isolados e o gene bft somente em dois isolados diarréicos. A similaridadade genética entre os B. fragilis mostrou a heterogeneidade das bactérias. / In this study the bacteria of Bacteroides fragilis group was evaluated in 108 fecal samples of calves with and without diarrhea, besides virulence factors and the genetic similarity among the B. fragilis strains. Hemolysin was observed in 36.3% and in 83.7% of calves with and without diarrhea, respectively. Only 7.4% of the isolates showed hemagglutinability. Of all the isolates, the major part resisted to the action of the serum and 100% were sensitive to the imipenem and metronidazole. There was resistance to the used heavy metals. Plasmids were detected in 7.4% isolates. Among 58.8% ß- lactamase producing, 19.7% and 26.0% strains of calves with and without diarrhea, respectively the cepA gene was detected, that was also observed in 5.5 kb plasmids. The cfiA gene was observed in 16.5% of the diarrheic isolates and 12.6% of non-diarrheic, but not in plasmids. The nanH gene was detected in 21.8% of the isolates and the bft gene only in two diarrheic isolates. The genetic similarity among the B. fragilis showed the heterogeneity of the bacteria.
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Caracterização da adesão de Escherichia coli enteropatogênica atípica do sorotipo O26:H11 a componentes de matriz extracelular / Characterization of adhesion atypical enteropathogenic Escherichia coli of the O26: H11 serotype to extracellular matrix componentsRossato, Sarita Schneider 15 September 2009 (has links)
Cepas de Escherichia coli enteropatogênica (EPEC) estão entre os patógenos mais freqüentemente envolvidos em casos de diarréia. Este patotipo é subdividido em EPEC típicas e atípicas, sendo que as típicas possuem o gene eae (EPEC attaching and effacing) e o plasmídeo EAF (EPEC adherence fator), e as atípicas albergam somente o gene eae. A principal característica de sua patogênese é a formação de uma lesão histopatológica no epitélio intestinal denominada attaching and effacing (A/E), que resulta da adesão íntima da bactéria ao enterócito. A adesão é uma etapa crítica na patogênese bacteriana, sendo o primeiro pré-requisito para que as E. coli colonizem com sucesso a mucosa do hospedeiro. A ligação da bactéria a um ou mais componentes teciduais da matriz extracelular como colágeno I e IV, laminina, fibronectinas celular e plasmática são indícios de que essas moléculas estão sendo usadas como substrato de adesão e colonização do hospedeiro pela bactéria patogênica. Adesinas com capacidade de interagir com componentes da matriz extracelular já foram identificadas em bactérias patogênicas, no entanto, ainda não foi caracterizada nenhuma proteína de EPEC atípica com essa capacidade de adesão. Essa propriedade foi evidenciada em um isolado de EPEC atípica durante pesquisas em nosso laboratório e neste trabalho visamos identificar e caracterizar a(s) proteína(s) envolvida(s) nesta habilidade adesiva. As proteínas possivelmente envolvidas apresentam massas moleculares relativas de 107, 44 e 35 kDa e a pré-incubação do isolado 2103 com componentes de matriz extracelular provoca uma variação no seu padrão de adesão e influencia o número de bactérias aderidas a células epiteliais. No entanto, como esse patotipo é muito heterogêneo essa característica não pode ser extrapolada para todos os isolados dessa categoria. / Atypical Enteropathogenic Escherichia coli (EPEC) has been a leading cause of childhood diarrhea in developing countries. The main mechanism of atypical EPEC pathogenesis is a lesion called attaching and effacing (A/E), which is characterized by intimate adherence of the bacteria to the intestinal epithelium and destruction of microvillus. Nevertheless, it represents a heterogeneous group and other virulence factors may be involved in atypical EPEC pathogenesis. Previously, we have identified one isolate of atypical EPEC, serotype O26:H11, which secretes proteins that interact with ECM macromolecules. The interactions between pathogenic bacteria and ECM molecules such as fibronectin, laminin and collagen may play an important role in the bacterium adherence to and invasion of host cells. Adhesion is critical for successful E. coli colonization of gastrointestinal tract and is mediated by adhesins. The aim of this study is to identify and characterize putative adhesins that may contribute to the binding of the isolate of atypical EPEC to extracellular matrix components. The supernatant of the atypical EPEC isolate was submitted to a solid phase binding assay with matrigel (a mouse basement membrane composed mainly of laminin, collagen IV and fibronectin), the adhered proteins were stripped from the wells, separated by SDS-PAGE, transferred to nitrocellulose membranes and submitted to immunoblotting assay. Three major proteins of apparent molecular weights of 107, 44 e 35 kDa were recognized by the anti-proteins polyclonal serum (produced in rabbit immunized with the isolate\'s supernatant) through immunoblotting assay. Besides, we observed that in the presence of ECM components the isolate clearly changes its adherence pattern of the isolate to HEp-2 cells, and the number of adhered bacteria to epithelial cells. The atypical EPEC do not share a unique pattern of virulence, suggesting that many virulence factors may contribute to the pathogenesis. The identification of proteins involved in the adhesion with extracellular matrix components in one isolate of this category of diarrheagenic E. coli confirms the heterogeneity among the atypical EPEC.
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