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Caracterização de espécies brasileiras de Adesmia DC. por RAPD

Dias, Paula Menna Barreto January 2003 (has links)
Dentro do gênero Adesmia, as técnicas moleculares ainda não foram empregadas na caracterização de germoplasma e na análise da diversidade genética das espécies brasileiras que compôem o gênero. Portanto os objetivos deste trabalho foram: caracterizar, com a utilização de marcador molecular do tipo RAPD, as espécies brasileiras do gênero Adesmia DC; com base nestas informações estabelecer relações de diversidade genética entre as espécies e os acessos analisados; relacionar dados de diversidade com dados morfológicos e de reprodução.
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Caracterização morfológica, citogenética e molecular de uma população de tangerineiras híbridas de 'Clementina fina' (Citrus clementina Hort. ex Tan.) e 'Montenegrina' (Citrus deliciosa Ten.) / Morphological, cytogenetic and molecular characterization of a population of hybrid tangerines of ' Clementina Fina' (Citrus clementina Hort. ex Tan) and 'Montenegrina' (Citrus deliciosa Ten.)

Weiler, Roberto Luis January 2006 (has links)
A produção citrícola se encontra dispersa por todos os continentes e no Brasil, os citros são a produção frutícola de maior volume de produção. A produção de citros de mesa, como as tangerinas, possibilita ao produtor obter maior valor pelo seu produto. O mercado consumidor é ávido por novas variedades e para tanto, um programa de melhoramento deve estar sempre em busca de genótipos que atendam ao mercado consumidor, bem como a cadeia produtiva. Na Estação Experimental Agronômica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, está localizada uma população de tangerineiras híbridas oriundas do cruzamento da tangerineira ‘Clementina Fina’ (Citrus clementina Hort. ex Tan.) e ‘Montenegrina’ (Citrus deliciosa Ten.) a qual foi caracterizada neste estudo, avaliando-se características morfológicas de acordo com os descritores propostos pelo International Board for Plant Genetic Resources, além da identificação da época de maturação, viabilidade de pólen, número cromossômico e caracterização molecular, utilizando marcadores do tipo microssatélites. Através da análise morfológica foi possível distinguir todas as 96 plantas avaliadas, porém não foi possível agrupar a F1 em grupos distintos de cada um dos genitores. A época de maturação de frutos das plantas se concentra entre a primeira quinzena de abril até a primeira quinzena de agosto. Todas as plantas analisadas apresentaram um alto grau de viabilidade de pólen, variando entre 79,04 e 98,08 %. Todas as plantas avaliadas são diplóides com um número cromossômico de 2n=18. Utilizando 12 pares de primers de microssatélites foi possível diferenciar 90 acessos do estudo, e agrupar a F1 em indivíduos mais próximos do genitor feminino e do genitor masculino. O PIC (Conteúdo de Informação de Polimorfismo) dos primers variou de 0,27 a 0,65. Não foi possível estabelecer uma relação entre a caracterização utilizando marcadores morfológicos e a caracterização utilizando marcadores moleculares. / Citrus production is widespread all over the world and in Brazil it represents the major volume of fruit production. Production of fresch fruit, as tangerines, allow the farmer to obtain a better value for the product. The consuming market is keen for new varieties and a breeding program should be always searching for genotypes that satisfy the market as well as the productive chain. At the Agronomic Experimental Station of Federal University of Rio Grande do Sul there is a population of hybrid tangerines, as result of crosses between ‘Clementina Fina’ (Citrus clementina Hort. ex Tan.) and ‘Montenegrina’ (Citrus deliciosa Ten.). In this study, this population was characterized using the morphological descriptors proposed by the International Board for Plant Genetic, besides other characteristics such as ripening period, pollen viability, chromosome number and a molecular characterization with SSR markers. It was possible to distinguish all the 96 evaluated plants by the morphological descriptors, but it was not possible to separate the F1 in groups distinct from the parents. Ripening occurred between mid April and mid August. All the analyzed plants had a high pollen viability, ranging from 79.04% to 98.08%. All plants are diploid, with 2n = 18. By using 12 pairs of primers it was possible to differentiate 90 of the analyzed accessions and group F1 individuals closer to the female and male parents. The PIC (polymorphism information content) ranged from 0.27 and 0.65. It was not possible to establish a relation between the morphological and the molecular characterizations. 1Master of Science dissertation in Agronomy, Faculdade de Agronomia, Universidade Federal do Rio Grande do Sul, Porto Alegre, RS, Brazil. (67p.) March, 2006.
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Biologia reprodutiva e estudo da fertilidade de Vriesea gigantea (Gaud., 1846), Bromeliaceae

Paggi, Gecele Matos January 2006 (has links)
Resumo não disponível
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Mapeamento genético de híbridos intraespecíficos de laranja doce [Citrus sinensis (L.) Osbeck], obtidos por cruzamentos controlados / Genetic mapping of intraspecific hybrids of sweet orange [Citrus sinensis (L.) Osbeck], obtained by controlled breeding

Layanne Batista Souza 24 September 2010 (has links)
Apesar do destaque do setor citrícola paulista e brasileiro, existe uma séria vulnerabilidade para o cultivo da laranja, que está pautada no uso de poucas variedades comerciais. A instalação de programas de melhoramento de laranjeiras com uso de cruzamentos controlados é dificultada principalmente pelos problemas de poliembrionia nas sementes e pela presença de ciclo juvenil longo nas plantas, o que ocasiona a dificuldade em obter plantas híbridas via cruzamentos controlados e o tempo muito longo para a conclusão de um ciclo de recombinação e seleção. O objetivo deste estudo foi a construção de um mapa de ligação utilizando uma população de 144 híbridos oriunda do cruzamento entre a laranjeira Tobias (CN 1392 e CN 1393), que apresenta ciclo juvenil curto, e laranjeira Pêra-de-Abril, variedade com sementes monoembriônicas. O mapa de ligação foi construído com base em marcadores moleculares SSR e TRAP através de dois softwares (JoinMap e Onemap). O mapa genético construído pelo JoinMap conteve 85 (61%) marcas dispostas em 13 grupos de ligação, totalizando 634 cM, com distância entre os marcadores adjacentes variando de 0 a 29 cM. Os tamanhos individuais dos grupos de ligação variaram de 8 a 85 cM e um total de 55 (39%) marcadores não se ligou ao mapa. Com o software OneMap 87 (62%) marcadores se ligaram em 16 grupos de ligação, totalizando 1.100 cM, com distância entre marcadores adjacentes variando de 0 a 36 cM. Os tamanhos individuais dos grupos de ligação variaram de 8 a 205 cM. Um total de 53 (38%) marcadores não se ligaram no mapa. A marca que constitui o caráter fenotípico de interesse florescimento precoce foi incluída no mapa quando utilizado o software OneMap. Houve similaridade entre os mapas de ligação de híbridos intraespecíficos de laranja doce construídos com os aplicativos JoinMap e OneMap. A distinção encontrada ocorreu, principalmente, devido aos marcadores com segregação distorcida / Despite the prominence of the citrus sector in São Paulo and Brazil, there is a serious vulnerability for the cultivation of orange, which is guided by the use of a few commercial varieties. Orange breeding programs that make use of controlled breeding are hampered mainly by the problems of polyembryony and the presence of long juvenile cycle, which impair the obtainment of hybrid plants through controlled crossings as well as taking a long time for the conclusion of a cycle of recombination and selection. The goal of this study was the construction of a linkage map using a population of 144 hybrids from crosses between Tobias sweet orange (CN 1392 and CN 1393), which present short juvenile cycle, and Pêra-de-Abril sweet orange, variety with monoembryonic seeds. The linkage map was constructed based on molecular markers SSR and TRAP using two softwares (JoinMap and Onemap). The genetic map obtained by JoinMap showed 85 (61%) markers arranged in 13 linkage groups totalizing 634cM, with the distance between adjacent markers ranging from 0 to 29 cM. The sizes of individual linkage groups ranged from 8-85 cM and a total of 55 (39%) markers could not be linked to the map. With the software OneMap 87 (62%) markers were linked in 16 linkage groups, totalizing 1.100 cM, with the distances between adjacent markers ranging from 0 to 36 cM. The sizes of individual linkage groups ranged from 8-205 cM. A total of 53 (38%) markers could not be linked on the map. The mark related to flowering, which is the phenotypic character of interest, was found using the software OneMap. There was similarity between the linkage maps of intraspecific hybrids of sweet orange built with JoinMap and OneMap softwares. The distinction found was mainly due to the markers with segregation distortion
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Imputação de alelos microssatélites a partir de haplótiposSNP para verificação de paternidade na raça Nelore / Imputation of microsatellite alleles from SNP haplotypes for parental verification in Nellore cattle

Milla Albuquerque de Souza 31 January 2013 (has links)
As técnicas de marcadores moleculares têm sido aplicadas em estudos populacionais das espécies bovinas, verificação de genealogia e teste de paternidade. Dentre os marcadores moleculares, os microssatélites (MS) são amplamente utilizados, porém, alguns problemas técnicos têm motivado o desenvolvimento de alternativas, como os marcadores do tipo polimorfismo de nucleotídeos único (SNP). Assim, surgiu a necessidade de identificar haplótipos SNP que estão em concordância com cada alelo MS e então os genótipos MS poderiam ser convertidos em genótipos SNP e vice-versa, por meio da imputação do genótipo. O objetivo deste trabalho foi aplicar um método para imputar alelos MS a partir de haplótipos SNP, para verificação de paternidade, utilizando animais da raça Nelore e também identificar um menor conjunto de SNP, com qualidade suficiente para otimizar e diminuir o custo da genotipagem. Foram realizadas genotipagens em SNP e MS para 99 trios de animais da raça Nelore provenientes da EMBRAPA Pecuária Sudeste e foi verificada a existência de alelos nulos pelo programa MICRO-CHECKER. Foram selecionados SNP que estivessem próximos de cada marcador MS e o programa BEAGLE foi usado para identificar a fase de ligação dos genótipos. Posteriormente, foi realizada a técnica de imputação dos MS a partir de haplótipos SNP e foi verificada a paternidade pelo programa CERVUS. A precisão da imputação dos alelos MS foi verificada através do cálculo da concordância entre os alelos MS imputados e relatados. O marcador SPS115 foi removido da análise por evidências de alelos nulos, devido ao excesso de homozigotos observados. O marcador mais informativo foi o TGLA122, cujo conteúdo de informação polimórfica (PIC) foi 0,8. Foram encontrados desvios do equilíbrio de HW (P<0,05) para os locos ETH225 e TGLA57. Um maior conjunto de SNP foi necessário para imputação de alelos MS para o marcador BM1824. As taxas de verificação de parentesco foram de 97,1% para os alelos MS genotipados e 96,3% para os MS imputados. Somente 4% dos 99 filhos não tiveram a paternidade atribuída, quando a simulação foi feita apenas para o pai conhecido e 1% quando pai e mãe eram conhecidos. Esta técnica obteve precisão maior que 96% para a imputação de dados MS e permitiu imputar dados genotípicos multialélicos a partir de bi-alélicos. Os resultados terão um impacto imediato para os pesquisadores e associações de criadores que visam a transição do MS para SNP baseada em verificação de parentesco. / Molecular markers techniques have been applied in bovine population studies, genealogy verification and paternity test. Among the molecular markers, microsatellites (MS) are widely used, however, some technical problems have motivated alternatives development, as markers type single nucleotide polymorphism (SNP). Thus, the need to identify SNP haplotypes which are in agreement with each MS allele and then MS genotypes could be converted into SNP genotypes and vice versa, through genotype imputation. The objective of this study was to apply a method to impute MS alleles from SNP haplotypes to verify paternity, using Nellore and also identify a smaller set of SNP, with enough quality to optimize and reduce genotype cost. SNP genotyping was performed at and for 99 MS trios Nellore from EMBRAPA Cattle Southeast and was checked for null alleles by MICROCHECKER. SNP were selected that were near each MS marker and the program BEAGLE was used to identify genotypes phase. Subsequently, were applied the MS imputation technique from SNP haplotype and paternity was verified by CERVUS. The accuracy of MS alleles imputation was verified by calculating the correlation between MS alleles imputed and reported. The SPS115 marker was removed from the analysis for null alleles evidence due to homozygote excess observed. The most informative marker was TGLA122 with 0.8 PIC. Deviations from equilibrium HW (P<0.05) were found for the loci ETH225 and TGLA57. A larger set of SNP was necessary to impute MS alleles for the marker BM1824. The verification rates of paternity were 97.1% for genotyped MS alleles and 96.3% for MS imputed. Using imputed MS alleles and when only the sire was considered only 4% of the 99 offspring were not assigned paternity and 1% when both parents were known. The technique achieved greater than 96% accuracy for MS imputation data. This research allow to impute multi-allelic genotypes from bi-allelic data. Our results will have an immediate impact for researchers and livestock associations aiming the transition from MS- to SNP-based parentage verification.
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Demografia e variação genética de Puma concolor (Linnaeus, 1771) na região nordeste do estado de São Paulo

Miotto, Renata Alonso 30 July 2010 (has links)
Made available in DSpace on 2016-06-02T19:29:28Z (GMT). No. of bitstreams: 1 3201.pdf: 3354953 bytes, checksum: bdc5334c7fcd85bffa2127f4aed40ef4 (MD5) Previous issue date: 2010-07-30 / Financiadora de Estudos e Projetos / The northeast area of São Paulo state was originally covered by cerrado and semideciduous forest, but for the last two centuries, it has experienced distinct cycles of human exploitation of its fertile soils. Despite of intensive human activities, large habitat loss and fragmentation of the native vegetation cover, pumas (Puma concolor) still inhabit remnant habitat fragments in the northeastern area of the state. In this study, by using fecal DNA and molecular markers, we investigated demographic and genetic issues on pumas to aggregate basic information for conservation efforts to maintain long term viable subpopulations of this toppredator in the region. Between 2004-2008, we identified 17 animals (13 females and four males) inhabiting two of the last natural refuges in the area; five females represented resident adults indicating that both refuge areas may act as a source of individuals in the landscape. Only three animals did not exhibit any degree of relatedness, and we found evidence of philopatry, behaviour already described in North American populations. By using mark-recapture-DNA-based methods, we estimated a density of 9.36 ± 2.54 animals/100 km2 inside and surrounding these areas (~260 km2), the largest density estimate for this species reported in the literature. The high abundance may reflect an absence of direct competitors, as well as large prey availability and absence of similar high quality patches in the matrix; mainly females tend to tolerate higher home-range overlap when many resources are available. Considering that pumas may disperse throughout the matrix, we quantified aspects that will probably have influence on the species viability in the area, such as roadkills (11; 10 males and one female) and puma-human conflicts (six events). Especially male pumas tend to disperse long distances from their natal area to occupy new home-ranges, avoiding inbreeding and maintaining high levels of gene flow. Thus, to qualify the dispersers movement success, in a higher geographic scale, we sampled 37 pumas and tested the hypothesis of lack of genetic structure among the natural areas in the region. We observed that pumas in the northeast area of São Paulo state constitute a single population, have high levels of genetic diversity (HE=0.79; mean of 10 alleles per locus) and are related to each other. We also found evidence of a recent bottleneck event in this 10 population. In spite of the huge landscape transformation in consequence of human activities, we concluded that pumas still maintain some levels of gene flow among the protected areas of the study area larger than 2,000 ha and more than 70 km distant one from another, so conservation efforts should be concentrated on the maintenance of this flow. We recommend that puma management should be conducted at the landscape level by increasing habitat connectivity, such as, (1) creating new protected areas; (2) applying an alternate cutting approach in eucalyptus plantations; (3) maintaining habitat patches in private properties; (4) creating structures to allow highway crossing of pumas; (5) designing educational actions to change community perception of large carnivores. / A região nordeste do estado de São Paulo era originalmente coberta por savanas e floresta semi-decídua, mas durante dois séculos passou por diversos ciclos de exploração de seus solos férteis. Apesar da grande perda de hábitats naturais e da fragmentação da vegetação remanescente em conseqüência de atividades agrícolas, algumas espécies de grandes carnívoros, como a onça-parda (Puma concolor), ainda persistem na região. Nesse trabalho, utilizando como ferramentas o DNA fecal e marcadores moleculares, procuramos agregar informações demográficas e genéticas da população de onças-pardas presente na região nordeste do estado de São Paulo a fim de contribuir para a persistência em longo prazo dessa espécie na região. Durante os anos de 2004 e 2008, identificamos 17 animais (13 fêmeas e quatro machos) ocupando dois dos últimos refúgios naturais da região; dentre estes, reconhecemos cinco fêmeas residentes adultas sugerindo que esses refúgios atuam como uma área fonte de indivíduos na paisagem. Com exceção de três indivíduos, todos os animais amostrados eram em algum grau aparentados e observamos ainda, evidências de filopatria, comportamento já descrito em populações da América do Norte. Por meio da aplicação de modelos de marcação e recaptura, estimamos uma densidade de 9.36 ± 2.54 animais/100 km2 no interior dessas áreas e entorno próximo (~260 km2), a mais alta densidade já descrita na literatura para a espécie. O grande número de animais concentrados nessas áreas provavelmente está relacionado à ausência de competidores diretos, bem como à grande disponibilidade de presas e à ausência de hábitats de qualidade similar na região; especialmente fêmeas tendem a tolerar maior sobreposição de territórios quando há grande disponibilidade de recursos. Considerando que onças devem migrar ao longo da matriz a partir dessas áreas, quantificamos aspectos que poderão vir a ter grande influência na viabilidade da espécie na região nordeste do estado e que exigem ações mitigatórias, como atropelamentos em rodovias (11; 10 machos e uma fêmea) e conflitos entre esses animais e atividades humanas (seis eventos). Onças-pardas, principalmente os machos, são animais que dispersam longas distâncias a partir de sua área natal para ocupar novos territórios, evitando o endocruzamento e 8 mantendo altos níveis de fluxo gênico. Desse modo, a fim de qualificar o sucesso de movimentos de dispersão das onças entre diferentes manchas de hábitat, em uma escala geográfica maior, amostramos 37 animais e testamos a existência de estruturação genética na região. Observamos que as onças-pardas que ocupam a região nordeste do estado constituem uma única população, possuem altos níveis de diversidade genética (HE=0.79; média de 10 alelos por loco), são em sua grande maioria relacionadas entre si, e detectamos ainda, evidências de gargalo populacional. Apesar da intensa transformação da paisagem em decorrência das atividades humanas, concluímos que ainda é mantido um fluxo gênico entre as Unidades de Conservação com mais de 2,000 ha da região e mais de 70 km distantes umas das outras, e que ações conservacionistas devem ser baseadas na manutenção desse fluxo. Considerando os resultados obtidos, sugerimos que o manejo da espécie deve ser conduzido em uma escala de paisagem visando o aumento da conectividade entre hábitats a partir (1) da criação de novas áreas protegidas; (2) do manejo alternado de plantações de eucalipto da região; (3) da manutenção de fragmentos de vegetação em propriedades particulares (Reserva Legal); (4) da construção de estruturas de passagem de fauna em rodovias; e (5) de ações educacionais que mudem a percepção da comunidade em relação à presença de grandes carnívoros.
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Impacto de marcadores inflamatórios e nível da prática de atividade física nos custos com o tratamento ambulatorial de pacientes da atenção básica / Impact of inflammatory markers and level of physical activity practice at costs with ambulatorial treatment of basic attention patients

Rocha, Ana Paula Rodrigues [UNESP] 21 August 2017 (has links)
Submitted by ANA PAULA RODRIGUES ROCHA null (rodrigues.anarocha@gmail.com) on 2017-10-24T13:08:34Z No. of bitstreams: 1 Dissertação.pdf: 1885406 bytes, checksum: 39f3136fdfcc9492b50e2d6b81990a29 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-10-26T18:03:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 rocha_apr_me_prud.pdf: 1885406 bytes, checksum: 39f3136fdfcc9492b50e2d6b81990a29 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T18:03:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 rocha_apr_me_prud.pdf: 1885406 bytes, checksum: 39f3136fdfcc9492b50e2d6b81990a29 (MD5) Previous issue date: 2017-08-21 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / As doenças crônicas geram impacto substancial nos custos públicos de saúde. A prática de exercício físico tem potencial de redução de concentrações circulantes de diversos biomarcadores inflamatórios, entretanto, não foram encontrados informações sobre o impacto de marcadores inflamatórios nos custos com saúde. Objetivo: Verificar se existe associação entre as concentrações de citocinas pró-inflamatórias e custo com saúde. Metodologia: Estudo transversal, conduzido em Presidente Prudente – SP. A amostra foi composta por homens e mulheres com idade maior que 50 anos, atendidos por Unidades Básicas de Saúde. Os participantes foram submetidos a avaliações que incluem as seguintes variáveis: i) pratica de atividade física habitual, ii) marcadores de inflamação, iii) perfil glicêmico e lipídico, iv) custos com o tratamento ambulatorial, v) excesso de peso e obesidade, vi) pressão arterial, vii) histórico de doença pessoal e familiar, viii) hábito de tabagismo e consumo alcoólico. A estatística descritiva foi composta por valores de média, desvio padrão, mediana, intervalo interquartil. O teste de Mann Whitney estabeleceu comparações entre os grupos formados, e as comparações significativas foram reanalisadas pela análise de covariância (ANCOVA). A significância estatística foi pré-fixada em valores inferiores a 5%, o software utilizado foi o BioEstat. Resultados: Nas comparações entre obesos e não obesos, foi possível identificar significância com valores superiores em obesos de concentrações de insulina (p-valor=0,039), do índice HOMA-IR (p-valor=0,016) e de leptina (p-valor=0,001), mesmo após ajuste. Da mesma forma, esses grupos apresentaram diferença estatisticamente significativa, nos custos com consulta médica (p=0,004), medicamentos (p-valor=0,038), custo total (p-valor=0,026) e custo total adicional (p-valor=0,024), sendo que custo de medicamentos (p-valor=0,007), custo total (p-valor=0,014) e custo total adicional (p-valor =0,017) foram mantidos após ajuste. Nas comparações entre ativos e inativos, foi possível identificar significância estatística com valores superiores para concentrações de glicose (p-valor=0,009) para os inativos e valores superiores para concentrações de TG (p-valor=0,031) para os ativos, no domínio exercício; somente TG (p-valor=0,040) se manteve significativo após o ajuste. Nos custos com saúde, foi possível identificar valores significativamente inferiores, para os participantes considerados ativos no domínio ocupacional, para custos com medicamentos (p=0,001), custo total (p=0,004) e custo total adicional (p-valor=0,008). Na correlação entre marcadores metabólicos e inflamatórios e custos de saúde, pode-se observar relação positiva e significante, ajustado por IMC e AFH, entre concentrações de glicose e custos de exames (r=0,343; p-valor=0,007) e custo total (r=261; p-valor=0,043); índice HOMA-IR e custo de exames (r=0,267; p-valor=0,038); IL-10 e custo com consulta médica (r=0,297; p-valor=0,020). Ajustado por %GC e AFH, custo de exame e concentrações de glicose (r=0,338; p-valor=0,008) e HOMA-IR (r=0,262; pvalor=0,042); custo total e glicose (r=0,295; p-valor=0,021); custo de consulta médica e IL-10 (r=0,297; p-valor=0,020). Conclusão: Com essa pesquisa foi possível concluir que marcadores metabólicos e inflamatórios estão relacionados com custos de consultas e exames, independentemente de IMC, %GC e AFH. Além disso, a obesidade esteve associada à concentração de insulina, HOMA-IR e leptina, bem como concentração de glicose foi menor em praticantes de atividade física. / Chronic diseases have a substantial impact on public health costs. The practice of physical exercise with the potential to reduce circulating concentrations of several inflammatory biomarkers, however, did not find information on the impact of inflammatory markers on health costs. Cross-sectional study, conducted in Presidente Prudente - SP. The sample consisted of men and women over 50 years old, attended by Basic Health Units. The sample consisted of men and women aged over 50, attended by basic health units of Presidente Prudente. Participants underwent evaluations that included the following variables: i) habitual physical activity, ii) markers of inflammation, iii) glycemic and lipid profile, iv) costs of outpatient treatment, v) excess weight, vi) blood pressure, vii) history of personal and family illness, viii) smoking habit and. Statistical analysis: The descriptive statistics were composed of mean values, standard deviation, median, interquartile range. The Mann Whitney test established comparisons between the groups formed, and significant comparisons were reanalysed by covariance analysis (ANCOVA). Statistical significance was set at values lower than 5%, the software used was BioEstat. Results: In the comparisons between obese and non-obese subjects, it was possible to identify higher values in obese subjects with insulin (p-value = 0.039), HOMA-IR (p-value = 0.016) and leptin (p-value = 0.001 ), even after adjustment. In the same way, these groups presented a statistically significant difference in the costs of medical consultation (p = 0.004), medication (p-value = 0.038), total cost (p-value = 0.026) and additional total cost ), with drug costs (p-value = 0.007), total cost (p-value = 0.014) and additional total cost (p-value = 0.017) were maintained after adjustment. In the comparisons between active and inactive, it was possible to identify statistical significance with higher values for glucose concentrations (p-value = 0.009) for the inactive and higher values for TG concentrations (p-value = 0.031) ; only TG (p-value = 0.040) remained significant after adjustment. In the health costs, it was possible to identify significantly lower values for the participants considered active in the occupational domain, for costs with medicines (p = 0.001), total cost (p = 0.004) and additional total cost (p-value = 0.008). In the correlation between metabolic and inflammatory markers and health costs, we can observe a positive and significant relationship, adjusted for BMI and AFH, between glucose concentrations and exam costs (r = 0.343, p-value = 0.007) and total cost r = 261; p-value = 0.043); HOMA-IR index and cost of exams (r = 0.267; p-value = 0.038); IL-10 and cost with medical consultation (r = 0.297; p-value = 0.020). Adjusted for% GC and AFH, examination cost and glucose concentrations (r = 0.338, p-value = 0.008) and HOMAIR (r = 0.262; p-value = 0.042); total cost and glucose (r = 0.295; p-value = 0.021); cost of medical consultation and IL-10 (r = 0.297; p-value = 0.020). Conclusion: This research it was possible to conclude that metabolic and inflammatory markers are related to the costs of consultations and examinations, independently of BMI,% GC and AFH. In addition, obesity was associated with insulin concentration, HOMA-IR and leptin, as well as glucose concentration was lower in physical activity practitioners. / FAPESP: 2015/12102-8 / FAPESP: 2014/09645-7 / FAPESP: 2015/13543-8 / CNPq: 401178/2013-7
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Implicações do uso de marcadores moleculares para o transplante de células germinativas em peixes / Implications of the use of molecular markers for the germ cells transplantation in fish

Vasconcelos, Ana Carina Nogueira January 2018 (has links)
O transplante de células germinativas tem sido uma importante abordagem experimental para o estudo da preservação genética de espécies ameaçadas de extinção ou economicamente importantes. A técnica consiste na remoção das células germinativas indiferenciadas das gônadas do animal doador e na transferência das mesmas para a gônada de um indivíduo receptor. A fim de aumentar a eficiência da técnica, a identificação prévia das células germinativas a serem transplantadas torna-se preferível, visto que a cavidade que as receberá apresenta tamanho limitado. Sendo assim, é importante o desenvolvimento de marcadores moleculares que identifiquem precisamente as células a serem transplantadas na cavidade do individuo receptor, e os genes mais utilizados para esta finalidade são o dead end e o gene vasa, os quais são expressos apenas nas células da linhagem germinativa. Devido à importância do Colossoma macropomum (tambaqui) para a economia brasileira, esta espécie foi escolhida como uma espécie modelo de preservação para este estudo. Através do isolamento e sequenciamento dos genes dead end e vasa, desenvolvemos sondas de hibridização capazes de reconhecer as células onde estes genes são expressos e estudar o seu padrão de expressão nas gônadas. Ambos os genes apresentaram intensa expressão nos oócitos pré-vitelogênicos e fraca expressão em algumas espermatogônias. Pela primeira vez na literatura, diferentes isoformas causadas por splicing alternativo foram identificadas no gene dead end. A quantificação da expressão temporal dos diferentes transcritos mostrou que o padrão de expressão da sequência completa do gene teve uma tendência distintiva comparada ao padrão dos transcritos curtos, sugerindo que as diferentes isoformas desempenham papéis específicos e importantes para o desenvolvimento da linha germinativa nesta espécie. / Germ cell transplantation has been an important experimental approach to the study of the genetic preservation of endangered or economically important species. The technique consists in removing undifferentiated germ cells from the donor animal's gonads and transferring them to the gonad of a recipient individual. In order to increase the efficiency of the technique, the prior identification of the germ cells to be transplanted becomes preferable, since the receiving cavity presents limited size. Therefore, it is important to develop molecular markers to precisely identify the cells to be implanted in the recipient cavity, and the genes most used for this purpose are the dead end and the vasa genes, which are expressed only in germline cells. Due to the importance of Colossoma macropomum (tambaqui) for the Brazilian economy, this species was chosen as a model species for preservation in this study. By isolating and sequencing the dead end and vasa genes, we developed hybridization probes capable of recognizing the cells where these genes are expressed and better studying their expression pattern in the gonads. Both genes presented intense expression in pre-vitellogenic oocytes and poor expression in some spermatogonia. For the first time in the literature, different isoforms caused by alternative splicing were identified in the dead end gene. Quantification of the temporal expression of the different transcripts showed that the expression pattern of the full-length sequence had a distinctive tendency compared to the short transcripts pattern, suggesting that the different isoforms play specific roles for the germline development in this species.
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Síntese e caracterização de nanocomplexos de lantanídeos com mesoiônicos: perspectivas para marcadores tumorais imunohistoquímicos e fármacos. / Synthesis and characterization of lanthanides nanocomplexes with mesoionics: perspectives to immunohistochemical tumor markers and pharmacs.

NASCIMENTO, Railda Shelsea Taveira Rocha do. 27 September 2018 (has links)
Submitted by Maria Medeiros (maria.dilva1@ufcg.edu.br) on 2018-09-27T14:29:18Z No. of bitstreams: 1 RAILDA SHELSEA TAVEIRA ROCHA DO NASCIMENTO - TESE (PPGEP) 2008.pdf: 2253809 bytes, checksum: ec04359cafb5760ae50bf56746b420d4 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-09-27T14:29:18Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RAILDA SHELSEA TAVEIRA ROCHA DO NASCIMENTO - TESE (PPGEP) 2008.pdf: 2253809 bytes, checksum: ec04359cafb5760ae50bf56746b420d4 (MD5) Previous issue date: 2008-11-17 / Sólidos obtidos em escala nanométrica têm demandado um grande interesse científico e tecnológico, dadas às significativas alterações nas propriedades físicas e químicas observadas em materiais com estas características, potencializando assim as aplicações tecnológicas. Neste trabalho foram sintetizados quatro nanocomplexos do tipo Ln(MI)3.3H2O onde, Ln = Er ou Eu e MI = 5(4-clorofenil)-3-fenil-1,3,4-tiodiazólio-2-tiolato (MI-1) ou 5(4-clorofenil)-3-metil-4-fenil-1,3-tioazólio-2-tiolato (MI-2). Estes complexos foram caracterizados através de técnicas físico-químicas, espectroscópicas, térmicas e estrutural. A metodologia utilizada para a síntese dos complexos partiu de uma solução etanólica de LnCl3 adicionando-se o mesoiônico, sob agitação e temperatura constante de 65oC, mantendo em refluxo por quatro horas. O resultado da análise elementar de C, H e N dos complexos Er(MI-1)3.3H2O, Eu(MI-1)3.3H2O, Er(MI-2)3.3H2O e Eu(MI-2)3.3H2O mostraram uma boa concordância entre os valores experimentais e os calculados. Os espectros de infravermelho indicam que a coordenação dos compostos mesoiônicos com os cátions Eu+3 e Er+3 acontece possivelmente através do átomo de enxofre exocíclico onde, pode-se perceber um deslocamento considerável na ligação carbono-enxofre (C-S-). Os espectros de RMN 1H dos complexos revelaram a presença de todos os sinais dos hidrogênios aromáticos, evidenciados nos compostos mesoiônicos. Através dos espectros de RMN 13C (APT), foi possível reconhecer o padrão de hidrogenação correspondente a cada átomo de carbono, possibilitando atribuir com segurança o deslocamento químico dos carbonos (C-2) e (C-5) do anel mesoiônico. Nos espectros de absorção na região do UV-visível as bandas dos complexos se deslocam quando comparadas às bandas dos compostos mesoiônicos, sendo possível atribuir a inserção dos cátions de lantanídeos à modificação das bandas de absorção, visto que os complexos apresentaram energias em comprimento inferior. Os espectros de emissão dos compostos MI-1 e MI-2 assim como os dos complexos Eu(MI-1)3.3H2O e Er(MI-2)3.3H2O apresentaram comportamento semelhante com uma banda larga de emissão entre 560 e 720 nm, não sendo possível a observação das bandas de emissão dos íons lantanídeo. As curvas TG/DTG indicaram que os compostos mesoiônicos se decompuseram em cinco etapas, diferentemente da decomposição dos complexos Er(MI-1)3.3H2O, Eu(MI-1)3.3H2O, Er(MI-2)3.3H2O e Eu(MI-2)3.3H2O que ocorreu em 5, 4, 7 e 6 etapas, respectivamente. Os complexos sintetizados com Eu apresentaram maior estabilidade térmica em detrimento dos complexos de Er, independente do mesoiônico utilizado. As curvas DSC, mostraram que os complexos estudados neste trabalho iniciam a reação de decomposição térmica ainda em estado sólido, antes da fusão. Os difratogramas de raios-x dos compostos mesoiônicos e dos complexos, apresentaram mais de uma fase, com características cristalinas, e cristalito inferior a 60nm. / The solids obtained in nanometric scale has been attracted the technological and scientific interest due to the significant modifications observed on their physical and chemical properties which increases the technological applications. In this work, four nanocomplex materials were synthesized: Ln(MI)3.3H2O where, Ln = Er or Eu and MI = 5(4-chlorophenyl)-3-phenyl-1,3,4-thiodiazole-2-tiolat (MI-1) or 5(4-chlorophenyl)-3-methyl-4-phenyl-1,3-thioazole-2-thiolate (MI-2). These complexes were characterized using physico-chemical, spectroscopic, thermal and structural techniques. To synthesize the complexes, it was used a LnCl3 ethanolic solution mixed with the mesoionic, maintained under agitation and at a constant temperature at 65oC and refluxed for a period of four hours. It was observed a good agreement between the experimental and calculated results of the C, H and N elemental analysis of Er(MI-1)3.3H2O, Eu(MI-1)3.3H2O, Er(MI-2)3.3H2O and Eu(MI-2)3.3H2O. The IR spectra indicates that the coordination of the mesoionic compounds with cations Eu+3 and Er+3, must happen probably because of the exocyclic sulfur atom and it can be perceived a considerable displacement in the carbon-sulfur (C-S-) ligation. The RMN 1H spectra suggested the presence of aromatic hydrogen evidenced in the mesoionic compounds. Through the RMN 13C (APT), it was possible to recognize the hydrogenation standard corresponding to each carbon atom. It can be safely attributed the carbon chemical displacement (C-2) and (C-5) of the mesoionic ring. In the UV-visible absorption spectra of the UV the complexes bands are displaced comparing to the mesoionic compound bands. It can be possible to attribute the insertion of the lanthanide cations to the modification of the absorption bands, once the complexes presented energies at inferior length. The MI-1 and MI-2 compounds emission spectra and the complexes Eu(MI-1)3.3H2O and Er(MI-2)3.3H2O presented a behavior similar to a large emission band between 560 and 720 nm. It was not possible to observe the emission bands of the lanthanide ions. The TG/DTG curves indicate that the mesoionic compounds were decomposed in five levels, with a different behavior of the Er(MI-1)3.3H2O, Eu(MI-1)3.3H2O, Er(MI-2)3.3H2O and Eu(MI-2)3.3H2O, which decomposition occurred in 5,4,7 and 6 steps, respectively. The complexes synthesized with Eu presented a higher thermal stability than the ones that used Er, independently of the kind of mesoionic compound that was used. The DSC curves showed that the studied complexes begin the thermal decomposition reaction before the fusion, in the solid state. The x-ray diffractograms of the complexes and mesoionic compounds present more than a level, with crystalline characteristics and crystallite size inferior to 60nm.
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Desenvolvimento de forma sólida obtida a partir de extrato seco de Schinopsis brasiliensis Engler / Development of solid form obtained from drying extract of Schinopsis brasiliensis Engler

Fernandes, Felipe Hugo Alencar 17 February 2014 (has links)
Submitted by Jean Medeiros (jeanletras@uepb.edu.br) on 2017-02-23T15:51:14Z No. of bitstreams: 1 PDF - Felipe Hugo Alencar Fernandes.pdf: 16926145 bytes, checksum: 74f97b50c6049751b8ef97ae0acf553f (MD5) / Approved for entry into archive by Secta BC (secta.csu.bc@uepb.edu.br) on 2017-03-07T16:46:46Z (GMT) No. of bitstreams: 1 PDF - Felipe Hugo Alencar Fernandes.pdf: 16926145 bytes, checksum: 74f97b50c6049751b8ef97ae0acf553f (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-07T16:46:46Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PDF - Felipe Hugo Alencar Fernandes.pdf: 16926145 bytes, checksum: 74f97b50c6049751b8ef97ae0acf553f (MD5) Previous issue date: 2014-02-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The drying extract of medicinal plants, obtained by spray drying is the starting point of development of herbal medicines. They exhibit good chemical stability, lower microbiological contamination and de possibility of application in the order dosage forms. For development of a dosage form, the active ingredient from previous trial are needed aiming to foresee and possible incompatibility that may affect the final product. Thus, the pre-formulation studies is an important step in pharmaceutics development since it identifies, among other characteristics, related to the excipient problems as well as the stability of the formulation. Thus, the objective of this work was the development of a solid dosage for from the drying extract of Schinopis brasiliensis Engler. The extract was dried by spray-drying was produced from de hydroalcoholic extract of bark of S. brasiliensis (BRCA). The compatibility study was performed using different excipients (starch, microcrystalline cellulose 101 and 102, lactose. magnesium stearate, PVP K-30 and talc) from different analytical techniques associated with chemometric tools. Kinetcs studies were also performed using isothermal thermogravimetry and determination and validation method for major polyphenol by high performance liquid chromatography UV-Vis (HPLC UV-Vis). The results of optical microscopy, differential scanning calorimetric (DSC) and chemometric analyze indicate possible incompatibility with starch, lactose and magnesium stearate, which were confirmed by X-ray diffraction (DRX). The proposed formulation was more stable than the drying extract and good self time. The extract also showed a high concentration of polyphenol, and we opted for gallic acid, which has several pharmacological activities such as chemical marker. The development method showed good precision, accuracy linearity and limits of detection and quantification acceptable. The results indicate that the analytical techniques used in the preformulation studies of the drying extract and that it can be used for the development of capsules and tables if S. brasiliensis. / Os extratos nebulizados de plantas medicinais, secos por aspersão é o ponto de partida para o desenvolvimento de medicamentos fitoterápicos. Eles apresentam boa estabilidade química, menor contaminação microbiológica e a possibilidade de aplicação em outras formas farmacêuticas. Para o desenvolvimento de uma forma farmacêutica, a partir de ingrediente ativo são necessários ensaios prévios visando prever possíveis incompatibilidades e que possam afetar o produto final. Dessa forma, os estudos de pré-formulação constituem uma importante etapa no desenvolvimento farmacotécnico, pois permite identificar, dentre outras características, problemas relacionados ao excipiente, bem como a estabilidade da formulação. Assim, o objetivo desse trabalho foi o desenvolvimento de uma forma farmacêutica sólida a partir do extrato seco de Schinopsis brasiliensis Engler. O extrato foi nebulizado por aspersão foi produzido a partir do extrato hidroalcoolico das cascas de S. brasilienses Engler. (BRCA). Foi realizado o estudo de compatibilidade, utilizando diferentes excipientes (amido, celulose microcristalina 101 e 102, lactose, estearato de magnésio, PVP K-30 e talco) a partir de diferentes técnicas analíticas associada a ferramentas quimiometricas. Também foram realizados estudos cinéticos utilizando termogravimetria isotérmica e a determinação e validação do método para o polifenol majoritário por cromatografia líquida de alta eficiência no UV-Vis (CLAE UV-Vis). Os resultados da microscopia óptica, Calorimetria exploratória diferencial (DSC) e das analises quimiometrica indicam uma possível incompatibilidade com amido, lactose e estearato de magnésio, as quais foram confirmadas por difração de raios X (DRX). A formulação proposta apresentou estabilidade maior que o extrato nebulizado e um tempo de prateleira considerável. O extrato também apresentou uma elevada concentração de polifenol, e optou-se pelo ácido gálico, que apresenta diversas atividades farmacológicas, como marcador químico. O método desenvolvido apresentou boa precisão, exatidão, inearidade e limite de detecção e quantificação aceitáveis. Os resultados apontam que as técnicas analíticas utilizadas nos estudos de pré-formulação do extrato nebulizado e que o mesmo pode ser utilizado para o desenvolvimento de capsulas e comprimidos de S. brasiliensis.

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