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Citotaxonomia do gênero Mimosa L. e variabilidade molecular em Mimosa scabrella Benth. / Cytotaxonomy of the genus Mimosa L. and molecular variability in Mimosa scabrella Benth

Dahmer, Nair January 2011 (has links)
O gênero Mimosa, dividido nas seções Mimadenia, Batocaulon, Calothamnos, Habbasia e Mimosa, possui cerca de 530 espécies, e, destas, cerca de 490 ocorrem nas Américas, ocupando diferentes tipos de habitats. No Brasil, ocorrem principalmente no Cerrado, uma zona de alta biodiversidade. Muitas espécies de grande importância econômica e, dentre elas, destaca-se M. scabrella, arbórea nativa da região Sul do Brasil. Apesar da grande importância do gênero, poucos são os estudos de citogenética. Portanto, o objetivo maior do presente trabalho foi determinar o número cromossômico de um grande número de espécies de Mimosa e tentar estabelecer relações entre distribuição dos níveis de ploidia com posição taxonômica, filogenética e distribuição geográfica. O outro objetivo foi de analisar um grande número de populações de M. scabrella, da região Sul do Brasil, quanto ao número cromossômico e caracterizar sua variabilidade utilizando marcadores moleculares do tipo RAPD. Os resultados, que aumentaram o número de determinações de número cromossômico para o gênero de 10% para mais de 20% dos táxons, são inéditos para 83% das espécies estudadas. O nível diplóide, 2n=2x=26, foi verificado em 76% das espécies. Das demais espécies, 24% são tetraplóides (2n=4x=52), e uma triplóide (2n=3x=39). Variabilidade intraespecífica, com acessos di e tetraplóides, foi verificada em M. pigra var. dehiscens, M. setosa var. paludosa e M. somnians. Com exceção de Mimadenia, onde só uma espécie foi estudada, poliplóides estão presentes em todas as seções taxonômicas. Os resultados indicam que o número cromossômico não é uma característica citotaxonômica distintiva e a poliploidia não foi um fator decisivo para a evolução deste gênero. Células polissomáticas, em ponta de raiz, foram observadas em 43 espécies, com freqüência que variou de 3 a 86%, mas somente logo após a germinação das sementes, não sendo verificado em plantas adultas, sugerindo que a polissomatia parece estar relacionada com um rápido desenvolvimento e estabelecimento da plântula, logo após a germinação. As 25 populações de M. scabrella estudadas foram todas tetraplóides. O resultado da análise molecular RAPD mostrou que a similaridade genética média entre as populações variou de 0,18 a 0,48, indicando grande variabilidade interpopulacional. Os resultados deste trabalho representam uma importante contribuição para um melhor conhecimento do gênero Mimosa. / The genus Mimosa, divided in sections Mimadenia, Batocaulon, Calothamnos, Habbasia and Mimosa, has around 530 species and, from these, approximately 490 occur in the Americas , in a wide range of habitats. In Brazil, they occur mainly in the Cerrado, an area of high biodiversity. Many species are of great economic importance, and among them is M. scabrella, a tree native to southern Brazil. Despite the great importance of the genus, cytogenetic studies are few. Therefore, the main objective of this work was to determine chromosome numbers is a great number of Mimosa species and try to correlate ploidy levels with taxonomic and phylogenetic position and geographic distribution.The other objective was to analyze a great number of M. scabrella populations from southern Brazil regarding chromosome number and genetic variability using RAPD markers. The results, that increased the number of chromosome number determinations for the genus from 10% to more than 20% of the taxa are original for 83% of the studied species. The diploid level 2n=2x=26, was verified in 76% of the species. Among the others, 24% are tetraploid (2n=4x=52), and one triploid (2n=3x=39). Intraspecific variability, with diploid and tetraploid accessions, was found in M. pigra var. dehiscens, M. setosa var. paludosa and M. somnians. With the exception of Mimadenia section, with only one species studied, polyploids occur in all the taxonomic sections. The results indicate that chromosome number is not a distinctive cytotaxonomic characteristic and that polyploidy was a decisive factor in the genus evolution. Polysomatic root-tip cells were found in 43 species, ranging from 3 to 86%, but only soon after seed germination and not in adult plants, suggesting that polysomaty is related to a rapid seedling development and establishment after germination. The 25 M. scabrella populations studied were all tetraploid. RAPD molecular analysis disclosed an average similarity index among populations ranging from, 0.18 to 0.48, indicating great interpopulational variability. The results of this work represent an important contribution to a better knowledge of genus Mimosa.
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Estudos genéticos em milho sobre o caráter tolerância no encharcamento do solo

Silva, Sérgio Delmar dos Anjos e January 2003 (has links)
A introdução de culturas de sequeiro em solos de várzea é importante para o desenvolvimento da região sul do Brasil, uma vez que estas áreas estão sub aproveitadas com a cultura de arroz irrigado e a pecuária extensiva. O milho é uma alternativa para o melhor aproveitamento destas terras, logo o desenvolvimento de genótipos tolerantes ao encharcamento do solo é fundamental para viabilizar esta exploração. Neste sentido, os objetivos deste trabalho foram estudar a genética da tolerância ao encharcamento e identificar marcadores de DNA associados a esse caráter. O trabalho foi conduzido em casa de vegetação, sendo analisados genitores, híbridos F1 e populações segregantes provenientes de cruzamentos entre linhagens tolerantes e sensíveis ao encharcamento do solo. A análise molecular, através de marcadores de microssatélites, foi realizada com uma população F3, resultante do cruzamento entre os genótipos mais contrastantes para a tolerância ao encharcamento. A seleção dos marcadores obedeceu ao critério de amostrar todos os cromossomos, com preferência aos que estivessem ligados a genes pertencentes a rotas metabólicas envolvidas com a glicólise e a fermentação. Os genitores demonstraram a existência de variabilidade genética para os caracteres matéria seca de parte aérea (MSP) e matéria seca de raiz (MSR), sendo que os coeficientes de herdabilidades estimados foram elevados. Ambos os caracteres revelaram complexidade quanto ao número de genes envolvidos, onde a análise de QTL indicou a presença de pelo menos três locos envolvidos na manifestação da tolerância ao encharcamento. A ação gênica predominante foi a de dominância e o efeito materno foi pronunciado. Três marcadores explicaram conjuntamente 33,3% da variação para MSP e 19,9% para MSR, podendo ser úteis na seleção assistida para a tolerância ao encharcamento na fase de planta jovem em milho De maneira geral, a seleção fenotípica para MSP e MSR poderá ser uma alternativa eficiente na seleção de genótipos de milho com tolerância ao encharcamento do solo.
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Relações evolutivas entre Passiflora actinia Hooker e Passiflora elegans masters (Passifloraceae)

Lorenz, Aline Pedroso January 2002 (has links)
Em estudos prévios sobre a filogenia de Passiflora, as espécies P. actinia e P. elegans destacaram-se pela sua grande similaridade genética, apesar de sua classificação em séries taxonômicas distintas. As duas espécies apresentam distribuição geográfica muito diferente. Enquanto P. actinia é encontrada em áreas de Mata Atlântica desde o estado do Espírito Santo até o Rio Grande do Sul (RS), P. elegans está restrita ao RS e a poucas regiões limítrofes. Para melhor avaliar as relações evolutivas entre estas duas espécies foram realizadas coletas intensivas em todo o estado e desenvolvidos testes quanto às seqüências dos espaçadores intergênicos cloroplasmáticos trnL-trnF e psbA-trnH, e dos espaçadores transcritos dos genes ribossomais nucleares ITS de plantas de diferentes localidades. As análises revelaram uma baixa variabilidade intraespecífica, e evidenciaram um perfil genético próprio a cada espécie. Nas comparações interespecíficas, foram utilizadas seqüências de espécies do subgênero (Passiflora) estudadas previamente, pertencentes às séries Simplicifoliae e Lobatae, as mesmas de P. actinia e P. elegans, respectivamente. Nos três marcadores as menores distâncias genéticas encontradas foram entre estas duas espécies, sugerindo o pouco tempo de divergência entre elas. Estas comparações não mostraram diferenças marcantes nas diversidades dentro e entre as duas séries, indicando similaridade genética entre elas Apesar da intensa amostragem realizada na área limítrofe das distribuições de P. actinia e P. elegans, somente foi encontrado um híbrido entre as duas. Além do fenótipo morfológico intermediário, o híbrido pôde ser reconhecido através das suas características genéticas, o espaçador nuclear ITS apresentando padrão aditivo nos sítios variáveis destas duas espécies; as seqüências dos marcadores cloroplasmáticos foram iguais às de P. actinia, indicando que esta é a espécie doadora deste genoma. Os padrões genéticos e geográficos destas duas espécies sugerem que o processo de especiação que se desenvolveu entre as duas seja recente e tenha ocorrido em alopatria, estando provavelmente ligado aos eventos geológicos do Holoceno que influenciaram a migração da Mata Atlântica no RS. A investigação das características abióticas das regiões de ocorrência das espécies não apresentou grandes dissimilaridades, podendo indicar que a atual segregação espacial deva-se à fragmentação florestal ou que haja exclusão competitiva entre elas, pois apresentam nichos ecológicos muito semelhantes.
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Análise da diversidade genética por marcadores RAPD e SSR em Fusarium oxysporum f. sp. cubense no Estado de Santa Catarina

Silva, Cristiane Maria da 24 October 2012 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2009 / Made available in DSpace on 2012-10-24T07:27:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 274971.pdf: 2846578 bytes, checksum: f745a914e07ddeda6a34cc83417453f8 (MD5) / O Mal-do-Panamá causado por Fusarium oxysporum f. sp. cubense (FOC) é um dos principais problemas fitossanitários da bananicultura. Para esta doença, o uso da resistência genética é o método de controle recomendável. Porém, sua eficiência depende tanto de genes de resistência disponíveis como da presença de patótipos do patógeno. Assim este estudo teve como objetivo caracterizar a diversidade genética de isolados de FOC por meio de descritores morfológicos e marcadores moleculares (RAPD, SSR). Para tanto, foram avaliados 66 isolados coletados em regiões produtoras de Santa Catarina. Os resultados de patogenicidade revelaram que 100% dos isolados foram patogênicos à bananeira da cultivar Enxerto. Quanto às características morfológicas dos isolados não se observou diferenças significativas com relação à taxa de crescimento das colônias, que variaram de 4,4 a 6,6 mm.dia-1. A coloração das colônias sobre meio de cultura BDA variou de branco, salmão e roxo. Os resultados utilizando marcadores moleculares RAPD apresentaram uma variabilidade considerável entre os isolados de FOC, com estimativas de similaridade que variaram de 35 a 98%. Baseado nos 10 marcadores selecionados de RAPD, os 66 isolados foram agrupados em cinco grupos distintos, sendo que o número de indivíduos provenientes das regiões norte e sul do Estado foi igualmente distribuído no primeiro grupo, onde 58 indivíduos foram agrupados. Nos outros quatro grupos formados teve-se somente isolados provenientes do norte do Estado, os quais apresentaram uma maior distância genética quando comparados ao grupo um. A técnica de marcador molecular SSR separou os isolados em três grupos distintos. O primeiro grupo foi constituído de 59 indivíduos provenientes dos diversos municípios onde as coletas foram feitas. O segundo grupo, composto por dois isolados (CO16, JS23), caracterizou-se por apresentar alelo nulo para o marcador MB11. Já o terceiro grupo, formado por quatro isolados (JS26, SI53, SI54, SI55, SI56), apresentou um alelo extra no marcador MB02. No estudo de compatibilidade vegetativa não foi possível observar o pareamento entre os quatro isolados testados não havendo, portanto compatibilidade vegetativa entre os mesmos. Não houve associação dos agrupamentos RAPD e SSR com origens geográficas e características morfológicas da colônia de FOC, visto que os isolados foram distribuídos indistintamente nos grupos.
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Marcador Molecular associado a cromossomos B em Partamona helleri (Hymenoptera, Apidae) / Molecular marker joined with B chromosomes in Partamona helleri (Hymenoptera, Apidae)

Tosta, Vander Calmon 15 August 2001 (has links)
Submitted by Marco Antônio de Ramos Chagas (mchagas@ufv.br) on 2017-05-09T14:05:48Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 569168 bytes, checksum: decebf3107d30e830c8a2d2c48a86ffd (MD5) / Made available in DSpace on 2017-05-09T14:05:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 569168 bytes, checksum: decebf3107d30e830c8a2d2c48a86ffd (MD5) Previous issue date: 2001-08-15 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Cromossomos B são cromossomos extras ao complemento normal, dispensáveis e que seguem suas próprias vias evolutivas, ou seja, têm um padrão de herança distinto do usual (mendeliano) entre os indivíduos que os carreiam. Eles podem se originar tanto intraespecificamente, a partir de quebra dos cromossomos do complemento normal, como interespecificamente, por transposição ou hibridação interespecífica. Estes cromossomos possuem uma característica típica resultante da sua evolução molecular, que os torna heterocromatinizados, com acúmulo de seqüências repetitivas e elementos transponíveis, ás vezes possuindo genes que podem ter efeitos diretos ou indiretos no “fitness” dos indivíduos que os apresentam. Em Partamona helleri foram encontrados indivíduos com até quatro cromossomos B. No intuito de obter informações sobre a origem e estrutura dos cromossomos B dessa espécie foi utilizada a técnica de RAPD para se isolar fragmentos de DNA associados a esses cromossomos. Verificou-se que a técnica de RAPD é útil para detectar seqüências específicas dos indivíduos portadores de cromossomos B. Um marcador RAPD associado aos cromossomos B em Partamona helleri, identificado previamente, foi isolado, clonado e seqüenciado. Os clones obtidos serão muito importantes para a construção de uma sonda específica para cromossomos B em Partamona helleri. Isto permitirá posterior hibridização in situ dessa sonda no genoma desta espécie e de outras relacionadas fornecendo dados sobre a origem dos cromossomos B. Um dos clones do marcador RAPD associado aos cromossomos B isolado foi seqüenciado. Uma análise desta seqüência mostrou que a mesma não codifica nenhuma proteína conhecida, não apresenta homologia com nenhuma outra seqüência específica de cromossomos B e possivelmente é característica de regiões de DNA repetitivo desses cromossomos de Partamona helleri. / B chromosomes are additional dispensable chromosomes that follow their own evolutionary pathway showing an unusual pattern of heredity (non-mendelian) among the individuals that carry them. The B chromosomes could be arised intraespecificaly as fragments of normal chromosomes, or interespecificaly for transposition or hybridization. The typical morphological traits of these chromosomes are results of their molecular evolution that become them heterochromatic, with repeated sequences and transposable elements, sometimes show genes affecting directly or indirectly the fitness of the individuals. Partamona helleri presented at most for chromosomes B per individual. In order to obtain information about the origin and structure of the B chromosomes of Partamona helleri was used a RAPD technical to isolated DNA fragments joined with these chromosomes. The work verified RAPD technical is useful to detect specific sequences of the individual with B chromosomes. One RAPD marker joined with B chromosomes in Partamona helleri, previously identified, was isolated, cloned and sequenced. The clones got will be so important to make specific probe to B chromosomes in Partamona helleri. This becomes possible in situ hybridization of this probe in the genome of this specie and other related species supply information about the origin of the B chromosomes. One of the clones of the RAPD marker joined with B chromosomes isolated was sequenced. Analysis of this sequence showed that it does not codify any protein known, does not present homology with any other B chromosome specific sequence and probably it is characteristic of repetitive DNA regions of the Partamona helleri B chromosomes. / Dissertação importada do Alexandria
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Estudo de herança e de marcadores moleculares para teor de ácido Iinolênico em soja / Inheritance studies and molecular of linolenic acid content in soybean seeds

Gesteira, Abelmon da Silva 28 June 1997 (has links)
Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-10-10T19:50:31Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 9708946 bytes, checksum: 640b45368bb37ece3d264e629a2ce731 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-10T19:50:31Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 9708946 bytes, checksum: 640b45368bb37ece3d264e629a2ce731 (MD5) Previous issue date: 1997-06-28 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / A redução do teor de ácido linolênico em soja está associado com a estabilidade oxidativa e melhoria do sabor do óleo. O acesso BARC-12, que possui baixo teor de ácido linolênico (3% em média), foi cruzado com o cultivar comercial CAC-1 (8.5 em média). Analises da composição dos ácidos graxos de sementes dos progenitores e da gerações F1, F2, 9 F3 foram deterrninadas por cromatografia a gás, de forma não destrutiva. Os estudos de herança indicam que o teor de ácido Iinolênico é controlado por dois genes de efeito maior. Contudo, a distribuição continua observada em sementes F2 e em familias F3 sugere que genes de efeito menor também estao envolvidos. As gerações F1, F2, e F3 também foram utilizadas para se estimarem alguns parâmetros genéticos. Análises quantitativas indicam que poucos genes com efeitos aditivos controlam o caráter em questão e que seus efeitos são principalmente aditivos. As estimativas de herdabilidade foram altas, possibilitando identificar, com precisão, os individuos desejados na população segregante, em gerações precoces. A metodologia “Bulked Segregant Analysis” foi utilizada para identificar marcadores RAPD Iigados a genes que determinam teor de ácido Iinolênico. Os 1000 “primers” aleatórios testados não detectaram nenhum polimorfismo de DNA que estivesse associado aos genes que controlam o baixo teor de ácido Iinolênico. / Genetic reduction of Iinolenic acid content in the soybean oil is considered to be important in order to increase oil stability and flavor. In this work, BARC-12 (an accession from USDA, USA), that contain low level of linolenic acid (3% on average), was crossed to the brazilian commercial variety CAC-t (8.5% on average). Fatty acid composition of the oil fraction extracted from F1, F2, and F3 seeds, by a non-destructive single seed analysis, was determined by gas chromatography. Inheritance studies indicated that Iinolenic acid levels are under the control of two independent major genes. However, the continuous distribution observed for Iinolenic acid content in F2 seeds and in F3 derived families suggested that minor genes also are involved. Quantitative analysis indicated that linolenic acid content in soybean is under the control of a low number of genes with additive effects. Stimated coefficient of heritabilities were high, indicating to be feasible to follow the character in individuals of segregant populations. Bulked segregant analysis was used to identify RAPD markers linked to gene(s) that determine low level of Iinolenic acid in F2 population from the cross CAC-1 x BARC 12. However, after testing 1000 primers, we were not able to find a RAPD marker linked to low Iinolenic acid in this cross.
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Relações evolutivas entre Passiflora actinia Hooker e Passiflora elegans masters (Passifloraceae)

Lorenz, Aline Pedroso January 2002 (has links)
Em estudos prévios sobre a filogenia de Passiflora, as espécies P. actinia e P. elegans destacaram-se pela sua grande similaridade genética, apesar de sua classificação em séries taxonômicas distintas. As duas espécies apresentam distribuição geográfica muito diferente. Enquanto P. actinia é encontrada em áreas de Mata Atlântica desde o estado do Espírito Santo até o Rio Grande do Sul (RS), P. elegans está restrita ao RS e a poucas regiões limítrofes. Para melhor avaliar as relações evolutivas entre estas duas espécies foram realizadas coletas intensivas em todo o estado e desenvolvidos testes quanto às seqüências dos espaçadores intergênicos cloroplasmáticos trnL-trnF e psbA-trnH, e dos espaçadores transcritos dos genes ribossomais nucleares ITS de plantas de diferentes localidades. As análises revelaram uma baixa variabilidade intraespecífica, e evidenciaram um perfil genético próprio a cada espécie. Nas comparações interespecíficas, foram utilizadas seqüências de espécies do subgênero (Passiflora) estudadas previamente, pertencentes às séries Simplicifoliae e Lobatae, as mesmas de P. actinia e P. elegans, respectivamente. Nos três marcadores as menores distâncias genéticas encontradas foram entre estas duas espécies, sugerindo o pouco tempo de divergência entre elas. Estas comparações não mostraram diferenças marcantes nas diversidades dentro e entre as duas séries, indicando similaridade genética entre elas Apesar da intensa amostragem realizada na área limítrofe das distribuições de P. actinia e P. elegans, somente foi encontrado um híbrido entre as duas. Além do fenótipo morfológico intermediário, o híbrido pôde ser reconhecido através das suas características genéticas, o espaçador nuclear ITS apresentando padrão aditivo nos sítios variáveis destas duas espécies; as seqüências dos marcadores cloroplasmáticos foram iguais às de P. actinia, indicando que esta é a espécie doadora deste genoma. Os padrões genéticos e geográficos destas duas espécies sugerem que o processo de especiação que se desenvolveu entre as duas seja recente e tenha ocorrido em alopatria, estando provavelmente ligado aos eventos geológicos do Holoceno que influenciaram a migração da Mata Atlântica no RS. A investigação das características abióticas das regiões de ocorrência das espécies não apresentou grandes dissimilaridades, podendo indicar que a atual segregação espacial deva-se à fragmentação florestal ou que haja exclusão competitiva entre elas, pois apresentam nichos ecológicos muito semelhantes.
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Imunoexpressão da proteína galectina-3 no câncer colorretal e sua relação com sobrevida / Immunoexpression of Galectin-3 Protein in Colorectal Cancer and its Relationship with Survival

Povegliano, Luciana Zaia Della Negra [UNIFESP] 30 April 2008 (has links) (PDF)
Made available in DSpace on 2015-07-22T20:50:20Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2008-04-30. Added 1 bitstream(s) on 2015-08-11T03:25:50Z : No. of bitstreams: 1 Publico-10919.pdf: 1330138 bytes, checksum: 230069b0ccbd38939c50df79ada51f8e (MD5) / Introdução: O câncer colorretal é um dos tumores mais comuns no mundo atual. A sobrevida e o tempo livre de doença estão sendo cada vez maiores graças ao surgimento de novas drogas quimioterápicas. Marcadores teciduais de prognóstico poderão contribuir para o melhor tratamento desta doença. As galectinas são proteínas pertencentes à família das lecitinas, que se ligam a galactoses, contendo glicoconjugados através de sua afinidade por -galactosídeo. Sua distribuição em tecidos sugere que têm função importante nos processos fisiológicos, como diferenciação celular, adesão celular, regulação do crescimento celular, e inibição ou indução da apoptose. A galectina-3, já estudada no câncer de tiróide, parece também ter um papel importante no câncer colorretal. Objetivos: Avaliar a imunoexpressão tissular da proteína galectina-3 em pacientes com câncer colorretal submetidos à ressecção cirúrgica e tratamento quimioterápico adjuvante ou paliativo e correlacionar a expressão tissular desta proteína com aspectos clínicos e de evolução da doença. Casuística e Método: Estudamos a imunoexpressão citoplasmática da galectina-3 em setenta e cinco adenocarcinomas colorretais. Os tumores foram classificados quanto à coloração citoplasmática em 1 (menos que 50% de células coradas) ou 2 (50% de células coradas). A positividade citoplasmática deste marcador foi comparada aos parâmetros clínicos e de evolução. Resultados: Entre os pacientes, 40 eram do sexo feminino, a média de idade foi de 61.98 anos (variando de 29 a 86 anos). Quanto à localização do tumor, 42,6% eram de reto, 24% de cólon esquerdo e 33,4% de cólon direito. Em relação ao estádio clínico, 33 eram estádio II, 32 estádio III e 10 estádio IV. A imunoexpressão da proteína galectina-3 foi classificada como 1 em 57,33% dos tumores e 2 em 42,67%. Quanto maior o estádio clínico, maior o percentual de células tumorais coradas (escore 2 em 60% dos tumores IV, 40,63% nos tumores estádio III e 39,39% nos estádios II, sendo p=0,4899). Em relação à sobrevida, pacientes com tumores com imunoexpressão 1 da galectina-3 mostraram uma maior sobrevida (65,96% dos doentes vivos sem doença com galectina-3 coloração 1 e 34,04% coloração 2). Em contrapartida entre os pacientes que evoluíram com metástase ou recorrência 52,63% apresentaram positividade das células com coloração 1 e 47,37% coloração 2 (p=0.0465). Nos pacientes que faleceram pela doença, 77,8% apresentaram imunoexpressão da galectina-3 moderada a fortemente coradas. Conclusão: Pacientes com imunoexpressão forte ou moderada da proteína galectina-3 (classificação 2) em maiores proporções faleceram ou evoluíram com recorrência. Observou-se redução marginalmente significante no risco de morte entre os pacientes com galectina-3 fraca ou nula (classificação 1) quando comparado com tumores de pacientes com galectina-3 forte ou moderada. O estudo da imunoexpressão citoplasmática da proteína galectina-3 parece ser um fator prognóstico nos tumores colorretais. / Backgrounds: Colorectal cancer is one of most common tumors nowadays. The survival and the disease-free survival are enhanced because of new chemotherapy drugs. Tumor biological markers will contribute for a better treatment. Galectin-3 is an endogenous galactose-binding protein that is expressed in a wide range of normal and neoplastic tissues and is thought to be involved in cellular adhesion, growth regulation and apoptosis. Galectin-3 is already studied in thyroid cancer, and seems to have an important role in colorectal cancer. Objective: Evaluate the immunoexpression of galectin-3 protein in patients with colorectal cancer under surgery and resection of the tumor and chemotherapy treatment and the relationship of galectin-3 expression and tumor evolution and clinical aspects. Methods: We studied the expression of galectin-3 in 75 colorectal tissues. An immunohistochemical scoring system was used to evaluate the cytoplasmic cells color. We divided the tumor’s cells in two groups: group 1, absent or weak (less than 50% staining cells) and group 2 strong or moderate ( 50% staining cells). Results: Among the 75 patients, 40 were female; the average age was 61.98 years old (from 29 to 86 years old). According to the site, 42.6% was of rectum, 33.4% right colon and 24% left colon. 33 tumors were stage II, 32 stage III and 10 stage IV. Galectin-3 immunoexpression was classified as 1 in 57.33% of tumors. The highest stage appears in the most staining cells (score 2 in 60% of tumors IV, 40.63% in tumors stage III and 39.39% in stage II, p=0.4899). In addition, galectin-3 immunoexpression group 1 showed higher survival (65.96% of no disease patient with galectin-3 group 1 and 34.04% group 2). On the other hand, in the group of patients with metastatic disease the results were 52.63% in group 1 and 47.37% in group 2 (p=0.0465). Conclusion: The imunoexpression of galectin-3 was strong or moderate in 42% of the colorectal tumors. Correlation among sex, age, stage, site or metastases and galectin-3 were not observed. Patients with strong or moderate imunoexpression of the protein in higher proportions died or had recurrence more frequently. The risk of death was marginally reduced in patients with negative or low grade galectin-3. Galectin-3 citoplasmatic immunoexpression seems to be a prognostic factor in colorectal cancer. / TEDE / BV UNIFESP: Teses e dissertações
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Implicações do uso de marcadores moleculares para o transplante de células germinativas em peixes / Implications of the use of molecular markers for the germ cells transplantation in fish

Vasconcelos, Ana Carina Nogueira January 2018 (has links)
O transplante de células germinativas tem sido uma importante abordagem experimental para o estudo da preservação genética de espécies ameaçadas de extinção ou economicamente importantes. A técnica consiste na remoção das células germinativas indiferenciadas das gônadas do animal doador e na transferência das mesmas para a gônada de um indivíduo receptor. A fim de aumentar a eficiência da técnica, a identificação prévia das células germinativas a serem transplantadas torna-se preferível, visto que a cavidade que as receberá apresenta tamanho limitado. Sendo assim, é importante o desenvolvimento de marcadores moleculares que identifiquem precisamente as células a serem transplantadas na cavidade do individuo receptor, e os genes mais utilizados para esta finalidade são o dead end e o gene vasa, os quais são expressos apenas nas células da linhagem germinativa. Devido à importância do Colossoma macropomum (tambaqui) para a economia brasileira, esta espécie foi escolhida como uma espécie modelo de preservação para este estudo. Através do isolamento e sequenciamento dos genes dead end e vasa, desenvolvemos sondas de hibridização capazes de reconhecer as células onde estes genes são expressos e estudar o seu padrão de expressão nas gônadas. Ambos os genes apresentaram intensa expressão nos oócitos pré-vitelogênicos e fraca expressão em algumas espermatogônias. Pela primeira vez na literatura, diferentes isoformas causadas por splicing alternativo foram identificadas no gene dead end. A quantificação da expressão temporal dos diferentes transcritos mostrou que o padrão de expressão da sequência completa do gene teve uma tendência distintiva comparada ao padrão dos transcritos curtos, sugerindo que as diferentes isoformas desempenham papéis específicos e importantes para o desenvolvimento da linha germinativa nesta espécie. / Germ cell transplantation has been an important experimental approach to the study of the genetic preservation of endangered or economically important species. The technique consists in removing undifferentiated germ cells from the donor animal's gonads and transferring them to the gonad of a recipient individual. In order to increase the efficiency of the technique, the prior identification of the germ cells to be transplanted becomes preferable, since the receiving cavity presents limited size. Therefore, it is important to develop molecular markers to precisely identify the cells to be implanted in the recipient cavity, and the genes most used for this purpose are the dead end and the vasa genes, which are expressed only in germline cells. Due to the importance of Colossoma macropomum (tambaqui) for the Brazilian economy, this species was chosen as a model species for preservation in this study. By isolating and sequencing the dead end and vasa genes, we developed hybridization probes capable of recognizing the cells where these genes are expressed and better studying their expression pattern in the gonads. Both genes presented intense expression in pre-vitellogenic oocytes and poor expression in some spermatogonia. For the first time in the literature, different isoforms caused by alternative splicing were identified in the dead end gene. Quantification of the temporal expression of the different transcripts showed that the expression pattern of the full-length sequence had a distinctive tendency compared to the short transcripts pattern, suggesting that the different isoforms play specific roles for the germline development in this species.
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Transcrição de genes citocromo P450 em ostra Crassostrea gigas

Gomes, Rafaela Pino January 2013 (has links)
Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Biológicas, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biociências, Florianópolis, 2013 / Made available in DSpace on 2013-12-05T23:03:33Z (GMT). No. of bitstreams: 1 320337.pdf: 2088380 bytes, checksum: b82e99715a833e8a5eb4c51e691ed579 (MD5) Previous issue date: 2013 / Diversas áreas costeiras no Estado de Santa Catarina estão associadas a zonas de cultivo de ostras, pesca e lazer, sendo que algumas destas estão contaminadas por esgoto sanitário. Tecnologias vêm sendo desenvolvidas na tentativa de monitorar a contaminação nestes ambientes, dentre as quais, podemos destacar os biomarcadores e a ostra Crassotrea gigas como organismo sentinela. Neste estudo encontramos diferença significativa na trasncrição de genes de citocromo P450 (CYP356A2, CYP2AU2, CYP30C1, CYP3071A1 e CYP26F1) em amostras de glândula digestiva de ostras expostas por diferentes períodos a um local contaminado por esgoto sanitário. Também avaliamos os níveis de transcrição dos genes CYP356A2, CYP2AU2 e CYP30C1, em diferentes tecidos de ostras C.gigas, após um dia de exposição, sendo que os três genes responderam a presença de contaminantes. Essas informações permitem um avanço na caracterização da indução destes genes por contaminantes, bem como, através da execução deste projeto aprofundamos nossos conhecimentos relacionados aos níveis de transcrição de isoformas de genes de CYPs, uma vez que os genes CYP307A1, CYP3071A1 e CYP26F1 foram analisados pela primeira vez em diferentes tecidos de ostras C. gigas presentes em local contaminado por esgoto sanitário <br> / Abstract: Several coastal areas in the State of Santa Catarina are associated with oyster farming, fishing and leisure and some of these are contaminated by sanitary sewage. Technologies have been developed in an attempt to monitor contamination in these environments, among which we can highlight the biomarkers and the oyster Crassostrea gigas as sentinel organism. In this study we found significant differences in the transcription of cytochrome P450 genes (CYP356A2, CYP2AU2, CYP30C1, CYP3071A1 and CYP26F1) in samples of digestive gland of oysters exposed for different periods of exposure to a sanitary sewage contaminated site. We also assessed the levels of transcription of genes CYP356A2, CYP2AU2 and CYP30C1 in different tissues of oyster exposed for one day at the contaminated site, and the three genes were responsive to the contaminants. This information allows an advance in characterization of these genes by inducing contaminants, and by performing this design deepened our knowledge related to levels of transcript isoform of CYP genes, once the genes CYP307A1, CYP3071A1 and CYP26F1 were analyzed for the first time in different tissues of oyster C. gigas present in sewagecontaminated site.

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