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Produção de mandioquinha-salsa (Arracacia xanthorrhiza B.) utilizando diferentes tipos de propágulos. / Production of arracacha (Arracacia xhanthorrhiza b.) from different types of propagules.

Bueno, Silvana Catarina Sales 14 April 2004 (has links)
A cultura da mandioquinha-salsa tem mostrado produção abaixo da demanda, na região sudeste, isso tem despertado o interesse dos produtores paulistas. Assim este trabalho teve como objetivo identificar algumas práticas na fase de produção de mudas e no sistema de cultivo, que permitam a expressão do potencial da cultura. As mudas foram avaliadas quanto ao tipo de propágulo: ápice e base do rebento maduro, e ápice do rebento juvenil; modo de pré enraizamento: canteiro de areia, tubete e plantio direto; no plantio de abril e no plantio de julho, em São Bento do Sapucaí -SP. O desempenho das plantas, a produção de raízes e rebentos, foi avaliado nos plantios de maio e de setembro, em Piracicaba - SP, utilizando as mudas produzidas em São Bento do Sapucaí. Durante o desenvolvimento das plantas, realizaram-se coletas de material vegetal, até o momento do transplantio e da colheita. Do período do pré-enraizamento até 30 dias após o transplantio no local definitivo, o propágulo juvenil apresentou o melhor desempenho. Contudo em épocas favoráveis podemos utilizar diversos tipos de propágulos, mediante a prática do pré-enraizamento dos rebentos. Em maio o ápice do rebento maduro pré-enraizado em tubete, promoveu uma produtividade estimada de 19,37 t/ha e na base do rebento maduro pré-enraizado em tubete 420.000 rebentos/ha As maiores quantidades raízes de melhor qualidade foram produzidas pelos rebentos maduros. No plantio de setembro os resultados foram insatisfatórios, com produtividade estimada de no máximo 1,65 t/ha de raízes. Em ambas as épocas de plantio os rebentos não serviram para serem utilizados como mudas, devido a infecções causadas por Xhanthomonas sp e Erwinia sp. Portanto, nesta região é possível a produção comercial de raízes. Entretanto é de fundamental importância, para se obter altas produtividades, utilizar rebentos maduros sadios e pré- enraizados. A instalação da cultura deve ser realizada no início do outono, para se colher as raízes durante o período de alta cotação e antes do aumento da pluviosidade. / The arracacha production in the southeast of Brazil has not met market demands, which has awakened the interest of growers. The purpose of the present work was to identify procedures in plantlets production and crop system which would allow the crop to express its full productive potential. Plantlets were evaluated considering the type of propagule (apex and base of mature shoots, and apex of juvenile shoots) and pre-rooting (in sand, in tubets or direct planting, without pre-rooting), for planting in April and July in São Bento do Sapucaí - SP. The plants performance and the production of roots and shoots were evaluated in crops planted in May and September in Piracicaba-SP, using plantlets produced in São Bento do Sapucaí. Plant material was collected during the plants development until transplanting and harvest. Juvenile propagules showed the best performance for plantlet production from the pre-rooting stage up to 30 days after transplanting to the field. However, in favorable periods several types of propagules undergoing pre-rooting can be used. In May, the plantlets produced from the apex of mature shoots pre-rooted in tubets promoted an estimate yield of 19.37 t/ha and 420,000 shoots/ha at the base of the mature shoots pre-rooted in tubets. Mature shoots yielded the largest amounts of best quality roots. Results were unsatisfactory for the September planting, with a maximum estimate yield of 1.65 t of roots/ha. Shoots were unsuitable for use as plantlets in both planting periods due to infections by Xanthomonas sp and Erwinia sp. The commercial production of roots in the studied region is possible. However, the use of good quality, pre-rooted shoots. The planting of the culture in mid-fall enable the harvest at the period of high market prices for the product, so that the harvest happens before the increase in rainfall, is fundamental to ensure high productivity and good quality.
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Detecção de proteínas e partículas virais do HTLV-1 em glândulas salivares de pacientes com Síndrome de Sjögren e de infectados pelo HTLV-1 / Detection of HTLV-1 viral proteins and particles in the salivary glands of patients with Sjögren\'s Syndrome and patients infected with HTLV-1

Vale, Daniela Assis do 05 December 2017 (has links)
O HTLV-1 (human T-cell lymphotropic virus type 1) foi o primeiro retrovírus humano a ser identificado. O HTLV-1 tem a capacidade de ativar e gerar uma intensa resposta inflamatória, podendo levar a alterações em diversos tecidos que mimetizam uma doença autoimune. Do complexo de doenças associadas ao HTLV-1, a Síndrome de Sjögren (SS) figura entre as mais estudadas. No entanto, nenhuma relação definitiva foi ainda estabelecida. Este trabalho propõe-se a investigar indícios da presença do HTLV-1 em glândulas salivares menores de pacientes infectados por esse retrovírus e comparar as alterações morfológicas em glândulas salivares menores de pacientes com HTLV-1 e de pacientes com SS não infectados. Amostras de glândula salivar menor foram coletadas de 14 pacientes HTLV+ que apresentavam síndrome seca (grupo de estudo) e 5 pacientes diagnosticados com SS e negativos para o HTLV (grupo controle). No grupo de estudo, o infiltrado inflamatório visto era composto principalmente por linfócitos T CD4+, no grupo controle a população majoritária foi de linfócitos B CD20+. Alterações morfológicas como fibrose e infiltração gordurosa foram mais comumente vistas nas amostras do grupo de estudo, sendo a diferença estatisticamente significativa (p=0,038 e 0,033 respectivamente). Na análise por PCR 11 (78,57%) dos casos do grupo de estudo foi detectado o gene tax e/ou rex do HTLV-1, no entanto 4 (80%) das amostras do grupo controle também foram positivas. O HTLV-1 mostra indícios de estar presente nas glândulas salivares de indivíduos com síndrome seca, no entanto pacientes HTLV-1+ apresentam alterações morfológicas em padrões diferentes dos vistos em pacientes com SS, denotando uma provável diferença no processo de ativação imunológica. / Human T-cell lymphotropic virus type I (HTLV-1) was the first human retrovirus to be discovered. HTLV-1 has the ability to activate and generate an intense inflammatory response, which can lead to changes in several tissues that mimic an autoimmune disease Of the complex of diseases associated with HTLV-1, Sjögren\'s Syndrome (SS) is among the most studied. The aim of this study is to investigate the presence of HTLV-1 in the minor salivary glands of patients infected with this retrovirus and to compare the morphological alterations in the salivary glands of patients with HTLV-1 and patients with SS uninfected. Minor salivary gland samples were obtained from 14 HTLV + patients with dry syndrome (study group) and 5 patients diagnosed with SS and HTLV negative (control group). In the study group, the inflammatory infiltrate was mainly composed of CD4+ T lymphocytes, in the control group the majority population was of CD20+ B lymphocytes. Morphological changes such as fibrosis and adipose tissue infiltration were more common in the study group, the difference was statistically significant (p = 0.038 and 0.033, respectively). The HTLV-1 tax and/or rex genes were detected by PCR in 11 (78.57%) patients of the study group, but 4 (80%) samples from the control group were also positive. HTLV-1 shows signs of being present in the salivary glands of individuals with dry syndrome however, HTLV-1+ patients present morphological alterations in different patterns from those observed in SS patients, denoting a probable difference in the immunological activation process.
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Propriedades funcionais em genótipos de amendoim adaptados ao semiárido: capacidade de desativação de espécies reativas do oxigênio e acessibilidade de polifenóis / Functional properties of peanut genotypes adapted to the Brazilian semiarid region: reactive oxygen species scavenging activity and accessibility of polyphenols

Massarioli, Adna Prado 08 February 2019 (has links)
O amendoim é um alimento conhecido pelo seu alto conteúdo proteico e lipídico, também, destaca-se com alto teor de compostos fenólicos, conhecidos por suas propriedades antioxidantes. A cultura do amendoim possui uma ampla adaptabilidade às condições tropicais e o seu cultivo no nordeste brasileiro possui um papel importante para a renda dos pequenos agricultores da região. Em atendimento a esses agricultores, a Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (Embrapa) detém o programa de melhoramento genético do amendoim para ambientes semiáridos, no desenvolvimento de cultivares tolerantes ao estresse hídrico. No presente estudo, um total de 14 genótipos pertencentes Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa (sendo 6 genótipos tolerantes, 1 médio tolerante e 7 não tolerantes à seca) foram analisados quanto à composição fenólica e o potencial no sequestro de espécies reativas do oxigênio, além da análise da bioacessibilidade desses compostos após a digestão simulada in vitro, nunca antes determinados para tais genótipos. Este trabalho está organizado em quatro capítulos, divididos na seguinte forma: Capítulo I destina-se à revisão da literatura; Capítulo II descreve o estudo com os genótipos BR1 (tolerante à seca) e LViPE-06 (não tolerante à seca) para determinar as melhores condições de obtenção do extrato rico em compostos fenólicos com atividade antioxidante e para determinar o perfil fenólico dos cotilédones e películas pela técnica LC-ESI-QTOF-MS; Capítulo III, com base nas condições estabelecidas para a extração, foram produzidos os extratos (cotilédones e películas) dos 14 genótipos de amendoins e analisados quanto ao sequestro de cinco diferentes espécies reativas de oxigênio; Capítulo IV, a acessibilidade dos compostos fenólicos majoritários do amendoim, inclusive o ácido p-cumárico, do genótipo BR1 foi determinada por meio da digestão simulada in vitro. Os valores estabelecidos de temperatura e grau de hidratação do etanol para a obtenção dos extratos dos cotilédones foram de 60°C e 35% e para os extratos das películas os valores foram de 40°C e 60%, que permitiram obter extratos com os maiores teores de compostos fenólicos e atividade antioxidante. Por meio da técnica LC-ESI-QTOF-MS os principais compostos fenólicos presentes nos extratos dos cotilédones foram os derivados do ácido p-cumárico e do p-cumaroil e nos extratos das películas, as procianidinas oligoméricas do tipo A. Quanto ao sequestro de espécies reativas, os extratos de películas se mostraram excelentes, especialmente no sequestro do radical hidroxila cujos valores do IC50 foram inferiores à concentração de 0,1 μg/mL e, concentrações maiores dos extratos (IC50= 29,07 - 42,84 μg/mL) foram necessárias para o sequestro do peróxido de hidrogênio. Entre os extratos dos cotilédones, se destacou o extrato do amendoim do genótipo BR1, no sequestro do radical superóxido (inibição de 28,85% na concentração de 50 μg/mL), peróxido de hidrogênio (IC25= 304,61 μg/mL) e radical peroxila (738,97 μmol Trolox/g). A acessibilidade de sete compostos fenólicos majoritários de amendoim variou de 7 a 100% sendo que o ácido p-cumárico se apresentou em maior concentração após a digestão simulada in vitro (252,86 μg/g) quando comparada à do extrato da amostra não digerida (68,55 μg/g). / Peanut is a food known for its high protein and lipid content as well as for its high content of phenolic compounds, which are described to have antioxidant properties. Peanut cultivation has a wide adaptability to tropical conditions and plays an important role in income generation among small local farmers in northeastern Brazil. To meet these farmers\' needs, the Brazilian Agricultural Research Corporation (Embrapa) holds a peanut genetic improvement program for semi-arid environments through which they develop cultivars tolerant to water stress. In this study, a total of fourteen genotypes from the Embrapa\'s Germplasm Active Collection (six drought-tolerant genotypes, one mild tolerant and seven non-drought tolerant) were analyzed for their phenolic composition, potential for scavenging reactive oxygen species, and bio-accessibility after in vitro simulated digestion, which have never been investigated for such genotypes. This study is organized into four chapters, as follows: Chapter I corresponds to the literature review; Chapter II describes the study with BR1 (drought tolerant) and LViPE-06 (non-drought tolerant) genotypes to determine the optimal conditions to obtain a phenolics-rich extract with antioxidant activity, as well as to determine the phenolic profile of peanut cotyledon and skin by the LC-ESI-QTOF-MS technique; Chapter III, based on the conditions established for extraction, cotyledon and skin extracts of the fourteen peanut genotypes were produced, which were analyzed for their scavenging capacity with five different reactive oxygen species; Chapter IV, the accessibility of the major phenolic compounds present in BR1 peanut genotype, including p-coumaric acid, was determined by in vitro simulated digestion. The optimal temperature and ethanol hydration to obtain the peanut cotyledon and skin extracts were 60°C and 35% and 40°C and 60%, respectively, which yielded extracts with the highest contents of phenolic compounds and strong antioxidant activity. The analysis by LC-ESI-QTOF-MS identified the main phenolic compounds present in the extracts, namely: derivatives of p-coumaric acid and p-cumaroil in cotyledon extracts, and type A oligomeric procyanidins in skin extracts. Skin extracts showed excellent reactive species scavenging activity, especially of hydroxyl radical, as IC50 values were lower than 0.1 μg/mL; higher concentrations of the extracts (IC50 = 29.07-42.84 μg / mL) were required for scavenging hydrogen peroxide. Among the cotyledon extracts, the extract from peanut genotype BR1 showed promising capacity to scavenge superoxide radical (inhibition of 28.85% at 50 μg/mL), hydrogen peroxide (IC25 = 304.61 μg/mL) and peroxyl radical (738.97 μmol Trolox/g). The bio-accessibility of seven major phenolic compounds ranged from 7% to 100%, with a higher concentration of p-coumaric acid found after in vitro simulated digestion (252.86 μg/g) as compared to the undigested extract (68.55 μg/g).
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Produção de biomassa, compostos fenólicos e atividade antioxidante em Passiflora incarnata L. mediante adubação orgânica e diferentes períodos de corte em solo arenoso / Biomass production, phenolic compounds and antioxidant activity in Passiflora incarnata L. by organic fertilization and different cutting periods in sandy soil

Feba, Luís Gustavo Torquato 19 November 2018 (has links)
Submitted by Michele Mologni (mologni@unoeste.br) on 2019-01-24T15:51:50Z No. of bitstreams: 1 Luís Gustavo Torquato Feba.pdf: 2538384 bytes, checksum: e99480491242ecf61572f38231c04aa7 (MD5) / Made available in DSpace on 2019-01-24T15:51:50Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Luís Gustavo Torquato Feba.pdf: 2538384 bytes, checksum: e99480491242ecf61572f38231c04aa7 (MD5) Previous issue date: 2018-11-19 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - CAPES / The objective of this research was to evaluate the production of passion fruit (Passiflora incarnata L.) in the edaphoclimatic conditions of Presidente Prudente-SP, as well as its development in sandy soil under the effect of organic fertilization. A randomized block design with six treatments and four replicates was used. Were tested 3 kinds of fertilizers (fertilizer without control, cattle manure - 7.6 t ha-1 and chicken manure - 4.2 t ha-1) and two cutting times (at 90 and 150 days after planting) . At each cutting season the dry biomass production (aerial part) was evaluated and total phenol content, total flavonoids and antioxidant activity in the ethanolic extract of the plants were analyzed. Soil chemical analyzes were performed for comparison with the initial condition and foliar analyzes for the macronutrient content for each cutting season. Dry matter production was not affected by the factors "fertilization" and "cutting season". The content of total phenolic compounds in leaves was higher in plants fertilized with cattle and chicken manure, which also resulted in higher antioxidant activity. Factors "fertilization" and "time" cutting exerted isolated effect on soil chemical properties at the end of the experiment, and the poultry manure provided increases in K, Mg and the sum of the ground bases and the second cut were observed lower contents of organic matter, S and K compared to the first cut. The average yield obtained in the treatments (1 t.ha-1) is within the expected for the crop. the wild passion fruit cultivation The conclusion that can be given to the state western region of São Paulo and the organic fertilizer via use of cattle and chicken waste has resulted in higher quality of the raw material due to the higher phenolic concentration in the leaves and higher antioxidant activity. It is recommended that the quantities of manure applied be greater than those recommended to result in biomass gains, depending on the sandy soil condition of the site, in which the decomposition of manures is faster. / O objetivo deste trabalho de pesquisa foi avaliar a produção do maracujá silvestre (Passiflora incarnata L.) nas condições edafoclimáticas de Presidente Prudente- SP, bem como o seu desenvolvimento em solo arenoso sob o efeito da adubação orgânica. Utilizou-se o delineamento de blocos ao acaso, com seis tratamentos e quatro repetições. Foram testados 3 tipos de adubação (controle sem adubação, esterco de gado – 7,6 toneladas ha-1 e esterco de galinha – 4,2 toneladas ha-1) e 2 épocas de corte (aos 90 e 150 dias após o plantio). Em cada época de corte foi avaliada a produção de biomassa seca (parte aérea) e foram realizadas análises quanto ao teor de fenóis totais, flavonoides totais e atividade antioxidante no extrato etanoico das plantas. Realizaram-se também análises químicas do solo, para comparação com a condição inicial e análises foliares quanto ao teor de macronutrientes para cada época de corte. A produção de massa seca não foi afetada pelos fatores “adubação” e “época de corte”. O teor de compostos fenólicos totais nas folhas foi maior nas plantas adubadas com estercos de gado e galinha, o que resultou também em maior atividade antioxidante. Os fatores “adubação” e “época” de corte exerceram efeito isolado sobre os atributos químicos do solo ao final do experimento, sendo que o esterco avícola proporcionou aumentos nos teores de K, Mg e na soma de bases do solo e no segundo corte foram observados menores teores de matéria orgânica, S e K em comparação ao primeiro corte. A média de produtividade obtida nos tratamentos (1 t.ha-1) encontra-se dentro do esperado para a cultura. Concluiu-se que o cultivo de maracujá silvestre pode ser indicado para a região Oeste do Estado de São Paulo e que a adubação orgânica via utilização de resíduos avícola e bovino resultou em maior qualidade da matéria prima, devido à maior concentração fenólica nas folhas e maior atividade antioxidante. Recomenda-se que as quantidades de esterco aplicadas sejam maiores que as recomendadas para resultar em ganhos de biomassa, em função da condição de solo arenoso do local, no qual a decomposição dos estercos é mais rápida.
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Escore de enchimento ruminal como ferramenta de monitoramento da saúde em vacas leiteiras no período de transição

Meotti, Otávio Backes 03 1900 (has links)
Submitted by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2017-06-12T13:44:14Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) OTÁVIO BACKES MEOTTI.pdf: 806223 bytes, checksum: d35606330f21e0cb45f98cc7474c455a (MD5) / Approved for entry into archive by Marcos Anselmo (marcos.anselmo@unipampa.edu.br) on 2017-06-12T13:44:34Z (GMT) No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) OTÁVIO BACKES MEOTTI.pdf: 806223 bytes, checksum: d35606330f21e0cb45f98cc7474c455a (MD5) / Made available in DSpace on 2017-06-12T13:44:34Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) OTÁVIO BACKES MEOTTI.pdf: 806223 bytes, checksum: d35606330f21e0cb45f98cc7474c455a (MD5) Previous issue date: 2017-03 / O período de transição é uma fase crítica na vida produtiva das vacas leiteiras, devido ao aumento do seu requerimento nutricional, concomitante a uma redução fisiológica na ingestão de matéria seca, e comprometimento imune. Devido a estes fatores, este período se associa a um estado catabólico, com alta incidência de enfermidades metabólico-nutricionais e infecciosas, que levam a perdas econômicas e deterioro do bem-estar animal. Como muitas dessas enfermidades são antecedidas por uma diminuição na ingestão de matéria seca (IMS), a avaliação de indicadores relacionados ao consumo poderiam servir para predizer o risco de doenças, durante o período de transição. Como o escore de enchimento ruminal (EER) apresenta uma boa correlação com IMS a presente dissertação teve dois objetivos: 1- correlacionar e comparar os escores de enchimento ruminal (EER, 1 a 5) com indicadores sanguíneos do balanço energético e mineral. 2- validar o escore de enchimento ruminal como ferramenta de monitoramento de saúde e taxa de retorno a ciclicidade em vacas leiteiras no período pré-parto. Para responder aos objetivos realizou-se um estudo de coorte com 113 vacas multíparas Holstein, e os resultados de cada objetivo são apresentados em 2 artigos separados. Para responder ao objetivo 1 foram coletados semanalmente nas semanas -2,-1, parto, +1,+2,+3, uma amostra de sangue para analisar as concentrações de βOH-butirato (BHBA), ácidos graxos não esterificados (NEFA), colesterol e cálcio, e aferido simultaneamente o EER e escore de condição corporal (ECC) das vacas. Nesse estudo comprovou-se que o EER correlacionou-se principalmente com o ECC. Também, se observou que o EER associou-se com indicadores sanguíneos estudados tanto no período pré como pós-parto, sendo que vacas com maiores EER (EER3) apresentaram maiores concentrações de cálcio, BHBA e colesterol no pré-parto. Já, no pós-parto vacas com EER1 tiveram valores maiores de NEFA e menores de colesterol que vacas com EER3. Para responder ao objetivo 2 mensurou-se o EER nas semanas -2, -1 e parto, diagnosticou-se a ocorrência de doenças clínicas e avaliou-se o regresso a ciclicidade entre a 4º e 8º semana pós-parto. Determinou-se o EER como preditor das doenças mais prevalentes (metrite, mastite, retenção placentária, deslocamento de abomaso e afecções podais). Observou-se que o EER≤2 duas semanas antes do parto foi um bom preditor de todas as doenças acima descritas, com sensibilidade variando de 53% a 75% e especificidade de 80%. Por outro lado, vacas com EER1 durante o pré-parto e parto voltaram mais tardiamente a ciclicidade e em menor porcentagem quando comparadas com vaca com EER3. Portanto o escore de enchimento ruminal correlacionou-se com os indicadores sanguíneos durante período de transição, bem como serviu como preditor para as doenças do período de transição e regresso a ciclicidade, podendo ser utilizado como ferramenta de monitoramento da saúde de vacas leiterias multíparas. / The transition period is a critical phase in the productive lives of dairy cows, due to the increase in their nutritional requirement, concomitant with a physiological reduction in dry matter intake, and immune compromise. Due to these factors, this period is associated with a catabolic state, with a high incidence of metabolic-nutritional and infectious diseases, leading to economic losses and deterioration of animal welfare. Since many of these diseases are preceded by a decrease in dry matter intake (DMI), the evaluation of consumption indicators could serve to predict disease risk during the transitional period. As the rumen fill score (RFS) presents a good correlation with DMI, the present dissertation had two objectives: 1 – To correlate and compare rumen fill (RFS, 1 to 5) with blood indicators of negative energy balance. 2 – To validate the rumen fill score as a health monitoring tool and rate of return to cyclicality when it comes to dairy cows’ pre-calving. In order to answer the objectives, a cohort study was carried out with 113 Holstein multiparous cows, and the results of each objective are presented in 2 separate articles. To respond to objective 1 blood samples were collected to analyze the concentrations of βOH-butyrate (BHBA), non-esterified fatty acids (NEFA), cholesterol and calcium at week -2, -1, calving, + 1, + 2, +3, and simultaneously, RFS and cow’s body condition score (BCS) were measured. It was verified in this study that the RFS is correlated mainly with the BCS. Also, it was observed that the RFS was associated with blood indicators studied in pre and post partum periods, and cows with higher RFS (RFS 3) had higher concentrations of calcium, BHBA and cholesterol in prepartum. In the postpartum period, cows with RFS 1 had higher NEFA values and lower cholesterol than cows with RFS 3. To respond to objective 2, the RFS was measured at week -2, -1 and calving, clinical diseases were diagnosed and the return to cyclicity between the 4th and 8th week postpartum was evaluated. RFS was determined as a predictor of the most prevalent diseases (metritis, mastitis, placental retention, displaced abomasum and lameness). It was observed that EER≤2 two weeks before calving was a good predictor of all diseases described above, with sensitivity varying from 53% to 75% and specificity of 80%. On the other hand, cows with EER1 during prepartum and calving returned to cyclicity later and in a lower percentage when compared to cows with EER3. Therefore, the ruminal filling score correlated with the blood indicators during the transitional period, and served as a predictor for the diseases of the transition period and return to cyclicity. It can be used as a monitoring tool for the health of multiparous dairy cows.
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Identificação de genes e promotores relacionados ao estresse de seca em cana-de-açúcar e obtenção de plantas transgênicas / Identification of genes and promoters related to drought stress in sugarcane and the generation of transgenic plants

Horta, Carolina Gimiliani Lembke 22 April 2013 (has links)
A cana-de-açúcar possui uma característica única entre as plantas de interesse econômico mundial: a capacidade de acumular altos níveis de sacarose no colmo. No Brasil, em virtude do aumento da demanda interna e mundial por fontes energéticas renováveis, é nítida a expansão da cultura canavieira para regiões menos propícias para cultivo, como as regiões secas do centro-oeste brasileiro. O déficit hídrico é um dos principais agentes que afetam o desenvolvimento das plantas e a obtenção de variedades melhor adaptadas é fundamental para a sustentabilidade e expansão da agroindústria canavieira. Neste sentido, genes regulados por seca são alvos importantes para a obtenção de plantas transgênicas mais tolerantes ao estresse. Como a expressão constitutiva do transgene pode causar efeitos indesejáveis nas plantas transgênicas, também é necessária a identificação de promotores induzíveis pelo estímulo ambiental. O objetivo deste trabalho é a identificação de genes e sequências promotoras reguladas pela seca em cana-de-açúcar que, além de contribuir com o entendimento dos mecanismos envolvidos na tolerância ao estresse, podem ser utilizados como alvos para obtenção de plantas transgênicas mais resistentes. Para a identificação de genes diferencialmente regulados por seca, utilizamos diferentes plataformas de microarranjo: SUCAST (com 1.830 genes relacionados à transdução de sinal), SUCAMET (com 4.594 genes relacionados a metabolismo) e CaneRegNet (com sondas para a identificação de transcritos senso e antisenso que correspondem a 14.522 genes únicos). Nestas plataformas, analisamos a expressão dos genes de quatro variedades de cana-de-açúcar, duas tolerantes e duas sensíveis à seca, submetidas a 24, 72 e 120 h de déficit hídrico. Dos genes diferencialmente expressos (alguns identificados como transcritos pelas fitas senso e/ou antisenso), 53 foram selecionados para validação por PCR em tempo real. As regiões promotoras de quatro dos genes selecionados foram identificadas por meio das técnicas de andamento cromossômico, de seleção e sequenciamento de cromossomos artificiais de bactéria contendo DNA de cana-de-açúcar e de análise de contigs obtidos por Whole Genome Shotgun. Sete sequências promotoras foram selecionadas e clonadas em um vetor contendo o gene repórter gus. As atividades promotoras destas sequências foram testadas e verificadas em transformações transientes de calos embriogênicos de cana-deaçúcar. Para obtenção de plantas de cana-de-açúcar transgênicas, selecionamos o gene induzido por seca que codifica uma PP2C. Através da transformação de calos embriogênicos de cana-de- açúcar com vetor de silenciamento de pp2c, obtivemos algumas plantas com expressão de pp2c reduzida. O transcriptoma das plantas transgênicas foi avaliado. Em comparação com plantas controles e em condições normais de irrigação, identificamos 352 transcritos com expressão alterada. As plantas transgênicas com pp2c silenciado e plantas controles também foram estudadas num experimento de supressão de rega. Os dados fisiológicos e as observações morfológicas demonstraram que um dos eventos transgênicos apresentou tolerância à seca. A comparação do transcriptoma das plantas irrigadas contra as submetidas à seca e da planta tolerante contra não tolerantes ao estresse mostrou que diversos genes estavam diferencialmente regulados, inclusive aqueles envolvidos na sinalização por ABA, via no qual o gene pp2c atua. / Sugarcane has a unique characteristic among crop plants in the world: the ability to accumulate high levels of sucrose in its stems. In Brazil, due to the local and global increasing demand for renewable energy sources, it is notable the expansion of sugarcane cultivation to areas less favorable for cultivation, such as the dry regions of central-western Brazil. Water deficit is one of the main agents that affect plant development. The production of better varieties is critical to the sustainability and expansion of the sugarcane industry. In this way, genes regulated by drought are important targets for obtaining transgenic plants tolerant to stress. Since transgene constitutive expression may cause unwanted effects in transgenic plants, it is also important to identify of stress inducible promoters. The goal of this work is the identification of genes and promoters regulated by drought in sugarcane that, in addition to contributing to the understanding of the mechanisms involved in stress tolerance, can be used as targets for the production of transgenic plants more resistant to water stress. For the identification of genes differentially expressed in response to drought, we have used different microarray platforms: SUCAST (contains 1,830 genes related to signal transduction), SUCAMET (contains 4,594 genes related to metabolism) and CaneRegNet (contains probes for the identification of sense and antisense transcripts that correspond to 14,522 unique genes). In these platforms we analysed gene expression of four different sugarcane varieties, two tolerant and two sensitive to drought, after 24, 72 and 120 h of water deficit. From the genes differentially expressed (some transcribed by the sense and/or antisense strand), 53 were selected for qPCR validation. Promoter regions of four genes were identified by Chromosome Walking, selection and sequencing of BACs and the analyses of Whole Genome Sequencing contigs. Seven promoter sequences were selected and cloned into a vector containing the gus reporter gene. Promoter activity was tested and verified through the transient transformation of sugarcane embryogenic calli. For sugarcane transgenics production we selected the drought-induced pp2c gene. Through the transformation of sugarcane embryonic calli with a vector for pp2c silencing we obtained transformed plants with pp2c gene expression reduced. The transcriptome of transgenic plants was analysed. In comparison with control plants and in irrigated conditions, we identified 352 differentially expressed transcripts. Transgenic plants with silenced pp2c and control plants were studied in a pilot drought experiment. Physiological data and morphological observations indicated that one of the transgenic events presented tolerance to drought. The comparison between irrigated and drought plants and between tolerant and no tolerant showed that a large number of genes was differentially regulated including genes related to the ABA signaling, pathway in which pp2c acts.
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Mapeamento associativo para múltiplos ambientes e múltiplos locos, visando tolerância à seca em milho / Multi-environment-multi-locus association mapping for drought tolerance in maize

Anoni, Carina de Oliveira 08 April 2016 (has links)
A seca é um dos estresses abióticos mais importantes na cultura do milho, o qual ocasiona reduções significativas na produção de grãos. A arquitetura genética da tolerância à seca é complexa, fazendo-se necessária a melhor compreensão desse caráter. Estudos envolvendo mapeamento associativo são úteis por explorarem a variação genética de caracteres quantitativos e, adicionalmente, levam em conta informações acerca de genótipos, ambientes e interações genótipo por ambiente (G × E). Ao considerar efeitos de G × E em modelos de mapeamento associativo há possibilidade de identificar regiões no genoma associadas à condições e ambientes específicos. Este trabalho teve como objetivo detectar associações relacionadas à tolerância à seca em milho por meio de um modelo de mapeamento associativo para múltiplos ambientes e múltiplos locos, o qual permitiu distinguir associações com efeitos ambiente-específico daquelas com efeitos principais e de interação associação por ambiente (QEI). O painel associativo foi composto por 190 linhagens, classificadas de acordo com os grupos heteróticos quanto ao tipo de grão. Marcadores SNPs (∼500k) foram utilizados para a genotipagem do painel associativo. Duas linhagens (L228-3 e L3) foram usadas como testadores comuns e os híbridos obtidos foram avaliados em duas localidades (Janaúba-MG e Teresina-PI), dois anos agrícolas (2010 e 2011), sob duas condições de tratamento (irrigado e não irrigado). Ao total, consideraram-se seis caracteres: peso de grãos, intervalo de florescimento, florescimento feminino e masculino, altura de planta e de espiga. Consideraram-se dois grupos de mapeamento, agrupados de acordo com os testadores utilizados. SNPs foram úteis para testar associações ao longo do genoma do milho e investigar o relacionamento genético entre indivíduos. O modelo de mapeamento associativo, com inclusão de informações sobre interação G × E, detectou o total de 179 associações, e o maior número de associações foram relacionadas aos caracteres de florescimento. A maioria das associações (168) apresentaram QEI significativo, sendo que o tamanho e a magnitude desses efeitos distinguiram-se de acordo com o ambiente em avaliação. Apenas o caráter florescimento feminino não apresentou associações com efeitos estáveis ao longo dos ambientes em estudo. A detecção de algumas associações em posições próximas do genoma evidenciam possíveis efeitos de pleiotropia. Algumas associações foram co-localizadas em regiões do genoma do milho relacionadas à tolerância à seca, sendo que algumas dessas associações estavam envolvidas a fatores pertencentes à vias metabólicas de interesse. O presente estudo forneceu informações úteis para a compreensão da base genética da tolerância à seca em milho sob os ambientes específicos em avaliação. / Drought is a severe stress factor in maize production and causes significant reduction in grain yield. Genetic architecture of drought tolerance is complex and a better understanding of this trait is required. Association mapping studies are useful to explore quantitative traits and simultaneously account for genetic backgrounds including genotype, environment and genotype-by-environment (G × E) interactions. By accounting for G × E into association mapping models it is possible to identify regions associated with specific environment and conditions. The main goal of this study was detect significant associations related to drought tolerance in maize via multi-environment-multi- locus association mapping model, distinguishing information about specific-environment effects from main and association-by-environment (QEI) effects. Our association panel was composed by 190 inbred lines classified according to heterotic groups. The panel was genotyped with ∼500K SNPs. Two inbred lines (L228-3 and L3) were used as common testers and testcrosses were assessed in two locations (Janaúba-MG e Teresina-PI), two years (2010 and 2011), under two treatment conditions (well-watered and water-stressed). A total of six traits were evaluated including grain yield, anthesis-silking interval, female and male flowering time, plant and ear height. Two mapping groups were considered, grouped by common testers. SNPs were used to test significant association along the maize genome and also to account for population structure and relatedness coefficient. Our mapping model detected a total of 179 associations and the highest number of associations were related to the flowering time measures. The most associations (168) showed significant QEI and the size and magnitude of those effects were distinguished by environment conditions. Only female flowering trait did not show stable effects across all environments. Mapped associations in nearby positions indicate plausible pleiotropy effects. Some associations were co-located in maize genome regions related to metabolic pathway factors. Our study support the detection of significant associations along the maize genome and contributes for understanding of the genetic basis of drought tolerance in maize.
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Lutas, glórias e desencantos: a peregrinação do retirante nordestino para São Paulo nas décadas de 1950 e 1960

Ferraz, Isaac Vitório Correia 03 May 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-04-25T20:20:36Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Isaac Vitorio Correia Ferraz.pdf: 1895631 bytes, checksum: 9b8c8bfdd971d1d619b459ef492e1491 (MD5) Previous issue date: 2012-05-03 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / the migration process was and remains a reality in Brazil, a country marked by great inequalities. The more developed regions have always been a focus of attraction for the inhabitants of less developed regions, what happened markedly between the Southeast and Northeast. In search of better living conditions, driven away by drought, in a political context that benefited from it, thousands of migrants from the region of Vitória da Conquista, Bahia in the southwest, this paper focuses on the migration to São Paulo in the 1950 s and the 1960 s, marked the withdrawal process, and when Brazil has undergone major economic changes, political and social. The method chosen for the research was qualitative, with interviews and obtaining oral histories of migrants aged over 60 years. There is a cultural value evident in all spheres of the paths they traveled. The reports show feelings of longing, passion, love for homeland and their loved ones, and the suffering that was always present in the lives of respondents. Migrants staged moments of exclusion and discrimination. The need for survival drove the trip to São Paulo, but the culture shock has marked their lives / O processo migratório foi e continua sendo uma realidade no Brasil, país marcado por grandes desigualdades. As regiões mais desenvolvidas sempre foram foco de atração para os habitantes das regiões menos desenvolvidas, o que aconteceu de forma marcante entre as regiões Sudeste e Nordeste. Em busca de melhores condições de vida, afugentados pela seca, num contexto político que se beneficiou dela, milhares de migrantes nordestinos se deslocaram de sua terra natal para São Paulo. Buscando revelar a trajetória dos migrantes oriundos da região de Vitória da Conquista, no sudoeste da Bahia, o presente trabalho tem como foco os fluxos migratórios para São Paulo nos anos de 1950 e 1960, décadas marcantes no processo de retirada, e momento em que o Brasil passou por grandes mudanças econômicas, políticas e sociais. O método eleito para a pesquisa foi o qualitativo, com a realização de entrevistas e obtenção de relatos orais de migrantes com idades superiores a 60 anos. Há uma dimensão cultural de valor notório em todas as esferas das trajetórias por eles percorridas. Os relatos demonstram sentimentos de saudade, emoção intensa, amor pela terra natal e pelos seus entes queridos, além do sofrimento que sempre se fez presente na vida dos entrevistados. Os migrantes protagonizaram momentos de exclusão e discriminação. A necessidade de sobrevivência impulsionou a ida para São Paulo, mas o choque cultural marcou a vida dessas pessoas
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Lutas, glórias e desencantos: a peregrinação do retirante nordestino para São Paulo nas décadas de 1950 e 1960

Ferraz, Isaac Vitório Correia 03 May 2012 (has links)
Made available in DSpace on 2016-04-26T14:53:30Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Isaac Vitorio Correia Ferraz.pdf: 1895631 bytes, checksum: 9b8c8bfdd971d1d619b459ef492e1491 (MD5) Previous issue date: 2012-05-03 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico / the migration process was and remains a reality in Brazil, a country marked by great inequalities. The more developed regions have always been a focus of attraction for the inhabitants of less developed regions, what happened markedly between the Southeast and Northeast. In search of better living conditions, driven away by drought, in a political context that benefited from it, thousands of migrants from the region of Vitória da Conquista, Bahia in the southwest, this paper focuses on the migration to São Paulo in the 1950 s and the 1960 s, marked the withdrawal process, and when Brazil has undergone major economic changes, political and social. The method chosen for the research was qualitative, with interviews and obtaining oral histories of migrants aged over 60 years. There is a cultural value evident in all spheres of the paths they traveled. The reports show feelings of longing, passion, love for homeland and their loved ones, and the suffering that was always present in the lives of respondents. Migrants staged moments of exclusion and discrimination. The need for survival drove the trip to São Paulo, but the culture shock has marked their lives / O processo migratório foi e continua sendo uma realidade no Brasil, país marcado por grandes desigualdades. As regiões mais desenvolvidas sempre foram foco de atração para os habitantes das regiões menos desenvolvidas, o que aconteceu de forma marcante entre as regiões Sudeste e Nordeste. Em busca de melhores condições de vida, afugentados pela seca, num contexto político que se beneficiou dela, milhares de migrantes nordestinos se deslocaram de sua terra natal para São Paulo. Buscando revelar a trajetória dos migrantes oriundos da região de Vitória da Conquista, no sudoeste da Bahia, o presente trabalho tem como foco os fluxos migratórios para São Paulo nos anos de 1950 e 1960, décadas marcantes no processo de retirada, e momento em que o Brasil passou por grandes mudanças econômicas, políticas e sociais. O método eleito para a pesquisa foi o qualitativo, com a realização de entrevistas e obtenção de relatos orais de migrantes com idades superiores a 60 anos. Há uma dimensão cultural de valor notório em todas as esferas das trajetórias por eles percorridas. Os relatos demonstram sentimentos de saudade, emoção intensa, amor pela terra natal e pelos seus entes queridos, além do sofrimento que sempre se fez presente na vida dos entrevistados. Os migrantes protagonizaram momentos de exclusão e discriminação. A necessidade de sobrevivência impulsionou a ida para São Paulo, mas o choque cultural marcou a vida dessas pessoas
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Uso de levedura na alimentação de bovinos de corte : uma revisão sistemática-metanálise / Yeast use in beef cattle feeding : a systematic review-meta-analysis

Sartori, Everton Dezordi January 2016 (has links)
O objetivo desta metanálise foi avaliar os efeitos da suplementação com levedura (Saccharomyces cerevisiae) sobre o ganho de peso médio diário e o consumo de matéria seca (CMS) de bovinos de corte. Os critérios para inclusão considerados foram ensaios aleatórios, suplementação com levedura Saccharomyces cerevisiae em comparação com um tratamento controle e que avaliassem o GMD e CMS. Os dados foram extraídos dos artigos relevantes a partir de um protocolo pré-definido. Uma metanálise de efeitos aleatórios foi conduzida para cada indicador separadamente com as médias do grupo controle e tratado. Foram utilizadas 12 publicações que relatam 22 estudos e 22 ensaios em 1161 bovinos analisados. Os níveis de heterogeneidade entre estudos foram elevados, variado entre 92 e 99%. Não foram observados efeitos (MD=-2,849 g, p=0,492) da inclusão de leveduras sobre o GMD. Contudo, observou-se redução no CMS (MD=-0,885 kg, p=0,023) para o grupo tratado. O GMD foi maior quando os níveis de volumoso da dieta ficaram entre 30 e 50% (MD=641,08 g, p=0,001) e diminuiu quando os níveis eram entre 51 e 75% (MD= -2,90 g, p=0,000). Quando o teor de FDN foi superior a 60% o uso de levedura diminuiu o GMD em 406,94 g (p=0,034). Foi observada uma redução no CMS nos bovinos manejados em sistema de confinamento (MD= -0,97, p=0,019) quando suplementados com levedura. Animais Bos taurus apresentaram maior CMS quando não suplementados, enquanto que os Bos indicus, apresentaram maior CMS suplementados com levedura (MD= -1,70 kg, p=0,000 e MD= 2,38 kg, p=0,000, respectivamente). Assim, a suplementação de bovinos de corte com Saccharomyces cerevisiae não apresentou efeitos sobre o GMD, contudo, melhorou a conversão alimentar devido à redução no CMS. / The purpose of this meta-analysis was to evaluate the effects of yeast supplementation (Saccharomyces cerevisiae) on average daily weight gain (ADG) and dry matter intake (DMI) in beef cattle. Inclusion criteria were complete and randomized trials, supplementation with yeast Saccharomyces cerevisiae compared with no supplementation, which measure ADG or DMI. Data were extracted from relevant paper onto pre-defined protocols. A meta-analysis of random effects was conducted for each indicator separately with the mean of control and treated groups. A total of 12 publications reporting 22 studies and 22 trials in 1161 cattle was analysed. The heterogeneity between studies was high, ranged from 92 to 99%. No effects (MD= -2.849 g, p= 0.492) were observed in ADG with the inclusion of yeast in the diet. However, there was a reduction on DMI (MD= -0.885 kg, p= 0.023) for the group treated. The ADG increased when the forage level in the diet was between 30 and 50% (MD= 641.08 g, p= 0.001), and decreased when the level was between 51 and 75% (MD= -2.90 g, p= 0.000). Over 60% of NDF, the use of yeast in the diet decreased the ADG by 406.94 g (p= 0.034). Animals handled in feedlot showed a reduction in the DMI (MD= -0.97 g, p= 0.019) when received yeast as a supplementation. The non-use of yeast in the diet increased the DMI (MD= -1.70 kg, p= 0.000) in Bos taurus cattle group, while Bos indicus group showed higher DMI (MD= 2.38 kg, p= 0.000) when received yeast as a supplementation. The supplementation with Saccharomyces cerevisiae in the diet for beef cattle had no effect on ADG; however, improve feed conversion due to the reduction in DMI.

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