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Caracterização de estirpes sugestivas de corinebactérias isolados de sítios intravenosos / Characterization of suggestive strains of corynebacteria isolated from intravenous sitesRamos, Juliana Nunes January 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Nacional de Controle de Qualidade em Saúde / Casos de infecções invasivas por corinebactérias, colonizadoras do ambiente e da microbiota humana ou de animais, tem sido crescentes em decorrência de melhor sobrevivência de indivíduos imunocomprometidos. Além da fenotipagem, métodos moleculares tem sido fundamentais na identificação de bastonetes Gram positivos irregulares(BGPI). O presente estudo teve como objetivo a caracterização fenotípica e genotípica de estirpes de corinebactérias isoladas de sítios intravenosos de pacientes internados em um hospital universitário no Rio de Janeiro. Neste sentido, 60 estirpes de microrganismos Gram positivos foram analisadas por metodologia enotípica convencional, sistemas API Coryne e Vitek 2 (bioMérieux) e análise das sequências dos genes 16S rRNA e rpoB, utilizada como metodologia de referência para avaliação dos sistemas fenotípicos. Os dados indicaram o isolamento de Corynebacterium striatum (44,68 %), Corynebacterium amycolatum (31,91 %), Corynebacterium jeikeium (8,51 %), Corynebacterium urealyticum (6,39 %), Corynebacterium diphtheriae (4,26%), Corynebacterium simulans (2,12%) e Corynebacterium minutissimum (2,12%) do sangue de pacientes fazendo o uso ou não de dispositivos invasivos. As espécies predominantes C. striatum e C. amycolatum apresentaram 8 e 9 perfis de resistência aos agentes antimicrobianos, respectivamente. O perfil de resistência com sensibilidade apenas à tetraciclina, linezolida e vancomicina, foi prevalente durante um surto epidêmico de C. striatum ocorrido em 2010. Este mesmo perfil foi observado para C. amycolatum, C. jeikeium e C. urealyticum. A identificação definitiva da maioria das estirpes de C. striatum, C. amycolatum, C. jeikeium, C. simulans e C. minutissimum só foi possível pela genotipagem. Interessantemente, a análise das sequências do gene 16S rRNA permitiu a identificação de outros microrganismos como Abiotrophia defectiva (6,67%), Arthrobacter (1,67%), Brevibacterium (11,67%) e Microbacterium (1,67%). / Cases of invasive infections corynebacteria , colonizing the environment and human and animal microbiota, has been increasing due to better survival of immunocompromised individuals. Besides phenotyping, molecular methods have been of great value in the identification of Gram positive irregular rods (BGPI). The present study aimed to phenotypic and genotypic characterization of isolates from corynebacteria isolated of intravenous sites of patients at a university hospital in Rio de Janeiro. Thus, 60 isolates of Gram positive microrganisms were analyzed by conventional phenotype methodology, and Vitek and API Coryne 2 systems (bioMérieux) and by sequence analysis of 16S rRNA and rpoB genes. The genotypic identification was used as reference methods for evaluation of phenotypic systems. The data indicated the isolation of Corynebacterium striatum (44,68 %), Corynebacterium amycolatum (31,91 %), Corynebacterium jeikeium (8,51%), Corynebacterium urealyticum (6,39 %), Corynebacterium diphtheriae (4,26%), Corynebacterium simulans (2.12%) and Corynebacterium minutissimum (2,12%) from the blood of patients making use or not of invasive devices. The predominant species C. striatum and C. amycolatum presented 8 and 9 profiles of resistance to antimicrobial agents, respectively. The resistance profile with sensitivity just to tetracycline, linezolid and vancomycin, was prevalent during an outbreak of C. striatum occurred in 2010. The same profile was observed for C amycolatum, C. jeikeium and C. urealyticum. The definitive identification of most strains of C. striatum, C. amycolatum, C. jeikeium, C. simulans and C. minutissimum was possible only by genotyping . Interestingly, the sequence analysis of the 16S rRNA gene allowed the identification of other microorganisms such as Abiotrophia defectiva (6,67%), Arthrobacter (1,67 %), Brevibacterium (11.67 %) and Microbacterium (1.67 %). In conclusion, BGPI isolates from invasive infections should not be neglected and sequence analysis of 16S rRNA and rpoB genes can contribute to the definitive identification of the species of Gram positive microorganisms, including corynebacteria involved in these infections.
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Diferentes genótipos do lócus da Proteína de Superfície de Merozoíto 1(MSP-1) de Plasmodium falciparumuma contribuição ao estudo da infecção plasmodial assintomática no município de Barcelos, AmazonasSilva, Ana Paula de Barros January 2014 (has links)
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Previous issue date: 2014 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / A malária é uma doença que acomete milhões de pessoas todos os anos no planeta. No Brasil, essa doença atingiu cerca de 267 mil pessoas somente em 2011, sendo que a maior parte dos casos ocorreu na região Amazônica. Causada por protozoários do gênero Plasmodium, possui um amplo espectro clínico que vai desdeinfecções assintomáticas, malária não complicada, a malária grave ou complicada, podendo evoluir até o óbito. Estudos realizados em áreas holo e hiperendêmicas de malária, fundamentalmente no continente Africano e em Papua Nova Guiné, permitiram estabelecer que o conhecimento da população de parasitos que circulam em uma área.Este estudo se propôs a avaliar o perfil genético da infecção por P. falciparumem uma área de alto risco epidemiológico para malária e com presença de infecção assintomática no município de Barcelos, médio rio Negro, estado do Amazonas
Para isso, foi estudado o gene MSP1 que codifica a Proteína de Superfície de Merozoíto 1, com o intuito de verificar a diversidade genética dos parasitos da região de Barcelos, a multiplicidade da infecção e as relações dos diferentes genótipos com o status clínico em área endêmica para malária. Foi realizada reação de polimerase em cadeia (PCR) a partir de DNA extraído de 79 amostras de sangue coletadas em indivíduos desta região. No total, foram encontrados 10 diferentes genótipos do parasito sendo que a maior parte dos indivíduos (45 pessoas, 56,96%) portava apenas um genótipo do parasito. Entre os indivíduos assintomáticos, 70,37% apresentavam um genótipo e os demais (29,63%) apresentaram dois genótipos
Entre os pacientes com malária, 50% tinham apenas um genótipo, 25% tinham dois genótiposs, 19,23% apresentaram três genótipos e 5,77% portavam quatro genótipos. Em média, portadores assintomáticos possuíam 1,3 genótipos diferentes enquanto pacientes com malária tiveram em média 1,8 genótipos. Concluiu-se que na região de Barcelos circulam populações de P. falciparumconsideravelmente diversas e que as infecções múltiplas estão mais presentes em portadores de malária que em indivíduos assintomáticos / Malaria is a disease that attacks millions of people all of the years in the
world
. In
Brazi
l,
it reached about 267
thousand people only in 2011
, and most of the cases was
registered
in the Amazonian area. Caused by protozoa of the gender
Plasmodium
, it
possesses a wide clinical spectrum
ranging from asymptomatic infections
, no
complicatedma
laria, serious or complicatedmalaria
that
could develop until death.
Studies accomplished in holo
-
and
hyperendemic
areas, fundamentally in t
he African
continent and in
Papua
New
Guinea, allowed to establish that the knowledge of the
population of parasite
s that circulate in a certain area
.
This study intended to evaluate
the genetic profile of the infection for
P. falciparum
in an area
of high
epidemic risk for
malaria and with
the
pre
sence of asymptomatic infection in the city
of Barcelos, medium
Rio
Negro
, state of Amazon
as
. For that, the gene MSP
-
1
,
that codifies the
Merozoite
Surface Protein
1, was studied to verify the genetic diversity of the parasites of the ar
ea
of Barcelos, the multiplicity
of the infection and the relationships of the differen
t
genotypes with the clinical status in
an
endemic area for malaria. Polymerase
Chain
R
ea
ction
(PCR)
was accomplished
starting from extracted DNA
from blood samples
collected in individuals from
this area. In total, 10 different genotypes of the parasite
we
re found and most of the individuals (45 people, 56,96%)
carried just a genotype of
the parasite
. Amon
g the asymptomatical individuals
, 70,37% introduced a genotype and
the othe
rs (29,63%) presented two
. Among the patients with malaria, 50% had
only one
ge
notype, 25% had two
genotypes
, 19,23% presented three genotypes and 5,77%
carried four genotypes. On
average, asymptomaticbearers
possessed 1,3 genotypes
while patient
s
with malaria had 1,8 genotypes on average. It was
concluded
that in the
area of Barcel
os
diverse populations
of
P. falciparum
circulate and that multiple
infections are more present in malaria bearers tha
n
in
asymptomatic individuals
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Genômica comparativa de protozoáriosTschoeke, Diogo Antônio January 2013 (has links)
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Previous issue date: 2013 / Fundação Oswaldo Cruz. Instituto Oswaldo Cruz. Rio de Janeiro, RJ, Brasil / Os protozoários são definidos como organismos eucariotos unicelulares, e apresentam grande diversidade e variedade. Cerca de 200 mil espécies são descritas e quase 10.000 são parasitas. As espécies patogênicas causam doenças como a malária, doença do sono, doença de Chagas, leishmaniose, amebíase e giardíase. Portanto, estudos comparativos entre os protozoários são importantes porque estes podem mostrar semelhanças e diferenças entre essas espécies. A identificação de ortólogos é importante para a categorização funcional de genomas, porque ortólogos tipicamente ocupam o mesmo nicho funcional nos diferentes organismos, enquanto a identificação de parálogos é importante porque eles são submetidos a uma diversificação funcional via duplicação, através dos processos de neofuncionalização e subfuncionalização. A fim de realizar uma análise comparativa de 22 protozoários, 204.624 proteínas não redundantes de Plasmodium, Entamoeba, Trypanosoma, Leishmania, Giardia, Theileria, Toxoplasma, Trichomonas e Cryptosporidium, foram submetidos ao programa OrthoMCL, resultando em 26.101 grupos homólogos. Entre eles, 21.119 grupos são ortólogos, incluindo 7.679 co-ortólogos (grupos que contêm parálogos recentes), e 4982 são parálogos internos. Entre os ortólogos, 348 são compartilhados por todas as 22 espécies e representam o núcleo proteômico de Protozoa
Com este núcleo realizamos uma análise filogenômica, usando os 348 ortólogos concatenados, resultando em uma supermatriz de 328.228 posições, que geraram uma árvore de espécies para os 22 protozoários. Quando inferimos os diferentes Núcleos Proteômicos, Kinetoplastida tem 5.000 grupos ortólogos e 67,92 % (3396/5000) são Kinetoplastida específicos, além disso, 46,29% (1592/3396) destes ortólogos são anotados como "hipotéticos". O núcleo proteômico de Apicomplexa tem 986 grupos ortólogos e 27,82% (224/986) são específicos, enquanto que 40,63% (92 /224) destes são classificados como hipotéticos. O núcleo proteômico de Entamoeba tem 5.915 grupos ortólogos e 75,08% (4441/5915) destes grupos são específicos, sendo que 65,41% (2905/4441) são anotados como hipotéticos. Analisando os parálogos, Trichomonas vaginalis foi a espécie que apresentou o maior número de grupos parálogos internos, 2933, e também mostrou 948 co-ortólogos totalizando 3.881 parálogos. Um aprofundamento da análise na ordem Kinetoplastida mostrou que Trypanosoma cruzi apresenta o número mais elevado de duplicações, totalizando 5.777 parálogos, sendo 4963 co-ortólogos e 814 parálogos internos
Os resultados da montagem e análise de L. amazonensis resultaram 29.670.588 bases e 8802 CDS identificadas. A análise comparativa do gênero Leishmania mostrou que as seis espécies estudadas compartilham 7016 ortólogos, enquanto L. amazonensis e L. mexicana têm o maior número de ortólogos-específicos e L. braziliensis o maior número de paralogos internos. A análise filogenômica mostrou a posição taxonômica esperada de L. amazonensis e juntamente com L. mexicana formando o "complexo Mexicana", além da separação esperada do subgênero Leishmania. Encontramos potenciais proteínas análogas entre L. amazonensis e Homo sapiens e dentro do genoma de L. amazonensis, denominados análogos intragenômicos. Finalmente, a mineração por genes de RNAi mostrou que L. amazonensis , provavelmente não apresenta esta via funcional / Protozoa are defined as single celled eukaryotic organisms showing an extremely
diversity and variety. Approximately 200,000 species are described and nearly
10,000 are parasitic. The pathogenic species cause diseases such as malaria,
sleeping sickness, Ch
agas disease, leishmaniasis, amoebiasis and giardiasis.
Therefore, comparative studies among Protozoa are important because they may
identify similarities and differences in these species. Orthologs identification is central
to functional characterization
of genomes because orthologs typically occupy the
same functional niche in different organisms, while paralogs identification is important
because they undergo a functional diversification by duplication, via the processes of
neofunctionalization and subfu
nctionalization. In order to perform comparative
protozoa analysis, 204,624 non
-
redundant proteins from
Plasmodium
,
Entamoeba
,
Trypanosoma
,
Leishmania
,
Giardia
,
Theileria
,
Toxoplasma
,
Trichomonas
and
Cryptosporidium
, totalizing 22 species, were submitted t
o OrthoMCL resulting in
26,101 homologs groups. Among them, 21,119 groups are orthologs including 7,679
co
-
orthologs (groups that contain recent paralogs) and 4,982 are inparalogs. Among
the orthologs, 348 are shared by all 22 species, representing the Pro
tozoa core
proteome, with this core we perform
ed
a phylogenomic analysis with the 348
concatenated orthologs, resulting in a global supermatrix of 328,228 positions that
generate a species tree for
the 22 protozoa. When we inferred
Core Proteome, the
Kinet
oplastida core has 5,000 orthologous groups and 67.92% (3,396/5000) are
Kinetoplastida Specific, besides 46.29% (1,592/3,396) of these orthologs are
annotated as “hypothetical”. Apicomplexa Core Proteome has 986 orthologous
groups and 27.82% (224/986) are
Apicomplexa Specific whereas 40.63% (92/224)
were classified as hypothetical proteins. Entamoeba Core Proteome has 5,915
orthologous groups and 75.08% (4,441/5,915) of these groups are Entamoeba
Specific and 65.41% (2,905/4441) were annotated as hypothetic
al. Analyzing the
paralogs,
Trichomonas vaginalis
was the
specie
s
that presented the highest number
of inparalogs groups, 2,933
and also
showed 948 co
-
orthologs totalizing 3881
paralogs.
A deep look into the Kinetoplastida order showed that
Trypanosoma cruzi
has
the highest duplication number, totalizing 5777 paralogs, 4963 co
-
orthologs and
814 inparalogs groups
. The
L. amazonensis
analysis resulted in 29,670,588 bases
assembled, and 8802 CDS identified. Comparative analysis into
the
Leishman
ia
genus showed that these 6 species share 7016 ortologs, whilst
L. amazonensis
and
L. mexicana
has the biggest number of specific orthologs and
L. braziliensis
biggest
number of inparalogs. Phylogenomic analysis showed the expected
L. amazonensis
taxonomi
c position together with
L. mexicana
forming the “Mexicana complex” and
the New and Old
Leishmania
(L
.
). spp. separation. Potential analagous proteins were
found between
L. amazonensis
and
H
omo
sapiens
, and also into the
L. amazonensis
proteome. Finally, R
NAi analysis showed that
L. amazonensis
, probably,
do
not have
functional RNAi pathway
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Fatores de risco para o abandono do tratamento da tuberculose em pacientes coinfectados com HIV/AIDS em Fortaleza / Risk factors for treatment dropout for tuberculosis coinfected with HIV / AIDS in the city of FortalezaBecker, Samelia Lea Menezes January 2014 (has links)
BECKER, Samelia Lea Menezes. Fatores de risco para o abandono do tratamento da tuberculose em pacientes coinfectados com HIV/AIDS em Fortaleza. 2014. 71 f. Dissertação (Mestrado em Saúde Pública) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2014. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2014-12-08T15:47:33Z
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Previous issue date: 2014 / People living with HIV/aids are more susceptible to TB disease due to presence of cell immunodeficiency. Besides, studies show a higher dropout rate from TB in these individuals. Fortaleza, capital of Ceara, is one of the urban centers with greater bur-den of TB in Brazil. The incidence of TB in this city is high, around 70 cases/100,000 inhabitants, and about 2,000 new cases are diagnosed each year. This study charac-terized the epidemiological patterns, and clinical risk factors for treatment dropout for tuberculosis coinfected with HIV / AIDS in the city of Fortaleza in the period 2008-2010. It was a retrospective study of case-control unpaired. Data of TB cases were obtained from 175 patients records. The software SPSS was used for statistical anal-ysis. The dropout rate of tuberculosis treatment was 28,20%. The average age was 37.5 years (SD ± 9.56), predominant in males (75.43%), single (53.14%), unem-ployed (48.01%), illiterates (6.85%) or incomplete 1st grade (52.01%), showing a scenario of socioeconomic vulnerability that permeates the TB long ago. Variables such as gender, occupation, education, smoking were not significant for the treat-ment dropout. Being married or in a stable relationship (OR = 0.49; CI = 0.24 -1.02), being new cases of tuberculosis (OR = 0.48; CI = .25-.95), use other drugs (OR = 0.25; CI = 0.12 to 0.51), present adverse reactions (OR = 0.64; CI = 0.33 to 1.26) and using HAART (OR = 0.21; CI = 0.09 to 0.49) were protective factors for abandon-ment. There was a greater chance of dropping out of treatment in those patients who consumed alcohol (OR = 1.81; CI = 0.95 to 3.42), had a diagnosis of pulmonary forms (OR = 6.25; CI = 1.78 -21.94), or disseminated (OR = 4.95; CI = 1.23 to 19.78). Illicit drug use (OR adj = 2.11; CI = 1.02 to 4.36), did not use drugs to treat opportun-istic diseases or comorbidities (OR adj = 2.87; CI = 1.28 to 6.45), and not using HAART (OR adj = 2.66; CI = 1.01 to 7.02), were conditions that together generated a higher risk for noncompliance with treatment for tuberculosis coinfection / Pessoas vivendo com HIV/aids são mais suscetíveis à tuberculose devido à presença de imunodeficiência celular. Além disso, estudos apontam para uma maior taxa de abandono de tratamento nestes indivíduos. Fortaleza, capital do Ceará, é um dos centros urbanos com maior carga da doença no Brasil, com alta incidência, em torno de 70 casos/100.000 habitantes, e cerca de 2.000 casos novos são diagnosticados a cada ano. Este estudo caracterizou os padrões epidemiológicos, clínicos e os fatores de risco para o abandono do tratamento da tuberculose em coinfectados com HIV/aids no município de Fortaleza no período de 2008 a 2010. Tratou-se de estudo retrospectivo do tipo caso-controle não pareado. Os prontuários de 175 casos de TB foram revisados. Utilizou-se o software SPSS na análise estatística. A taxa de abandono do tratamento da tuberculose foi de 28,20%. A média de idade foi de 37,5 anos (DP±9,56), predominante no sexo masculino (75,43%), solteiros (53,14%), desempregados (48,01%), analfabetos (6,85%) ou com 1°grau incompleto (52,01%), mostrando um cenário de vulnerabilidade socioeconômica que permeia a TB há muito tempo. As variáveis: sexo, ocupação, escolaridade, tabagismo não foram significantes para o abandono do tratamento da TB. Estar casado ou em união estável (OR=0,49; IC= 0,24 -1,02), ser caso novo de tuberculose (OR=0,48; IC=0,25-0,95), usar outros medicamentos (OR=0,25; IC=0,12-0,51), apresentar reações adversas (OR=0,64; IC=0,33-1,26) e usar a TARV (OR=0,21; IC=0,09-0,49), foram fatores de proteção para o abandono. Houve uma chance maior de abandonar o tratamento naqueles pacientes que ingeriam bebida alcoólica (OR=1,81; IC=0,95-3,42), tiveram o diagnóstico de formas pulmonar (OR=6,25; IC=1,78-21,94), ou disseminada (OR=4,95; IC=1,23-19,78). Utilizar droga ilícita (ORaj=2,11; IC=1,02-4,36), não usar medicamentos para o tratamento de comorbidades ou doenças oportunistas (ORaj=2,87; IC= 1,28-6,45), e não utilizar a TARV (ORaj=2,66; IC=1,01-7,02), foram condições que, em conjunto, geraram um maior risco para o abandono do tratamento da tuberculose em coinfectados.
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Parasitoses intestinais em portadores de HIV/AIDS nas eras pré e pós terapia anti-retroviral potente / Enteric parasitic infections in HIV/aids-patients before and after the highly active antiretroviral therapyBachur, Tatiana Paschoalette Rodrigues January 2007 (has links)
BACHUR, Tatiana Paschoalette Rodrigues. Parasitoses intestinais em portadores de HIV/AIDS nas eras pré e pós terapia anti-retroviral potente. 2007. 160 f. Dissertação (Mestrado em Patologia) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Medicina, Fortaleza, 2007. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2012-01-02T16:45:43Z
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Previous issue date: 2007 / Since the description of the first cases of AIDS, a high prevalence of diarrhea due to parasitic diseases in HIV-infected individuals has been reported. Before the onset of highly active antiretroviral therapy (HAART), the prevalence of enteric parasites in HIV/AIDS patients was high in Brazil; after its introduction, this picture seems to have been modified. The aim of this work was to determine and compare the prevalences of intestinal parasites in HIV/AIDS patients who had been admitted at two public hospitals of Fortaleza-CE, Brazil, in the periods before (from January, 1990 to March, 1995) and after (September. 2005 to January, 2007) the introduction of HAART, to see if this form of anti-retroviral treatment contributed to a significant reduction of parasitic diseases in HIV/AIDS patients. Two groups of HIV/AIDS patients of both the sex, of ages 18 years and above were recruited: GROUP I (before-HAART era) with 482 patients and GROUP II (after-HAART era) with 100 patients. Each patient provided a single fresh stool sample for detection of intestinal parasites. The samples were analyzed by the methods of direct microscopy of the stool-smears in saline and Lugol’s iodine, the Lutz’s method, the Baermann-Moraes’ technique and the modified Ziehl-Neelsen staining. About 8 to 10 smears from each fecal sample were analyzed by light microscopy. Intestinal parasites were prevalent in 63,9% of the patients in GROUP I, as follows: hookworms–13,7%, Ascaris lumbricoides–15,6%, Strongyloides stercoralis–30,1%, Trichuris trichiura–13,1%, Cryptosporidium sp.–8,1%, Entamoeba histolytica/dispar–3,3%, Giardia duodenalis–7,9%, Isospora belli–4,8%, and the non-pathogenic species Chilomastix mesnilii-0,6%, Entamoeba coli-17%, Endolimax nana-7,3% and Iodamoeba butschilii-7,1%. In the GROUP II, the general prevalence of intestinal parasites was 24%, and consisted of the following: hookworms–2%, A. lumbricoides–2%, S. stercoralis–11%, T. trichiura, Hymenolepis nana, E. histolytica/dispar, G. duodenalis e I. belli – each specie in 1% of the samples, and the non-pathogenic protozoa Entamoeba coli–8%, Endolimax nana–3% and Iodamoeba butschilii–3%. The coccidian Cryptosporidium sp. was not detected in this group. There was a significant reduction in the prevalence of enteric parasites after onset of HAART, in comparison with the before-HAART period (p<0.0001). The prevalences of the species S. stercoralis, A. lumbricoides, T. trichiura, hookworms, Cryptosporidium sp. and G. duodenalis were significantly reduced between the before-HAART and after-HAART periods (p<0.05). These findings reveal that a significant improvement resulted in the condition of HIV/AIDS patients, with respect to the occurrence of some important enteric parasites, in the after-HAART era, which may have resulted from the introduction the highly active antiretroviral therapy alone, or from the combined influence of HAART, other medicines, better clinical practices and better awareness of the patients to take care of themselves. This work possibly suggests that periodic evaluations of stools for enteric parasites may be of some importance for the assessment of the general health conditions of HIV/AIDS patients under treatment, particularly in those with low CD4+ cell counts. / Desde os primeiros casos de AIDS descritos, alta prevalência de diarréia de etiologia parasitária era reportada; antes da terapia anti-retroviral potente (HAART), era elevada a prevalência de enteroparasitos em portadores de HIV/AIDS no Brasil. Com o advento da HAART, isto tem se modificado. O objetivo deste trabalho foi determinar a prevalência de parasitos intestinais em portadores de HIV/AIDS atendidos no Hospital São José de Doenças Infecciosas e no Hospital Universitário Walter Cantídio, em Fortaleza-CE, nas eras pré-terapia anti-retroviral potente – HAART (janeiro de 1990 a março de 1995), retrospectivamente, e pós-HAART (setembro de 2005 a janeiro de 2007), de forma prospectiva, e comparar os achados dos dois períodos. A população do estudo foi composta de 2 grupos de portadores de HIV/AIDS, de ambos os sexos, com idade igual ou superior a 18 anos: GRUPO I – 482 pacientes da era pré-HAART e GRUPO II – 100 pacientes da era HAART. A metodologia consistiu na realização de exame parasitológico de fezes em 01 amostra fecal fresca obtida de cada paciente, sendo executadas as seguintes técnicas: exame direto, a fresco e com lugol; método de Lutz; método de Baermann-Moraes modificado e coloração de Ziehl-Neelsen modificada. Foram lidas de 8 a 10 lâminas por amostra fecal. Os resultados obtidos no GRUPO I revelaram prevalência geral de enteroparasitos de 63,9%, sendo encontrados: ancilostomídeos–13,7%, Ascaris lumbricoides–15,6%, Strongyloides stercoralis–30,1%, Trichuris trichiura–13,1%, Cryptosporidium sp.–8,1%, Entamoeba histolytica/dispar–3,3%, Giardia duodenalis–7,9%, Isospora belli–4,8%, além das espécies não patogênicas Chilomastix mesnilii-0,6%, Entamoeba coli-17%, Endolimax nana-7,3% e Iodamoeba butschilii-7,1%. No GRUPO II a prevalência geral foi de 24%, sendo detectados: ancilostomídeos–2%, A. lumbricoides–2%, S. stercoralis–11%, T. trichiura, Hymenolepis nana, E. histolytica/dispar, G. duodenalis e I. belli – cada uma destas espécies em 1% da amostra, além dos não patogênicos Entamoeba coli–8%, Endolimax nana–3% e Iodamoeba butschilii–3%; o coccídio Cryptosporidium sp. não foi detectado neste grupo. Houve redução significante (p<0,0001) na prevalência geral de enteroparasitos na era HAART em relação à era pré-HAART. Os seguintes parasitos tiveram a prevalência reduzida significativamente na era HAART em relação à era pré-HAART (p<0,05): Strongyloides stercoralis, Ascaris lumbricoides, Trichuris trichiura, ancilostomídeos, Cryptosporidium sp. e Giardia duodenalis. O estudo revelou que, na era HAART, os pacientes estão menos sujeitos às enteroparasitoses, provavelmente, por influência dos seguintes fatores: uso da terapia anti-retroviral potente, utilização de quimioprofiláticos, melhor manejo clínico e melhor conscientização dos pacientes em adotar medidas de prevenção contra parasitos intestinais. O trabalho ressalta a importância da realização periódica do exame parasitológico de fezes para portadores de HIV/AIDS, principalmente àqueles que se encontram com baixa contagem de linfócitos T CD4+, mais sujeitos a algumas parasitoses e às complicações decorrentes das mesmas.
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Avaliação prospectiva de parâmetros de saúde em portadores do HIV mediante consulta de enfermagem / Prospective assessment of health parameters in HIV patients through nursing consultationCarvalho, Carolina Maria de Lima January 2010 (has links)
CARVALHO, Carolina Maria de Lima. Avaliação prospectiva de parâmetros de saúde em portadores do HIV mediante consulta de enfermagem. 2010. 125 f. Tese (Doutorado em Enfermagem) - Universidade Federal do Ceará. Faculdade de Farmácia, Odontologia e Enfermagem, Fortaleza, 2010. / Submitted by denise santos (denise.santos@ufc.br) on 2012-02-13T12:03:38Z
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Previous issue date: 2010 / Nursing consultations identify HIV patients’ specific needs and enhances survival when the infection cannot be cured. The goal was to assess health parameters used during the nursing consultation, according to Orem’s Model, involving HIV patients. Clinical, intentional, prospective, concurrent longitudinal research. Participants were 30 HIV patients at a specialized outpatient clinic in Fortaleza-CE. Between November 2008 and August 2009, data were collected during the nursing consultation, using specific health instruments: quality of life (HAT-QoL), social support (Social Support Scale for People Living with HIV/aids), anxiety and depression (HAD), Adherence to antiretrovirals (CEAT-VIH). Each patient was exposed to six nursing consultations, at minimum intervals of 30 days, applying the different assessment instruments during the first and sixth consultation. Student’s t and Snedecor’s F test were used for data assessment, 2, Fisher-Freeman-Halton and Spearman’s linear correlation coefficient rs and Pearson’s r were used to assess association and correlation, with significance set at 5%. Twenty-one participants were men and nine women, between 22 and 62 years of age, and 23 took antiretroviral drugs. Regarding quality of life, significant changes (p<0.001) were observed after the nursing interventions, whose patients demonstrated better ratios in terms of: general and sexual activities, concerns with secrecy, financial concerns, awareness on HIV, satisfaction with life, medication-related issues and trust in the physician. As for social support, the variables indicated a significant improvement in emotional (p=0.005) and instrumental (p=0.013) support levels at the end of the study. Anxiety and depression levels were low and significant after the interventions, with p=0.001 and p=0.006, respectively. The comparison between adherence levels to antiretrovirals during the first and last intervention showed a significant difference (p=0.039), indicating improvements in medication use. The data show that patients’ coping with the disease improved, as well as the recovery process of health levels and reintegration into the family and social environment, and also upon returning to daily activities, thus permitting better adaptation to the illness, a better quality of life, greater social involvement, decreased anxiety and depression levels, besides treatment adherence. In conclusion, health monitoring of HIV patients, using nursing consultations focusing on self-care, may have supported the changes observed during the outpatient monitoring interval. This study revealed the urgent need for nurses to set up systematic outpatient follow-up for HIV patients in specialized health services, with a view to improving and promoting these clients’ health. / A consulta de enfermagem identifica as necessidades específicas dos portadores HIV/aids e promove a sobrevida enquanto não há cura da infecção. Objetivou-se avaliar parâmetros de saúde empregados durante a consulta de enfermagem de acordo com o Modelo de Orem em portadores de HIV. Pesquisa clínica, intencional, prospectiva, longitudinal concorrente, desenvolvido com 30 portadores de HIV em ambulatório especializado, em Fortaleza-CE. De novembro de 2008 a agosto de 2009, foram coletados os dados durante a consulta de enfermagem, empregando-se instrumentos de saúde específicos: qualidade de vida (HAT-QoL), suporte social (Escala de Suporte Social para Pessoas Vivendo com HIV/aids), ansiedade e depressão (HAD), adesão aos antirretrovirais (CEAT-VIH). Cada paciente foi exposto a seis consultas de enfermagem com intervalo mínimo de 30 dias, aplicando-se na primeira e na sexta consultas os diferentes instrumentos de avaliação. Os dados foram avaliados utilizando-se os testes t de Student e teste F de Snedecor. Para associação e correlação, os testes de 2, Fisher-Freeman-Halton e pelos coeficientes de correlação linear rs de Spearman e r de Pearson, adotando-se nível de 5%. Dos participantes 21 eram homens e nove mulheres, com idades entre 22 e 62 anos e 23 faziam uso de antirretrovirais. No relacionado à qualidade de vida, observaram-se alterações significativas (p<0,001) após as intervenções de enfermagem, cujos pacientes demonstraram melhores índices de: atividades gerais, sexuais, preocupações com o sigilo, financeiras, conscientização sobre o HIV, satisfação com a vida, questões relativas à medicação e confiança no médico. Quanto ao suporte social, as variáveis indicaram melhora significativa dos níveis do suporte emocional (p=0,005) e instrumental (p=0,013) no final do estudo. Os níveis de ansiedade e de depressão mostraram-se reduzidos e significantes após as intervenções, respectivamente p=0,001 e p=0,006. Ao se comparar os índices de adesão aos antirretrovirais da primeira e da última intervenção de enfermagem encontrou-se diferença significativa (p=0,039), apontando melhora nos uso dos medicamentos. Os dados indicam que houve melhora dos pacientes no enfrentamento da doença, no processo de recuperação dos níveis de saúde e reintegração ao ambiente familiar e social, bem como ao retorno de suas atividades diárias, possibilitando, assim, melhor adaptação a doença, melhor qualidade de vida, maior envolvimento social, redução dos níveis de ansiedade e depressão, além da adesão à terapêutica. Conclui-se que o acompanhamento em saúde de portadores do HIV utilizando-se consulta de enfermagem focalizada no autocuidado pode ter auxiliado nas mudanças observadas no intervalo do seguimento ambulatorial. Do avaliado, urge a necessidade da implementação de seguimento ambulatorial sistemático pelo enfermeiro, direcionado aos portadores do HIV em serviço especializado de saúde, com o intuito de melhorar e promover saúde nessa clientela.
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Infecções respiratórias agudas registradas na cidade de Salvador no período de 2004-2008 e suas relações com as condições climáticasTeles, Aline Barreto January 2011 (has links)
Submitted by Edileide Reis (leyde-landy@hotmail.com) on 2014-10-07T14:54:10Z
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Aline Barreto Teles.pdf: 6496761 bytes, checksum: f167d3a11391275b25a888822fd8be66 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Meirelles (rodrigomei@ufba.br) on 2015-05-30T14:03:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1
Aline Barreto Teles.pdf: 6496761 bytes, checksum: f167d3a11391275b25a888822fd8be66 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-05-30T14:03:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1
Aline Barreto Teles.pdf: 6496761 bytes, checksum: f167d3a11391275b25a888822fd8be66 (MD5) / Dentre os principais fatores que contribuem para o aumento dos casos e da gravidade das infecções respiratórias agudas em crianças, estão os elementos climáticos e a poluição do ar. O presente trabalho de dissertação estuda, através de uma análise estatística, a relação entre três elementos climáticos (temperatura, pluviosidade e umidade relativa do ar) com as infecções respiratórias agudas (IRA) notificadas em crianças na faixa etária de até cinco anos de idade, na cidade de Salvador-BA, referente ao período de 2004 a 2008. Para o ano de maior número de internações por IRA, foi feita uma análise diária entre as variáveis climáticas e o número de internações notificadas, onde se realizou uma análise integrativa dos resultados obtidos, com uma abordagem pertinente à climatologia Geográfica. Na execução desse estudo analítico quantitativo, primeiramente foram coletados e organizados os dados meteorológicos, obtidos pelo INMET, referentes aos elementos climáticos citados acima, para um período de 31 anos – 1978/2008 - com o objetivo de analisar o clima da cidade ao longo desta série. Posteriormente, foi feito o estudo dos elementos climáticos, dos últimos cinco anos (2004/2008), com o número de internações por IRA, no mesmo período, obtidos através do Sistema de Internação Hospitalar do DATASUS. Foi constatado que, no período em estudo, o
número de internações por IRA e os elementos climáticos, não apresentaram características estatisticamente significantes entre os anos, somente entre as estações. Em seguida, foi feita a análise estatística bivariada e multivariada entre os elementos climáticos (pluviosidade, umidade relativa do ar e temperatura média compensada) com as internações por IRA, utilizando o modelo de regressão linear para a série 2004 a 2008 e o modelo linear generalizado robusto somente para o ano de 2004. Nessas análises, os elementos climáticos associados estatisticamente às internações foram a temperatura média compensada e a umidade relativa do ar. Desta forma, é possível concluir que estes elementos contribuem significativamente para o aumento das infecções respiratórias agudas, em crianças menores de cinco anos de idade na cidade de Salvador-BA.
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Resposta inflamatória, estado nutricional e função pulmonar em crianças e adolescentes como fibrose císticaPereira, Letícia Cristina Radin January 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde. Programa de Pos-Graduação em Nutrição. / Made available in DSpace on 2013-06-25T22:12:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1
308886.pdf: 3296643 bytes, checksum: 8770f77f2968289e6b1523022592341f (MD5) / Introdução: as infecções das vias respiratórias e a ativação de processos inflamatórios promovem depleção nutricional e declínio da função pulmonar, representando as principais consequências da Fibrose Cística (FC). Objetivo: avaliar a relação entre resposta inflamatória, estado nutricional e função pulmonar em crianças e adolescentes com FC. Sujeitos e Métodos: estudo clínico-transversal realizado com 86 sujeitos distribuídos em Grupo Controle (GC, n= 31) e Grupo FC (GFC, n= 55), redistribuído em GFC bacteriologia negativa (GFCB?) ou GFC bacteriologia positiva (GFCB+) e GFC Pseudomonas aeruginosa negativa (GFCPa?) ou GFC Pseudomonas aeruginosa positiva (GFCPa+). A função pulmonar foi avaliada pelo Volume Expiratório Forçado no primeiro segundo (VEF1) e o estado nutricional pelo z-escore de peso-para-idade (zP/I), estatura-para-idade (zE/I), índice de massa corporal-para-idade (zIMC/I), área muscular do braço (zAMB), área gordurosa do braço (zAGB) e percentual de gordura corporal (%GC). A resposta inflamatória foi avaliada pela dosagem de mieloperoxidase (MPO), interleucina-1beta (IL-1?), fator de necrose tumoral-alfa (TNF-?), proteína C-reativa (PCR), metabólitos de óxido nítrico (NOx), adenosina deaminase (ADA) e contagem de leucócitos, neutrófilos, linfócitos e monócitos. A análise bacteriológica foi avaliada na secreção da cavidade orofaríngea. Foi adotado um nível de significância p< 0,05.
Resultados: o VEF1 foi significativamente maior no GC (88,57%) comparado com GFC (66,77%; p=0,001), GFCB+ (57,87%; p<0,001) e GFCPa+ (54,82%; p<0,001). Comparados ao GC e após análise ajustada para variáveis de confusão observou-se: redução do zIMC/I e zAMB no GFC (p=0,030; p=0,019), GFCB+ (p=0,030; p=0,029), e GFCPa+ (p=0,047; p=0,026). Aumento da MPO (p<0,001, todos subgrupos), IL-1? (p<0,001, todos subgrupos) e PCR (GFC: p=0,002; GFCB?: p=0,007; GFCB+: p=0,009; GFCPa?: p=0,004 e GFCPa+: p=0,020). Nos GFCB+ e GFCPa+ o NOx (p=0,001; p<0,001), leucócitos (p=0,002; p=0,001) e neutrófilos (p=0,003; p<0,001) estavam aumentados. No GFC foi observada correlação positiva entre VEF1 e zP/I (p=0,009), zE/I (p=0,006), zIMC/I (p=0,028) e zAMB (p=0,027) e negativa com leucócitos (p=0,008) e neutrófilos (p=0,031), correlação negativa entre zAMB e NOx (p=0,028). Conclusão: sujeitos com FC independente do tipo de infecção acometida apresentam resposta inflamatória importante caracterizada por aumento de MPO, IL-1? e PCR. A bacteriologia positiva apresentou efeito aditivo na resposta inflamatória levando ao aumento do NOx, leucócitos e neutrófilos. A desnutrição, leucocitose e neutrofilia estão correlacionadas com a redução da função pulmonar. / Background: the infections of the airways and the activation of immune and inflammatory process promote nutritional depletion and decline in lung function, representing the main consequences of cystic fibrosis (CF). Aim: evaluate the relationship between inflammatory response, nutritional status and pulmonary function in children and adolescents with CF. Subjects andMethods: clinical-cross-sectional study was conducted with 86 subjects distributed in Control Group (CG, n= 31) and CF Group (CFG, n= 55), redistributed in CFG bacteriology negative (CFGB.) or CFG bacteriology positive (CFGB+) and CFG Pseudomonas aeruginosa negative (CFGPa.) or CFG Pseudomonas aeruginosa positive (CFGPa+). Pulmonary function was assessed by Forced Expiratory Volume in the first second (FEV1) and the nutritional status by indicators in Z-escore weight-for-age (zW/A), height-for-age (zH/A), body mass index-for-age (zBMI/A), arm muscle area (zAMA), arm fat area (zAFA) and percentage of body fat (%BF). Inflammatory response was assessed by measurement of myeloperoxidase (MPO), interleukin-1beta (IL-1â), tumor necrosis factor-alpha (TNF-á), C-reative protein (CRP), nitric oxide metabolites (NOx), adenosine deaminase (ADA) and leukocytes, neutrophils, lymphocytes, monocytes counts. Bacteriological analysis was assessed in the secretion of the oropharyngeal cavity. Was adopted a significance level of p<0.05. Results: the FEV1 was significantly higher in CG (88.57%) compared with CFG (66.77%, p=0.001), CFGB+ (57.87, p<0.001) and CFGPa+ (54.82, p<0.001). Compared to CG and after adjustment for confounding variables was observed: reduction the zBMI/A and zAMA in CFG (p=0.030; p=0.019), CFGB+ (p=0.030; p=0.029), and CFGPa+ (p=0.047; p=0.026). Increased to MPO (p<0.001, all subgroups), IL-1â (p<0.001, all subgroups) and CRP (CFG: p=0.002; CFGB.: p=0.007; CFGB+: p=0.009; CFGPa.: p=0.004 and CFGPa+: p=0.020). In the CFGB+ and CFGPa+, the NOx (p=0.001; p<0.001), leukocytes (p=0.002; p=0.001) and neutrophils (p=0.003; p<0.001) was increased. In the CFG was observed positive correlation between FEV1 and zW/A (p=0.009), zH/A (p=0.006), zBMI/A (p=0.028) and zAMA (p=0.027) and negative with leukocytes (p=0.008) and neutrophils (p=0.031), negative correlation between zAMA and NOx (p=0.028). Conclusion: subjects with CF independent of infection involved showed important inflammatory response characterized by increased MPO, IL-1â and CRP. The bacteriology positive had additive effect on the inflammatory response by increasing the NOx, leukocytes and neutrophils. Malnutrition, leukocytosis and neutrophilia are correlated with reduced lung function.
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Avaliação da acurácia diagnóstica do exame de urina na detecção laboratorial de infecções do trato urinárioSchulz, Tamirys January 2013 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências da Saúde, Programa de Pós-Graduação em Farmácia, Florianópolis, 2013 / Made available in DSpace on 2013-07-16T21:02:58Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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Validação da mensuração da explosão respiratória em granulócitos humanos normais e leucêmicos induzida por zymosan e éster de forbol pela técnica de citometria de fluxoLunardi, Fabiane January 2004 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa catarina, Centro de Ciências Biológicas. Programa de Pós-graduação em Biotecnologia. / Made available in DSpace on 2012-10-22T05:28:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1
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