Submitted by Felipe Rodrigues Bruzadin (felipebruzadin@hotmail.com) on 2018-11-14T15:47:02Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Felipe Rodrigues Bruzadin.pdf: 1216866 bytes, checksum: 8f5b1b8d6f77b31f16363a41024cdedc (MD5) / Rejected by ALESSANDRA KUBA OSHIRO ASSUNÇÃO (alessandra@fct.unesp.br), reason: Solicitamos que realize correções na submissão seguindo as orientações abaixo: - A ficha catalográfica está fora do padrão. Ela deve ser gerada através do link https://www.biblioteca.unesp.br/ficha/ Será gerado um pdf que deverá ser acrescentado ao trabalho - A ficha deve vir antes da folha de aprovação - Nos agradecimentos, de acordo com a portaria nº 206, de 04/09/2018, deverá constar a seguinte frase: O presente trabalho foi realizado com apoio da Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior - Brasil (CAPES) - Código de Financiamento 001 Agradecemos a compreensão. on 2018-11-14T18:09:34Z (GMT) / Submitted by Felipe Rodrigues Bruzadin (felipebruzadin@hotmail.com) on 2018-11-14T18:58:24Z No. of bitstreams: 1 Dissertação Felipe Rodrigues Bruzadin.pdf: 1223088 bytes, checksum: 6154c5af3c3bf01a650eed314f51f20e (MD5) / Approved for entry into archive by ALESSANDRA KUBA OSHIRO ASSUNÇÃO (alessandra@fct.unesp.br) on 2018-11-14T19:19:22Z (GMT) No. of bitstreams: 1 bruzadin_fr_me_prud.pdf: 1223088 bytes, checksum: 6154c5af3c3bf01a650eed314f51f20e (MD5) / Made available in DSpace on 2018-11-14T19:19:22Z (GMT). No. of bitstreams: 1 bruzadin_fr_me_prud.pdf: 1223088 bytes, checksum: 6154c5af3c3bf01a650eed314f51f20e (MD5) Previous issue date: 2018-09-27 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Este trabalho apresenta uma sequência didática onde são utilizadas ferramentas de informática e a experimentação como recursos metodológicos, com o intuito de contribuir com o ensino e a prática em sala de aula dos professores. Na sequência, aparece a ordem de como trabalhar a dispersão e a difração da luz, assim como as habilidades e competências necessárias, levando em conta os conhecimentos prévios dos alunos. Os resultados nos mostram que os alunos conseguiram entender a relação entre o espectro e a luz fornecida por diferentes lâmpadas assim como a participação deles nas atividades foi relevante. / This work presents a didactic sequence in which computer tools and experimentation are used as methodological resources, with the aim of contributing to teaching and practice in the teachers' classroom. In the sequence, appears the order of how work the scattering and diffraction of light, as well as the skills and competencies necessary, taking into account the prior knowledge of students. The results show us that students understand the relationship between the spectrum and the light supplied by different light bulbs as well as their participation in activities was relevant.

Submitted by Anderson Silva (avargas@icict.fiocruz.br) on 2012-11-26T15:43:37Z No. of bitstreams: 1 daniel_a_p_martins_ioc_bcm_0024_2010.pdf: 10130276 bytes, checksum: 596c01e9402f3b4dd80395ef8bc4aa50 (MD5) / Made available in DSpace on 2012-11-26T15:43:37Z (GMT). No. of bitstreams: 1 daniel_a_p_martins_ioc_bcm_0024_2010.pdf: 10130276 bytes, checksum: 596c01e9402f3b4dd80395ef8bc4aa50 (MD5) Previous issue date: 2010 / Universidade Federal do Rio de Janeiro. Instituto de Biofísica Carlos Chagas Filho. Departamento de Neurobiologia. Rio de Janeiro, RJ,Brasil / A doença de Chagas é causada pelo protozoário Trypanosoma cruzi sendo a principal causa de morbi-mortalidade entre as cardiopatias na América Latina, onde é endêmica. No presente trabalho nós utilizamos modelos experimentais tais como cultivo celular e infecção de camundongos albinos para avaliar aspectos relacionados à patogênese desta doença. Primeiramente utilizamos a técnica de microarranjos de oligonucleotídeos para determinar as diferentes assinaturas transcriptômicas induzidas por quatro diferentes cepas de T. cruzi em uma linhagem de células musculares. Neste trabalho, verificamos que os genes alterados significativamente nas células infectadas (p<0,05) foram diferentes para cada cepa e apenas 21 sofreram a mesma alteração nas quatro cepas estudadas. No entanto, mioblastos apresentaram assinaturas transcriptômicas únicas após infecção pelas quatro cepas de T. cruzi utilizadas. Estes resultados indicam que a infecção com diferentes cepas do parasito modula vias similares, porém não idênticas, nas células hospedeiras. Em seguida analisamos o impacto da infecção de cardiomiócitos murinos na expressão de caveolina-3 (Cav-3), proteína formadora das cavéolas, importantes para a manutenção da homeostase de cálcio intracelular e envolvida em processos de hipertrofia cardíaca. A infecção in vitro e in vivo por T. cruzi induziu redução significativa (p<0,05) nos níveis de Cav-3. Esta redução foi acompanhada pela ativação da quinase regulada por sinal extracelular (ERK), majoritariamente envolvida no processo de remodelamento e hipertrofia cardíacos, sugerindo a participação desta via de sinalização na patogênese da doença de Chagas. Por último, avaliamos a capacidade tripanocida do composto antiarrítmico amiodarona em culturas de cardiomiócitos infectadas. Este composto apresentou atividade seletiva anti-T. cruzi, promovendo danos ultra-estruturais às formas amastigotas intracelulares e a recuperação da célula hospedeira, incluindo restabelecimento do citoesqueleto de actina e junções comunicantes, além da contratilidade espontânea das culturas. O conjunto de dados gerado com esta tese traz importantes avanços para o entendimento do estabelecimento da doença de Chagas cardíaca e novas opções para o tratamento etiológico desta doença negligenciada. / Chagas’disease is caused by the protozoan Trypanosoma cruzi and is the main cause of morbidity and mortality by heart problems in endemic countries in Latin America. In the present work we employed as experimental models cell cultures and murine experimental infection to evaluate aspects related to the pathogenesis of this disease. In the first part we determined through oligonucleotide microarrays the transcriptomic signatures induced in a myoblast cell line by four reference T. cruzi strains. We observed that the significantly altered (p<0.05) genes differed for each strain studied and only 21 suffered changes in the same direction in all four strains. However, infected myoblasts presented proportional alterations in the the overall transcriptome. These results indicate that the infection with distinct strains modulate similar, but not identical, pathways in the host cell. Next we analyzed the impact of T. cruzi infection on cardiac caveolin-3 (Cav-3) expression, which has an important role in the maintenance of intracellular calcium homeostasis and is also involved in cardiac hypertrophy pathways. Both in vitro and in vivo infection induced a significant reduction of Cav-3 levels. This reduction was followed by the activation of extracellular signal regulated kinase (ERK), which plays a major role in cardiac remodeling and hypertrophy, suggesting that this pathway may be involved in the pathogenesis of Chagas’ heart disease. Finally we tested the tripanocidal potential of the anti-arrhythmic drug amiodarone in infected cultures of cardiac myocytes. This compound displayed a selective anti-T. cruzi activity, inducing ultrastructural alterations in intracellular amastigotes and promoted host cell recovery with actin cytoskeleton and gap junction reassembly, followed by restoration of the spontaneous contractility. The data generated in this work bring important advances into the understanding of Chagas heart disease establishment and also a new option for the etiological treatment of this neglected disease.

MELO, Bárbara Olímpia Ramos de. Letramento e apropriação do gênero textual carta de reclamação no contexto da educação de jovens e adultos. 2009. 289f. Tese (Doutorado em Linguística) – Universidade Federal do Ceará, Departamento de Letras Vernáculas, Programa de Pós-graduação em Linguística, Fortaleza-CE, 2009. / Submitted by nazareno mesquita (nazagon36@yahoo.com.br) on 2012-08-13T14:10:57Z No. of bitstreams: 1 2009_tess_ BORDEMELO.pdf: 1600395 bytes, checksum: 65b341cf7b1e67b28545e74d68fb46e4 (MD5) / Approved for entry into archive by Maria Josineide Góis(josineide@ufc.br) on 2013-09-25T23:39:21Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2009_tess_ BORDEMELO.pdf: 1600395 bytes, checksum: 65b341cf7b1e67b28545e74d68fb46e4 (MD5) / Made available in DSpace on 2013-09-25T23:39:21Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2009_tess_ BORDEMELO.pdf: 1600395 bytes, checksum: 65b341cf7b1e67b28545e74d68fb46e4 (MD5) Previous issue date: 2009 / Studies on how textual genres teaching-learning practices are built in the classroom have been the object of many questions. In this study, we investigated the appropriation of a complaint letter pattern by students doing the 3rd and 4th semesters on the Youth and Adult Education programme, participating or not in didactic sequences, enrolled in two public municipal schools in Teresina-PI, aiming to identify which elements of textual genres were learnt by using activities designed to this end. Our goal was also to investigate the influence the events of literacy have on the appropriation of writing. The selected classes worked as control and experimental groups. On the former, written production occurred as one of the activities conducted by the teacher, that is, it was done according to school planning. On the latter, we also worked as teachers and developed a didactic sequence. After quantitative and qualitative analyses of the texts from both groups, we verified that theme development, thematic continuity, discursive-argumentative links, discursive relations and modalizations were more easily learnt and contributed to building a meaning in the experimental group students’ production. Concerning the relation among the events of literacy in which the subjects take part, we found out that the more significant the subjects’ participation is in the events of literacy on its varied communicative routines, the more fluency they show on using the textual genre studied. Under a more theoretical point of view, this paper sought to evidence contributions from those applied studies concerning questions that come under didactic-pedagogic heading with enunciative-discursive studies, established on a linguistic dialogic conception as proposed by bakhtinian thinking / Os estudos sobre os modos como se constroem as práticas de ensino-aprendizagem dos gêneros textuais em contexto escolar têm sido objeto de vários questionamentos. Neste estudo, investigamos a apropriação do gênero textual carta de reclamação, por alunos dos 3º e 4º blocos da Educação de Jovens e Adultos, participantes e não-participantes de uma sequência didática, matriculados em duas escolas públicas municipais de Teresina-PI, com o objetivo de verificar quais elementos do gênero textual em estudo os alunos aprendem por meio de atividades estruturadas para este fim. Foi objetivo nosso também investigar a influência que os eventos de letramento exercem sobre a apropriação da escrita. As turmas selecionadas funcionaram como grupo controle e experimental. No primeiro, a produção escrita aconteceu como uma das atividades feitas pelo professor da turma, ou seja, foi seguido o planejamento da escola. No segundo grupo, atuamos também com a função de professora e desenvolvemos uma sequência didática. Após as análises quantitativas e qualitativas dos textos de ambos os grupos, verificamos que o desenvolvimento do tema, a continuidade tópica, os articuladores discursivo-argumentativos, as relações discursivas e as modalizações tiveram sua aprendizagem facilitada e contribuíram para a construção do sentido nas produções dos alunos do grupo experimental. Tais aspectos não foram constatados nos textos produzidos pelos alunos do grupo controle. Sobre a relação entre os eventos de letramento de que os sujeitos participam e a apropriação da escrita, constatamos que, quanto mais significativa a participação dos sujeitos em eventos de letramento nas suas variadas rotinas comunicativas, mais fluência eles demonstraram na construção do gênero textual em estudo. Do ponto vista mais propriamente teórico, o trabalho buscou conjugar contribuições dos estudos aplicados voltados para questões de ordem didático-pedagógica com estudos enunciativo-discursivos, fundados em uma concepção dialógica da linguagem tal qual proposta no pensamento bakhtiniano

Falhas reprodutivas são importante causa de prejuízos econômicos na suinocultura. Elas implicam na diminuição do número de leitões nascidos vivos e aumentam o descarte de animais e as taxas de reposição de matrizes, levando à redução da produtividade do rebanho. Embora a maioria dos casos de natimortalidade sejam associados a fatores não infecciosos, os agentes infecciosos possuem um papel importante e ainda pouco conhecido na etiologia deste quadro. Até o presente, nenhum trabalho foi realizado visando o estudo do conjunto de vírus que possam estar presentes em matrizes com eventos de natimortalidade por ocasião do parto. Em função disso, o presente trabalho teve por objetivo examinar o viroma do soro de matrizes suínas com e sem casos de natimortalidade. Foram coletadas 94 amostras de soro de matrizes de seis granjas distribuídas em cinco municípios do Rio Grande do Sul. Em cada granja foram formados dois pools de soros: um composto por matrizes que pariram (um ou mais) natimortos e outro por matrizes que pariram leitegadas sem natimortos. Os pools foram submetidos à extração de ácido nucleico viral, enriquecimento e sequenciamento de alto desempenho, buscando a identificação de agentes que possam representar um fator de risco à natimortalidade em suínos Não foi possível identificar diferenças significativas nos viromas de matrizes correlacionadas à ocorrência de natimortalidade. Não obstante, foi possível identificar uma ampla variedade de genomas virais, a maioria deles correspondendo a vírus das famílias Anelloviridae. Este estudo permitiu ainda identificar 20 genomas completos de três espécies de vírus: torque teno vírus suíno 1a e 1b, circovírus suíno tipo 3 (PCV3) e vírus circulares DNA fita simples codificantes de replicase (CRESS), seis dos quais até o presente ainda não reportados em suínos. Em duas granjas, em matrizes que apresentaram natimortalidade, foram identificados genomas de PCV3, cuja participação como potencial causador de problemas reprodutivos precisa ser futuramente investigada. Não foram identificados vírus com genoma de RNA. Este estudo traz uma contribuição ao conhecimento do viroma em soros de matrizes suínas e, paralelamente, busca contribuir para o esclarecimento das possíveis causas de natimortalidade de origem infecciosa em suínos. / Reproductive failure in swine herds is an important cause of economic losses. It leads to a decrease in the number of piglets reared per sow and may imply in the need for replacement of sows, reducing the productivity in a herd. Although the majority of cases of stillbirths have been attributed to non-infectious causes, several infectious agents have been implicated in the etiology of such condition. Nevertheless, other as yet unknown agents may be involved in the pathogenesis of stillbirths. The aim of this work was to investigate the virome in sera of sows without and with one or more cases of stillbirth in the litter. Sera were collected from 94 sows of six commercial farms in five municipalities in the state of Rio Grande do Sul, Brazil. Two pools of sera were collected from each farm: one representative of sows that had at least on stillbirth in the last litter and another composed by sera of sows that had litters with no stillbirths. The pools were subjected to nucleic acid extraction, enrichment and high throughput sequencing. No significant differences were detected in the serum viromes of sows with or without stillbirth Nevertheless, it was possible to identify a wide variety of viral genomes, most of these representing viruses of Anelloviridae family. In addition, the present work allowed the identification of 20 complete genome sequences including torque teno sus virus 1a and 1b, porcine circovirus 3 (PCV3) and circular rep-encoding ssDNA viruses (CRESS), including six species not previously reported in swine. In two farms, PCV3 genomes were identified in the serum pools of sows which had cases of stillbirth. The role for this virus as a potential cause of reproductive failure needs additional investigations. No genomes of viruses with RNA genomes were identified. This study provides a contribution to the knowledge on the serum virome of pregnant sows. In addition, it is expected to aid in the identification of possible causes of stillbirth in swine.

Submitted by Flávio Renato dos Santos (flavioguap@hotmail.com) on 2018-10-03T21:51:38Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - FLÁVIO RENATO DOS SANTOS - FINALIZADO.pdf: 3662521 bytes, checksum: 5c4c1aa3cb5b99a4f276d0d3f26499c2 (MD5) / Rejected by Adriana Aparecida Puerta null (dripuerta@rc.unesp.br), reason: Prezado Flávio, O documento enviado para a coleção Campus Unesp Rio Claro foi recusado pelo(s) seguinte(s) motivo(s): - Falta o local de defesa na capa, elemento obrigatório. Agradecemos a compreensão e aguardamos o envio do novo arquivo. Atenciosamente, Biblioteca Campus Rio Claro Repositório Institucional UNESP https://repositorio.unesp.br on 2018-10-04T17:29:01Z (GMT) / Submitted by Flávio Renato dos Santos (flavioguap@hotmail.com) on 2018-10-04T18:48:02Z No. of bitstreams: 1 Dissertação - FLÁVIO RENATO DOS SANTOS - FINALIZADO.pdf: 3662521 bytes, checksum: 5c4c1aa3cb5b99a4f276d0d3f26499c2 (MD5) / Approved for entry into archive by Adriana Aparecida Puerta null (dripuerta@rc.unesp.br) on 2018-10-04T19:12:25Z (GMT) No. of bitstreams: 1 santos_fr_me_rcla.pdf: 3662521 bytes, checksum: 5c4c1aa3cb5b99a4f276d0d3f26499c2 (MD5) / Made available in DSpace on 2018-10-04T19:12:25Z (GMT). No. of bitstreams: 1 santos_fr_me_rcla.pdf: 3662521 bytes, checksum: 5c4c1aa3cb5b99a4f276d0d3f26499c2 (MD5) Previous issue date: 2018-08-15 / A presente pesquisa, de natureza qualitativa, discute a escrita de gêneros textuais por alunos do último ano do Ensino Fundamental I, procurando avaliar sobretudo os componentes formais do gênero escrito, tais como estrutura composicional, estilo de linguagem e conteúdo temático. Este estudo divide-se em duas fases: 1. Discussão teórico-bibliográfica e levantamento de estudos acadêmicos; 2. Estudo de campo com a análise dos textos escritos pelos alunos. A bibliografia estudada apontou para a necessidade do letramento escolar e, portanto, para a obrigatoriedade do ensino dos gêneros textuais nas escolas de modo sistematizado (de seus componentes internos e externos), uma vez que seu aprendizado propicia a participação dos sujeitos em práticas sociais de uso da escrita. Constatou-se também, pela leitura de teses, dissertações e artigos acadêmicos, que os alunos escreveram gêneros textuais funcionais nas escolas, contudo, houve diferentes problemas na construção de seus componentes internos que comprometeram o uso social de tais textos. Para resolvê-los, essas pesquisas sugeriram o uso das Sequências Didáticas, já que, por meio delas, é possível identificar os problemas de escrita do gênero e construir atividades direcionadas à sua solução. No mesmo sentido, também estão os resultados obtidos no estudo de campo, constatou-se, na escrita de poemas e de narrativas de terror, a capacidade escritora de gêneros textuais pelos alunos, porém, com fragilidades no desenvolvimento de seus componentes internos. As análises dos textos permitiram traçar uma relação direta entre as atividades desenvolvidas pelas docentes e os resultados das escritas. O desenvolvimento do conteúdo temático, por exemplo, foi 100% alcançado na escrita dos poemas, cujo trabalho com o tema foi sistematizado pela Professora A; já o desenvolvimento verossímil do terror e do medo nos contos de terror, não trabalhado pela outra docente, foi alcançado apenas por 27,2% dos alunos. O trabalho feito pela professora A com a estrutura do poema, em versos e em estrofes, também propiciou resultados satisfatórios nas escritas, diferente do que ocorreu com a linguagem, cujo estilo conotativo, necessário aos poemas, não foi trabalhado pela docente e, portanto, quase não aconteceu nos textos dos alunos. Da mesma forma, os contos de terror, para os quais a Professora B não propôs nenhuma intervenção, apresentaram muitos problemas relativos ao uso da norma padrão da língua, dentre eles, 22,7% tiveram o entendimento de excertos dos textos comprometido pelas dificuldades de escrita apresentadas. Diante disto, conclui-se que a criação das Sequências Didáticas, destinadas ao atendimento das dificuldades dos alunos, é necessária para o avanço na construção dos componentes internos dos gêneros textuais escritos, já que se observou que, quando trabalhados sistematicamente pelas professoras, houve progresso na escrita. / The present research, of a qualitative nature, discusses the writing of textual genres by students of the last year of Elementary School I, trying to evaluate, in particular, the formal components of the written genre, such as compositional structure, language style and thematic content. This study was divided into two phases: 1. Theoretical - bibliographic discussion and survey of academic studies; 2. Field study with the analysis of texts written by the students. The bibliography studied pointed to the necessity of school literacy and, therefore, to the compulsory teaching of the textual genres in schools in a systematized way (of their internal and external components), since their learning provides the participat ion of the subjects in social practices of use of the writing. It was also verified by reading theses, dissertations and academic articles, that students wrote functional textual genres in schools; however, there were different problems in the construction of its internal components that compromised the social use of such texts. In order to solve them, these researches suggested the use of Didactic Sequences, since, through these, it is possible to identify the problems of writing of the genre and the const ruction of activities directed to its solution. In this way, are also the results obtained in the field study; it was verified, in the writing of poems and horror narratives the writing ability of textual genres by the students; however, with weaknesses in the development of its internal components. The analysis of the texts allowed to draw a direct relation between the activities developed by the teachers and the results of the writing. The development of the thematic content, for example, was 100% achieve d in the writing of the poems, whose work with the theme was systematized by Professor A, and the verisimilar development of terror and fear in the tales of terror, not worked by the other teacher, was reached by only 27.2% of the students. The work done b y teacher A with the structure of the poem, in verses and in stanzas, also provided satisfactory results in the writings. Different from what happened with language, whose connotative style, necessary to the poems, was not worked by the teacher and, theref ore, almost did not happen in the texts of the students. Similarly, the horror stories, for which Professor B did not propose any intervention, presented many problems related to the use of the standard language, among them, 22.7% had an understanding of e xcerpts from texts compromised by the difficulties of presented. From this, it was concluded that the creation of Didactic Sequences, at addressing the difficulties observed, are primordial to obtain improvements in the construction of internal components of written text genres, since it was observed that, when they were systematically worked by the teachers, there was progress in writing.

A presente pesquisa pretende mostrar os desafios que os professores em geral e, em especial, por conta da proposta desta dissertação, os professores do Ensino Fundamental II enfrentam para que seus alunos sejam produtores proficientes de textos orais e escritos. Com base na concepção dos fatores de textualidade desenvolvidos por Beaugrand e Dressler (2002), sustentamos a hipótese de que o texto argumentativo, produzido na escola em condições tradicionais de ensino, sofre de baixo grau de informatividade, entre outros motivos, principalmente por carecerem de um projeto de ensino desta disciplina. A grande questão que se apresenta é como atingir esse propósito. Em geral, redação escolar não é considerada pelas direções, equipes pedagógicas e, algumas vezes, pelos próprios professores como uma disciplina que possa ser ensinada, pois acreditam que o conhecimento gramatical da língua materna e a leitura de textos literários e não literários constituam instrumentos suficientes para que o aluno por si só seja capaz de produzir bons textos. O objetivo maior desta dissertação é refletir acerca dos aspectos relacionados à informatividade nos textos argumentativos produzidos por alunos do nono ano do EF II de uma escola particular do Município do Rio de Janeiro, pertencentes à classe média alta. O corpus da presente pesquisa é constituído de quinze redações com seguintes condições de produção: sete delas foram produzidas com a motivação de um texto apresentado pelo professor, e oito com apenas a apresentação do tema escolhido, também, pelo professor. A partir da análise do corpus e confirmando a hipótese de que é possível e necessário ensinar o aluno a produzir textos, sugere-se uma sequência didática que dá conta do passo a passo pertinente ao aprimoramento da progressão das ideias do tipo textual referido / This research aims to show the challenges that teachers in general and in particular on account of the purpose of this dissertation, the elementary school teachers face II for their students to be proficient producers of oral and written texts. Based on the conception of textuality factors developed by Beaugrand and Dressler, sustain the hypothesis that the argumentative text, produced in traditional school in terms of education suffers from low degree of informativeness, among other reasons, mainly because they lack a project teaching this subject. The big question that arises is how to achieve this purpose. In general, school essay is not regarded by the directions, and pedagogical teams, sometimes by teachers themselves as a discipline that can be taught. Because they believe the grammatical knowledge of language and reading literary and non-literary texts are sufficient tools for the student alone is capable of producing good texts. The main objective of this thesis is to study aspects related to informativeness argumentative and expository texts produced by ninth graders EF II from a private school in the city of Rio de Janeiro, belonging to the upper middle class. The corpus of this study consists of fifteen essays with production following conditions: seven were produced with the motivation of a text presented by the teacher, and eight with only the presentation of a chosen topic, too, by the teacher. From the analysis of the corpus and confirming the idea that possible and necessary to teach students to produce texts, we suggest a teaching sequence that reflects the walkthrough relevant to the improvement of the progression of ideas of the text types listed

Orientador: Prof. Dr. Márcio Katsumi Oikawa / Dissertação (mestrado) - Universidade Federal do ABC, Programa de Pós-Graduação em Ciência da Computação, 2016. / No Brasil, há grande variação da prevalência de doenças infecciosas, dentre as quais podemos destacar as hepatites B e C. Um dos fatores que pode in uenciar o tratamento é a realização de um diagnóstico preciso e rápido do genótipo do vírus que ataca o paciente. Esse diagnóstico norteará todos os procedimentos clínicos de tratamento de curto, médio e longo prazo, além de permitir indicar com maior precisão a lista de medicamentos usados pelo paciente e acompanhar historicamente a in uência do tratamento na sua vida cotidiana. Em muitos casos ocorre a resistência da doença a um determinado medicamento, resistência associada à presença de mutações em regiões específicas do DNA. O processo de compreensão da resistência é dinamico e depende de muitas observações e testes, no entanto, pode ser estruturado com regras e expressões representadas pela lógica de primeira ordem, pois esta ultima fornece sentenças abrangentes sob a forma de quantificadores e operações sobre variáveis. Nesse contexto, esse projeto se propõe a implementar uma gramática capaz de interpretar expressõess em lógica de primeira ordem, aplicados a análise de dados biológicos e a diversos contextos semânticos. A gramática foi desenvolvida na linguagem de programação Java, com o auxílio da ferramenta ANTLR e empregada por uma biblioteca, nomeada de BIAR (Biblioteca de Análise de Regras). Na forma de biblioteca, o BIAR, pode ser utilizado sozinho ou acoplado com outros softwares. Na seleção resultados encontramos um estudo de caso sobre sua aplicabilidade para a composição de regras de tratamento usando medicamentos. Desta forma, o BIAR demonstra condições de analisar expressões levando em consideração características clinicas e epidemiol logicas, oferecendo um grau maior de especifcidade para as analises de sequencias, baseado no historico de pacientes de centros hospitalares da cidade de São Paulo. / In Brazil, there is wide variation in infectious diseases prevalence, among which we highlight the hepatitis B and C. One of the factors that may in uence the treatment is to perform an accurate and rapid identication of the virus genotype that infected the patient. This diagnosis will guide all clinical procedures in short, medium and long term treatments, and also allows to state more precisely the list of medicines that will used by the patient and to track the in uence of treatment in their daily lives. In many cases, there may be a disease resistance to a particular drug which is associated to the presence of mutations in specic regions of DNA. The process of understanding the resistance is dynamic and depends on many observations and exams. However, it can be structured with rules and keywords represented by rst-order logic, that provides comprehensive decisions as quantiers of operations on variables. In this context, this project aimed to implement a lexical grammar capable of interpreting expressions in rst-order logic, applied to biological data analysis and dierent semantic contexts. The grammar was developed in Java programming language, with the help of ANTLR tool, and employed by a library named BIAR (Analysis of rules library). In its library format, the BIAR may be used alone or coupled with other softwares. In the Results section, we present a case study about its applicability to the development of procedures in treatments with drugs. Therefore, BIAR demonstrates the abilities to analyze expressions according to clinical and epidemiological characteristics, providing a higher degree of specicity for analysis of sequences, based on the medical histories of patients from hospitals centers in S~ao Paulo city.

Made available in DSpace on 2014-06-11T19:25:59Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2011-07-13Bitstream added on 2014-06-13T19:12:46Z : No. of bitstreams: 1 barbosa_gas_me_prud.pdf: 8883369 bytes, checksum: f53f0fdd5ff881fc25aa98bb619cef73 (MD5) / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Secretaria Estadual de Educação / Esta pesquisa, vinculada ao Programa de Pós-Graduação em Educação da Faculdade de Ciências e Tecnologia de Presidente Prudente, na linha de pesquisa Infância e Educação, tem por objetivo geral investigar a qualidade de dois materiais didáticos, para ensino da leitura e da escrita do gênero textual artigo de opinião, na escola de Ensino Médio. O primeiro material é “Sequência Didática Artigo de Opinião”, o qual foi produzido para o curso Ensino Médio em Rede – oferecido aos professores pela Secretaria Estadual de Educação de São Paulo, entre os anos de 2004 e 2006. O segundo é “Pontos de Vista”, que acompanha a coleção de materiais da Olimpíada de Língua Portuguesa: Escrevendo o Futuro, a qual teve início em 2008 e está em vigor. O objetivo específico da pesquisa é investigar como estão construídas nos materiais as etapas da sequência didática, a materialização do gênero textual artigo de opinião e a abordagem de leitura e escrita. O procedimento metodológico de análise é a pesquisa documental, que utiliza as duas publicações como fonte primária e decompõe as partes dos materiais para compreender a organização e os conceitos adotados. O referencial teórico básico sustenta-se nos pressupostos bakhtinianos de gêneros discursivos e nas pesquisas desenvolvidas na Universidade de Genebra acerca do procedimento sequência didática... / This research, linked to the Graduate Program in Education, Faculty of Science and Technology of Presidente Prudente, in the search line Childhood and Education, aims to investigate the overall the quality of two textbooks for teaching reading and writing genre oped in school High School. The first material is Instructional Sequence Opinion, which was produced for the program Ensino Médio em Rede - offered to teachers by the State Board of Education of São Paulo between 2004 and 2006. The second is Points of View, which follows the collection of materials Olympics Portuguese: Writing the Future, which began in 2008 and is in effect today. The specific objective of this research is to investigate how materials are constructed in the steps of the instructional sequence, the concept of genre and op-ed approach to reading and writing. The methodological procedure of analysis is the documentary research, which uses the two publications as a primary source and breaks down parts of the material to understand the organization and the concepts adopted. The theoretical base is underpinned by the assumptions of Bakhtinian speech genres and the research developed at the University of Geneva on the procedure instructional sequence... (Complete abstract click electronic access below)

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:29:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 5471.pdf: 7638931 bytes, checksum: c87748a2f96946166ab14d98ed641bae (MD5) Previous issue date: 2013-08-17 / Financiadora de Estudos e Projetos / This present dissertation, structured in the methodology of well-known research as Didactic Engineering, it presents the development of an unpublished class for the teacher on combination analysis in the High School. The objective of this work is to elaborate a didactic material that aids the students in the learning of some concepts of combination analysis in a significant way. The elaborated didactic sequence is inserted in the telephony context and it approaches the current subject on the increment of the 9th digit in the numbers of cellular of the area of the State of São Paulo with code of area 11. The whole sequence was thought so that the student will be the protagonist of its learning, making observations, you conjecture, debating with the colleagues, manipulating materials and solving the problems proposed in the leaves of activities in an autonomous way. The didactic sequence was applied for two groups of 2nd year of the High School in the School Educational Center SESI Bragança Paulista. For they accomplish the activities, the students were divided in groups. All the sheets of activities accomplished by the students and the registrations of observations facts by the teacher during the application of the activities were good as tools to verify the objective plans were reached. / A presente dissertação, estruturada na metodologia de pesquisa conhecida como Engenharia Didática, apresenta o desenvolvimento de uma aula inédita para o professor sobre análise combinatória no Ensino Médio. O objetivo deste trabalho é elaborar um material didático, que auxilie os alunos no aprendizado de alguns conceitos de análise combinatória de forma significativa. A sequência didática elaborada está inserida no contexto de telefonia e aborda o assunto atual sobre o acréscimo do 9º dígito nos números de celulares da região do Estado de São Paulo com código de área 11. Toda a sequência foi pensada de forma que o aluno seja o protagonista de sua aprendizagem, fazendo observações, conjecturas, debatendo com os colegas, manipulando materiais e solucionando os problemas propostos nas folhas de atividades de maneira autônoma. A sequência didática foi aplicada para duas turmas de 2º ano do Ensino Médio na Escola Centro Educacional SESI Bragança Paulista. Para realizarem as atividades, os alunos foram divididos em grupos. Todas as folhas de atividades realizadas pelos alunos e os registros de observações feitos pelo professor durante a aplicação das atividades serviram como ferramentas para verificar se os objetivos traçados foram atingidos.

Made available in DSpace on 2016-06-02T20:36:39Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4425.pdf: 4096750 bytes, checksum: d77921e33ac24b167ed701cea4759eb0 (MD5) Previous issue date: 2012-04-18 / Financiadora de Estudos e Projetos / Plant cell walls are composed of approximately 65% cellulose microfibrils and pectin. The latter is proteolytically degraded by the so-called pectinases enzymes (also known as pectinolytic enzymes). Pectinases may be either depolymerizing. They are produced by plants, filamentous fungi, bacteria, and yeast. Due to the wide commercial use of pectinase, one has testified a growing number of studies devoted to understand the activities of such enzymes. Bioinformatics tools were employed throughout this work in order to study fungal polygalacturonase (PG) under two aspects. Firstly, all stored fungal PG sequences in databases (2093) were analyzed in order to evaluate through searching for sequential motifs and phylogenetic studies the possibility to classifying the enzymes as either Endo- or Exo-PG. After excluding those with less than 70 amino acids, those that corresponded to the hypothetical protein , and those that were neither PG nor fungal PG, there were 957 sequences left. Those sequences were separated according to genus and species. For each group, multiple sequence alignments were made by using ClustalW software. The alignments were analyzed and the sequences displaying 100% identity were then expunged, thus resulting in a database of unique sequences of fungal PG. By means of the alignment, the study of structural motifs, and the construction of phylogenetic trees, one was able to classify all the sequences according to their mode of action in either Endo- or Ex-PG. Throughout the second part of our research, protein homology-modeling methods were employed while constructing a three-dimensional model of a L. gongylophorus fungal polygalacturonase, symbiont of leaf-cutting ant. The model was validated by PROCHECK, VERIFY 3D, and WHAT IF software. By analyzing the 3D model of the L. gongylophorus PG, a catalytic mechanism of the enzyme was outlined, which may take place by inverting the configuration of sugar anomeric carbon (substrate). / A parede celular de células de plantas é composta de aproximadamente 65% de rede de celulose e rede de pectato. Essa última é proteoliticamente degradada por enzimas chamadas pectinases ou enzimas pectinolíticas. As pectinases podem ser despolimerizantes ou desesterificantes e são produzidas por plantas, fungos filamentosos, bactérias e leveduras. Impulsionado pelas aplicações comerciais que pectinases representam, é crescente o estudo para o melhor entendimento sobre as atividades dessas enzimas. Ferramentas de bioinformática foram usadas neste trabalho para estudar poligalacturonases (PG) de fungos, sob dois aspectos. Na primeira parte do trabalho, todas as sequências de PG de fungos depositadas em bancos de dados (2093) foram analisadas e avaliadas quanto à possibilidade de classificação das enzimas em Endo- ou Exo-PG através de busca de motivos sequenciais e estudos filogenéticos. Após exclusão daquelas com menos de 70 aminoácidos, das que correspondiam a 'proteína hipotética' e ainda das que não eram PG ou mesmo não eram PG de fungos restaram 957 sequências. Essas sequências foram separadas por gênero e espécie e para cada grupo foram realizados alinhamentos múltiplos de sequências usando o programa ClustalW . Os alinhamentos foram analisados e as sequências com 100% de identidade foram retiradas, resultando em um conjunto de dados com 417 sequências únicas de PG de fungos. Através dos alinhamentos, do estudo de motivos estruturais e da construção de árvores filogenéticas foi possível classificar todas as sequências de acordo com seu modo de ação em Endo- ou Exo-PG. Na segunda parte do trabalho foi usado o método de modelagem por homologia na construção do modelo tridimensional de uma poligalacturonase do fungo L. gongylophorus, simbionte de formigas cortadeiras. O modelo foi validado com os programas PROCHECK, VERIFY 3D e WHAT IF. Através da análise do modelo 3D da PG do L. gongylophorus foi possível propor um mecanismo de ação da enzima, que deve ocorrer com inversão da configuração do carbono anomérico do açúcar (substrato).