O Papaya ringspot virus (PRSV) é uma espécie do gênero Potyvirus, sendo que a maioria dos isolados pertence a duas estirpes distintas: "papaya" (P) e "watermelon" (W). O Papaya ringspot virus - estirpe W (PRSV-W) tem sido considerado um dos vírus mais importantes no cultivo de cucurbitáceas pela predominância e pelos prejuízos significativos que causa no Brasil. O controle do mosaico da abobrinha-de-moita, causado pelo PRSV-W, tem sido obtido de forma satisfatória através da premunização com as três estirpes fracas, designadas PRSV-W-1, PRSV-W-2 e PRSV-W-3. O principal objetivo desse estudo foi comparar essas estirpes fracas com estirpes severas PRSV-W-C, PRSV-W-PR e PRSV-W-PE, com base na seqüência de nucleotídeos do gene que codifica a proteína da capa protéica e na mobilidade dessa proteína em SDS-PAGE. A seqüência de nucleotídeos da capa protéica das estirpes fracas PRSV-W-1 e PRSV-W-2 apresentou 100 % de homologia. Quando comparadas com a estirpe fraca PRSV-W-3, a homologia foi de 98 %. As estirpes fracas PRSV-W-1 e PRSV-W-2 apresentaram 95 % de homologia com as estirpes severas PRSV-W-C e PRSV-W-PE. Essas duas estirpes severas, por sua vez, apresentaram respectivamente, 93 e 95 % de homologia com a estirpe fraca PRSV-W-3. O alinhamento das seqüências de nucleotídeos entre as estirpes fracas e as severas evidenciou a inserção de 6 nucleotídeos na região conservada desse gene nas estirpes fracas. Essa inserção refletiu na adição de dois amino ácidos (Asn e Asp) na seqüência de amino ácidos deduzidos dessa proteína. A mobilidade da capa protéica em SDS-PAGE foi semelhante para todas as estirpes estudadas. / Papaya ringspot virus (PRSV), a species of the enus Potyvirus, is classified into two strains: "papaya" (P) and "watermelon" (W). Papaya ringspot virus - type W (PRSV-W) has been considered one of the most important viruses infecting cucurbits in Brazil due to its predominance and significative damage caused on the crops. The control of the disease caused by this virus has been efficiently achieved by means of cross protection with three mild strains, namely PRSV-W-1, PRSV-W-2, and PRSV-W-3. The main purpose of the present study was to compare these mild strains with the severe strains PRSV-W-C, PRSV-W-PR, and PRSV-W-PE, based on the nucleotide sequence of the coat protein gene and on the mobility of the capsid protein in SDS-PAGE. The nucleotide sequence of the coat protein gene of the mild strains PRSV-W-1 and PRSV-W-2 showed 100 % of homology. When compared with the coat protein gene of the mild strain PRSV-W-3, the homology was 98 %. The mild strains PRSV-W-1 and PRSV-W-2 showed 95 % of homology with the severe strains PRSV-W-C and PRSV-W-PE. These two severe strains, otherwise, showed respectively, 93 and 95 % of homology with the mild strain PRSV-W-3. The alignment of the nucleotide sequences of the mild and the severe strains indicated an insertion of 6 nucleotides in the conserved region of the coat protein gene of the mild strains. This insertion reflected on the addition of two amino acids (Asn e Asp) in the amino acid deduced sequence of this protein. The mobility of the coat protein in SDS-PAGE was similar for all the strains studied.

As estrelas Herbig Ae/Be (HAeBe) representam os objetos de massa intermediária (2-10 Msol) na pré-sequência principal. Algumas de suas propriedades físicas são pouco compreendidas até o momento. Somente o estudo conjunto das informações fornecidas em diversos comprimentos de onda pode revelar as características do material circunstelar destes objetos. O objetivo deste trabalho de doutorado é analisar sob vários aspectos a estrutura, a composição e a evolução destes ambientes circunstelares. Para realização deste estudo, adotamos a amostra de candidatas a estrelas HAeBe detectadas pelo Pico dos Dias Survey (Vieira et al. 2003). Evitamos as possíveis contaminações desta amostra por estrelas em estágios mais avançados utilizando diagramas de cores, estimativas de extinção e características espectrais. A química da poeira circunstelar foi analisada a partir das propriedades dos espectros ISO disponíveis para nossos objetos. O perfil espectral do silicato em torno de 10 microns revelou características evolutivas do material circunstelar. O status evolutivo dos objetos mais embebidos foi determinado por meio de estimativas da massa de seus envoltórios circunstelares. Este estudo indicou que a maior parte desta sub-amostra se encontra no estágio intermediário entre a Classe 0 (Menv>>M*) e a Classe I (Menv<M*) de estrelas jovens. Detalhes da morfologia do disco de PDS340 foram analisados por imagens no infravermelho-médio, obtidas em bancos de dados. Estas observações impuseram vínculos à extensão e orientação espacial do disco nesta faixa espectral. As observações disponíveis em vários comprimentos de onda revelaram características da estrutura e evolução do material circunstelar associado a estrelas HAeBe. A perspectiva do desenvolvimento de um modelo completo que abranja todas estas informações é descrita na conclusão do trabalho. / Herbig Ae/Be (HAeBe) objects are intermediate mass (2 -10 Msun) stars in the pre-main sequence. Some of their properties remain not well understood to date. Only a full multi-wavelength study is able to reveal a reasonable scenario for their circumstellar material. The purpose of the present work is to study the structure, composition and evolution of these circumstellar environments. To address this issues, the sample of HAeBe candidates detected by the Pico dos Dias Survey (Vieira et al., 2003) was adopted. To avoid the contamination by more evolved stars, we developed an analysis based on two-color diagrams, extinction values and spectral features. The chemistry of the circumstellar dust was studied based on Infrared Space Observatory spectra available to our sample. The silicate feature around 10 micron revealed evolutionary information of the circumstellar material. The evolutionary stage of the more embedded sources was determined by estimates of their envelope masses. This study indicates almost all of this sub-sample to be in the intermediate phase between Class 0 (Menv>>Msun) and Class I (Menv<Msun). Mid-infrared images, retrieved from archive data, introduced morphological constraints to the orientation and extension of the disk associated to PDS340. The available observations for several wavelengths revealed some characteristics of the structure and evolution of the circumstellar material associated to HAeBe stars. The perspective of the development of a complete model, which encompasses all the available data, is described in the conclusion of this work.

O guaraná, Paullinia cupana var. sorbilis, espécie nativa do Brasil é uma cultura de relevância para o país, principalmente nos estados da Bahia e Amazonas. O fruto contém substâncias estimulantes, como a cafeína, que conferem ao guaraná um grande potencial exploratório, visto que esta é uma das substâncias estimulantes mais consumidas no mundo. Apesar de sua importância, a cultura do guaraná é pouco estudada, portanto pouco se sabe sobre sua genética e as interações microbianas existentes, tanto em relação aos microrganismos endofíticos e epifíticos, quanto em relação aos patógenos. De tal forma que a cultura do guaraná na região Amazônica vem sendo afetada por condições fitossanitárias desfavoráveis, como a presença do fungo do gênero Colletotrichum, causador da antracnose, doença considerada uma ameaça à produção comercial do guaraná. Assim, visando compreender a dinâmica envolvida na interação planta - microrganismos e o possível controle da antracnose, o presente trabalho acessou a comunidade bacteriana associada às folhas com e sem sintomas de antracnose, de forma independente e dependente de cultivo; bem como, investigou o potencial biotecnológico e de biocontrole dos isolados bacterianos. A comunidade bacteriana acessada de forma dependente e independente de cultivo apresentaram similaridades, como maior valor de riqueza e menor diversidade bacteriana em folhas assintomáticas, quando comparadas com folhas sintomáticas, e com relação ao filo Proteobacteria, mais abundantemente acessado nas duas comunidades. Comparações realizadas com isolados bacterianos acessados epi e endofiticamente de folhas com e sem sintoma da antracnose apontaram que o aparecimento da doença antracnose na folha pareceu ser o fator que mais influenciou na estrutura da comunidade bacteriana. Com relação às diferenças entre tecidos sintomáticos e assintomáticos, foi possível identificar alguns gêneros abundantes mais frequentemente acessados em plantas sintomáticas, sendo que os gêneros Pseudomonas, Stenotrophomonas e Pantoea foram acessados em grande frequência tanto de forma dependente como independente de cultivo. Porém, de forma independente de cultivo foram acessados outros táxons abundantes que diferiram significativamente entre as plantas, sendo que folhas sintomáticas apresentaram Acinetobacter, Acidobacter_GP1 e Sphingobacteria, e em folhas assintomáticas foram acessados os táxons Methylobacterium, Beijerinckia, Bacilli e um grupo de Rhizobiales não classificados. Além disto, os microrganismos endofíticos e epifíticos cultivados foram testados com o fitopatógeno Colletotrichum sp. em ensaios de antagonismos, sendo que isolados do gênero Bacillus, Stenotrophomonas, Pantoea, Erwinia, Entereobacter, Pseudomonas, entre outros, apresentaram inibição do crescimento do fungo fitopatogênico. As bactérias cultivadas ainda foram testadas quanto ao potencial biotecnológico de produção de enzimas hidrolíticas e sideróforo. Muitos isolados apresentaram produção de protease e sideróforo. Foi possível também correlacionar a produção das enzimas amilase, lipase e poligalacturanase com os isolados provenientes de tecidos sintomáticos. / Guarana, Paullinia cupana var. sorbilis, is a native culture of Brazil that has relevance to the country, mainly in the states of Bahia and Amazonas. The fruit contains stimulants substances, such as caffeine, that gives a high exploration potential to the culture, since this is one of the most consumed stimulant substance in the world. Despite its importance, the culture of guarana hasnt gotten much of attention, and little is known about its genetics and microbial interactions with both epiphytic and endophytic microorganisms, and in relation to pathogens. So, the guarana culture in the Amazon region has been affected by bad phytosanitary conditions, such as the presence of the fungi Colletotrichum, which causes anthracnose disease thats considered a threat to guarana commercial production. Thus, to understand the dynamics involved in the interaction plant-microorganism and the possible control of anthracnose, this study accessed the bacterial community associated to leaves with and without anthracnose symptoms, combining culture-dependent and -independent methodologies and also investigated the biotechnology potential and biocontrol of culture-dependent bacteria. The bacterial community accessed by culture-dependent and -independent manner presented similarities, both presented higher bacterial richness but lower bacterial diversity in asymptomatic leaves when compared with symptomatic leaves, and both communities presented the Proteobacteria phylum as the most abundant one. Comparisons between the endophytic and epiphytic bacterial isolates associated with leaves with and without anthracnose symptoms showed that the onset of anthracnose disease on leaf seemed to be the most important factor that modified the bacterial community structure. Regarding the differences between symptomatic and asymptomatic tissue it was possible to identify some genera most frequently accessed in symptomatic plants such as Pseudomonas, Stenotrophomonas and Pantoea accessed in both culture-dependent and independent methodologies. However, the cultureindependent approach of bacterial accessed others abundants taxa that differed significantly between plants. Symptomatic leaves showed Acinetobacter, Acidobacter_GP1 and Sphingobacteria and asymptomatic leaves presented taxa Methylobacterium, Beijerinckia, group Bacilli and a group of unclassified Rhizobiales. In addition, endophytic and epiphytic isolates microorganisms were tested with the pathogen Colletotrichum sp. in antagonism assays, and isolates from the genus Bacillus, Stenotrophomonas, Pantoea, Erwinia, Entereobacter, Pseudomonas, and others, showed inhibition of growth of the fungus. The bacterial isolates were also tested for production of hydrolytic enzymes and siderophore. Many isolates showed protease and siderophore production. It was possible to correlate the production of amylase, lipase and poligalacturanase with isolates from symptomatic tissue.

Made available in DSpace on 2016-04-29T13:17:55Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Thais Albernaz M C Guimaraes.pdf: 6220100 bytes, checksum: c404e9dfaf460e8d6dbaf51d0ba83a2e (MD5) Previous issue date: 2015-06-19 / The objectives of this research were to identify and describe component behaviors and prerequisites involved in the mathematical behavior of counting, propose a hierarchical sequence for the acquisition of counting behavior and evaluate the suitability of the proposed hierarchical sequence. Hence, two studies were proposed. Study (1) is a research throughout the existing literature to identify and describe components behavior and prerequisites of counting. Three components of counting were identified regularly, namely: one-one correspondence, intraverbal of the number sequence and cardinality. As a result of Study (1) a hierarchical sequence, following the proposition Resnick, Wang, and Kaplan (1973), was developed. For each of the three components, prerequisites behaviors were established. In Study (2), we sought to evaluate the adequacy of the hierarchical sequence proposed in Study (1). Participants were 13 children with an average age of 4 ½ years of age. The process included teaching and testing steps related to the hierarchical sequence of counting behavior, as well as pre and post test involving supposedly more complex behavior such as sets comparison and arithmetic. The adequacy test of the hierarchical sequence was conducted in four distinct stages: 1) initial test; 2) test after teaching component A; 3) test after teaching component B; and 4) test after teaching component C. The method used was escale analysis in which performance of each participant was recorded in terms of approval (+) or failure (-) in the test for each component and prerequisite. The sequence was considered improper for instances where a supposedly more complex behavior was carried out according to the criteria but not its prerequisites. The results showed that the sequence was adequate for most participants in the proposed components and prerequisites. More specifically, this research showed that in the initial application of the hierarchical sequence, component A (one-one correspondence) was the one that most participants results differed. Prerequisites that seemed inadequate in regard to its ordination were A.1.1 (remove objects one by one in random order while assigning a number name to each of the items), C.3.1 (answer the question how many objects there are in a group after adding items in front of the childs) and C.2.1 (producing sets with fingers). For other prerequisites, the results were as expected. The data showed that after teaching, performance of most participants improved in the hierarchical sequence tests. Finally, the results of arithmetic test showed that 8 of 11 participants increased the number of correct answers on questions about sets comparison and all the 11 participants showed increased number of correct answers relating to problem situations, indicating a possible effect of teaching prerequisite counting behaviors upon more complex mathematical behavior. Research limitations on this topic and its importance to practice are discussed / Os objetivos da presente pesquisa foram identificar e descrever comportamentos componentes e pré-requisitos envolvidos no comportamento matemático de contagem, propor uma sequência hierárquica para a aquisição do comportamento de contagem e avaliar a adequação da sequência hierárquica proposta. Para tanto, dois estudos foram desenvolvidos. O Estudo 1 apresenta uma busca na literatura pela identificação e descrição de comportamentos componentes e prérequisitos da contagem. Foram identificados, com regularidade na citação de autores, três componentes da contagem, a saber: correspondência termo a termo, intraverbal de sequência numérica e cardinalidade. Como resultado do Estudo 1, uma sequência hierárquica, seguindo a proposição de Resnick, Wang e Kaplan (1973), foi elaborada. Para cada um dos três componentes, estabeleceram-se comportamentos pré-requisitos. No Estudo 2, buscou-se avaliar a adequação da sequência hierárquica proposta no Estudo 1. Para tanto, participaram desse estudo 13 crianças com média de 4 anos e meio de idade. O procedimento contou com etapas de teste e de ensino referentes à sequência hierárquica do comportamento de contagem, assim como um pré e um pósteste envolvendo comportamentos supostamente mais complexos, como comparação de conjuntos e questões de aritmética. O teste de adequação da sequência hierárquica foi realizado em quatro momentos distintos: 1) teste inicial; 2) teste pós-ensino do componente A; 3) teste pósensino do componente B; e 4) teste pós-ensino do componente C. O método de análise empregado foi escalar, de modo que o desempenho de cada participante foi registrado em termos de aprovação (+) ou de reprovação (-) no teste de cada componente e pré-requisito. Nesse método, a sequência hierárquica é considerada inadequada para ocorrências em que um comportamento supostamente mais complexo é realizado conforme o critério, mas não os seus pré-requisitos. De maneira geral, os resultados mostraram que a sequência foi adequada para a maioria dos participantes nos componentes e pré-requisitos propostos. Os resultados desta pesquisa também mostraram que, na aplicação inicial da sequência hierárquica, o componente A (correspondência termo a termo) foi aquele para o qual mais participantes apresentaram resultados discrepantes com a hipótese de ordenação dos pré-requisitos. Além disso, os prérequisitos que pareceram mais inadequados no que diz respeito à sua ordenação foram o A.1.1 (retirar, um a um, objetos em disposição aleatória atribuindo nome de um número a cada um dos itens), o C.3.1 (responder quantos objetos há em um grupo após a adição de itens [um a três] à sua vista [contagem sem atraso]) e o C.2.1 (produzir conjunto com dedos). Para os demais prérequisitos, os resultados mostraram estar de acordo com a sequência hierárquica proposta. Os dados do ensino mostraram que o desempenho da maioria dos participantes melhorou nos testes de adequação da sequência hierárquica. Por fim, os resultados do pós-teste mostraram que 8 de 11 participantes aumentaram o número de acertos nas questões acerca de comparação de conjuntos e que todos os 11 participantes aumentaram o número de acertos nas questões de aritmética, indicando um possível efeito do ensino dos pré-requisitos de contagem em comportamentos matemáticos mais complexos. Ao fim, discutiram-se as limitações de pesquisa com essa temática e a sua importância para a prática

As técnicas de super-resolução possibilitam combinar várias imagens de uma mesma cena para se obter uma imagem com resolução radiométrica e geométrica aumentada, denominada de imagem de super-resolução. Nessa imagem são realçadas características importantes possibilitando recuperar detalhes e informações. As aplicações envolvem diferentes áreas, tais como: na agricultura para identificar possíveis desmatamentos e controle de pragas, na área médica para a detecção de doenças em estágios iniciais, identificação facial de pessoas suspeitas em imagens de circuito fechado, reconstrução de filmes, identificação de placas de veículos, entre outras. No presente trabalho, é proposta uma metodologia para a geração de imagens de super-resolução a partir de uma região selecionada de um mosaico. Embora existam vários trabalhos publicados relacionados à geração de imagens de super-resolução, as metodologias não se aplicam para uma região específica do mosaico. E grande parte dos trabalhos utiliza uma imagem de referência, a partir da qual é gerada a imagem de super-resolução. Na metodologia proposta, inicialmente, é gerado um mosaico a partir de um conjunto de imagens baseando-se nos algoritmos SIFT ou SURF, BBF e RANSAC e é criada uma estrutura de dados, que organiza os pontos correlacionáveis das imagens com sobreposição, facilitando e simplificando o processo de fusão desses pontos para a obtenção da imagem de super-resolução. A ferramenta implementada a partir dessa metodologia, possibilita ao operador selecionar a região de interesse no mosaico, a partir da qual, é gerada a imagem de super-resolução utilizando as técnicas SIFT (ou SURF), interpolação Bicúbica e a fusão pelo valor mediano dos pontos da área com sobreposição das imagens da sequência. Para validar a metodologia, foram utilizados quatro conjuntos de imagens, que incluem imagens simuladas, obtidas com câmeras de baixa e alta resolução, imagens aéreas de áreas urbanas e rurais, coloridas e em escalas de cinza, e imagens contendo elementos textuais. Nas imagens simuladas foram adicionados ruídos e avaliada a imagem de super-resolução gerada por meio de duas métricas: raiz do erro médio quadrático (RMSE) e o índice de similaridade estrutural (SSIM). Os resultados mostraram que mesmo com valor de RMSE elevado, o SSIM foi acima de 70%, evidenciando o alto grau de similaridade. As imagens de super-resolução obtidas a partir de uma região dos mosaicos gerados foram comparadas com imagens superamostradas por meio de interpolações e avaliadas confrontando as imagens extrapoladas para verificação visual dos elementos da cena. Os resultados apresentados concluem que as imagens de super-resolução geradas, apresentam melhorias no que diz respeito à restauração das mesmas para futura análise de alvos de interesse, sem ter o retrabalho de adquirir novas imagens da cena, pois dependendo da cena analisada não será possível nova aquisição. O presente trabalho contribui com a geração de imagem de super-resolução, a partir de uma região do mosaico e com estruturas de dados e algoritmos que possibilitam a análise de regiões específicas do mosaico, sem que o mesmo tenha que ser processado integralmente. / Super-resolution techniques allow combining several images of the same scene in order to obtain an image with increased geometric and radiometric resolution, called super-resolution image. In this image are enhanced features allowing to recover important details and information. The applications involve different areas, such as: in the agriculture to identify possible deforestation and pest control, in the medical area to detect diseases in early stages, facial identification in images of suspects in closed loop, movies reconstruction, license plates recognition, among others. In this work, we propose a methodology for generating super-resolution images from a selected region of a mosaic. Although there are several published papers related to the generation of super-resolution images, the existing methodologies do not apply to a specific region of the mosaic. And the majority of studies use a reference image, from which is generated the super-resolution image. In the proposed methodology, initially, a mosaic is generated from a set of images based on the algorithms SIFT or SURF, BBF and RANSAC and creates a data structure that organizes the points correlate of the images with overlapping, facilitating and simplifying the fusion process of these points to obtain the super-resolution image. The tool implemented from this methodology allows to the operator to select the region of interest in the mosaic, from which is generated the image using super-resolution techniques SIFT (or SURF), Bicubic interpolation and fusion process by the median value of the points with overlapping area from the images of the sequence. In order to validate the methodology, we used four sets of images, including simulated images taken with cameras of low and high resolution, aerial images of urban and rural areas, color and grayscale images and images containing texts. In the simulated images were added noise and were evaluated the super-resolution image generated by two metrics: root mean square error (RMSE) and the structural similarity index (SSIM). The results showed that even with high RMSE value, the SSIM was above 70%, reflecting the high degree of similarity. The super-resolution images obtained from a region of the mosaics were compared with images generated by super-sampled interpolation and evaluated by comparing the images extrapolated to visual inspection of elements of the scene. From the results it can be concluded that the super-resolution images generated present improvements with regard to restoration of images for further analysis of targets of interest, without reworking to acquire new images of the scene, because depending on the analyzed scene it would not be possible a new acquisition. This work contributes to the generation of super-resolution image from a region of the mosaic and with data structures and algorithms which enable the analysis of specific regions of the mosaic without it has to be fully processed.

Falhas reprodutivas são importante causa de prejuízos econômicos na suinocultura. Elas implicam na diminuição do número de leitões nascidos vivos e aumentam o descarte de animais e as taxas de reposição de matrizes, levando à redução da produtividade do rebanho. Embora a maioria dos casos de natimortalidade sejam associados a fatores não infecciosos, os agentes infecciosos possuem um papel importante e ainda pouco conhecido na etiologia deste quadro. Até o presente, nenhum trabalho foi realizado visando o estudo do conjunto de vírus que possam estar presentes em matrizes com eventos de natimortalidade por ocasião do parto. Em função disso, o presente trabalho teve por objetivo examinar o viroma do soro de matrizes suínas com e sem casos de natimortalidade. Foram coletadas 94 amostras de soro de matrizes de seis granjas distribuídas em cinco municípios do Rio Grande do Sul. Em cada granja foram formados dois pools de soros: um composto por matrizes que pariram (um ou mais) natimortos e outro por matrizes que pariram leitegadas sem natimortos. Os pools foram submetidos à extração de ácido nucleico viral, enriquecimento e sequenciamento de alto desempenho, buscando a identificação de agentes que possam representar um fator de risco à natimortalidade em suínos Não foi possível identificar diferenças significativas nos viromas de matrizes correlacionadas à ocorrência de natimortalidade. Não obstante, foi possível identificar uma ampla variedade de genomas virais, a maioria deles correspondendo a vírus das famílias Anelloviridae. Este estudo permitiu ainda identificar 20 genomas completos de três espécies de vírus: torque teno vírus suíno 1a e 1b, circovírus suíno tipo 3 (PCV3) e vírus circulares DNA fita simples codificantes de replicase (CRESS), seis dos quais até o presente ainda não reportados em suínos. Em duas granjas, em matrizes que apresentaram natimortalidade, foram identificados genomas de PCV3, cuja participação como potencial causador de problemas reprodutivos precisa ser futuramente investigada. Não foram identificados vírus com genoma de RNA. Este estudo traz uma contribuição ao conhecimento do viroma em soros de matrizes suínas e, paralelamente, busca contribuir para o esclarecimento das possíveis causas de natimortalidade de origem infecciosa em suínos. / Reproductive failure in swine herds is an important cause of economic losses. It leads to a decrease in the number of piglets reared per sow and may imply in the need for replacement of sows, reducing the productivity in a herd. Although the majority of cases of stillbirths have been attributed to non-infectious causes, several infectious agents have been implicated in the etiology of such condition. Nevertheless, other as yet unknown agents may be involved in the pathogenesis of stillbirths. The aim of this work was to investigate the virome in sera of sows without and with one or more cases of stillbirth in the litter. Sera were collected from 94 sows of six commercial farms in five municipalities in the state of Rio Grande do Sul, Brazil. Two pools of sera were collected from each farm: one representative of sows that had at least on stillbirth in the last litter and another composed by sera of sows that had litters with no stillbirths. The pools were subjected to nucleic acid extraction, enrichment and high throughput sequencing. No significant differences were detected in the serum viromes of sows with or without stillbirth Nevertheless, it was possible to identify a wide variety of viral genomes, most of these representing viruses of Anelloviridae family. In addition, the present work allowed the identification of 20 complete genome sequences including torque teno sus virus 1a and 1b, porcine circovirus 3 (PCV3) and circular rep-encoding ssDNA viruses (CRESS), including six species not previously reported in swine. In two farms, PCV3 genomes were identified in the serum pools of sows which had cases of stillbirth. The role for this virus as a potential cause of reproductive failure needs additional investigations. No genomes of viruses with RNA genomes were identified. This study provides a contribution to the knowledge on the serum virome of pregnant sows. In addition, it is expected to aid in the identification of possible causes of stillbirth in swine.

O presente trabalho apresenta um estudo empírico a partir de uma abordagem qualitativa de investigação que almejou caracterizar a produção de argumentos escritos de estudantes do ensino médio ao longo do processo de recontextualização do conceito de biodiversidade. A partir da teoria de Bernstein sobre o modelo do discurso pedagógico, a análise deste trabalho incide inicialmente no sentido de caracterizar o conceito de biodiversidade contido no \"que\" da mensagem sociológica dos documentos oficiais - Parâmetros Curriculares Nacionais (PCN) e na Proposta Curricular do Estado de São Paulo. A partir disso, caracterizou-se o \"que\" contido no discurso sobre biodiversidade de uma sequência didática investigativa (SDI) cujo objetivo era o ensino da biodiversidade. Essa sequência didática faz parte do campo de recontextualização pedagógico, em que os autores fazem adaptações em relação à mensagem sociológica veiculada nos documentos oficiais. Segue-se o estudo com a aplicação da SDI em uma escola da rede pública estadual, no ano de 2014, em Ribeirão Preto, São Paulo. Durante a aplicação o foco de análise foi os argumentos escritos produzidos pelos estudantes ao longo de um novo processo de recontextualização. A presença de regras de reconhecimento e realização caracteriza a produção de argumentos nesse processo. Os resultados obtidos evidenciaram que existe uma diminuição progressiva da qualidade conceitual da biodiversidade entre o PCN e a Proposta Curricular, e que continua diminuindo quando se verifica pesquisas a respeito deste conceito em livros didáticos. Na SDI, entretanto, a qualidade conceitual da biodiversidade é bastante complexa e os estudantes são mobilizados a utilizar o pensamento científico para compreender o conceito de biodiversidade e argumentar em diferentes situações. Nesse sentido, observou-se uma compreensão mais profunda a respeito da biodiversidade por parte dos estudantes, evidenciada pelo aumento do número de estudantes com regras de reconhecimento e realização ao longo de cada atividade proposta na SDI. / This research presents an empirical study based on a qualitative approach that aimed to characterize the production of written arguments of high school students throughout the process of recontextualisation of biodiversity concept. The theory of Bernstein about the model of pedagogical discourse helped to analyze the context of recontextualisation, and the \"what\" of the sociological message of the official documents - National Curricular Parameters (NCP) and Curricular Proposal of the State of São Paulo. Then, there was the analyses of the \"what\" contained in the discourse of biodiversity of an investigative didactic sequence (IDS). This IDS is part of the pedagogical field of recontextualisation, which authors made some changes in relation to the sociological message of the official documents. The study is followed by application of the IDS in a public school from Ribeirão Preto, São Paulo, in 2014. During the application the focus of analyses was the written arguments produced by the students. The presence of recognition and realization rules characterizes the production of arguments in this process of recontextualisation. The results obtained showed that there is a progressive decrease in the conceptual quality of biodiversity between the NCP and the Curricular Proposal and other researchers showed that it continues to decrease in the textbooks. However the ISD showed a high complexity quality of the biodiversity concept and the students were mobilized to use scientific thinking to understand the concept of biodiversity and argue in different situations. Thus, we observed a deeper understanding of biodiversity concepts by the students that was evidenced by the increase in the number of students with recognition and realization rules for each activity proposed in IDS.

Numa perspectiva teórica que parte dos pressupostos de Bakhtin (2000), Vygotsky (1996), estendendo-se a Bronckart (1999), Dolz e Schneuwly (2004), relata-se uma experiência didática aplicada a alunos da 8ª série do ensino fundamental com o gênero crônica, considerado um instrumento que pode ser empregado para o aprimoramento das habilidades de escrita e também da criticidade dos alunos, ou seja, para o desenvolvimento da capacidade linguístico-discursiva dos alunos. Para Schneuwly (2002), essa aprendizagem depende da apropriação dos utensílios da escrita e dos elementos constituintes dos gêneros e suas relações. No tocante à crônica, identificam-se, na materialidade linguística dos textos produzidos, as marcas que revelam alguns dos aspectos relacionados ao contexto de produção: aspectos enunciativos e organizacionais, vistos a partir dos pressupostos do interacionismo sócio-discursivo que propiciaram a observação de aspectos da produção de textos que dizem respeito à dimensão semântica e linguístico-discursiva dos textos. Verificou-se que o gênero crônica é um instrumento que possibilitou ao aluno expressar sua opinião, analisar criticamente os fatos que o rodeiam e aprimorar sua habilidade de escrita. Nas produções dos alunos ficaram evidentes: seu posicionamento, suas intenções - as ações que podem ser realizadas por meio do uso da linguagem e os diferentes efeitos de sentido produzidos. O trabalho foi desenvolvido por meio de uma sequência didática que procurou salientar as características, os parâmetros do gênero e, assim proporcionar aos alunos situações para que eles refletissem sobre a crônica e sobre os diferentes modos de organização do gênero. A análise das crônicas produzidas pelos alunos revelou a assimilação dessas características e de marcas de autoria e estilo, traços que revelam o trabalho de escrita empreendido pelo aluno e o efeito da sequência didática. Para Bronckart, os gêneros textuais veiculam representações ou conhecimentos que estão disponíveis no intertexto e foram elaborados por gerações anteriores ou contemporâneas que as semiotizaram. / In a theoretical perspective which started from the presuppositions of Bakhtin (2000), Vygotsky (1996), extend as far as Bronckart (1999), Dolz and Schneuwly (2004) reports an educational experience applied to pupils of the 8th grades on fundamental teaching with the chronicle genre, considered a way that can be used to improve writing skills and also pupils criticism, in other words, to the development of discursive language ability of these pupils. For Schneuwly (2002), this apprenticeship depends on the appropriation of the writing tools and on the elements of this genre and their relations. Regarding the chronicle, aspects are identified, in the linguistic materiality of the produced texts, the tools show some of the aspects relating to the context of the production: enunciatively and organizational aspects, which concern the semantic and language discursive dimension. It was checked that chronicle genre is one of the tools that let the pupils express their own opinions, analyze the facts around them and improve their writing skills. In the pupils\' productions they were obvious: their positioning, their intentions - the actions can be carried out by the language use and the different effects of the produced sense. This paper was developed by an educational sequence that aims to point out the characteristics of the genre and makes pupils think about the different ways of genre organizing. The analysis of chronicles produced by the pupils revealed the assimilation of these characteristics and the authorship and style registration. For Bronckart, the textual genre shows us knowledge available in the intertext and they were prepared by previous or contemporary generations, on a semiotics way.

Este trabalho tem o objetivo de estudar a construção do texto descritivo literário, considerando, em especial, o papel do adjetivo e o seu funcionamento dentro desse modo de organização textual. Neste sentido, a presente pesquisa se inscreve no conjunto de reflexões em torno do aspecto linguístico e do literário. Tendo como base o texto descritivo, não se trata de estudar o discurso literário aplicando noções linguísticas, mas de refletir sobre o processo da escritura literária como linguagem que explora os recursos da língua. A perspectiva que permeia este estudo tem por ambição repensar a prática pedagógica em aulas de língua estrangeira, em específico o francês. Partindo de uma contextualização não exaustiva do texto descritivo literário, desde a tradição a movimentos literários, a pesquisa visa ao exame dos limites do texto descritivo, considerando, sobretudo, sua relação com o modo narrativo. O trabalho interroga sobre a possibilidade de se estabelecer fronteiras entre os dois modos e sobre a existência de parâmetros linguísticos, discursivos e estéticos que permitem determinálos: Afora os procedimentos que configuram o ato de descrever, como devem ser tratadas as questões tidas como decisivas nesse processo, como a subjetividade, os efeitos de realidade e de ficção? A hipótese que norteia a pesquisa é a de que, inicialmente, existe um conjunto de marcas linguísticas, a exemplo do adjetivo, que, combinadas, constituem o modo descritivo e permitem sua caracterização. Assim, no primeiro capítulo, além de leituras críticas de textos que versam sobre a temática em questão, desenvolvem-se ainda alguns conceitos que estão ligados intrinsecamente à construção do texto descritivo, entre eles a isotopia e a focalização. A fim de observar a elaboração de uma sequência descritiva e o funcionamento do adjetivo como parte desse processo, o segundo capítulo propõe a análise de um corpus, constituído pelos contos Le curé de Cucugnan, de Alphonse Daudet, e La montagne du dieu vivant, de Jean-Marie Gustave Le Clézio, e pela novela La maison du chat-qui-pelote, de Honoré de Balzac. Na análise da sequência, observa-se o processo que envolve a construção e a encenação descritiva no corpus. Quanto à análise do adjetivo, examina-se o processo de adjetivação como forma de exposição da subjetividade. O terceiro capítulo se apoia em uma perspectiva pedagógica que discute a importância da didática no ensino-aprendizagem de língua e de literatura estrangeira e apresenta exercícios que visam à leitura e à produção de textos de natureza descritiva. Os resultados apontados no trabalho possibilitam por meio da análise do corpus uma reflexão mais particularizada de aspectos relacionados à descrição literária e ao papel do adjetivo nesse contexto. Especialmente em relação à construção de uma sequência descritiva, observam-se questões que, aparentemente, são consideradas menos importantes, mas que, ao contrário, exigem certo domínio de propriedades linguísticodiscursivas que contribuem para a elaboração desse tipo de sequência, como, por exemplo a fronteira entre o descritivo e o narrativo. Além disso, o trabalho permite ainda a elaboração de uma proposta de exercícios, a título de exemplo prático. / The aim of this work is to study the construction of the descriptive literary text, particularly considering the role of the adjective and its operation within this textual organization mode. In this sense, the present research is inserted in reflections around the linguistic and literary aspects. Based on the descriptive text, it is not the aim here to study the literary discourse applying linguistic notions, it is the intend to reflect upon the literary writing as language which explores the resources of the language. The perspective that permeates this study aims at rethink the pedagogical practice in foreign language lessons, more specifically in French language. Departing from a non exhaustive contextualization of the descriptive literary text, from tradition to literary movements, the research aims at examining the limits of the descriptive text, considering its relation with the narrative mode. The work questions about the possibility of establishing boundaries between the two modes, and about the existence of linguistic, discursive and esthetic parameters which permit to determine them. Aside from the proceedings that configure the act of writing, how should be treated the decisive questions in this process, like the subjectivity, the reality and the fiction effects? The hypothesis here is that, initially, there exist a group of linguistic marks (see the adjective as example), that, in combination, constitute the descriptive mode and permit its characterization. Thus, in the first chapter, besides the readings upon the theme, it also elaborates on some concepts which are intrinsically linked to the construction of the descriptive text, among them are the isotopy and the focalization. Aiming at observing a descriptive sequence, and the operation of the adjective as part of this process, the second chapter proposes the analyses of a corpus, constituted by the tales of Le curé de Cucugnan, by Alphonse Daudet, and La montagne du dieu vivant, by Jean-Marie Gustave Le Clézio, and by the romance La maison du chat qui pelote, by Honoré de Balzac. In the analyses of the sequence, it is observed the process that involves the construction and the descriptive staging in the corpus. Concerning to the analysis of the adjective, it is examined the adjectival process as a form of the exposition of the subjectivity. The third chapter is based on pedagogical perspective which discusses the importance of the didactic in the teaching-learning of foreign language and literature, and presents exercises that aims at the reading and production of descriptive texts. The results from the research make feasible a more peculiar reflection of the aspects related to the literary description, as well as the role of the adjectives in this context. Concerning to the construction of a descriptive sequence, it is possible to observe issues that, at first sight, are considered of less importance, but that actually demand a domain of linguistic-discursive properties that contribute to the elaboration of this kind of sequence, the boundary between the descriptive and the narrative for instance. Besides that, the work still allows the elaboration of exercises in a more practical way.

A presente pesquisa analisa a abordagem do ensino de Geografia em um dos conceitos basilares dessa ciência, o lugar. Assim sendo, buscamos entender como esse conceito poderia ser aprendido pelos alunos do 6º ano do Colégio Alcântara de Carvalho, no município de Jataí /GO, relacionando os conceitos científicos geográficos e os conhecimentos cotidianos desses alunos. Nosso objetivo foi entender de que forma os poemas de Cora Coralina, poetisa goiana, especificamente os que caracterizam o entendimento do lugar, poderiam contribuir metodologicamente com os conteúdos da Geografia no Estado de Goiás na Educação Básica. Embasados nisso, a análise está dividida em quatro capítulos, sendo o primeiro capítulo uma discussão sobre o referencial teórico acerca do ensino de Geografia e lugar no contexto da educação geográfica; o segundo, um entendimento da possibilidade relacional entre Geografia e literatura, analisando o uso de poesias na escola, e especificamente os poemas de Cora Coralina e o lugar; o terceiro capítulo foi destinado ao momento de verificar a contextualização do conceito de lugar presente nos materiais didáticos do Estado de Goiás ( Referencial Curricular de Goiás Geografia e livro didático utilizado); o quarto capítulo versa sobre a nossa proposta de entender melhor o lugar, recorrendo à metodologia de sequência didática, que concebe o ensino como sendo um processo de construção, não um produto acabado. Priorizamos nessa sequência o uso de duas poesias de Cora, Minha cidade e Jabuticabal II. Enfatizamos a nossa metodologia no desenvolvimento da sequência didática, com a problematização da temática lugar e seus atributos. Para isso, desenvolvemos atividades prévias sobre o conhecimento dos alunos sobre lugar, atividades escritas, musicais e desenhos sobre o Cerrado que eles conhecem, atividades sobre as duas poesias de Cora Coralina que foram selecionadas e finalizamos a sequência com a enquete sobre o que foi aprendido. Essa tese nos evidenciou que a sequência didática difere e extrapola a ação do plano de aula em si. A sequência didática pressupõe dinâmica, interação, problematização entre os sujeitos da sala de aula, proporcionando uma ação reflexiva sobre os conceitos preconcebidos e agora problematizados e ressignificados após desenvolvimento da sequência didática aplicada. A junção entre sequência didática e as poesias de Cora Coralina foram estratégicas didáticas que viabilizaram o conhecimento na escola, levaram esses alunos a repensar os seus lugares enquanto cotidiano vivido e aprendido, enquanto experiência individual e coletiva. / The present research analyzes the approach of the Geography teaching in one of the basic concepts of that science, the \'place\'. Thus, we sought to understand how that concept could be learned by the 6th grade students of the Alcântara de Carvalho School, Jataí / GO, relating the geographical scientific concepts and the daily knowledge of these students. Our objective was to understand how the poems of Cora Coralina, a poet from Goiás, could contribute methodologically to the contents of Geography in the State of Goiás in Basic Education, specifically those that characterize the understanding of the \"place\". Based on this, the analysis is divided in four chapters, the first chapter is a discussion about the theoretical reference on the Geography teaching and place in the context of geographic education; The second one is, an understanding of the relational possibility between Geography and literature, analyzing the use of poetry in school, and specifically the poems of Cora Coralina and the place; The third chapter was aimed at verifying the contextualization of the concept of place present in the Goiás teaching material (Goiás Referential Curriculum - Geography and adopted textbook); The fourth chapter is about our proposal for better understanding the \"place\", using the teaching sequence methodology that conceives teaching as a construction process, not a finished product. We prioritized in this sequence the use of two poems of Cora, \"Minha Cidade\" and \"Jabuticabal II\". We emphasize our methodology on the development of the teaching sequence, with the problematization of \"place\" theme and its attributes. For this we developed: previous activities about the students\' knowledge of \"place\"; written activities, musicals and drawings about the Brazilian savannah that they know; activities on the two selected Cora Coralinas poems and we finished the sequence with the poll about what has been learned. This thesis has shown us that the teaching sequence differs and extrapolates the action from the lesson plan itself. The teaching sequence presupposes dynamics, interaction, and problematization among the subjects in the classroom, providing a reflexive action on the pre-conceived concepts and now problematized and re-signified after development of the applied teaching sequence. The junction between teaching sequence and Cora Coralina\'s poems were teaching strategies that enabled the knowledge at school, they led these students to rethink their places as a lived and learned daily life as individual and collective experience.