Made available in DSpace on 2014-06-11T19:32:54Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2007-04-05Bitstream added on 2014-06-13T20:44:16Z : No. of bitstreams: 1 silveira_gg_dr_rcla.pdf: 641894 bytes, checksum: 52f7995780eb514330fda7bbbcb68b69 (MD5) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / Neste trabalho foi estudada a produção de renina microbiana pelo zigomiceto Mucor miehei utilizando Fermentação em Estado Sólido (FES). Os substratos utilizados foram farelos de trigo, laranja, aveia e arroz, bagaço de cana e casca de café. Foi estudada também a combinação de várias quantidades de dois substratos diferentes já mencionados. Dos substratos utilizados, não houve crescimento evidenciado do fungo quando foi utilizado, casca de café, bagaço de cana e farelo de laranja. Caseína é um importante fator na potencialização da biosíntese de renina tanto em fermentação submersa quanto em Fermentação em Estado Sólido. Nos experimentos com farelos de trigo e aveia as maiores atividades enzimáticas foram observadas entre 48 e 72 horas de cultivo, umidade acima de 79% e o aumento da quantidade de farelo de trigo na mistura foi favorável no que diz respeito ao aumento desta atividade. Nos experimentos com farelos de trigo e arroz sem suplementação de caseína, todas as combinações de meio de cultivo foram estatisticamente significativas sobre a atividade enzimática. Umidades acima de 98 % parecem inibir o crescimento do fungo e, consequentemente, a síntese enzimática que aumentou após 48 horas de cultivo. Quando houve a suplementação de caseína nos experimentos com farelos de trigo e arroz, houve um sensível incremento nas atividades enzimáticas. Os meios 2, 3 e 4 não forneceram influência estatisticamente importantes segundo o teste de Tukey e as menores atividades foram observadas no meio tipo 1. Umidades abaixo de 80 % e acima de 100 % forneceram baixas atividades enzimáticas. Assim como nos experimentos anteriores, as maiores atividades foram observadas após 48 horas de cultivo. Analisando-se todos os experimentos, verifica-se que as maiores atividades enzimáticas foram superiores quando comparadas aos relatos de outros pesquisadores. / The microbial rennin production by zigomiceto Mucor miehei produced on Solid State Fermentation (SSF) using wheat bran, rice bran, oat bran, sugarcane bagasse and coffee husk was studied in this work. The combination of two different substrates was also studied. No growth of microorganism was observed when coffee husk, sugar cane bagasse and orange pulp were used. Casein has an important factor in the rennin biosynthesis induction in Submerged Fermentation and Solid State Fermentation. In the experiments with wheat bran and oat bran the maximum enzyme activities had been observed between 48 and 72 hours. Moisture above of 79% and the wheat bran increase in the mixture were favorable for increase enzyme activity. Moisture above 98 % can inhibit the microorganism growth and the enzyme synthesis increased after 48 hours. When casein was added in wheat bran and rice bran medium, a rise in the enzymatic activities was observed. Low enzyme activities were observed in moisture between 80 % and 100 %. The highest activity was observed after 48 hours. The enzyme activity in this study was upper when compared with other researchers.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária, 2008. / Submitted by Diogo Trindade Fóis (diogo_fois@hotmail.com) on 2009-09-22T12:44:33Z No. of bitstreams: 1 2008_RafaelRochaAndrade.pdf: 735842 bytes, checksum: ce0a24e259ccfd7d09f8b75a7e097554 (MD5) / Approved for entry into archive by Gomes Neide(nagomes2005@gmail.com) on 2010-02-08T17:25:04Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_RafaelRochaAndrade.pdf: 735842 bytes, checksum: ce0a24e259ccfd7d09f8b75a7e097554 (MD5) / Made available in DSpace on 2010-02-08T17:25:04Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_RafaelRochaAndrade.pdf: 735842 bytes, checksum: ce0a24e259ccfd7d09f8b75a7e097554 (MD5) Previous issue date: 2008 / O objetivo deste trabalho foi verificar a ocorrência e identificar, por análise bioquímica e RFLPPCR do gene 23S rRNA, as espécies de Listeria spp. presentes em amostras de salsichas tipo hot dog a granel e carne bovina homogeneizada a granel comercializadas no Distrito Federal. A metodologia usada para a realização do isolamento bacteriano, bem como a diferenciação bioquímica foi a preconizada pela Instrução Normativa n° 40, de 16 de dezembro de 2005 do Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento do Brasil (MAPA), e, para a RFLP PCR foi utilizada a metodologia descrita por Paillard et al., (2003). Um total de 162 amostras, sendo 127 salsichas tipo hot dog e 35 amostras de carne bovina homogeneizada foram testadas. Das 127 amostras de salsichas tipo hot dog analisadas, 26 foram positivas para Listeria spp.. e, destas amostras positivas, 18 foram identificadas como Listeria innocua e 09 como Listeria monocytogenes, tanto na identificação por testes bioquímicos como por RFLP-PCR. Das 35 amostras de carne bovina homogeneizada testadas, 16 foram positivas para Listeria spp., destas, 12 foram identificadas como Listeria innocua e 04 como Listeria monocytogenes. Os resultados deste trabalho demonstram que as bactérias Listeria monocytogenes e Listeria innocua estão presentes em amostras de salsichas tipo hot dog a granel e em carne bovina homogeneizada a granel de estabelecimentos comerciais no Distrito Federal e a metodologia RFLP-PCR permitiu diferenciar as cepas isoladas neste tipo de alimento. ___________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / The objective of this work was to verify the occurrence and identify, by biochemical analysis and (RFLP-PCR) of the 23S rRNA gene, the species of Listeria spp. in hot dog sausages and minced bovine meat sold in bulk commercialized in Distrito Federal, Brazil. The methodology used for this bacteriological isolation and biochemical tests for identification of the strains was used according to the Instrução Normativa n° 40, from December 16 2005, of the Ministry of Agriculture, Cattle Breeding and Supply of Brazil (MAPA), and, to the identification using RFLP-PCR according to Paillard et al., (2003). A total of 162 samples, being 127 hot dog sausages and 35 samples of minced bovine meat were tested. From the 127 samples of hot dog sausages analyzed, 26 were positive to Listeria spp. and, from these, 18 were identified as Listeria innocua and 09 as Listeria monocytogenes, in both identifications by biochemical tests and RFLP-PCR. From the 35 samples of minced bovine meat tested, 16 were positive to Listeria spp., from these, 12 were identified as Listeria innocua and 04 as Listeria moncytogenes. The results of this work show that the bacteria Listeria monocytogenes and Listeria innocua are found in hot dog sausages and bovine minced meat sold in bulk from commercial grocery stores in Distrito Federal and the RFLP-PCR methodology allowed the identification of the strains isolated in this kind of food.

Células de combustível microbianas despertaram interesse nos últimos anos devido à aplicação em tratamento de águas, biorremediação e geração de eletricidade. Um dos organismos que tem sido estudado a fundo para a aplicação em células de combustível microbianas é a Geobacter sulfurreducens. Esta espécie de Geobacter, que gera eletricidade pela oxidação de compostos, mostrou gerar uma quantidade significativa de energia devido a múltiplos mecanismos extracelulares de transferência de elétrons através de pilis ou citocromos do tipo C. Outra espécie de Geobacter que desperta grande interesse é a Geobacter metallireducens por ser capaz de oxidar compostos aromáticos e reduzir metais nocivos solúveis (até mesmo radioativos) à forma inofensiva insolúvel. Porém, o aumento na densidade de potência destes dispositivos é essencial para que sejam competitivos com outras fontes de energia renovável. Neste trabalho foi feito o estudo da melhor configuração visando a ausência de limitações catódicas para aumento da densidade de potência nas células, o que demostrou que medidas como diminuição do tamanho no ânodo, proximidade dos eletrodos e substituição do cátodo de oxigênio por ferricianeto melhoram a desempenho da célula. Também foram feitas comparações de densidade de potência em células de combustível microbianas de culturas puras de G. metalirreducens e G. sulfurreducens e uma cocultura das duas espécies. Essa comparação demonstrou que G. metallireducens além de poder ser utilizada para biorremediação apresenta uma densidade de potência elevada, podendo ser usada também como cultura pura em células de combustível microbianas, para a produção de eletricidade. Também se pode perceber uma relação direta entre a espessura do biofilme e a potência produzida nas três células. A espécie G. metallireducens demonstrou ainda ser útil na utilização de glicerol como fonte de carbono, podendo servir como espécie remediadora para este resíduo. / Microbial fuel cells aroused interest in recent years due to the application in water treatment, bioremediation and electricity generation. One of the microorganisms that has been studied thoroughly for application in microbial fuel cells is the Geobacter sulfurreducens. This specie of Geobacter, which generates electricity by oxidizing compounds, showed generate a significant amount of energy due to multiple mechanisms of extracellular electron transfer through Pilis or c type cytochromes. Another specie of Geobacter that arouses great interest is the Geobacter metallireducens by being able to oxidize aromatic compounds and soluble reducing harmful metals to insoluble harmless. However, the increased power density of these devices is essential to be competitive with other renewable energy sources. This present work studied the best configuration aiming the absence of cathodic limitations to increasing power density of the cells. Measurements have shown that reduced anode size, location of the electrodes and replacement of oxygen by ferricyanide, improves the performance of the cells. Comparisons of power density between pure cultures of G. sulfurreducens and G. metalirreducens and a coculture of the two species were also made. This comparison showed that G. metallireducens can be used for bioremediation and also in a microbial fuel cell to produce electricity due the high power density produced. Direct relationships between the thickness of the biofilm and the power produced in the three cells have been notice. The specie G. metallireducens also showed to use glycerol as a carbon source, which may be an alternative for glycerol consumption.

A capacidade de adquirir, com facilidade, resistência à terapia antimicrobiana torna-se uma das características mais estudadas em Acinetobacter sp., mundialmente conhecido por estar relacionado a surtos de infecções associadas à assistência a saúde (IAAS) e por ser apontado como um grave problema de saúde pública. Embora isolados clínicos desse gênero sejam extensivamente estudados quanto à presença e a diversidade de genes do tipo OXA-carbapenemases,existem poucos estudos sobre essa relação em isolados ambientais. Este trabalho teve como objetivo determinar a presença de carbapenemases do tipo OXA (e sua diversidade), de ISAba1 e de sua relação com as carbapenemases em isolados clínicos e de esgoto hospitalar de Acinetobacter sp. na cidade de Porto Alegre, Rio Grande do Sul. Um total de 310 isolados (145 clínicos e 165 ambientais) foram submetidos a análise por PCR das regiões genéticas de interesse. A diversidade dos genes do tipo blaOXA-51 foi realizada por DGGE. Os resultados indicam a presença do gene blaOXA-58 em um isolado, pela primeira vez no Brasil. A sequência ISAba1 foi frequentemente encontrada (92,9%), porém, a sua associação com blaOXA-51 foi baixa e encontrada em 9,8% dos isolados clínicos e em 6,5% dos isolados ambientais. A análise de diversidade revelou uma baixa freqüência de alelos de OXA-51 entre os isolados estudados, sendo blaOXA-65 a variante mais encontrada. Contudo, podemos afirmar que o esgoto hospitalar analisado constitui-se de uma fonte de contaminação de bactérias patogênicas e que as precárias políticas de saneamento podem proporcionar a disseminação de multirresistência para o meio ambiente. / The ability of easily acquiring resistance to antimicrobial therapy becomes one of the most studied features in Acinetobacter sp., world renowned for being related to outbreaks of infection associated with health care and for being appointed as a serious public health problem. Although clinical isolates of this genus are extensively studied for the presence and diversity of OXAcarbapenemase genes, there are few studies about this relationship in environmental isolates. This study aimed to determine the presence of OXAtype carbapenemases (and yours diversity), of ISAba1 and its relationship with carbapenemases in clinical and hospital sewage isolates of Acinetobacter sp. in Porto Alegre, Rio Grande do Sul. A total of 310 strains (145 of clinical origin and 165 of environmental origin) were subjected to PCR analysis of genetic regions of interest. The diversity of blaOXA-51-like genes was performed by DGGE. The results indicate the presence of the gene blaOXA-58 in an isolated, for the first time in Brazil. ISAba1 was frequently found (92.9%) but its association with blaOXA-51-like was low and was found in 9.8% of clinical isolates and in 6.5% of environmental isolates. The diversity analysis showed that there is a low frequency of alleles of OXA-51 among the studied isolates being blaOXA-65 variant the most often found. However, we can state that the hospital sewage is considered to be a source of pathogenic bacteria contamination and that the poor sanitation politics contributes to the spread of multidrug resistance in the environment.

Made available in DSpace on 2015-12-06T23:05:43Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2005 / As infecções causadas por P. aeruginosa são freqüentemente de difícil tratamento devido à virulência e a resistência a vários antimicrobianos apresentados por este patógeno. Os carbapenens são geralmente o tratamento de escolha para infecções causadas por P. aeruginosa multirresistentes, porém, a resistência a estes compostos tem aumentado rapidamente, principalmente, devido ao surgimento de amostras produtoras de metalo-ß-lactamases. Os objetivos deste estudo foram: i) avaliar o perfil de sensibilidade a antimicrobianos das amostras de P. aeruginosa resistentes aos carbapenens isoladas de hospitais brasileiros; ii) avaliar a freqüência da produção de MPL entre as amostras de P. aeruginosa resistentes aos carbapenens; iii) avaliar o perfil de sensibilidade a antimicrobianos das amostras de P. aeruginosa produtoras de MβL pela técnica de microdiluição em caldo; iv) detectara presença dos genes biasSPM-1, blaIMP-1, blaVIM-1, e blaVIM-2 entre as amostras de P. aeruginosa produtoras de MßL; v) avaliar a presença de variantes alélicos do gene blasIPM-1, entre as amostras de P. aeruginosa produtoras da MPL do tipo SPM-1, e vi) avaliar a similaridade genética entre as amostras de P. aeruginosa resistentes aos carbapenens produtoras de MßL. Foram avaliadas 206 amostras de P. aeruginosa resistentes aos carbapenens isoladas entre 2001 e 2003, de 25 centros médicos. As 206 amostras foram testadas pelo método de disco-difusão. Os testes de sensibilidade foram realizados de acordo com a padronização do "National Committee for Clinical Laboratory Standards" (NCCLS). Os isolados resistentes aos carbapenens foram triados para a produção de metalo-ß-lactamases pelo teste de aproximação de discos utilizando dois inibidores enzimáticos (EDTA e ácido 2mercaptopropiônico). A produção de MßL foi confirmada pela metodologia do Etest® (fita Etest©MBL). Em seguida foi realizada a técnica de PCR para a pesquisa dos genes blaIMP-1, blaVIM-1, bIaVIM-2 e blaSPM-1. A avaliação da similaridade genética entre as amostras produtoras de MßL foi realizada pela técnica da ribotipagem automatizada e PFGE. Para fins comparativos, também foram selecionadas para análise da similaridade genéticaamostras não produtoras de MßL isoladas em centros médicos, que apresentavam amostras de P. aeruginosa produtoras de MPL. Altas taxas de resistência a maioria dos antimicrobianos foram observadas entre as amostras de P. aeruginosa resistentes aos carbapenes…(au). / Infections caused by Pseudomonas aeruginosa are often difficult to treat because of its virulence and antimicrobial resistance. Carbapenems are usually active against multiresistant P. aeruginosa, but resistant to these compounds has been increasing rapidly. High-level resistance to carbapenems is still uncommon in P. aeruginosa and is usually indicative of metallo-β-lactamases (MβL). The purpose of the study were to evaluate the antimicrobial susceptibility profiles of carbapenems resistant P. aeruginosa isolated from Brazilian Hospitals, were to detect the presence of gene blaSPM-1, blaIMP-1, blaVIM-1 e blaVIM-2 and to evaluate the genetic similarity of P. aeruginosa resistant to carbapenems. Were evaluated 206 P. aeruginosa resistant to carbapenems collected during 2001 – 2003 from 25 medical centers. Antimicrobial susceptibilities testing to selected agents were determined by disk diffusion to 206 strains. The suscepptibility testing were to using the reference “National Committee for Clinical Laboratory Standards” (NCCLS). Carbapenems resistant isolates were screened for MβL production by disk approximation test using 2 enzyme inhibitors (EDTA and 2-mercaptopropionic acid). The procedure was confirmed by Etest (Etest MBL strip) and also by PCR assays using the following primers blaIMP-1, blaVIM-1, blaVIM-2 e blaSPM-1. The genetic similarity was performed in MβL producers strains and one negative-MβL strains for medical centers by automated ribotyping and PFGE. High resistance rates to majority of the antimicrobial agents were demonstrated. The polymyxins were the most active antimicrobial agents evaluated with 100,0% of susceptibility rate to all strains. The MβL production was detected in 98 (47,6%) of 206 strains. The blaSPM-1 gene was detected in 82 strains (83,7%) and blaIPM-1 gene in 3 strains (16,3%). Thirteen isolates did not show PCR amplification for none of the primers used. The analysis of genetic similarity showed a clonal diversity among the 98 carbapenems-resistant strains (46 ribogroups). CONCLUSION: This study indicates high prevalence of MβL producing in carbapenems-resistant P. aeruginosa and clonal dissemination these microrganism to a wide geographic area of Brazil. / BV UNIFESP: Teses e dissertações

El presente artículo tiene como finalidad resaltar la falta de conocimiento en cuanto a la diversidad microbiana, bajo la consideración de que es fundamental el rol que juegan los microorganismos en favor de la humanidad a través de numerosos procesos que benefician al hombre, plantas y animales. En los estudios sobre biodiversidad, los trabajos se han enfocado tradicionalmente hacia la flora y fauna haciendo caso omiso a las poblaciones microbianas; y, considerado el Perú un país megadiverso, no se hacen referencias, sin embargo, al componente microbiano cuya diversidad debe situarse en la misma proporción. Los estudios, asimismo, se enfocan en los efectos de los microoganismos sobre el hombre, plantas y animales (patógenos). Se sabe muy poco o nada en cuanto a los efectos de la intervención antrópica sobre estos a través de los variados sistemas de explotación del suelo. La diversidad microbiana en un centímetro cubico de suelo amazónico o en un gramo de lodo de un humedal costero constituye todavía un misterio. Estudios pioneros en la Amazonía peruana señalan la variabilidad en la ocurrencia de bacterias fijadoras de nitrógeno y de hongos formadores de micorrizas, así como los efectos del manejo de suelos sobre estos microorganismos. El conocimiento de las poblaciones microbianas y su funcionamiento puede contribuir grandemente a resolver problemas ambientales en diferentes ámbitos geográficos en el país. La biogeografía microbiana se presenta como una prioridad en la investigación de la diversidad biológica. En este artículo, se presentan algunas recomendaciones y pautas para el desarrollo de la referida investigación.   The purpose of the present paper is to highlight the lack of knowledge on microbial diversity considering the fundamental role microorganisms render to humankind through the various processes they intervene for the benefit of humans, plants and animals. In studies on biodiversity, work traditionally was centralized to flora and fauna, neglecting the microbial component. Peru is considered a country of megadiversity in biological terms, however, there are no references to the microbial resource whose diversity should exist in the same proportion. Additionally, studies are focused on the effects of microorganisms on humans, plants and animals (patoghens). Very little or nothing is known on the effects of human intervention to microbes through the various systems of soil use. Microbial diversity in a cubic centimeter from an amazon soil or one gram of mud from a coastal marsh is still a mistery. Pioneer studies conducted in the peruvian amazon showed the variable occurrence of nitrogen fixing bacteria and mycorrhizal fungi and the effects of soil management on these microoganisms. The knowledge of microbial populations and their functioning can greatly contribute to solve enviromental problems in different geographical landscapes in the country. Microbial biogeography is presented in this paper as a priority in research on biological diversity. Some recommendations and guidelines are proposed to this respect.

Submitted by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T10:53:14Z No. of bitstreams: 2 bernardo_murta_salomao.pdf: 765787 bytes, checksum: 15feb0d656e2880a46734eb591340e74 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T11:33:45Z (GMT) No. of bitstreams: 2 bernardo_murta_salomao.pdf: 765787 bytes, checksum: 15feb0d656e2880a46734eb591340e74 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T11:33:51Z (GMT) No. of bitstreams: 2 bernardo_murta_salomao.pdf: 765787 bytes, checksum: 15feb0d656e2880a46734eb591340e74 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Approved for entry into archive by Rodrigo Martins Cruz (rodrigo.cruz@ufvjm.edu.br) on 2015-01-05T11:34:41Z (GMT) No. of bitstreams: 2 bernardo_murta_salomao.pdf: 765787 bytes, checksum: 15feb0d656e2880a46734eb591340e74 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-01-05T11:34:41Z (GMT). No. of bitstreams: 2 bernardo_murta_salomao.pdf: 765787 bytes, checksum: 15feb0d656e2880a46734eb591340e74 (MD5) license_rdf: 23898 bytes, checksum: e363e809996cf46ada20da1accfcd9c7 (MD5) Previous issue date: 2013 / Coordena??o de Aperfei?oamento de Pessoal de N?vel Superior (CAPES) / Conselho Nacional de Desenvolvimento Cient?fico e Tecnol?gico (CNPq) / Funda??o de Amparo ? Pesquisa do estado de Minas Gerais (FAPEMIG) / Instituto Nacional de Ci?ncia e Tecnologia de Ci?ncia Animal (INCT-CA) / Foram avaliados o consumo, as digestibilidades totais e ruminais e as taxas de digest?o (kd) e de passagem (kp) ruminal dos nutrientes de dietas constitu?das de cana-de-a??car in natura e diferentes n?veis de concentrado, bem como o pH e a concentra??o de am?nia ruminal e a efici?ncia microbiana. Foram utilizados cinco bovinos mesti?os Holand?s-Zebu, machos castrados, fistulados no r?men, com peso corporal (PC) m?dio inicial de 300 ? 50 kg, distribu?dos em delineamento experimental em quadrado latino 5 x 5 balanceado para efeito residual. O experimento foi constitu?do de cinco per?odos experimentais, com dura??o de dezesseis dias cada um, sendo oito dias destinados ? adapta??o dos animais ?s dietas e os outros oito para a realiza??o das coletas. As dietas experimentais foram constitu?das de: 1) 100% cana-de-a??car in natura (CA); 2) 80% de CA + 20% de concentrado (C); 3) 60% de CA + 40% de C; 4) 40% de CA + 60% de C e 5) 20% de CA + 80% de C. A cana-de-a??car foi corrigida com ureia/sulfato de am?nio (ureia/SA), na propor??o de 9:1, sendo as dietas isoproteicas (aproximadamente 12% de PB na base da MS). Os dados foram analisados utilizando o procedimento MIXED do SAS (vers?o 9.1), utilizando-se an?lise de regress?o e 5% como n?vel cr?tico de probabilidade para o erro tipo I. O consumo de mat?ria seca (MS), expresso em kg/dia ou g/kg de peso corporal foi influenciado (P<0,05) pelos n?veis de concentrado, estimando-se consumo m?ximo com 63,61 e 75,04%, respectivamente. Os demais consumos calculados em kg/dia tamb?m foram influenciados (P<0,05) pelos n?veis de concentrado, estimando-se consumos m?ximos com 63,21; 63,78; 53,14; 64,31; 32,49; 88,47 e 55,46% de concentrado na dieta, para MO, PB, FDNcp, NDT, FDNi, FDNcpD e CNF, respectivamente. O ponto de m?ximo para as vari?veis expressas em g/kg de peso corporal foi obtido com 56,94; 33,25 e 63,93% de concentrado para FDNcp, FDNi e NDT, respectivamente. O Pool (kg/dia) foi aumentado linearmente ? medida que se elevou os n?veis de concentrado para MS, PB, MO e CNF. Comportamento similar foi observado para ki (h-1) da MS, PB, MO, FDNcp e CNF. As taxas de digest?o (kd h-1) da MS, MO e FDNcp e a taxa de passagem (kp h-1) da PB, aumentaram linearmente com a eleva??o dos n?veis de concentrado na dieta. Estimaram-se m?ximos fluxos omasais (kg/dia) com 52,22; 51,78; 80,83 e 31,45% de concentrado na dieta, respectivamente, para MS, MO, CNF e FDNi. As digestibilidades aparentes (DA) da MS, EE e CNF tamb?m foram influenciadas pelos n?veis de concentrado na dieta. As digestibilidades ruminais da MS e FDN aumentaram linearmente (P<0,05) com a adi??o de n?veis crescentes de concentrado . A efici?ncia microbiana calculada a partir dos derivados de purina na urina n?o foi influenciada (P>0,05) pelos n?veis de concentrado na dieta. Houve intera??o entre tempo e tratamento para o pH ruminal. Para cada tratamento, os valores de pH no l?quido ruminal apresentaram comportamento quadr?tico em fun??o do tempo, estimando-se valores m?nimos de 6,83; 6,78; 6,55; 6,76 e 6,36 nos tempos de 11,29; 8,26; 11,62; 11,09 e 10,31 horas ap?s a alimenta??o para as dietas contendo 0, 20, 40, 60 e 80 % de concentrado, respectivamente. N?o houve efeito de intera??o entre tratamento e tempo e tampouco de tratamento (P>0,05) sobre a concentra??o de N-NH3/100 mL. Mas foi observado efeito quadr?tico de tempo ap?s a alimenta??o (P<0,05), sobre esta vari?vel estimando-se concentra??o m?nima de 9,64 mg de N-NH3 /100 mL ?s 15,9 horas ap?s a alimenta??o. Conclui-se que n?veis pr?ximos de 65% de concentrado resultam em maior ingest?o de energia em dietas contendo cana-de-a??car. / Disserta??o (Mestrado) ? Programa de P?s-Gradua??o em Zootecnia, Universidade Federal dos Vales do Jequitinhonha e Mucuri, 2013. / ABSTRACT Five ruminal cannulated crossbred (Holstein x Zebu) steers with average body weight (BW) of 300 ? 50kg were used to evaluate intake, total and apparent digestibility, ruminal digestion (kd) and passage (kp) rates of nutrients from sugar-cane based diets containing different levels of concentrate as well as its effects on ruminal pH and ammonia concentration, and microbial efficiency. Cattle were assigned into a 5 x 5 Latin Square design balanced for residual effects. The trial was divided into five 16 d experimental periods with 8 days for adaptation to experimental diets and 8 days for sample collection. Experimental treatments were composed of four different diets: 1) 100% of sugar-cane in natura (CA); 2) 80% of sugar-cane + 20% of concentrate; 3) 60% of CA + 40% of C; 4) 40% of CA + 60% of C; 5) 20% of CA + 80% of C. Experimental diets were isoprotein (approximately 12% DM basis) and a mix of urea/ammonium sulphate was used at 9:1ratio to correct the protein level of sugar-cane. A regression analysis was performed using the MIXED procedure of SAS (9.1 version) and significance was considered at P < 0.05. Dry matter intake (DMI) expressed either as kg/day or g/kg of BW was affected (P < 0.05) by concentrate level and the maximum intake was estimated to be at 63.61 and 75.04% of concentrate, respectively. Intake (kg/day) of OM, CP, NDFap, TDN, iNDF, digestible NDFap (NDFapD), and NFC were affected by concentrate level (P < 0.05) and their maximum intake was estimated to be at 63.21; 63.78; 53.14; 64.31; 32.49; 88.47 e 55.46% of concentrate, respectively. The ruminal pool size of DM, CP, OM, and NFC increased linearly as the dietary levels of concentrate increased. Similarly, ki (h-1) DM, CP, OM, NDFap, and NFC has also increased as the dietary levels of concentrate increased. The digestion rates (kg h-1) of DM, OM, and NDFap as well as the passage rate (kg h-1) of CP increased linearly as the dietary levels of concentrate increased. The maximum omasal flux (kg/day) of DM, OM, NFC, and iNDF were estimated to be at 52.22; 51.78; 80.83; and 31.45% of dietary concentrate, respectively. Apparent digestibility of DM, EE, and NFC was also linearly enhanced (P < 0.05) with the increase of concentrate levels. Microbial efficiency calculated from urinary purine derivates was not affected (P > 0.05) by the concentrate levels evaluated. An interaction of sampling time and dietary treatment was observed for ruminal pH. A quadratic effect across sampling time was observed for each experimental treatment the ruminal fluid pH where the estimation of the minimum values was 6.83; 6.78; 6.55; 6.76; and 6.36 for 11.29; 8.26; 11.62; 11.09; and 10.31 hours after feeding for diets containing 0, 20, 60, and 80% of concentrate, respectively. No interaction was observed (P > 0.05) among dietary treatments and sampling time for concentration of N-NH3/100 mL. Indeed, no effects (P > 0.05) of dietary treatments on ruminal concentration of N-NH3/100 mL. However, a quadratic effect (P < 0.05) was observed for time after feeding with the minimum concentration of 9.64 mg of N-NH3/100mL was estimated to be obtained at 15.9 hours after feeding. The data suggests that levels up to 65% of concentrate result in greater energy intake by cattle fed sugarcane based diets.

A capacidade de adquirir, com facilidade, resistência à terapia antimicrobiana torna-se uma das características mais estudadas em Acinetobacter sp., mundialmente conhecido por estar relacionado a surtos de infecções associadas à assistência a saúde (IAAS) e por ser apontado como um grave problema de saúde pública. Embora isolados clínicos desse gênero sejam extensivamente estudados quanto à presença e a diversidade de genes do tipo OXA-carbapenemases,existem poucos estudos sobre essa relação em isolados ambientais. Este trabalho teve como objetivo determinar a presença de carbapenemases do tipo OXA (e sua diversidade), de ISAba1 e de sua relação com as carbapenemases em isolados clínicos e de esgoto hospitalar de Acinetobacter sp. na cidade de Porto Alegre, Rio Grande do Sul. Um total de 310 isolados (145 clínicos e 165 ambientais) foram submetidos a análise por PCR das regiões genéticas de interesse. A diversidade dos genes do tipo blaOXA-51 foi realizada por DGGE. Os resultados indicam a presença do gene blaOXA-58 em um isolado, pela primeira vez no Brasil. A sequência ISAba1 foi frequentemente encontrada (92,9%), porém, a sua associação com blaOXA-51 foi baixa e encontrada em 9,8% dos isolados clínicos e em 6,5% dos isolados ambientais. A análise de diversidade revelou uma baixa freqüência de alelos de OXA-51 entre os isolados estudados, sendo blaOXA-65 a variante mais encontrada. Contudo, podemos afirmar que o esgoto hospitalar analisado constitui-se de uma fonte de contaminação de bactérias patogênicas e que as precárias políticas de saneamento podem proporcionar a disseminação de multirresistência para o meio ambiente. / The ability of easily acquiring resistance to antimicrobial therapy becomes one of the most studied features in Acinetobacter sp., world renowned for being related to outbreaks of infection associated with health care and for being appointed as a serious public health problem. Although clinical isolates of this genus are extensively studied for the presence and diversity of OXAcarbapenemase genes, there are few studies about this relationship in environmental isolates. This study aimed to determine the presence of OXAtype carbapenemases (and yours diversity), of ISAba1 and its relationship with carbapenemases in clinical and hospital sewage isolates of Acinetobacter sp. in Porto Alegre, Rio Grande do Sul. A total of 310 strains (145 of clinical origin and 165 of environmental origin) were subjected to PCR analysis of genetic regions of interest. The diversity of blaOXA-51-like genes was performed by DGGE. The results indicate the presence of the gene blaOXA-58 in an isolated, for the first time in Brazil. ISAba1 was frequently found (92.9%) but its association with blaOXA-51-like was low and was found in 9.8% of clinical isolates and in 6.5% of environmental isolates. The diversity analysis showed that there is a low frequency of alleles of OXA-51 among the studied isolates being blaOXA-65 variant the most often found. However, we can state that the hospital sewage is considered to be a source of pathogenic bacteria contamination and that the poor sanitation politics contributes to the spread of multidrug resistance in the environment.

OLIVEIRA, N. S. Streptococcus pneumoniae: sensibilidade a antimicrobianos e detecção de genes de resistência em isolados de crianças com pneumonia adquirida na comunidade em Fortaleza, Ceará. 2013. 83 f. Dissertação (Mestrado em Microbiologia Médica) - Faculdade de Medicina, Universidade Federal do Ceará, Fortaleza, 2013. / Submitted by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2016-06-23T12:51:16Z No. of bitstreams: 1 2013_dis_nsoliveira.pdf: 1681873 bytes, checksum: c62b8c7f03d7d8081b4975a923cd4dae (MD5) / Approved for entry into archive by Erika Fernandes (erikaleitefernandes@gmail.com) on 2016-06-23T12:51:26Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2013_dis_nsoliveira.pdf: 1681873 bytes, checksum: c62b8c7f03d7d8081b4975a923cd4dae (MD5) / Made available in DSpace on 2016-06-23T12:51:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2013_dis_nsoliveira.pdf: 1681873 bytes, checksum: c62b8c7f03d7d8081b4975a923cd4dae (MD5) Previous issue date: 2013-12-10 / Acute respiratory infection (ARI) is a clinical syndrome, in which about 80% of deaths attributed to pneumonia, a serious disease that affects the lower respiratory tract. The common etiologic agent in community-acquired pneumonia (CAP) is Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae). Pneumococcal diseases begin with colonization of S. pneumoniae in the nasopharynx and may progress to invasive disease. In recent decades, the increasing number of strains of S. pneumoniae resistant to β-lactam antibiotics and macrolides has hindered the treatment of pneumococcal infections. The objectives of this study were to determine the prevalence of carriers of S. pneumoniae in children with CAP, the sensitivity profile to antibiotics and serotype distribution in Fortaleza, Brazil. The strains of S. pneumoniae were isolated from nasopharyngeal aspirates of children with CAP treated at Children's Hospital Albert Sabin (HIAS). For the determination of minimum inhibitory concentration (MIC) was used the E-test method for the following antibiotics: penicillin, ceftriaxone, sulfamethoxazole / trimethoprim, amoxicillin, clindamycin and erythromycin. Genotyping of strains of S. pneumoniae was performed by multiplex PCR technique. 527 samples of children with CAP were isolated S. pneumoniae in 30.17%. 126 isolates from patients found a resistance rate of 25.8% for penicillin, 81.2% to sulfamethoxazole / trimethoprim, from 21.4% to erythromycin, 19% to clindamycin and 0.8% for ceftriaxone and amoxicillin. Of the 102 genotyped strains, the most commonly found serotypes were 6A / 6B, followed by 14, 19A and 19F. They selected 29 strains resistant to penicillin for detection of protein modifications penicillin binding (PBP). Found change in PBP 1a in 69%, while for the PBP 2b and PBP 2x all tested strains showed change. As for clindamycin and erythromycin were selected 24 strains for the detection of gene ermB. Of the 24 strains tested, 79.2% had ermB gene. This study generated data on the prevalence of children with CAP S. pneumoniae revealed phenotypic and genotypic data on the resistance of the isolated front to antimicrobials used in clinical and distribution of serotypes of pneumococcus in children with CAP treated at HIAS. / A infecção respiratória aguda (IRA) é uma síndrome clínica, em que cerca de 80% das mortes são atribuídas à pneumonia, uma doença grave que atinge o trato respiratório inferior. O agente etiológico comumente isolado na pneumonia adquirida na comunidade (PAC) é o Streptococcus pneumoniae (S. pneumoniae). As doenças pneumocócicas começam com a colonização do S. pneumoniae na nasofaringe, podendo progredir para doença invasiva. Nas últimas décadas, o aumento do número de cepas de S. pneumoniae resistentes a antibióticos β-lactâmicos e a macrolídeos tem dificultado o tratamento das infecções pneumocócicas. Os objetivos desse estudo foram determinar à prevalência de portadores de S. pneumoniae em crianças com PAC, o perfil de sensibilidade a antimicrobianos e distribuição dos sorotipos, em Fortaleza, Brasil. As cepas de S. pneumoniae foram isoladas de aspirados de nasofaringe de crianças com PAC atendidas no Hospital Infantil Albert Sabin (HIAS). Para a determinação das Concentrações Inibitórias Mínimas (CIM) foi utilizado o método de E-test para os seguintes antimicrobianos: penicilina, ceftriaxona, sulfametoxazol/trimetoprim, amoxicilina, clindamicina e eritromicina. A genotipagem das cepas de S. pneumoniae foi realizada pela técnica de multiplex PCR. De 527 amostras de crianças com PAC, foram isolados S. pneumoniae em 30,17%. De 126 isolados de portadores foi encontrada uma taxa resistência de 25,8% para penicilina, de 81,2% para sulfametoxazol/trimetoprim, de 21,4% para eritromicina, de 19% para clindamicina e de 0,8% para ceftriaxona e amoxicilina. Das 102 cepas genotipadas, os sorotipos mais comumente encontrados foram 6A/6B, seguido do 14, 19A e 19F. Foram selecionadas 29 cepas resistentes à penicilina para detecção das alterações proteínas de ligação a penicilina (PBP). Foi encontrada alteração na PBP 1a em 69%, já para as PBP 2b e PBP 2x todas as cepas testadas apresentaram alteração. Já para clindamicina e eritromicina, foram selecionados 24 cepas para detecção do gene ermB. Das 24 cepas testadas, 79,2% possuíam o gene ermB. O presente trabalho gerou dados sobre a prevalência de crianças portadoras com PAC de S. pneumoniae, revelou dados fenotípicos e genotípicos acerca da resistência dos isolados frente aos antimicrobianos utilizados na clínica e a distribuição dos sorotipos do pneumococo de crianças com PAC atendidas no HIAS.

Submitted by Nathália Faria da Silva (nathaliafsilva.ufv@gmail.com) on 2017-07-05T14:05:09Z No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 148274 bytes, checksum: 7adc5a6b35939acf27313f34dfadc26d (MD5) / Made available in DSpace on 2017-07-05T14:05:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 texto completo.pdf: 148274 bytes, checksum: 7adc5a6b35939acf27313f34dfadc26d (MD5) Previous issue date: 2001-10-16 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / O experimento foi realizado no Departamento de Zootecnia da Universidade Federal de Viçosa, objetivando avaliar o efeito da amonização de fenos de capim-tifton 85, na dieta de bovinos, sobre o consumo; as digestibilidades aparentes totais e parciais de matéria seca (MS), matéria orgânica (MO), proteína bruta (PB), extrato etéreo (EE), carboidratos totais (CHO) e fibra em detergente neutro (FDN); a degradabilidade da FDN; a eficiência de síntese microbiana; o balanço de compostos nitrogenados; o pH ruminal; as concentrações de amônia; e as taxas de passagem da digesta ruminal. Foram utilizados quatro novilhos, fistulados no rúmen e abomaso, com peso variando de 286 a 463 kg, distribuídos em um quadrado latino 4 x 4. Cada período experimental teve duração de 21 dias, sendo 10 dias de adaptação, seis dias para coleta de amostras de fezes e digesta de abomaso, um dia para coleta de urina, dois dias para coleta de digesta de rúmen para determinação da taxa de passagem, um dia para coleta de líquido ruminal para determinação do pH e das concentrações de N-NH 3 e um dia para coleta de digesta ruminal para isolamento viiide bactérias. Os tratamentos (T) consistiram de: T1 – controle: feno com adição de 1% de uréia com base na matéria natural, a uréia foi diluída em um litro de água e aplicada no momento da oferta; T2 – feno amonizado com 5% de uréia; T3 – feno de amonizado com 6% de uréia; e T4 – feno amonizado com 3% de amônia anidra. A uréia e amônia nos T2, T3 e T4 foram aplicadas com base na matéria seca. Observaram-se maiores consumos de matéria seca (MS), matéria orgânica (MO), proteína bruta (PB), carboidratos totais (CHO), fibra em detergente neutro (FDN) e nutrientes digestíveis totais (NDT) para os fenos amonizados, que, por sua vez, não diferiram entre si. Por outro lado, registraram- se menores digestibilidades aparentes totais de MS, MO, PB, CHO e FDN para o feno com 1% de uréia, no momento da alimentação. Para a digestibilidade aparente ruminal dos nutrientes, apenas a PB foi influenciada pelos tratamentos, registrando-se o menor valor para o feno não-amonizado. O balanço de nitrogênio foi maior nos fenos amonizados, que, por sua vez, não diferiram entre si. A produção de biomassa microbiana e as quantidades de carboidratos degradados no rúmen foram maiores para os animais alimentados com feno amonizado, porém, a eficiência de síntese microbiana, expressa em diferentes formas, não foi influenciada pelos tratamentos. O pH ruminal e a taxa de passagem da digesta também não foram influenciados pelos tratamentos, apresentando valor máximo de pH, de 6,78, 3,1 horas após alimentação, e valor médio da taxa de passagem de 3,0%/h. Para as concentrações de amônia ruminal, houve efeito dos tratamentos e da interação entre tratamento e tempo de coleta, em que as concentrações máximas de N-NH 3 estimadas foram de 8,44 (controle); 18,33 (5% uréia); 22,42 (6% uréia) e 13,57 mg/100 mL (3% amônia anidra), respectivamente, às 3,62; 4,53; 4,32; e 3,96 horas após a alimentação. / The experiment was carried out at the Animal Science Department of Federal University of Viçosa, to evaluate the effect of diets with ammoniated Tifton 85 grass hay, fed to steers, on the intake; total and partial apparent digestibility dry matter, organic matter (OM), crude protein (CP), ether extract (EE), total carbohydrates (CHO) and neutral detergent fiber (NDF); NDF degradability; microbial synthesis efficiency; nitrogen compounds balance; ruminal pH; ammonia concentrations; and passage rates of ruminal digesta. Four steers fistulated in the rumen and abomasum, with weight from 286 to 463 kg, were assigned to a 4 x 4 Latin square. Each experimental period lasted 21 days, 10 days of adaptation, six days for samples collection of feces and abomasum digesta, one day for urine collection, two days for rumen collection to determine the passage rate, one day for ruminal fluid to determine pH and N-NH 3 concentrations and one day for ruminal digesta collection to bacteria isolation. The treatments (T) consisted of: T1 – control: hay plus 1% urea, on as fed basis, the urea was diluted in one liter of water and fed in the moment of offer; xT2 – ammoniated hay with 5% urea; T3 – ammoniated hay with 6% urea; and T4 – ammoniated hay with 3% anhydrous ammonia. Urea and ammonia in T2, T3 and T4 were used according to dry matter basis. Higher intakes of dry matter (DM), organic matter (OM), crude protein (CP), total carbohydrates (CHO), neutral detergent fiber (NDF) and total digestible nutrients (TDN) were observed for the ammoniated hays, that did not differ. However, smaller total apparent digestibility of DM, OM, CP, CHO and NDF were recorded for the hay with 1% urea, during feeding. For the ruminal apparent digestibility of nutrients, only CP content was affected by the treatments, where the smaller value was recorded for the non ammoniated hay. The nitrogen balance was higher for the ammoniated hays, that did not differ. The microbial biomass production and the ruminal degraded carbohydrates amounts were higher for the animals fed ammoniated hay, however the microbial synthesis efficiency, express on different ways, was not influenced by treatments. The ruminal pH and the digesta passage rate also were not affected by the treatments, with maximum pH value, of 6.78, 3.1 hours after feeding, and average passage rate of 3.0%/h. There was effect of treatments and of interaction among treatment and collection time on the ruminal ammonia concentrations, where the maximum estimated N-NH 3 concentrations were 8.44 (control), 18.33 (5% urea), 22.42 (6% urea) and 13.57 mg/100 mL (3% anhydrous ammonia), respectively, at 3.62, 4.53, 4.32, and 3.96 hours after feeding.