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Study of the role of quail as reservoirs for avian infectious bronchitis virus / Estudo do papel das codornas como reservatório para o vírus da bronquite Infecciosa das galinhas

Alejo, Carolina Torres 14 December 2015 (has links)
This study aimed to investigate the occurrence and molecular diversity of coronavirus in quail and laying hens raised on the same farms and quail only farms, to determine the role of quail as reservoir for avian infectious bronchitis virus (IBV). To this end, two investigations were carried out, one in the São Paulo state, Southeastern Brazil, in 2013, when some farmers started quail vaccination with Massachusetts IBV serotype after surveillance carried out in 2009-2010 and the other in two regions of Northern Italy, in 2015. In the Brazilian study, samples were collected as pools of tracheas, lungs, reproductive tract, kidneys and enteric contents from quail (Coturnix coturnix Japonica) and laying hens showing IB-like symptoms, while, in the Italian study, samples were collected as pools of tracheal and cloacal swabs and intestine/enteric content from European quail (Coturnix coturnix), showing enteric disorders. All samples were tested by a nested RT-PCR targeted to the 3\'UTR of the Gammacoronavirus genus. Positive samples were submitted to RT-PCR to the RNA-dependent RNA-polymerase gene (RdRp) and two different RT-PCRs to the spike gene, including a typing-multiplex one. Two other RT-PCRs were used to detect the avian metapneumovirus (aMPV) and Newcastle disease virus (NDV). Avian coronavirus was found in all types of samples analyzed in quail and chickens from both type of creations, aMPV subtype B was found in chickens (Brasil) and the NDV was not observed in any samples. Based on the DNA sequences for the RdRp gene, Brazilian and Italian quail strains clustered within either Gammacoronavirus or Deltacoronavirus genus, while, for one Brazilian sample, it was detected co-infection with the two genuses. Phylogeny based on partial S1 subunit sequences showed that the gammacoronaviruses detected in the Brazilian and Italian quail belong to the Brazil type and 793/B, respectively. These results suggest that quail are susceptible to Gamma and Deltacoronavirus and that quail avian coronavirus share spike genes identical to chicken infectious bronchitis virus (IBV); thus, quail might act as reservoirs for avian coronaviruses. Also, Massachusetts vaccination was not efficient to control IBV in Brazilian quail. / Este estudo teve como objetivo pesquisar a ocorrência e diversidade molecular de coronavírus em codornas e galinhas criadas nas mesmas propriedades e em codornas criadas em propriedades isoladas, para determinar o papel das codornas como reservatório para o vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV). Para isso, duas pesquisas foram realizadas, uma em 2013, no estado de São Paulo, Sudeste do Brasil, onde algumas granjas iniciaram a vacinação em codornas contra o IBV com o sorotipo Massachusetts, após um estudo realizado em 2009-2010; e a outra, em 2015, em duas regiões do Norte da Itália. No estudo brasileiro, foram coletados pools de aparelho reprodutor, pulmões, rins, traqueia e conteúdo entérico de codornas (Coturnix coturnix japonica() e galinhas com histórico de manifestações clínicas compatíveis com a Bronquite Infecciosa das galinhas (BIG). Por outro lado, no estudo italiano, as amostras foram coletadas em forma de pools de swabs traqueais e cloacais e intestino/conteúdo entérico de codornas (Coturnix coturnix) com sinais entéricos. Estas amostras foram testadas para os coronavírus aviário (Gammacoronavirus) mediante uma semi-nested RT-PCR dirigida a região não-traduzida 3 (3´UTR). As amostras positivas foram submetidas a RT-PCR do gene codificador da proteína RNA-polimerase RNA-dependente (RdRp) e duas RT-PCRs, incluindo uma multiplex dirigidas a proteína de espícula (S) do vírus da BIG, para genotipagem. Além disso, a detecção de metapneumovírus aviário (aMPV) e o vírus da doença de Newcastle (NDV) também foi realizada por meio de RT-PCRs. Coronavírus aviários foram encontrados em todos os tipos de amostras estudadas em codornas e galinhas de todos os tipos de criações, aMPV subtipo B foi encontrado em galinhas (Brasil) e o NDV não foi encontrado em nenhuma amostras. Com base nas sequências de DNA para o gene codificador da proteína RdRp, as amostras brasileiras e italianas foram agrupadas no gênero Gamma ou Deltacoronavirus, enquanto que, em uma amostra brasileira, foi detectada coinfecção pelos dois gêneros. A filogenia com base nas sequências parciais da subunidade S1da proteína de espícula, evidenciou que os Gammacoronavirus detectados nas codornas brasileiras e italianas pertencem ao genótipo Brasil e 793/B, respectivamente. Estes resultados sugerem que as codornas são suscetíveis aos coronavírus do gênero Gamma e Delta e os coronavírus aviários das codornas compartilham genes de espícula idênticos aos do IBV. Desta forma, sugere-se que as codornas podem servir como reservatórios para coronavírus aviários e que a vacinação com o sorotipo Massachusetts não foi eficiente no controle de IBV nas codornas brasileiras.
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Produção e qualidade de ovos em poedeiras semi-pesadas: efeitos do consumo de energia e óleo / Production and egg quality semi-heavy laying hens: effects of energy consumption and oil

Silva, Amadeu Benedito Piozzi da 04 July 2001 (has links)
O presente experimento foi realizado no aviário da Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia da Universidade Estadual Paulista do Campus de Botucatu. Foram utilizadas 288 aves da linhagem Hisex Brown, em produção, com 30 semanas de idade no início do experimento, divididas em nove tratamentos com quatro repetições cada, num esquema fatorial 3X3, sendo três níveis de energia metabolizável fornecidos por ave/dia (280, 300 e 320 kcal) e três diferentes consumos de óleo por ave/dia (0,00; 0.75 e 1,50 g). O consumo diário de ração foi restrito a 115, 110 e 105 g para obtenção dos níveis desejados de energia metabolizável e óleo. As rações foram balanceadas para que todas as aves recebessem diariamente 18 g de proteína bruta, 4,2 g de Cálcio, 0,66 g de Fósforo Total, 0,40 g de Metionina, 0,73 g de Metionina + Cistina e 0,83 g de Lisina. Não foi constatada diferença estatística (P>0,05) para produção (%), massa (g/ave/dia), peso médio (g) e gravidade específica dos ovos bem como para umidade, percentagem de gordura, proteína e cinzas do albume e da gema. Houve efeito do consumo diário de energia (P>0,05) sobre o peso final, ganho de peso e percentagem de gordura abdominal, havendo um aumento destes com o aumento da densidade energética. Foram constatadas pioras significativas, com efeito linear, na conversão alimentar por massa, na conversão alimentar por dúzia de ovos produzidos e conversão de energia, em função do aumento da energia consumida diariamente. Foram constatados efeitos significativos, com efeito quadrático na percentagem de casca em função do consumo diário de energia. Já para percentagem de gema e albume houve efeito linear em relação ao consumo de óleo, sendo que para o primeiro parâmetro houve aumento do mesmo com maior inclusão de óleo e, no outro, diminuição. Houve efeito significativo do consumo diário de óleo (P<0,05) e da interação consumo de energia e consumo de óleo (P<0,05) sobre Unidades Haugh. Houve efeito significativo da cor da gema em função do consumo diário de energia e óleo diários (P<0,05). / The present experiment was carried out at the experimental aviary of the Veterinary Medicine and Zootecny University - Botucatu. At the beginning of the experiment 288 semi -heavy Hisex Brown strain birds were used, in production, 30 weeks old, divided in nine treatments with four replications each, in a factorial arrangement 3X3, with three levels of metabolizable energy supplied per bird/day (280, 300 and 320 kcal) and three different oil consumptions for bird/day (0.00; 0.75 and 1.50 g). The birds had a restricted daily feed consumption of 115, 110 and 105 9 to obtain the levels of metabolizable energy and oi!. The diets were balanced so that ali of the experimental birds received 18 9 of crude protein daily, 4.2 9 of Calcium, 0.66 9 of Total Phosforus, 0.40 9 of Methionine, 0.73 9 of Methionine + Cistine and 0.83 9 of Cistine. The parameters of production (%), mass (g/bird/day), average weight (g) and specific gravity of the eggs where not humidity, fat percentage, protein and ash of the albumen and yolk didn \'t differ significantly different among the treatments. There was a significant effect of the daily consumption of energy on the final weight, weight gains and percentage of abdominal fat, which demonstrate an increase of these parameters with the increase of the energy density. Significant worsenings were verified (P < .05), with linear effect in the feed conversion for mass, in the feed conversion for dozen of produced eggs and conversion of energy, in function of the increase of the energy consumed daily. Significant effects were verified, with quadratic effect in the shell percentage in function of the daily consumption energy. However for yolk percentage and albumen there was a linear effect to oil consumption and for the first parameter there was an increase of that with larger oil inclusion and, in the other one, decreased. There was significant effect of daily consumption of oil (P < .05) and of the interaction consumption of energy and oiI consumption (P < .05) on Haugh Units. There was a significant effect of the color of the yolk in function to the daily consumption of energy and oil (P <.05).
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Concentração de proteínas (fosvitina e lipovitelina) em gemas de ovos de galinhas (Gallus gallus) nos diferentes ciclos de postura e sua interferência na disponibilidade do ferro / Protein concentration (phosvitin and lipovitelin) in egg yolks of hens (Gallus gallus) in the different cycles of position and its interference in the availability of the iron

Sartori, Erika Vidal 28 August 2007 (has links)
O ovo é o produto de eficiente transformação biológica feita pela galinha (Gallus gallus) de postura, com alta qualidade nutricional para o consumo humano. Na gema do ovo encontra-se a proteína denominada fosvitina, a mesma atua como carreadora do ferro se ligando a ele. A deficiência de ferro ocorre normalmente devido ao consumo insuficiente de alimentos fontes de ferro ou a baixa biodisponibilidade. O objetivo desta pesquisa foi verificar a concentração de proteínas, em especial a fosvitina/lipovitelina presente em gemas de ovos crus e cozidos nos diferentes ciclos de postura (inicial, intermediário e final) e avaliar a interferência desta proteína na disponibilidade do micronutriente ferro. Os tratamentos foram realizados em diferentes períodos e utilizaram-se ovos crus e cozidos, sendo gemas cruas de poedeiras em início, meio e fim de postura e gemas cozidas nos três ciclos de postura. Foram realizadas as análises de composição centesimal, concentração de ferro total e dialisável, concentração de proteínas em gemas e eletroforese em gel de poliacrilamida (SDS-PAGE). Houve diferença na concentração de proteínas e diferentes níveis de ferro dialisável nos três ciclos de postura, porém em gemas cruas e cozidas. Com o passar dos ciclos (inicial, intermediário e final), as poedeiras mais velhas, apresentaram gemas com teor mais elevado de ferro disponível, porém uma quantidade inferior de proteínas em especial a fosvitina/lipovitelina, comparando-se com os ciclos inicial e intermediário. A disponibilidade de ferro foi mais elevada em gemas que passaram pelo processo de cocção, porém em poedeiras de postura final. / The egg is the product of efficient biological transformation made by the hens of position, with high nutricional quality for the human consumption. In the egg yolk of the egg it meets phosvitin called protein, the same one acts as hauled of the iron if binding it. The iron deficiency normally occurs due to the insufficient food consumption iron sources or low the bioavailability. The objective of this research was to verify the protein concentration, in special the present phosvitin/lipovitelin in egg yolks of raw eggs and stews in the different cycles of position (initial, intermediate, end) and to evaluate the interference of this protein in the availability of the micronutrient iron. The treatments had been carried through in different periods and had used raw eggs and cooked, being raw egg yolks of hens in initial, intermediate and end of position and egg yolks boil in the three cycles of position. The analyses of proximal composition had been carried through, concentration of total and availability iron, protein concentration in egg yolks and electrophoresis in poliacrilamide (SDS-PAGE) were carried. It had difference in the protein concentration and different levels of iron availability in the three cycles of position, however in raw and boiled egg yolks. With passing of the cycles (initial, intermediate, end), the hens oldest, had more presented egg yolks with a raised amount of available iron, however special amount of proteins in the fosvitina/lipovitelina, comparing themselves with the cycles initial and intermediate. The iron availability more was raised in egg yolks that had passed for cooking process, however in hens of final position.
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Efeito de adição de drogas hipolipemizantes à ração sobre as concentrações de lípides plasmáticos e de colesterol na gema do ovo de galinhas / Effect of dietary Iipid-Iowering drugs upon plasma lipids and egg yolk cholesterol levels of laying hens

Mori, Agnes Veridiana 14 September 1998 (has links)
Para se verificar o efeito de drogas hipolipemizantes sobre a qualidade do ovo, desempenho das aves, níveis de Iípides plasmáticos e colesterol na gema do ovo, foram realizados dois experimentos utilizando-se galinhas poedeiras Shaver. No experimento 1, 240 aves com 30 semanas de idade, foram alimentadas durante 12 semanas com dieta comercial (CON1) acrescida de Probucol a 0,1% (PROB), Gemfibrozil a 0,025% (GEMF) e Lovastatina em três concentrações: 0,0005% (LOV1), 0,001% (LOV2) e 0,0015% (LOV3), totalizando seis tratamentos. No experimento 2, 128 aves com 26 semanas de idade, receberam como alimentação, durante seis semanas, dieta formulada sem ingredientes de origem animal (CON2), acrescida de Colestiramina a 0,2% (COL 1) e 0,3% (COL2) e Lovastatina a 0,005% (LOV4), perfazendo um total de quatro tratamentos. Em ambos os experimentos, a adição das drogas não prejudicou a qualidade da casca e do albúmen dos ovos e, de um modo geral, não determinou efeitos indesejáveis sobre o desempenho produtivo das aves, com exceção da redução observada no peso médio dos ovos no experimento 2. No experimento 1, em relação aos lípides plasmáticos, a adição de drogas à ração determinou reduções de significado estatístico (p<0,05), nos triglicérides, apenas no LOV2 (38,5%), e no colesterol total, nos grupos LOV2 (36,0%), LOV3 (36,8%), PROB (29,6%) e GEMF (30,4%). Não foram consignadas alterações significativas nos níveis de HDL-colesterol em relação ao CON 1, observando-se, com exceção do GEMF, tendência a elevação de seus valores com o uso das diferentes drogas. Verificou-se redução significativa (p<0,05) do colesterol na gema (mg/g) nos grupos LOV1 (7,4%) e LOV3 (12,1%). No experimento 2, os lípides plasmáticos não sofreram alterações de significado estatístico em relação ao CON2, sendo que os triglicérides e o colesterol total mostraram tendência a diminuição no LOV4. A concentração de colesterol na gema (mg/g) permaneceu inalterada, em cotejo com o CON2, mediante a adição das drogas utilizadas no experimento 2. Os efeitos da Lovastatina sobre as concentrações de Iípides sanguíneos e de colesterol do ovo foram menos evidentes no experimento 2, onde as aves apresentavam níveis de Iípides plasmáticos mais reduzidos. Os coeficientes de correlação e as equações de regressão calculados mostraram que o peso da gema aumenta conforme o peso do ovo se eleva (p<0,05), e que um aumento do peso da gema corresponde a um incremento de seu teor de colesterol, indicando que as variações dos níveis de colesterol por gema podem ser, em parte, justificadas pelas diferenças entre os pesos dos ovos. / Two experiments were carried out to evaluate the effect of lipid¬lowering agents upon egg quality, reproductive performance, plasma lipids and egg yolk cholesterol levels of Shaver laying hens. In the first trial, two hundred and forty 30-week-old hens were fed basal diet (commercial ration - CON1) supplemented with 0.1 % Probucol (PROB), 0.025% Gemfibrozil (GEMF), or Lovastatin at 0.0005% (LOV1), 0.001 % (LOV2) and 0.015% (LOV3) for a 12-week experimental period. In experiment 2, one hundred and twenty-eight 26-week-old hens were fed basal diet without animal products (CON2) containing either 0.2% Cholestyramine (CaL 1), 0.3% Cholestyramine (COL2) or 0.005% Lovastatin (LOV4) for a period of six weeks. At the termination of both experiments, it was observed that the supplement of the drugs did not impair albumen and shell quality. In addition, hen performance was not adversely affected, with the exception of the significant reduction (p<0.05) in egg weights observed in experiment 2. In experiment 1, with regard to the plasma lipids, the depression in triglyceride concentrations approached statistical significance (p<0.05) only in LOV2 (38.5%), and total cholesterol was significantly depressed (p<0.05) in LOV2 (36.0%), LOV3 (36.8%), PROB (29.6%) and GEMF (30.4%) groups. HOL-cholesterol levels were not significantly altered by drug treatments; but with the exception of GEMF, there was a trend towards the elevation by the use of other drugs. Egg cholesterol content, expressed per gram of yolk was significantly lowered (p<0.05) in LOV1 (7.4%) and LOV3 (12.1 %). In experiment 2, no significant changes were observed on plasma lipids due to the addition of the drugs, but cholesterol and triglyceride levels tend to reduction in LOV4 group. Egg yolk cholesterol remained unchanged in experiment 2 with the supplement of the drugs. The effect of Lovastatin on plasma lipid and egg yolk cholesterol concentration was less remarkable in experiment 2, when hens presented lower plasma lipid levels. When correlation coefficients and regression equations were calculated, it was found that yolk weight increased linearly (p<0.05) as egg weight raised, and the higher the yolk weight, the higher the yolk cholesterol content, indicating that yolk cholesterol content changes may be partially explained by differences among egg weights.
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Caracterização e comparação molecular de estirpes de referência e de campo do vírus da bronquite infecciosa das galinhas / Molecular characterization and comparison of reference and field strains of infectious bronchitis vírus

Santos, Sueli da Silva 02 February 2012 (has links)
A bronquite infecciosa é uma doença viral, aguda e altamente contagiosa que afeta as aves da espécie Gallus gallus, de todas as idades, causando grandes perdas econômicas devido à mortalidade, queda na produção e qualidade dos ovos. Variações na sequência de aminoácidos na região hipervariável da subunidadade S1 da proteína de espícula (S) levam à emergência de novos sorotipos do vírus da bronquite infecciosa das galinhas (IBV). Este estudo teve como objetivo seqüenciar parcialmente o gene S1 para determinar a relação filogenética entre amostras vacinais e de campo com o intuito de investigar os genótipos circulantes. Cento e sessenta amostras foram coletadas, na forma de pools, de plantéis sintomáticos durante 2009/2010. Cada pool continha tecidos de 3 a 5 aves e foram compostos por diferentes órgãos (traquéia, pulmões, rins, conteúdo entérico, trato reprodutivo e swabs traqueais). As amostras foram triadas para a presença de IBV utilizando-se uma nested RT-PCR, direcionada a região 3UTR. As amostras positivas, (n=89) foram submetidas a nova nested RT-PCR dirigida para o gene S, resultando em 10 amplicons de 390pb que foram então submetidos a seqüenciamento de DNA e análise filogenética. As amostras brasileiras segregaram-se em dois grupos filogenéticos: Massachusetts (Mass) e tipos marcadamente brasileiros. Seis amostras agruparam-se no grupo Mass, com vacinas vivas atenuadas utilizadas no Brasil. Quatro amostras agruparam com cepas de campo brasileiras previamente descritas (acesso no GeneBank: FJ791257 to FJ791273). A identidade de aminoácidos no grupo Mass variou de 98% a 100%, sugerindo a detecção de vírus vacinal. Enquanto que entre as amostras brasileiras e o grupo Mass, a variabilidade de aminoácidos foi de 79% a 81%. Esses resultados mostram uma variação importante em genótipos virais circulantes nos plantéis industriais avícolas brasileiros. Portanto, o presente estudo reforça a contínua emergência e disseminação de novas linhagens de IBV no Brasil e a importância de constantes pesquisas e monitoramento, para que se compreendam aos fenômenos de emergência de novas linhagens e suas consequências, bem como para otimizar as medidas de controle do vírus. / Infectious bronchitis is a viral disease, acute and highly contagious that affects birds of the Gallus gallus species, of all ages, causing huge economic losses due to mortality, drop in production and quality eggs. Differences between serotypes of IBV are due to variations in the amino acids sequence in S1 hypervariable region subunit of spike protein (S). This study aimed to partially sequence the S1 gene to determine the phylogenetic relationship between field and vaccine viral types, and to investigate circulating genotypes in Brazil. One hundred and sixty pool samples were collected from symptomatic flocks during 2009/2010. Each pool contained tissues from 3 to 5 birds and was composed by different organs (tracheas, lungs, kidneys, enteric contents, tract reproductive and tracheal swabs). Samples were screened for the presence of IBV using a nested RT-PCR targeted to the 3UTR. Positive samples (n=56) were submitted to a nested RT-PCR target to S gene resulting in 10 amplicons of 390pb that were then submitted to DNA sequencing and analysis. Brazilian IBV genotypes segregated in two phylogenetic groups: Massachusetts (Mass) and Brazilian types. Six samples clustered in the Mass group, with live attenuated vaccines used in Brazil. Four samples grouped with field Brazilian strains previously described (GeneBank accession: FJ791257 to FJ791273). In Mass cluster aminoacids identity range from 98% to 100%, suggesting vaccine virus detection, in this last case. Moreover, the verified identity between samples from this study and Mass group ranged 79% to 81%. Therefore the present study reinforces the emergence and circulation of news lineages of IBV in commercial Brazilian flocks, as well as the importance of consistent research and monitoring to better understand this phenomen and its consequences, aiming to improved control measures against the virus.
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Modulação da resposta imune em aves imunizadas com vacinas aviárias associadas ao b-glucano. / Immune response modulation in chicken immunized with vaccines associated to b-Glucan.

Pedroso, Antonio Carlos 06 August 2009 (has links)
Os b-glucanos são formados por polissacarídeos estruturais da parede celular de leveduras (Saccharomyces cerevisiae), alguns cereais em grãos e fungos. Os b-glucanos apresentam a molécula de glicose ligada ao carbono nas posições b-1,3 e pode apresentar cadeias laterais com o resíduo de glicose ligado nas posições b-1,6. O b-glucano tem sua ação benéfica como antiinflamatório, antitumoral, hipocolesterolêmico e hipoglicêmico. A inocuidade do b-glucano solubilizado nesse trabalho foi demonstrada in vitro, em cultivo celular de fibroblastos de embriões de galinhas SPF, e confirmado in vivo após a injeção no músculo peitoral de frangos. O b-glucano é um modulador biológico devido sua capacidade de em aumentar a resposta imune inata, aumentando os mecanismos inespecíficos de defesa dos animais. O b-glucano solúvel na dose de 240 mg/ave, associado ao diluente da vacina de Marek, apresentou efeito imunomodulador na resposta imune humoral. Os níveis de IgG no plasma foram detectados pela técnica de ELISA, e a resposta imune celular foi avaliada pela detecção de IFNg-, IL-2 e IL-6 em frangos vacinados com vacina recombinante e viva contra doença de Gumboro. O b-glucano solúvel nesse experimento demonstrou ser um potente imunoadjuvante após aumentar a resposta imune humoral e celular para os antígenos da doença infecciosa da Bursa, quando associado em vacinas recombinantes e vivas. / The b-glucans are structural polysaccharides from yeast cell wall (Saccharomyces cerevisiae), some cereal grains and fungi. The b-glucans have a glucose molecule carbon linked in sites b-1,3 and they have side chains of glucose residue in sites b-1,6. The b-glucans have a helpful effect as anti-inflammatory, antitumoral, hypoglycemic and hypocholesterolemic activity .The safety of b-glucan water-soluble obtained in this work was demonstrated in vitro, using specific-pathogen-free (SPF) cell culture chicken embryo fibroblast and it was confirmed in vivo after injection in chicken pectoral muscle. The b-glucan is a biological modulator due to its ability to increase the innate immune response. The soluble b-glucan in 240 mg/bird dose, associated to Marek\'s disease vaccine diluents showed immunomodulatory effect in humoral immune response. The IgG plasma levels were detected by ELISA method, and the cellular immune response was evaluated by detection IFN-g, IL-2 and IL-6 in vaccinated chickens with recombinant and live vaccines against Gumboro\'s disease using Real-Time PCR technique. The soluble b-glucan used in this trial demonstrated a powerful immune-adjuvant effect enhancing the cellular and humoral immune response against Bursal disease, when associated to recombinant vaccine and live vaccines.
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Ocorrência de interações QTL x Sexo, de epistasias e de QTLs pleiotrópicos em aves (Gallus gallus) / QTL by Sex Interactions, epistasis and pleiotropic QTLs in chicken (Gallus gallus)

Pinto, Luis Fernando Batista 27 April 2007 (has links)
Este estudo teve por objetivo mapear QTLs para características de desempenho e de carcaça em Gallus gallus . Foram estudadas 350 aves F2 oriundas de um cruzamento, na primeira geração, de machos de corte da linhagem TT com fêmeas de postura da linhagem CC. O peso vivo com 1, 35 e 42 dias de idade; o ganho de peso, o consumo de ração e a conversão alimentar de 35 a 41 dias de idade; os pesos dos pulmões, fígado, coração, moela, peito, coxas (peso de coxas e sobre-coxas), carcaça (sem vísceras, pés e cabeça), carcaça residual (peso da carcaça sem peito, asas e coxas), asas, cabeça, pés e gordura abdominal; o comprimento do intestino e o percentual de hematócrito, foram os fenótipos analisados. Foram utilizados 79 marcadores microssatélites, os quais cobriram 1510,7 cM dos cromossomos 1, 2, 3, 4, 5, 8, 11 e 13. Primeiramente, foram realizadas análises isoladas de cada fenótipo original e de variáveis canônicas obtidas por análise de componentes principais dos fenótipos. O teste razão de verossimilhanças (LRT) entre um modelo incompleto (apenas com efeitos fixos de sexo, incubação e o efeito aleatório de valor genético infinitesimal) e um completo (todos os efeitos anteriores mais os efeitos de QTL) foi o procedimento utilizado nas análises, exceto para testar modelos com interações epistáticas, onde a metodologia de quadrados mínimos foi utilizada. Modelos com interação QTL x sexo também foram testados. Posteriormente, foram feitas análises de múltiplos fenótipos simultaneamente, onde foi possível testar a hipótese de QTL pleiotrópico x QTLs ligados, além dos testes descritos acima, com exceção de efeitos epistáticos. As análises descritivas e de componentes principais foram obtidas no SAS, enquanto o mapeamento de QTL foi realizado no programa QxPak, exceto para análise de efeitos epistáticos, em que um código em Fortran 90 foi empregado. O modelo univariado, sem interações, permitiu mapear oito QTLs altamente significativos (cinco no GGA1 para PV35, PV42, gordura abdominal, comprimento do intestino e peso da cabeça; dois QTLs no GGA2 para PV35 e PV42; e um QTL no GGA3 para gordura abdominal) seis significativos (dois no GGA1 para conversão alimentar e ganho de peso; dois no GGA3 para peso das asas e das coxas; um no GGA4 para peso da cabeça; e um no GGA8 para peso da moela), além de 13 ligações sugestivas para diversas características. Dez QTLs apresentaram interação com sexo, sendo cinco específicos para machos. O modelo com busca simultânea de dois QTLs mapeou seis QTLs anteriormente perdidos (cinco para PV35 e PV42; e um para peso da cabeça). Interações epistáticas foram observadas para PV35 e PV42 entre um QTL em 69 cM do GGA1 com QTLs em 333 cM do GGA1, 272 cM do GGA3 e 77 cM do GGA5. Dois QTLs e seis ligações sugestivas foram mapeados na análise de variáveis canônicas, os quais não haviam sido mapeados com as variáveis originais. Com o procedimento de múltiplas características foi possível mapear nove QTLs pleiotrópicos e o aumento de poder do teste foi evidenciado, principalmente, no GGA2. / This study aim to map QTL for performance and carcass traits in (Gallus gallus) . There were used 350 F2 chickens developed by crossing a broiler male line (TT) with a layer line (CC). The body weight with 1, 35 and 42 days of age, weight gain, feed intake and feed conversion from 35 to 41 days, weights of lung, liver, heart, gizzard, breast, drums and thighs, carcass (without giblets, feet and head), residual carcass (weight of carcass without breast, drums, thighs, and wings), wings, head, feet, and abdominal fat, intestine length and hematócrito value were the phenotypes analyzed. Seventy nine microssatellite markers were used, which covered 1510.7 cM of chromosomes 1, 2, 3, 4, 5, 8, 11, and 13. Firstly, QTL analysis was carried out for each original trait and for canonical variables, obtained from principal components analysis of the phenotypes. The likelihood ratio test (LRT) between a reduced model (only fixed effects of sex, hatch and random effect of infinitesimal genetic value) and a full model (all anterior effects and QTL effects) was applied to map QTL, but mean square approach was used for mapping QTL with epistatic effect. Besides, models with QTL by sex interaction were also tested. Finally, multi-trait analysis was used to test the hypothesis of pleiotropic x linkage QTLs, besides of the tests previously described, except models with epistatic effects. For descriptive and principal components analysis the SAS software was used. QTL mapping was carried out with QxPak software and a fortran 90 source code to test models with epistatic effect. The univariate model, without interactions, allowed to map eight highly significant QTLs (five in the GGA1, for PV35, PV42, abdominal fat, intestine length, and head weight; two QTLs in the GGA2, for PV35 and PV42; and one QTL in the GGA3 for abdominal fat), six significant QTLs (two in the GGA1 for feed conversion and weight gain; two in the GGA3 for wings and drums and thighs weights; one in the GGA4 for head weight; and one in the GGA8 for gizzard weight), besides 13 suggestive linkages for several traits. Ten QTLs interacted with sex, being five of them male specific QTLs. The model with simultaneous search for two QTLs was important to map six QTLs previously lost (five for body weight at 35 and 42 days; and one for head weight). Epistatic Interactions were observed for body weight among a QTL in 69 cM of GGA1 with QTLs in 333 cM of GGA1, 272 cM of GGA3 and 77 cM of GGA5. Two QTLs and six suggestive linkages were mapped with the analysis on canonical variables, which have not been mapped with the original variables. With the multi-trait approach nine pleiotropic QTLs were mapped and an increase in the test power was observed mainly in the GGA2 chromosome.
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Caracterização biológica e genotípica de isolados da Toxoplasma gondii obtidos de galinhas de criação livre do Pantanal do Mato Grosso do Sul / Biological and genotypic characterization of Toxoplasma gondii isolated from free ranges chickens from Pantanal of Mato Grosso do Sul

Silveira, Luciane Holsback 24 September 2009 (has links)
Apesar de o protozoário Toxoplasma gondii ser considerado a única espécie válida para o gênero, são reconhecidas três linhagens clonais, denominadas Tipo I, Tipo II e Tipo III, predominantes em países da Europa ocidental e Estados Unidos. Com a pesquisa de amostras deste parasito provenientes de outras regiões do mundo, como no caso do Brasil, várias outras configurações genotípicas diferentes das dos arquétipos mencionados acima vêm sendo encontradas. Neste trabalho, quarenta galinhas/galos (Gallus domesticus) de criação livre de oito propriedades rurais de áreas limítrofes ao Pantanal da Nhecolândia no estado do Mato Grosso do Sul foram eutanasiadas e amostras de sangue, cérebro e coração foram coletadas. O sorodiagnóstico foi realizado através do Teste de Aglutinação Modificado (MAT) e, com um pool de órgãos dos animais positivos, foi realizado bioensaio em camundongos. Foram obtidos, após o bioensaio, 11 isolados de T. gondii. O DNA foi extraído dos tecidos dos camundongos infectados e a tipificação dos isolados foi realizada utilizando 12 marcadores PCR-RFLP, genericamente denominados SAG1, 5´3´SAG2, SAG2, SAG3, BTUB, GRA6, c22-8, c29-2, L358, PK1, Apico e CS3. Vinte e sete galinhas (67,5%) foram sorologicamente positivas para T. gondii e 13 (32,5%) foram negativas. Das amostras soropositivas, 7 (25,9%) foram positivas na diluição 1:5, 3 (11,1%) em 1:10, 2 (7,4%) em 1:20, 3 (11,1%) em 1:320, 1 (3,7%) em 1:640, 3 (11,1%) em 1:1280, 2 (7,4%) em 1:2560, 4 (14,8%) em 1:5120 e 2 (7,4%) em 1:10240. Quanto à genotipagem, cinco genótipos foram revelados nos 11 isolados de galinhas de cinco propriedades do município de Aquidauana e uma propriedade do município de Rio Verde do Mato Grosso, incluindo um genótipo misto encontrado em um isolado (TgCkBr198) que demonstrou um complexo cujos padrões são uma combinação de 2 alelos observados em oito loci. Dois genótipos foram descritos pela primeira vez, considerando os 140 isolados de galinhas de diferentes regiões brasileiras avaliadas em estudos anteriores. Os resultados corroboram com estudos anteriores sobre os isolados de T. gondii no Brasil, confirmando sua diversidade e atipicidade. / Despite the protozoan Toxoplasma gondii is considered the only valid species for the genus, three clonal lineages are recognized, known as the Type I, Type II and Type III, which predominate in Western European countries and the USA. The search for samples of this parasite from other regions of the world, as in the case of Brazil, has revealed different genotypes other than the archetypes above mentioned. In this study, forty free range chickens (Gallus domesticus) of eight farms from areas belonging to the Pantanal Nhecolândia in the state of Mato Grosso do Sul were euthanized and samples of blood, brain and heart were collected. The serodiagnosis was performed using the technique of modified agglutination test (MAT) and a pool of organs of seropositive animals was used to perform the bioassay in mice. It was obtained 11 isolates of T. gondii. DNA was extracted from tissues of infected mice and characterization of isolates was performed using 12 PCR-RFLP markers, known generically SAG1, 5\'3\'SAG2, SAG2, SAG3, BTUB, GRA6, c22-8, C29-2, L358, PK1, Apico and CS3. Twenty-seven chickens (67.5%) were serologically positive for T. gondii and 13 (32.5%) were negative. Among the seropositive samples, 7 (25.9%) were positive at 1:5 dilution, 3 (11.1%) in 1:10, 2 (7.4%) in 1:20, 3 (11.1%) at 1:320, 1 (3.7%) at 1:640, 3 (11.1%) in 1:1280, 2 (7.4%) in 1:2560, 4 (14.8%) on 1:5120 and 2 (7.4%) at 1:10240. With regard to genotyping, five genotypes were found within 11 isolates from chickens from five properties in the municipality of Aquidauana and one property of the municipality of Rio Verde of Mato Grosso, including a mixed genotype found in one isolate (TgCkBr198) that showed a complex pattern which is a combination of 2 alleles observed at eight loci. Two genotypes have been described for the first time, considering the 140 isolates from chickens in different Brazilian regions evaluated in previous studies. The results corroborate with previous studies on the isolates of T. gondii in Brazil, confirming their diversity and atypicality.
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Mapeamento de QTL para desempenho e características de carcaça, nos cromossomos 3 e 5 de Gallus gallus. / Mapping of quantitative trait loci affecting performance and carcass traits on chicken chromosomes 3 and 5.

Ruy, Deborah Cléa 25 May 2004 (has links)
Uma população experimental F2 foi desenvolvida a partir do cruzamento de sete machos de uma linhagem não endogâmica de frangos de corte (TT), com sete fêmeas de uma linhagem não endogâmica de postura (CC), gerando vinte famílias F1 TC, com aproximadamente 100 progênies F2 cada obtidas em 17 incubações. Foram obtidos dados fenotípicos para vinte e oito características de desempenho e qualidade da carcaça em 2063 aves F2. As aves F1 TC foram genotipadas para 30 marcadores microssatélites posicionados nos cromossomos 3 e 5 para determinar o grau de informação dos marcadores. Os marcadores informativos foram empregados na genotipagem seletiva das aves F2 que apresentaram valores fenotípicos extremos (4,5 % superiores e 4,5 % inferiores), dentro de cada uma das 20 famílias, para a característica peso vivo aos 42 dias de idade ajustado (PV42aj). Os genótipos obtidos foram comparados através do teste de qui-quadrado. Foram encontradas seis regiões no cromossomo 3 e três regiões no cromossomos 5 com marcadores apresentando ligaçãio sugestiva (P < 0,10) com QTL para PV42aj. Foram selecionadas seis famílias mais informativas para a maioria dos marcadores significativos, e 90 progênies F2 de cada família (n=540) foram genotipadas. Os genótipos foram empregados para construção de mapas de ligação específicos para os cromossomos. Os fenótipos ajustados para efeitos fixos, os mapas de ligação e os genótipos foram empregados para mapeamento de QTL por análise de regressão, utilizando o programa QTL Express. Foram encontrados no cromossomo 3 10 QTL siginificativos para peso corporal aos 35, 41 e 42 dias de idade, para ganhos de peso do nascimento aos 35, 41 e 42 dias de idade, para peso de asas e coxas com sobrecoxas, e para peso de gordura abdominal e porcentagem de gordura. Foram observados um QTL no cromossomo 3 com ligação sugestiva para peso de pés, e três QTL no cromossomo 5 para consumo de ração, peso do coração, peso de gordura abdominal e porcentagem de gordura abdominal. Não houve interações significativas do QTL com efeito de família ou sexo. Os QTL significativos para peso de gordura abdominal e porcentagem de gordura abdominal apresentaram forte efeito de imprinting gamético. Os efeitos dos QTL foram na sua maioria aditivos, com o alelo originado da linhagem de corte aumentando o valor para a característica. Características de carcaça apresentaram efeito aditivo negativo, indicando que os alelos provenientes da linhagem de postura diminuíram o valor dessas características. A população experimental foi adequada para o mapeamento de QTL significativos para características de desempenho e carcaça no cromossomo 3, e QTL sugestivos para características de carcaça no cromossomo 3 e características de desempenho e carcaça no cromossomo 5. / An F2 chicken population was established from a cross of a broiler-sire line (TT) and an egg laying line (CC). This population was used for detecting and mapping quantitative trait loci (QTL). Over 2000 F2 TC offspring from 17 hatches were reared to slaughter at 6 wk of age. Twenty-eight performance and carcass traits were measured. The DNA were extracted from blood samples and informativeness of 50 selected microsatellite markers along chromosomes 3 and 5 were obtained in F1s. Data of 2063 individuals from 20 families were used to chosen offspring with high and low phenotypes for BW42, for selective genotyping. Twenty markers were used in the complete genotyping of 566 individuals from 6 families most informative. Interval mapping QTL analyses were carried out by regression method, using QTL Express software. Significant QTL at the genome were mapped on chromosome 3 for body weigh at 35, 41 and 42 days, gain between birth and 35, 41 and 42 days, abdominal fat weight, abdominal fat percentage, weight of wings and weight of thighs. Suggestive QTL were identified for weight of feet on chromosome 3 and for abdominal fat weight, abdominal fat percentage, heart weight and feed consumption on chromosome 5. Significant QTL for abdominal fat weight and abdominal fat percentage showed strong imprinting effect. There was no evidence for interactions of the QTL with sex and family, or for two QTL on the same chromosome for any of the traits. Genetic effects were generally additive, with the broiler alleles increasing performance traits. Additive effects were negative for carcass traits, indicating that the layer line decreased these traits. Experimental population was adequate to mapping significant QTL for performance and carcass traits on chromosome 3, and suggestive QTL for carcass traits on chromosome 3 and for performance and carcass traits on chromosome 5.
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Biomassa de rubrivivax gelatinosus como suplemento de rações para galinhas poedeiras /

Polonio, Lorrayne Bernegossi. January 2007 (has links)
Orientador: Elisa Helena Giglio Ponsano / Banca: Roberto de Oliveira Roça / Banca: Otto Mack Junqueira / Resumo: Os efeitos da adição de biomassa de Rubrivivax gelatinosus em dietas de galinhas poedeiras foram investigados. Sorgo e milho foram utilizados para formulação de rações basais que receberam níveis crescentes de biomassa. A biomassa bacteriana aumentou a tonalidade de vermelho e diminuiu a luminosidade das gemas quando adicionada a ambas as rações basais. Na ração à base de milho, 1.500ppm de biomassa foram suficientes para alcançar a preferência do consumidor, enquanto que, com ração à base de sorgo, 7.500ppm foram necessários para atingir o mesmo objetivo. Galinhas alimentadas com ração à base de milho tiveram consumo de ração superior e melhor conversão alimentar que aquelas alimentadas com ração à base de sorgo, mas os níveis de inclusão da biomassa em ambas as rações basais não influenciaram estes parâmetros. Durante o período experimental não ocorreu mortalidade nem mudança no peso das galinhas. As galinhas alimentadas com ração à base de milho mostraram taxas superiores de produção de ovos, peso e massa de ovos que aquelas alimentadas com ração à base de sorgo. Estes parâmetros não foram influenciados pela inclusão de níveis de biomassa em ambos os tipos de ração. Níveis normais para enzimas séricas e ausência de lesões degenerativas e inflamatórias nos fígados e nos rins das galinhas permitem a indicação da biomassa para suplementação de rações. / Abstract: The effects of the dietary inclusion of Rvi. gelatinosus biomass in layers rations were investigated. Sorghum and corn were used for the formulation of basal rations that received increasing levels of biomass. The bacterial biomass increased red hues and decreased lightness of yolks when added to both basal rations. Biomass at 1,500ppm in the corn-based ration was enough to reach consumers' preference, while with the sorghum-based ration, 7,500ppm were necessary to reach the same. Hens fed corn-based rations had superior feed consumption and better feed conversion than those fed sorghum-based rations but the inclusion levels of the biomass on both basal rations did not influence these parameters. No mortality and no change on layers weight occurred during the experimental period. Hens fed corn-based rations showed superior egg production, egg weight and egg mass rates than those fed sorghum-based rations. These parameters were not influenced by the inclusion levels of the biomass on both kinds of rations. Normal levels for seric enzymes and the absence of degenerative and inflammatory lesions in livers and kidneys of hens allow the indication of the biomass for ration supplementation. / Mestre

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