Resumo: Um total de 196 amostras fecais de bezerros leiteiros mestiços, de 7 a 30 dias de idade de ambos o sexos foram colhidas em 31 propriedades com o objetivo de determinar a ocorrência de Cryptosporidium na região Noroeste do Estado de São Paulo, assim como caracterizar molecularmente as espécies envolvidas nesta parasitose. Realizou-se a análise microscópica pela técnica de coloração negativa com verde malaquita em todas as amostras de fezes. Para identificação molecular de Cryptosporidium, utilizou-se a reação de nested PCR, utilizando primers específicos para amplificação de fragmentos do gene codificador da subunidade 18S do RNA ribossômico e do gene da glicoproteína GP 60, submetendo o produto da PCR a sequenciamento e análise filogenética. Por meio de exame de fezes, foi observada positividade de 2% (4/196), por meio de microscopia, e de 10,7% (21/196) pela nested PCR. Como resultado do sequenciamento, foram identificadas quatro espécies de Cryptosporidium: C. parvum (subtipo IIa15G2R1) C. ryanae, C. bovis e C. andersoni. Esta descoberta de C. parvum subtipo IIaA15G2R1 na região estudada ilustra a utilidade da subtipagem. Embora estes resultados iniciais baseados em subtipos com GP60 sejam úteis para compreender a dinâmica de transmissão das espécies de Cryptosporidium, o número de amostras analisadas é relativamente pequeno e muito mais ainda pode ser pesquisado. É interessante notar que as informações de tipagem molecular com o gene 18S rRNA e a subtipagem com o gene GP60, permitem que os epidemiologistas possam rastrear as fontes de surtos das diferentes espécies de Cryptosporidium. / Abstract: A total of 196 fecal samples from crossbred calves, 7-30 days old of both sexes were collected in 31 properties with the objective of determining the prevalence of Cryptosporidium in the northwestern region of São Paulo, as well as characterizing the molecular species involved in this parasite. We performed microscopic analysis by the technique of negative staining with malachite green in all stool samples. For molecular identification of Cryptosporidium, we used the reaction of nested PCR using specific primers for amplification of gene fragments coding for the 18S subunit ribosomal RNA gene and the glycoprotein GP 60 by subjecting the PCR product sequencing and phylogenetic analysis. By stool examination, positivity was observed 2% (4 / 196) by means of microscopy, and 10.7% (21/196) by nested PCR. As a result of sequencing, we identified four species of Cryptosporidium: C. parvum (subtype IIa15G2R1) C. Ryanair, C. bovis and C. andersoni. This discovery of C. IIaA15G2R1 parvum subtype in the studied region illustrates the usefulness of subtyping. Although based on these initial results with GP60 subtypes are useful for understanding the transmission dynamics of the species of Cryptosporidium, the number of samples is relatively small and much more can still be searched. It is interesting to note that the information of molecular typing with 18S rRNA gene and subtyping with the GP60 gene, allow epidemiologists can track sources of outbreaks of different species of Cryptosporidium. / Orientador: Luiz Claudio Nogueira Mendes / Coorientador: Marcelo Vasconcelos Meireles / Banca: Ricardo Velludo Gomes de Soutello / Banca: Katia Denise Saraiva Bresciani / Mestre

Orientador: Urbano dos Santos Ruiz / Resumo: O objetivo desta pesquisa foi avaliar o aditivo alternativo, composto por ácido benzoico e óleos essenciais de eugenol, timol e piperina, associado ou não a antibiótico melhorador de desempenho na alimentação de leitões recém-desmamados. Foram utilizados 108 leitões, de linhagem genética comercial, em três fases: I - dos 21 aos 35 dias; II - dos 36 aos 50 dias; e III - dos 51 aos 63 dias de idade. As dietas foram isonutritivas, diferindo quanto à adição dos aditivos, da seguinte maneira: dieta sem qualquer aditivo melhorador de desempenho, dieta com adição de 40 ppm do antibiótico colistina, dieta com inclusão de 0,3% do aditivo alternativo, dieta com adições de 0,3 % do aditivo alternativo e de 40 ppm de colistina. Foram avaliados: o desempenho zootécnico, digestibilidades de nutrientes das dietas; incidência de diarreia; tempo de trânsito da digesta, morfologia intestinal, pesos relativos de órgãos do sistema digestório; composição da microbiota do conteúdo do ceco; e índices econômicos. Os animais foram distribuídos em blocos casualizados, de acordo com seus pesos ao início do experimento, com quatro tratamentos e nove repetições, sendo a unidade experimental a baia, composta por três animais na fase I e dois nas fases II e III. Como os animais não foram redistribuídos nos blocos ao final de cada fase, as análises estatísticas foram efetuadas de forma cumulativa, ou seja, do início do experimento ao final das fases I, II e III, em um esquema fatorial 2×2. Os dados foram su... (Resumo completo, clicar acesso eletrônico abaixo) / Abstract: The objective of this research was evaluate alternative feed additive, composed by benzoic acid and the essential oils of eugenol, thymus and piperine, associated or not with performance enhancer antibiotic, in newly weaned piglets feeding. One hundred and eight piglets, from a commercial lineage, were used in three phases: I – from 21 to 35 days; II from 36 to 50 days; and III – from 51 to 63 days. The diets were composed mainly by corn, soybean meal, spray dried blood plasma and dairy products, presenting the same levels of metabolizable energy, digestible amino acids, calcium and digestible phosphorous, differing over feed additive addition, as follows: diet without performance enhancer feed additive: diet with 40 ppm of colistin; diet with 0.3% alternative feed additive; diet with 40 ppm colistin and 0.3% alternative feed additive. The parameters evaluated were: growth performance; nutrient diets digestibility; diarrhea incidence; digesta transit time; intestinal morphology, weights of digestive organs (absolute and relative to body weight); microbial cecum content compositon; economical indices. The animals were distributed in blocks, according with their initial body weight, assigned to four treatments, with nine repetitions, and the experimental unit was the pen, with three animals in phase I e two, in phases II and III. As the animals were redistributed in blocks at the end of each phase, the statistical analysis were performed in a cumulative way, that is, from the b... (Complete abstract click electronic access below) / Mestre

A própolis é um produto natural elaborado pelas abelhas e vendido comercialmente, muito conhecida pela sua capacidade antimicrobiana, antioxidante e anti-inflamatória. Esse trabalho teve como objetivo caracterizar a influência da própolis vermelha no desempenho, metabolismo e ocorrência de doenças em bezerros leiteiros suplementados diariamente. Foram utilizados 32 bezerros recém-nascidos colostrados e alojados individualmente com acesso a água e concentrado inicial. Os animais foram colocados em blocos de acordo com o peso ao nascer, data de nascimento e sexo, distribuídos em dois tratamentos: 1) Controle e 2) Suplementação diária de 4mL/dia de extrato alcoólico de própolis (30%) no leite integral. O consumo de alimentos e o escore de saúde e fecal foram monitorados diariamente, já as pesagens foram realizadas semanalmente. Amostras de sangue foram colhidas semanalmente, duas horas após o aleitamento da manhã, para realização de hemograma, determinação de hematócrito e das concentrações de glicose, proteína total, &beta;-hidroxibutirato, lactato, ureia, além da capacidade de ligação de ferro. O tratamento não apresentou efeito para os dados de consumo, ganho de peso e desempenho (P>0,05). No entanto, os animais suplementados com própolis vermelha apresentaram significante redução no escore fecal e no número de dias com diarreia (P<0,05). Para os parâmetros sanguíneos, apenas a contagem de eritrócitos totais sofreu efeito do tratamento, apresentando redução em sua concentração nos animais suplementados (P<0,05). O extrato de própolis vermelha brasileira tem grande potencial como alternativa natural para diminuir a incidência de diarreia em bezerros leiteiros, reduzindo a utilização de antibióticos nos sistemas de criação de bezerras. / This study aimed to characterize the influence of propolis or bee glue in the performance, metabolism and diseases of dairy calves. Propolis is a natural product collect by bees and sold commercially, well know for its antibacterial, antioxidant and anti inflammatory effects and the ability to improve the immunity system, both for humans and for animals. For ruminants, there are many positive effects that can contribute positively to animal productivity. Thirty two newborn calves were individually housed, with free access to water and concentrate, and fed 6 L/day of whole milk. The animals were blocked according to their birth weight, birth date and sex, distributed in two treatments: 1) Control and 2) Daily supplementation of 4mL / day of red propolis alcoholic extract (30%) in milk. Food consumption, fecal score and health score of bronchopneumonia were monitored daily, and the weight of the calves were measured every week. Samples of blood were collected weekly, two hours after morning milk feeding, for hemogram and hematocrit determination. Determination of blood glucose, protein, &beta;-hydroxybutyrate, lactate, urea and iron binding capacity have also been done to evaluate effects on metabolism and oxidative stress. Starter feed intake, daily weight gain and body measurements were not affected by the red propolis supplementation (P>0.05). Blood parameters were also not affected (P>0.05), exception made for the red blood count, which were lower in animals supplemented with ethanolic red propolis extract (P<0.05). Fecal score and days with diarrhea were significantly affected by the treatment (P<0.05). Fecal score and days with diarrhea were inferior in animals supplemented with red propolis extract. Propolis has a big potential as a natural alternative to improve calves health, reducing the incidence of diarrhea and as a consequence, the use of antibiotics in calf rearing systems.

A proteína dispersina, codificada pelo gene aap, é um dos fatores de virulência de Escherichia coli enteroagregativa (EAEC). A detecção de aap tem sido utilizada juntamente com aggR e aatA no diagnóstico molecular de EAEC. Para verificar sua especificidade, esses genes foram pesquisados em 243 amostras de E. coli diarreiogênica (DEC). Todas as amostras foram negativas para os genes aggR e aatA, enquanto 26 amostras foram positivas para aap. Estas amostras haviam sido descritas como E. coli enteropatogênica atípica, entretanto essa classificação não foi confirmada, uma vez que elas não apresentaram o gene eae. Três amostras aderiram em células HEp-2 no padrão agregativo e foram classificadas como EAEC. O restante constituiu um grupo de amostras sem marcadores que caracterizam os patótipos de DEC. O seqüenciamento do gene aap de 6 amostras demonstrou alta homologia entre as seqüências obtidas e a seqüência da amostra protótipo de EAEC 042. Este estudo revelou que o gene aap não é exclusivo de EAEC. / The protein dispersin, encoded by aap, is one of the virulence factors of enteroaggregative Escherichia coli (EAEC). Detection of aap has been employed along with aggR and aatA in the molecular diagnosis of EAEC. In order to verify their specificity, these genes were searched in a collection of 243 diarrheagenic E. coli (DEC) strains. All of them were negative for aggR and aatA, whereas 26 were positive for aap. These strains have been described as atypical enteropathogenic E. coli. However, this classification was not confirmed since they did not harbor the eae gene. Three strains showed the aggregative adherence pattern to HEp-2 cells and were classified as EAEC. The remaining strains were part of a group that did not harbor any specific markers of DEC pathotypes. The DNA sequence analysis of 6 aap-harboring strains showed high homology between the sequence of these strains and the aap sequence of the EAEC prototype strain 042. This study revealed that aap is not exclusive of EAEC.

O objetivo deste estudo foi avaliar a suplementação de um probiótico composto por cepas de Bacillus subtilis e Bacillus licheniformis, fornecidos via sucedâneo lácteo, no que se refere ao escore e pH fecal, contagem de microrganismos intestinais, parâmetros sanguíneos e desempenho geral dos animais. Foram utilizados 24 animais da raça Holandês que receberam 4L/dia de sucedâneo comercial (15PB:15EE), além de livre acesso a água e concentrado inicial. O desaleitamento ocorreu na 8ª semana de vida. Os animais foram distribuídos em delineamento de blocos casualizados, em dois tratamentos: 1) Controle - sem a suplementação de probiótico; 2) Suplementação de 2g/d (1,6 x 109 UFC) de Bacillus subtilis e Bacillus licheniformis via sucedâneo lácteo. Semanalmente foram realizadas pesagens e aferições de medidas corporais (altura de cernelha, perímetro torácico e largura de garupa); e colheitas de sangue para determinação de glicose, proteína total, ureia e albumina, além de determinação de hematócrito. Foram colhidas amostras semanalmente para contagem de bactérias ácido láticas e enterobactérias e determinação de pH fecal. O monitoramento do consumo de concentrado e do escore fecal foi realizado diariamente. O peso corporal, o ganho de peso médio diário e as medidas corporais não foram alteradas (P>0,05) pela suplementação do probiótico contendo Bacillus subtilis e Bacillus licheniformis; muito embora tenham apresentado efeito significativo de idade dos animais (P<0,001). O escore fecal, pH fecal e consumo de concentrado diário também não foram afetados pela suplementação com probiótico. No entanto, o consumo de concentrado e o pH fecal sofreram influência da idade em resposta ao crescimento natural dos bezerros. A contagem de bactérias ácido láticas foi maior que número de enterobactérias durante todo o período (P<0,05). Apenas as enterobactérias sofreram efeito da idade (P<0,05), enquanto as bactérias ácido láticas permaneceram variando, porém dentro de um padrão constante. Os parâmetros sanguíneos também não foram afetados pela suplementação com probiótico (P>0,05) mas todos, com a exceção da albumina, tiveram influência da idade (P<0,001). A suplementação com o probiótico contendo Bacillus subtilis e Bacillus licheniformis via sucedâneo não apresentou benefícios no desempenho ou no metabolismo de bezerros leiteiros, bem como não reduziu a ocorrência de casos de diarreia. / The objective of this study was to evaluate the supplementation of a probiotic containing strains of Bacillus subtilis and Bacillus licheniformis, supplied via milk replacer, with regard to fecal score and pH, intestinal microorganisms count, blood parameters and overall performance of the animals. Twenty-four Holstein calves were utilized and received 4L/d of liquid diet consisting of commercial milk replacer (20CP:15EE), and had free access to water and starter concentrate. Weaning occurred at the 8th week of age. Animals were distributed in a randomized block design, in the following treatments: 1) Control - without supplementation with probiotic, 2) Supplementation: 2g/d of Bacillus subtilis and Bacillus licheniformis (1.6 x 109 CFU), via milk replacer. Every week calves were weighted and body measurements were taken (hip width, withers height and heart girth). Blood samples were drawn weekly for determination of hematocrit, glucose, total protein, urea and albumin. Fecal samples were weekly collected for lactic acid bacteria and enterobacteria couting and fecal pH determination. Concentrate starter intake and fecal scores were monitored daily. Body weight, average daily gain, and corporal measurements were not affected (P>0,05) by the supplementation of probiotic; however, presented a significant age effect (P<0,001). The fecal score, fecal pH and starter intake were not affected by probiotic supplementation (P>0.05). However, starter intake and fecal pH were affected by age due to calves\' natural growth. The acid lactic bacteria count was higher than the count of enterobacteria during the whole evaluation period. Only enterobacteria were affected by the age of animals, while acid lactic bacteria remained constant despite little variations. Blood parameters were also not affect by supplementation of probiotic (P>0.05), but all of them, except albumin concentrations, were influenced by age (P<0,001). The supplementation with probiotic containing Bacillus subtilis and Bacillus licheniformis via milk replacer presented no benefits in dairy calves performance or metabolism and did not reduced the occurrence of diarrhea.

aEPEC é capaz de causar lesão A/E, provocada por proteínas codificadas na região LEE. Foi realizada a análise estrutural e funcional da região LEE de amostras de aEPEC que expressam os padrões ALL, AA e AD, e amostra não aderente (NA). O padrão de adesão característico e capacidade de causar a lesão A/E foram investigados em células epiteliais. As amostras mantiveram o padrão de adesão independentemente da origem da linhagem celular. A lesão A/E foi detectada em algumas linhagens celulares após o contato com as amostras ALL e AD. A presença da região LEE foi detectada intacta e ensaios de PCR em tempo real, microarray e imunodetecção, mostrando a funcionalidade da mesma em todas as amostras. Um plasmídio que expressa a proteína EspFu foi introduzido em todas as 4 amostras, demonstrando não influenciar nos padrões de adesão e nem na capacidade de causar a lesão A/E nas amostras ALL, AA e AD. Mas, a amostra NA expressou o padrão ALL e foi capaz de causar a lesão A/E. Assim, EspFu desempenhou papel na adesão celular além do estabelecimento da lesão A/E in vitro. / aEPEC is capable to cause A/E lesion, triggered by proteins encoded by LEE region. We analyzed structurally and functionally the LEE region of aEPEC strains displaying LAL, AA, DA, and one nonadherent (NA) strain. The adherence characteristics and ability to cause A/E were investigated in epithelial cells. The displayed adherence patterns were independent of the cell line origin. A/E lesion was detected in some cellular lines after contact only with ALL- and AD-strains. LEE region presence was detected intact and real time PCR, microarray and immunodetection, in all samples tested. An EspFu-expressing plasmid was introduced in all strains, demonstrating no influence of this protein neither in the adherence patterns nor in the capacity to cause A/E of the LAL-, AA- and DA-strains. But, NA-strain expressed the LAL pattern and was able to cause A/E. Therefore, EspFu was shown to play a role in cell adhesion in addition to the establishment of the A/E lesion in vitro.

A diarreia é apontada mundialmente como uma das principais enfermidades que acometem bovinos. Estudos em diferentes países tem reconhecido a participação do Torovírus Bovino (BToV) na etiologia de enterites em bezerros e bovinos adultos. Devido à inexistência de dados a respeito da sua ocorrência no Brasil, o presente estudo foi conduzido buscando detectar a presença deste vírus em amostras fecais diarreicas. Através da técnica de nested-RT-PCR dirigida para o gene que codifica a proteína do nucleocapsídeo (N), analisou-se 80 amostras fecais de animais com diarreia, jovens e adultos, dos estados de Mato Grosso, Rio Grande do Sul e São Paulo. Obteve-se amplificação de fragmento do gene N em 5 das amostras estudadas. Após clonagem em vetor plasmidial de 3 das amostras, confirmou-se a especificidade dos fragmentos obtidos. Através de estudo de diversidade molecular, demonstrou-se a presença de duas linhagens brasileiras, ambas relacionadas com as sequências reportadas na Europa e Japão. / Diarrhea is pointed worldwide as a major disease affecting cattle. Studies in different countries have recognized the role of Bovine Torovirus (BToV) in the etiology in enteritis in calves and adult cattle. Due to lack of data about its occurrence in Brazil, this study was conducted to detect the presence of this virus in diarrheic stool samples. Using the nested-RT-PCR technique directed for the gene encoding the nucleocapside protein (N gene), we analyzed 80 stool samples from animal with diarrhea, calves and adults, from states of Mato Grosso, Rio Grande do Sul and São Paulo. We obtained amplification of gene N fragments in 5 samples. Three positive for BToV samples were clones in a plasmidial vector and then submitted to sequencing for confirmation of specificity. Studies of molecular diversity were showed the presence of 2 strains of BToV in Brazil, both related with sequences reported in Europe and Japan.

E. coli enteropatogênica atípica (aEPEC) é um importante patótipo causador de diarréia. As cepas de aEPEC não produzem BFP, sugerindo que outras fimbriais estão envolvidas na adesão de aEPEC ao hospedeiro. ECP é encontrada na maioria das cepas patogênicas e não patogênicas de E. coli. O objetivo do estudo foi avaliar a expressão e produção de ECP em cepas de aEPEC. A presença do operon ecp foi avaliada por PCR e a expressão avaliada por PCR utilizando cDNA obtido a partir do cultivo bacteriano em LB, DMEM e DMEM pré-condicionado. A produção de ECP foi avaliada por imunofluorescência. Foi observado que a expressão, por todas as cepas, só ocorreu quando foram cultivadas em DMEM pré-condicionado. Houve expressão diferencial do operon com o cultivo em LB ou DMEM. A produção de ECP foi observada apenas puma cepa quando cultivada em LB. Já em DMEM, três cepas produziram ECP. Houve um aumento do número de cepas produtoras da fímbria com o cultivo em DMEM pre condicionado. Esses resultados sugerem que a sinalização celular pode interferir na expressão e produção da ECP. / Atypical enteropathogenic E. coli (aEPEC) is an pathotype that causes diarrhea. aEPEC does not produce BFP, suggesting that other pili must be involved in aEPEC adhesion to the host cell. ECP is found in most pathogenic and non-pathogenic E. coli. The objective of this study was to evaluate the expression and production of ECP in aEPEC. The presence of ecp operon was assessed by PCR and the expression evaluated by PCR using cDNA obtained from bacterial growth in LB, DMEM and preconditioned DMEM. ECP production was evaluated by immunofluorescence. It was observed that the operon expression by all strains only occurred when they were grown in preconditioned DMEM. There was differential expression of ecp operon when strains were grown in LB or DMEM. ECP production was observed only by one strain when grown in LB. Three strains producted ECP grown in DMEM, but there was a higher production of the pili when strains were grown in DMEM preconditionated. These results suggest that cellular signaling may interfere with the expression and production of ECP.

Um total de 144 amostras fecais colhidas de leitões com diarréia provenientes de diversas granjas distribuídas por 10 municípios do Estado de São Paulo, Brasil, foram examinadas para a presença de rotavírus através de eletroforese em gel de poliacrilamida e ELISA, num esquema de triagem em paralelo. Destas, 24 e 39 amostras foram, respectivamente, positivas por estes testes e a caracterização dos genotipos P e G foi realizada em 43 amostras por nested RT-PCR, usando diferentes conjuntos de primers. Utilizando-se primers animais, o genotipo P[6] foi o mais freqüente, detectado em 25,58% das amostras, seguido pelo P[1] (11,62%) e P[7] (9,3%). Infecção concomitante de genotipos P[6]+P[7] (9,3%), P[1]+P[6] (4,65%), P[1]+P[6]+P[7] (2,32%) foi também observada. O genotipo G[5] foi o mais freqüente, detectado em 30,23% das amostras, seguido pelo G[10] (20,93%) e G[6] (4,65%). Infecção concomitante de genotipos G[5]+G[10] (18,6%) foi também observada. Utilizando-se primers humanos, somente o genotipo P[6] (65,11%) foi encontrado. Foram detectados os genotipos G[4] (27,9%), G[3] (13,95%) nas amostras, e as infecções concomitantes G[3]+G[4] (9,3%), G[2]+G[3]+G[4] (4,65%) e G[2]+G[3] (2,32%). A combinação mais freqüente foi G[5]P[6] e G[4]P[6], porém foram encontradas também infecções mistas, genotipos atípicos e reassortants. O seqüenciamento do gene a partir dos produtos de nested PCR dos genotipos animais P e G mostrou diversidade de nucleotídeos e aminoácidos dentro de um mesmo genotipo. As árvores filogenéticas utilizando o critério de maxima parcimônia e o algoritmo branch-and-bound, tiveram topologias nas quais as seqüências de nucleotídeos geradas neste trabalho concordam com as outras descritas anteriormente e pertencentes a um mesmo genotipo, suportadas por índices aceitáveis de \"bootstrap\". Os resultados deste estudo, além de contribuir para um melhor entendimento da epidemiologia dos rotavírus suínos, é relevante ao mostrar que além de haver uma diversidade de genotipos circulantes no campo, há também dentro dos mesmos genotipos, e isto deve ser considerado ao se utilizar e desenvolver métodos de diagnóstico, bem como ao se adotarem medidas preventivas específicas contra esta doença. / A total of 144 fecal specimens collected from piglets with diarrhea from many swine-producing units distributed among 10 municipalities of São Paulo State, Brazil, were examined for rotavirus by polyacrylamide gel electrophoresis and ELISA, in a parallel screening scheme. Twenty-four and thirty-nine samples, respectively, were positive by these tests and the characterization of the P and G genotypes was performed on 43 samples by a nested reverse transcription-PCR typing assay, using different sets of primers. Using the animal set of primers, the P[6] genotype was the most frequent, accounting for viruses in 25.58% of the samples, followed by P[1] (11.62%) and P[7] (9.3%). Concomitant infection of P[6]+P[7] (9.3%), P[1]+P[6] (4.65%), P[1]+P[6]+P[7] (2.32%) genotypes was also observed. The G[5] genotype was the most frequent, accounting for viruses in 30.23% of the samples, followed by G[10] (20.93%) and G[6] (4.65%). Concomitant infection of G[5]+G[10] (18.6%) genotypes was observed. Using human set of primers, only the P[6] (65.11%) genotype was found. It was detected the genotypes G[4] (27.9%), G[3] (13.95%) on the samples. Concomitant infection of the genotypes G[3]+G[4] (9.3%), G[2]+G[3]+G[4] (4.65%) and G[2]+G[3] (2.32%) was also observed. The more frequent combination were G[5]P[6] and G[4]P[6], but it was found mixed infections, atypical genotypes and reassortants. Gene sequencing of nested products of G and P animal genotypes showed a diversity of nucleotides and aminoacids under the same genotype. The phylogenetic trees for P and G genotypes under the maximum parsimony criterion, using the branch-and-bound algorithm, had topologies in which the nucleotide sequences generated by this work agree to others described elsewhere that have the same genotypes, supported by acceptable scores of bootstrapping. The results of the present study, while contributing to a better understanding of epidemiology of porcine rotaviruses, address the relevance that there is not only a diversity of genotypes circulating on the field, but inside the same genotypes, and this must be considered when using and developing diagnostic tests, as well when carrying out specific preventive measures against this disease.

Worldwide, diarrhea is the second leading cause of death in children aged under 5, yet it is both preventable and treatable. Several studies have established the effects of exposure to inadequate water, sanitation, and hygiene (WASH) on diarrhea prevalence, but little was known on how the interactions of socioeconomic status and WASH influence the economic cost of treatment of diarrhea. This retrospective cross-sectional survey study was focused on assessing the correlation between socioeconomic status, WASH, and household cost of treatment of diarrhea among children aged under 5 in Uganda using the multiple exposure-multiple effect model. Secondary data from the 2015/16 Uganda National Panel Survey were used. At bivariate level of analysis, 5 of 6 independent variables (education level of mother, household expenditure, residence type, source of drinking water, and type of toilet facility) had statistically significant associations with household cost of treatment of diarrhea (p value < .05). The multivariate-hierarchical multiple linear regression indicated that only 3 of the 6 variables significantly predicated household cost of treatment of diarrhea. These were highest education level of mother (p = 0.001), source of drinking water (p = 0.022), and type of toilet facility (p = 0.012). At p value < .05, about 67% of the variation in the cost of treatment was explained by the independent variables. Households with a higher socioeconomic status incurred higher costs of treatment, although those with a lower status experienced the highest prevalence rates. Therefore, policy makers and practitioners could use these findings to employ multiple interventions to address the disease burden and cause behavior change.