Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2013-07-16T02:57:05Z (GMT). No. of bitstreams: 0 / Este trabalho apresenta os resultados do desenvolvimento e caracterização de marcadores microssatélites para Araucaria angustifolia a partir de bibliotecas genômicas enriquecidas para seqüências microssatélites (SSR). O trabalho envolveu clonagem de segmentos genômicos, transformação bacteriana, sequenciamento de clones, desenho de iniciadores específicos e otimização de marcadores. A triagem dos iniciadores foi feita utilizando-se inicialmente quatro indivíduos em gel de agarose 2%. Para a otimização foram utilizados 16 indivíduos de 5 diferentes populações em gel de poliacrilamida 4%, com detecção em nitrato de prata. Foram obtidos 29 marcadores microssatélites inéditos para Araucaria angustifolia, com a possibilidade de utilização imediata. Os marcadores desenvolvidos revelaram elevada heterozigosidade esperada para os locos, com uma detecção média de 8,1 alelos por loco. Os marcadores microssatélites demonstraram elevado conteúdo informativo para os estudos de diversidade genética e discriminação genotípica de indivíduos. As sequências originais contendo regiões microssatélites foram depositadas no GenBank (NCBI - National Center for Biotechnology Information). Um estudo de diversidade genética e estrutura de duas populações naturais de Araucaria angustifolia foi desenvolvido utilizando-se locos microssatélites específicos desenvolvidos para a espécie. Para realizar a genotipagem das duas populações: Guamirim Gateado e Parque Ecológico de Lages, foram utilizados dois sistemas de detecção alélica colorimétrico baseado em nitrato de prata, aplicado a sete locos microssatélites e outro com detecção por fluorescência aplicado a nove locos microssatélites. Os resultados mostram que, grande parte da variabilidade genética observada nas duas populações encontra-se dentro das populações e não entre as populações. As análises feitas a partir de genotipagens em sistema com nitrato de prata, superestimaram os valores de heterozigosidade. O sistema de detecção fluorescente mostrou-se necessário quando os marcadores microssatélites são baseados em seqüências de di-nucleotídeo, pois facilitam a análise em sistema "multiplex" utilizados na mesma reação de amplificação e/ou analisados conjuntamente na mesma eletroforese, propiciando redução de gastos e maior confiabilidade nos resultados devido à leitura automática do sistema, baseado no marcador de tamanho de fragmento conhecido. As comparações das análises populacionais feitas nos distintos sistemas de detecção revelaram que o sistema de detecção com fluorescência, é significativamente mais preciso devido à presença de bandas fantasmas, formadas pela separação das duas fitas de DNA durante a eletroforese, detectadas nas análises com nitrato de prata. Diferenças estatisticamente significativas entre os valores de heterozigosidade das duas populações estudadas foram obtidas com marcadores isoenzimáticos, fato este que não foi confirmado com o uso de marcadores microssatélites (0,87 e 0,86 para He e de 0,59 e 0,58 para Ho, respectivamente). Marcadores isoenzimáticos revelaram diferença estatística na estrutura genética entre as duas populações. No estudo com marcadores microssatélites não foi detectada divergência significativa entre as duas populações estudadas (FST=0,023). (Instituição financiadora: FAO - Food and Agriculture Organization of the United Nations/Ministério do Meio Ambiente).

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais / Made available in DSpace on 2012-10-22T12:36:47Z (GMT). No. of bitstreams: 1 228958.pdf: 3083548 bytes, checksum: 8a823dc11e77d06c616b1a82b8b32893 (MD5) / O presente trabalho teve como objetivo estudar os sistemas de conhecimento formal e informal envolvidos no manejo e conservação da agrobiodiversidade no oeste de Santa Catarina. Fez-se necessário entender a construção dos processos de experimentação praticados por agricultores familiares, bem como avaliar os diferentes níveis de interação existentes entre os sistemas de conhecimento destes agricultores (informal) e dos pesquisadores (formal). Partindo desta compreensão, também se objetivou a proposição de estratégias metodológicas complementares de conservação e desenvolvimento participativo das variedades, e ainda, de políticas públicas de pesquisa e extensão rural voltadas à conservação da agrobiodiversidade. A pesquisa foi realizada nos municípios de Anchieta e Guaraciaba. No primeiro, pela existência há vários anos de um programa participativo de apoio ao manejo e conservação da agrobiodiversidade estruturado com o uso de metodologias formais. No segundo, por não possuir uma política prévia de apoio à agrobiodiversidade local e nem articulação com o sistema formal de pesquisa. Nesta diferença, detectada a priori, residia o pressuposto de que o sistema local de manejo da agrobiodiversidade de cada um destes municípios teria características marcantes diferentes, apesar das similaridades socioeconômicas e ambientais. Utilizou-se quatro componentes de pesquisa: diagnóstico participativo do sistema de conhecimento informal de sete famílias de agricultores (três de Guaraciaba e quatro de Anchieta) em relação às espécies milho feijão, arroz e batata-doce; estudo do processo de avaliação de variedades locais de milho por parte de sete grupos de agricultores (três de Guaraciaba e quatro de Anchieta); estudo de uma dinâmica de priorização de características de seleção de milho; e, avaliação de 62 famílias meio-irmãos da variedade local de milho MPA 01 por parte de agricultores de Anchieta, de Guaraciaba e pesquisadores do Núcleo de Estudos em Agrobiodiversidade da Universidade Federal de Santa Catarina. Os resultados revelaram que os agricultores participantes da pesquisa conservam, dinamicamente, considerável estoque de diversidade, sendo que para tanto, utilizam estratégias locais informais, muitas vezes complementadas por conhecimentos formais comunitariamente crioulizados. No caso de Anchieta, o impacto causado pelas políticas de apoio foi significativo no aumento e revalorização da agrobiodiversidade. A experimentação e o intercâmbio de conhecimentos são freqüentes nas famílias e nos sistemas informais, sendo que em relação a cada espécie e à cada família de agricultores são observados alguns aspectos particulares. Detectou-se compatibilidade entre a avaliação visual de famílias de meio-irmãos realizadas pelos agricultores e aquela feita pelos pesquisadores do NEABio dentro da metodologia científica. Isto poderá imprimir mais efetividade aos processos de pesquisa participativa, bem como aproximar as diferentes estratégias que visem o uso sustentável e a conservação da agrobiodiversidade.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias. Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais. / Made available in DSpace on 2012-10-24T11:44:27Z (GMT). No. of bitstreams: 1 264568.pdf: 4180934 bytes, checksum: 773d5f518ce2cc4ff756ec9ce83201ab (MD5) / Este estudo caracteriza o conhecimento local e a variação fenotípica e genética associados à Acca sellowiana, com vistas a avançar no conhecimento sobre o processo de domesticação da espécie, favorecer a elaboração de estratégias de conservação on-farm, bem como estimular a implementação de um programa de melhoramento genético participativo. Foram utilizadas duas abordagens: a primeira objetivou caracterizar o conhecimento local associado à espécie, em especial as estratégias de uso e manejo, e os informantes detentores deste conhecimento. Para tanto, foram utilizadas entrevistas semi-estruturadas e observação direta junto a informantes dos municípios catarinenses de São Joaquim, Urubici e Urupema. A segunda abordagem objetivou a caracterização da diversidade fenotípica e genética de plantas de A. sellowiana manejadas e/ou mantidas nas propriedades dos informantes, de plantas coletadas em área de ocorrência natural e daquelas mantidas no Banco Ativo de Germoplasma (BAG). Para a caracterização fenotípica foram utilizados seis descritores qualitativos e três descritores quantitativos; enquanto que para a caracterização genética foram empregados 12 marcadores microssatélites. Como resultado da primeira abordagem, está a constatação da presença de conhecimento associado à A. sellowiana, o qual pode ser utilizado em estratégias de melhoramento genético e conservação. Com base na intensidade de uso e manejo, os 56 informantes entrevistados foram caracterizados como mantenedores (n=32), manejadores (n=10), cultivadores (n=7) e usuários (n=7). Dentre as atividades de uso, o medicinal recebeu o maior número de citações (n=39); para as atividades de manejo, a atividade de poda recebeu o maior número de citações (n=36). Destaca-se também a necessidade da realização de estudos sobre aspectos relevantes ainda não devidamente explorados, como por exemplo, a necessidade de entender as perspectivas sociais e principalmente culturais que mantêm o uso da espécie incipiente, e demais aspectos relacionados à biologia e manejo da espécie. Com relação à segunda abordagem, com o emprego de descritores qualitativos apenas os descritores coloração de polpa e inserção de sépalas permitiram verificar diferenças significativas entre os grupos. Com base nos descritores quantitativos foi possível verificar ampla distribuição das plantas dos três grupos, sugerindo que existe a possibilidade de seleção de plantas de alto potencial mantidas pelos informantes, bem como o papel da área de ocorrência natural como fonte de diversidade. Todavia, o desempenho agronômico dos acessos oriundos do BAG foi superior, possivelmente devido aos tratos culturais e seleção praticados. Para a realização da caracterização genética foram desenvolvidos e caracterizados os 13 primeiros pares de iniciadores microssatélites para A. sellowiana, dos quais 12 apresentam-se informativos (com média de 11 alelos por loco) e passíveis de uso no estudo da diversidade genética dos grupos. O fato de ter sido observada alta diversidade, o índice médio de fixação foi de apenas 0,059, e a presença de alelos exclusivos para os grupos estudados, fazem com que estratégias de conservação in situ, on-farm e ex situ tenham importante papel na manutenção de variabilidade genética. A presença da alta diversidade e de potencial agronômico em plantas mantidas em propriedades dos informantes e de conhecimento local associado, favorece a implementação de estratégias de pesquisa participativa complementares ao atual processo de domesticação da espécie. Como primeiros passos, neste sentido sugerem-se a organização dos agricultores e a formalização de uma rede multidisciplinar permanente de pesquisa em A. sellowiana.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T17:58:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 326987.pdf: 2902981 bytes, checksum: 8382373a82310d299344bd119b5caaa5 (MD5) Previous issue date: 2014 / O nitrogênio é um nutriente essencial no crescimento e desenvolvimento das plantas. A habilidade da planta em suprir a necessidade de nitrogênio necessária pode vir da fixação biológica de nitrogênio (FBN), através de interações com bactérias diazotróficas associativas. Azospirillum brasilense, que coloniza a rizosfera, e Herbaspirillum seropedicae, capaz de colonizar tecidos internos, são exemplos de bactérias benéficas que se associam com raízes de gramíneas de importância agrícola e econômica. O processo de interação planta-bactéria envolve diversos processos que ainda não estão totalmente elucidados. No presente trabalho foram avaliados parâmetros de crescimento e a regulação transcricional de 10 genes em plântulas de milho (Zea mays) inoculadas com H. seropedicae SmR1 1, 4, 7 e 10 dias após inoculação (DAI). Foi observado um aumento no número de raízes laterais das plantas com 7 e 10 DAI. Aumento significativo, foi observado na quantificação de transcritos dos genes Zmko1 e ZmrbohC em raízes das plantas inoculadas com H.seropedicae aos 4 DAI. Deste modo concluímos que Herbaspirillum seropedicae SmR1 presente nas raízes de milho pode alterar a expressão do gene Zmko1 que esta envolvido na biossíntese de giberelina bem como do gene ZmrbohC envolvido na resposta de burst oxidativo, no inicio da interação. Brachypodium distachyon tem sido proposto como sistema modelo de plantas C3, pois possui atributos atrativos como, por exemplo, baixa estatura, curto ciclo de vida e genoma sequenciado. A fim de selecionar um sistema modelo de gramíneas para estudos de interação planta-bactéria, foi realizada uma seleção utilizando 23 acessos de Brachypodium distachyon inoculados com Azospirillum brasilense e Herbaspirillum seropedicae crescidos em condições de baixo nitrogênio e/ou sem nitrogênio. Nos parâmetros de crescimento, 4 genótipos do tratamento sem nitrogênio e 3 genótipos tratados com baixo nitrogênio, responderam a pelo menos um dos parâmetros de crescimento avaliados em B. distachyon, A colonização externa e dos tecidos internos das raízes das plantas, foi visualizada utilizando cepas de bactérias marcadas. Deste modo pode-se concluir que as respostas aos parâmetros de crescimento em plantas de B. distachyon em associação com estas bactérias, são altamente variáveis quanto ao genótipo, no entanto B. distachyon é fortemente colonizada por A. brasilense e H. seropedicae. Investigamos as respostas fisiológicas e metabólicas relacionadas ao processo de interação planta-bactéria, além de medir o nitrogênio fixado e assimilado em plantas de S. viridis linhagem A10.1 crescidas sob baixo nitrogênio e comparadas a plantas com alta disponibilidade de nitrogênio. Utilizando radioisótopos de vida curta, num primeiro momento 11CO2, foi analisada a fixação, distribuição e alocação de CO2 em plantas inoculadas com A. brasilense e H. seropedicae crescidas com baixa disponibilidade de nitrogênio, bem como o perfil de açúcares e aminoácidos. Os resultados permitem concluir que plantas de S. viridis inoculadas com ambas as bactérias e baixa disponibilidade de nitrogênio demonstraram comportamento similar ao de plantas supridas com nitrogênio para os parâmetros analisados. Por fim, utilizando 13N2 observaram-se evidências de nitrogênio fixado em plantas de S. viridis inoculadas com A. brasilense e H. seropedicae crescidas em condições de baixo nitrogênio.<br> / Abstract : Nitrogen is an essential nutrient in plant growth. The ability of the plant to supply the required amount of nitrogen can come from biological nitrogen fixation (BNF), through interactions with diazotrophic bacteria. Azospirillum brasilense, which colonize the rhizosphere, and Herbaspirillum seropedicae, able to colonize the internal tissues, are examples of beneficial bacteria that associate with roots of grasses with agricultural and economic importance. The plant - bacterium interaction involves several processes that still unclear. In this work the growth parameters and transcriptional regulation of 10 genes were evaluated in maize seedlings (Zea mays) inoculated with H. seropedicae SmR1 at 1, 4, 7 and 10 days after inoculation (DAI). An increase was observed in lateral roots number of the plants with 7 and 10 DAI. Significant increase was observed in the transcripts level of Zmko1 and ZmrbohC genes in maize roots plant inoculated with H.seropedicae at 4 DAI. In conclusion, Herbaspirillum seropedicae SmR1 present in maize roots can influence the expression of Zmko1 gene that is involved in the gibberellins biosynthesis and also the expression of ZmrbohC gene involved in burst oxidative response at the beginning of the interaction. Brachypodium distachyon has been proposed as a model system of C3 plants. It has attractive features such as short stature, short life cycle and sequenced genome. In order to select a grass model for plant - bacterium interaction system, we screened 23 accessions of Brachypodium distachyon inoculated with Azospirillum brasilense and Herbaspirillum seropedicae. The plants were grown under no nitrogen or low nitrogen condition. In growth parameters, four genotypes under no nitrogen and three genotypes under low nitrogen condition, showed positive responses at least for one of the analyzed parameters. External and internal roots colonization tissues of plant were visualized using labeled bacteria strains. The growth parameters responses in B. distachyon plants associated with A. brasilense and H. seropedicae were highly variable to the different genotypes, however B. distachyon was strong colonized by A.brasilense and H. seropedicae. We also investigated the physiological and metabolic responses related to the plant - bacterium interaction process, and measure the fixed nitrogen and photoassimilates in plants of Setaria viridis genotype A10.1 grown under low nitrogen and compared to plants grown under high nitrogen availability. Using short-lived radioisotopes, as 11CO2, at first was analyzed CO2 fixation, distribution and allocation in plants inoculated with A.brasilense and H. seropedicae grown under low nitrogen condition. Furthermore, were analyzed the sugars profile and amino acids pools. The results indicate that plants of S. viridis inoculated with both bacteria grown under low nitrogen condition demonstrated similar behavior to the plants supplied with normal nitrogen. Finally, using 13N2 was demonstrated evidence of fixed nitrogen in S. viridis plants inoculated with A.brasilense and H. seropedicae grown under low nitrogen condition.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T18:05:02Z (GMT). No. of bitstreams: 1 327726.pdf: 2295961 bytes, checksum: c15e851f205c598b58bb4eaa370c09f8 (MD5) Previous issue date: 2014 / O sequenciamento do genoma plastidial de coníferas vem sendo realizado por meio do isolamento do DNA total, seguido por amplificações do DNA plastidial através de PCR de longo alcance. Esse método de sequenciamento é mais trabalhoso do que o sequenciamento a partir DNA plastidial. O sequenciamento do genoma plastidial permite a realização de várias análises comparativas, como estudos filogenéticos, filogeografia, evolução e estrutura, localização de regiões repetidas, identificação de sítios de edição de RNA, entre outras. Dessa forma, o presente trabalho visou desenvolver um protocolo de isolamento de cloroplastos e DNA plastidial em coníferas e sequenciar o genoma plastidial do Podocarpus lambertii. O protocolo foi desenvolvido a partir da Araucaria angustifolia e Araucaria bidwilli (Araucariaceae), P. lambertii (Podocarpaceae) e Pinus patula (Pinaceae). O protocolo se baseia no isolamento plastidial a partir de um tampão salino, seguido por gradiente salino de Percoll. Essas duas estratégias combinadas, reduziram a contaminação e aumentaram o rendimento do DNA plastidial. O DNA plastidial foi sequenciado em sequenciador Illumina MiSeq, obtendo-se uma cobertura média do genoma de: 24,63 para A. angustifolia, 135,97 para A. bidwilli, 1196,10 para P. lambertii e 64,68 para P. patula. O genoma plastidial do P. lambertii é formado por 133.734 pb e apresentou a perda de uma das regiões invertidas repetidas. O genoma contém 118 genes únicos e 1 tRNA duplicado (trnN-GUU). Estruturalmente, o genoma plastidial do P. lambertii apresenta quatro grandes inversões de aproximadamente 20.000 pb quando comparado ao Podocarpus totara. O genoma plastidial do P. lambertii apresenta um total de 28 repetições em tandem e 156 simple sequence repeat (SSRs). Os resultados obtidos são inovadores uma vez que um protocolo viável para o isolamento de DNA plastidial de coníferas com alta qualidade e quantidade de DNA foi obtido. Adicionalmente, a sequência do genoma plastidial do P. lambertii revelou diferenças estruturais significativas, mesmo em relação à outra espécie do mesmo gênero. Os diversos SSRs encontrados no genoma plastidial do P. lambertii podem ser avaliados como regiões polimórficas intraespecíficas, que podem levar, entre outros, a estudos filogenéticos com maior sensibilidade.<br> / Abstract : Plastid genome sequencing protocols for conifer species have been based mainly on long-range PCR, which is known to be time-consuming and difficult to implement than sequencing from isolated plastid DNA. Plastid genome sequencing are useful for several comparative analyzes, as phylogeny, phylogeography, evolution and structure, location of repeated regions, identification of RNA editing sites, among others. Thus, this study aimed to develop a protocol for chloroplast and plastid DNA isolation in conifers and sequence the chloroplast genome of Podocarpus lambertii. The protocol was developed using Araucaria angustifolia and Araucaria bidwilli (Araucariaceae), P. lambertii (Podocarpaceae) and Pinus patula (Pinaceae) species. The protocol is based on plastid isolation with saline buffer followed by saline Percoll gradient. These two combined strategies reduced contamination and increased the plastid DNA yield. The plastid DNA was sequenced in MiSeq Illumina sequencer, and the average genome coverage were 24.63 to A. angustifolia, 135.97 to A. bidwilli, 1196.10 to P. lambertii, and 64.68 to P. patula. The chloroplast genome of P. lambertii is 133.734 bp in length and lacks one of the inverted repeat regions. The genome contains 118 unique genes and one duplicated gene, the tRNA (trnN-GUU). Structurally, the plastid genome of P. lambertii shows four large inversions of approximately 20,000 bp compared to Podocarpus totara. The plastid genome of P. lambertii shows a total of 28 tandem repeats and 156 simple sequence repeat (SSR). Results show that this improved protocol is suitable for enhanced quality and yield of chloroplasts and cpDNA isolation from conifers. Additionally, the sequence of the plastid genome of P. lambertii revealed significant structural differences, even in relation to other species of the same genus. The various SSRs found in the plastid genome of P. lambertii can be evaluated for intraspecific polymorphic regions, which may allow highly sensitive phylogeographic and population structure studies, as well as phylogenetic studies of species of this genus.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T18:05:06Z (GMT). No. of bitstreams: 1 327441.pdf: 1029331 bytes, checksum: ed98a015aebda97cf6ecf74163b0c133 (MD5) Previous issue date: 2014 / As doenças míldio (Plasmopara viticola) e oídio (Erysiphe necator) são um sério problema para os produtores de V. vinifera. Explorar a resistência genética a estas doenças é uns dos maiores objetivos nos programas de melhoramento genético. O presente trabalho teve por objetivo identificar e selecionar via SAM (Seleção assistida por marcadores moleculares) plantas de videira contendo os locos de resistência contra o míldio (Rpv1 e Rpv3) e o oídio (Run1 e Ren3) piramidados e em homozigose, para utilizá-las em novos ciclos de cruzamento. Foram analisadas as populações experimentais de videira UFSC-2013-1 e UFSC-2013-2 provenientes das linhas de melhoramento 2000-305-134 (uvas tintas) e 2000-305-97 (uvas brancas) que apresentam os locos de resistência Rpv1/Run1, Ren3 e Rpv3 piramidados e em heterozigose. As 637 plantas das duas progênies F2 foram genotipadas com seis marcadores microssatélites ligados aos locos de resistência. Para a análise de segregação foi utilizado o teste ?2. Nas duas populações estudadas observou-se distorção na segregação com os marcadores microssatélites ligados aos locos de resistência Rpv1/Run1, localizados no cromossomo 12. Para o míldio, foram encontradas 300 plantas (48,2%) apresentando os dois locos de resistência piramidados sendo que, destas, 10 plantas carregam os locos de resistência em homozigose. Na avaliação fenotípica o menor valor médio de esporangióforos/disco foi observado nas plantas contendo os dois locos de resistência ao míldio em homozigose (4,9). Para o oídio a genotipagem permitiu identificar 311 plantas (50,5%) apresentando os dois locos de resistência piramidados; destas sete plantas exibiram os dois alelos em homozigose. Na avaliação geral foram encontradas 27 combinações genéticas, onde 231 plantas (38,2%) apresentaram os quatro locos de resistência (Rpv1/Run1, Ren3, Rpv3) piramidados. Foi identificada uma planta carregando os alelos de resistência em homozigose em todos os locos e nove plantas que apresentaram os dois locos de resistência para o míldio em homozigose e para o oídio um loco em homozigose e outro em heterozigose. Estas plantas apresentam extrema importância para o melhoramento genético da videira, pois ao ser utilizada em novos cruzamentos com variedades de importância econômica para o Brasil, todas as progênies obtida apresentarão resistência piramidada para as duas doenças.<br> / Abstract : The diseases downy mildew (Plasmopara viticola) and powdery mildew (Erysiphe necator) are a serious problem for producers of V. vinifera. Exploring the genetic resistance to these diseases is a major objective in breeding programs. This study is aimed to identify and select via Marker Assisted Selection (MAS), grape plants containing resistance alleles at distinct the loci against downy mildew (Rpv1 and Rpv3) and powdery mildew (Run1 and Ren3) pyramided and homozygous, to be used in new cycles of crossing. Two experimental populations of grapes were analized, UFSC-2013-1 and UFSC-2013-2, both derived from the breeding lines 2000-305-134 (red wine grape) and 2000-305-97 (white grape) that carry resistance loci against both diseases Rpv1/Run1, Ren3 and Rpv3 pyramided and heterozygous. The 637 plants from two F2 progenies were genotyped with six microsatellite markers linked to the resistance loci. The segregation analysis by the ?2 test revealed distorted segregation at microsatellite loci, which are linked to resistance loci Rpv1/Run1, located on chromosome 12. For downy mildew, 300 plants were found (48.2%) showing the two resistance loci pyramided and, from these, 10 plants carried homozygous loci for resistant alleles. Results from phenotypic evaluation showed the lower mean sporangiophores per disc in plants containing both resistance loci, to downy mildew, in homozygous conditions (4.9). For powdery mildew the genotyping allowed us to identify 311 plants (50.5%) that presented resistant alleles at the two pyramided loci, from which, seven plants exhibited homozygous alleles at both loci. Overall, there were found all the 27 genotypic combinations (since two loci are linked), being 231 plants (38.2%) showing resistant alleles at the four loci (Rpv1/Run1, Ren3 and Rpv3) pyramided. One plant was identified carrying resistant alleles at all loci in homozygous conditions and nine plants with two homozygous loci for downy mildew and for powdery mildew one homozygous loci and other heterozygous.These plants are extremely important for the genetic improvement of the vine, they will be used in new crosses with varieties of economic importance to Brazil, because all obtained progeny will present pyramided resistance to the both diseases.

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2014-08-06T18:08:05Z (GMT). No. of bitstreams: 1 326997.pdf: 1462184 bytes, checksum: 9704fb583c742c6f8d898e2911052150 (MD5) Previous issue date: 2014 / O Estado de Santa Catarina tem se destacado no cenário nacional pelo potencial na produção de vinhos finos de qualidade, em função da altitude. No entanto, algumas regiões de Santa Catarina, como o município em estudo, Rancho Queimado, apresentam elevada pluviosidade no período de maturação e colheita, além de riscos de ocorrência de geadas e granizos, o que compromete a qualidade da uva. A cobertura plástica dos vinhedos surge como uma opção para o controle destas adversidades climáticas, principalmente, para evitar a ação do excesso de precipitação durante a maturação das uvas. No entanto, a utilização e o conhecimento desta técnica é incipiente em uvas destinadas à vinificação. Portanto, é importante a caracterização climática e a definição dos parâmetros ecofisiológicos de vinhedos sob cobertura para que seja explorado ao máximo o potencial vitícola e enológico destes locais. O objetivo desse trabalho foi avaliar as influências microclimáticas estabelecidas pela cobertura plástica sobre a fisiologia, o potencial produtivo e a qualidade vitienológica da videira (Vitis vinifera L.). As variedades avaliadas foram Sauvignon Blanc, Cabernet Sauvignon e Merlot, no município de Rancho Queimado-SC (altitude de 1000 metros, latitude de 27°42' 26" S, longitude 49°04' 17? W), durante os ciclos 2011/2012 e 2012/2013. O vinhedo foi implantado no ano de 2009 em sistema de condução espaldeira, sobre porta-enxerto Paulsen 1103, com espaçamento de 3,0 m x 1,0 m. As variáveis climáticas avaliadas foram: temperatura do ar (ºC); precipitação pluviométrica (mm); umidade relativa do ar (%); radiação solar global (Wm-2) e radiação fotossintética ativa (µmol fótons m-2s-1). As análises ecofisiológicas compreenderam as avaliações fenológicas entre a brotação e a colheita, área foliar, teores foliares de clorofila, avaliação das trocas gasosas e rendimento. Na colheita foram avaliados o teor de sólidos solúveis totais, acidez total titulável, pH, índice de polifenóis totais e antocianinas manoméricas totais, trans-resveratrol, catequina e epicatequina. Com relação à temperatura, as máximas diárias são as que mais sofrem influência do uso da cobertura plástica, com aumento em média de 2?C. As médias das temperaturas máximas, mínimas e médias, assim como a amplitude térmica e o somatório térmico em graus-dia são superiores no vinhedo coberto quando comparados ao descoberto. Enquanto que a radiação global, a radiação fotossinteticamente ativa, a umidade relativa do ar e a precipitação pluviométrica foram maiores no vinhedo descoberto. A presença da cobertura plástica reduz em 28% a radiação fotossinteticamente ativa incidente sobre o dossel vegetativo, e em 32% a radiação solar global em todo o ciclo da videira. Devido ao aumento no somatório de graus-dia, a cobertura plástica sobre o vinhedo antecipou o início da brotação e demais eventos fenológicos até a mudança de cor das bagas. Entretanto, a redução da radiação solar proporcionou o prolongamento do processo de maturação das uvas. Uvas das variedades Cabernet Sauvignon e Merlot produzidas na área coberta apresentaram menores teores de acidez e maiores teores de sólidos solúveis totais, pH, polifenóis totais, catequinas e epicatequinas. Uvas cobertas de Merlot apresentram maiores teores de antocianinas manoméricas totais e de resveratrol. Houve incremento no teor de sólidos solúveis totais em uvas Sauvignon Blanc sob cobertura plástica. O teor de resveratrol foi reduzido em uvas das variedades Cabernet Sauvignon e Sauvignon Blanc cobertas, enquanto o conteúdo de catequinas e epicatequinas foram superiores em comparação as uvas do vinhedo descoberto. As uvas produzidas a partir do vinhedo coberto apresentam melhor qualidade do que em céu aberto, como consequência da melhor sanidade dos cachos. Os resultados obtidos na avaliação das trocas gasosas sugerem que o processo fotossintético foi beneficiado pelo microclima propiciado pela cobertura, e isto foi refletido na maior produtividade das plantas. Houve aumento das concentrações dos pigmentos nas folhas de plantas cobertas das variedades Cabernet Sauvignon na fase de maturidade e Sauvignon Blanc no ciclo 2012/13. As plantas cobertas das três variedades avaliadas mantiveram suas folhas cerca de 28 dias a mais do que as plantas descobertas. A presença da cobertura plástica aumenta a produtividade das variedades Cabernet Sauvignon em 54% e Sauvignon Blanc em 30%. E melhora a relação área foliar:produtividade de todas as variedades avaliadas.<br> / Abstract : In last years viticulture in high altitude regions of Santa Catarina State has been highlighted for producing wines of unique quality in Brazil. Some regions of Santa Catarina State, as the city under study, Rancho Queimado, have high rainfall in maturation and harvest period, as well as risk of occurrence of frosts and hail, which compromises grape quality. The plastic cover is an option to control weather adversities especially to avoid excessive rainfall during the grape ripening. However, the use and knowledge of this technique is incipient to grapes for winemaking. The objective of this study was to evaluate the microclimate influences established by the plastic cover on the physiology, production potential and enological quality of the vine (Vitis vinifera L.). The varieties evaluated were Sauvignon Blanc, Cabernet Sauvignon and Merlot in the city of Rancho Queimado - Santa Catarina State (latitude 27 ° 42 '26 "S, longitude 49 ° 04' 17" W, altitude 1,000 meters), during seasons 2011/2012 and 2012/2013. The vineyard was planted in 2009, trained in vertical shooting positioning trellis, grafted on 1103P and spacing 3.0 x 1.0 m. Climatic data evaluated were precipitation (mm), relative humidity (%), maximum, air temperature (°C), global radiation (Wm-2) and photosynthetically active radiation (µmol photons m-2s-1). Ecophysiological analyzes were: phenological assessments between budbreak and maturity, leaf area, leaf chlorophyll content, leaf gas exchanges and yield. At harvest were evaluated total soluble solids, total acidity, pH, total polyphenols, total monomeric anthocyanins, trans-resveratrol, catechin and epicatechin. Regard to temperature, daily maximum suffers the greatest influence by the use of plastic cover, with an average increase of 2°C. The maximum, minimum and mean temperatures as well as thermal amplitude and heat summation (growing degree-days) are higher in the covered vineyard. While global radiation, photosynthetically active radiation, relative humidity and precipitation are higher in the uncovered vineyard. Due to the increase in the heat summation, the plastic cover antecipates budbreak and other phenological events until veraison. However, the reduction of solar radiation prolong the maturation process. Cabernet Sauvignon and Merlot produced under plastic cover present lower acidity and higher total soluble solids, pH, total polyphenols and catechins. Merlot produced under plastic cover presents higher contents of total monomeric anthocyanins and trans-resveratrol. Sauvignon Blanc under plastic cover presents higher contents of total soluble solids. The resveratrol content is reduced in covered Cabernet Sauvignon and Sauvignon Blanc, while the content of catechins and epicatechins are higher in the uncovered vineyard. The presence of the plastic cover reduces 28% of photosynthetically active radiation incident on the canopy, and 32% of global solar radiation throughout the cycle of the vine. The grapes produced in the covered vineyard have better quality as a result of better cluster sanity. The plastic cover influences vine phisiology. The results obtained in the evaluation of leaf gas exchange suggest that the photosynthetic process is benefited by the microclimate afforded by the cover, and this is reflected in higher plant yield. The plastic cover also increases the pigments concentrations in the leaves of Cabernet Sauvignon and Sauvignon Blanc (season 2012/13). The plants covered from the three varieties keep their leaves about 28 days longer than the uncovered ones. The plastic cover increases 54% of Cabernet Sauvignon yield and 30% of Sauvignon Blanc yield. And also improves the leaf area:yield ratio of all tested varieties.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2014. / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:20:51Z (GMT). No. of bitstreams: 1 332314.pdf: 1573375 bytes, checksum: bff58997fb8a8d0eb5d2ed9710dc1790 (MD5) Previous issue date: 2014 / O mal-do-panamá, causado por Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), é uma doença endêmica em todas as regiões produtoras de banana, sendo citado como uma das seis doenças mais importantes de plantas cultivadas e responsável por grandes perdas econômicas. O cultivo da bananeira em Santa Catarina sofre com essa doença e uma das estratégias usadas no seu controle é a substituição das cultivares do subgrupo Prata, consideradas suscetíveis ao fungo, pelas cultivares do subgrupo Cavendish, devido a sua maior resistência. Nos últimos anos, no entanto, essa estratégia vem sendo questionada em função da ocorrência de focos de Foc nos bananais de cultivares do subgrupo Cavendish. Tendo em vista a importância da bananicultura no Sul do Brasil, região subtropical, a constatação do avanço da doença e o aumento de focos do mal-do-panamá em bananais de cultivares do subgrupo Cavendish nessa região, este trabalho teve como objetivo caracterizar isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense coletados de cultivares de bananeira dos subgrupos Prata e Cavendish e desenvolver um marcador SCAR associado à suscetibilidade ao mal-do-panamá. Avaliou-se uma população de 152 isolados de Foc coletados em 13 regiões produtoras de banana do Estado de Santa Catarina por meio de características morfológicas, níveis de agressividade, utilização de marcadores moleculares microssatélites e intermicrossatélites (SSR, ISSR) e também pelo sequenciamento do fator de alongação TEF 1a. A patogenicidade foi confirmada para todos os isolados, e os critérios morfológicos confirmaram a identidade do fungo. Em relação aos níveis de agressividade, foi possível classificar os isolados em três grupos distintos, considerados como pouco agressivo moderadamente agressivo e agressivo. Quando utilizamos as técnicas moleculares, observou-se que os resultados de ISSR, SSR e sequenciamento TEF 1a revelaram uma menor variação entre os isolados analisados, sendo que, a maioria apresentou 100% de similaridade interna. Entre esses marcadores, ISSR + SSR foi o mais polimórfico, sendo capaz de diferenciar mais indivíduos e com uma maior percentagem de dissimilaridade. Na segunda etapa desse trabalho, aplicando-se 78 iniciadores arbitrários em DNA genômico de genótipos resistentes e suscetíveis, uma banda de RAPD associada à susceptibilidade foi selecionada e usada para gerar o iniciador SCAR SuscPD-F/SuscPD-R. Este marcador foi validado em 28 cultivares de bananeira e os resultados indicaram um elevado grau de especificidade do marcador, o qual foi capaz de discriminar entre os dois grupos de contraste resistentes ou suscetíveis com um poder12discriminatório de 93%. Os resultados obtidos poderão apoiar os trabalhos de melhoramento genético da cultura, acelerando a seleção e o desenvolvimento de cultivares com maior nível intrínseco de resistência às infecções e melhorias nas técnicas de controle à doença. Esse trabalho representa uma contribuição na caracterização de Foc e no estudo de resistência da bananeira em áreas subtropicais, onde há até o momento uma carência de resultados e ferramentas nesta área.

Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2014 / Made available in DSpace on 2015-02-05T20:42:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 329615.pdf: 3961925 bytes, checksum: 7e3a320e4decb889aa05d9dcd4fd5dd5 (MD5) Previous issue date: 2014 / No Brasil, a produção de pera é insuficiente para atender a demanda interna, gerando uma crescente necessidade de importação de frutas que podem ser produzidas nas regiões mais frias. Por isso, a pera é a fruta fresca importada em maior quantidade pelo Brasil. Por ser alógama devido à incompatibilidade gametofítica, a maioria das cultivares europeias de pereiras não produzem frutos com sementes sem a presença de insetos polinizadores. Neste contexto, foram realizados ensaios buscando elucidar os aspectos da biologia reprodutiva da pereira portuguesa (Pyrus communis L. cv. Rocha) e suas cultivares polinizadoras, assim como avaliar a qualidade das colmeias destinadas à polinização. Os resultados mostraram que a fenologia das cvs. Rocha e suas polinizadoras diferiu entre elas e entre os anos, podendo afetar significativamente a polinização. A data aproximada da plena floração das cultivares estudadas foi similar em 2012 (? 17//09), porém, diferiu em 2013. Foi observado que a cv. Rocha polinizada com pólen de cultivares compatíveis apresentou elevada frutificação efetiva, chegando a atingir até 67,8% de frutificação efetiva sem a aplicação exógena de giberelina. Além disso, nestes frutos observou-se maior número de sementes (>5 sementes.fruto-1), o que acarretou frutos com melhores índices de qualidade comparativamente com outros tratamentos de polinização. A autopolinização promoveu a formação de frutos (10,9% de frutificação efetiva em 2012 e 1,66% em 2013), mas em quantidade e qualidade inferiores aos frutos oriundos de polinização cruzada. A partenocarpia natural foi observada na cv. Rocha, mas esta incapaz de sustentar produções comercialmente viáveis (4,16% de frutificação efetiva). A aplicação exógena de ácido giberélico mostrou ser uma opção para o aumento da frutificação efetiva através do estímulo da formação de frutos partenocárpicos, contudo foi observada uma variação na sua eficiência entre os anos (frutificação efetiva de 74,1% em 2012, reduzindo para 30,0% no ano seguinte) e a tendência da redução da qualidade dos frutos formados, os quais eram menores e mais alongados do que os frutos com sementes. A produção de néctar variou entre cultivares e entre os anos, mas sendo sempre considerados volumes pequenos (<3µL) e com baixo teor de sólidos solúveis totais (<20ºBrix), o que acarretou em baixa atratividade dos polinizadores (<1 abelha.árvore-1.minuto-1). No entorno do pomar foi observada uma forte competição floral com Mimosa scabrella e Piptocarpha angustifolia, as quais produzem néctar em maior quantidade e qualidade do que as pereiras. A polinização deficiente ficou evidenciada pela não deposição de pólen nos estigmas da cv. Rocha após visita legítima da flor por Apis mellifera, possivelmente devido à falta de plantas polinizadoras e à baixa densidade de colmeias no pomar. As colmeias utilizadas na polinização apresentaram variações populacionais entre os anos, observando-se uma redução significativa no número de favos cobertos com cria aberta e com reservas de mel de 2012 para 2013, o que resultou em menor atividade de abelhas campeiras forrageando no horário de voo máximo (100,8 abelhas entrando no alvado.minuto-1 em 2012 e 59,3 abelhas entrando no alvado.minuto-1 em 2013). Também foi constatada a presença do Varroa destructor (infestação de 1,89 e 1,45% em 2012 e 2013, respectivamente) e Nosema ceranae (712.500 esporos.abelha-1 em 2012).<br> / Abstract: In Brazil, the pear production is insufficient to supply the domestic demand, creating a growing market for imported fruits that can be produced in south Brazil. Due to this, Brazil's fresh pear imports grow every year. Since pears are alogamous due to gametophytic incompatibility, most European pear cultivars do not produce fruit with seeds without the presence of pollinating insects. In this context, experiments were conducted to elucidate the aspects of the reproductive biology of the Portuguese pear (Pyrus communis L. cv. Rocha) and their pollinating cultivars, as well as the quality of the hives used for orchard pollination. The results show that the phenology of cvs. Rocha and their pollinators differs between them and years, which may significantly affect pollination. The approximate date of full bloom of the cultivars was similar in 2012 (~=17/09) while differ in 2013. We observed that cv. Rocha pollinated with pollen from compatible cultivars showed a high fruit set, reaching up to 67,8% of fruit set without exogenous gibberellin application. Moreover, in these fruits was observed a greater number of seeds (> 5 seeds.fruit-1), which resulted in higher quality fruits (scores compared with other pollination treatments). Self-pollination produced some fruits (10,9% of fruit set in 2012 and 1,66% in 2013), but in lower quantity and quality when compared with cross-pollination. Natural parthenocarpy was observed in cv. Rocha, but it was unable to sustain commercially viable yields (4,16% of fruit set). The exogenous gibberellic acid application was an option for increasing fruit set by stimulating the formation of parthenocarpic fruits, however we observed a variation of it's efficiency between years (fruit set of 74,1% in 2012, decreasing to 30,0% in 2013) and showed a trend of reduced quality of formed fruits, which were smaller and more elongated than the fruit with seeds produced by cross-pollination. Nectar production varied among cultivars and years, but always being considered small volumes (<3µL) and whith low sugar content (<20ºBrix), which resulted in low attractiveness of pollinators (<1 bee.tree-1.minute-1). In the surrounding area of the orchard we observed strong competition with Mimosa scabrella and Piptocarpha angustifolia wich bear more and richer nectar. We observed poor natural pollination due to the non-pollen deposition on the stigmas of 'Rocha' after a legitimate flower visit by Apis mellifera, possibly due to lack of pollinating plants and low density of quality beehives in the orchard. The hives used for pollination showed a variation in their population between years, wich can be observed in the significant reduction in the number of combs covered with larvae and honey reserves from 2012 to 2013, resulting in lower activity of foraging bees in the period of maximum flight activity (100,8 foraging bees entering in the hive.minute-1 in 2012 and 59,3 foraging bees entering in the hive.minute-1 in 2013). We also observed the presence of Varroa destructor (infestation of 1.89 and 1.45% in 2012 and 2013, respectively) and Nosema ceranae (712.000 spores.bee-1 in 2012).

Dissertação (mestrado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2014 / Made available in DSpace on 2015-02-05T21:04:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 328845.pdf: 3297142 bytes, checksum: 27a2f1115c660c9e8bfe3202b21ce437 (MD5) Previous issue date: 2014 / A Podridão Amarga (PA) e a Mancha Foliar de Glomerella (MFG) estão entre as doenças de maior importância na cultura da macieira, pelo rápido progresso dos sintomas e elevada susceptibilidade da cultivar "Gala", uma das mais consumidas no mundo. O presente trabalho objetivou determinar os grupos de compatibilidade vegetativa (GCVs) de isolados brasileiros e uruguaios de Colletotrichum spp. de PA e MFG e monitorar a formação de tubos de anastomose conidial (TACs) in vitro e in vivo. OsGCVs foram determinados pelo pareamento em Meio Mínimo (MM) de mutantes defectivos na via de assimilação de nitrogênio. Os mutantes foram gerados em meio BDA+KClO3 e mantidos em MM. Os isolados foram classificados em mesmo GCV quando seu pareamento resultou na formação de heterocárion. Isolados de complexos ou espécies diferentes nunca perteceram ao mesmo GCV. Somente um isolado brasileiro de MFG foi incluido em mesmo GCV que isolados uruguaios de fruto Quatro e nove grupos foram encontrados dentre os isolados uruguaios e brasileiros, respectivamente. Em três GCVs, foram incluidos tanto isolados de PA quanto de MFG. Para monitorar o desenvolvimento de TACs e estruturas pré-infectivas, distribuiram-se gotas de 10 e de 20µL de supensão conidial (1x106 conídios/mL) sobre lâminas de poliestireno e superfície de folhas destacadas de macieira. O desenvolvimento foi examinado microscopicamente a cada duas horas de incubação a 25°C,entre 14 e 24h e após 48h, sobre poliestireno e folhas destacadas, respectivamente. O percentual e tempo de máxima germinação, formação e melanização de apressórios foram avaliados. Os TACs foram quantificados e categorizados conforme a conexão em três tipos: tubo-tubo(t-t), tubo-conídio (t-c) e conídio-conídio (c-c). Isolados de Colletotrichum gloeosporioides apresentaram elevada germinação e formação mais precoce de apressórios melanizados. As conexões do tipot-t foram encontradas em menor frequência, para todos os isolados testados. As conexões do tipo c-c foram as mais frequentes em isolados de Colletotrichum acutatum. Dentres todos os isolados analisados, os que apresentaram maior percentual de conexões t-t, também formaram mais t-c. Isolados de Colletotrichum fragariae e C. gloeosporioides de folha nunca desenvolveram TACs sobre poliestireno ou folhas destacadas. Aqueles que formaram TACs sobre poliestireno também o fizeram sobre a superfície do hospedeiro. Foram observados vários núcleos através dos TACs e alguns conídios com nenhum e mais de um núcleo. Em geral, populações de Colletotrichum spp. do Brasil e do Uruguai foram aparentemente distintas, sugerindo que estas mantiveram-se separadas. Os processos de formação de TACs e apressórios parecem ser antagônicos. O desenvolvimento de TACs é um processo comum para C. gloeosporioides de frutos e C. acutatum. A possível contribuição dos TACs para aumento da variabilidade de Colletotrichum spp. é discutida.<br> / Abstract: Bitter Rot (BR) and Glomerella leaf spot (GLS) are amongst the major apple diseases, due to the fast progress of symptoms and high susceptibility of the cultivar "Gala", one of most worldwide consumed. The present study aimed to determinate the vegetative compatibility groups of brazilian and uruguayan strains of Colletotrichum spp causing BR and GLS as well as to monitor the development of conidial anastomosis tubes (CATs) in vivo and in vitro. VCGs were determined by pairing mutants defective in nitrogen assimilation pathway on Minimal Medium (MM). Mutants were generated on PDA+ KClO3 medium and kept on MM. Strains were classified in same VCG when pairing led to heterokaryon formation. Strains of different complexes or species never belonged to the same VCG. Only one GLS-brazilian strain was includedin the VCG of fruit uruguayan strains. Four and nine groups were found among uruguayan and brazilian strains, respectively. In three VCGs, both PA and MFG strains were included. In order to monitor the development of CATs and pre-infective structures, drops of 10 and 20 µL of conidial suspension (1x106 conídios/mL) were distributed on polystyrene slides and detached apple leaves surfaces. The development was microscopically examined at every two hours of incubation at 25°C, from 14 to 24h and at 48h, on polystyrene and detached leaves, respectively. Percentage and time of maximum germination, apressoria development and melanization were evaluated. CATs were quantified and categorized into three types, according to the kind of connections: tube-tube (t-t),tube-conidium (t-c) and conidium-conidium (c-c). Strains of Colletotrichum gloeosporioides showed a high percentage of germination and early formation of melanized appressoria. The t-t connections were less frequent for all strains. The c-c connections were the most frequent type for Colletotrichum acutatum strains. Among all tested strains, those showing a higher percentage of t-t- connections, also formed more t-c. Strains of Colletotrichum fragariae and C. gloeosporiodes from leaves never developed CATs, neither on polystyrene nor on detached leaves.Those that formed CATs on polystyrene also did it on host surface. Many nuclei were observed through CATs, such as many conidia with none and more than one nucleus. Generally, populations of Colletotrichum spp. from Brazil and Uruguay were apparently distinct, suggesting that they were kept isolated. Appressoria melanization and CATs development seem to be antagonist processes. Formation of CATs is a common processin C. gloeosporioides from fruits and C. acutatum. The possible contribution of CATS and its consequence for increasing variability in Colletotrichum ssp. is discussed.