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The effects of Brazil’s family health strategy on educational outcomes

Costa, Gabriel Weber 27 April 2018 (has links)
Submitted by Gabriel Weber Costa (gabrielwebercosta@outlook.com) on 2018-05-29T14:34:58Z No. of bitstreams: 1 Dissertação_Gabriel_FHS_educational_outcomes.pdf: 630168 bytes, checksum: 8120962064fbefa887281c93de4abc1d (MD5) / Approved for entry into archive by Pamela Beltran Tonsa (pamela.tonsa@fgv.br) on 2018-05-29T14:38:18Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação_Gabriel_FHS_educational_outcomes.pdf: 630168 bytes, checksum: 8120962064fbefa887281c93de4abc1d (MD5) / Approved for entry into archive by Suzane Guimarães (suzane.guimaraes@fgv.br) on 2018-05-29T15:29:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Dissertação_Gabriel_FHS_educational_outcomes.pdf: 630168 bytes, checksum: 8120962064fbefa887281c93de4abc1d (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-29T15:29:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Dissertação_Gabriel_FHS_educational_outcomes.pdf: 630168 bytes, checksum: 8120962064fbefa887281c93de4abc1d (MD5) Previous issue date: 2018-04-27 / We aim to evaluate the effects of Brazil’s Family Health Strategy (FHS), a large-scale community-based health intervention, on educational outcomes during primary and secondary education.We use student-level data and adopt a differences-in-differences approach that explores timing of program implementation across municipalities and students’ year and location of birth to estimate FHS effects on enrollment flow, school delay, and Mathematics and Portuguese performance. Results suggest that FHS implementation is associated with an increased probability that students stay in school after age 7 and a decreased probability that students are delayed by two or more grades, although the latter seems to fade after age 12. Estimates for student performance indicate that the program decreases test scores, although these estimates could be affected by compositional changes in treatment and control groups. We also find evidence that program effects are stronger when time of exposition is increased, which is consistent with the FHS continuous expansion over time and with previous research. / Este trabalho tem como objetivo avaliar os efeitos da Estratégia Saúde da Família (FHS), uma intervenção de saúde de larga escala implementada ao nível comunitário no Brasil, sobre resultados educacionais durante a educação básica. Utilizando dados de alunos, é adotada uma estratégia de diferenças em diferenças que explora variações no tempo de implementação da FHS nos municípios brasileiros e informações sobre ano e localidade de nascimento de cada aluno para se estimar os efeitos do programa sobre fluxo escolar, atraso escolar e desempenho em matemática e língua portuguesa. Os resultados sugerem que a implementação da FHS está associada com uma maior probabilidade de que os alunos permaneçam na escola após os 7 anos de idade e uma menor probabilidade de que os alunos estejam atrasados por duas ou mais séries, apesar de esse último parecer se dissipar após os 12 anos de idade. Estimativas para desempenho dos alunos indicam que a FHS diminui as notas durante o quinto ano, entretanto esses resultados podem ser afetados por mudanças na composição nos grupos de tratamento e controle. Também são encontradas evidências de que os efeitos do programa são maiores quando o tempo de exposição é maior, o que é consistente com a expansão da FHS ao longo do tempo e com resultados de pesquisas anteriores.
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Caracterização da implantação das equipes de saúde da família no Estado de São Paulo: limites e possibilidades / Characterization of the implantation of the family health team in the São Paulo State: limits and possibilities.

Rosicler Aparecida Viegas di Lorenzo 19 September 2006 (has links)
Este estudo tem como objetivo caracterizar o processo de implantação das equipes de saúde da família (ESF) no Estado de São Paulo (ESP) no período de 1996 a 2001. Foram utilizados dados secundários referentes ao Estado, produzidos por uma pesquisa nacional realizada pelo Ministério da Saúde em 2001 e 2002. Esta pesquisa foi ampliada com questões específicas desenvolvidas pela Coordenação Estadual do Programa Saúde da Familia (PSF). Estes dados referem-se às 1058 ESF implantadas em 54% dos municípios do Estado, e foram estruturados abrangendo os seguintes aspectos: 1. caracterização das ESF; 2. infraestrutura (área física, equipamentos disponíveis e recursos humanos); 3. ações desenvolvidas pelas ESF; 4. instrumentos de planejamento e organização do atendimento do trabalho das ESF; 5. capacitações das ESF. As variáveis utilizadas no plano de análise foram o tempo de implantação das equipes e o porte dos municípios. Também foi desenvolvida uma classificação de adequação das caracteristicas estudadas que objetivou verificar maior ou menor aproximação com a situação ideal preconizada pelas diretrizes do PSF. Os resultados do presente estudo fornecem elementos que podem contribuir para implantação de novas ESF e servir como linha de base para estudos futuros. / The objective of this study is to evaluate the implantation of family health teams (FHTs) in the State of São Paulo (SSP), Brazil, during the period 1996-2001. Secondary data from the SSP obtained through a national survey carried out by the Ministry of Health in 2001-2202 were utilized. This survey was expanded by the State Coordination of the Family Health Program (PSF) to include specific questions. These data refer to 1058 FHTs implemented in 54% of the municipalities of the SSS, and were structured to encompass the following aspects: 1. characterization of the FHTs; 2. infrastructure (physical area, available equipment and human resources); 3. actions developed by the FHTs; 4. planning instruments and organization of the work of the FHTs; 5. FHTs training. The variables used for the analysis included time of implementation of the FHTs and size of the municipalities. An adequateness scoring classification for the studied characteristics was developed in order to assess greater or smaller approximation to the ideal situation envisioned by the Family Heath Program (PSF) of guidelines. The results of this study provide elements that may contribute to the implementation of new FHTs and serve as baseline data for future studies.
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Saúde mental em atenção primária no Estado de São Paulo / Mental health and primary care in the State of São Paulo

Eleonora Haddad Antunes 28 August 1998 (has links)
Esta dissertação parte do pressuposto que a Saúde Mental, a Atenção Primária e a articulação entre essas, são proposições originárias de outros contextos históricos e realidades sociais, havendo portanto uma retradução nos seus processos de assimilação no Brasil e no Estado de São Paulo. A partir disso, a investigação segue em dois eixos: a construção do campo da Saúde Mental e suas articulações com a Saúde de forma geral e à Atenção Primária; o seguimento da articulação da Saúde Mental à Atenção Primária no Estado de São Paulo. O estudo conclui que a Saúde Mental emerge numa condição histórica de favorecimento de políticas públicas de reinclusão social, numa possibilidade de extensão assistencial populacional. Desse modo, integra proposições higiênicas e terapêuticas, mantendo-se como higiene social normativa. A investigação conclui também que a integração das ações médicas às ações preventivas, consideradas dentro de níveis de prevenção, faz com que a Saúde Mental possa se articular à Atenção Primária e aos serviços de Saúde Pública. No Estado de São Paulo, a emergência da Saúde Mental em Atenção Primária, de forma abrangente, realiza-se no contexto de redemocratização política, em 1982, sendo resultado da convergência da implementação das Ações Integradas de Saúde, do movimento de descentralização do Estado brasileiro e da tomada da proposta de Atenção Primária como lema democrático. Esta implementação realiza-se de forma peculiar no Estado de São Paulo, com a alocação de equipes multiprofissionais de Saúde Mental nas redes de cuidados primários à saúde, caracterizando uma experiência de reforma psiquiátrica. / This dissertation starts from the presupposition that Mental Health, Primary Care and their articulations are propositions originated specific historical contexts and social conditions, implying necessarily in a translation when their assimilation occurs in Brazil and the state of São Paulo. The investigation developed along two lines: the building of the Mental Health field and its links with health and Primary Care in general and the articulation of Mental Health and Primary Care in the state of São Paulo. The study concludes that Mental Health emerges in historical conditions which favor public policies of social inclusion, through the extension of care, In this way it integrates hygiene and therapeutic propositions, and continues to exert a normative social hygiene. The integration of preventive and medical practices, taken as part of specific levels of prevention, makes possible the articulation of Mental Health to Primary Care and public health services. In the state of São Paulo, Mental Health in Primary Care emerges in the context of political redemocratization in 1982, as part of the implementation of specific forms of financing health care (\"Ações Integradas de Saúde - AIS\"), the decentralization of the governmental programs and the importance of Primary Care as a political banner. This implementation occurs in specific conditions in the state of São Paulo, with the inclusion of multiprofessional mental health teams in public primary health care services, as an experience of psychiatric reform.
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Atenção de enfermagem ao usuário de álcool e outras drogas no contexto dos serviços de saúde extra-hospitalares: um estudo exploratório de campo

Gonçalves, Sonia Silva Paiva Mota January 2006 (has links)
Submitted by Fabiana Gonçalves Pinto (benf@ndc.uff.br) on 2016-02-01T18:45:32Z No. of bitstreams: 1 Sonia Silva Paiva Mota Gonçalves.pdf: 1987630 bytes, checksum: ad9c466ce0c330565126dc79b3e0218a (MD5) / Made available in DSpace on 2016-02-01T18:45:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Sonia Silva Paiva Mota Gonçalves.pdf: 1987630 bytes, checksum: ad9c466ce0c330565126dc79b3e0218a (MD5) Previous issue date: 2006 / Conselho Regional de Enfermagem - Rio de Janeiro - COREN-RJ / Mestrado Profissional em Enfermagem Assistencial / O uso abusivo do álcool e outras drogas são destacados pelo Ministério da Saúde como um dos principais problemas de saúde pública. Na rede extra-hospitalar de saúde há pouco esclarecimento dos profissionais quanto às atribuições junto aos usuários de álcool e outras drogas. Tal fato se complica em virtude dos próprios usuários preferirem recorrer à internação como forma de resolução dos agravos decorrentes do uso abusivo de álcool e outras drogas. Por não se sentir capaz de estabelecer trocas sociais e afetivas fora do ambiente hospitalar, o usuário de drogas, principalmente o alcolista, elege a hospitalização como um momento de pausa, controle e possibilidade de cura do sofrimento. Neste sentido, a atuação do enfermeiro junto a usuários de álcool e outras drogas deve levar em consideração uma complexa rede de interações e instituições para a garantia da integralidade da assistência. Este estudo tem como objetivos: conhecer as demandas do usuário de álcool e outras drogas na rede de saúde extra-hospitalar; descrever quais são as atividades desenvolvidas pelo enfermeiro no atendimento ao usuário de álcool e outras drogas e analisar a relação entre o enfermeiro e o SUS na busca da integralidade da assistência. Na equipe de saúde, os enfermeiros são os profissionais que mantêm maior contato com os usuários, com grande potencial para reconhecer os problemas relacionados ao uso de álcool e drogas e desenvolver ações assistenciais. O presente estudo constitui uma pesquisa qualitativa de abordagem descritiva de campo, tendo como cenário a Região Centro-Sul Fluminense. Os sujeitos são trinta enfermeiros da rede extra-hospitalar, compreendendo coordenações de Programas do Ministério da Saúde, unidades de PSF, CAPS I, CAPS AD e Comunidade Terapêutica. Os dados foram coletados por meio da realização de entrevista semi-estruturada e analisados de acordo com a análise temática de conteúdo. O projeto foi aprovado pelo Comitê de Ética em Pesquisa do CCM/UFF, em 2004. Como resultados observaram-se que a demanda por atendimento do usuário de álcool e outras drogas ocorre de forma espontânea direta ou indireta, por busca ativa e que alguns enfermeiros não identificam esta demanda em sua unidade ou não sabem informar como ocorre a demanda. Foram identificadas ações de enfermagem no âmbito da prevenção, tratamento e reabilitação. Entre as dificuldades apontadas estão a não aceitação pelo usuário ao tratamento, falta de capacitação para o atendimento, dificuldade de acesso, tempo não disponível em virtude do acúmulo de atividades. Os dados analisados apontam para necessidade de o enfermeiro redirecionar a sua prática junto a esta clientela, buscando formas inovadoras e criativas que assegurem maior resolutividade de suas ações. Conclui-se que a própria rede de serviços, e não apenas o enfermeiro, não responde as necessidades de saúde do usuário de álcool e outras drogas na perspectiva da integralidade da assistência. Contudo, alguns avanços já foram obtidos pelos enfermeiros, como por exemplo, a construção de vínculo com a comunidade local e a percepção de suas próprias fragilidades e necessidades de capacitação / The abusive use of alcohol and other drugs is detached by the Ministry of Health as one of the main problems of public health. In the net of health extra-hospital the professionals receive little explanation about their attributions close to the users of alcohol and other drugs. Such fact gets complicated because of the own users prefer to appeal the internment as form of resolution of consequent problems of the abusive use of alcohol and other drugs. For not feeling capable to establish social and affective changes out of the hospital environment, the user of drugs, mainly of alcohol, chooses hospitalization as a moment of pause, control and possibility of cure of the suffering. In this sense, the nurse's performance close to users of alcohol and other drugs should take into account a complex net of interactions and institutions for the warranty of the completeness of the assistance. This study has as objectives: to know the demands of the user of drugs in the net of health extra-hospital; to describe which are the activities developed by the nurse in the in the service to the user of alcohol and other drugs, and to analyze the relationship between the nurse and the SUS in the search of the completeness of the assistance. In the health team, the nurses are the professionals whom maintain larger contact with the users, with great potential for to recognize the problems related to the use of alcohol and drugs, and to develop assistance actions. The present study constitutes a qualitative research of descriptive approach of field, having as scenery the Area Fluminense South Center. The subjects are thirty nurses of the net extra-hospital, including coordination of Programs of the Ministry of Health, units of PSF, CAPS I, AD CAPS and Therapeutic Community. The data were collected through the accomplishment of semi-structured interview and analyzed in agreement with the analysis content theme. The project was approved by the Committee of Ethics in Research of CCM/UFF, 2004. As results were observed that the demand for attendance of the users of alcohol and other drugs occurs of direct or indirect spontaneous form, for active search. Some nurses do not identify this demand in their unit or do not know to inform how the demand occurs. Nursing actions in the scope of the prevention, treatment and rehabilitation were identified. Amongst the pointed difficulties are the non acceptance for the user to the treatment, lack of qualification for the attendance, access difficulty, not available time in virtue of the accumulation of activities. The analyzed appear for nurse's need to redirect their practice close to this clientele, looking for innovative and creative forms that assure larger effectiveness of their actions. In conclusion, the own services net, and not only the nurse, does not answer the health needs of the users of alcohol and other drugs in the perspective of the completeness of the assistance. However, some progresses were already obtained by the nurses, as for example, the construction of bond with the local community and the perception of their own fragilities and qualification needs
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Estudo das condições de hidrólise de álcoois primários sulfatados. / A study on the susceptibility to acid-catalysed hydrolysis of primary alcohol ether sulfates in concentrated aqueous mixtures.

Oliveira, Maria Rita Perez de 04 April 2011 (has links)
Álcoois primários sulfatados de cadeia longa, usualmente na forma de sais de sódio, são tensoativos de grande interesse comercial utilizados em diversas formulações de higiene pessoal e limpeza doméstica. Eles são produzidos comercialmente através da reação de álcoois etoxilados com trióxido de enxofre seguida de imediata neutralização com hidróxido de sódio. O produto formado é uma solução neutra de álcool primário etoxilado sulfatado em água. Sabe-se que a armazenagem desse produto por longos períodos de tempo em temperaturas elevadas pode levar à hidrólise completa, mas, em condições normais de uso e temperatura ambiente é esperado que o produto seja resistente à hidrólise. No entanto observou-se que algumas amostras comerciais de lauril éter sulfato de sódio que foram estocadas por diferentes períodos de tempo em frascos fechados à temperatura ambiente sofreram hidrólise em intervalos de tempo relativamente curtos. Isso leva à hipótese de que o comportamento de hidrólise seria influenciado por outras variáveis além da temperatura e do tempo de estocagem. O presente trabalho consistiu em identificar as variáveis de maior impacto na reação de hidrólise por meio de experimentos planejados. O teor de ativos foi acompanhado ao longo da reação para avaliar o efeito da presença de eletrólitos, de material insulfatado, em diferentes temperaturas, variando-se o pH inicial por meio da adição de ácido clorídrico. O comportamento da reação de hidrólise observado foi compatível com aquele descrito na literatura para o dodecil sulfato de sódio. A hidrólise apresentou-se como sendo autocatalítica, com a aceleração da taxa de reação provavelmente causada pela presença de íons hidrogênio liberados na reação. Foi possível identificar que as variáveis de maior efeito na reação foram: pH inicial, o teor de cloreto de sódio e a temperatura. O modelo de troca iônica em pseudo-fase foi utilizado para o tratamento dos resultados experimentais e mostrou-se adequado tendo sido, portanto, utilizado para prever o comportamento de estabilidade do produto à temperatura ambiente e nas condições em que o produto é normalmente comercializado. Um modelo empírico de redes neurais foi desenvolvido com sucesso para prever o comportamento do pH ao longo do tempo para as condições estudadas. / Long-chain primary alkyl sulfuric acids, usually as their sodium salts, are important commercial surfactants used in a large number of household and personal care formulations. They are commercially produced by treatment of mixtures of ethoxylated fatty alcohols with sulfur trioxide followed by immediate neutralization with sodium hydroxide, a neutral aqueous mixture of sodium primary alkyl ether sulfate is obtained. It is known that prolonged storage of the material at elevated temperature can lead to complete hydrolysis but under normal use and typical environmental conditions the product is expected to be resistant to hydrolysis. In spite of that it has been observed that some commercial samples of sodium lauryl ether sulfate stored for different periods of time in sealed containers at room temperature have undergone hydrolysis in a relatively short period of time which leads to the hypothesis that the hydrolysis behavior would be strongly influenced by variables other than temperature and storage time. The present work consisted of identifying the process variables with the most significant effect on the acid hydrolysis by using experimental design. The rate of hydrolysis has been followed acidimetrically to evaluate the effect of electrolytes as well as the concentration of unsulfated matter at different temperatures, over a wide initial pH range, under the presence of added hydrochloric acid. The pattern of kinetic behaviour observed was broadly the same as previously described for the sodium dodecyl sulfate. The hydrolysis presented the characteristic autocatalytic form, the catalysis presumably arising from the production of hydrogen sulfate ions. It was possible to observe that the most significant effects on the rate of hydrolysis were the initial pH, the total amount of sodium chloride and the temperature. The results were also discussed in terms of the ion-exchange pseudophase model of the micelle reaction. Accordingly to the fitting of parameters that was carried out it is possible to conclude that the pseudo-phase ion-exchange theory is found to account satisfactorily for the results reported and it was used to predict the stability behavior of the product at room temperature and under normal commercial conditions. A neural network based model was also successfully developed in order to predict the pH behavior in the conditions studied.
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Violência de Gênero, Necessidades de Saúde e Uso de Serviços em Atenção Primária. / Gender violence, Healthcare needs and the use of healthcare services

D'Oliveira, Ana Flávia Pires Lucas 21 August 2000 (has links)
Estudou-se a forma usual como a violência vem se apresentando e é ou não trabalhada no interior dos serviços de saúde de atenção primária. A partir da interação que se estabelece entre as usuárias e profissionais desses serviços busca-se as condições que propiciam ou obstaculizam a emergência, o acolhimento e a proposta de intervenção sobre a questão no interior de um serviço de saúde. Foi estudado um serviço específico que tinha como característica ter o PAISM implantado através de observação direta de atividades assistenciais, análise do registro em prontuário e do perfil de consumo do serviço e entrevistas com usuárias e profissionais. Encontrou-se a emergência de conflitos em torno das relações de gênero e violência de gênero no registro tanto em prontuários como na observação direta. Observou-se que as possibilidades de emergência destes conflitos estão ligadas aos canais de comunicação abertos e à possibilidade de antever alguma resposta para o exercício profissional. Discute-se os riscos trazidos pela possível medicalização e psiquiatrização da violência e a importância de um trabalho intersetorial e multidisciplinar para apreender e trabalhar o problema. / The purpose of this paper is to identify the usual ways in which violence has been manifesting itself and how health services deal with it –- or fail to do so. It tries to understand the relation that is established between female users and the professionals who work at these healthcare services with regard to the problem of violence against women as a form of demand capable of generating the production of healthcare. This comprehension has made it possible to understand the conditions that either enable or stand it the way of the manifestation, the provision of care and the intervention proposal relative to the issue within healthcare services. The risks that result from the possible medicalization of violence are also discussed, as well as the importance of interdisciplinary and intersectorial work in both understanding and dealing with the problem.
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"Consumo de serviço de saúde numa população adscrita ao Programa Saúde da Família na região noroeste do município de São Paulo" / Consume of health supplies in a population attended by the family Health Program in a district of the city of São Paulo

Estorilio, Elisabete Amodio 30 August 2004 (has links)
O PSF emerge para reordenar o modelo de atenção à saúde. Os objetivos deste trabalho são o de estimar o consumo dos serviços de saúde e identificar a capacidade de oferta de serviços da USF. Foram realizadas entrevistas sobre o consumo de serviços de saúde por amostragem na população adscrita a equipe 01 da USF Jd Pirituba no Município de São Paulo. A procura por serviço de saúde nos 15 dias que precederam a entrevista foi de 22%. O local mais procurado foi o Centro de saúde. O principal motivo de procura foi a consulta clínica (51%). A descrição e análise do consumo efetivo da população adscrita às equipes de PSF pode servir como um importante instrumento para o planejamento das ações da USF / Brazil still has a National Health System unable to meet the needs of the population. Since the year 2001 the city of São Paulo established the Family Health Care Program as a structural strategy for the municipal health system. The hypothesis of this research is that the Family Health Care Program, as the other models of health care, offers services without matching the people utilization of health supplies. To stimate the utilization of health care supplies of a population visited by the Family Program (1360 families) and to identify the care services provided by a Family Health Care team are the objetives of this survey. A community inquiry were carried out among a sample from the population assisted by a family health care team in the Distritct of Pirituba located in the north-west of the city of São Paulo. The supervisor and the general phisicyan were also interviewed in order to estimate the services provided by the health team. The results showed an adult population, low level of literacy and low income. Thirthy-one percent was the population having a supplementary private health insurances. Twenty-two percent of the population seek the care of a professional within 15 days before the interview. The primary care services has the skill to be a portal of entry to the health System. People suffering from hypertension, heart disease and depression use more health services than healthy population. Searching for a physician appointment was 51% of the reasons to go to a health service, showing a poor interdiciplinary teamwork culture. Self-medication was very high for those medicine causing important side-effects. Referring patients to a specialist, having access to high-technology procedures and finding a place at hospitals were the main dificultties found by the family health care team. The health care coverage of the family health care team do not consider the utilization of health services by tha area served by them keeping the old fashion way of planning health services. The services they provide are not enough to meet the needs of the population they visit. The metodology of measuring the needs of the population to be attended is one of the ways to organize and plan a better population-based halth care system.
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O transcritoma antisense primário de Halobacterium salinarum NRC-1 / The antisense primary transcriptome of Halobacterium salinarum NRC-1

João Paulo Pereira de Almeida 04 September 2018 (has links)
Em procariotos, RNAs antisense (asRNAs) constituem a classe de RNAs não codificantes (ncRNAs) mais numerosa detectada por métodos de avaliação de transcritoma em larga escala. Apesar da grande abundância, pouco se sabe sobre mecanismos regulatórios e aspectos da conservação evolutiva dessas moléculas, principalmente em arquéias, onde o mecanismo de degradação de RNAs dupla fita (dsRNAs) é um fenômeno pouco conhecido. No presente estudo, utilizando dados de dRNA-seq, identificamos 1626 inícios de transcrição primários antisense (aTSSs) no genoma de Halobacterium salinarum NRC-1, importante organismo modelo para estudos de regulação gênica no domínio Archaea. Integrando dados de expressão gênica obtidos a partir de 18 bibliotecas de RNA-seq paired-end, anotamos 846 asRNAs a partir dos aTSSs mapeados. Encontramos asRNAs em ~21% dos genes anotados, alguns desses relacionados a importantes características desse organismo como: codificadores de proteínas que constituem vesículas de gás e da proteína bacteriorodopsina, além de vários genes relacionados a maquinaria de tradução e transposases. Além desses, encontramos asRNAs em genes pertencentes a sistemas de toxinas-antitoxinas do tipo II e utilizando dados públicos de dRNA-seq, evidenciamos que esse é um fenômeno que ocorre em bactérias e arquéias. A interação de um ncRNA com seu RNA alvo pode ser dependente de proteínas, em arquéias, a proteína LSm é uma chaperona de RNA homóloga a Hfq de bactérias, implicada no controle pós-transcricional. Utilizamos dados de RIP-seq de RNAs imunoprecipitados com LSm e identificamos 91 asRNAs interagindo com essa proteína, para 81 desses, o mRNA do gene sense também foi encontrado interagindo. Buscando por aTSSs presentes nas mesmas regiões de genes ortólogos, identificamos 160 aTSSs que dão origem a asRNAs em H. salinarum possivelmente conservados em Haloferax volcanii. A expressão dos asRNAs anotados foi avaliada ao longo de uma curva de crescimento e em uma linhagem knockout de um gene que codifica uma RNase R, possível degradadora de dsRNAs em arquéias. Encontramos um total de 144 asRNAs diferencialmente expressos ao longo da curva de crescimento, para 56 desses o gene sense também está diferencialmente expresso, caracterizando possíveis mecanismos de regulação em cis por esses RNAs. Na linhagem knockout, encontramos cinco asRNAs diferencialmente expressos e apenas para um desses o gene sense também está diferencialmente expresso, resultado que não nos permitiu inferir um possível papel de degradação de dsRNAs da RNAse R em H. salinarum NRC-1. Nesse trabalho apresentamos um mapeamento completo do transcritoma antisense primário de H. salinarum NRC-1 com resultados que consistem em um importante passo na direção da compreensão do envolvimento da transcrição antisense na regulação gênica pós-transcricional desse organismo modelo do terceiro domínio da vida. / Antisense RNAs (asRNAs) constitute the most numerous class of non-coding RNAs (ncRNAs) detected by transcriptome highthroughput methods in prokaryotes. Despite this abundance, little is known about regulatory mechanisms and evolutionary aspects of these molecules, mainly in archaea, where the mechanism of double-strand RNA (dsRNA) degradation remains poorly understood. In this study, using dRNA-seq data, we identified 1626 antisense transcription start sites (aTSSs) in the genome of Halobacterium salinarum NRC-1, an important model organism for gene expression regulation studies in Archaea. By integrating gene expression data from 18 RNA-seq paired-end libraries, we were able to annotate 846 asRNAs from mapped aTSSs. We found asRNAs in ~21% of annotated genes including genes related to important characteristics of this organism, such as: gas vesicle proteins, bacteriorhodopsin, translation machinery and transposases. We also found asRNAs in type II toxin-antitoxin systems and using public dRNA-seq data, we show evidences that this phenomenon might be conserved in archaea and bacteria. The interaction of a ncRNA with its target may depend on intermediary proteins action. In archaea, the LSm protein is a RNA chaperone homologous to bacterial Hfq, involved in post-transcriptional regulation. We used RIP-seq data from RNAs immunoprecipitated with LSm and identified 91 asRNAs interacting with this protein, for 81 of these the mRNA of the sense gene is also interacting. We searched for aTSSs present in the same region of orthologous genes in the Haloferax volcanii. We found 160 aTSSs that originated asRNAs in H. salinarum NRC-1 that might be conserved in this two archaea. The expression of annotated asRNAs was analyzed over a growth curve and in a knockout strain for RNase R gene. We found 144 asRNA differentially expressed over the growth curve, for 56 of these the sense gene was also differentially expressed, characterizing possible cis regulators asRNAs. In the knockout strain we found five differentially expressed asRNAs and only one asRNA/gene pair, this result does not allow us to infer a dsRNA degradation in vivo activity for this RNase in H. salinarum NRC- 1. This work contributes to the discovery of the antisense transcriptome in H. salinarum NRC- 1 a relevant step to uncover the post-transcriptional gene regulatory network in this archaeon.
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O transcritoma antisense primário de Halobacterium salinarum NRC-1 / The antisense primary transcriptome of Halobacterium salinarum NRC-1

Almeida, João Paulo Pereira de 04 September 2018 (has links)
Em procariotos, RNAs antisense (asRNAs) constituem a classe de RNAs não codificantes (ncRNAs) mais numerosa detectada por métodos de avaliação de transcritoma em larga escala. Apesar da grande abundância, pouco se sabe sobre mecanismos regulatórios e aspectos da conservação evolutiva dessas moléculas, principalmente em arquéias, onde o mecanismo de degradação de RNAs dupla fita (dsRNAs) é um fenômeno pouco conhecido. No presente estudo, utilizando dados de dRNA-seq, identificamos 1626 inícios de transcrição primários antisense (aTSSs) no genoma de Halobacterium salinarum NRC-1, importante organismo modelo para estudos de regulação gênica no domínio Archaea. Integrando dados de expressão gênica obtidos a partir de 18 bibliotecas de RNA-seq paired-end, anotamos 846 asRNAs a partir dos aTSSs mapeados. Encontramos asRNAs em ~21% dos genes anotados, alguns desses relacionados a importantes características desse organismo como: codificadores de proteínas que constituem vesículas de gás e da proteína bacteriorodopsina, além de vários genes relacionados a maquinaria de tradução e transposases. Além desses, encontramos asRNAs em genes pertencentes a sistemas de toxinas-antitoxinas do tipo II e utilizando dados públicos de dRNA-seq, evidenciamos que esse é um fenômeno que ocorre em bactérias e arquéias. A interação de um ncRNA com seu RNA alvo pode ser dependente de proteínas, em arquéias, a proteína LSm é uma chaperona de RNA homóloga a Hfq de bactérias, implicada no controle pós-transcricional. Utilizamos dados de RIP-seq de RNAs imunoprecipitados com LSm e identificamos 91 asRNAs interagindo com essa proteína, para 81 desses, o mRNA do gene sense também foi encontrado interagindo. Buscando por aTSSs presentes nas mesmas regiões de genes ortólogos, identificamos 160 aTSSs que dão origem a asRNAs em H. salinarum possivelmente conservados em Haloferax volcanii. A expressão dos asRNAs anotados foi avaliada ao longo de uma curva de crescimento e em uma linhagem knockout de um gene que codifica uma RNase R, possível degradadora de dsRNAs em arquéias. Encontramos um total de 144 asRNAs diferencialmente expressos ao longo da curva de crescimento, para 56 desses o gene sense também está diferencialmente expresso, caracterizando possíveis mecanismos de regulação em cis por esses RNAs. Na linhagem knockout, encontramos cinco asRNAs diferencialmente expressos e apenas para um desses o gene sense também está diferencialmente expresso, resultado que não nos permitiu inferir um possível papel de degradação de dsRNAs da RNAse R em H. salinarum NRC-1. Nesse trabalho apresentamos um mapeamento completo do transcritoma antisense primário de H. salinarum NRC-1 com resultados que consistem em um importante passo na direção da compreensão do envolvimento da transcrição antisense na regulação gênica pós-transcricional desse organismo modelo do terceiro domínio da vida. / Antisense RNAs (asRNAs) constitute the most numerous class of non-coding RNAs (ncRNAs) detected by transcriptome highthroughput methods in prokaryotes. Despite this abundance, little is known about regulatory mechanisms and evolutionary aspects of these molecules, mainly in archaea, where the mechanism of double-strand RNA (dsRNA) degradation remains poorly understood. In this study, using dRNA-seq data, we identified 1626 antisense transcription start sites (aTSSs) in the genome of Halobacterium salinarum NRC-1, an important model organism for gene expression regulation studies in Archaea. By integrating gene expression data from 18 RNA-seq paired-end libraries, we were able to annotate 846 asRNAs from mapped aTSSs. We found asRNAs in ~21% of annotated genes including genes related to important characteristics of this organism, such as: gas vesicle proteins, bacteriorhodopsin, translation machinery and transposases. We also found asRNAs in type II toxin-antitoxin systems and using public dRNA-seq data, we show evidences that this phenomenon might be conserved in archaea and bacteria. The interaction of a ncRNA with its target may depend on intermediary proteins action. In archaea, the LSm protein is a RNA chaperone homologous to bacterial Hfq, involved in post-transcriptional regulation. We used RIP-seq data from RNAs immunoprecipitated with LSm and identified 91 asRNAs interacting with this protein, for 81 of these the mRNA of the sense gene is also interacting. We searched for aTSSs present in the same region of orthologous genes in the Haloferax volcanii. We found 160 aTSSs that originated asRNAs in H. salinarum NRC-1 that might be conserved in this two archaea. The expression of annotated asRNAs was analyzed over a growth curve and in a knockout strain for RNase R gene. We found 144 asRNA differentially expressed over the growth curve, for 56 of these the sense gene was also differentially expressed, characterizing possible cis regulators asRNAs. In the knockout strain we found five differentially expressed asRNAs and only one asRNA/gene pair, this result does not allow us to infer a dsRNA degradation in vivo activity for this RNase in H. salinarum NRC- 1. This work contributes to the discovery of the antisense transcriptome in H. salinarum NRC- 1 a relevant step to uncover the post-transcriptional gene regulatory network in this archaeon.
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Archealth : enterprise architecture framework para sistemas telehealth baseados em tv digital interativa

Meneses, Diego Armando de Oliveira 10 August 2016 (has links)
From the 1970s to the present time, the World Health Organization (WHO) explains the importance of health promotion in the world. The increased interest in promoting health and increasing health costs for the economies contributed to the recognition of health care as an important area of research. One of the most important aspects of these research currently is the Telehealth, using Information and Communication Technologies (ICT) to try to provide universal access to health. The use of Interactive Digital TV technology helps in accessing remote locations and creates the opportunity to distribute applications across their infrastructure. Dealing with the problems that arise from the convergence of these concepts is of great importance. The architectural description process helps in the development of applications and systems based on the referenced concepts. However, there are no frameworks to help the description of architectures for this particular domain. This paper proposes the ARCHealth an enterprise architecture framework created to assist the architecture development process in accordance with ISO/IEC/IEEE 42010:2011. The ARCHealth was based on the principles of primary health care, taking into account the main concerns of stakeholders and the specific area. / Desde a década de 1970 até o presente momento, a Organização Mundial da Saúde (OMS) expõe a importância da promoção da saúde no mundo. O aumento do interesse na promoção da saúde e os custos de saúde crescentes para as economias contribuíram para o reconhecimento dos cuidados à saúde como uma importante área de pesquisa. Uma das vertentes mais importantes dessas pesquisas atualmente, é a Telehealth, que utiliza das Tecnologias de Informação e Comunicação (TIC) para tentar prover acesso universal à saúde. O uso da TV Digital Interativa auxilia no acesso a locais remotos e cria a oportunidade de distribuir aplicações através de sua infraestrutura. Lidar com os problemas que surgem a partir da convergência desses conceitos é de grande importância. O processo de descrição de arquitetura auxilia no desenvolvimento de aplicações e sistemas baseados nos conceitos referenciados. Porém, não existem muitos frameworks que auxiliem a descrição de arquiteturas para esse domínio específico. Este trabalho propõe o ARCHealth, um enterprise architecture framework criado para auxiliar o processo de desenvolvimento de arquitetura em conformidade com a norma ISO/IEC/IEEE 42010:2011. O ARCHealth foi elaborado com base nos princípios de Atenção Primária à Saúde, levando em consideração as principais preocupações das partes interessadas e do domínio específico.

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