This item was digitized as part of the Million Books Project led by Carnegie Mellon University and supported by grants from the National Science Foundation (NSF). Cornell University coordinated the participation of land-grant and agricultural libraries in providing historical agricultural information for the digitization project; the University of Arizona Libraries, the College of Agriculture and Life Sciences, and the Office of Arid Lands Studies collaborated in the selection and provision of material for the digitization project.

Thesis (MSc (Microbiology))--Stellenbosch University, 2008. / The genus Fusarium contains members that are phytopathogens of a number of agricultural commodities causing severe diseases such as wilts and rots. Fusarium species also secrete mycotoxins that have devastating effects on humans and animals. The ability of Fusarium species to change their genetic makeup in response to their immediate environment allows these fungi to exist in diverse habitats. Due to the ubiquitous nature of Fusarium, it forms part of the fungal communities in both agricultural and native soils. Fynbos is the major vegetation type of the Cape Floristic Region (CFR), which is a region that is renowned for its high plant species diversity and endemism. In this study, the occurrence and distribution of Fusarium species in indigenous fynbos soils and associated plant debris is investigated. In addition, the phylogenetic relationships between Fusarium species occurring in this particular habitat are evaluated. Fusarium isolates were recovered from soils and associated plant debris, and identified based on morphological characteristics. The morphological identification of isolates was confirmed using Polymerase Chain Reaction (PCR) based restriction fragment length polymorphism (RFLP) analyses of the translation elongation factor 1 alpha (TEF-1α) and internal transcribed spacer (ITS) regions. Furthermore, phylogenetic relationships between Fusarium species were based on the TEF-1α, ITS and β-tubulin gene regions. One-hundred-and-twenty-two (122) Fusarium strains were isolated from the fynbos soils in the Cape Peninsula area (Western Cape). Based on both morphological and molecular identification, the most prevalent Fusarium species in the fynbos soils were F. oxysporum Schlecht. emend. Snyd. and Hans., F. solani (Martius) Appel and Wollenw. emend. Snyd. and Hans., F. equiseti (Corda) Sacc. and an undescribed Fusarium species. Fusarium oxysporum was the dominant species in fynbos soils and strains of this species displayed significant genetic variability. Some strains of both F. oxysporum and F. solani showed close phylogenetic affinities to formae speciales (strains pathogenic to specific plant hosts) in the phylogenetic analyses. However, no diseased plants were observed in and within the vicinity of our sampling sites. In the third chapter, the undescribed Fusarium strains are described as Fusarium peninsulae prov. nom. Morphologically these strains are characterized by falcate macroconidia produced from brown sporodochia. The macroconidia are pedicellate, falcate to curved with hooked apical cells. Also, this fungus produces apedicellate mesoconidia on polyphialides in the aerial mycelium and forms microconidia sparsely. Chlamydospores are formed abundantly on aerial mycelium and submerged hyphae. All these morphological characteristics closely relate this fungus to F. camptoceras species complex in Fusarium section Arthrosporiella. However, phylogenetic analysis based on the ITS sequences differentiate these strains from F. camptoceras and other related species in section Arthrosporiella. Considering the fact that both as phytopathogens and saprophytic fungi, Fusarium species secrete a variety of cell wall degrading enzymes such as cellulases and xylanases. These enzymes allow the fungi to degrade the plant cell wall components to obtain nutrients. In Fusarium, notably endoxylanases play a role in phytopathogenesis of these fungi. Endoxylanase enzymes from F. oxysporum f. sp. lycopersici, F. verticillioides and F. graminearum have been characterized. In this final chapter, the use of the endoxylanase encoding gene, as a molecular marker in phylogenetic analysis was evaluated using F. graminearum (Fg) clade species as model. Degenerated primers were designed and the endoxylanase region amplified by PCR, cloned and sequenced. PAUPgenerated neighbour-joining analysis of the endoxylanase (XYL) region enabled all species to be distinguished and was as informative as the analysis generated with UTPammonia ligase (URA), phosphate permase (PHO), reductase (RED) and trichothecene 3- О-acetyltransferase (TRI101). Furthermore, the results of the phylogenetic analysis of XYL showed better species resolution in comparison to the analysis of the structural genes (TEF-1α and histone H3). Overall, the results demonstrated that phylogenetic analysis of XYL combined with other functional genes (URA, PHO, RED and TRI101) clearly distinguished between the Fg clade species far better than the analysis of structural genes (TEF-1α and histone H3).

Fusarium Ear Blight (FEB) is a globally important floral disease of cereal crops such as wheat, maize and barley. The predominant causal agents of FEB disease of wheat in the UK are Fusarium culmorum and F. graminearum. Wheat infecting isolates of both of these fungal species infect the floral and silique tissues of the model plant Arabidopsis thaliana, providing a tractable model for analysis of factors determining plant susceptibility or resistance to Fusarium infection. The effect of F. culmorum infection on the metabolic composition (metabolome) of Arabidopsis pedicel tissue following silique inoculation was investigated in a collection of mutants with altered defence responses to F. culmorum and/or other plant pathogens, using a 1¬H-NMR/ESI-MS (+/-) triple fingerprinting approach. These mutants showed differing metabolomic fingerprints in the absence of F. culmorum infection, as well as differences in accumulation or depletion of metabolites in response to F. culmorum colonisation. A number of metabolites were also identified which were induced by F. culmorum infection irrespective of plant genotype. Quantitative differences in compound accumulation were also observed between genotypes in the Columbia and Landsberg erecta accessions following F. culmorum infection. One of the genotypes investigated was eds11, which has enhanced susceptibility to F. culmorum floral infection. Mapping of the mutation responsible for the eds11 phenotype was initiated using an isogenic mapping by sequencing approach. This resulted in a list of potential candidates for the EDS11 gene. Additional Arabidopsis mutants were investigated for altered defence responses to F. culmorum floral infection. Multiple mutant alleles of the Arabidopsis homoserine kinase gene DMR1 were found to have enhanced resistance to F. culmorum silique infection and rosette leaf colonisation, associated with accumulation of homoserine in siliques and delayed leaf senescence. Exogenous homoserine application enhanced resistance in wild type and dmr1 plants. Collectively, these findings form a novel contribution to current knowledge of the Fusarium-Arabidopsis interaction. This may have applications for improvement of FEB resistance in cereals.

O gengibre é uma das especiarias mais importantes e amplamente utilizadas no mundo. Atualmente, a maior produção desta cultura concentra-se nos estados do sul do Brasil, sendo grande parte destinada para exportação. A geração de renda e a manutenção da variabilidade genética do gengibre são feitas principalmente pela agricultura familiar. Portanto, com o objetivo de continuar incrementando a diversidade genética do gengibre e contribuir com uma adoção rápida de variedades com melhor rendimento, adaptadas às características dos campos dos agricultores, e com resistência à principal doença desta cultura (Fusariose), este trabalho visou selecionar genótipos de gengibre do banco de germoplasma da ESALQ/USP com características relacionadas às prioridades dos agricultores do vale de Caraguatatuba - Ubatuba e que possuam algum nível de resistência a Fusarium oxysporum. Para tal, esta pesquisa foi dividida em duas partes. Primeiramente, desenvolveu-se um processo de melhoramento genético participativo, onde os agricultores ajudaram a identificar as prioridades de seleção de gengibre, procurando características que sejam adequadas às suas necessidades e na identificação da sintomatologia de fusariose mediante escala de notas. Na segunda parte, foi feita uma seleção de genótipos promissores por meio de avaliações em campo e casa de vegetação, através de uma análise de interação genótipo x ambiente. Os resultados mostraram que as prioridades de melhoramento escolhidas pelos agricultores foram resistência a doenças e pragas, altos rendimentos, estabilidade no tempo, variedades que consigam suprir necessidades de venda in natura e industrializado e com capacidade de atender diferentes tipos de mercado. Dentre os genótipos avaliados pelos agricultores, foram selecionados os genótipos G7, G16, G20, G22, G29, G31, G33, G47, G49, G51, G53, G58, G61 e G66 como resistentes e com características agronômicas promissoras. Nas avaliaçãoes de campo e casa de vegetação observou-se que dos 49 genótipos analisados, G47 apresentou o maior nível de resistência, enquanto que G11, G23, G30, G43 e G64, foram identificados como genótipos resistentes. Desses genótipos selecionados como resistentes apenas os genótipos G23 e G64 foram promissores, apresentando estabilidade na resistência, produção, formação de perfilhos, e caracteres qualitativos de interesse agronômico. Entre os genótipos selecionados mediante melhoramento clássico e os selecionados com melhoramento participativo houve apenas uma coincidência na seleção (G47) referente à sintomatologia, mas ao ser testado para estabilidade referente à doença, este genótipo apresentou alta inestabilidade no tempo, não se mostrando adequado para recomendação como variedade resistente. Dessa forma, novos estudos deverão ser desenvolvidos visando testar estes genótipos em outros ambientes. / Ginger is the most important and widely used spice in the world. Currently, the greater production of this crop is focused in the southern states of Brazil, where most of the production is destined for export. The generation of income and the maintenance of genetic variability of ginger are provided mainly by family farming. Therefore, with the objective to continue increasing genetic diversity of ginger and contribute with a rapid adoption of varieties with better yield, adapted to farmers\' fields characteristics, and resistance to the main disease of this crop (fusariosis), this work aimed at selecting ginger genotypes from the germplasm bank of ESALQ/USP with characteristics related to the priorities of the farmers from Caraguatatuba-Ubatuba Valley, presenting some level of resistance to Fusarium oxysporum. Therefore, this research was divided in two parts. First, a participatory breeding process was developed, where farmers helped to identify the priorities of selection in ginger, searching for features that are appropriate to their needs and to identify the symptoms of Fusarium by grading scale. In the second part, a selection was made of promising genotypes through evaluations in the field and in a greenhouse, through an analysis of genotype x environment interaction. Results showed that the farmers’ breeding priorities were resistance to diseases and pests, high income, stability in time, varieties that are able to meet sales requirements both in natura and industrialized, including ability to supply different market types. Among the genotypes evaluated by the farmers, the genotypes G7, G16, G20, G22, G29, G31, G33, G47, G49, G51, G53, G58, G61 and G66 were selected as being resistant and with promising agronomic characteristics. In the field and greenhouse evaluations, it was observed that from the 49 genotypes analyzed, genotype G47 showed the highest level of resistance, while G11, G23, G30, G43 and G64, and were identified as resistant genotypes. From these genotypes selected as resistant only G23 and G64 were promising, showing stability in resistance, production, tillers production, and qualitative traits of agronomic interest. Among the genotypes selected by classical breeding and those selected through participatory breeding, there was only one coincidence in the selection (G47) related to symptoms, but when tested for disease stability, it presented high instability in time, not being suitable for recommendation as a resistant variety. Thus, further studies should be developed aiming to test these genotypes in other environments.

Os membros do complexo de espécies Fusarium graminearum (CEFG) estão entre os mais importantes fungos micotoxigênico que infectam tecidos florais e interferem no desenvolvimento dos grãos de cereais resultando na redução da produtividade e qualidade dos grãos. Sais imidazólicos (SI) são compostos orgânicos constituídos por um grande cátion orgânico em conjunto com um ânion e alquilo substituintes. Os cátions e ânions constituintes modificam as propriedades químicas e físicas resultando no surgimento de características interessantes destes compostos, que incluem natureza anfifílica e baixa toxicidade para as células humanas. Recentemente, SI foram testados contra fungos e bactérias patogênicas para o homem com resultados promissores. O objetivo deste estudo foi investigar a atividade antifúngica de SI contra o CEFG que afetam grãos de trigo. A sensibilidade de F. graminearum, F. asiaticum e F. meridionale foi avaliada frente a três SI, que variaram quanto aos ânions substituintes (C16MImCl, C16MImMeS e C16MImNTf2), e um fungicida comercial (tebuconazol). A avaliação foi realizada com base na germinação dos esporos e na inibição efetiva de 50% do micélio. A concentração inibitória mínima (CIM) variou de 1,56 a 6,25 μg/mL, e o CIM mais frequente foi determinado em 3,12 μg/mL. Apenas um SI, cloreto de 1-n-hexadecil-3-metilimidazolio - C16MImCl, foi capaz de reduzir 50% do crescimento micelial in vitro (CE50) para todos os isolados, a uma concentração de 0,321 g/L. As curvas de tempo de morte indicaram que o SI C16MImCl apresenta efeito fungicida significativo na concentração de 12,48 μg/mL, com a ação iniciada desde a primeira hora de incubação, que foi mantida durante o desenvolvimento do ensaio. O SI C16MImCl foi pulverizado sobre as espigas de trigo durante a floração suprimindo com sucesso os sintomas e controlando F. graminearum nas espigas e grãos quando aplicado de forma preventiva (antes da inoculação fúngica) e na dose mais elevada (2 g/L), não diferindo do fungicida usual tebuconazol. Os dados sugerem o uso potencial do SI C16MImCl para o controle do fungo micotoxigênico F. graminearum em doenças que afetam o trigo especialmente quando aplicados antes da infecção fúngica. / Members of the Fusarium graminearum species complex (FGSC) are among the most important mycotoxigenic fungi that infect floral tissues and developing kernels of cereal crops, and lead to reduced grain yield and quality. Imidazolium salts (IMSs), are organic compounds composed entirely of a large organic cation together with an anion and alkyl substituents. The cation and/or anion constituents modifiy the chemical and physical properties which may result in the emergence of interesting properties of these compounds that include an amphiphilic nature, low toxicity to human cells . Recently, IMSs have been tested against fungi and bacteria that are pathogenic to humans with promising results. The aim of this study was to investigate the antifungal activity of imidazolium salts (IMS) against FGSC which affects wheat grains. The sensitivity of F. graminearum, F. asiaticum and F. meridionale isolates to three IMS, which vary in substituent anions (C16MImCl, C16MImMeS and C16MImNTf2), and one commercial fungicide (tebuconazole) was evaluated based on spore germination and mycelial growth inhibition. The minimum inhibitory concentration (MIC) ranged from 1.56 to 6.25 μg/mL, with 3.12 μg/mL as the most frequent MIC. Only one IMS, 1-n-Hexadecyl-3-methylimidazolium chloride (C16MImCl), was able to reduce 50% of the in vitro mycelial growth (EC50) for all isolates at a concentration of 0.321g/L. The time-kill curves indicated a significant fungicidal effect at the concentration of four times the MIC (12,48 μg/mL), starting since one hour after incubation, which was maintained during the course of the experiment. The IMS C16MImCl sprayed onto the wheat spikes during flowering succesfully supressed symptoms and control of the disease in the spikes and kernels when applied preventatively (before fungal inoculation) at the highest dosage (2 g/L), not differing from tebuconazole. The data suggests the potential of using an IMS for controlling mycotoxigenic Fusarium and the resulting disease affecting wheat, especially when applied prior to fungal infection.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-02-20T13:53:01Z No. of bitstreams: 1 Denise de Santana Silva.pdf: 550225 bytes, checksum: ad8bfba40464a81bb730c91685eba898 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-20T13:53:01Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Denise de Santana Silva.pdf: 550225 bytes, checksum: ad8bfba40464a81bb730c91685eba898 (MD5) Previous issue date: 2009-01-23 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Heliconias are the most cultivated flowers in tropical floriculture of the Brazil northeast, due to its characteristics like beauty, exotic, exuberant colors and rusticity, but its yield has being affected by Fusarium wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. cubense. The present study had how objective to determine the genetic diversity existing between the isolates of F. oxysporum f. sp. cubense collected in heliconia and banana through the ITS region of rDNA using ARDRA (Amplified Ribossomal DNA Restriction Analysis), markers like RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). In the ARDRA analysis products amplified by ITS1 and ITS4 primers were digested by restriction enzymes Hae III, Xho I, Hind III and Eco IV by 37ºC. But only enzyme Hae III showed to be efficient a molecular marker, to analysis genetic diversity of F. oxysporum f. sp. cubense to RAPD marker was realized the Polymerase Chain Reaction (PCR) using tenoligonucleotides follow arbitrary up, only seven oligonucleotides generated a total 44 bands polymorphic with fragments varying from 100 pb to 700 pb. The two techniques used in the study genetic diversity showed high genetic variability of fungal, don’t related to with geographical region where were colleted the isolates. / As helicônias são as flores mais cultivadas dentro da floricultura tropical no Nordeste brasileiro, devido a características como beleza, exoticidade, cores exuberantes e rusticidade, porém a produção de várias espécies vem sendo afetada pela murcha de fusário, causada pelo fungo de Fusarium oxysporum f. sp. cubense. O presente trabalho teve como objetivo caracterizar a diversidade genética existente entre os isolados de F.oxysporum f. sp. cubense, coletados em helicônias e bananeiras através da análise da região ITS do rDNA utilizando ARDRA (Amplified Ribossomal DNA Restriction Analysis) e marcadores do tipo RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Para a amplificação da região do rDNA, foram utilizados os primers ITS1 e ITS4 que foram digeridos pelas enzimas de restrição Hae III, Xho I, Hind III e Eco IV a 37ºC. Porém apenas a enzima Hae III, neste trabalho mostrou ser um marcador molecular eficiente,utilizada na técnica de ARDRA para estudos de diversidade genética dos isolados. Para o marcador RAPD realizou-se a Polymerase Chain Reaction (PCR) utilizando-se dez oligonucleotídeos de seqüência arbitrária, onde apenas sete oligonucleotídeos geraram um total de 44 bandas polimórficas com fragmentos que variaram de 100pb a 700pb. As duas técnicas utilizadas no estudo de diversidade genética evidenciaram alta variabilidade genética do fungo, não relacionada com as regiões geográficas onde foram coletados os isolados.

Submitted by Mario BC (mario@bc.ufrpe.br) on 2017-03-14T13:04:27Z No. of bitstreams: 1 Jose Aldo Teixeira da Silva.pdf: 972040 bytes, checksum: d6bba973ec0295e20860c1178753f8e3 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T13:04:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Jose Aldo Teixeira da Silva.pdf: 972040 bytes, checksum: d6bba973ec0295e20860c1178753f8e3 (MD5) Previous issue date: 2015-10-26 / Cassava has economic importance in Brazil and abroad, for their food importance. The Northeast is the region that most increased this crop in Brazil, but farmers use few technologies, resulting in diseases and decline in production. The crop is attacked for numerous pathogens as Fusarium solani and Scytalidium lignicola, that causes diseases such as cassava root rot and cassava black root, affecting the commercial part of plant, the tubera. Several research, support the use of practices that enable the production and support the environment, so the use of biocontrol has been used, particularly with the use of Trichoderma spp. However, little research reporting the physiological mechanisms that are activated by plants when exposed to this interaction, pathogen-plant-antagonist such as plant response to infection diseases. Thus, the objective this work was to verify the potential antagonism of Trichoderma spp. against F. solani and S. lignicola, and evaluating the physiological response of plants exposed to the pathosystem. We analyzed in vitro inhibition of mycelial growth of F. solani and S. lignicola to select the best Trichoderma antagonist with potential direct these pathogens. By the method of use of basal medium with colloidal chitin as the only carbon source, it was used to evaluate the best Trichoderma production of chitinase. In greenhouse, the selected Trichoderma was compared against the use of plant resistance inducer in vivo inhibition assessing the severity of disease infested plants after 92 days of growth. Then we evaluated the enzyme of antioxidative complex (peroxidase ascorbate, catalase, peroxidase and polyphenyl oxidase). All strains were inhibited the growth of pathogens. However, the best strain against F. solani was T. hamatum (6656), and has been for S. lignicola was T. harzianum (3086), with values of 88.91 and 80.78% growth mycelial respectively, being designated as the best candidates for treatments in the greenhouse. For chitinase production evaluation, all Trichoderma tested were positive, highlighting the T. aureoviride (5158) to produce 6.70 U mL-1, being selected candidate for inhibiting the severity of pathogens in greenhouse. All Trichoderma selected for in vivo testing against the severities of diseases, presented efficiency compared to the control with the presence of the pathogen. However, the T. aureoviride (5158), showed the blunt values for both pathogens. The results of the enzymes of the plants, treatments that stopped inoculation of Trichoderma showed satisfactory results, collaborating with the answer in a greenhouse, however, again treating with the strain (5158), showed the best values, especially the production of the enzymes peroxidase and ascorbate peroxidase. Therefore, concludes the efficiency of Trichoderma aureoviride (5158), for use as biocontrol of root rot and black rot of cassava as induced resistance to plant pathogens, contributing to the production of enzymes antioxidatives. / A mandioca tem grande expressão econômica no Brasil e no mundo, pela sua importância alimentar. O Nordeste é a região que mais aumentou a produção dessa cultura no Brasil, porém, os produtores usam poucas tecnologias, acarretando em possíveis desenvolvimentos de doenças e queda na produção. A cultura sofre muitas perdas na produção pela ação de inúmeros fitopatógenos, sendo os do solo os mais severos, o Fusarium solani e Scytalidium lignicola, ganham ênfase por causarem doenças como a podridão radicular e negra da mandioca, respectivamente, afetando diretamente a parte comercial da planta, a tubera. Muitas pesquisas, apoiam o uso de práticas que viabilizem a produção e favoreçam o ambiente, assim, a utilização de biocontroladores vem ganhando destaque, principalmente fungos do gênero Trichoderma spp., por suas características como antagonistas de uma gama de fitopatógenos. Todavia, há poucas pesquisas que relatam os mecanismos fisiológicos que são ativados pelas plantas, quando expostos a essa interação, patógeno-planta-antagonista, como resposta vegetal a infecção de doenças. Desse modo, objetivou-se verificar o potencial antagônico de dez Trichoderma spp. aos patógenos F. solani e S. lignicola, e avaliar a resposta fisiológica das plantas exposta a esse patossistema. Foi analisado, in vitro, a inibição do crescimento micelial do F. solani e S. lignicola em meio batata-dextrose-ágar, para selecionar o melhor Trichoderma com potencial antagonista direto a esses patógenos. Através do método da utilização de meio basal com quitina coloidal, sendo a única fonte de carbono, foi utilizada para avaliar o melhor Trichoderma para produção de quitinase. Em casa de vegetação, foi comparado os Trichoderma selecionados, contra o indutor de resistência, in vivo, avaliando a inibição das doenças infestadas nas plantas, após 92 dias de crescimento. Em seguida, avaliou-se a produção de enzimas das plantas dos tratamentos in vivo, do complexo oxidativo (ascorbato peroxidase, catalase, peroxidase e polifeniloxidase). Todas as estirpes apresentaram inibição do crescimento dos fitopatógenos. Porém, a melhor estirpe contra o F. solani foi o T. hamatum (6656), e para o S. lignicola foi o T. harzianum (3086), com valores de 88,91 e 80,78% de inbiçao de crescimento micelial, respectivamente, sendo designados como os melhores candidatos para tratamentos em casa de vegetação. Para a avaliação de produção de quitinase, todos os Trichoderma testados foram positivos, destaque dado ao T. aureoviride (5158) por produzir 6,70 U mL-1, sendo selecionado para candidato da inibição da severidade dos patógenos em casa de vegetação. Todas os Trichoderma selecionados para teste in vivo contra as severidades das doenças, apresentaram eficiência em comparação ao controle com a presença do patógeno. No entanto, o T. aureoviride (5158), foi a que apresentou valores contundentes para os dois patógenos. Dos resultados das enzimas das plantas, os tratamentos que detiveram a inoculação dos Trichoderma apresentaram resultados satisfatórios, colaborando com a resposta em casa de vegetação, contudo, novamente o tratamento com a estirpe (5158), foi a que apresentou melhores valores, com destaque a produção das enzimas ascorbato peroxidase e peroxidase. Portanto, conclui-se a efiência do Trichoderma aureoviride (5158), para uso como biocontrolador da podridão radicular e da podridão negra da mandioca, pois induziu resistência a planta aos fitopatógenos, colaborando com a produção das enzimas antioxidativas.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-14T16:35:35Z No. of bitstreams: 1 Litervaldo Pereira Machado.pdf: 672024 bytes, checksum: 9d3735863709f5a0cf0be5231401e55c (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-14T16:35:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Litervaldo Pereira Machado.pdf: 672024 bytes, checksum: 9d3735863709f5a0cf0be5231401e55c (MD5) Previous issue date: 2008-02-26 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / The cotton wilt caused by Fusarium oxysporum f. sp. vasinfectum is one of the most important cotton diseases of the world. This disease is potentially destructive and had caused losses to cotton farms in the main cotton growing area in Brazil. The use of resistant cultivars is the main recommended practice to manage fusarium cotton wilt. In this study is described a simple, precise, and fast method to screen cotton germplasm for wilt resistance. By employing this method was identified new resistance sources of cotton genotypes to fusarium cotton wilt, as the genotypes FM 993, Stoneville LA 887, CNPA GO 2002-3778, and HS 26 among 64 accessions inoculated with a Brazilian pathogen population sample. / A murcha-de-fusário, causada pelo fungo Fusarium oxysporum f.sp. vasinfectum, é uma das principais doenças do algodoeiro em todo o mundo. Apesar da baixa incidencia da doença no cerrado, principal região produtora do Brasil, a murcha-de-fusário tem preocupado os produtores de algodão na região em virtude de ser potencialmente destrutiva. A tática de manejo da doença mais desejável é o uso de cultivares resistentes. Neste trabalho desenvolveu-se um método para seleção de genótipos de algodoeiro, que consistiu no plantio de sementes de algodoeiro em bandejas de plástico para germinação, que foram dispostas em casa-de-vegetação climatizada. As células das bandejas foram preenchidas com vermiculita esterilizada, e em cada célula foi plantada uma semente. Aos 5 e 7 dias após o plantio, depositou-se, em cada célula, uma suspensão de esporos. Foram testados 64 genótipos de algodoeiro com intuito de avaliar a sua resistência à murcha-de-fusário. O uso desse método possibilitou a identificação de novas fontes com alta resistência a murcha-de-fusário, como os genótipos FM 993, Stoneville LA 887,CNPA GO 2002-3778 e HS 26.

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2017-03-21T15:11:06Z No. of bitstreams: 1 Marcelo Rodrigues Figueira de Mello.pdf: 564270 bytes, checksum: 601abbc8a1b41f24d6121911ea57ea95 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T15:11:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Marcelo Rodrigues Figueira de Mello.pdf: 564270 bytes, checksum: 601abbc8a1b41f24d6121911ea57ea95 (MD5) Previous issue date: 2001-09-21 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Pineapple micropropagation is important due to the quality and quantity of the plantlets produced. After an acclimation period of 5 to 10 months, plantlets are read for planting in field where they will be exposed to several adverse factors including pests and diseases. The fusariosis caused by Fusarium subglutinans may cause losses as high as 80 and 20%, respectively in fruits and plantlets. Plant growth-promoting rhizobacteria have been used to increase development of micropropagated plantlets and for disease biological control. This study aimed to select a bacterization method and bacterial isolates that could efficiently promote growth of micropropagated pineapple plantlets cv. Pérola, increasing biomass and reducing the acclimation period; to test mixtures of isolates efficient in the growth-promotion and to determine their mechanisms of action; and to study the effect of bacteria on the fusariosis in micropropagated plantlets and the mechanisms involved in this protection. Overall the best methods were root dipping + soil drenching and root dipping the second being chosen due to its practicability. The most efficient bacterial strains were C210 (B. cereus), ENF16 (B. pumilus), RAB9 (Bacillus sp.) e ENF10 (B. thuringiensis subvar. kurstakii). Increases as high as 163.6%, 107.7% and 87.0% were obtained by RAB9 applied by root dipping, respectively for shoot dry weight, root dry weigh and leaf area thirty days after bacterization. All strains showed compatibility and combination of ENF10+RAB9, ENF16+C210 and C210+RAB9 induced respectively 100%, 88.1% and 80.1%, for root dry weight. Productions of IAA, HCN or phosphate solubilization were not detected for any of the bacterial isolates under the experimental conditions here utilized.Only nittrogen amounts in bacterized plantlets significantly differ (P=0,05) from the controls. In the study of the influence of bacterial isolates on the pineapple fusariosis by using root dipping the isolates ENF12 (not identified), C21 (Bacillus sp.), C11 (Bacillus sp.), ENF14 (Enterobacter cloacae), C210 and IN937A (Pseudomonas chlororaphis) significantly differ (P=0,05) from the control in relation to disease grade averages. ENF12, C21 and benomyl showed disease severity reduction of 85.2; 79.0 and 88.0% respectively, in relation to control without treatment. In the experiment using bacteria to spray detached leaves, disease index was significantly reduced (P=0,05) by EN5 (Alcaligenes piechaudii) which promoted disease severity reduction of 90.2%. In the experiment spraying bacteria onto attached leaves, only ENF14 significantly (P=0,05) reduced the disease severity in 55.6; 39.4 and 68.4 % respectively in relation to foliar symptoms, number of infected leaves and internal symptoms. None of the bacterial isolates produced celulase, pectinase or HCN. However C210, R14 (B. subtilis), ENF19 (not identified), ENF14, C11 and C21 inhibited the pathogen growth “in vitro” by antibiosis. In relation to iron competition the isolate EN5 showed reversion of inhibition of the pathogen mycelial growth at 20 ppm of FeCl3. The conclusions are: (i) mixtures of the strains C210, ENF16, RAB9 and ENF10 applied by root dipping are able to increase biomass production of micropropagated pineapple plantlets, reducing the acclimation period; (ii) E. cloacae ENF14 is a potential biocontroler for pineapple fusariosis. However experiments by leaf spraying with mixtures of isolates ENF14, EN5, C210 e C21 that act by distinct mechanisms are recommended. / A micropropagação do abacaxizeiro é importante pela qualidade e quantidade das mudas produzidas as quais, após 5 a 10 meses de aclimatação, serão levadas ao campo, onde estarão expostas a fatores adversos entre os quais, pragas e doenças. A fusariose causada por Fusarium subglutinans pode causar perdas de até 80% nos frutos e 20% nas mudas. Bactérias promotoras de crescimento têm sido utilizadas tanto para acelerar o desenvolvimento de plantas micropropagadas como no controle biológico de doenças. Os objetivos deste estudo foram selecionar um método de bacterização e isolados bacterianos eficientes para promoção de crescimento de mudas de abacaxi micropropagadas, de modo à aumentar a biomassa das plantas e reduzir o período de aclimatação; testar misturas dos isolados na promoção de crescimento e determinar os mecanismos de ação envolvidos nessa promoção; bem como, estudar o efeito de bactérias sobre a fusariose em mudas micropropagadas e os mecanismos de ação envolvidos nessa proteção. Dentre os métodos de bacterização testados, imersão de raízes + infestação do substrato e imersão de raízes foram os mais eficientes, sendo escolhido o segundo pela maior praticidade. Dentre os isolados testados, os mais eficientes foram C210 (Bacillus cereus), ENF16 (B. pumilus), RAB9 (Bacillus sp.) e ENF10 (B. thuringiensis subvar. kurstakii). Aumentos de 163,6%, 107,7% e 87,0% foram obtidos pelo isolado RAB9 aplicado pela imersão de raízes, respectivamente, para matéria seca da parte aérea, matéria seca das raízes e área foliar 30 dias após a bacterização. Todos os isolados selecionados foram compatíveis e as misturas entre os isolados ENF10+RAB9, ENF16+C210 e C210+RAB9 induziram aumentos de, respectivamente 100%, 88,1% e 80,1%, para matéria seca das raízes. Não foi observada a produção de ácido indolacético, ácido cianídrico ou solubilização de fosfatos pelos isolados bacterianos, nas condições experimentais utilizadas. O nitrogênio foi o único macronutriente cujo teor diferiu significativamente (P=0,05) entre as mudas bacterizadas e testemunhas. No estudo do efeito de bactérias sobre a fusariose do abacaxizeiro, utilizando-se a imersão de raízes, os isolados ENF12 (não identificado), C21 (Bacillus sp.), C11 (Bacillus sp.), ENF14 (Enterobacter cloacae), C210 e IN937A (Pseudomonas chlororaphis) diferiram significativamente (P=0,05) da testemunha com relação às notas atribuídas para cada planta. ENF12, C21 e benomil reduziram a severidade da doença em 85,2; 79,1 e 88,0% respectivamente, em relação a testemunha. No experimento utilizando a pulverização dos biocontroladores em folhas destacadas, EN5 (Alcaligenes piechaudii) diferiu significativamente (P=0,05) da testemunha quanto ao índice de doença, reduzindo a severidade em 90,2%. No experimento, utilizando a pulverização dos biocontroladores em plantas, apenas ENF14 diferiu significativamente (P=0,05) da testemunha, reduzindo a severidade da doença em 55,6; 39,4 e 68,4 considerando, respectivamente, índice de doença para lesões foliares, número de folhas infectadas e índice de doença para sintomas internos. Nenhum isolado bacteriano produziu celulase, pectinase ou HCN. No entanto, C210, R14 (B. subtilis), ENF19 (não identificado), ENF14, C11 e C21 inibiram o crescimento do patógeno “in vitro” por antibiose. Na competição por ferro foi demonstrado que o isolado EN5 apresentou reversão da inibição do crescimento micelial do patógeno no nível de 20 ppm de FeCl3. Concluiu-se que: (i) misturas dos isolados C210, ENF16, RAB9 e ENF10 aplicadas pela imersão de raízes, podem promover o aumento de biomassa de mudas de abacaxi micropropagadas, reduzindo a fase de aclimatação; (ii) o isolado E. cloacae ENF14 é um potencial biocontrolador para a fusariose do abacaxizeiro, recomendando-se testes com misturas dos isolados ENF14, EN5, C210 e C21 que agem por mecanismos distintos, utilizando-se a bacterização por pulverização das folhas

Made available in DSpace on 2018-08-01T23:26:43Z (GMT). No. of bitstreams: 1 tese_11880_87 - Ana Carolina Lyra Brumat.pdf: 1982746 bytes, checksum: d2338d3f287ef07c150e9304247877f7 (MD5) Previous issue date: 2018-02-16 / O estudo espaço-temporal de doença de plantas analisa a interação entre o patógeno, ambiente e o hospedeiro, no qual existem diversas metodologias que podem ser utilizadas para esse fim. A fusariose é considerada a principal doença fúngica na cultura da pimenta-do-reino, no entanto ainda são poucos os estudos epidemiológicos da doença. Visto isso, objetivou-se com o trabalho estudar a distribuição espacial da fusariose em pimenta-do-reino utilizando diferentes metodologias de estudo. Foram monitoradas quatro áreas homogêneas de pimenta-do-reino, no município de São Mateus-ES, no período de dez/2015 a dez/2016. A presença ou ausência de sintomas, bem como a posição de cada planta, foram anotadas em planilhas obtendo-se o mapeamento da evolução da doença dentro das áreas. Para o estudo espacial analisou-se os dados por diferentes metodologias: Índice de Dispersão (ID), Lei de Taylor modificada, análise de dinâmica e estrutura de focos (ADEF), e a krigagem. A análise dos dados por meio Lei de Taylor modificada indicou distribuição agregada somente para a área quatro. A ADEF mostrou que, com a evolução da doença no campo, os focos se tornavam maiores e em menor número. Com a utilização de geoestatística foi possível observar que a fusariose é disseminada a curta distância, e que os focos obedecem a um padrão de alongamento. Comparando os resultados obtidos pelos diferentes métodos observa-se que a geoestatística corroborou com os resultados apresentados pelas metodologias convencionais (Lei de Taylor modificada e a ADEF), e que a mesma tem potencial para ser utilizada no estudo espacial de doença de plantas.