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Superfícies com curvatura gaussiana constante e vetor curvatura média normalizado paralelo

Souza, José Roberto Guimarães de 20 June 2014 (has links)
Submitted by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-11-03T10:11:33Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - José Roberto.pdf: 1479021 bytes, checksum: 108a79be3b0cfe5702a5a3bc10672dbf (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-11-03T10:15:29Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - José Roberto.pdf: 1479021 bytes, checksum: 108a79be3b0cfe5702a5a3bc10672dbf (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-11-05T18:29:02Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação - José Roberto.pdf: 1479021 bytes, checksum: 108a79be3b0cfe5702a5a3bc10672dbf (MD5) / Made available in DSpace on 2015-11-05T18:29:03Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação - José Roberto.pdf: 1479021 bytes, checksum: 108a79be3b0cfe5702a5a3bc10672dbf (MD5) Previous issue date: 2014-06-20 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The objective of this work is to show that "M" is an analytic surface, oriented and closed the Euclidean space "Em" a constant Gaussian curvature and vector average curvature standard parallel, then either "M" is in a hypersphere of "Em" as a minimum area or "M" is a surface product of two circles plans. / O objetivo deste trabalho é mostrarmos que se "M" é uma superfície analítica, orientada e fechada do espaço euclideano "Em" com curvatura Gaussiana constante e vetor curvatura médio normalizado paralelo, então ou "M" está em uma hiperesfera de "Em" como uma superfície mínima ou "M" é uma superfície produto de dois círculos planos.
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Sobre a Curvatura Gaussiana de superfícies compactas em variedades homogêneas de dimensão três

Pereira, João Filipe Bezerra, 092984439644 06 March 2015 (has links)
Submitted by João Pereira (joao_jou@hotmail.com) on 2018-09-10T15:36:42Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação Versão Final João Filipe com capa (3).pdf: 9622644 bytes, checksum: 8e5d2a24add110a015378d665087c184 (MD5) / Approved for entry into archive by PPG Matemática (ppgmufam@gmail.com) on 2018-09-10T15:39:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação Versão Final João Filipe com capa (3).pdf: 9622644 bytes, checksum: 8e5d2a24add110a015378d665087c184 (MD5) / Rejected by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br), reason: A Carta de Encaminhamento para Autodepósito precisa ser depositada. Siga as instruções http://biblioteca.ufam.edu.br/servicos/teses-e-dissertacoes on 2018-09-10T18:01:09Z (GMT) / Submitted by João Pereira (joao_jou@hotmail.com) on 2018-09-10T19:51:06Z No. of bitstreams: 3 Dissertação Versão Final João Filipe com capa (3).pdf: 9622644 bytes, checksum: 8e5d2a24add110a015378d665087c184 (MD5) Carta de Encaminhamento - João Filipe (1).pdf: 345703 bytes, checksum: 0b5e944c4f490db26b7032a876662635 (MD5) Ata de Defesa - João Felipe.pdf: 448121 bytes, checksum: c6b961e6c79bdc34c86617f4f4e12aaa (MD5) / Approved for entry into archive by PPG Matemática (ppgmufam@gmail.com) on 2018-09-11T12:52:07Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Dissertação Versão Final João Filipe com capa (3).pdf: 9622644 bytes, checksum: 8e5d2a24add110a015378d665087c184 (MD5) Carta de Encaminhamento - João Filipe (1).pdf: 345703 bytes, checksum: 0b5e944c4f490db26b7032a876662635 (MD5) Ata de Defesa - João Felipe.pdf: 448121 bytes, checksum: c6b961e6c79bdc34c86617f4f4e12aaa (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-09-11T14:51:20Z (GMT) No. of bitstreams: 3 Dissertação Versão Final João Filipe com capa (3).pdf: 9622644 bytes, checksum: 8e5d2a24add110a015378d665087c184 (MD5) Carta de Encaminhamento - João Filipe (1).pdf: 345703 bytes, checksum: 0b5e944c4f490db26b7032a876662635 (MD5) Ata de Defesa - João Felipe.pdf: 448121 bytes, checksum: c6b961e6c79bdc34c86617f4f4e12aaa (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-11T14:51:20Z (GMT). No. of bitstreams: 3 Dissertação Versão Final João Filipe com capa (3).pdf: 9622644 bytes, checksum: 8e5d2a24add110a015378d665087c184 (MD5) Carta de Encaminhamento - João Filipe (1).pdf: 345703 bytes, checksum: 0b5e944c4f490db26b7032a876662635 (MD5) Ata de Defesa - João Felipe.pdf: 448121 bytes, checksum: c6b961e6c79bdc34c86617f4f4e12aaa (MD5) Previous issue date: 2015-03-06 / CAPES - Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Compact flat surfaces of homogeneous Riemannian 3-manifolds with isometry group of dimension 4 are classified. Nonexistence results for compact constant Gauss curvature surfaces in these 3-manifolds are established. / Neste trabalho vamos classificar as superfícies compactas planas em variedades riemannianas homogêneas tridimensionais com grupo de isometrias de dimensão 4. Além disso, vamos estabelecer resultados de inexistência de superfícies compactas de curvatura gaussiana constante nestas variedades.
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Superfícies imersas numa forma espacial tridimensional com curvatura gaussiana constante

SANTOS, José Alan Farias dos 31 January 2011 (has links)
Made available in DSpace on 2014-06-12T18:33:43Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo9406_1.pdf: 1494004 bytes, checksum: 7f5915c4a7cdea79377d96b8d73722e1 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2011 / O teorema de Cartan assegura que as variedades Rn, Sn,Hn são essencialmente as únicas variedades Riemannianas completas simplesmente conexas com curvatura seccional constante. Nomeia-se esses tipos de variedades como sendo Formas Espaciais. O trabalho apresenta, quando possível, a classificação das superfícies completas de curvatura constante imersas numa forma espacial tridimensional. Assim, são estabelecidos três teoremas de classificação os quais trazem a classificação geral, quando possível, pois algumas questões continuam em aberto. No primeiro caso, referente ao R3 mostra-se que as classes das superfícies completas imersas em R3, segundo o sinal da curvatura Gaussiana K são cilindros se K &#8801; 0, ou esferas se K > 0. E não existem se K < 0(teorema de Hilbert), . As classificações referentes a S3 e H3 é feita segundo a curvatura extrínseca(Kext). Porém, no final de cada respectivo capítulo figuram teoremas que trazem a classificação geral(quando possível) por meio da curvatura intrínseca(Kint). Em relação ao S3 é evidenciado que a classe de superfícies são constituídas por 2- esferas se Kint &#8805; 1; pelo conjunto vazio se Kint < 0 ou 0 < Kint < 1; e para o caso Kint = 0(superfícies flats) é feita uma discussão sobre a classe das superfícies de translação, da qual os toros de Clifiord fazem parte. Para o H3, estas superfícies são esferas Geodésicas se Kint > 0, horosferas ou conjunto de pontos equidistantes de uma quando Kint = 0. No caso Kint &#8801; &#8722;1, elas são formadas por porção de Cones ou Cilindros Geodésicos se; não existem superfícies para quando Kint < &#8722;1(consequência direta de uma versão mais geral do Teorema de Hilbert); finalmente, quando &#8722;1 < Kint < 0, exibimos apenas as superfícies de revolução, incluindo hiperesferas
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Modelamiento Geoestadístico de Abundancias de Minerales en el Yacimiento Radomiro Tomic

Cornejo González, Javier January 2009 (has links)
El consumo de ácido en yacimientos con zonas de óxidos superficiales es una variable importante dentro del proceso, ya que una pequeña variación en el porcentaje de minerales como la crisocola, el copper wad, las arcillas de cobre y la atacamita puede aumentar el costo asociado a este consumo y además disminuir la extracción final. Con esto, es clave realizar una buena estimación de las abundancias de minerales, ayudando a tomar decisiones que pueden derivar en el éxito o fracaso económico del proyecto y a reducir los costos de procesamiento. El presente estudio se realizó en el yacimiento Radomiro Tomic, en particular para el banco 28.250 que forma parte de la zona de óxidos superficiales. Dentro de esta zona, se consideró cuatro variables (arcillas de cobre, atacamita, crisocola y copper wad) que corresponden a una asociación de óxidos. Los datos disponibles provienen de pozos de tronadura y corresponden a apreciaciones visuales del porcentaje de presencia dentro de los óxidos, de forma que su medida (entre 0% y 100%) tiene un error asociado debido a su naturaleza cualitativa. Por esta razón, se clasificaron los datos en un número limitado de valores, con lo que se obtuvieron cuatro variables discretas ordenadas. Con la información anterior, se aplicaron dos métodos geoestadísticos (co-kriging y co-simulación) para modelar la distribución de las abundancias de minerales en el banco. Estos métodos se diferencian por cuanto el primero está pensado para estimación de variables produciendo un alisamiento de los valores, mientras que el segundo está pensado para reproducir la variabilidad de las abundancias reales. Ambos están basados en un modelamiento de la correlación espacial de cada variable y de las correlaciones entre variables. Luego, se buscó comparar los dos enfoques, en cuanto a sus capacidades de predecir las abundancias en sectores sin información y de medir la incertidumbre en los valores reales de estas abundancias. Los métodos propuestos presentan tiempos de cálculo disímiles, así como complejidades muy superiores en el caso de la co-simulación, la cual requiere convertir las variables discretas en variables Gaussianas. Sin embargo, a diferencia del co-kriging, la co-simulación permite reproducir la variabilidad espacial de las abundancias de minerales, con lo cual se puede determinar intervalos en donde las abundancias reales son susceptibles de hallarse y tener una mejor idea de los riesgos de tener excesos o deficiencias de ciertos minerales en el proceso metalúrgico. Finalmente la co-simulación es una herramienta muy útil para la producción en el corto plazo, a fin de determinar las mezclas enviadas a planta, pudiendo mejorarse la recuperación y la extracción y minimizar los costos de consumo de ácido y así mejorar las utilidades del negocio.
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Modelamiento del efecto de soporte en un contexto multivariable

Cuevas Machuca, Leonardo Nicolás January 2013 (has links)
Ingeniero Civil de Minas / Encontrar un modelo que se ajuste a la distribución conjunta de varios elementos de interés, dependiendo del soporte en el que se estudie (compósito o bloque), es un problema que atañe a la evaluación de yacimientos polimetálicos. Por este motivo, el presente trabajo busca generalizar un modelo de cambio de soporte (a saber, el modelo Gaussiano discreto) al contexto multivariable, aplicándolo a la estimación global de los recursos recuperables sobre determinadas leyes de corte. Se cuenta con una base de datos referente a una veta polimetálica con cinco elementos de interés: plata, oro, plomo, zinc y cobre, siendo la variable de mayor interés la plata. Los datos de leyes son transformados a datos de potencia y acumulaciones, con la finalidad de trabajar con variables aditivas, pasando entonces de un estudio tridimensional a un estudio bidimensional en el plano de la veta. Para validar los resultados obtenidos por el modelo de cambio de soporte, se construye un modelo de referencia, utilizando una cosimulación seguida de un rebloqueo, el que entrega una distribución al mismo soporte que el modelo Gaussiano discreto (bloques de cinco metros de lado). El modelo de referencia es considerado como el escenario real y con ello se tiene un punto de comparación. Los resultados del modelo de cambio de soporte se estudian por medio de análisis de medias, varianzas, histogramas, nubes de correlación y curvas de selectividad (tonelaje-ley, tonelaje-ley equivalente y fino-tonelaje), obteniendo tonelajes, leyes medias y finos a diferentes leyes de corte del elemento principal (plata) o de una combinación de los diferentes elementos (plata equivalente). Se verifica que el cambio de soporte genera una simetrización de las distribuciones y una disminución de la dispersión, generando leyes medias más bajas, mayor tonelaje y una disminución en la cantidad de finos, indicativo de una pérdida de selectividad. Al considerar una ley de corte de plata equivalente de 1000 [g/t], el modelo indica que la cantidad total de roca a extraer es del orden de las 60.000 toneladas y que las leyes medias son de 2269 [g/t] para la plata, 0,25 [g/t] para el oro, 1,53% para el plomo, 2,18% para el zinc y 1,16% para el cobre. La explotación minera selecciona bloques de mineral, de tamaño definido para cada método de explotación, por lo que obtener una buena estimación de las distribuciones al soporte de los bloques de selección es trascendente para evaluar los recursos recuperables por sobre determinadas leyes de corte y el beneficio económico asociado. Puesto que las distribuciones concuerdan globalmente con el modelo de referencia, se recomienda el modelo Gaussiano discreto para ser utilizado en etapas preliminares o de prefactibilidad del proyecto minero, debiendo ser completado por estimaciones locales en etapas posteriores.
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[en] CALCULUS OF AFFINE STRUCTURES AND APPLICATIONS FOR ISOSURFACES / [pt] CÁLCULO DE ESTRUTURAS AFINS E APLICAÇÃO ÀS ISOSSUPERFÍCIES

04 October 2011 (has links)
[pt] A geometria diferencial provê um conjunto de medidas invariantes sob a ação de um grupo de transformações, em particular rígidas, afins e projetivas. Os invariantes por transformações rígidas são usados em quase todas as aplicações de computação gráfica e modelagem geométrica. O caso afim, por ser mais geral, permite estender essas ferramentas. Neste trabalho, propriedades geométricas são apresentadas no caso de superfícies paramétricas ou implícitas, em particular, a métrica afim, os vetores co-normal e normal afins e as curvaturas Gaussiana e média afins. Alguns resultados usuais de geometria Euclidiana, como a fórmula de Minkowski, são estendidos para o caso afim. Esse estudo permite definir estimadores das estruturas afins no caso de isossuperfícies. Porém, um cálculo direto dessas estruturas resulta em um grande número de operações e instabilidade numérica. Uma redução geométrica é proposta, obtendo fórmulas mais simples e mais estáveis numericamente. As propriedades geométricas incorporadas no Marching Cubes são analisadas e discutidas. / [en] Differential Geometry provides a set of measures invariant under a set of transformations, in particular rigid, affine, and projective. The invariants by rigid motions are using almost all applications of computer graphics and geometric modeling. The affine case, since it is more general, allows to extend these tools. In this work, geometric properties are presented in the case of parametric or implicit surfaces, in particular the affine metric, the conormal and normal vectors, and the affine Gaussian and mean curvatures. Some usual results of Euclidean geometry, as the Minkowski formula, are extended for the affine case. This study allows to define estimators of affines structure in the case of isosurfaces. Although, the direct calculation of these structures greatly increases the number of operations and numerical instabilities. A geometrical reduction is proposed obtaining a much simpler and numerical stabler formulae. The geometrical properties are incorporated in the Marching Cubes algorithms, then they are analyzed and discussed.
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Estudo comparativo entre a Simulação Sequencial Gaussiana e a Simulação Baseada em Wavelets aplicado a quantificação de minério de Cu em um depósito sintético / Comparison between Sequential Gaussian Simulation and Wavelet-based Simulation applied to quantify copper ore in a synthetic deposit

Takafuji, Eduardo Henrique de Moraes 31 August 2015 (has links)
O julgamento da qualidade de um método de estimativa/simulação é mais adequado se os resultados puderem ser comparados a dados reais. Uma vez que na mineração isto é inviável, este trabalho é baseado em um modelo de depósito mineral de cobre - representando a geologia e a distribuição de dados de modo heterogêneos. O modelo reproduz um depósito com preenchimento hidrotermal em uma falha inversa e as rochas encaixantes são meta-arenito e folhelho dobrados. O objetivo é comparar os resultados obtidos pelo método de Simulação Baseada em Wavelets - método o qual utiliza a estatística espacial de alta-ordem para reproduzir as estruturas da geologia - com o método clássico de Simulação Sequencial Gaussiana, a fim de avaliar um método de geoestatística de multiponto aplicado a variável contínua. Para comparar os resultados, foi calculado o valor potencial e para qual pilha (minério ou estéril) deveria ir cada bloco. Os resultados mostram que, matematicamente, a Simulação Sequencial Gaussiana obteve resultados melhores, uma vez que destinou melhor seus blocos e perdeu menos dinheiro com estéril na pilha de minério e minério de pilha de estéril. Porém, é notória a influência da imagem de treinamento nos resultados da Simulação Baseada em Wavelets, o que mostra que a Simulação Baseada em Wavelets de variáveis contínuas é promissora se a imagem de treinamento for adequada. O grande problema é que sua escolha ou criação é demasiadamente complexa, pois necessita de precisão local e global. / The judgment of the quality of an estimation/simulation method is more suitable if the results can be compared to real data. Once in mining that is not feasible, this work is based on a synthetic mineral deposit - represented by a very heterogeneous geology and spatial data distribution. The model reproduces a deposit with hydrothermal filling in a n inverse fault and the bedrocks are folded meta-sandstone and phyllite. The objective is to compare the results obtained by Wavelet-based Simulation method - which uses the spatial high-order statistic to reproduce the geologic structures - with the classic method of Sequential Gaussian Simulation in order to evaluate a multipoint geostatistical method applied to a continuous variable. To compare the results, the potential value was calculated and to which pile (ore or waste) each block should go. The results show that, mathematically, Sequential Gaussian Simulation\'s results are better, since its blocks allocated better and lost less money on waste in ore pile and ore in waste pile. However, it is clear the influence of the training image on the results of Wavelet-based Simulation. This shows that the Wavelet-based Simulation of continuous variables is promising if the training image is appropriate. The big problem is that choosing or creating it is too complex, because it requires local and global precision.
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Emissões atmosféricas e implicações potenciais sobre a biota terrestre devido as atividades antrópicas na Baía do Almirantado/ Ilha Rei George Antártica / Atmospheric emissions and potential implications on the terrestrial biota due to anthropogenic activities in Admiralty Bay / King George Island - Antarctica

Eduardo Delfino Sodré 30 September 2011 (has links)
In this study it was conducted a study on the impact on the atmosphere and terrestrial biota due to anthropogenic emissions in Admiralty Bay / King George Island - Antarctica. It was monitored the emissions of volatile organic compounds and semi-volatile, both in emission sources and in the surrounding of Antarctic Station Comandante Ferraz, and estimated emissions from ships, diesel generators and waste incineration. In assessing the environment, it were collected air, snow and feathers samples. With the emissions results, meteorology database and topographical study, it was used a Gaussian plume modeling to assess impacts. Four scenarios were evaluated: the presence of two ships NApOca Ary Rongel and Maximiano had concentrations up to 356 mg m-3 for VOCs and 18 mg m-3 for particulate matter, while the other, without the presence of the vessels, only considering research stations EACF Arctowski showed concentrations of up to 2.5 mg m-3 for VOC and 1.3 mg m-3 for particulate matter. VOC samples collected were consistent with the most critical scenario. The correlation study for atmospheric carbonyls and HPA and HPA and Black Carbon, deposited on snow, EACF pointed to be the main emissions source. The levoglucosan concentrations found approximately 2 km from EACF pointed to the practice of waste incineration at EACF. All areas of biological interest, previously mapped within the AAEG are vulnerable to anthropogenic emissions, as suggested by the dispersion model and the overlap of results / Neste trabalho foi realizado um estudo sobre o impacto sobre a atmosfera e a biota terrestre devido às emissões antrópicas na Baia do Almirantado/Ilha Rei George Antártica. Foram monitoradas as emissões dos compostos orgânicos voláteis e semi-voláteis, tanto nas fontes emissoras como no entorno da Estação Antártica Comandante Ferraz e estimadas as emissões dos navios, dos geradores a diesel e da incineração de lixo. Na avaliação do entorno, coletaram-se amostras de ar, neve e penas de aves. Com os resultados das emissões, do estudo topográfico e da meteorologia, realizou-se uma modelagem de plumas gaussiana para avaliar os impactos. Quatro cenários foram avaliados: dois com a presença dos navios NApOc Ary Rongel e Maximiano apresentaram concentrações máximas de até 356 g m-3 de COV e 18 g m-3 de material particulado, enquanto os demais, sem a presença dos navios, apenas considerando as estações de pesquisa EACF e Arctowski, apresentaram concentrações máximas de até 2,5 g m-3 de COV e 1,3 g m-3 de material particulado. Amostras de COV coletadas foram compatíveis com o cenário mais crítico. O estudo de correlação para carbonilas e HPA atmosférico e Carbono elementar e HPA, depositados em neve, apontaram a EACF como a principal fonte de emissão. As concentrações de levoglucosano detectadas a aproximadamente 2 km da EACF apontaram para a prática de incineração de lixo da EACF. Todas as áreas de interesse biológicos, anteriormente mapeados, dentro da AAEG, são vulneráveis às emissões antrópicas, como sugeriu o modelo de dispersão e a sobreposição dos resultados encontrados.
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Análise de modos normais em proteínas / Normal mode analysis in proteins

Mendonça, Matheus Rodrigues de 26 April 2010 (has links)
A abordagem de modos normais de baixa frequência na descrição das flutuações conformacionais dos estados nativos das proteínas globulares tem ajudado na caracterização das suas funções biológicas. Vários métodos teóricos e experimentais têm sido empregados para a determinação destas flutuações internas. Estes movimentos podem ser caracterizados pelo fator Debye-Waller (fator-B), correspondente à mobilidade local do resíduo em nível atômico. A análise de modos normais utilizando os modelos de rede elástica (ENM) demonstra ser uma técnica robusta. Fatores-B experimentais são reproduzidos teoricamente por meio desta técnica em tempos computacionais relativamente curtos, mostrando-se competitiva com as técnicas mais sofisticadas. O modelo de rede elástica é uma abordagem t ipo coarse-grain na qual a proteína no seu estado enovelado é representada por uma rede elástica tridimensional de carbonos conectados por molas. As molas representam as interações ligantes e não ligantes entre os carbonos . Neste trabalho, inicialmente, estudamos os modelos de rede elástica já conhecidos na literatura. Em seguida, realizamos um estudo comparativo entre eles. Neste estudo, comprovamos que os modelos pfGNM e pfANM apresentam melhor correlação com os fatores-B experimentais que os os modelos GNM e ANM tradicionais. Desenvolvemos também uma nova abordagem, a qual intitulamos número de contatos ponderados anisotrópica (AWCN). Mostramos que a abordagem AWCN apresenta um desempenho significativamente melhor que o modelo de rede elástica anisotrópica tradicional. Por fim, realizamos um estudo de caráter investigativo do comportamento do peso das interações entre resíduos. Este estudo re velou que, para os modelos WCN e AWCN, a correlação exibe o seu valor máximo para interações ponderadas $1/R^p$, entre resíduos $i$ e $j$j, para valores de $p$ em torno de 2. Nos modelos pfGNM e pfANM a correlação é maximizada para dois valores de $p$, o primeiro em torno de 2 e o segundo em torno de 4,75, indicando que a ponderação pelo recíproco do quadrado da distância, usualmente empregada na literatura, pode não ser adequada para obter a melhor correlação. / Low frequency normal mode approach to describe conformational fluctuations of globular proteins has helped to characterize their biological functions. Various theoretical and experimental methods have been employed to det ermine the magnitudes of those internal motions. Those motions can be characterized by the Debye-Waller factor (B-factor), co rresponding to the local mobility of the residue at the atomic level. Normal mode analysis using elastic network models (ENM) has demonstrated to be a robust technique. Experimental B-factors has been reproduced theoretically by means of this techniq ue in a short computational time and it has been shown to be competitive with more sophisticated techniques. The ENM is a coarse-grained approach in which the protein is represented by a three-dimensional elastic network of alpha-carbon atoms connect ed by springs. Springs represent bonded and non-bonded interactions between the alpha-carbon atoms. In this work, we study th e elastic network models known in the literature. Next, we perform a comparative study between them. We show that the pfGNM a nd pfANM models present better correlation with experimental B-factors than the traditional GNM and ANM models. We also devel op a new approach, which we entitled anisotropic weighted contact number (AWCN). We show that it presents results significantly better than the traditional anisotropic elastic network model. Finally, we perform a study of investigative character of the behavior for the weight of the interactions between residues. This study revealed that, for the WCN and AWCN models, the correlation exhibits its maximum value for weighted interactions $1/R^p$, between residues $i$ and $j$, for values of $p$ around 2. In the pfGNM and pfANM models the correlation is max imized for two values of $p$, the first one around 2 and the second one around 4.75. This indicates that the weighting by the reciprocal of the square of the distance, usually employed in the literature, may not be appropriate to obtain the best correlation.
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Detecção de anomalias por Floresta caminhos ótimos /

Passos Júnior, Leandro Aparecido January 2015 (has links)
Orientador: João Paulo Papa / Coorientador: Kelton Augusto Pontara da Costa / Banca: Alexandre Luís Magalhães Levada / Banca: Antonio Carlos Sementille / Resumo: O problema de detecção de anomalias vem sendo estudado há vários anos, dado que esta área é de grande interesse por parte de indústrias e também da comunidade científica. Basicamente, a detecção de anomalias difere da tarefa de reconhecimento de padrões convencional pelo fato de apenas amostras não anômalas (normais) estarem disponíveis para o treinamento da técnica de aprendizado de máquina. Assim, quando uma nova amostra é classificada, o sistema deve reconhecer a mesma como pertencente ou não ao modelo de dados "normais" que o mesmo aprendeu. Dentre as várias técnicas disponíveis, uma das mais antigas e populares é a que faz uso de distribuições Gaussianas multivariadas, as quais modelam o conjunto de dados normais como sendo distribuições Gaussianas e, qualquer amostra que não pertençaa a essas distribuições, é considerada anômala. Entretanto, um grande problema dessa abordagem está relacionado à etapa de estimação dos parãmetros dessas distribuições Gaussianas, a qual é realizada de maneira não supervisionada. Na presente dissertação, objetivamos estudar o comportamento do classificador Floresta de Caminhos Ótimos (Optimum-Path Forest - OPF) para (i) estimação dos parâmetros das distribuições Gaussianas, bem como compará-lo com várias outras técnicas comumente utilizadas para esta tarefa, e (ii) desenvolver uma nova técnica de detecção de anomalias centralizada nas funcionalidades do OPF. Os resultados experimentais em bases de dados sintéticas e reais demonstraram que o classificador OPF obteve melhores resultados em ambas as tarefas, dado que o mesmo é menos sensível à escolha dos parâmetros iniciais, o que é de grande valia em bases de dados cujas amostras "normais" estão representadas por múltiplos agrupamentos / Abstract: Anomaly detection has a massive literature, since detecting such anomalies are of great interest for big companies and also the scientific community. Basically, anomaly detection differs from regular pattern recognition task by the fact that only nom-anomalous (normal) samples are available for training the machine learning technique. Therefore, when a new a sample is classified, the system should recognize whether the sample belongs or not to the "normal" data model. Multivariate Gaussian Distributions is one of the oldest and most used techniques among others available, which models the set of normal samples as Gaussian Distributions, and classifies any sample outside those distributions as an anomaly. However, this approach presents a problem related to the parameter estimation, which is performed in a non-supervised classification. In this work, we propose to study the behavior of the Optimum Path Forest (OPF) classifier to (i) estimate the parameters of Gaussian distributions, as well as to compare it against with some of the most used techniques for this task, and (ii) to develop a new anomaly detection technique centered in the OPF functionalities. The experimental results applied in synthetic and real datasets show that OPF classifier achieved best results for both tasks, since its initial parameters are less sensible than the other techniques, which makes a great difference for datasets when "normal" samples are represented by many clusters / Mestre

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