Medicina da Universidade de São Paulo. Objetivo: Esse estudo foi desenvolvido para avaliar o impacto dos poluentes do ar na morbidade nas crianças e adolescentes portadoras de anemia falciforme. Métodos: Foram utilizadas as associações entre as concentrações diárias entre as concentrações dos poluentes do ar (PM10, SO2, NO2, CO, e O3) e os atendimentos no Pronto Socorro de anemia falciforme (CID 10 - D57) no período de setembro de 1999 até dezembro de 2004. Foi utilizado o desenho de case - crossover com dias de exposição de referencia escolhidos utilizando-se uma abordagem estratificada por tempo onde as exposições no dia índice foram comparadas a exposições com dias do mesmo mês com o mesmo valor de temperatura como o caso índice, controlando-se para o dia da semana. Estação do ano, clima e covariantes variáveis lentas foram controladas por pareamento. Também foram adotados modelos onde as exposições do caso índice foram comparadas às exposições para o mesmo dia da semana ou a cada três dias. Os efeitos estimados também foram estratificados para as duas causas principais de atendimento no pronto socorro de pacientes falciformes, dor e infecção respiratória. Resultados: As variações de interquartile aumentaram nas médias móveis de PM10 (25.9 mg/m3), NO2 (64.8 mg/m3), SO2 (8.1 mg/m3), CO (1.2 ppm), e O3 (57.23 mg/m3) foram associadas com aumento de 19.2% (95% CI: 11.2 - 27.8), 15.6% (95% CI: 6.3 - 25.8), 14.5% (95% CI: 6.6 - 23.0), 15,1% (95% CI: 7.7 -23.1), e 10% (95% CI: 1,3 - 18,6) nos atendimentos totais dos pacientes falciformes no pronto socorro, respectivamente. Na análise estratificada para dor, que é a manifestação cardinal dos processos de vaso-oclusão, os aumentos nos atendimentos dos pacientes falciformes com dor (23.1%, 95%CI: 11.0 - 36.5) devido a um aumento na variação interquartile da média móvel de 3 dias do PM10 foi 43% maior que nos pacientes falciformes sem dor. Conclusão: esse estudo mostra que o efeito da poluição do ar na saúde da população pediátrica não se restringe às doenças respiratórias. Também , entre os pacientes falciformes a manifestação principal dos efeitos adversos foi associada com o processo inflamatório dos vasos, reproduzindo resultados já observados entre pacientes adultos e idosos saudáveis e não saudáveis. Finalmente, esse estudo mostrou que os efeitos da poluição do ar na saúde ainda não esta definitivamente estimados e outros resultados serão observados em mais investigações. / Objective: This study was developed to assess the impact of air pollutants on sickle cell morbidity in children and adolescents. Methods we examined the associations between daily air pollutants concentrations (PM10, SO2, NO2, CO, and O3) and sickle cell (ICD10th revision: D57) emergency room visits, from September 1999 to December 2004. We applied a case-crossover design with referent exposure days chosen using the time-stratified approach such that exposures on the case day were compared to exposures on days of the same month with the same value of temperature as the case day, controlling for day of the week. Season, weather, and slowly varying covariates were controlled for by matching. We also adopted models where exposures on the case day were compared to exposures on the same day of the week or on every third day. Effects estimates were also stratified by the two main causes of sickle cell emergency room visits, pain and respiratory infections. Results: interquartile range increases of the 3-day moving averages of PM10 (25.9 mg/m3), NO2 (64.8 mg/m3), SO2 (8.1 mg/m3), CO (1.2 ppm), and O3 (57.23 mg/m3) were associated with increases of 19.2% (95% CI: 11.2 - 27.8), 15.6% (95% CI: 6.3 - 25.8), 14.5% (95% CI: 6.6 - 23.0), 15,1% (95% CI: 7.7 - 23.1), and 10% (95% CI: 1,3 - 18,6) in total sickle cell emergency room visits, respectively. When the analyses were stratified by pain, the main clinical manifestation of vase-occlusion process, increases in visits of sickle cell patients with pain (23.1%, 95%CI:11.0 -36.5) due to an interquartile range increase of the 3-day moving averages of PM10 were 43% higher than in sickle cell patients without pain. Conclusions: this study found that the effects of air pollutants on children\'s health are not limited to respiratory diseases. Also, among sickle cell patients, the main manifestation of adverse effect was associated with inflammatory process of vases, reproducing results already observed among healthy and non-healthy adults and elderly people. Finally, this study showed that the burden of air pollution on health has not been definitively estimated and other outcomes deserve further investigation.

Introdução: A doença falciforme (DF) é a afecção hematológica hereditária de maior prevalência no mundo, sendo que a anemia falciforme (AF) é a forma mais grave com elevada morbidade e mortalidade. Alterações cardíacas são reconhecidamente associadas à AF, como aumento cavitário, hipertensão arterial pulmonar e disfunção diastólica do ventrículo esquerdo. No entanto, ainda não existe consenso quanto à função sistólica ventricular nesses pacientes. O objetivo deste estudo foi o de investigar a função ventricular de pacientes com anemia falciforme utilizando o strain e o twist ventricular obtidos pelo speckle tracking bidimensional, e reconhecer os indivíduos sob maior risco cardiovascular, em que a instituição precoce de tratamento específico poderá beneficiar essa população. Métodos: Foram recrutados 40 pacientes com anemia falciforme (23,5 ± 9,3 anos; 24 homens) e 40 controles saudáveis pareados por sexo e idade, submetidos à entrevista estruturada, ecocardiograma transtorácico, cintilografia pulmonar ventilação perfusão e coleta de amostras de sangue. Todos os indivíduos foram submetidos à avaliação ecocardiográfica convencional padrão e subsequente avaliação offline do strain sistólico biventricular e estudo rotacional do ventrículo esquerdo utilizando speckle-tracking ecocardiográfico. Resultados: Os pacientes com AF apresentaram volume do VE indexado, massa do VE indexado, pressão arterial pulmonar e E/E\' médio superiores aos controles. As medidas de FE do VE, excursão sistólica do plano da tricúspide (TAPSE), Strain Global do VE (longitudinal, circunferencial, radial) e Strain Global do VD (longitudinal) não evidenciaram diferenças entre os grupos. Twist VE se mostrou reduzido em comparação aos controles (7,4 ± 1,2? vs 10,7 ± 1,8? , P <0,0001 ) e Tempo de pico de rotação apical prolongado (366,7 ± 26,1ms vs 344,6 ± 11,7ms , P <0,0001 ). Algumas variáveis se mostraram fortemente relacionadas ao twist VE, como índice de gravidade clínico (Rho= - 0,97, Z value= - 6,05, P < 0,0001), relação E/E\' médio (r = 0,94, F valor= 156.9, p<0,0001), IVDFVE (índice do volume diastólico final do ventrículo esquerdo)(r = 0,81 e p<0,0001) e pressão sistólica arterial pulmonar (r = 0,72 e p<0,0001). Conclusões: Os resultados deste trabalho indicam que o twist ventricular esquerdo derivado do speckle tracking bidimensional encontra-se alterado em pacientes com anemia falciforme e função sistólica ventricular preservada, avaliada pela metodologia convencional, e existe forte correlação entre o twist ventricular esquerdo e o índice clínico de gravidade, relação E/E\', índice do volume diastólico final do ventrículo esquerdo e pressão sistólica arterial pulmonar. / Background: Sickle cell disease (SCD) is the most prevalent hematological condition in the world, with sickle cell anemia (SCA) being its most serious form, displaying a high level of morbidity and mortality. Cardiac changes are known to be associated with SCA, including an increase in cardiac chamber size, pulmonary hypertension and left ventricle diastolic dysfunction. However, there is still no consensus regarding the ventricular systolic function in these patients. The purpose of this study is to investigate the ventricular function of patients with sickle cell anemia utilizing the strain and ventricular twist, obtained by two-dimensional speckle tracking, as well as to identify individuals with higher cardiovascular risk, in which early application of specific treatment could benefit this group of people. Methods: 40 patients were recruited with sickle cell anemia (ages 23.5 ± 9.3 years; 24 males) and 40 healthy control individuals paired by gender and age, submitted to structured interviews, transthoracic echocardiogram, pulmonary scintigraphy and collection of blood samples. All individuals were submitted to a standard echocardiographic evaluation and subsequent off line evaluation of the biventricular systolic strain and rotational study of the left ventricle using echocardiographic speckle-tracking. Results: Patients with SCA presented LV volume indices, LV mass Indices, pulmonary arterial pressure and E/ E\' ratios statistically higher than the control individuals. Measurements of Ejection Fraction (EF) of the left ventricle, tricuspid annular plane systolic excursion (TAPSE), Overall LV Strain (Longitudinal, Circumferential, and Radial) and Overall RV Strain (Longitudinal) did not present differences between the groups. LV twist was significantly lower in relation to the control group (7,4 ± 1,2? vs 10,7 ± 1,8? , P <0,0001 ) and prolonged time to peak apical rotation (366.7 ± 26.1ms vs 344.6 ± 11.7ms , P <0.0001 ). In addition, some variables showed themselves to be strongly related to LV twist such as the clinical severity index ( Rho= - 0.97, Z value= - 6.05, P < 0.0001), E/E\' Ratio (r = 0.94, F value=156.9 e p<0.0001) ), left ventricle end diastolic volume index (LVEDV index) (r = 0,81, p<0,0001) and pulmonary systolic arterial pressure (r = 0.72 e p<0.0001). Conclusions: The results of this study indicate that the left ventricular twist derived from two-dimensional speckle tracking is altered in patients with sickle cell anemia and a preserved ventricular systolic function, evaluated using conventional methodology and that there is a strong correlation between left ventricular twist and the clinical severity index, E/E\' ratio, left ventricle end diastolic volume index and the pulmonary systolic arterial pressure.

La drépanocytose est une hémoglobinopathie génétique ayant pour conséquences une anémie hémolytique chronique et sévère et des crises vaso-occlusives itératives. Cette pathologie s’accompagne également d’une intolérance à l’effort et d’altérations de la fonction et du tissu musculaire. Récemment, nous avons pu montrer, par une étude contrôlée et randomisée, l’innocuité et les bénéfices fonctionnels d’un programme d’entrainement en endurance, d’intensité modérée, chez des patients drépanocytaires. L’objectif de ce travail doctoral a été d’évaluer les effets de ce programme d’entrainement sur les caractéristiques musculaires de quarante patients drépanocytaires homozygotes. L’analyse des biopsies musculaires rapporte des adaptations tissulaires chez les patients entrainés, illustrées par une augmentation de la surface des myocytes, une amélioration de leur capacité oxydative, une augmentation du nombre de microvaisseaux sans modification de leur tortuosité, laissant supposer une meilleure oxygénation musculaire. L’excellente tolérance de ce mode d’entrainement semble reposer sur une plus faible mobilisation des voies anaérobies comme en témoigne la stabilité des activités enzymatiques associées à la glycolyse lactique et l’absence de modification du contenu musculaire des protéines impliquées dans la régulation du pH. Par ailleurs, cet entrainement n’a pas engendré de dégradation tissulaire notable. Ainsi, cet entrainement a non seulement apporté des bénéfices fonctionnels, mais également réduit les dysfonctionnements tissulaires musculaires. Cette thérapie par l’exercice peut donc être considéré comme une stratégie adjuvante prometteuse pour les patients drépanocytaires. / Sickle cell disease is a genetic hemoglobinopathy resulting in chronic and severe hemolytic anemia and iterative vaso-occlusive crisis. This pathology is also accompanied by exercise intolerance and alterations in muscle function and tissue. Recently, we demonstrated, through a randomized controlled study, the safety and functional benefits of a moderate-intensity endurance exercise training program in sickle cell disease patients. The objective of this doctoral work was to evaluate the effects of this training program on the muscle characteristics of forty homozygous sickle cell disease patients. The analysis of muscle biopsies reported tissue adaptations in trained patients, illustrated by an increase in the surface area of myocytes, an improvement in their oxidative capacity, an increase in the number of microvessels without modification of their tortuosity, suggesting a better muscle oxygenation. The excellent tolerance of this training mode seems to be based on a lower mobilization of the anaerobic pathways, as shown by the stability of the enzymatic activities associated with lactic glycolysis and the lack of any modification of the muscle protein content involved in pH regulation. Moreover, this training did not result in any significant tissue degradation. Thus, this training provided functional benefits, but also reduced muscle tissue dysfunctions. This exercise therapy can therefore be considered a promising adjuvant strategy for sickle cell disease patients.

Medicina da Universidade de São Paulo. Objetivo: Esse estudo foi desenvolvido para avaliar o impacto dos poluentes do ar na morbidade nas crianças e adolescentes portadoras de anemia falciforme. Métodos: Foram utilizadas as associações entre as concentrações diárias entre as concentrações dos poluentes do ar (PM10, SO2, NO2, CO, e O3) e os atendimentos no Pronto Socorro de anemia falciforme (CID 10 - D57) no período de setembro de 1999 até dezembro de 2004. Foi utilizado o desenho de case - crossover com dias de exposição de referencia escolhidos utilizando-se uma abordagem estratificada por tempo onde as exposições no dia índice foram comparadas a exposições com dias do mesmo mês com o mesmo valor de temperatura como o caso índice, controlando-se para o dia da semana. Estação do ano, clima e covariantes variáveis lentas foram controladas por pareamento. Também foram adotados modelos onde as exposições do caso índice foram comparadas às exposições para o mesmo dia da semana ou a cada três dias. Os efeitos estimados também foram estratificados para as duas causas principais de atendimento no pronto socorro de pacientes falciformes, dor e infecção respiratória. Resultados: As variações de interquartile aumentaram nas médias móveis de PM10 (25.9 mg/m3), NO2 (64.8 mg/m3), SO2 (8.1 mg/m3), CO (1.2 ppm), e O3 (57.23 mg/m3) foram associadas com aumento de 19.2% (95% CI: 11.2 - 27.8), 15.6% (95% CI: 6.3 - 25.8), 14.5% (95% CI: 6.6 - 23.0), 15,1% (95% CI: 7.7 -23.1), e 10% (95% CI: 1,3 - 18,6) nos atendimentos totais dos pacientes falciformes no pronto socorro, respectivamente. Na análise estratificada para dor, que é a manifestação cardinal dos processos de vaso-oclusão, os aumentos nos atendimentos dos pacientes falciformes com dor (23.1%, 95%CI: 11.0 - 36.5) devido a um aumento na variação interquartile da média móvel de 3 dias do PM10 foi 43% maior que nos pacientes falciformes sem dor. Conclusão: esse estudo mostra que o efeito da poluição do ar na saúde da população pediátrica não se restringe às doenças respiratórias. Também , entre os pacientes falciformes a manifestação principal dos efeitos adversos foi associada com o processo inflamatório dos vasos, reproduzindo resultados já observados entre pacientes adultos e idosos saudáveis e não saudáveis. Finalmente, esse estudo mostrou que os efeitos da poluição do ar na saúde ainda não esta definitivamente estimados e outros resultados serão observados em mais investigações. / Objective: This study was developed to assess the impact of air pollutants on sickle cell morbidity in children and adolescents. Methods we examined the associations between daily air pollutants concentrations (PM10, SO2, NO2, CO, and O3) and sickle cell (ICD10th revision: D57) emergency room visits, from September 1999 to December 2004. We applied a case-crossover design with referent exposure days chosen using the time-stratified approach such that exposures on the case day were compared to exposures on days of the same month with the same value of temperature as the case day, controlling for day of the week. Season, weather, and slowly varying covariates were controlled for by matching. We also adopted models where exposures on the case day were compared to exposures on the same day of the week or on every third day. Effects estimates were also stratified by the two main causes of sickle cell emergency room visits, pain and respiratory infections. Results: interquartile range increases of the 3-day moving averages of PM10 (25.9 mg/m3), NO2 (64.8 mg/m3), SO2 (8.1 mg/m3), CO (1.2 ppm), and O3 (57.23 mg/m3) were associated with increases of 19.2% (95% CI: 11.2 - 27.8), 15.6% (95% CI: 6.3 - 25.8), 14.5% (95% CI: 6.6 - 23.0), 15,1% (95% CI: 7.7 - 23.1), and 10% (95% CI: 1,3 - 18,6) in total sickle cell emergency room visits, respectively. When the analyses were stratified by pain, the main clinical manifestation of vase-occlusion process, increases in visits of sickle cell patients with pain (23.1%, 95%CI:11.0 -36.5) due to an interquartile range increase of the 3-day moving averages of PM10 were 43% higher than in sickle cell patients without pain. Conclusions: this study found that the effects of air pollutants on children\'s health are not limited to respiratory diseases. Also, among sickle cell patients, the main manifestation of adverse effect was associated with inflammatory process of vases, reproducing results already observed among healthy and non-healthy adults and elderly people. Finally, this study showed that the burden of air pollution on health has not been definitively estimated and other outcomes deserve further investigation.

Introdução - Alterações cardíacas na anemia falciforme (AF) são frequentes e iniciam-se precocemente. Há evidências de que exista também disfunção na regulação do sistema nervoso autônomo o que pode contribuir com eventos de morbidade. Objetivos Avaliar a modulação autonômica cardíaca por meio da variabilidade da frequência cardíaca em crianças e adolescentes com anemia falciforme. Método - Estudo analítico no qual foi realizada uma comparação da variabilidade da frequência cardíaca em 45 crianças e adolescentes, menores de 20 anos, com anemia falciforme, com um grupo controle pareado um a um por idade e sexo. A frequência cardíaca foi obtida pelo frequencímetro de pulso e analisada, batimento a batimento. Estes pacientes são usuários do ambulatório de hematologia pediátrica do Sistema Único de Saúde. Esta pesquisa está em consonância com a resolução 466/2012 do Ministério da Saúde. Resultados - Observamos diferença significativa nos índices do domínio da frequência (VLF, LF, HF e LF/HF). Estas diferenças não foram observadas nos pacientes em uso de hidroxiureia. Conclusão - Existe uma disfunção autonômica na AF que ocorre desde a infância, podendo estar relacionada a uma menor modulação do simpático e uma maior modulação do parassimpático. Esta diferença não foi observada em pacientes em uso de hidroxiureia / Introduction - Cardiac changes in sickle cell disease (AF) are frequent and begin early. There is evidence that there is also dysfunction in the regulation of the autonomic nervous system, which may contribute to morbidity events. Objectives - To evaluate the autonomic cardiac modulation by heart rate variability in children and adolescents with sickle cell anemia. Method - An analytical study comparing the heart rate variability of 45 children and adolescents, younger than 20 years, with sickle cell anemia, with a control group matched one by one by age and sex. The heart rate was obtained by pulse frequency and analyzed, beat by beat. These patients are attending the pediatric hematology outpatient of the National Health System. Results - We observed a significant difference in the frequency domain indexes (VLF, LF, HF and LF / HF). The results of this study are in agreement with resolution 466/2012 of the Ministry of Health of Brazil. These differences were not observed in patients taking hydroxyurea. Conclusion - There is an autonomic dysfunction in AF that occurs from childhood, and may be related to a lower modulation of the sympathetic and greater modulation of the parasympathetic. This difference was not observed in patients taking hydroxyurea

Thèse numérisée par la Division de la gestion de documents et des archives de l'Université de Montréal

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Made available in DSpace on 2011-05-04T12:36:19Z (GMT). No. of bitstreams: 0 Previous issue date: 2009 / A Política Nacional de Atenção Integral às Pessoas com Doença Falciforme e outras Hemoglobinopatias afirmou o compromisso público para a proteção àsaúde aos portadores destas doenças e a garantia dos direitos sociais dos pacientes a todos os níveis de assistência existentes no sistema público de saúde do Brasil, o Sistema Único de Saúde (SUS): níveis primário, secundário e terciário. No Estado do Rio de Janeiro propôs-se uma rede assistencial descentralizada para os municípios estruturada em unidades de atenção básica, que devem acompanhar e tratar os pacientes avaliados como de baixa complexidade e inseri-los nas atividades deste nível de atenção, que abrangem a promoção, proteção e manutenção da saúde, a prevenção deagravos, o diagnóstico, o tratamento e a reabilitação, através de ações nas esferas individual e coletiva. Procuramos avaliar a Política de Atenção Integral à Pessoa com Doença Falciforme no Estado do Rio de Janeiro com foco na descentralização dos pacientes diagnosticados pela triagem neonatal. Analisamos documentos disponíveis, como cadastros, portarias e resoluções do SUS referentes à doença falciforme e aplicamos questionário de avaliação em 27 médicos participantes da implementação da política. As fragilidades encontradas nos ambulatórios de doença falciforme e no sistema de saúde fazem com que neles se reproduza o modelo médico hegemônico, centrado na consulta médica. As dificuldades de articulação das unidades básicas com os níveis intermediários de atenção e o marcante papel desempenhado pelo Hemorio (hemocentro do Estado do Rio de Janeiro) como coordenador da Hemorrede e prestador de assistência na alta complexidade faz com que se invertam os papéis e que uma unidade terciária seja o nível onde se estabeleçaa linha de cuidado de pacientes com doença falciforme. / The Brazilian National Policy for Comprehensive Care of Persons with Sickle Cell Disease and Other Hemoglobinopathies is committed to providing the population afflicted with these diseases with medical assistence in different levels according to their needs. The State of Rio de Janeiro has established a decentralized network for such population based on municipal units of health care that are responsible for the identification, the basic treatment and the follow-up of patients classified in "low complexity" category. These units are also responsible for providing the patients and/or their families with the health education necessary at this level. This study attempts at evaluating the aforementioned policy in the State of Rio de Janeiro focusing on the health care, in these basic units, of patients diagnosed by neonatal screening according to what has been established in the documents of the Brazilian Unified Health System (Sistema Único de Saúde - SUS). A questionnary was developed and applied to 27 doctors who are implementing this policy at the local level, and the results indicate that structural problems in these units and in the health system make them tend to reproduce the traditional health care model based almost exclusively on medical care. Furthermore, there is poor articulation between the basic and the intermediary levels. The Hemorio, as coordinator of the network of hematology, and responsible for high complexity assistance of patients with such diseases is overwhelmed with work that should be done at the basic level.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:05:56Z (GMT). No. of bitstreams: 1 4310.pdf: 3265738 bytes, checksum: 6650fb70eee9b096860bcac6b5ed596c (MD5) Previous issue date: 2012-02-24 / Currently in the medical field there is a large amount of unstructured information (i.e., in textual format). Regarding the large volume of data, it makes it impossible for doctors and specialists to analyze manually all the relevant literature, which requires techniques for automatically analyze the documents. In order to identify relevant information, as well as to structure and store them into a database and to enable future discovery of significant relationships, in this paper we propose a paragraph-based process to extract treatments from scientific papers in the biomedical domain. The hypothesis is that the initial search for sentences that have terms of complication improves the identification and extraction of terms of treatment. This happens because treatments mainly occur in the same sentence of a complication, or in nearby sentences in the same paragraph. Our methodology employs three approaches for information extraction: machine learning-based approach, for classifying sentences of interest that will have terms to be extracted; dictionary-based approach, which uses terms validated by an expert in the field; and rule-based approach. The methodology was validated as proof of concept, using papers from the biomedical domain, specifically, papers related to Sickle Cell Anemia disease. The proof of concept was performed in the classification of sentences and identification of relevant terms. The value obtained in the classification accuracy of sentences was 79% for the classifier of complication and 71% for the classifier of treatment. These values are consistent with the results obtained from the combination of the machine learning algorithm Support Vector Machine with the filter Noise Removal and Balancing of Classes. In the identification of relevant terms, the results of our methodology showed higher F-measure percentage (42%) compared to the manual classification (31%) and to the partial process, i.e., without using the classifier of complication (36%). Even with low percentage of recall, there was no impact observed on the extraction process, and, in addition, we were able to validate the hypothesis considered in this work. In other words, it was possible to obtain 100% of recall for different terms, thus not impacting the extraction process, and further the working hypothesis of this study was proven. / Atualmente na área médica existe uma grande quantidade de informações não estruturadas (i.e., em formato textual) sendo produzidas na literatura médica. Com o grande volume de dados, torna-se impossível que os médicos e especialistas da área analisem toda a literatura de forma manual, exigindo técnicas para automatizar a análise destes documentos. Com o intuito de identificar as informações relevantes, estruturar e armazenar estas informações em um banco de dados, para posteriormente identificar relacionamentos interessantes entre as informações extraídas, nesta dissertação é proposto um processo baseado em parágrafos para a extração de tratamentos de artigos científicos do domínio biomédico. A hipótese é que a busca inicial de sentenças que possuem termos de complicação melhora a eficiência na identificação e na extração de termos de tratamento. Isso acontece porque tratamentos ocorrem principalmente na mesma sentença de complicação ou em sentenças próximas no mesmo parágrafo. Esta metodologia utiliza três abordagens de extração de informação encontradas na literatura: abordagem baseada em aprendizado de máquina para classificar as sentenças de interesse; abordagem baseada em dicionário com termos validados pelo especialista da área e abordagem baseada em regras. A metodologia foi validada como prova de conceito, utilizando artigos do domínio biomédico, mais especificamente da doença Anemia Falciforme. A prova de conceito foi realizada na classificação de sentenças e identificação de termos relevantes. O valor da acurácia obtida na classificação de sentenças foi de 79% para o classificador de complicação e 71% para o classificador de tratamento. Estes valores condizem com os resultados obtidos com a combinação do algoritmo de aprendizado de máquina Support Vector Machine juntamente com a aplicação do filtro Remoção de Ruído e Balanceamento das Classes. Na identificação de termos relevantes, os resultados da metodologia proposta obteve percentual superior de 42% de medida-F comparado à classificação manual (31%) e comparado ao processo parcial, ou seja, sem utilizar o classificador de complicação (36%). Mesmo com a baixa revocação, foi possível obter 100% de revocação para os termos distintos de tratamento, não impactando o processo de extração, e portanto a hipótese considerada neste trabalho foi comprovada.

Made available in DSpace on 2016-06-02T19:06:20Z (GMT). No. of bitstreams: 1 6477.pdf: 3193803 bytes, checksum: 2bf85c80b2865f8b7efd9d6eeb6aa172 (MD5) Previous issue date: 2013-11-28 / Financiadora de Estudos e Projetos / Recently, there is an enormous amount of scientific material written in textual format and published in electronic ways (paper on proceedings and articles on journals). In the biomedical field, researchers need to analyse a vast amount of information in order to update their knowledges, in order to get more precise diagnostics and propose more modern and effective treatments. The task of getting knowledge is extremely onerous and the manual process to annotate relationships and to propose novel hypothesis for treatments becomes very slow and error-prone. In this sense, as a result of this master s research it is proposed a method to extract cause and effect semantic relationships in sentences of scientific papers of the biomedical domain. The goal of this work is to propose and implements a solution for: (1) to extract terms from the biomedical domain (genes, proteins, chemical components, structures and anatomical processes, cell components and strutures, and treatmens), (2) to identify existing relationships on the texts, from the extracted terms, and (3) to suggest a knowledge network based on the relations of cause and effect . Over the approach using textual patterns, our proposed method had extracted semantic relations with a precision of 94,83 %, recall of 98,10 %, F-measure of 96,43 %. / Atualmente, existe uma enorme quantidade de material científico escrito em formato textual e publicado em meios eletrônicos (artigos em anais de eventos e periódicos). Na área biomédica, pesquisadores necessitam assimilar uma grande parte deste conteúdo com a finalidade de se atualizarem e, por conseguinte realizarem diagnosticos mais precisos e aplicar tratamentos mais modernos e eficazes. A tarefa de obtenção de conhecimento é bastante onerosa e o processo manual para anotar relacionamentos e propor novas hipóteses de tratamentos torna-se muito lento. Neste sentido, como resultado desta pesquisa de mestrado, foi proposto um método para a extração de relacionamentos semânticos do tipo causa e efeito em artigos científicos do domínio biomédico. Mais especificamente, o objetivo deste trabalho é propor e implementar uma solução para (1) extrair termos do domínio biomédico de documentos científicos (genes, componentes químicos, proteínas, estruturas e processos anatômicos, componentes e estruturas celulares e tratamentos), (2) identificar relacionamentos existentes nos textos, com base nos termos extraídos, e (3) sugerir uma rede de conhecimento baseada nos relacionamentos extraídos. Através de uma abordagem utilizando regras e padrões textuais, o método proposto extraiu relacionamentos semânticos com uma precisão de 94,83 %, cobertura de 98,10 % e Medida-F de 96,43 %.