No Brasil, a ferrugem, causada pelo fungo Puccinia psidii Winter, se destaca como a mais importante doença da cultura do eucalipto, principalmente na região Sudeste do país. O uso de genótipos resistentes é o principal método de controle da doença, o que torna essencial o conhecimento das bases genéticas da resistência para a seleção de genótipos resistentes. Neste estudo, uma progênie F1 de 90 irmãos completos foi utilizada para identificar marcadores ligados a genes de resistência a este patógeno. A severidade da doença foi avaliada em quatro épocas ao longo de uma epidemia por meio de escala diagramática e os dados foram utilizados para o cálculo da área sob a curva de progresso da doença (AUDPC) para cada indivíduo. O delineamento experimental foi de blocos incompletos em dois ambientes e os valores de AUDPC foram analisados por meio de modelos mistos, excluindo-se a variação ambiental. Um mapa genético foi construído com base em marcadores microssatélites, AFLP e TRAP através de uma análise multiponto. O mapeamento de QTL seguiu duas abordagens: mapeamento por intervalos (IM) e mapeamento por intervalos compostos (CIM). No mapa de ligação foram posicionados 117 marcadores microssatélites, 10 TRAP e 33 AFLP, distribuídos por 11 grupos de ligação, totalizando 1075 cM com distância média de 6,7 cM entre marcadores. A análise de IM identificou um QTL (LOD=7,7) no grupo de ligação 3, representando 28,5% da variação em AUDPC na progênie observada. Já a análise CIM detectou dois QTL, ambos no grupo de ligação 3. A posição do primeiro QTL coincidiu com aquela do QTL identificado na análise por IM, porém com maior valor de LOD (10,3), explicando 39,5% da variação em AUDPC. O segundo QTL (LOD=3,4), cujo valor probabilístico máximo distou 39,0 cM do primeiro QTL, explicou 6,9% da variação fenotípica. Os alelos de resistência nos dois QTL se encontram em repulsão, com efeito aditivo negativo (=-0,60) e ausência de dominância no primeiro QTL e efeito aditivo positivo (=0,29) e dominância completa (=-0,23) no segundo QTL. Os marcadores ligados aos dois QTLs têm potencial utilização na seleção assistida, com conseqüente aumento na eficiência durante a seleção de genótipos resistentes. / In Brazil, the eucalyptus rust, caused by Puccinia psidii Winter, stands out as the most important disease of eucalypts, mainly in southeastern Brazil. The use of resistant genotypes is the main control method, which makes the understanding of the genetic basis of resistance essential to the selection of resistant genotypes. In this study, an F1 progeny of 90 plants was used to identify markers linked to resistance genes to this pathogen. Four disease severity assessments were conducted during an epidemic with a diagrammatic scale and the data were used to calculate the area under the disease progress curve (AUDPC) for each plant. The experimental design consisted of incomplete blocks in two environments. AUDPC values were analyzed using mixed models, excluding the environmental variation between locations. A genetic map was constructed based on microsatellite, AFLP and TRAP markers based on a multipoint analysis. QTL mapping was done based on two approaches: interval mapping (IM) and composite interval mapping (CIM). The linkage map consisted of 117 microsatellite, 10 AFLP and 33 TRAP markers, placed over 11 linkage groups, totalizing 1075 cM with an average distance of 6.7 cM between markers. IM analysis identified a QTL (LOD = 7.7) on linkage group 3, accounting for 28.5% of the phenotypic variation in AUDPC. The CIM analysis detected two QTL, both on linkage group 3. The position of the first QTL coincided with that of the QTL identified in the IM analysis, but with a higher LOD (10.3), accounting for 39.5% of the variation. The second QTL (LOD = 3.4), whose maximum probability value was placed 39.0 cM away from the first QTL, accounted for 6.9% of the phenotypic variation. The resistance alleles in the two QTL are linked in repulsion with negative additive effect ( =- 0.60) and lack of dominance in the first QTL and positive additive effects (=0.29) and complete dominance (=-0.23) in the second. The markers linked to the two QTL have potential use in assisted selection, thus increasing the efficiency of selection of resistant genotypes.

O Brasil é o maior produtor de laranja doce do mundo. O histórico da citricultura brasileira é marcado por uma sucessão de doenças causadas por diferentes agentes etiológicos. Entre as principais doenças que afetam a cultura, têm levado a maiores prejuízos, as bacterianas, com destaque para o cancro cítrico causado por Xanthomonas citri subsp. citri e o Huanglongbing associado a três espécies de \"Candidatus Liberibacter\". Devido à ausência de cultivares de laranja doce resistentes a estas doenças, a transformação genética é uma alternativa promissora para obtenção de plantas resistentes. Uma das estratégias no uso da transgenia para conferir ação contra bactérias é a inserção de genes que codificam peptídeos antimicrobianos como o D4E1, um peptídeo sintético, que tem apresentado eficiência no controle de doenças fúngicas e bacterianas de várias culturas, in vivo e in vitro. Este trabalho foi realizado com o objetivo de obter plantas transgênicas de laranja doce das cultivares \'Hamlin\', \'Pêra\' e \'Valência\', via Agrobacterium tumefaciens, expressando o gene D4E1, dirigido pelos promotores CaMV35S (Cauliflower mosaic virus 35S promoter) de expressão constitutiva ou pelo AtPP2 (Arabidopsis thaliana phloem protein 2) com expressão preferencial no floema, visando obter plantas resistentes a doenças bacterianas. Foram obtidas 13 plantas transgênicas da cultivar \'Hamlin\', 10 da cultivar \'Pêra\' e 8 da cultivar \'Valência\', contendo a construção gênica CaMV35S/D4E1 e 19 plantas transgênicas da cultivar \'Hamlin\', 6 da cultivar \'Pêra\' e 15 da cultivar \'Valência\' contendo a construção gênica AtPP2/D4E1. As plantas transgênicas apresentaram um a três eventos de inserção do T-DNA no genoma. Os níveis de expressão do transgene dirigido pelo promotor de expressão preferencial no floema foi menor comparado ao das plantas contendo o transgene dirigido pelo promotor de expressão constitutiva. Os resultados da expressão do transgene permitem selecionar plantas com maior expressão de cada uma das construções gênicas, para que, futuramente, estas sejam multiplicadas e avaliadas quanto à resistência ao cancro cítrico e ao HLB. / Brazil is the largest sweet orange producer in the world. The history of the Brazilian citrus industry is marked by a series of diseases caused by different etiologic agents. Among the diseases affecting the culture, those caused by bacteria are the ones that have caused more significant losses, especially the citrus canker caused by Xanthomonas citri subsp. citri, and huanglongbing (HLB) associated with three \"Candidatus Liberibacter\" bacteria species. Due to the absence of genetic resistance to these diseases in commercial sweet orange cultivars, the genetic transformation is a promising alternative to produce resistant plants. One of the strategies to produce transgenic resistant plants to bacteria is the use of genes that code for antimicrobial peptides, such as D4E1, a antimicrobial synthetic peptide, which has shown efficient results controlling diseases caused by bacteria and fungi in several crops, through in vitro and in vivo experiments. The aim of this study was to produce \'Hamlin\', \'Pêra\' and \'Valencia\' sweet orange transgenic plants, via Agrobacterium tumefaciens, expressing the D4E1 gene driven by the constitutive promoter Cauliflower mosaic virus (CaMV35S) or Arabidopsis thaliana phloem protein 2 (AtPP2), a promoter preferentially expressed in the phloem. It was possible to regenerate 13 \'Hamlin\' transgenic lines, 10 \'Pêra\' transgenic lines and 8 \'Valencia\' transgenic lines bearing the gene construct CaMV35S/D4E1, whereas 19 \'Hamlin\' transgenic lines, 6 \'Pêra\' transgenic lines and 15 \'Valencia\' transgenic lines bearing the AtPP2/D4E1 gene construct were regenerated. The transgenic plants had one to three T-DNA insertion events in the genome. The transgene expression levels in transgenic plants for D4E1 gene driven by the phloem preferential promoter were lower than the transgenic expression levels of the transgene driven by the constitutive promoter. Transgene expression levels results may allow the selection of those plants with higher expression levels of each genetic construct for future multiplication and evaluation for citrus canker and HLB resistance.

O meloeiro (Cucumis melo L.) é uma cultura de grande importância econômica para o comércio de exportação brasileiro e é cultivada principalmente na região Nordeste. A produção da cultura pode ser limitada por uma doença das partes aéreas, denominada oídio, sendo no Brasil, causada pelo fungo Podosphaera xanthii. Este patógeno apresenta diversas raças definidas com base na reação de um conjunto de cultivares diferenciadoras de meloeiro. Dentre estes genótipos, o acesso PI 414723 é resistente à maior parte das raças e a linhagem Védrantais é suscetível. O presente trabalho teve como objetivos: (i) estudar a herança da resistência às raças 1, 3 e 5 de P. xanthii em indivíduos da geração F2 do cruzamento PI 414723 x Védrantais e (ii) mapear os genes de resistência a estas raças com base em marcadores de polimorfismo de comprimento de fragmentos amplificados (AFLP), de repetições de sequências simples (SSR) e análogos de genes de resistência (RGA) também nesta população. A herança da resistência foi analisada em 87 indivíduos F2 cultivados em condições de casa-de-vegetação. As três raças foram inoculadas em seis regiões eqüidistantes da nervura central em quatro folhas de cada planta. Plantas foram classificadas como resistentes ou suscetíveis com base em avaliações visuais do desenvolvimento do fungo nas folhas. As plantas foram classificadas como suscetíveis quando houve reprodução abundante de conídios e resistentes quando a reprodução foi inexistente ou escassa. Frequências de indivíduos resistentes e suscetíveis indicaram que a resistência às três raças é controlada por um gene dominante de efeito maior. Um mapa genético foi construído compreendendo 1.469 cM, consistindo de 207 marcadores (139 AFLP, 47 SSR, 18 RGA e três fenotípicos) e com uma distância média de 7,4 cM entre marcadores distribuídos em 12 grupos de ligação. Análises de co-segregação com marcadores indicaram que os genes de resistência estão localizados no grupo de ligação II. Em adição a isto, as análises indicaram ligação completa entre os genes de resistência às raças 1 e 5, sendo este gene denominado Pm-x1.5. Já o gene de resistência à raça 3 (Pm-x3) foi localizado a 5,1 cM dos demais. Um marcador AFLP (H35M75_156) foi localizado entre os dois genes a 1,3 cM de Pm-x1.5 e 3,8 cM de Pm-x3. Este é o primeiro relato da localização genética de genes de resistência às raças 3 e 5 em PI 414723 e também o primeiro relato do mapeamento de marcadores RGA gerados pela técnica TRAP em meloeiro. / Melon (Cucumis melo L.) is a crop of great economic importance for the export trade in Brazil and is cultivated mainly in the Northeast. Crop yield can be affected by a disease of the aerial parts, called powdery mildew that in Brazil is caused by the fungus Podosphaera xanthii. This pathogen has several races characterized based on the reaction of a set of differential melon cultivars. Among these genotypes, the plant introgression PI 414723 is resistant to most races and the breeding line Védrantais is susceptible. This study aimed to: (i) study the inheritance of resistance to races 1, 3 and 5 of P. xanthii in the F2 generation from the cross PI 414723 x Védrantais, and (ii) map resistance genes to these races in this same population based on amplified fragment length polymorphism (AFLP), simple sequence repeat (SSR) and resistance gene analog (RGA) markers. The inheritance of resistance was analyzed on 87 F2 individuals grown under greenhouse conditions. The three races were inoculated simultaneously on four leaves of each plant. Plants were classified as resistant or susceptible based on visual assessments of fungal growth on the leaves. Plants were considered susceptible when there was abundant production of conidia and resistant when the production was scarce or non-existent. The frequencies of resistant and susceptible individuals indicated that resistance to all three races is controlled by a dominant major gene. A genetic map was constructed comprising 1469 cM, consisting of 207 markers (139 AFLP, 47 SSR, 18 RGA, and three phenotypic) with an average distance of 7.4 cM between markers distributed in 12 linkage groups. Co-segregation analysis with markers indicated that the resistance genes are located on linkage group II. Moreover, the analysis indicated complete linkage between resistance to races 1 and 5, and this gene was denominated Pm-x1.5. The gene for resistance to race 3 (Pm-x3) was located at 5.1 cM from Pmx1.5. An AFLP marker (H35M75_156) was located between the two genes at 1.3 cM from Pmx1.5 and 3.8 cM from Pm-x3. These is the first report on the location of resistance genes to races 3 and 5 in PI 414723, and also the first report of RGA markers mapping using the TRAP technique in melon.

Os objetivos do presente trabalho foram estudar a herança da resistência à antracnose foliar em milho, estimar os parâmetros genéticos e identificar marcadores moleculares ligados a genes de resistência a esta doença. Parâmetros genéticos foram estimados com base na análise de modelos de herança mista de seis gerações de quatro cruzamentos entre duas linhagens resistentes (DAS4 e DAS3) e duas linhagens suscetíveis (DAS6 e DAS22). O delineamento experimental foi o de blocos casualizados com parcelas subdivididas, com três repetições, sendo as parcelas constituídas pelos cruzamentos e as subparcelas, pelas gerações. As plantas foram inoculadas artificialmente e avaliadas em dois experimentos através de uma escala de notas de 1 a 6. Os testes de hipóteses para selecionar o modelo de herança genética e as estimativas dos parâmetros foram realizados pelo método da máxima verossimilhança. Os resultados da análise de modelos mistos indicaram que a resistência é controlada por um gene de efeito maior em todos os cruzamentos e experimentos avaliados e também por poligenes, em pelo menos um dos experimentos. A ação gênica é aditiva e dominante, com predominância de efeitos genéticos aditivos. O mapeamento de QRLs foi realizado utilizando 141 indivíduos F1RC1 do cruzamento (DAS6 x DAS4) x DAS6, com base na avaliação fenotípica das suas famílias, em dois experimentos. O delineamento experimental foi o látice 12 x 12, incluindo as famílias, genitores e híbrido, com 3 repetições. As plantas foram inoculadas artificialmente e avaliadas através de uma escala de notas de 1 a 6. O mapeamento de QRLs, utilizando marcadores microssatélites e AFLPs e análise de bulks segregantes para detecção de marcadores candidatos, foi realizado pela análise de regressão linear múltipla (RLM) e pelo mapeamento por intervalo composto (MIC). Ambas metodologias de análise identificaram pelo menos um QRL no cromossomo 10 em cada experimento. Também foram detectados QRLs nos cromossomos 2, 3 e 5, apenas pela RLM. Os QRLs identificados pela RLM explicaram 25,7%, 23,3% e 24,5% da variação fenotípica no experimento 1, no experimento 2 e na análise conjunta, respectivamente. Já os QRLs identificados pelo MIC explicaram 28,9%, 32,3% e 31,0% da variação fenotípica no experimento 1, no experimento 2 e na análise conjunta, respectivamente. A análise de bulks segregantes permitiu a detecção apenas dos QRLs de efeitos fenotípicos mais expressivos localizados no cromossomo 10. Na maioria dos QRLs detectados, os alelos de resistência provieram do genitor resistente. A identificação destes QRLs oferece uma significativa contribuição para o entendimento da resistência de milho à antracnose foliar, podendo levar à identificação de genes e elucidação dos mecanismos envolvidos na expressão da resistência. / The objectives of this work were to study the inheritance of resistance to anthracnose leaf blight, estimate the genetic parameters, and identify molecular markers associated with resistance genes to this disease. Genetic parameters were estimated based on the analysis of mixed inheritance models in six generations of four crosses between two resistant (DAS4 and DAS3) and two susceptible inbred lines (DAS6 and DAS22). The experimental design consisted of randomized blocks containing split-plots, with three replicates, where the plots were represented by crosses and the subplots were the generations. The plants were inoculated artificially and evaluated in two experiments by means of a rating scale from 1 to 6. The hypothesis testing to select the genetic inheritance model and parameter estimates were obtained by the maximum likelihood method. The results from the mixed models analysis indicated that resistance is controlled by a major gene in all crosses and experiments evaluated, and also by polygenes in at least one experiment. The genetic action is additive and dominant, with predominance of additive genetic effects. QRL mapping was performed using 141 F1RC1 individuals from the (DAS6 × DAS4) × DAS6 cross, based on the phenotypic evaluation of their families, in two experiments. The experimental design was a 12 × 12 lattice which included the families, parents, and the hybrid, with 3 replicates. The plants were inoculated artificially and evaluated by means of a rating scale from 1 to 6. QRL mapping, using microsatellites and AFLPs markers, and bulked segregant analysis to detect candidate markers was performed by multiple linear regression analysis (MLR) and by composite interval mapping (CIM). Both methodologies of analysis identified at least one QRL in chromosome 10 in each experiment. QRLs were also detected, by MLR only, in chromosomes 2, 3 and 5. The QRLs identified by MLR explained 25.7%, 23.3%, and 24.5% of the phenotypic variation in the experiment 1, in the experiment 2 and in the joint analysis, respectively. The QRLs identified by CIM, however, explained 28.9%, 32.3%, and 31.0% of the phenotypic variation in the experiment 1, in the experiment 2 and in the joint analysis, respectively. The bulked segregant analysis only allowed the detection of QRLs that showed the more expressive phenotypic effects located in chromosome 10. In most detected QRLs, the resistance alleles came from the resistant parent. The identification of these QRLs offers a significant contribution to an understanding of resistance to anthracnose leaf blight in maize, and could lead to the identification of genes and to an elucidation of the mechanisms involved in the expression of resistance.

Apesar da espécie Vigna unguiculata (L.) Walp. ser bastante rústica e estar adaptada às condições adversas de clima e solo brasileiros, seu rendimento é muito baixo. Diversas causas têm sido levantadas para explicar esse comportamento; entre elas destacam-se as doenças fúngicas, sobretudo aquelas cujos patógenos são transmitidos por sementes, em especial a podridão cinzenta do caule, causada por Macrophomina phaseolina (Tassi) Goid. A abordagem analítica desse patossistema revelou alguns problemas emergentes. Entre eles, destacam-se: a) desconhecimento da qualidade sanitária das sementes de caupi, utilizadas para semeadura; b) desunifomidade na metodologia usada para detectar os patógenos presentes nas semente; c) dificuldade na esporulação do patógeno, máxime de alguns isolados reticentes em esporular em meios artificiais de cultivo, cujo comportamento dificulta os trabalhos de seleção de genótipos resistentes; d) carência de medidas de controle do patógeno, que empreguem práticas naturais, como uso de sementes sadias, de indutores de resistência e de cultivares resistentes, de fácil uso e passível de adoção por parte dos produtores. Na estruturação da matriz lógica do presente estudo, referidos problemas foram transformados em objetivos. Os trabalhos foram conduzidos no Departamento de Entomologia, Fitopatologia e Zoologia Agrícola da ESALQ/USP, em Piracicaba-SP. Os resultados indicaram o teste de sanidade de sementes de caupi empregando o método do papel de filtro com restrição hídrica utilizando NaCl a -0,8Mpa, como o mais adequado para detecção dos fungos presentes nas sementes de caupi, especialmente M. phaseolina. A análise sanitária das amostras de sementes originadas de vários estados brasileiros revelou que, em 62% das amostras analisadas, o fungo M. phaseolina estava presente, sendo as amostras originadas do estado da Paraíba, Piauí, Pará e Bahia as que apresentaram maiores níveis de incidência do patógeno. Os melhores níveis de esporulação do patógeno foram conseguidos com a combinação de sobreposição de discos de folhas de trigo ao meio BDA, com temperatura de 25oC. Quanto à identificação de indutores de resistência, capazes de controlar M. phaseolina, os resultados revelaram que o acibenzolar-S-metil (ASM) foi o mais eficiente, quando comparado com quitosana e com um produto silicatado derivado de rocha micronizada (PSiM), apresentando um controle residual por mais de 40 dias após a semeadura. A maior eficiência verificada pelo ASM ocorreu devido a sua capacidade de ativar mecanismos bioquímicos de defesa, configurando-se em efetivo ativador da resistência induzida nas plantas de caupi, por atuar na cinética de importantes enzimas relacionadas à defesa, como a fenilalanina amônia-liase, peroxidase e quitinase. Quanto à reação de cultivares de caupi à doença, foi possível verificar razoável nível de resistência de algumas cultivares, tendo sido consideradas resistentes Mulato, Guariba e Maratauã. / Notwithstanding the specie Vigna unguiculata (L.) Walp is sufficiently rustic and adapted to the adverse conditions of the Brazilian soil and climate, its improvement is very low. Many causes have been raised in order to explain such behavior; among them the fungal diseases stand out, over all those whose pathogens are transmitted by the seeds especially the charcoal rot disease caused by Macrophomina phaseolina (Tassi) Goid. The analytical approach of such pathosystem has revealed some emerging problems. Among them, it stands out: a) the ignorance of the sanitary quality of the cowpea seeds used for sowing; b) the non-uniformity in the used methodology in order to detect the pathogens, which are present in the seed; c) the difficult in pathogen sporulation, principally of some isolated reticent in forming spores in cultivation artificial environments whose behavior hampers the selection works of the resistant genotypes; d) lack of pathogen control measures, which utilize natural practices, such as the use of healthy seeds, resistance inducers and resistant cultivars of easy utilization and liable to adoption by the producers. In structuring the logical matrix of this study, such problems were transformed into objectives. The works were conducted at the Entomology, Phytopathology and Agricultural Zoology Departments of ESALQ/USP, in Piracicaba-SP. The results have pointed out the sanity test of the cowpea seeds through the method of filter paper with hydric restriction using NaCI - 0,8Mpa, as the most suitable for detecting the current fungus in cowpea seeds, especially M. phaseolina. The sanitary analysis of the seeds samples originated from several Brazilian states has revealed that in 63% of the analyzed samples, the fungus M. phaseolina was present, and the samples originated from the states of Paraíba, Piauí, Pará and Bahia were those that have presented higher incident levels of pathogen. The best levels of sporulation were obtained with the combination of the superposition of wheat leaves disks in the middle of BDA in 25ºC. As to the identification of the resistance inducers, capable of controlling the M. phaseolina, the results have revealed that the acinbezolar-S-methyl (ASM) was more efficient when compared to chitosan and with a silicate product originated from micronized rock (PsiM), presenting a residual control for more than 40 days after the sowing. The greatest efficiency ascertained by ASM has occurred due to its capacity of activate the defense biochemistries mechanisms, forming itself in an activator effect of the induced resistance in cowpea plants because it acts in the kinetic of important enzymes related to the defense, such as the phenylalanine ammonia-lyase, peroxidase and chitinase. As to the cowpea cultivars reaction to the disease, it was possible to ascertain a reasonable resistance level of some cultivars, and BR 14 Mulato, Guariba e Maratauã were considered as resistant.

The blast is the main disease of flooded rice. The integrated management of this disease is based on the adoption of cultural, genetic and chemical strategies of control. The objective of this work was to evaluate the effect of eight chemical control programs of Pyricularia oryzae applied on IRGA 424, IRGA 428, GURI INTA CL, PUITA INTA CL, QM 10 10 CL and INOV CL rice varieties, and 10/30/2013 and 11/26/2013 sowing times. This work was conducted in the 2013/2014-crop season, under field conditions, in lowland area in Sao Sepé, RS, Brazil. The treatments were arranged in a randomized experimental blocks design, in a split plot and five replications. The variables analyzed were AUCPD on the flag leaf and entire plant, panicle blast, yield and the whole grains percentage. The delay in sowing date increased significantly the incidence and severity of the blast in flooded rice. IRGA 424, IRGA 428 and QM 10 10 CL showed resistance to Pyricularia oryzae, while the GURI INTA CL, PUITA INTA CL and INOV CL were susceptible. The addition of Tricyclazole fungicide to Kresoxim-methyl + Epoxiconazole fungicides is critical to the efficient control of Pyricularia oryzae. The applications of fungicides in the R1 + R2 + R4 and R2 + R4 stages are the most effective in the chemical control of rice blast. The integration among cultural, genetic and chemical methods is critical to the efficient management of blast in flooded rice. / A brusone é a principal doença da cultura do arroz irrigado. O manejo integrado desta doença é baseado na adoção de um conjunto de métodos de controle, como o controle cultural, controle genético e o controle químico. O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de oito programas de controle químico de Pyricularia oryzae, nas cultivares de arroz irrigado IRGA 424, IRGA 428, GURI INTA CL, PUITÁ INTA CL, QM 10 10 CL e INOV CL, nas datas de semeadura de 30/10/2013 e 26/11/2013. O experimento foi conduzido em São Sepé/RS, na safra 2013/14, obedecendo o delineamento experimental de blocos ao acaso, em parcelas subsubdivididas e cinco repetições. As variáveis consideradas foram AACPB na folha bandeira e na planta inteira da cultura do arroz, o percentual de incidência de brusone na base da panícula, a produtividade e o percentual de grãos inteiros. O atraso na época de semeadura aumentou significativamente a incidência e a severidade da brusone na cultura do arroz irrigado. IRGA 424, IRGA 428 e QM 10 10 CL apresentaram resistência à Pyricularia oryzae, enquanto que GURI INTA CL, PUITÀ INTA CL e INOV CL foram suscetíveis. A adição do fungicida Triciclazol aos fungicidas Cresoxim-metilico + Epoxiconazol foi eficiente para controle de Pyricularia oryzae. As aplicações de fungicidas para controle químico da brusone foram mais eficazes quando realizadas nos estádios R1 + R2 + R4 e R2 + R4. A integração entre os métodos cultural, genético e químico foi eficiente para o manejo da brusone na cultura do arroz irrigado.

Made available in DSpace on 2016-08-12T19:15:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 leidianeBA_DISSERT.pdf: 951596 bytes, checksum: 769c70c85ea3d6f0353cabbe1093e973 (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Downy mildew, caused by the fungus Pseudoperonospora cubensis, is a major threat to the production of melons in wetlands worldwide. Despite its importance, there are few studies involving the assessment of sources of resistance, as well as the identification of molecular markers that are connected to this feature and that may help breeders in marker-assisted selection (MAS). Given this, the objectives of this work were promote the selection of sources of resistance to downy mildew, from melon accessions, collected from different states in the Northeast region of Brazil and to identify QTLs that co-segregate with the resistance gene of this pathogen, using the F2:3 obtained from parents and Védrantais MR-1, contrasting to the register character. To identify sources of resistance, thirty-six accesses and four commercial cultivars in a randomized block design (RBD) were assessed with three replications and seven plants per plot, which evaluation was made on the field. The evaluation was carried out on 24 days after transplanting the seedlings to the field, when 50% of plants reached the stage of flowering, with the aid of a diagrammatic scale. It was observed that there is variability in melon germplasm for reaction to downy mildew. The accessions A1, A4, A6, A9, A12, A17, A18, A23, A27, A35 and A36 were considered promising for use in breeding programs aiming resistance to P cubensis. All commercial cultivars analyzed were highly susceptible to the pathogen. To identify markers connected the resistance QTLs, MR-1 and Védrantais parents were crossed and subsequently the F2 generation was obtained. It was extracted the DNA for evaluation molecular of the 98 plants obtained with microsatellite primers polymorphic selected from contrasting parents. Of F2 plants were obtained 98 progenies F2:3 that were used for the assessments phenotypic of the severity caused by P. cubensis, it was used the same time assessment described in the previous experiment, the period April-June 2013. The experimental design utilized was lattice simple 10 x 10. The efficiency of lattice was low (100.28%) thus data were analyzed in DBC. Significant genetic differences (P<0.01) between the progenies were identified. The estimated of heritability was considered high (86.75%), indicating successful selection. Were found 23 primers polymorphic, of this sum, thirteen amplified in all the population and were used for analyzes genotypic. Of these, ten markers presented values below level critical specified by FDR test. There was more proportion allele of parent Védrantais for eight loci, while there was more proportion allele the parent MR-1 for two loci. For other loci (three), frequencies allelic did not change. The values coefficients of determination (R2) obtained for the markers were relatively low in population. By regression simple linear, the markers explained the feature in population F2:3 the most were CMBR 139 and CMMS 22-2, being the same identified by regression multiple linear, thus they can also be used in SAM / O míldio, causado pelo fungo Pseudoperonospora cubensis, é uma das principais ameaças à produção do meloeiro em áreas úmidas em todo o mundo. Apesar de sua importância, são poucos os trabalhos envolvendo a avaliação de fontes de resistência, bem como a identificação de marcadores moleculares que estejam ligados a esta característica e que possam auxiliar os melhoristas na seleção assistida por marcadores (SAM). Diante disso, os objetivos deste trabalho foram promover a seleção de fontes de resistência ao míldio, a partir de acessos de meloeiro, coletados em diferentes estados da região Nordeste do Brasil e também identificar QTLs que co-segreguem com genes de resistência a este patógeno, utilizando progênies F2:3 obtidas dos genitores MR-1 e Védrantais, contrastantes para o caráter. Para a identificação de fontes de resistência, foram avaliados trinta e seis acessos e quatro cultivares comerciais em delineamento em blocos casualizados (DBC) com três repetições e sete plantas por parcela, cuja avaliação foi feita em campo. A avaliação se deu aos 24 dias após o transplantio das mudas para o campo, depois que 50% das plantas atingiram o estágio de floração, com o auxílio de uma escala diagramática. Observou-se que existe variabilidade no germoplasma de meloeiro para reação ao míldio. Os acessos A1, A4, A6, A9, A12, A17, A18, A23, A27, A35 e A36 foram considerados promissores para o uso em programas de melhoramento visando resistência a P cubensis. Todas as cultivares comerciais analisadas foram altamente suscetíveis ao patógeno. Para identificação de marcadores ligados a QTLs de resistência, os genitores MR-1 e Védrantais foram cruzados e posteriormente foi obtida a geração F2. Das 98 plantas obtidas foi extraído o DNA para avaliação molecular com primers microssatélites polimórficos selecionados a partir dos genitores contrastantes. Das plantas F2 foram obtidas 98 progênies F2:3 que foram utilizadas para as avaliações fenotípicas quanto a severidade provocada por P. cubensis, seguindo a mesma época de avaliação descrita no experimento anterior no período de abril a junho de 2013. O delineamento utilizado foi o látice simples 10 x 10. A eficiência do látice foi baixa (100,28%), por isso, os dados foram analisados em DBC. Foram identificadas diferenças genéticas significativas (P<0,01) entre as progênies. A estimativa de herdabilidade foi considerada alta (86,75%), indicando sucesso com a seleção. Foram encontrados 23 primers polimórficos. Treze amplificaram em toda a população e foram utilizados para as análises genotípicas. Destes, dez marcadores apresentaram valores abaixo do nível crítico especificado pelo teste FDR. Para oito locos houve maior proporção de alelos do genitor Védrantais, enquanto que para dois locos houve maior proporção de alelos do genitor MR-1. Para os demais locos (três), as frequências alélicas não se alteraram. Os valores dos coeficientes de determinação (R2) obtidos para os marcadores foram relativamente baixos na população. Pela regressão linear simples, os marcadores que mais explicaram a característica na população F2:3 foram CMBR 139 e CMMS 22-2, sendo os mesmos identificados pela regressão linear múltipla, podendo, portanto, serem utilizados na SAM

Made available in DSpace on 2016-08-12T19:18:45Z (GMT). No. of bitstreams: 1 leidianeBA_DISSERT.pdf: 951596 bytes, checksum: 769c70c85ea3d6f0353cabbe1093e973 (MD5) Previous issue date: 2014-02-28 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / Downy mildew, caused by the fungus Pseudoperonospora cubensis, is a major threat to the production of melons in wetlands worldwide. Despite its importance, there are few studies involving the assessment of sources of resistance, as well as the identification of molecular markers that are connected to this feature and that may help breeders in marker-assisted selection (MAS). Given this, the objectives of this work were promote the selection of sources of resistance to downy mildew, from melon accessions, collected from different states in the Northeast region of Brazil and to identify QTLs that co-segregate with the resistance gene of this pathogen, using the F2:3 obtained from parents and Védrantais MR-1, contrasting to the register character. To identify sources of resistance, thirty-six accesses and four commercial cultivars in a randomized block design (RBD) were assessed with three replications and seven plants per plot, which evaluation was made on the field. The evaluation was carried out on 24 days after transplanting the seedlings to the field, when 50% of plants reached the stage of flowering, with the aid of a diagrammatic scale. It was observed that there is variability in melon germplasm for reaction to downy mildew. The accessions A1, A4, A6, A9, A12, A17, A18, A23, A27, A35 and A36 were considered promising for use in breeding programs aiming resistance to P cubensis. All commercial cultivars analyzed were highly susceptible to the pathogen. To identify markers connected the resistance QTLs, MR-1 and Védrantais parents were crossed and subsequently the F2 generation was obtained. It was extracted the DNA for evaluation molecular of the 98 plants obtained with microsatellite primers polymorphic selected from contrasting parents. Of F2 plants were obtained 98 progenies F2:3 that were used for the assessments phenotypic of the severity caused by P. cubensis, it was used the same time assessment described in the previous experiment, the period April-June 2013. The experimental design utilized was lattice simple 10 x 10. The efficiency of lattice was low (100.28%) thus data were analyzed in DBC. Significant genetic differences (P<0.01) between the progenies were identified. The estimated of heritability was considered high (86.75%), indicating successful selection. Were found 23 primers polymorphic, of this sum, thirteen amplified in all the population and were used for analyzes genotypic. Of these, ten markers presented values below level critical specified by FDR test. There was more proportion allele of parent Védrantais for eight loci, while there was more proportion allele the parent MR-1 for two loci. For other loci (three), frequencies allelic did not change. The values coefficients of determination (R2) obtained for the markers were relatively low in population. By regression simple linear, the markers explained the feature in population F2:3 the most were CMBR 139 and CMMS 22-2, being the same identified by regression multiple linear, thus they can also be used in SAM / O míldio, causado pelo fungo Pseudoperonospora cubensis, é uma das principais ameaças à produção do meloeiro em áreas úmidas em todo o mundo. Apesar de sua importância, são poucos os trabalhos envolvendo a avaliação de fontes de resistência, bem como a identificação de marcadores moleculares que estejam ligados a esta característica e que possam auxiliar os melhoristas na seleção assistida por marcadores (SAM). Diante disso, os objetivos deste trabalho foram promover a seleção de fontes de resistência ao míldio, a partir de acessos de meloeiro, coletados em diferentes estados da região Nordeste do Brasil e também identificar QTLs que co-segreguem com genes de resistência a este patógeno, utilizando progênies F2:3 obtidas dos genitores MR-1 e Védrantais, contrastantes para o caráter. Para a identificação de fontes de resistência, foram avaliados trinta e seis acessos e quatro cultivares comerciais em delineamento em blocos casualizados (DBC) com três repetições e sete plantas por parcela, cuja avaliação foi feita em campo. A avaliação se deu aos 24 dias após o transplantio das mudas para o campo, depois que 50% das plantas atingiram o estágio de floração, com o auxílio de uma escala diagramática. Observou-se que existe variabilidade no germoplasma de meloeiro para reação ao míldio. Os acessos A1, A4, A6, A9, A12, A17, A18, A23, A27, A35 e A36 foram considerados promissores para o uso em programas de melhoramento visando resistência a P cubensis. Todas as cultivares comerciais analisadas foram altamente suscetíveis ao patógeno. Para identificação de marcadores ligados a QTLs de resistência, os genitores MR-1 e Védrantais foram cruzados e posteriormente foi obtida a geração F2. Das 98 plantas obtidas foi extraído o DNA para avaliação molecular com primers microssatélites polimórficos selecionados a partir dos genitores contrastantes. Das plantas F2 foram obtidas 98 progênies F2:3 que foram utilizadas para as avaliações fenotípicas quanto a severidade provocada por P. cubensis, seguindo a mesma época de avaliação descrita no experimento anterior no período de abril a junho de 2013. O delineamento utilizado foi o látice simples 10 x 10. A eficiência do látice foi baixa (100,28%), por isso, os dados foram analisados em DBC. Foram identificadas diferenças genéticas significativas (P<0,01) entre as progênies. A estimativa de herdabilidade foi considerada alta (86,75%), indicando sucesso com a seleção. Foram encontrados 23 primers polimórficos. Treze amplificaram em toda a população e foram utilizados para as análises genotípicas. Destes, dez marcadores apresentaram valores abaixo do nível crítico especificado pelo teste FDR. Para oito locos houve maior proporção de alelos do genitor Védrantais, enquanto que para dois locos houve maior proporção de alelos do genitor MR-1. Para os demais locos (três), as frequências alélicas não se alteraram. Os valores dos coeficientes de determinação (R2) obtidos para os marcadores foram relativamente baixos na população. Pela regressão linear simples, os marcadores que mais explicaram a característica na população F2:3 foram CMBR 139 e CMMS 22-2, sendo os mesmos identificados pela regressão linear múltipla, podendo, portanto, serem utilizados na SAM

Submitted by Claudia Rocha (claudia.rocha@udesc.br) on 2018-03-01T14:42:48Z No. of bitstreams: 1 PGPV17MA224.pdf: 154129 bytes, checksum: 3bf57ab9d2cd225c2d1b35626e15d188 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-03-01T14:42:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV17MA224.pdf: 154129 bytes, checksum: 3bf57ab9d2cd225c2d1b35626e15d188 (MD5) Previous issue date: 2017-02-17 / CNPq / Phytophthora rot, caused by Phytophthora sojae causes seed rotting, damping-off, and also root and stem necrosis. Phytophthora rot has been occurring frequently in soybean crops in southern Brazil, even with the use of resistant cultivars. In the 2015/16 harvest, soybean crops in southern Brazil were surveyed to detect plants with Phytophthora rot. Thirty-two samples were analyzed, and the diagnosis and the attempt of isolation in specific culture medium were performed. The disease was detected in 62.5 % of them, and seven pathogen isolates were obtained. The disease was predominant in crops under monoculture, with aggravation in livestock-crop integration system areas. In a second experiment the soybean cultivars BMX ELITE IPRO, BMX APOLO RR, BMX ALVO RR, NA 5909 IPRO and NS 6909 IPRO were tested using a P. sojae isolate with virulence formula Rps1d, 2,3b, 3c, 4, 5,6,7, to verify the reaction of these cultivars to this isolate. All cultivars tested were resistant to the isolates. In a third experiment, soybean seeds of cultivar CD 202 IPRO, susceptible to P. sojae were treated with mixtures of chemical and microbiological fungicides. Plants from these treatments were inoculated with P. sojae mycelium in the hypocotyl, through two inoculation methods, at 6 (syringe method) and at 12 days (stick method). The seeds were also sown on a substrate containing P. sojae inoculum, like a third method of inoculation. Each experiment was conducted in a completely randomized design with four replicates of 12 plants per treatment. The experiments were replicated. The active ingredient (ia) mefenoxam at a dose of 7.5 g (100 kg of seeds) guaranteed the emergence of soybean seedlings in P. sojae infested soil superior to the other fungicides used, reduced the severity of the disease and provided greater root dry mass. No fungicide was effective when inoculation was performed on the hypocotyl of the seedling / A podridão de fitóftora, causada por Phytophthora sojae causa apodrecimento de sementes, tombamento de plântulas, necrose das raízes e da haste da soja. A podridão de fitóftora vem ocorrendo com frequência em lavouras de soja no sul do Brasil, mesmo com a utilização de cultivares indicadas como resistentes. Na safra 2015/16 foi realizado um levantamento em lavouras de soja do sul do Brasil com o objetivo de detectar plantas com podridão de fitóftora. Ao total 32 amostras foram analisadas e de onde se realizou a diagnose e a tentativa de isolamento em meio de cultura específico. A doença foi detectada em 62,5 % delas, de onde foram obtidos sete isolados do patógeno. Houve predominância da doença em lavouras conduzidas sob monocultura, com agravo em áreas com sistema de integração lavoura-pecuária. Num segundo experimento foram testadas as cultivares de soja BMX ELITE IPRO, BMX APOLO RR, BMX ALVO RR, NA 5909 IPRO e NS 6909 IPRO, utilizando um isolado de P. sojae com fórmula de virulência Rps1d,2,3b,3c,4,5,6,7, com o objetivo de verificar a reação dessas cultivares ao isolado. Todas as cultivares testadas se mostraram resistentes ao isolado utilizado. Em um terceiro experimento, sementes de soja da cultivar CD 202 IPRO, suscetível a P. sojae, foram tratadas com misturas de fungicidas químicos e microbiológicos. Plântulas oriundas destes tratamentos foram inoculadas com micélio de P. sojae no hipocótilo, através de dois métodos de inoculação, aos 6 (método da seringa) e aos 12 dias (método do palito). As sementes também foram semeadas em substrato contendo inóculo de P. sojae, sendo considerado um terceiro método de inoculação. Cada experimento foi conduzido sob delineamento inteiramente casualizado com quatro repetições de 12 plântulas por tratamento. Os experimentos foram replicados. O ingrediente ativo (i.a) mefenoxam na dose de 7,5 g de i.a (100 kg de sementes) garantiu a emergência de plântulas de soja em solo infestado com P. sojae superior aos outros fungicidas utilizados. Nenhum fungicida foi eficiente quando a inoculação foi realizada no hipocótilo da plântula

Made available in DSpace on 2016-12-06T17:42:07Z (GMT). No. of bitstreams: 1 PGPV14DA016.pdf: 1791236 bytes, checksum: 435d76b4d49498dd4bdc194423dac320 (MD5) Previous issue date: 2014-10-17 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The gibberella ear rot caused by fungus Fusarium graminearum, causes damage in productivity and quality of maize kernel being disease of difficult to control due to the unavailability of resistant hybrids and low efficacy of cultural practices. Three studies were conducted, the aim of the first was to compare four methods of inoculation (injection silkchannel, sprinkling on silk, kernel- wounding and deposition in the ear leaf sheath) and a control treatment in four hybrids (P30R50H, P30B30H, P3989, P32R48H) based on disease severity and kernel yield; the second study determined the reaction of 20 hybrids to gibberella ear rot by quantifying the incidence of the disease, rot kernels and F. graminearum in the kernels and their correlations; and the third study characterized the genetic resistance of hybrids to gibberella ear rot through preparation of a reaction scale involving classes and disease intensity and their correlation with kernel yield and inoculation methods. The experiments of first study were conducted in 2011/12 harvest in Cruz Alta, RS and Lages. The experiments of the second and third studies were conducted in two environments in the season 2012/13 in Cruz Alta. The design of the experiments was a randomized complete blocks design with treatments arranged in a factorial with four replications. In the first study there was no difference in disease severity between hybrids and inoculation methods. The hybrid P32R48H presented higher disease severity, distinguishing from the others. Inoculations in silk-channel and wounding the kernels provided higher disease severity and lower kernel yield. In the second study, the method of the wounding the kernels provided increases above 40% in the incidence of gibberella ear rot, rot kernels and occurrence of F. graminearum in the grain when compared to the injection silk-channel method. There was an effect of hybrids and the values were 37.2% and 95.6% for the incident of gibberella ear rot, 2.1% to 17.0% for rot kernels and 4.0% to 29.3% for incidence of F. graminearum in the kernels. Significant and positive correlations (r = 0.70) were found between incidence of F. graminearum in the kernels and rots kernels. In the third study it was watched that the kernel yield was affected by hybrids, regardless of the inoculation method. The P30F35YH and BG7049H hybrids obtained better yields, regardless of the environment and inoculation method, being classified as moderately susceptible to gibberella ear rot. The AG8025PRO, DKB250PRO2, AS1555PRO, Status, 30K64HNSR and P4285 were classified as moderately resistant considering the intensity of gibberella ear rot and the involvement of resistance to colonization of the stigma (tip of the ear) and kernel resistance. There were significant and positive relationship between productivity with injection in the silk-channel (r = 0.93) and wounding the kernels with productivity (r = 0.94) in environment 1 and 2. It was found that although there are no resistant hybrids there is genetic variability and the involvement resistance of stigma mechanisms and the kernels, and the giberella ear rot affected more kernel quality than quantity / A podridão de giberela causada pelo fungo Fusarium graminearum, provoca danos na produtividade e qualidade de grãos de milho sendo doença de difícil controle devido à indisponibilidade de híbridos resistentes e baixa eficácia de práticas culturais. Foram realizados três estudos, o objetivo do primeiro foi comparar quatro métodos de inoculação (injeção no canal do estilo-estigma, aspersão nos estigmas, ferimento dos grãos no centro da espiga e deposição na bainha da folha da espiga) e um tratamento controle em quatro híbridos (P30R50H, P30B30H, P3989, P32R48H) com base na severidade da doença e produtividade de grãos; o segundo estudo determinou à reação de 20 híbridos a podridão de giberela pela quantificação da incidência da doença, grãos ardidos e F. graminearum nos grãos e suas correlações; e o terceiro estudo caracterizou a resistência genética de híbridos à podridão de giberela pela elaboração de uma escala de reação envolvendo classes e intensidade de doença e suas correlações com produtividade de grãos e métodos de inoculação. Os experimentos do primeiro estudo foram conduzidos na safra 2011/12 em Cruz Alta, RS e Lages, SC. Os experimentos do segundo e terceiro estudos foram realizados em dois ambientes na safra agrícola 2012/13, em Cruz Alta. O delineamento dos experimentos foi em blocos casualizados com tratamentos arranjados num fatorial com quatro repetições. No primeiro estudo houve diferença na severidade da doença entre híbridos e métodos de inoculação. O híbrido P32R48H apresentou maior severidade da doença, diferindo dos demais. Inoculações no canal do estilo-estigma e ferimento dos grãos proporcionaram maior severidade da doença e menores produtividades de grãos. No segundo estudo o método de ferimento dos grãos proporcionou acréscimos superiores a 40% na incidência de espigas giberelas, incidência de grãos ardidos e incidência de F. graminearum nos grãos quando comparado ao método de injeção no canal do estilo estigma. Houve efeito de híbridos e os valores foram de 37,2% a 95,6% para incidência de espigas giberelas, 2,1% a 17,0% para grãos ardidos e 4,0% a 29,3% para incidência de F. graminearum nos grãos. Correlações significativas e positivas (r = 0,70) foram obtidas entre incidência de F. graminearum nos grãos e grãos ardidos. No terceiro estudo foi observado que a produtividade de grãos foi afetada pelos híbridos, independentemente do método de inoculação. Os híbridos P30F35YH e BG7049H obtiveram melhores produtividades, independente do ambiente e método de inoculação, sendo classificados como moderadamente suscetível à podridão de giberela. Os híbridos AG8025PRO, DKB250PRO2, AS1555PRO, Status, 30K64HNSR e P4285 foram classificados como moderadamente resistente, considerando a intensidade de giberela e o envolvimento da resistência à colonização do estigma (ponta da espiga) e resistência do grão. Houve relações significativas e positivas entre produtividade com injeção no canal do estilo-estigma (r = 0,93) e produtividade com ferimento dos grãos (r = 0,94) nos ambientes 1 e 2. Foi constatado que apesar de não haver hibridos resistentes existe variabilidade genética e o envolvimento de mecanismos de resistência do estigma e dos grãos, e que as podridões de giberela afetaram mais a qualidade dos grãos do que a quantidade