Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Ciência dos Alimentos. / Made available in DSpace on 2012-10-23T03:09:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 245557.pdf: 1330055 bytes, checksum: 6489188032287553c96eedd3c82f79e7 (MD5) / A segurança do consumidor de moluscos bivalves, como as ostras, depende da sanidade destes a qual, por sua vez, depende das condições físicas, químicas e microbiológicas do ambiente de origem, do manuseio e tecnologia pós-captura, bem como da existência de legislação adequada, que se baseie na fiscalização de todas as etapas de produção. Esta pesquisa teve por objetivo monitorar a qualidade bacteriológica das águas onde os moluscos são cultivados e de ostras (Crassostrea gigas) em seis diferentes regiões de cultivo na Baía Sul da Ilha de Santa Catarina, por um período 12 meses, totalizando 15 coletas. Nas águas foram realizados ensaios microbiológicos para contagens de coliformes a 35°C, coliformes a 45°C, e de Escherichia coli. Na carne das ostras, além dos ensaios realizados nas águas, foram realizadas contagens de Vibrio spp., Estafilococos coagulase positivo, além de detecção de Salmonella spp. Embora as contagens tenham ficado abaixo dos limites máximos estabelecidos pela legislação brasileira, foram encontradas correlações positivas entre contagens de coliformes a 35°C, 45°C e E. coli nas águas onde são cultivadas, e na carne das ostras. Foram observadas diferenças estatísticas significativas entre as contagens de coliformes a 45°C nas amostras de águas onde são cultivadas as ostras provenientes da região mais contaminada (Barro Vermelho) e das regiões menos contaminadas (Caieira da Barra do Sul e Costeira do Ribeirão). Os parâmetros físico-químicos apresentaram pouca ou nenhuma correlação estatística com as contagens bacteriológicas realizadas nas águas onde os moluscos são cultivados, no entanto foi encontrada uma correlação positiva significativa entre a temperatura destas águas e a incidência de Vibrio spp. na carne dos moluscos. Considerando a Baía Sul como um todo, foi possível observar a influência do índice pluviométrico nas contagens bacteriológicas obtidas nas águas e consequentemente nas ostras, sendo que as maiores contagens de coliformes a 35°C, 45°C e Escherichia coli nas águas, e de Escherichia coli nas ostras, foram observadas no mês de novembro 2006, mesmo mês em que foram registrados os maiores acumulado pluviométricos, tanto mensal quanto na semana anterior a coleta. Os resultados encontrados, tanto para águas onde os moluscos são cultivados quanto para as amostras de ostras estão de acordo com os parâmetros descritos na legislação brasileira, estando todas as regiões aptas para o cultivo de moluscos bivalves. Contudo, ressalta-se a importância da implantação de saneamento básico em regiões de cultivo de moluscos bivalves, assim como o monitoramento bacteriológico constante de indicadores de qualidade, tanto nas águas onde os moluscos são cultivados, como nos moluscos, além do desenvolvimento de programas de qualidade para a cadeia produtiva de moluscos bivalves.

Submitted by Reginaldo Soares de Freitas (reginaldo.freitas@ufv.br) on 2017-02-09T15:44:27Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5123644 bytes, checksum: 4fe6372fb6e0642bdd0f806dd9635fd6 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-02-09T15:44:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 5123644 bytes, checksum: 4fe6372fb6e0642bdd0f806dd9635fd6 (MD5) Previous issue date: 2005-09-02 / Os objetivos deste trabalho foram: estudar através da análise espacial de dados geográficos, a ocorrência de cigarras ( Quesada gigas Oliver) em povoamentos de paricá (Schizolobium amazonicum Huber ex Ducke), avaliando os efeitos da variação da intensidade amostral e da composição de unidades amostrais, na precisão dos mapas de predição da quantidade de cigarras por árvore nos reflorestamentos e testando a aplicação de dois interpoladores (krigagem e inverso do quadrado da distância) para a geração de mapas de predição da quantidade de insetos dentro dos reflorestamentos. Para isto, foi feita a contagem do número de cigarras/árvore em pontos dentro de duas áreas de estudo, presentes em um reflorestamento de paricá localizado no município de Dom Eliseu - PA, onde ocorriam problemas com infestação por cigarras. Em uma destas áreas os pontos foram lançados na densidade de 1 ponto a cada 30 hectares, onde foi amostrada uma única árvore por ponto, obedecendo à estratégia de amostragem convencionalmente usado pela empresa proprietária do reflorestamento em estudo. Na outra área, outros pontos foram lançados, desta vez na densidade de 1 ponto a cada 3 hectares e com a amostragem feita em 4 árvores ao invés de uma. As unidades amostrais, suas localizações geográficas, bem como a quantidade de cigarras contada em cada um deles foram inseridos em um programa de geoprocessamento, que tinha suporte para análise espacial de dados geográficos. Neste programa, tais dados foram analisados através da aplicação de dois métodos de interpolação (krigagem ordinária e inverso do quadrado da distância), que possibilitou a geração de mapas de predição da quantidade de cigarras por árvore, bem como permitiu avaliar a adequação dos métodos de interpolação e das diferentes estratégias de amostragem, através da validação cruzada das interpolações. As análises indicaram que as duas intensidades amostrais usadas neste trabalho não foram suficientes para permitir a detecção de forte dependência espacial do número de cigarras/árvore nas áreas de estudo. A dependência espacial ainda permaneceu fraca mesmo na amostragem onde foram usadas 4 árvores por unidade amostral; no entanto, houve uma tendência de melhora nos resultados da validação cruzada e consequentemente na precisão dos mapas de predição de cigarras/árvore, à medida que se aumentou a quantidade de árvores por unidade amostral. Devido a esta baixa dependência espacial, os resultados dos dois métodos de interpolação (krigagem ordinária e inverso do quadrado da distância) apresentaram-se semelhantes. Apesar disto, o método da krigagem ordinária apresentou-se vantajoso pela maior quantidade de recursos que ofereceu durante a análise dos resultados. Os resultados deste t abalho indicam que as estratégias de amostragem utilizadas devem ser r melhoradas para gerar mapas de predição com maior precisão para a quantidade de cigarras/árvore nos reflorestamentos de paricá. / This work has as an objective the study of the occurrence of buzzers ( Quesada gigas Oliver) in Paricá ( Schizlobium amazonicum Huber ex Ducke) stands using spatial geographical data analysis, evaluating the effects of the sample intensity variation and the composition of the sample units on the precision of the buzzer quantity prediction maps per tree in the reforestations, testing the application of two interpolators (kriging and the inverse of the square of the distance) for the generation of insect quantity prediction maps within the reforestation stands. As such, the number of buzzers/tree were counted in points in the two study areas, within a Paricá reforestation in the Dom Eliseu county, state of Pará, that has a buzzer infestation problem. In one of these areas the points were set out in a density of 1 point for every 30 hectares, where as one tree was sampled per point, obeying the sample strategy conventionally used by the company which owns the reforestation in study. In the other area, more points were set out, but this time with a density of 1 point for every 3 hectares and with the sampling done on four trees instead of one. The sample units, there geographical localization and the quantity of buzzers in them, were put in to a geoprocessing program that supports spatial geographical data analysis. In this program, the data was analyzed applying two interpolation methods (ordinary Kriging and the inverse of the square of the distance) that allowed the generation of buzzer quantity prediction maps per tree, and also allowed for the study of the adequacy of the interpolation methods and of the different sampling strategies, through the cross validation of the interpolations. The analysis indicated that the two sampling intensities utilized in this work weren’t enough to allow a strong spatial dependence of the number of buzzers/tree in the study areas. The spatial dependency still remained weak when the sampling was of four trees per sample unit, however, there was an improvement tendency in the results of the cross validation and consequently in the precision of the buzzer/tree prediction maps, as the number of trees per sample unit increased. Due to this low spatial dependency, the results of both interpolation methods (ordinary Kriging and the inverse of the square of the distance) were similar. Other than this, the ordinary Kriging method was more of an advantage because of the greater amount of resources it offered during the result analysis. The results of this work indicate that the sampling strategies must be improved to generate better and more precise buzzer/tree prediction maps for the reforestations of Paricá. / Não foi localizado o cpf do autor.

A produção do agronegócio brasileiro se faz competitiva em escala. No mercado mundial vendemos commodities e compramos produtos processados de maior valor agregado, despendendo recursos naturais e verba pública para gerar pouca riqueza para o país. É sabido que, nos últimos anos vem ocorrendo incremento da atividade aquícola nacional, mas apesar disso, a produção de pescado ainda apresenta cadeias produtivas pouco organizadas. Neste trabalho sugere-se o pirarucu como espécie de pescado apta a apresentar cadeia produtiva de produtos competitivos no mercado nacional de pescado de maior valor agregado. Foram realizadas entrevistas semiestruturadas em 22 atores da cadeia produtiva do pirarucu cultivado, resultando em mais de 13 horas de diálogo para compreensão de quem são os atores, quais são os gargalos e quais são as potencialidades de um produto de alto valor agregado à base de pirarucu. Objetivando responder se partes nobres do peixe podem ser competitivas enquanto produto premium, as respostas foram categorizadas em: atores da cadeia produtiva, gargalos na produção, gargalos no mercado, potencialidades intrínsecas e potencialidades extrínsecas do produto. A conclusão alcançada foi que produtos de pirarucu (como filé e lombo congelados e embalados em pequenas porções) são produtos nobres e podem se tornar competitivos no nicho de mercado de pescado premium, caso seus gargalos sejam superados, uma vez que apresentam potencialidades intrínsecas e extrínsecas de grande valor para o consumidor. / Brazilian agribusiness is competitive in scale. We sell commodities and buy processed value added products, spending natural resources and public money doing this. In recent years there has a increase in the national aquaculture activity, but despite this, fish production still presents disorganized supply chain. In this work suggested that pirarucu is a fish capable to have competitive products in the national premium fish market. Were conducted semi-structured interviews in 22 players of the cultivated pirarucu supply chain production, resulting in more than 13 hours of dialogue to understand who the players are, what the constraints are, and what the potentialities are. In order to answer the question of whether the premium fish can be competitive as a product, the answers were categorized as: players, constraints in the production, constraints in the market, intrinsic potentialities and extrinsic potentialities. The conclusion reached was that pirarucu products (such as frozen fillet and loin) are premium products and can become competitive in the niche market of value-added fish, if their constraints are overcome, since they have intrinsic potentialities and extrinsic values to the consumer.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Aquicultura / Made available in DSpace on 2012-10-26T09:59:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 303437.pdf: 395745 bytes, checksum: 1ba3fefe906aa4dfb31bc194833092ac (MD5) / Para obter dados que permitissem o dimensionamento e planejamento de um laboratório, compatível com o mercado atual, foi analisado o histórico (2004-2010) do mercado de sementes diplóides de ostras do Pacífico do Laboratório de Moluscos Marinhos (LMM), da Universidade Federal de Santa Catarina (UFSC), e o processo de produção utilizado no mesmo. A partir desta avaliação preliminar foram projetados três laboratórios, com capacidades de produção de 50, 100 e 150 milhões de sementes por safra, e realizadas análises de viabilidade econômico-financeiras com base nas técnicas de valor presente líquido (VPL) e taxa interna de retorno (TIR), tendo como condicionantes preços pré-fixados, do milheiro de sementes, de R$ 12,00, R$ 18,00 e R$ 24,00. Para cada laboratório, foram calculados os custos de capital e operacional para determinar quais os pesos relativos que incidem sobre cada um, bem como, os preços mínimos da semente de ostra que determinam a recuperação de todo o investimento (custo de capital e custo operacional), como forma de verificar o impacto da economia de escala sobre a atividade. Foi possível concluir a partir destas análises, que o mercado atual de sementes diplóides de ostras do Pacífico (de cerca de 45 milhões de sementes por safra) é pequeno e que a entrada da iniciativa privada nele representará uma alta no preço da semente. Um laboratório com capacidade para produzir esta quantidade de sementes teria que praticar um preço mínimo de R$ 17,00 para recuperar o investimento realizado. Com a demanda subindo para 90 milhões ou 135 milhões de sementes, este preço seria reduzido para R$ 10,80, ou R$ 7,80, respectivamente, devido à economia de escala. Ao se excluir o valor do terreno do custo de capital, esses preços mínimos diminuem, passando a ser de R$ 14,10, R$ 8,60 e R$ 6,30, respectivamente, demonstrando a influência da redução do volume de investimento inicial sobre a viabilidade do empreendimento. Um laboratório com capacidade de produção de 100 milhões de sementes, próxima a do LMM (mas operando para o mercado atual de apenas 45 milhões) teria que praticar um preço superior a R$ 18,00. Com este preço, obteve-se um VPL de -R$ 745.031,00 e uma TIR de apenas 1,85% ao ano, o que levaria a rejeição do empreendimento. Além disso, essa alternativa geraria um desperdício em custos variáveis da ordem de R$ 371.159,31. Com o preço de R$ 24,00, este laboratório demonstra viabilidade, apresentando um VPL de R$ 673.013,00 e uma TIR de 18,08%. Com relação ao investimento necessário, os custos mais relevantes dizem respeito à compra da área e de equipamentos, representando quase 70% do total. Entre os custos operacionais, a mão de obra direta e a energia consumida foram os itens mais representativos. A mão de obra, por ter sido classificada como um custo fixo teve a sua participação relativa reduzida à medida que aumentava o tamanho do laboratório e o preço da semente, tendo apresentado valores entre 42,28% e 20,62%. Para um mesmo preço de semente, esse item teve uma amplitude média de variação, entre um laboratório pequeno e um grande, de 16%. A energia apresentou um comportamento mais sensível à economia de escala, porém com uma baixa amplitude de variação, com uma média de 2%, entre o menor e o maior laboratório, operando ao mesmo preço de semente. Dependendo do tamanho do laboratório analisado e do preço fixado para o milheiro da semente, a energia teve uma participação máxima de 30,14%, para um laboratório com capacidade para 150 milhões de semente e preço a R$ 12,00 e 22,51%, também, para um laboratório deste porte, porém com a semente a R$ 24,00. Em termos monetários, entretanto, a diferença de consumo de energia entre o maior e o menor laboratório foi bem representativo e da ordem de R$ 933.465,00. Por meio deste estudo foi possível observar que duas alternativas a economia de escala surgem para redução do custo de produção de sementes de ostras e, consequentemente, de seu preço: mudanças tecnológicas que imprimam novos e significativos patamares de eficiência ao processo produtivo e/ou a diversificação de produtos, através da produção de espécies nativas potenciais, como o mexilhão (Perna perna) e a vieira (Nodipecten nodosus).

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2013 / Made available in DSpace on 2013-12-05T23:03:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 320337.pdf: 2088380 bytes, checksum: b82e99715a833e8a5eb4c51e691ed579 (MD5) Previous issue date: 2013 / Diversas áreas costeiras no Estado de Santa Catarina estão associadas a zonas de cultivo de ostras, pesca e lazer, sendo que algumas destas estão contaminadas por esgoto sanitário. Tecnologias vêm sendo desenvolvidas na tentativa de monitorar a contaminação nestes ambientes, dentre as quais, podemos destacar os biomarcadores e a ostra Crassotrea gigas como organismo sentinela. Neste estudo encontramos diferença significativa na trasncrição de genes de citocromo P450 (CYP356A2, CYP2AU2, CYP30C1, CYP3071A1 e CYP26F1) em amostras de glândula digestiva de ostras expostas por diferentes períodos a um local contaminado por esgoto sanitário. Também avaliamos os níveis de transcrição dos genes CYP356A2, CYP2AU2 e CYP30C1, em diferentes tecidos de ostras C.gigas, após um dia de exposição, sendo que os três genes responderam a presença de contaminantes. Essas informações permitem um avanço na caracterização da indução destes genes por contaminantes, bem como, através da execução deste projeto aprofundamos nossos conhecimentos relacionados aos níveis de transcrição de isoformas de genes de CYPs, uma vez que os genes CYP307A1, CYP3071A1 e CYP26F1 foram analisados pela primeira vez em diferentes tecidos de ostras C. gigas presentes em local contaminado por esgoto sanitário <br> / Abstract: Several coastal areas in the State of Santa Catarina are associated with oyster farming, fishing and leisure and some of these are contaminated by sanitary sewage. Technologies have been developed in an attempt to monitor contamination in these environments, among which we can highlight the biomarkers and the oyster Crassostrea gigas as sentinel organism. In this study we found significant differences in the transcription of cytochrome P450 genes (CYP356A2, CYP2AU2, CYP30C1, CYP3071A1 and CYP26F1) in samples of digestive gland of oysters exposed for different periods of exposure to a sanitary sewage contaminated site. We also assessed the levels of transcription of genes CYP356A2, CYP2AU2 and CYP30C1 in different tissues of oyster exposed for one day at the contaminated site, and the three genes were responsive to the contaminants. This information allows an advance in characterization of these genes by inducing contaminants, and by performing this design deepened our knowledge related to levels of transcript isoform of CYP genes, once the genes CYP307A1, CYP3071A1 and CYP26F1 were analyzed for the first time in different tissues of oyster C. gigas present in sewagecontaminated site.

A produção do agronegócio brasileiro se faz competitiva em escala. No mercado mundial vendemos commodities e compramos produtos processados de maior valor agregado, despendendo recursos naturais e verba pública para gerar pouca riqueza para o país. É sabido que, nos últimos anos vem ocorrendo incremento da atividade aquícola nacional, mas apesar disso, a produção de pescado ainda apresenta cadeias produtivas pouco organizadas. Neste trabalho sugere-se o pirarucu como espécie de pescado apta a apresentar cadeia produtiva de produtos competitivos no mercado nacional de pescado de maior valor agregado. Foram realizadas entrevistas semiestruturadas em 22 atores da cadeia produtiva do pirarucu cultivado, resultando em mais de 13 horas de diálogo para compreensão de quem são os atores, quais são os gargalos e quais são as potencialidades de um produto de alto valor agregado à base de pirarucu. Objetivando responder se partes nobres do peixe podem ser competitivas enquanto produto premium, as respostas foram categorizadas em: atores da cadeia produtiva, gargalos na produção, gargalos no mercado, potencialidades intrínsecas e potencialidades extrínsecas do produto. A conclusão alcançada foi que produtos de pirarucu (como filé e lombo congelados e embalados em pequenas porções) são produtos nobres e podem se tornar competitivos no nicho de mercado de pescado premium, caso seus gargalos sejam superados, uma vez que apresentam potencialidades intrínsecas e extrínsecas de grande valor para o consumidor. / Brazilian agribusiness is competitive in scale. We sell commodities and buy processed value added products, spending natural resources and public money doing this. In recent years there has a increase in the national aquaculture activity, but despite this, fish production still presents disorganized supply chain. In this work suggested that pirarucu is a fish capable to have competitive products in the national premium fish market. Were conducted semi-structured interviews in 22 players of the cultivated pirarucu supply chain production, resulting in more than 13 hours of dialogue to understand who the players are, what the constraints are, and what the potentialities are. In order to answer the question of whether the premium fish can be competitive as a product, the answers were categorized as: players, constraints in the production, constraints in the market, intrinsic potentialities and extrinsic potentialities. The conclusion reached was that pirarucu products (such as frozen fillet and loin) are premium products and can become competitive in the niche market of value-added fish, if their constraints are overcome, since they have intrinsic potentialities and extrinsic values to the consumer.

Made available in DSpace on 2014-06-12T15:51:42Z (GMT). No. of bitstreams: 2 arquivo3102_1.pdf: 1259276 bytes, checksum: c0878ec8ef24a46259582227748106b4 (MD5) license.txt: 1748 bytes, checksum: 8a4605be74aa9ea9d79846c1fba20a33 (MD5) Previous issue date: 2010 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A protease alcalina extraída do ceco pilórico do pirarucu (Arapaima gigas) foi purificada em quatro etapas: tratamento térmico, precipitação com sulfato de amônio, cromatografia de gel-filtração em coluna Sephadex® G-75 e cromatografia de afinidade em coluna benzamidina-agarose. Após as etapas de purificação aplicou-se uma amostra da proteina obtida em gel de eletroforese e verificou-se a presença de única banda que apresentou peso molecular aproximado de 28,0 kDa. Desta forma, após purificação, avaliaram-se as propriedades físico-químicas e cinéticas da enzima e o efeito de íons metálicos e de inibidores de proteases na atividade proteolítica da mesma, utilizando-se benzoyl-DL-arginine-p-nitroanilide (BApNA) como substrato. O pH e a temperatura ótima de reação encontrada foram 9,0 e 65°C, respectivamente. A enzima mostrou-se estável, após 30 min de incubação, em ampla faixa de pH alcalino (pH 6,0 a 11,5). Após 30 minutos de incubação a 60ºC, foi detectada uma perda de 10% da atividade tríptica. Os valores encontrados para os parâmetros cinéticos (Km, Kcat e Kcat/Km) foram: 0,47 ± 0,042 mM, 1,33 s-1 and 2,82 s-1 · mM-1, respectivamente, usando BApNA como substrato. A atividade tríptica mostrou-se sensível a alguns íons metálicos. A atividade tríptica foi inibida, em ordem crescente, pelos íons: Mn2+ > Ca2+ > Li+ > Cd2+ > Cu2+ > Fe2+ > Hg2+ > Zn2+ > Al3+ > Pb2+. Por outro lado, os íons K+, Mg2+ e Ba2+ não promoveram nenhum efeito na atividade da protease. A enzima foi fortemente inibida por inibidores de tripsina. Os ensaios com substrato específico e inibidores de tripsina forneceram evidências de que esta enzima é provavelmente uma tripsina-símile e suas características sugerem um forte potencial para ser utilizada em processos e produtos industriais

Submitted by Alisson Leda (alisson-brasil@outlook.com) on 2018-04-20T14:05:00Z No. of bitstreams: 2 Tese_adailton_2018_FINAL.pdf: 2103840 bytes, checksum: 5f0cfb2fe4f0061b7dd2bd23696e22b8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-04-20T14:06:52Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese_adailton_2018_FINAL.pdf: 2103840 bytes, checksum: 5f0cfb2fe4f0061b7dd2bd23696e22b8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2018-04-20T15:28:01Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese_adailton_2018_FINAL.pdf: 2103840 bytes, checksum: 5f0cfb2fe4f0061b7dd2bd23696e22b8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-04-20T15:28:01Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese_adailton_2018_FINAL.pdf: 2103840 bytes, checksum: 5f0cfb2fe4f0061b7dd2bd23696e22b8 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2018-01-12 / FAPEAM - Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado do Amazonas / The present thesis describes the main ecophysiological aspects of pirarucu (Arapaima gigas) adults and fingerlings coming from aquatic environments of the Nhamundá Environmental Protection Area (APA). The APA Nhamundá is a confluence between the Nhamundá (black water) and the Amazonas (white water) rivers, which allow to form several intermediates resulting from the water supply of one of the rivers. The pirarucu is a rustic animal and, from the physiological point of view, is phenotypically plastic capable of tolerating different types of environments. In this sense, adult specimens of A. gigas captured in five lakes within the APA Nhamundá were analyzed. For this animals, reference values for hematology, plasma biochemistry (hemoglobin, erythrocytes, hematocrit, hematimetric indexes, plasma ions and nitrogen metabolites), metabolic enzymes (lactate dehydrogenase, LDH and malate dehydrogenase, MDH) and body indexes (condition relative and condition factor). It was observed that the parameters of the blood physiology, as well as enzymatic, are closely associated with the physical and chemical characteristics of each environment where the fish was collected. To test the hypothesis that the physiological and metabolic variables are influenced by the chemical and physical characteristics of the environment, juveniles weighing 20-75 g (16-23 cm total length) were experimentally maintained for 7 and 14 days in the black water of the Nhamundá River, white water of the Amazon River and in nursery (excavated tank). In these specimens the body, hematological, biochemical of the plasma indexes and the enzymatic activity of LDH and MDH in different tissues were analyzed. As observed in adult animals, hematological parameters and metabolic enzymes varied according to the physical and chemical characteristics of the water where the fish remained submitted. . Therefore, both juveniles and pirarucu adults showed high physiological and metabolic plasticity in relation to different types of water (with profound variations in pH, conductivity, salt concentration, hardness, alkalinity, transparency and oxygen concentration). These results provide physiological explanations about the rustic and adaptive characteristics of pirarucu in different environments in the Amazon. / A presente tese descreve os principais aspectos ecofisiológicos de pirarucu (Arapaima gigas) adultos e alevinos advindos de ambientes aquícolas da Área de Proteção Ambiental (APA) Nhamundá. A APA Nhamundá é uma confluência entre os rios Nhamundá (água preta) e rio Amazonas (água branca), os quais permitem formar diversos intermediários resultantes do aporte de água de um dos rios. O pirarucu é animal rústico e que, do ponto de vista fisiológico é fenotipicamente plástico capaz de tolerar diferentes tipos de ambientes. Neste sentido, foram analisados exemplares adultos de A. gigas capturados em cinco lagos dentro da APA Nhamundá. Para este animais foram descritos valores de referência para a hematologia, bioquímica plasmática (hemoglobina, eritrócitos, hematócrito, índices hematimétricos, íons plasmáticos e metabólitos nitrogenados), enzimas metabólicas (lactato desidrogenase, LDH e malato desidrogenase, MDH) e índices corporais (fator de condição e fator de condição relativo). Observou-se que os parâmetros da fisiologia do sangue, bem como enzimáticos, estão intimamente associados às características físicas e químicas de cada ambiente onde o peixe foi coletado. Para testar a hipótese que as variáveis fisiológicas e metabólicas são influenciadas pelas características químicas e físicas do ambiente, juvenis pesando 20-75 g (16-23 cm de comprimento total) foram experimentalmente mantidos por 7 e 14 dias na água preta do Rio Nhamundá, água branca do Rio Amazonas e em viveiro (tanque escavado). Nestes exemplares foram analisados os índices corporais, hematológicos, bioquímicos do plasma e atividade enzimática da LDH e MDH em diferentes tecidos, . Tal como observado nos animais adultos, os parâmetros hematológicos e as enzimas metabólicas variaram em função das características físicas e químicas da água onde os peixes permaneceram submetidos. . Portanto, tanto juvenis quanto os adultos de pirarucu demonstraram elevada plasticidade fisiológica e metabólica em relação aos diferentes tipos de água (com profundas variações de pH, condutividade, concentração de sais, dureza, alcalinidade, transparência e concentração de oxigênio). Estes resultados fornecem explicações fisiológicas sobre as características rústicas e adaptáveis do pirarucu em diferentes ambientes na Amazônia.

Endocrine disrupting chemicals (EDCs) are compounds that can interfere with hormone signaling pathways and are now recognized as pervasive in estuarine and marine waters. One prevalent EDC in California’s coastal waters is the xenoestrogen 4-nonylphenol (4-NP), which has been shown to impair reproduction, development, growth, and in some cases immune function of marine invertebrates. To further investigate effects of 4-NP on marine invertebrate immune function we measured total hemocyte counts (THC), relative transcript abundance of immune-relevant genes, and lysozyme activity in Pacific oysters (Crassostrea gigas) following bacterial infection. To quantify these effects we exposed oysters to dissolved phase 4-NP at high (100 μg l-1), low (2 μg l-1), or control (100 μl ethanol) concentrations for 7 days, and then experimentally infected (via injection into the adductor muscle) the oysters with the marine bacterium Vibrio campbellii. 4-NP significantly altered the effects of bacterial infection had on THC. Oysters exposed to both high and low 4-NP did not experience a bacteria-induced increase in THC, as seen in control oysters. We also determined that V. campbellii infection induced differential expression of a subset of immune-related genes tested (Cg-bigdef2, Cg-bpi1, Cg-lys1, Cg-timp) in some, but not all, tissues; 4-NP exposure altered expression patterns in two of these genes (Cg-bpi1 and Cg-tgase). Exposure to 4-NP alone also caused differential expression in some genes (Cg-bpi1, Cg-galectin1, Cg-clec2). Lastly, low levels of 4-NP significantly increased lysozyme activity 24 h post-infection. These results suggest that exposure to 4-NP can alter both cellular and humoral immune responses to bacterial infection in C. gigas.

Les rythmes biologiques constituent une propriété fondamentale de la vie, permettant aux organismes d’appréhender leur environnement et d’en anticiper les changements. Ces rythmes possèdent une double origine : une horloge moléculaire génère ces rythmes, qui sont ensuite synchronisés par des facteurs environnementaux. Si les organismes terrestres sont essentiellement soumis au rythme d’alternance jour/nuit, les espèces marines côtières et estuariennes occupent un biotope plus changeant encore : ils sont en effet également confrontés au rythme des marées. Pourtant, leurs rythmes biologiques sont à ce jour encore mal connus et les mécanismes moléculaires de(s) (l’) horloge(s) sous-jacente(s) ne sont pas caractérisés. Parallèlement, les efflorescences d’algues toxiques, en constante augmentation depuis 1970, constituent un problème écologique majeur, tant local qu’international. Les objectifs du présent travail consistaient à caractériser les rythmes de référence de l’huître Crassostrea gigas et d’en déterminer l’origine (moléculaire, zeitgebers). Il s’agissait ensuite d’étudier les perturbations potentielles de ces rythmes par l’algue toxique Alexandrium minutum, qui produit des toxines paralytiques et est régulièrement présente dans de nombreuses mers du globe. Les travaux réalisés ont permis de mettre en évidence l’existence d’un rythme d’activité valvaire circadien, faible et dual, et n’a pas permis de supporter l’hypothèse de l’existence d’une horloge circatidale. Nous avons formulé l’hypothèse que, chez C. gigas, le rythme tidal est soit d’origine exogène, soit produit par l’horloge circadienne synchronisée par les marées. Les analyses moléculaires réalisées sur le gène circadien cryptochrome dans le muscle adducteur - effecteur du mouvement des valves - ont montré que ce gène oscille à une fréquence tidale dans le muscle strié, favorisant notre seconde hypothèse. Par ailleurs, au-delà des gènes de l’horloge, l’algue A. minutum réprime l’expression de gènes impliqués dans différentes voies métaboliques importantes : la lutte contre le stress oxydant (cat, gpx), la respiration mitochondriale (cox1), l’immunité (ilk), la détoxification (mdr). Finalement nos analyses ont permis de mettre en évidence un impact génotoxique d’A. minutum chez C. gigas. / Biological rhythms constitute a fundamental property of life, allowing organisms to anticipate and adapt to their changing environment. These rhythms present a double origin: they are generated by a molecular clock and synchronized by environmental cues. Whereas terrestrial organisms are mainly subjected to day/night alternation, coastal and estuarine marine species inhabit an even more cycling biotope. They are indeed also submitted to tides. Nevertheless, biological rhythms in marine species are still unrecognized and molecular mechanisms of the underlying oscillator(s) are to date not determined. At the same time, toxic algae blooms are increasing since the 1970s and represent a major ecological concern, both at local and international levels. An objective of the present work was the characterization of biological rhythms in the oyster Crassotrea gigas and of their origin (molecular mechanism, zeitgebers). Furthermore, the work was designed to study the potential disruption of these rhythms by the toxic algal of worldwide distribution Alexandrium minutum, which produces paralytic toxins. The present results show the existence of a weak and dual circadian rhythm of valve activity in the oyster, and do not provide evidence for the existence of any circatidal clock. We suggested that, in the oyster C. gigas, the tidal rhythm could either be generated exogenously or endogenously by the tidally-synchronized circadian clock. Molecular analyses performed on the circadian gene cryptochrome in the adductor muscle of oyster, the effector of valve movements, revealed that Cgcry oscillates at tidal frequency in the striated muscle. This result supports our second hypothesis. Furthermore, A. minutum represses the expression of genes involved in key metabolic pathways: struggle against oxidative stress (cat, gpx), mitochondrial respiration (cox1), immunity (ilk), detoxification (mdr). Moreover, A. minutum impacts C. gigas at DNA level, being thus genotoxic.