The value proposition of Personalized Medicine is to deliver the “right drug, to the right patient, at the right time”. Companion diagnostics is the required tool for Personalized Medicine used to aid clinical decision making with the aim to identify patients who are most suitable for a given treatment approach and to avoid adverse effects. However, even 16 years after the first co-approval of a therapeutic drug and an associated diagnostic test (trastuzumab (Herceptin1) from Genentech and the HercepTest1 from Dako), the co-development and co-approval of drug-diagnostic pairs is a challenging task.This study has the aim to identify major challenges for diagnostics companies when developing and commercializing companion diagnostics. This is achieved by (1) a literature research and (2) an empirical case study in form of interviews with diagnostics companies. The collected data is analyzed and discussed with focus on current regulatory and reimbursement frameworks in the USA and European Union. The co-development strategies and business models of companion diagnostics developers are identified.The conclusion of this study is that the major hurdles for companion diagnostics development and commercialization are gaps in scientific evidence and lacking regulatory guidelines for co-development and clinical biomarker studies. Companion diagnostics commercialization is further challenged by poor reimbursement levels. The main strategy of diagnostics companies to address these challenges is the demonstration of a beneficial outcome for patients in form of clinical studies. Small companies with limited resources for clinical research receive funding from academic research grants, patient support groups, pharmaceutical industry, and governmental Innovation agencies.Finally the formation of a new “pharma-diagnostics” sectoral innovation system as a result of the emerging paradigm of stratified medicine has been proposed.

As the global population increases, so does the demand for water, and the increasing water scarcity is a challenge to the global water sector. It is imperative to take large-scale action in order to make water consumption more sustainable, and information and communication technologies such as smart meters have shown great potential.  Sweden is a country that generally does not face water shortage and where research on smart water metering is still rather new. Previous studies have focused on countries where water scarcity is very common, and more research is needed to examine the generalizability of previous findings. The purpose of this thesis is to examine the possibilities for a large-scale implementation of smart water meters in Swedish households, and the guiding research question is: “What are the main enablers and barriers for a large-scale implementation of smart water meters in Swedish households?”. This thesis is of qualitative and exploratory character, and the study consists of a pre-study, a literature review and interviews. Furthermore, the analysis in this thesis is made using a theoretical framework based on Technological Innovation Systems.  The findings indicate that the possibilities for a large-scale implementation of smart water meters in Swedish households are very good. The most significant enablers are that the Swedish water sector is an open and enabling environment, that smart water meters provide more technological opportunities compared to mechanical meters, and that smart water meters are generally accepted among the actors and considered to be the optimal solution in the future.  On the other hand, there are barriers which need to be addressed for a successful large-scale implementation. The most significant barriers are that smart water meters are more expensive and that there are still some uncertainties regarding the choice of technology such as compatibility issues, risk of lock-in effect, and that the technology quickly becomes outdated. However, these factors may not constitute barriers in the future since they either can disappear with time or some of them could be avoided already today. Therefore, the possibilities for a large-scale implementation are still assessed to be very good. / I samband med den globala befolkningsökningen ökar också efterfrågan på vatten, och den ökande vattenbristen är en utmaning för den globala vattensektorn. Det är nödvändigt att vidta storskaliga åtgärder för att göra vattenförbrukningen mer hållbar, och informations- och kommunikationsteknik såsom smarta mätare har visat stor potential.  Sverige är ett land som vanligtvis inte har vattenbrist och där forskningen om smart vattenmätning fortfarande är i sin linda. Tidigare studier har genomförts i länder där vattenbrist är mycket vanligare, och mer forskning behövs för att undersöka generaliserbarheten av tidigare resultat. Syftet med detta examensarbete är att undersöka möjligheterna för en storskalig implementering av smarta vattenmätare i svenska hushåll, och arbetets forskningsfråga är: ”Vilka är de viktigaste möjliggörarna och hindren för en storskalig implementering av smarta vattenmätare i svenska hushåll?”. Detta examensarbete är av kvalitativ och utforskande karaktär, och studien består av en förstudie, en litteraturstudie samt intervjuer. Vidare görs analysen i detta examensarbete med hjälp av ett teoretiskt ramverk baserat på Teknologiska innovationssystem.  Resultaten i denna studie tyder på att möjligheterna för en storskalig implementering av smarta vattenmätare i svenska hushåll är mycket goda. De viktigaste möjliggörarna är att den svenska vattensektorn är en öppen och möjliggörande miljö, att smarta vattenmätare ger fler tekniska möjligheter jämfört med mekaniska mätare, och att smarta vattenmätare är allmänt accepterade bland aktörerna och anses vara den optimala lösningen i framtiden.  Det finns dock vissa hinder som måste åtgärdas för att uppnå en framgångsrik storskalig implementering. De viktigaste hindren är att smarta vattenmätare är dyrare och att det fortfarande finns vissa osäkerhetsfaktorer när det gäller val av teknik, t.ex. kompatibilitetsproblem, risk för inlåsning, och att tekniken snabbt föråldras. Det är dock möjligt att dessa faktorer inte utgör hinder i framtiden eftersom de antingen kan försvinna med tiden eller undvikas och hanteras redan idag. Därför bedöms möjligheterna för en storskalig implementering av smarta vattenmätare i svenska hushåll ändå vara mycket goda.

Detta kandidatexamensarbete som utförts på uppdrag av ST-läkare i urologi Per Nordlund hade målet att bygga en urinflödesmätare. Eftersökta mätvärden att registrera var tidpunkt för miktionstillfället, mängden urin per tidsenhet (ml/s), flödesmönster, total mikterad volym (ml) samt miktionstid (sek). Urinflödesmätaren syftar till att förbättra initial bedömning samt uppföljning av personer med vattenkastningssvårigheter, en vanlig orsak till sjukvårdskontakt hos svenska män. För utvärdering av patienters vattenkastning ombeds patienten idag själv registrera och mäta urinvolym, en metod som ofta innebär besvär för patienten och kan innehålla inkomplett och felaktig data. Vid urologmottagningar ges möjligheten att elektroniskt mäta urinflöde och volym. Då en stor variation över dygn och miktionstillfälle föreligger kan en felaktig bild över symtom presenteras. Detta har gett upphov till idén att skapa en urinflödesmätare vars uppgift är att automatisera mätningsprocessen i hemmet.  Arbetet utfördes genom att programmera en Arduino mikrokontroller samt användning av en flödessensor. Flödessensorns konstruktion bestod av en magnet, halleffektsensor samt en turbin. Halleffektsensorns uppgift var att mäta det elektriska fältet som uppstår då magneten som sitter på flödessensorns turbin roterar. Genom att utnyttja turbinrotationen kan bland annat volym beräknas. Arbetet har även inneburit användning av Python med syftet att spara det mätvärde från mikrokontrollern i en CSV fil som kan öppnas av en vårdgivare med applikationer som Excel. / This bachelor's degree project which was carried out on behalf of Per Nordlund, urology resident, had the goal of building a urine flow meter. The sought-after values to register each time of the micturition; the amount of urine per unit time (ml/ s), flow pattern, total micturized volume (ml) and micturition time (sec). The urine flow meter aims to improve initial assessment and follow-up of people with urination difficulties, a common cause of medical contact in Swedish men. Today, when evaluating patients urination, the patient is asked to register and measure urine volume themselves, a method that often causes problems for the patient and may contain incomplete and incorrect data. At urology clinics, individuals are given the opportunity to electronically measure urine flow and volume. When there is a large variation over day and occasion of micturition, an incorrect picture of symptoms can be presented. This has given rise to the idea of creating a urine flow meter whose task is to automate the measurement process in the home.  The work was performed by programming an Arduino microcontroller and using a flow sensor. The design of the flow sensor consisted of a magnet, a hall-effect sensor and a turbine. The task of the hall-effect sensor was to measure the electric field that arises when the magnet attached on the flow sensor's turbine rotates. By utilizing the turbine rotation, volume can be calculated. The work has also involved the use of Python with the aim of saving the output values from the microcontroller in a CSV file that can be opened by a healthcare provider with applications such as Excel.

Background: Joint injuries are a complex matter. Due to the low blood flow to the tendons and ligaments, they take months or even years to heal; some fail to heal. This can be devastating for the elite athlete as well as for the labour worker or everyday person. Today, the devices that can detect an upcoming inflammation or injury, cost 15 000 US dollars and more. A cheaper technology would increase the access. This project is investigating the possibility to detect an upcoming inflammation through measuring the local skin temperature. Method: A model of an arm was built in Comsol Multiphysics, where a tennis elbow (lateral epicondylitis) was simulated through local temperature increase. Clinical tests were pursued on two healthy subjects, in order to gain knowledge on how the skin temperature behaves on healthy subjects. Results: At an internal temperature increase in the LE of 0.25 K, a temperature difference on the skin of 0.18 K was detected in the model. The clinical tests on healthy subjects indicated a correlation between the temperatures on and around the elbow joint. Discussion: The model results does not include any error sources, such as deviation in room temperature and factors affecting the subject´s body temperature, such as time of day, eating and exercising routines. The clinical tests show a pattern of the temperature distribution on and around the elbow joint, in healthy subjects. The fact that a pattern is present, is a presumption enabling to find deviations, caused by upcoming inflammation. Conclusion: The model is indicating that a local temperature increase in the LE is detectable at the skin surface. The clinical test indicates that the noise in the temperature data of a healthy person, is small enough to enable to detect a local temperature deviation. At a local skin temperature increase of more than 0.5 K, the results are indicating that the deviation is detectable. Analysing the model data, 0.5 K in skin temperature increase would mean a local temperature increase at the LE of approximately 0.7 K. This is before the stage of inflammation according to literature, which occurs at an increase of 1.5 to 2.2 K. Further studies would be interesting to make, in purpose of developing an affordable device that can detect if an inflammation is about to occur, and thereby enable the subject to stop the course. A prototype should be developed in order to make tests on more subjects. The equine industry is also a target group – the prototype may therefore be developed to fit both humans and horses. / Bakgrund: Ledskador är komplicerade. På grund av det låga blodflödet till senor och ligament, tar de månader eller år att läka; visa skador läker aldrig helt. Det här kan vara förödande för såväl elitatleter som arbetande och gemene man. Tekniker idag som kan detektera uppkommande inflammation eller skada, kostar 15 000 US dollar och mer. En billigare teknik skulle ha en större tillgänglighet. Det här projektet undersöker möjligheten att detektera en uppkommande inflammation genom att mäta den lokala skintemperaturen. Metod: En modell av en arm byggdes i Comsol Multiphysics, där en tennisarmbåge (lateral epikondylit) simulerades genom en lokal temperaturökning. Kliniska tester utfördes på två friska subjekt, för att skapa en bil av hur skintemperaturen varierar på friska personer. Resultat: Vid en inner temperaturökning om 0,25 K i LE, uppmättes en temperaturökning på huden om 0,18 K i modellen. De kliniska testerna på friska subjekt indikerade att en korrelation finns mellan temperaturerna på och runt armbågsleden. Diskussion: Resultat från modellen saknar felkällor, som exempelvis variation av rumstemperatur och andra faktorer som påverkar subjektets kroppstemperatur, som tid på dagen, mat- och träningsrutiner.De kliniska testerna uppvisar ett mönster av temperaturdistributionen hos friska subjekt på och runt armbågsleden. Att ett mönster finns, banar väg för att hitta avvikelser, som orsakas av uppkommande inflammation. Slutsats: Modellen indikerar att en lokal temperaturökning i LE är mätbar på huden. Det kliniska testet indikerar att bruset i temperaturdistributionen hos ett friskt subjekt, är litet nog för att möjliggöra detektion av en lokal temperaturavvikelse. Vid en lokal ökning av hudtemperatur med mer än 0,5 K, indikerar resultaten att avvikelsen är detekterbar. Vid analys av modellresultaten, innebär 0,5 K hudtemperatursökning en temperaturökningi LE om ungefär 0,7 K. Det är innan inflammation har brutit ut, som sker vid en ökning om 1,5 till 2,2 K. Vidare studier är intresssant att göra, i ändamål att utveckla en prisvärd produkt som kan detektera om en inflammation är på väg, och därigenom göra det möjligt för subjektet att stoppa förloppet. En prototyp behöver utvecklas för att kunna utföra tester på fler subjekt. Utöver människor, är hästindustrin en målgrupp – prototypen bör därför utvecklas för att passa båda grupperna.

Neurofeedback is a type of biofeedback in which subjects learn to use the activity of their own electrical brain waves to respond to a visual or auditory feedback from the activity of the brain. This is done by connecting electrodes to the body to get the brain's electrical activity in the form of encephalogram signals (EEG) which are then calculated and converted into useful feedback.The purpose of this work was to evaluate a neurofeedback platform via an OpenBCI open-source EEG technology that could lead to more accessible neurofeedback for society.This study was conducted with different methods where the focus was on testing and data analysis. The study has included a summary of theory used in neurofeedback, a comprehensive pilot study on an 8-channel open-source EEG neurofeedback platform and some of the ethical aspects behind the technology used and neurofeedback in Sweden. During the work, two different experts were interviewed: Gunilla Radu, founder and owner of Nordic Center of Neurofeedback AB and Jan Rutkowski, who is an engineer in medical engineering at the Uppsala Hospital.The tests with 8-channel EEG with an OpenBCI hardware and software show results from three subjects. The answers from a follow-up survey that subjects were allowed to answer are presented in the report. This was used as an evaluation of the tests performed. The aim of the tests was to give Biohackeri an opportunity to see the potential for a neurofeedback platform and to create a basis for further development of such a platform. The result indicates that a measurement of the brain activity at rest with the technology from OpenBCI shows a higher concentration level in the human body with open eyes compared to closed eyes. In addition, a higher level of relaxation is noticed when resting with eyes closed compared to eyes open. Answers from the survey show that what is important to the test subjects is, among other things, the convenience while testing the technology. In terms of requirements and rules that Neurofeedback therapists must meet, it turned out that in Sweden therapists do not need to have a specific background or education. There are ethical perspectives that Neurofeedback therapists may consider in implementing Neurofeedback Therapy.The conclusion of this project is that the tested 8-channel EEG equipment gives a result that agrees with the presented theory. Thus, a Neurofeedback platform could be built on the commercially available open-source technology, such as the technology from OpenBCI. / Neurofeedback är en typ av biofeedback som försökspersoner lär sig att använda sin egen elektriska hjärnvågors aktivitet för att svara på en visuell eller auditiv återkoppling från hjärnans aktivitet. Det görs huvudsakligen genom att ansluta elektroder till huvudet för att få hjärnans elektriska aktivitet i form av encefalogramsignaler (EEG) som sedan beräknas och omvandlas till användbar återkoppling.Syftet med detta arbete var att utvärdera en Neurofeedback-plattform via en OpenBCI open-source EEG-teknologi som skulle kunna leda till mer tillgänglig Neurofeedback för samhället.Denna studie genomfördes med olika metoder där huvudfokus låg på testning och dataanalys. Studien har innefattat en sammanfattning av teori som används inom Neurofeedback, en pilotstudie på en 8-kanals open-source EEG-Neurofeedback plattform och en del av de etiska aspekterna bakom den använda tekniken och Neurofeedback i Sverige. Under arbetets gång intervjuades två olika experter, Gunilla Radu, grundare och ägare av Nordic Center of Neurofeedback AB och Jan Rutkowski som är medicinteknisk ingenjör på Akademiska sjukhuset.Från testerna med 8-kanal EEG med en OpenBCI hårdvara och mjukvara visas resultat från tre försökspersoner. Svaren från en efterundersökningsenkät som försökspersoner fick svara på presenteras i rapporten. Detta användes som en utvärdering på de utförda testerna. Målet med testerna var att ge Biohackeri en möjlighet att se potentialen för en Neurofeedback-plattform samt att skapa en grund för vidareutveckling av en sådan plattform. Resultatet indikerar att en mätning på hjärnaktiviteten vid vilotillstånd med tekniken från OpenBCI kan det märkas högre koncentrationsnivån i människokroppen med öppna ögon jämfört med stängda ögon. Dessutom märks det en högre avslappningsnivå vid vilotillstånd med stängda ögon jämfört med öppna ögon. Svar från enkäten visar att det som är viktigt för testpersonerna är bland annat bekvämligheten under provning av tekniken. När det gäller krav och regler som Neurofeedback-terapeuter ska uppfylla visade det sig att i Sverige behöver terapeuter inte ha en specifik bakgrund eller utbildning. Det finns etiska perspektiv som Neurofeedback-terapeuter kan överväga att implementera vid Neurofeedbackterapi.Slutsatsen av detta projekt blir att den testade 8-kanal EEG utrustningen ger ett resultat som stämmer överens med den presenterade teorin. Därmed skulle en Neurofeedback-plattform kunna byggas på den kommersiellt tillgängliga open-source tekniken såsom tekniken från OpenBCI.

This study investigates the potential of Spatial Frequency Domain Imaging (SFDI) as a non-invasive imaging technique for tissue analysis in the context of Mohs surgery, a standard procedure for skin cancer removal with margin control. The current practice of performing multiple histopathologic sections during the procedure is time-consuming and labor-intensive. SFDI, utilizing optical measurements, offers quantitative imaging of biological tissues, enabling the assessment of their function and structure. This makes it particularly suitable for imaging sensitive tissues like the skin and the eye. By accurately measuring the optical properties of tissues, a deeper understanding of their characteristics and the interaction of light with tissue can be achieved. In this study, a novel transillumination SFDI system was designed and utilized to obtain spectral data from examined 2 mm thick tissue-simulating phantoms. The results demonstrated the potential of the transmission-based SFDI as a valuable tool in tissue analysis,providing rapid and accurate information about tissue properties. The implementation of transmission-based SFDI system holds promise for enhancing tissue-conserving surgeries. By enabling direct analysis of tissue properties at the point of care, this system could eliminate the need for histopathologic processing. Consequently, it can provide rapid and accurate information about tissue characteristics without the need for histopathologic processing, allowing for more precise and efficient surgical procedures and better patient outcomes

Predation is one of many factors that form the structure of the macroinvertebrate community in lakes, wetlands and watercourses. Earlier studies lack an examination concerning how fish- and waterfowl predation affect macroinvertebrates during shorter periods in the spring. I performed an exclosure study in the shallow eutrophic Lake Tåkern which is located in the western part of Östergötland County, Sweden. The experiment was performed during a three week period (1-21 April 2012) when the water temperature was low and the density of migrating diving ducks was high. The experimental cages used included three out of four different treatments; general predation (open cages), bird exclusion (net with mesh size 90*45mm) and no predation (net with mesh size 1*1mm). In the fourth treatment, which was used to control for cage effects, samples were collected outside the cages. The cages where placed in blocks three and three, one for each the three treatments, on eight different locations in the experiment area. No significant difference was detected between the different treatments concerning diversity (Shannon diversity index: F3,25=1,39; P=0,27 and Simpson diversity index: F3,25=1,47; P=0,25), taxonomic richness (F3,25=1,74; P=0,19) nor density (F2,25=0.41; P=0,75) of the macroinvertebrate fauna. The lack of effect from predation of fish is most likely explained by the low water temperature during the experiment period. The lack of effect from waterfowl predation is most likely due to a low density of diving ducks, despite the season. / Predation är en av flera faktorer som styr makroevertebratfaunans sammansättning i sjöar, våtmarker och vattendrag. Jag genomförde ett utestängningsexperiment i den grunda näringsrika sjön Tåkern i västra Östergötland. Experimentet genomfördes under en treveckorsperiod (1april-21-april) på året då densiteten flyttande dykänder är hög och vattentemperaturen är låg, vilket saknas från tidigare studier. Experimentet innefattade fyra behandlingar; kontrollpunkter utan burar, generell predation (öppna burar), fågelexkludering (nät 45*90mm) samt ingen predation (stängda burar, nät, 1,1mm). Burarna bestod av plastlådor med en volym på 130 liter (Längd*höjd*bredd: 79cm*57cm*42cm). Burarna placerades i block om tre, en för varje behandling, på botten av sjön vid åtta olika provpunkter. Resultatet visade ingen signifikant skillnad mellan de olika behandlingarna gällande makroevertebratfaunans sammansättning, varken i fråga om diversitet (Shannons diversitetsindex: F3,25=1,39; P=0,27 och Simpsons diversitetsindex: F3,25=1,47; P=0,25 ANOVA) eller densitet (F2,25=0.41; P=0,75). Avsaknaden av effekt från fiskpredation förklaras troligen av låg vattentemperatur under experimentperioden vilken påverkar fiskarnas födosökshastighet negativt. Som förväntat såg vi ingen effekt av fågelpredation vilket troligen beror på att densiteten dykänder inte var tillräckligt hög.

When performing sepsis diagnosis, the most important preanalytical variable is blood volume. Too little blood increases the risk for false negatives whereas overfilling causes increased risk for false positives. Even though this fact is known, there are case studies showing that in a majority of tests, the taken blood sample volume is not the recommended amount. As previously tried methods have been limited in their ability to tackle the problem this study aimed at creating a technical device to aid healthcare providers with blood volume sample collection. As a base, the double diamond approach by the Design Council was used. This design approach splits up the design process in four distinctly different phases (discover, define, develop, and deliver) all using their own methods to aid the creative process. After completing the discover and define phase it was determined that a non-contact capacitance liquid level sensor could operate as an ideal blood volume sample device. During the development and delivery phase prototypes were created and evaluated. The final results of this work could not give conclusive evidence concerning if a non-contact liquid level sensor could operate as an ideal blood volume collection device. The methodological approach used in this thesis can be used as inspiration for a designer to create a device for a similar or different purpose. Moreover, information from this thesis can also work as reference material to develop a device to perform ideal blood volume sample collection. Such a device would have the potential to be an essential part of the everyday workflow in sample collection from patients with sepsis worldwide and would aid in ensures effective and fast diagnostics.

Lactate is an important biomarker in sports and the lactate threshold concept is one of the best indicators of endurance performance in an athlete. However, to quantify the lactate threshold, an invasive method to take a blood sample must be used. Limitations for this method include stopping the active exercise for blood sampling and no real-time feedback. Instead, a novel non-invasive wearable biosensor can be used to measure the lactate concentration in sweat. The sensor generates an electrical current depending on the lactate concentration in the sweat, and therefore must an electronic device called a potentiostat be used to condition the current. However, available potentiostats are not suitable for use in sports where form factor, battery life and wireless connectivity is important. This thesis aims to solve this by developing a wearable device and software which can be used to measure the lactate concentration in sweat in real-time during exercise. The development process consisted of the determination of specifications, prototype development and thorough laboratory and on-body testing. Finally, a novel wearable device and software capable of real-time lactate measurements in sweat during exercise were presented. The device, called LactateStat, was 58mm ∗ 55mm ∗ 13mm, the current consumption was only 7.8mA, the current measurement resolution was 0.5 nA, the limit of detection was 0.45 nA and the current measurement range was around 750 μA. LactateStat is one of the first of its kind and provides a base for future development as the hardware, firmware and software resources are provided as open-source. / Laktat är en viktig biomarkör inom idrott och konceptet laktattröskel är en av de bästa indikatorerna för uthållighet hos en idrottsutövare. Men för att mäta laktattröskeln krävs en invasiv metod som går ut på att man tar ett blodprov. Begränsningarna med denna metod är bland annat att idrottsutövningen måste stoppas för att ta ett blodprov och att man inte får realtidsåterkoppling. I stället kan en liten och icke-invasiv bärbar biosensor användas för att mäta laktatkoncentrationen i svett. Sensorn genererar en elektrisk ström beroende på laktatkoncentrationen i svetten och en enhet som kallas potentiostat måste därför användas för att mäta denna ström. Tillgängliga potentiostater är dock inte lämpliga för användning inom sport där formfaktor, batteritid och trådlös kommunikation är viktigt. Denna avhandling har som syfte att lösa detta genom att utveckla en bärbar enhet och mjukvara som kan användas för att mäta laktatkoncentrationen i svett i realtid under träning. Utvecklingsprocessen bestod av bestämning av specifikationer, framtagning av en prototyp och noggrann laboratorie- och kroppstestning. Som resultat presenterades en banbrytande bärbar enhet och mjukvara som kan mäta laktat i realtid i svett under träning. Enheten, som kallades LactateStat, var 58mm * 55mm * 13mm, den aktiva strömförbrukningen var 7.8mA, den bästa mätupplösningen för ström var 0.5 nA, detektionsgränsen var 0.45 nA och det maximala mätområdet för ström var ca. 750 μA. LactateStat är en av de första i sitt slag och ger en bas för framtida utvecklingsarbete eftersom hårdvaru-, programvaru- och mjukvaruresurserna tillhandahålls som öppen källkod.

Non-invasive methods to evaluate skeletal muscle oxidative capacity have beenemerging as a viable substitute for invasive methods in recent years. One ofthose methods utilises near-infrared spectroscopy (NIRS) to calculate V O2mrecovery off-kinetics following an exercise. The data analysis of the measuredsignals from the NIRS is still done manually in a time-consuming and dauntingprocess. The present thesis aimed to develop software, associated with theNIRS method, capable of analysing the recovery from a repeated arterialocclusion protocol following an exercise to assess muscle oxidative capacity.Additionally, to analyse the recovery from ischemic preconditioning as a singletest to assess muscle oxidative capacity. A method that has never been utilisedbefore.11 active, healthy subjects were analysed to calculate their recovery rate.Subjects underwent ischemic preconditioning before exercising for 6 minutesat 80% of gas exchange threshold. A repeated arterial occlusion protocol wascarried out after the exercise. A software was developed in R that utilised linearregression as well as exponential fitting to calculate the recovery rate of eachsubject during both the ischemic preconditioning and the occlusion protocol.The calculated results were compared to predetermined recovery rate results ofeach subject. The calculated results of the repeated arterial occlusion protocolgave similar results to the predetermined ones and even more data on eachsubject’s recovery from an exercise. The calculated results of the ischemicpreconditioning were promising and implied that ischemic preconditioning asa single test can be utilised as a method to assess muscle oxidative capacity.However, further research is required to confirm it. / Icke-invasiva metoder för att utvärdera skelettmuskulaturens oxidativa förmågahar på senare år blivit en användbar ersättning för invasiva metoder. Nearinfrared spectroscopy (NIRS) är en utav dessa metoder och har använts föratt beräkna V O2m återhämtning off-kinetics efter träning. Dataanalysen av deuppmätta signalerna från NIRS görs fortfarande manuellt i en tidskrävandeoch felbenägen process. Syftet med den här uppsatsen var att utveckla enprogramvara som kopplad till NIRS metoden, kan analysera återhämtningenfrån ett protokoll med upprepade arteriella ocklusioner efter träning för attutvärdera skelettmuskulaturens oxidativa förmåga. Dessutom att analyseraåterhämtningen från ischemic preconditioning som ett enda test för att utvärderaskelettmuskulaturens oxidativa förmåga. En metod som aldrig tidigare använts.11 aktiva, friska försökspersoner analyserades för att beräkna deras återhämtningshastighet.Försökspersonerna genomgick ischemic preconditioning innan de tränadei 6 minuter med 80% av gasutbyteströskeln. Ett protokoll med upprepadearteriella ocklusioner genomfördes efter träningen. En programvara utveckladesi R som använde sig av linjär regression och monoexponentiell funktionsanpassningför att beräkna återhämtningshastigheten för varje försöksperson under bådeichemic preconditioning och ocklusionprotokollet. De beräknade resultatenjämfördes med förutbestämda resultat av återhämtningshastigheten för varjeförsöksperson. De beräknade resultaten av ocklusionprotokollet gav liknanderesultat som de förutbestämda och gav ännu fler uppgifter om varje försökspersonåterhämtning efter träning. De beräknade resultaten av ischemic preconditioningvar lovande och indikerade att ischemic preconditioning som ett enda testkan användas som en metod för att utvärdera skelettmuskulaturens oxidativaförmåga. Det krävs dock ytterligare forskning för att bekräfta detta.