Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Trees native to Brazil, mangaba (Hancornia speciosa Gomes) is a species mainly extractive, occurrence in various regions of the country. The Northeast holds of 99% of all production, being the Sergipe state the largest producer. The potential for the use of the pulp is quite varied, is used for fresh consumption and industrialization of various foods and drinks. The species has been threatened with extinction by several factors that are contributing to reduction of their naturally occurring areas. To enlarge the database for the use and knowledge of the variability of this species, as well as support to its domestication, it is necessary to carry out studies and characterization of genetic diversity. The present work was developed with the purpose to display and evaluate morphological descriptors, physico-chemical and molecular in germplasm of mangaba. The genebank of mangaba (BGmangaba) of Embrapa Coastal Tablelands was implemented in 2006 and has 213 individuals, representing 22 accessions. For morphological and physico-chemical characterization, 21 descriptors were used on 54 plants, from 10 access on fruit-bearing stage. There was wide variation and significance among and with access, without direct relationship with its origins. Fourteen descriptors were considered of significant importance for studies of characterization of mangaba, without loss of information on characterization. The accesses that presented the most significant values were AB, BI, CA, LG, TC, with greater development when compared to the others, the accesses TC, AB, AD, stand out as attractive, due to their physicochemical characteristics and the accesses BI and TC with fruits of larger masses, characteristic of interest for the in natura consumption and agroindustrial processing. All accesses of the BAG were used for molecular characterization and genetic structure, using nine microsatellite markers (SSR). 100% of polymorphism was observed with the use of SSR. 147 alleles were identified, with an average of 16 alleles for loco. Reliability was verified with stress values (0.042) and correlation (0.988). The alleles showed high frequency of heterozygosity (Ho>Ho). Fst values (0.22) and f (0.07) indicated moderate population structure, being presented greater diversity within the traffic. Bayesian analysis indicated a group with k=2, confirmed with the UPGMA. Were formed two distinct groups, grouped according to similarity. The pairs of individuals PM5 and GX2; CN1 and CN9; G18 and PA1; JA14 and JA15; OI8 and OI9, all belonging to the G2 were those closest genetically. The combination of the keywords used in this study, favors the identification of different individuals and with features of interest. The germplasm evaluated has diversity among and within access.The results will collaborate in the conservation of this material strategies and future breeding programs. The proposed descriptors will be used by FAO/Biodiversity. / Frutífera nativa do Brasil, a mangabeira (Hancornia speciosa Gomes) é uma espécie de cultivo predominantemente extrativista, que ocorre em várias regiões do país. A região Nordeste detém 99% de toda a produção, e o estado de Sergipe é o maior produtor. O potencial para o aproveitamento da polpa é bastante variado, é utilizada para o consumo in natura e industrialização de diversos alimentos e bebidas. Para ampliar a base de dados e conhecimento da variabilidade desta espécie, bem como dar suporte à sua domesticação, é necessário que se realizem estudos de caracterização e de diversidade genética. O presente trabalho foi desenvolvido com a finalidade de indicar e avaliar descritores morfológicos, físico-químicos e moleculares em germoplasma de mangaba. O Banco de Germoplasma de Mangaba (BGMangaba) da Embrapa Tabuleiros Costeiros foi implantado em 2006 e possui 213 indivíduos, que representam 22 acessos. Para a caracterização morfológica e físico-química, 21 descritores foram utilizados em 54 plantas, oriundas de 10 acessos em fase de frutificação. Observou-se ampla variação e significância entre e dentro dos acessos, sem relação direta com a sua origem. Quatorze descritores foram considerados de significativa importância para estudos de caracterização de mangabeira, sem perda de informações na caracterização. Os acessos que apresentaram valores mais significativos foram AB, BI, CA, LG TC com maior desenvolvimento quando comparado aos demais, os acessos TC, AB, AD, se destacam como atrativos, por suas características físico-químicas, e os acessos BI e TC com frutos de maiores massas, característica de interesse para o consumo in natura e processamento agroindustrial. Todos os acessos do BGMangaba foram utilizados para a caracterização molecular e estrutura genética, utilizando nove marcadores microssatélites (SSR). Observou-se 100% de polimorfismo com o uso dos SSR. Foram identificados 147 alelos, com média de 16 alelos por loco. A confiabilidade foi verificada com valores de estresse (0,042) e de correlação (0,988). Os alelos apresentaram alta frequência de heterozigosidade (He>Ho). Os valores de Fst (0,22) e de f (0,07) indicaram moderada estrutura populacional, sendo apresentada maior diversidade dentro dos acessos. A análise Bayesiana indicou um agrupamento com k=2, confirmado com o UPGMA. Foram formados dois grupos distintos, agrupados de acordo com a similaridade. Os pares de indivíduos PM5 e GX2; CN1 e CN9; G18 e PA1; JA14 e JA15; OI8 e OI9, todos pertencentes ao G2 foram os mais próximos geneticamente. A combinação dos descritores utilizados nesse estudo, favorece a identificação de indivíduos mais divergentes e com características de interesse. A diversidade entre e dentro dos acessos foi confirmada com as análises moleculares. Os resultados irão colaborar nas estratégias de conservação desse material e futuros programas de melhoramento. A proposta de descritores será utilizada pela FAO/Biodiversity. / São Cristóvão, SE

Submitted by Alisson Mota (alisson.davidbeckam@gmail.com) on 2015-07-13T18:33:56Z No. of bitstreams: 1 Tese - Aldecinei Bastos Siqueira.pdf: 11876927 bytes, checksum: cf4e6b319286981a71942bf8cef68bc4 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-16T17:25:00Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Aldecinei Bastos Siqueira.pdf: 11876927 bytes, checksum: cf4e6b319286981a71942bf8cef68bc4 (MD5) / Approved for entry into archive by Divisão de Documentação/BC Biblioteca Central (ddbc@ufam.edu.br) on 2015-07-16T17:33:31Z (GMT) No. of bitstreams: 1 Tese - Aldecinei Bastos Siqueira.pdf: 11876927 bytes, checksum: cf4e6b319286981a71942bf8cef68bc4 (MD5) / Made available in DSpace on 2015-07-16T17:33:32Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Tese - Aldecinei Bastos Siqueira.pdf: 11876927 bytes, checksum: cf4e6b319286981a71942bf8cef68bc4 (MD5) Previous issue date: 2010-06-11 / CNPq - Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / Piper peltatum (Piperaceae) and Ampelozizyphus amazonicus (Rhamnaceae) are species that have important medicinal features proven, for example, the action against malaria. Both are used as medicinal by the Amazonian peoples, and are obtained exclusively by the practice of extraction. These species are not scientifically well-known, and, due to their potential, studies about methodologies for the conservation of genetic resources and the domestication of these species are necessary. The objectives of this study were to locate and characterize, based on field observation and environmental data base, the natural populations of these species along the Amazon River, and developing strategies for conservation of Ampelozizyphus amazonicus and Piper peltatum germplasm by minimum growth techniques and sub-zero and cryogenic temperatures. For in vitro conservation minimum growth techniques were used. The maintenance of P. peltatum microshoots was evaluated under different temperatures (10 °C, 20 °C and 25 °C) and different salts concentrations in MS medium. Microshoots of P. peltatum and Ampelozizyphus amazonicus were subjected to different concentrations of sucrose, mannitol and sorbitol (1%, 2% and 3%). Microshots of P. peltatum were also subjected to culture media with different concentrations of sucrose, mannitol and sorbitol (1%, 2% and 3%) with or without salicylic acid (SA). Seeds conservation of Piper peltatum were evaluated under sub-zero (-20 °C) and cryogenic (-196 °C) temperatures. For seeds preservation under sub-zero temperatures, the seeds were desiccated for 0h, 24h and 48h and maintained for 0, 90 and 180 days in temperature of -20 °C. For cryopreservation, seeds were immersed in liquid Nitrogen for 24h, and stored with or without other cryoprotectors. Field observation and the data base demonstrate that most of sampling areas visited are under anthropic deforestation. The In vitro maintenance of P. peltatum microshoots was more efficient in the temperature of 20 °C. The use of mannitol for conservation in vitro resulted in high mortality rates of the microshoots of both species. In vitro conservation of P. peltatum in function of sucrose, mannitol e sorbitol and different concentrations of SA, the best results are obtained in the absence of AS. Germination rates were satisfactory when the seeds of Piper peltatum were dried for up to 48 hours and stored for up to 180 days at -20 ° C. The seeds were also tolerant to cryopreservation, regardless of the use of cryoprotectants. It is possible the conservation of the species in vitro for up to 180 days by reducing the growth temperature. The addition of mannitol and sorbitol, for the concentrations tested, are inadequate for in vitro conservation of A. amazonicus microshoots. Sorbitol may be used in P. peltatum conservation in concentrations between 1% and 2% in MS medium. Piper peltatum seeds are tolerant to desiccation and exposure to subzero and cryogenic temperatures, suggesting that Piper peltatum seeds are orthodox. / Ampelozizyphus amazonicus Ducke (Rhamnaceae) e Piper peltatum L. (Piperaceae) são espécies que possuem características medicinais importantes comprovadas cientificamente, dentre essas a ação contra a malária. Ambas são usadas como medicinais pelas populações da Amazônia, que as obtêm exclusivamente pela prática do extrativismo. As espécies são pouco conhecidas sob o ponto de vista científico e devido ao potencial que estas apresentam, são necessários estudos a respeito de metodologias para a conservação dos recursos genéticos e domesticação destas espécies. Este trabalho teve por objetivo localizar populações naturais de Ampelozizyphus amazonicus e Piper peltatum ao longo dos rios Solimões e Amazonas, caracterizar por meio de observações nas áreas de coleta e informações de bases de dados as condições ambientais das populações, e desenvolver estratégias para a conservação de germoplasma por técnicas de crescimento mínimo, temperaturas sub zero e criogênicas. Para a conservação in vitro utilizaram-se técnicas de conservação in vitro por crescimento mínimo. Foi avaliada a manutenção de microestacas de Piper peltatum sob diferentes temperaturas (10 °C, 20 °C e 25 °C) e o cultivo em diferentes concentrações dos sais do meio de cultura MS. Microestacas de Ampelozizyphus amazonicus e Piper peltatum foram submetidas a diferentes concentrações de sacarose, manitol e sorbitol (1%, 2% e 3%). Em outro ensaio microestacas de Piper peltatum foram cultivadas em meio de cultura com diferentes concentrações de sacarose, manitol e sorbitol (1%, 2% e 3%) adicionado ou não de ácido salicílico (AS). Foram realizados ensaios de conservação de sementes de Piper peltatum, estas foram submetidas a conservação por temperaturas sub zero (-20 oC) e criogênicas (-196 oC). Para a conservação de sementes sob temperatura sub zero, inicialmente as sementes foram dessecadas por 0h, 24h e 48h e conservadas por 0, 90 e 180 dias, a -20 °C de temperatura. Para a criopreservação, as sementes foram testadas quanto à tolerância a imersão por 24 horas em Nitrogênio líquido (NL) e quanto ao uso ou não de diferentes tipos de crioprotetores. As observações ambientais realizadas e as informações das bases de dados demonstram que a maior parte das áreas de coleta visitadas está sob ação antrópica de desmatamento. A manutenção in vitro de microestacas de Piper peltatum a 20 °C de temperatura foi a mais eficiente na conservação in vitro sob diferentes temperaturas. O uso do manitol para a conservação in vitro resultou no aumento das taxas de mortalidade das microestacas de ambas as espécies estudadas. Para a conservação in vitro de P. peltatum em função da sacarose, manitol e sorbitol e diferentes concentrações de AS, os melhores resultados das culturas sobreviventes são obtidos na ausência de AS. A conservação de sementes de Piper peltatum apresentou taxa de germinação satisfatória quando dessecadas por até 48 horas e conservadas por até 180 dias à -20 °C de temperatura. As sementes foram tolerantes à criopreservação independentemente do uso de crioprotetores. Conclui-se que é possível a conservação in vitro de P. peltatum por até 180 dias pela redução da temperatura de crescimento. A adição de manitol e sorbitol, nas concentrações testadas, são inadequadas para a conservação in vitro de microestacas de A. amazonicus. O sorbitol pode ser usado na conservação de P. peltatum em intervalo de 1% a 2% da concentração adicionado ao meio de cultura de MS. As sementes de Piper peltatum são tolerantes à dessecação e à exposição às temperaturas sub zero e criogênicas, sugerindo que se trata de semente do tipo ortodoxa.

Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Espécies de arroz silvestre são colonizadas por bactérias diazotróficas, contudo, pouco se conhece sobre a colonização em Oryza glumaepatula (Steud). Este estudo teve como objetivo isolar e caracterizar bactérias diazotróficas de arroz silvestre em áreas de mata e cerrado no bioma amazônico. Amostras de plantas selvagens foram coletadas e utilizadas para o isolamento bacteriano, sendo as bactérias obtidas avaliadas quanto à formação de película em meio de cultura semi-sólido. Posteriormente, as que apresentaram a formação de película foram analisadas quanto a presença do gene nifH utilizando os iniciadores PolF/PolR e, as que foram positivas, caracterizadas através de Box-PCR, solubilização de fosfato de Ca e produção de ácido indol acético (AIA). Trinta e oito bactérias, cerca de 4% do total, formaram película e apresentaram produto de amplificação do gene nifH. A incidência de bactérias diazotróficas foi semelhante entre as áreas, porém maior número foi isolado na parte aérea das plantas. Além disso, mais de 30% das bactérias diazotróficas apresentaram produção de AIA e/ou solubilização de fosfato, sendo a maior concentração na parte aérea das plantas do cerrado. Nessa área ocorre maior diversidade genotípica de bactérias diazotrófica associadas ao arroz silvestre e maior número destas bactérias capazes de solubilizar fosfato de Ca e produzir AIA. / Species of wild rice are colonized by diazotrophic bacterias, however, little is known about the colonization in Oryza glumaepatula (Steud). This study aimed isolate and characterize diazotrophic bacterias of the wild rice from forest and cerrado areas in the Amazon biome. Samples of wild plants were collected for bacterial isolation, and semi-solid medium was used to assay the pellicles formation by the bacterias. Later, the nifH gene was also amplified by PCR using the primer set PolF/PolR and the bacterias, each ones were positive, characterized through Box-PCR, solubilization of calcium phosphate and production of indol acetic acid (AIA). Thirty eight bacterias, around 4% of the total, formed pellicles and also presented nifH gene amplification. A incidência de bactérias diazotróficas foi semelhante entre as áreas, porém maior número foi isolado na parte aérea das plantas. Além disso, mais de 30% das bactérias diazotróficas apresentaram produção de AIA e/ou solubilização de fosfato, sendo a maior concentração na parte aérea das plantas do cerrado. Nessa área ocorre maior diversidade genotípica de bactérias diazotrófica associadas ao arroz silvestre e maior número destas bactérias capazes de solubilizar fosfato de Ca e produzir AIA. The incidence of diazotrophic bacterias was similar between the areas, however, higher number was isolated from the aerial part of the plants. Furthermore, more than 30% of the diazotrophic bacterias produced AIA and/or solubilized phosphate, and the largest concentration of these bacteria was isolate in the aerial part of the plants from cerrado. In this area happens higher genotypic diversity of diazotrophic bacterias associated to the wild rice and also the larger number of these bacterias is capable producing AIA and solubilizing phosphate.

Submitted by Gabriela Lopes (gmachadolopesufpel@gmail.com) on 2016-10-03T17:15:46Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Dissertação - Marina de Magalhães da Fonseca.pdf: 2736383 bytes, checksum: b1ef8a122c1dc6e2d92f2bb25c8badb3 (MD5) / Approved for entry into archive by Aline Batista (alinehb.ufpel@gmail.com) on 2016-10-06T20:42:53Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marina de Magalhães da Fonseca.pdf: 2736383 bytes, checksum: b1ef8a122c1dc6e2d92f2bb25c8badb3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-10-06T20:42:53Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Dissertação - Marina de Magalhães da Fonseca.pdf: 2736383 bytes, checksum: b1ef8a122c1dc6e2d92f2bb25c8badb3 (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2014-02-13 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Os estudos de biologia reprodutiva são fundamentais para a conservação e manejo das espécies de plantas, uma vez que o período reprodutivo é uma fase de grande importância para a dinâmica das populações e sobrevivência das espécies . Esta dissertação teve como objetivo contribuir para o conhecimento da morfologia floral, biologia floral e reprodutiva de Butia odorata (Barb. Rodr.) Noblick, além de identificar os agentes polinizadores e suas relações com as flores. O trabalho foi realizado em dois países, no Uruguai (em La Paloma, Departamento de Rocha) e no Brasil (em Porto Alegre, Rio Grande do Sul). Foram identificadas as fases de floração, antese masculina e feminina. Foi estimado o número de flores masculinas e femininas por ráquila na inflorescência, e a relação existente entre flores masculinas e femininas. Foi verificada a coloração das ráquilas e das flores. As flores foram caracterizadas quanto à sua morfologia e morfometria. Foram identificadas as ordens de insetos que visitaram as inflorescências, a relação dos insetos com as flores, os recursos florais coleta dos e o período de visitação durante as fases de floração. As flores de Butia odorata são unissexuais, hipóginas, actinomorfas, diclamídeas e sésseis. As flores masculinas e femininas ocorrem na mesma inflorescência e possuem formatos distintos, sendo as primeiras muito mais numerosas do que as segundas. As flores masculinas estão dispostas por toda a ráquila, com maior concentração do meio para o ápice, as flores femininas são encontradas do meio para a base da ráquila, formando tríades com duas masculinas. Existe variabilidade genética para cor e tamanho de ráquilas e para cor das flores em inflorescências de B. odorata. A espécie apresenta mecanismos de protandria. Uma grande diversidade de espécies de insetos das ordens Hymenoptera, Coleoptera e Diptera visitam as inflorescências. Durante a antese masculina, as ordens Hymenoptera e Coleoptera são mais frequentes, enquanto que durante a antese feminina a ordem Hymenoptera se destaca. Os insetos são atraídos pelos recursos como pólen e néctar disponibilizados pelas flores. A compreensão sobre a biologia reprodutiva, apresentado nos dois capítulos da dissertação, serve de alicerce para a preservação do butiá, pois este conhecimento é de grande importância para traçar estratégias de conservação e uso de recursos genéticos e programas de melhoramento. / Studies of reproductive biology are essential for the conservation and management of plant species, once the reproductive period is a time of great importance for the population dynamics and species survival. This dissertation had as objective to contribute to uderstanding floral morphology, floral and reproductive biology of Butia odorata (Barb. Rodr.) Noblick. Also, to identify the pollinators and their relationship with the flowers. The study was conducted in two Countries, Uruguay (La Paloma, Rocha Department) and Brazil (Porto Alegre, Rio Grande do Sul State). Stages of flowering, and male and female anthesis were identified. The number of male and female flowers per rachille in the inflorescence, and the ratio between male and female flowers were estimated. The coloring of rachilles and flowers was verified. The morphology and morphometry of flowers were characterized. Orders of insects that visited the inflorescences, the relationship of insects with flowers, the collected floral resources and the period of visitation during the stages of flowering were identified. Flowers of Butia odorata are unisexual, hypogynous, actinomorphic, dichlamydeous and sessile. The male and female flowers occur on the same inflorescence and have different formats, being the male more numerous than the female. The male flowers are arranged throughout the rachille, with higher concentration from the middle to the apex. The female flowers are found from the middle to the base of rachille, forming triads with two male flowers. There is genetic variability for color and size of rachilles and for color of flowers on inflorescences of B. odorata. The species has mechanisms of protandry. A great diversity of insects' species, belonging to the Hymenoptera, Coleoptera and Diptera orders visit the inflorescences. During male anthesis, the Hymenoptera and Coleoptera orders are more frequent, whereas during female anthesis the Hymenoptera order stands. The insects are attracted by the resources such as pollen and nectar provided by the flowers. The understanding of the reproductive biology, presented in two chapters of this dissertation, serves as the foundation for the preservation of butiá, because this knowledge is of great importance to devise strategies for the conservation and use of genetic resources and breeding programs.

Made available in DSpace on 2014-08-20T14:06:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_carla_sigales_vasconcelos.pdf: 943673 bytes, checksum: 528e6049558caf03bbdfbaa425977260 (MD5) Previous issue date: 2012-11-30 / Genetic resources are essential for sustainable development of agriculture and agribusiness. Landraces, improved varieties, advanced lines and native and wild species are comprised in the concept of genetic resources. The diversity found in Capsicum is wide, with a variety of fruit shapes, sizes, colors and flavors, and also with different levels of pungency and nutritional composition. In this context, this study aims to contribute to the genetic resources knowledge of C. baccatum landraces from collection of Active Germplasm Bank of Embrapa Temperate Agriculture. Two papers will be presented with the objectives of characterize and agronomical evaluate C. baccatum landraces, and characterize the genetic variability to produce bioactive compounds in the fruits. 18 accessions of landraces were evaluated using 27 descriptors (14 quantitative and 13 qualitative multicategoric). The statistical analyzes included comparison of means, using clustering by Tocher method for quantitative data, and clustering by Tocher method and UPGMA for qualitative data. Accessions P27 and P179 are recommended for fresh consumption. The access P92 has the highest productivity and pungent fruits that can be used for canning. Access P8 may be recommended for ornamental use due to prostrate growth habit, high density leaves and erect fruit that change color during maturation. The production of phenolic compounds, anthocyanins, total carotenoids and antioxidant activity was evaluated at four points of fruit maturation (0%, 30%, 70% and 100%). The data were subjected to multivariate statistical analysis with principal components analysis. The production of bioactive compounds varied according the different points of maturation. Generally the fully ripe fruit produced higher levels of bioactive compounds. Accession P25 had higher values of anthocyanins for fruits with 30% of maturation, which are violet. Accession P108 showed large variations in antioxidant activity, ranging from 588.44 mg in the unripe fruit to 1373.44 mg in 70% of maturation. To carotenoids the accession P49 varied from 65.03 mg in totally immature fruit to 367.73 mg in 100% maturation. There is great genetic variability in C. baccatum landraces. / Os recursos genéticos são imprescindíveis para o desenvolvimento sustentável da agricultura e da agroindústria. Compreendem as variedades tradicionais, variedades melhoradas, linhas avançadas e espécies nativas e silvestres. A diversidade encontrada em Capsicum é ampla, com grande variedade de formatos, tamanhos, cores e sabores de fruto, e com diferentes níveis de pungência e de composição nutricional. Esta dissertação se propõe contribuir para o conhecimento dos recursos genéticos de variedades crioulas de Capsicum baccatum que fazem parte do acervo do Banco Ativo de Germoplasma de Capsicum da Embrapa Clima Temperado. Os dados serão apresentados em dois artigos, cujos objetivos são caracterizar e avaliar agronomicamente variedades crioulas de Capsicum baccatum; e caracterizar a variabilidade genética para produção de compostos bioativos em frutos de variedades crioulas de pimenta. Foram avaliados 18 acessos de variedades crioulas, utilizando 27 descritores (14 quantitativos e 13 qualitativos multicategóricos). Foram realizadas análises de comparação de médias, utilizando-se agrupamento pelo método de Tocher, para os dados quantitativos, e agrupamento pelo método de Tocher e de UPGMA, para os dados qualitativos. Os acessos P27 e P179 são recomendados para consumo in natura. O acesso P92 apresenta maior produtividade, com frutos pungentes que podem ser usados para a produção de conservas. O acesso P8 é recomendado para uso ornamental, devido ao hábito de crescimento prostrado, alta densidade de folhas e frutos eretos que passam por quatro cores durante o processo de maturação. A produção de compostos fenólicos, antocianinas totais, atividade antioxidante e carotenoides totais foi avaliada em quatro pontos de maturação dos frutos (0% de maturação, 30% de maturação, 70% de maturação e 100% maduros). Os dados obtidos foram submetidos à análise estatística multivariada, com análise de componentes principais. A produção de compostos bioativos variou com os diferentes pontos de maturação. De modo geral os frutos totalmente maduros produziram maiores teores de compostos bioativos. O acesso P25 apresentou valores de antocianinas bastante superiores para frutos com 30% maturação, os quais apresentaram coloração violeta. O acesso P108 apresentou grande variação para atividade antioxidante, variando de 588,44 μg nos frutos imaturos a 1373,44 μg nos frutos com 70% de maturação. Para carotenoides o acesso que mais variou foi P49, com 65,03mg em frutos totalmente imaturos e 367,73mg com 100% de maturação. Existe grande variabilidade genética nos acessos de variedades crioulas de Capsicum baccatum.

Las variedades tradicionales de tomate son apreciadas por los consumidores, que están dispuestos a pagar mayores precios por recuperar el sabor del tomate. Este interés ha propiciado que los estudios referentes a estos materiales se hayan multiplicado durante los últimos años, aunque normalmente se ciñen a pocas variedades, pocas poblaciones por variedad, o a aspectos muy concretos de sus características. El presente trabajo aborda una caracterización de variedades tradicionales del levante español que permita reunir e integrar los resultados de caracterización morfo-agronómica, organoléptica, funcional y molecular, en un intento de poner en valor estos importantes recursos fitogenéticos. Dentro de las poblaciones de las variedades tradicionales evaluadas se han observado niveles elevados de variación en características morfo-agronómicas y funcionales. Dicha variación puede deberse a factores micro-ambientales o diferencias genotípicas, puesto que se trata de variedades población. No obstante, las diferencias observadas en los niveles de variación respecto a híbridos F1 empleados como control, sugiere que las diferencias genotípicas entre individuos no serían tan importantes como cabría pensar. La variación detectada entre poblaciones de la misma variedad es, en general, mayor en todos los niveles (morfo-agronómico, organoléptico, funcional y molecular). Aunque parece existir una cierta tendencia en el perfil organoléptico, funcional y morfológico para cada variedad, lo cierto es que los rangos de variación de estos perfiles entre distintas variedades se solapan. La selección diferencial realizada por cada agricultor dentro de variedad podría ser una de las principales causas de la elevada variabilidad detectada. A ésta se añade los efectos de la mezcla de semillas y los cruzamientos espontáneos que se han evidenciado en la evaluación de los materiales (tanto por segregación morfo-agronómica como por los niveles de heterocigosidad observada en algunas poblaciones). De esta forma, tras estos sucesos el agricultor aplicaría una elevada presión de selección para recuperar las características básicas externas de la variedad, pero la variación se mantendría, especialmente, en los caracteres internos. La elevada variabilidad entre las poblaciones de una misma variedad presenta varios problemas a la hora de abordar la promoción de su cultivo y su conservación in situ. Por un lado, la existencia de tanta variación complica que los consumidores asocien un morfotipo muy definido con un elevado estándar de calidad. Además, la falta de un ideotipo claro y relativamente uniforme, dificulta el registro de los materiales como variedades de conservación. Por otro lado, no todas las poblaciones de una variedad aglutinan una morfología y estructura del fruto adecuada, representativa de la variedad y que además manifieste el mejor sabor posible. Por ello, es conveniente llevar a cabo programas de depuración varietal en los que se realicen selecciones de las mejores poblaciones que reúnan las mejores características. Por otro lado, también sería recomendable realizar selecciones dentro de población en los casos en los que la variación intra-poblacional sea excesiva. En ocasiones, y de forma complementaria, podría contemplarse la introgresión de genes de resistencia a virosis en variedades tradicionales, como medida necesaria en aquellas zonas especialmente afectadas por determinadas enfermedades. De forma adicional, considerando el creciente interés por los alimentos saludables, la detección de variedades o poblaciones dentro de variedad que destaquen por un elevado valor funcional, puede contribuir a identificar un valor añadido que permita valorizar estas variedades tradicionales. En este contexto, se han encontrado poblaciones con niveles de vitamina C próximos a los mostrados por cultivares “Double Rich”, de licopeno dentro del rango de variación mostrado por cultivares “high pigment” y de β-caroteno comparables a los mejores resultados obtenidos en cultivares “high pigment”. Estos materiales resultan potencialmente útiles como fuentes de variación o pueden ser directamente aprovechables para ser reintroducidos en el mercado con un valor añadido contrastado. Aunque se ha encontrado variación para el contenido en polifenoles totales, éstos han sido intermedios. Finalmente, a la hora de realizar una adecuada identificación del ideotipo varietal, de depurar una variedad descartando poblaciones, de acelerar programas de introgresión de genes o simplemente para defender los mercados de calidad frente a fraudes que pretendan aprovechar los diferenciales de precio de las variedades tradicionales, es necesario contar con herramientas de caracterización molecular eficientes. En este trabajo se ha seleccionado y comprobado la efectividad de una colección de marcadores SNP para caracterizar variedades tradicionales de tomate y se han obtenido huellas moleculares para las variedades: “Centenares”, “Cuarenteno”, “De la pera”, “De pera”, “Flor de baladre”, “Gordo rojo”, “Moruno”, “Muchamiel”, “Negre”, “Pimiento”, “Valenciano” y “Tomaca gallega”. La tipificación varietal, la identificación de un valor añadido en las características organolépticas y funcionales de estos materiales, y la detección de perfiles moleculares que permitan autentificarlos, son elementos clave y necesarios para asegurar la protección de estos recursos genéticos. Estas actividades contribuirán a consolidar los mercados de calidad, satisfaciendo las demandas de los consumidores, y ofreciendo una alternativa de cultivo rentable a agricultores en sistemas minifundistas. / Cortés Olmos, C. (2015). Puesta en valor de variedades tradicionales de tomate [Tesis doctoral]. Universitat Politècnica de València. https://doi.org/10.4995/Thesis/10251/48532

Made available in DSpace on 2014-07-29T15:25:09Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Fabricio Ribeiro.pdf: 837268 bytes, checksum: 934d44a7485d39d24a699339c9207985 (MD5) Previous issue date: 2010-08-10 / The potential cost-effective generated by biological diversity misrepresented the sense and value of traditional knowledge associated with biodiversity, intensifying exploitation and destruction of natural resources, notably in developing countries. Protection of biodiversity is regulatory framework of the Convention on biological diversity, with three main objectives: biodiversity conservation, sustainable use of its components and the fair and equitable sharing of benefits derived from the use of natural resources, through their appropriate access and transfer of relevant technologies. Another band, the international intellectual property system, embodied by the TRIPS Agreement, expressed through its institutions, notably the WTO and WIPO, by application of the system of patents to traditional knowledge, legalising the expropriation of elements of biodiversity, what is termed the "back of Columbus". This work you want to check each one of the main points of these two models of protection of traditional knowledge, discerning possible alternatives present on the international scene. Accordingly, the approach is highly theoretical, having as main conceptual the thinking of Fritjof Capra, his work "the Web of life", which implies recognizing that biodiversity has an intrinsic value. The search will seek to identify the lines category nature demarcatórias, while discussing unsustainable current model of economic development, result of Cartesian rationalism. Will performed consulting agreements and international documents, comparing the positions of several authors and institutions involved. / As potencialidades econômicas geradas pela diversidade biológica alteraram profundamente o sentido e o valor dos conhecimentos tradicionais associados à biodiversidade, intensificando a exploração e a destruição dos recursos naturais, notadamente nos países em desenvolvimento. A proteção da biodiversidade tem como marco regulatório a Convenção sobre Diversidade Biológica, destacando-se três objetivos principais: conservação da biodiversidade, utilização sustentável de seus componentes e repartição justa e equitativa dos benéficos derivados da utilização dos recursos naturais, mediante seu acesso adequado e transferências de tecnologias pertinentes. De outra banda, o sistema internacional de propriedade intelectual, consubstanciado no Acordo TRIPS, manifesta-se através de suas instituições, notadamente da OMC e da OMPI, pela aplicação do regime de patentes aos saberes tradicionais, legalizando a expropriação dos elementos da biodiversidade, o que se convencionou chamar de a volta de Colombo . O presente trabalho pretende verificar cada um dos principais pontos desses dois modelos de proteção aos conhecimentos tradicionais, vislumbrando possíveis alternativas presentes no cenário internacional. Nesse sentido, a abordagem será eminentemente teórica, tendo como principal marco conceitual o pensamento sistêmico de Fritjof Capra, destacando-se sua obra A Teia da Vida , o que implica reconhecer que a biodiversidade tem um valor intrínseco. A pesquisa vai buscar identificar as linhas demarcatórias da categoria natureza, ao mesmo tempo em que discute a insustentabilidade do atual modelo de desenvolvimento econômico, resultado do racionalismo cartesiano. Para tanto, será realizada consulta a acordos e documentos internacionais, confrontando as posições dos diversos autores e instituições envolvidas.

Actualmente nos encontramos en un momento de profunda transformación en la historia de la humanidad y de las leyes de la naturaleza caracterizada, entre otras cosas, por un desarrollo expansivo de la industria biotecnológica. La biotecnología tiene como materia prima los recursos genéticos y, también, los extractos bioquímicos de las especies vegetales, animales y microbianas que componen la diversidad biológica, la cual permite un sin fin de posibilidades alimenticias, medicinales, energéticas, industriales entre otros recursos básicos que proveen bienes y servicios esenciales a la pervivencia de la especie humana al mismo tiempo que constituye un elemento integrante de la red de la vida.Si, la perpetua tradición del biocolonialismo o biopiratería que desarrollaron algunos pocos países arrollando a muchos se atenúa o, siendo optimistas, se extingue observando las normas que edifican el Convenio sobre la diversidad biológica y, especialmente, el régimen de acceso a los recursos genéticos en él instituido (artículo 15), las posibilidades de crecimiento económico y, consecuentemente, de desarrollo humano de estos países podría ser una de las innumerables alternativas para empezar a tomar forma. Además, la minimización de los efectos perniciosos sobre la diversidad biológica, mediante su conservación y la aplicación del paradigma desarrollo sostenible, podría favorecer y corregir el dilema utilización versus deterioro.Así pues, el artículo 15 del referido Convenio ofrece por primera vez en el Derecho internacional público un régimen jurídico para un acceso a recursos genéticos legalmente constituido. La característica principal del mismo es que el acceso a un determinado recurso genético se trata de una expectativa sometida a complejas y a la vez oportunas condiciones. Por una parte, está vinculado a contraprestaciones anteriormente inexistentes, las cuales afectan especialmente a la parte usuaria: la transferencia de tecnologías, incluidas las biotecnologías; la distribución justa y equitativa de los beneficios provenientes de cualquier modalidad de utilización y la realización de investigaciones científicas basadas en los recursos accedidos. Por otra parte, está vinculado a la legislación nacional del Estado suministrador del recurso, al consentimiento fundamentado previo del mismo e a las condiciones mutuamente convenidas en la negociación de los acuerdos que le darán vida jurídica.

Submitted by Lara Oliveira (lara@ufersa.edu.br) on 2017-01-04T13:05:22Z No. of bitstreams: 1 CarinaML_TESE.pdf: 1476302 bytes, checksum: d8ce6c34270ba40b6a6e97b30bf6d975 (MD5) / Approved for entry into archive by Vanessa Christiane (referencia@ufersa.edu.br) on 2017-01-24T14:44:07Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CarinaML_TESE.pdf: 1476302 bytes, checksum: d8ce6c34270ba40b6a6e97b30bf6d975 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-03-21T14:51:15Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CarinaML_TESE.pdf: 1476302 bytes, checksum: d8ce6c34270ba40b6a6e97b30bf6d975 (MD5) Previous issue date: 2014-03-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The tall coconut palm is about 70% of the coconut farm in Brazil. Nonetheless the information about the genetic variability existing in Brazilian populations and their genetic relationships are still incipient. Microsatellite markers or SSR (Simple Sequence Repeats) and morphological markers are the techniques most suitable for studies of genetic diversity. Thus, knowledge of the variability and genetic structure in the giant coconut palm, it is necessary to direct the activities of conservation and use of germplasm in breeding programs of this species. The objectives of this study were: 1) to analyze the distribution of the genetic variability of the original population of Tall-Brazil-Praia-Forte ( GBrPF - PO), located on the north coast of Bahia, and four coming accesses this population; 2) levels of diversity and genetic relationships between two accesses tall coconut palm collected in Brazil and introduced seven accessions of different geographical regions, conserved in Banco Internacional de Coco for Latin America and the Caribbean (ICG - LAC). The accessions were analyzed using 25 SSR primers specific morphological descriptors and 16 of the list of IPGRI, 1995. Accesses tall- Brazil-Praia-Forte (GBrPF) are conserved in physical bases in Ceará (GBrPF-CE), Pará (GBrPF-PA ) and ICG - LAC, the latter two physical bases in Sergipe: one in the experimental field of the Betume in the city of Neópolis (GBrPF-CEB) and the other in the experimental field Itaporanga in the municipality of Itaporanga d'Ajuda (GBrPF-CEI) . The other accesses greens: tall-do-Brazil-Merepe (GBrMe), collected in the coastal Northeast, tall-Malaysia (GML), tall-Vanuatu (GVT), tall-West African (GOA), tall-Polynesia (GPY), tall-Rennel (GRL), tall-Tonga (GTG) and tall-Rotuma (GRT) introduced in different geographic regions of the world, too are conserved in the ICG - LAC in the experimental field of the Betume. Three studies from this research project will be presented. In the first study, we found 18 polymorphic primers, 91 alelos, with a mean of 5.05 alleles/locus. Genotypic indices indicate greater genetic variability of access GBrPF-PA, GBrPF-CE and GBrPF-CEB, the analysis of gene structure identified an allele sharing and access of the population, suggesting that accesses listed represent the genetic structure of the original population. The grouping (UPGMA) showed the formation of 14 groups, with the GBrPF-CEB and GBrPF-PA showed greater similarity to the original population accesses. In the second study, for the study of genetic relationships among accessions of tall coconut palm, 19 primers were polymorphic, detecting 125 alleles, with an average of 6.57 alleles/locus. Genotypic indices indicate greater genetic variability among accessions of coconut - derived giant introduced the Pacific region. The analysis of gene structure led to the formation of five groups and accessions collected in Brazil showed genetic relationship with the African access and the emergence of ecotypes giant coconut palm in Brazil. Cluster analysis by the Nearest Neighbor method formed two main groups. In group I, the accessions were grouped into three subgroups: Ia (GTG, GRT and GPY), Ib (GRL and GVT) and Ic (GML). In group II, the accessions were separated into two subgroups: IIa (GOA) and IIb (GBrMe, GBrPF),indicating that the genetic relationships of the accessions are based on ecogeographic regions. In the third work, the study of genetic diversity through morphological markers using techniques of univariate and multivariate genetic variability was observed among genotypes. The results of principal component analysis, obtained from 16 morphological characters shows that three components were needed, that the variance explained by them reached a minimum of 80% and the selection of six characters with the highest contribution to the study of diversity. UPGMA was formed by five groups. Group I meets the GVT and GML access; group II with GPY, GTG and GBrPF; group III and IV each with one access, GRT and GOA, respectively, while group V with GBrMe and GRL. Groups showed an inconsistency with respect to the origins of the accessions, probably due to the quantitative nature of those characteristics that are controlled by many genes, being affected by environmental factors. Diversity and genetic structure evaluations demonstrate the variability and genetic relations in giant coconut palm. These results will guide decisions about the activities of conservation and use of coconut germplasm in the country / O coqueiro-gigante representa cerca de 70% da exploração do coqueiro no Brasil. Apesar disso, as informações sobre a variabilidade genética existente nas populações brasileiras e suas relações genéticas ainda são incipientes. Os marcadores microssatélites ou SSR (Simple Sequence Repeats), e os marcadores morfológicos, são as técnicas mais indicadas para os estudos de diversidade genética. Assim, o conhecimento da variabilidade e da estruturação genética em coqueiro-gigante, torna-se necessário para direcionar as atividades de conservação e utilização do germoplasma nos programas de melhoramento da espécie. Os objetivos do presente estudo foram: 1) analisar a distribuição da variabilidade genética da população original de gigante-do-Brasil-da-Praia-do-Forte (GBrPF-PO), localizada do litoral norte do Estado da Bahia, e de quatro acessos procedentes dessa população; 2) os níveis de diversidade e as relações genéticas entre dois acessos de coqueiro-gigante coletados no Brasil e sete acessos introduzidos de diferentes regiões geográficas do mundo, conservados no Banco Internacional de Coco para a América Latina e Caribe (ICG- LAC).Os acessos foram analisados por meio de 25 primers SSR específicos e 16 descritores morfoagronômicos da lista do IPGRI, 1995.Os acessos de gigante-do-Brasil-da-Praia-Forte (GBrPF) são conservados em bases físicas no Ceará (GBrPF-CE), Pará (GBrPF-PA) e no ICG-LAC, este último em duas bases físicas em Sergipe: uma no campo experimental do Betume, no município de Neopólis (GBrPF-CEB) e a outra no campo experimental de Itaporanga, no município de Itaporanga d’Ajuda (GBrPF-CEI). Os demais acessos de coqueiro: gigante-do-Brasil-de-Merepe (GBrMe), coletado no litoral do Nordeste do país, gigante-da-Malásia (GML), gigante-de-Vanuatu (GVT), gigante-do-Oeste-Africano (GOA), gigante-da-Polinésia (GPY), gigante-de-Rennel (GRL), gigante-de-Tonga (GTG) e gigante-de-Rotuma (GRT) introduzidos de diferentes regiões geográficas do mundo, também estão conservados no ICG-LAC no campo experimental do Betume. Três trabalhos oriundos deste projeto de pesquisa serão apresentados. No primeiro trabalho, constatou-se 18 primers polimórficos, 91alelos, com media de 5,05 alelos/loco. Os índices genotípicos indicam maior variabilidade genética dos acessos GBrPF-PA, GBrPF-CE e GBrPF-CEB, a análise da estrutura gênica identificou um compartilhamento de alelos da população e dos acessos, sugerindo que os acessos coletados, representam a estruturação genética da população original. O agrupamento (UPGMA), evidenciou a formação de 14 grupos, tendo os acessos GBrPF-CEB e GBrPF-PA mostrado maior similaridade com a população original. No segundo trabalho, para o estudo das relações genéticas entre acessos de coqueiro-gigante, 19 primers foram polimórficos, detectando 125 alelos, com média de 6,57 alelos/loco. Os índices genotípicos indicam uma maior variabilidade genética entre os acessos de coqueiros-gigantes introduzidos oriundos da região do Pacífico. A análise da estrutura gênica levou a formação de cinco grupos e os acessos coletados no Brasil apresentaram relação genética com o acesso Africano e o surgimento de ecótipos de coqueiro-gigante no Brasil. A análise de agrupamento pelo método do Vizinho mais Próximo formou dois grupos principais. No grupo I, os acessos foram agrupados em três subgrupos: Ia (GTG, GRT e GPY), Ib (GRL e GVT) e Ic (GML). No grupo II, os acessos foram separados em dois subgrupos : IIa (GOA) e IIb (GBrMe, GBrPF). Indicando que as relações genéticas dos acessos são fundamentadas nas regiões ecogeográficas. O terceiro trabalho,o estudo da diversidade genética, por meio de marcadores morfoagronômicos utilizando técnicas de análises uni e multivariadas, foi observada variabilidade genética entre os acessos. Os resultados da análise dos componentes principais, obtidos a partir de 16 caracteres morfoagronômicos mostra que foram necessários três componentes, para que a variância por eles explicada atingisse um mínimo de 80% e a seleção de seis caracteres de maior contribuição para o estudo da diversidade. Pelo método UPGMA formou-se cinco grupos. O grupo I reúne os acessos GVT e GML; o grupo II com o GPY, GTG e GBrPF; o grupo III e IV com apenas um acesso cada, GRT e o GOA, respectivamente e o grupo V com o GBrMe e GRL. Os grupos apresentaram uma incoerência com relação às origens dos acessos, provavelmente devido à natureza quantitativa das características avaliadas, que são controladas por muitos genes, sendo afetadas por fatores ambientais. As avaliações da diversidade e da estruturação genética evidenciam a variabilidade e as relações genéticas existentes em coqueiro-gigante. Esses resultados permitirão orientar as decisões sobre as atividades de conservação e uso do germoplasma do coqueiro no país / 2017-01-04

Submitted by Cássia Santos (cassia.bcufg@gmail.com) on 2016-12-20T10:33:59Z No. of bitstreams: 2 Tese - Gisele Aparecida Felix - 2016.pdf: 1558360 bytes, checksum: 761cc39345caea8787f3f1e6a9816a8c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Approved for entry into archive by Luciana Ferreira (lucgeral@gmail.com) on 2016-12-27T12:47:48Z (GMT) No. of bitstreams: 2 Tese - Gisele Aparecida Felix - 2016.pdf: 1558360 bytes, checksum: 761cc39345caea8787f3f1e6a9816a8c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-27T12:47:48Z (GMT). No. of bitstreams: 2 Tese - Gisele Aparecida Felix - 2016.pdf: 1558360 bytes, checksum: 761cc39345caea8787f3f1e6a9816a8c (MD5) license_rdf: 0 bytes, checksum: d41d8cd98f00b204e9800998ecf8427e (MD5) Previous issue date: 2016-06-24 / Conselho Nacional de Pesquisa e Desenvolvimento Científico e Tecnológico - CNPq / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / Outro / Trichology is a method to analyze micro-structural patterns of scarf-skin scales arrangements and medullary cells found in mammals guard hair. The present study was conducted to identify Caracu, Curraleiro Pé-Duro, Pantaneiro and Nellore bovine breeds by trichological morphology and morphometry, as well as validate the technique compared with genetic characterization. This study was presented in chapters. First, a review on trichology application on mammal species and breeds identification with basic concepts necessary for understanding trichology analysis and its applications. The second chapter was composed by characterization of guard hair of Caracu, Curraleiro Pé-Duro and Pantaneiro (Bos taurus taurus) and of Nellore (Bos taurus indicus), Brazilian bovine breeds, through trichology analysis, to assess the possibility of using this technique as a racial marker. Morphological and morphometric descriptions were held by 160 cattle (40 animals/breeds). Sub-samples of each bovine were made until quality slides were obtained. Morphology was determined through dichotomous keys and measures were carried out in the cuticle scale and in the hair shield matrix. Results indicated that trichology and genetic evaluation were similar in the point of view of classification of individuals within racial groups. Therefore, the technique can be considered useful as a marker for bovine breeds. / A tricologia é um método que permite analisar os padrões microestruturais de arranjos de escamas cuticulares e células medulares encontradas em pelos guarda de mamíferos. O presente estudo foi conduzido com o objetivo de identificar as raças bovinas Caracu, Curraleiro Pé-Duro, Pantaneiro e Nelore por meio da morfologia e morfometria tricológica, bem como validar a técnica comparando com resultados da caracterização genética. Esse estudo foi apresentado em forma de capítulos, com uma revisão de literatura sobre a aplicação da tricologia na identificação de espécies de mamíferos e de raças de interesse zootécnico, onde foram disponibilizadas informações sobre os conceitos básicos necessários ao entendimento da análise tricológica e suas aplicações. O capítulo seguinte foi composto pela caracterização de pelos guarda das raças bovinas Caracu, Curraleiro Pé-Duro e Pantaneiro (Bos taurus taurus) e da raça Nelore (Bos taurus indicus), por meio de análise tricológica, a fim de avaliar a possibilidade de uso desta técnica como marcador racial. Realizaram-se descrições morfológicas e morfométricas dos pelos de 160 bovinos (40 animais/raça). De cada bovino foram feitas subamostras de pelos até serem obtidas lâminas de qualidade. A morfologia foi determinada por meio de chave dicotômica e as medidas foram realizadas na escama cuticular e na medula e os resultados dessa metodologia foram comparados à caracterização genética dos animais amostrados. Os resultados indicaram que a tricologia e a avaliação genética foram similares no ponto de vista de classificação dos indivíduos dentro dos grupos raciais. Portanto, a técnica pode ser considerada útil como marcador racial para raças bovinas.