Submitted by LISIERY NEGRINI PAIATTO null (lisy_paiatto@hotmail.com) on 2017-10-23T19:38:26Z No. of bitstreams: 1 DISSERTAÇÃO LISIERY NEGRINI PAIATTO.pdf: 2873819 bytes, checksum: 5b03d17f06d1cc030a85241da7535ae7 (MD5) / Approved for entry into archive by Luiz Galeffi (luizgaleffi@gmail.com) on 2017-10-26T12:04:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 paiatto_ln_me_rcla.pdf: 2873819 bytes, checksum: 5b03d17f06d1cc030a85241da7535ae7 (MD5) / Made available in DSpace on 2017-10-26T12:04:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 paiatto_ln_me_rcla.pdf: 2873819 bytes, checksum: 5b03d17f06d1cc030a85241da7535ae7 (MD5) Previous issue date: 2017-08-31 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES) / Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP) / A quebra da tolerância imunológica a antígenos próprios é um mecanismo gerador comum às respostas imunes deletérias. Várias estratégias têm sido propostas para modular respostas autoimunes, entre as quais se destacam a administração oral de antígenos relacionados à doença, a transferência adotiva de células tolerogênicas e/ou o tratamento com citocinas reguladoras. Nesse contexto, tem sido mostrado que a ingestão de antígenos proteicos presentes na dieta pode gerar efeitos indiretos sobre o sistema imune do hospedeiro, caracterizados pela supressão da resposta imune a proteínas antigenicamente não relacionadas, conhecidos como supressão bystander. O presente projeto teve por objetivo analisar os efeitos indiretos da tolerância oral induzida pela ingestão de ovalbumina (OVA) e a transferência adotiva de células dendríticas isoladas de animais tolerantes a OVA (tDC) na colite induzida por TNBS em camundongos. Os resultados mostraram que o tratamento de camundongos com OVA por via oral, antes ou após a indução da colite e a transferência adotiva de tDC, foram capazes de reduzir sinais da doença, tais como a perda de peso, bem como preservar parcialmente a integridade do tecido colônico, quando comparados aos animais colíticos não tratados com OVA (controles). A supressão bystander relacionada ao consumo de OVA foi associada à expansão da frequência de células T reguladoras (regs) e de células T secretoras de interleucina (IL) -10, possíveis mecanismos de regulação das manifestações clínicas da colite induzida por TNBS. As DC obtidas de animais tolerantes a OVA apresentaram expressão aumentada de CD80, compatível com perfil tolerogênico. A transferência dessa população de células para animais colíticos foi capaz de reduzir os sinais clínicos e histológicos da colite, mimetizando os efeitos da tolerância oral. A transferência adotiva de tDC levou a redução da frequência de células Th17, redução de secreção de IL-17 e IL-9 e aumento de secreção de IL-10 e IL-4 in vitro. Até onde é de nosso conhecimento, não existem dados na literatura mostrando o efeito da tolerância oral e a transferência adotiva de tDC no tratamento de colite. / The breakdown of immune tolerance to self antigens is a common mechanism for deleterious immune responses. Several interventions have been proposed to modulate autoimmune responses, such as oral administration of disease-related antigens, adoptive transfer of tolerogenic cells and/or treatment with regulatory cytokines. In this context, it has been demonstrated that the ingestion of protein antigens can generate indirect effects on the immune system of the host, characterized by suppression of the immune response to antigenically unrelated proteins, known as bystander suppression. The present project aims to analyze the indirect effects of oral tolerance induced by ovalbumin (OVA) and by adoptive transfer of tolerant dendritic cells (tDC) in TNBS induced colitis in mice. Our results showed that the treatment of oral OVA mice before or after induction of colitis and the adductive transfer of tDC were able to reduce the signs of the disease, such as weight loss, as well as partially preserve the integrity of the Compared to non-OVA treated animals (controls). The bystander suppression related to OVA consumption appears to favor the expansion of regulatory (regs) T and interleukin (IL)-10 secreting T cells responsible for reducing the clinical manifestations of TNBS-induced colitis. On the other hand, DC obtained from OVA-tolerant animals showed increased expression of CD80. Administration of this cells population to colitic animals was able to reduce the clinical and histological signs of colitis, possibly by reducing Th17 cells, reduction of secretion of Il-17 and IL-9 and augment of IL-10 and IL-4. To the best of our knowledge, there are no data in the literature showing the effect of oral tolerance and the adoptive transfer of tDC in the treatment of colitis. / FAPESP: 2013/20258-2

Submitted by (lucia.rodrigues@ufrpe.br) on 2016-08-25T14:43:48Z No. of bitstreams: 1 Hugo Henrique Costa do Nascimento.pdf: 3926222 bytes, checksum: ff626f3f3693af25b6e00e1333bd2dec (MD5) / Made available in DSpace on 2016-08-25T14:43:48Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Hugo Henrique Costa do Nascimento.pdf: 3926222 bytes, checksum: ff626f3f3693af25b6e00e1333bd2dec (MD5) Previous issue date: 2013-02-27 / Among the tree species native to Brasil, the jatoba (Hymenaea courbaril L.) has been the subject of several studies addressing its potential in carbon sequestration, as well as restoration of degraded environments. However, the physiological responses on the water stress, salinity and nutritional plants jatoba are practically unknown. In order to clarify some of the relationships between these processes, the present study aimed to evaluate the effects of suppression water, salinity and omission of N, P and K in the physiological behavior of seedlings jatoba. To conduct this work were conducted three experiments in the greenhouse of the Laboratory of Plant Physiology, Department of Biology, Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife, Brazil. Therefore, the plants were propagated from seeds collected in two regions of occurrence of the species, in the Pernambuco State. The first trial addressed the effects of water stress by suppressing irrigation and later irrigation, while for the evaluation of salt stress, we conducted a test checking the deleterious effects of the incremental addition of NaCl (0, 50 and 100 mM), hydroponically, and finally the effects of omission of N, P and K were evaluated in the third trial. In all experiments, the parameters were evaluated for growth, gas exchange, water relations, photosynthetic pigments, quantum efficiency of photosystem II and biochemical aspects by quantification of compatible solutes. The results of this study infers that jatoba seedlings have a tendency to accumulation of photosynthetic pigments and organic solutes, mainly proline as the main features of coping suppression watering. Fact allowing rapid reestablishment of their metabolism after rehydration in the early stage of development. Another fact that should be emphasized is that there is evidence that they bear up to 12 days of drought without compromising your metabolism. Information that may be useful to reforestation programs and producing seedlings of the species. Regarding the behavior versus salinity, it is concluded that the jatobá plants osmotically adjusted, once accumulated organic solutes that promote the increase of leaf turgidity, resulting in the continued growth and stabilization of gas exchange, even after subjection to stress severe salt (100 mM). Among the variables is recommended to evaluate the levels of chloride, sodium and potassium in the leaves, stems and roots for the characterization of the state of tolerance to salinity changes of jatoba. Regarding the behavior of seedlings by omission of N, P and K was observed that N was the most limiting macronutrient development of jatoba plants, suggesting that the nutritional requirement regarding macronutrients of that species obeying the order of decreasing N> P> K. It is hoped that the results obtained in this study may elucidate the main mechanisms used by jatobá to tolerate abiotic stresses and that information is useful for establishing adequate management exploitation of the species, since the ease of obtaining seedlings and its occurrence in areas prone to various environmental stresses, enhance its use in the processes of reclamation and / or reforestation. / Dentre as espécies arbóreas nativas do Brasil, o jatobá (Hymenaea courbaril L.) tem sido alvo de diversos estudos abordando sua potencialidade na fixação de carbono, bem como na recuperação de ambientes degradados. No entanto, as respostas fisiológicas ante os estresses hídrico, salino e nutricional em plantas de jatobá ainda apresentam lacunas a serem esclarecidas. Visando elucidar algumas desses pontos, o presente estudo objetivou avaliar os efeitos da supressão hídrica, salinidade e omissão de N, P e K no comportamento fisiológico de mudas de jatobá. Para a realização desse trabalho foram conduzidos três ensaios em casa de vegetação do Laboratório de Fisiologia Vegetal do Departamento de Biologia da Universidade Federal Rural de Pernambuco, Recife, Brasil. Para a montagem dos experimentos foram utilizadas as mudas obtidas de sementes colhidas em duas regiões de ocorrência da espécie, situadas no Agreste pernambucano. No primeiro ensaio foram avaliados os efeitos do estresse hídrico por meio da supressão de rega e posterior reirrigação; já para a análise do comportamento das mudas sob estresse salino, conduziu-se um ensaio verificando os efeitos deletérios da adição crescente de NaCl (0, 50 e 100 mM), em sistema hidropônico; por fim, os efeitos da omissão de N, P e K foram avaliados no terceiro ensaio. Em todos os experimentos, foram avaliados as variáveis de crescimento, trocas gasosas, relações hídricas, pigmentos fotossintéticos, eficiência quântica do fotossistema II e aspectos bioquímicos pela quantificação de solutos compatíveis. Os resultados desta pesquisa permitem inferir que mudas de jatobá acumulam pigmentos fotossintéticos e solutos orgânicos, principalmente a prolina, como as principais características de enfrentamento a supressão de rega. Fatos que possibilitam um rápido reestabelecimento de seu metabolismo após a reidratação na fase inicial do desenvolvimento. Outro fato que merece ser destacado é que há indícios de que as mesmas suportem até 12 dias de estiagem sem comprometer seu metabolismo. Informação que pode ser útil a programas de reflorestamento e produtores de mudas da referida espécie. Quanto ao comportamento ante a salinidade, conclui-se que as plantas de jatobá se ajustaram osmoticamente, uma vez que acumularam solutos orgânicos que promoveram a elevação da turgescência foliar, resultando na continuidade do crescimento e estabilização das trocas gasosas, mesmo após submissão a um estresse salino severo (100 mM). Dentre as variáveis estudadas recomenda-se a avaliação dos teores de cloreto, sódio e potássio nas folhas, caules e raízes para a caracterização do estado de tolerância de mudas de jatobá à salinidade. Em relação ao comportamento das mudas mediante omissão de N, P e K observou-se que o N foi o macronutriente mais limitante ao desenvolvimento de plantas de jatobá, sugerindo que o requerimento nutricional quanto aos macronutrientes da referida espécie obedeça à ordem decrescente de N>P>K. Os resultados obtidos nesta pesquisa indicam os principais mecanismos utilizados pelo jatobá para tolerar estresses abióticos. Essas Informações podem ser úteis para o estabelecimento de um manejo adequado à exploração da espécie, uma vez que a facilidade de obtenção de mudas aliada a ocorrência em áreas propensas a estresses ambientais diversos, potencializam a utilização do jatobá nos processos de recuperação de áreas degradadas e/ou reflorestamentos.

Submitted by Fabio Sobreira Campos da Costa (fabio.sobreira@ufpe.br) on 2017-04-24T14:27:21Z No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE__DIOGO_CAVALCANTI_COSTA.pdf: 8696014 bytes, checksum: 6ecb7de16968f61db789940caeae149e (MD5) / Made available in DSpace on 2017-04-24T14:27:21Z (GMT). No. of bitstreams: 2 license_rdf: 1232 bytes, checksum: 66e71c371cc565284e70f40736c94386 (MD5) TESE__DIOGO_CAVALCANTI_COSTA.pdf: 8696014 bytes, checksum: 6ecb7de16968f61db789940caeae149e (MD5) Previous issue date: 2015-03-02 / CNPQ / Desde os anos 1960, foram criadas inúmeras técnicas para segmentação de imagens, contudo poucas se aproximam do nível de desempenho humano, sendo essas computacionalmente custosas e inadequadas para aplicação em tempo real. Portanto, nesta tese é apresentada uma técnica de segmentação de baixo custo computacional, baseada em descontinuidades e em multirresolução, voltada à detecção de contornos de objetos em imagens naturais – fotografias do mundo real. A estrutura da técnica proposta é dividida em cinco etapas. Na primeira, atributos de cor e foco são realçados na imagem de entrada. O mapeamento de cor realça as diferenças de cor entre os canais RGB e propicia a detecção de bordas entre os canais de cor por operadores de gradiente. Dois modelos de cor de diferença cromática, RhGhBh e LgC, são propostos para esse fim. Também é proposta a transformada de decomposição de cor que segmenta a escala de cor RGB em canais independentes, isolando as cores aditivas e subtrativas, e os tons de cinza. Assim, é possível mensurar a variação local de cada cor para criar um mapeamento das regiões em foco. Na segunda etapa, uma filtragem morfológica para supressão de texturas suaviza as mudanças abruptas de cor no interior das mesmas, possibilitando a identificação de seus contornos e diminuindo a falsa identificação de bordas internas. Na terceira etapa, oito máscaras orientadas, batizadas de máscaras de detecção de contornos, são usadas para calcular o gradiente local, realçando os contornos dos objetos em detrimento de suas bordas internas. Na quarta etapa, um afinamento em tons de cinza é realizado por meio de um empilhamento topológico das bordas erodidas e suavizadas, no qual os pixels de bordas maximamente centralizados são isolados e afinados morfologicamente. Por fim, na quinta etapa, a intensidade das bordas é corrigida função do gradiente local e da densidade local das bordas, realçando os contornos dos objetos. Comparações com técnicas de segmentação recentes e clássicas são conduzidas com auxílio do Berkeley Segmentation Dataset and Benchmark. Os resultados obtidos posicionam a técnica proposta em quinto lugar no Benchmark, com tempo de processamento inferior a 0,5% do tempo das técnicas melhor classificadas, sendo adequada para uso em tempo real. / Since the 1960’s, numerous image segmentation techniques were developed, however only a few approach human level segmentation, being computationally costly and inadequate to real time applications. Therefore, this Thesis presents a low computational cost multi-resolution and edge-based image segmentation technique for objects’ contour detection in natural images – real world scenes photographs. The proposed technique’s framework is divided into five steps. First, color and focus features are mapped from the input image. The color mapping enhances the color differences between RGB channels, allowing the inter-channel colors edge detection by gradient operators. Two chromatic difference color models are proposed, RhGhBh and LgC. The color decomposition transform is also proposed, which is able to segment the RGB color scale in independent channels, isolating the additive and subtractive colors, and the shades of gray. The transform allows the measurement of the local variation within each color, thus, producing the image´s focus map. In the second step, a morphological texture suppression filtering smoothes abrupt color changes inside textures, allowing textures’ outer edges detection and decreasing the false identification of texture inner edges as objects’ contours. In the third step, eight oriented masks, called contour detection masks, are used to calculate the local gradient, enhancing the objects’ contours over their inner edges. In the fourth step, a grayscale thinning is performed through a topological stacking of eroded and smoothed edges, where the maximally centered edge pixels are isolated and morphologically thinned. Finally, in the fifth step, the edges’ intensities are corrected to reflect the local gradient and the local edges’ density, allowing better identification of objects’ contours. Comparisons with recent and classic segmentation techniques are conducted by the Berkeley Segmentation Dataset and Benchmark. The results rank the proposed segmentation in fith position in the Benchmark, with a processing time below 0.5% of the better ranked techniques, being suitable for real-time applications.

Made available in DSpace on 2014-08-20T13:44:26Z (GMT). No. of bitstreams: 1 dissertacao_helen_claudine_saliba_rodrigues.pdf: 1023984 bytes, checksum: 108e9fceec945fa268f473cea166dd99 (MD5) Previous issue date: 2011-03-28 / The study aimed to evaluate the cold tolerance of four rice cultivars under stress conditions (13-18°C) in stages S0-V3 and check the season effect of irrigation suppression on the quality of rice seeds from the cultivars BRS Atalanta, BRS Querência and BRS 7 Taim. The study consisted on two experiments performed independently. In the first experiment, it was evaluated the cold tolerance of seeds of the cultivars Brilhante, BRS SCS Tio Taka, BRS Querência and BRS7 Taim under stress conditions (13-18°C) during early development (S0-S3). The evaluative parameters were: speed index of total emergence, speed index of emergence of the stage V1, V2 and V3, index of cold tolerance (ICT), index of susceptibility to cold (ISC), index of cold intensity (ICI), geometric average (GA), chlorophyll content (CC) and seedling length (SL). The Brilhante cultivar showed tolerance to the temperature of 13-18°C, measured by the speed index of total emergence, speed index of vegetative stages, tolerance index, geometric average, chlorophyll content and seedling length at the initial development. In the second experiment, it was used seeds from the cultivars BRS Atalanta, BRS Querência and BRS 7 Taim and it was conducted in two stages. In the first stage, it was made the irrigation suppression in four seasons: Season 1: stage of panicle exsertion (R3) Season 2: stage of milky grain (R6) Season 3: stage of pasty grain (R7), and Season 4: physiological maturity (R9). In the second stage, it was performed the analysis of seed quality harvested for each treatment, through the germination test, cold test, accelerated aging, electrical conductivity, weight of a thousand seeds and seed health. It was not possible to assess the season of irrigation suppression, in the stages of panicle exsertion, milky grain, pasty grain and physiological maturity due to the high rainfall occurred throughout the reproductive phase of rice seeds of the three cultivars evaluated. The high rainfall combined with high temperature were the main factors that favored the incidence of fungus from the genus Aspergillus sp., Penicillium sp., Fusarium sp., and Bipolaris sp. on the seeds of the cultivars in study. / O trabalho objetivou avaliar a tolerância ao frio de quatro cultivares de arroz sob condições de estresse (13-18ºC) nos estádios S0-V3 e verificar o efeito da época da supressão da irrigação na qualidade das sementes de arroz das cultivares BRS Atalanta, BRS Querência e BRS 7 Taim. O estudo constitui-se de dois experimentos realizados independentemente. No primeiro experimento, avaliou-se a tolerância ao frio das sementes das cultivares Brilhante, BRS SCS Tio Taka, BRS Querência e BRS7 Taim em condições estresse (13-18ºC) durante o desenvolvimento inicial (S0-V3). Os parâmetros avaliativos utilizados foram: índice de velocidade de emergência total, índice de velocidade de emergência do estádio V1, V2 e V3, índice de tolerância ao frio (ITF), índice de suscetibilidade ao frio (ISF), índice de intensidade ao frio (IIT), média geométrica (MG), teor de clorofila (TC) e comprimento de plântula (CP). A cultivar Brilhante apresentou tolerância à temperatura 13-18°C, avaliado pelo índice de velocidade de emergência total, índice de velocidade dos estádios vegetativos, índice de tolerância, média geométrica, teor de clorofila e comprimento de plântula no desenvolvimento inicial. No segundo experimento, utilizou-se sementes das cultivares BRS Atalanta, BRS Querência e BRS 7 Taim e foi realizado em duas etapas. Na primeira etapa, realizou-se a supressão da irrigação em quatro épocas: Época 1: estádio de exerção da panícula (R3); Época 2: estádio de grão leitoso (R6); Época 3: estádio de grão pastoso (R7) e, Época 4: maturidade fisiológica (R9). Na segunda etapa, efetuaram-se as análises de qualidade das sementes colhidas para cada tratamento, através dos testes de germinação, frio, envelhecimento acelerado, condutividade elétrica, peso de mil sementes e sanidade. Não foi possível avaliar a época da supressão da irrigação, nos estádios de exerção da panícula, grão leitoso, grão pastoso e maturidade fisiológica em função da elevada precipitação pluvial ocorrida durante toda a fase reprodutiva das sementes de arroz das três cultivares avaliadas. A elevada precipitação pluvial aliada à alta temperatura foram os principais fatores que favoreceram a incidência dos fungos dos gêneros Aspergillus sp., Penicillium sp., Fusarium sp., e Bipolaris sp. sobre as sementes das cultivares em estudo.

The present paper studied the floristic composition, structure and volume of a forest with an area of 120.2 hectares, called Forest Secret Massif, located in the village of Figueira, Segredo s city, Rio Grande do Sul, in order to create the VCA indicator (expanded margin call), RNR indicator (natural regeneration relative) and IRF indicator (forest resilience rating) to describe the representativeness of species in the forest. Also evaluated the phenotypic aspects of the trees and the related of competition at the trees in order to propose a forest restructuring plan by removing mature trees and regenerating trees in order to improve the conditions of the forest and noble species. The three indicators, on a percentage scale, presented able to describe the representation of mature species (VCA), the regenerating species (RNR) and both the forest formation (IRF), which allowed understand the current situation of each species and will understand the changes that may be manifested in the implementation of management plans, obtaining a history. The restructuring plan has listed 13,139 mother trees, 31,820 normal trees and 10,210 trees subject to deletion (group 1), 2.095 noble trees (group 2), 2776 bagueiras (group 3), 4,538 important trees for the forest ecology maintenance (group 4) ; and 24,454 individuals subject to removal for strategic reasons, except the 7,365 needed to stand on environmental issues (group 5). The regenerating forest comes up with 18,430 trees future level 1, 56 415 trees future level 2 and 17,107 trees future level 3. / O presente trabalho estudou a composição florística, estrutural e volumétrica de uma floresta com área de 120,2 hectares, denominada de Maciço Florestal Segredo, situado na localidade de Figueira, no município de Segredo, Rio Grande do Sul, com o objetivo de criar o indicador (valor de cobertura ampliado), (regeneração natural relativa) e (índice de resiliência florestal) para descrever a representatividade das espécies na floresta. Também se avaliou os aspectos fenotípicos e relacionados à competição das árvores com o objetivo de propor um plano de reestruturação florestal por meio da supressão de árvores maduras e de regenerantes, a fim de melhorar as condições da floresta e de espécies nobres. Os três indicadores, em uma escala percentual, se apresentaram capazes de descrever a representatividade das espécies maduras ( ), das espécies regenerantes ( ) e de ambas na formação da floresta ( ), o que permitiu entender a atual situação de cada espécie e permitirá entender as alterações que poderão se manifestar com a aplicação de planos de manejo, obtendo-se um histórico. O plano de reestruturação elencou 13.139 árvores matrizes, 31.820 árvores normais e 10.210 árvores passíveis de supressão (grupo 1), 2.095 árvores nobres (grupo 2), 2.776 bagueiras (grupo 3), 4.538 árvores importantes para manutenção da ecologia florestal (grupo 4); e 24.454 indivíduos passíveis a supressão por motivos estratégicos, salvo os 7.365 necessários a se manter por questões ambientais (grupo 5). A floresta regenerante surge com 18.430 árvores futuro nível 1, 56.415 árvores futuro nível 2 e em 17.107 árvores futuro nível 3.

O agente etiológico da Febre Maculosa das Montanhas Rochosas (RMSF), conhecida no Brasil como Febre Maculosa Brasileira, é a bactéria Rickettsia rickettsii. Essa bactéria é transmitida ao homem pela picada de diferentes espécies de carrapatos ixodídeos. No Brasil, os vetores são Amblyomma cajennense e A. aureolatum. As taxas de prevalência de R. rickettsii nas populações de carrapatos de áreas endêmicas para RMSF são baixas, em geral abaixo de 1%. Essa baixa prevalência parece estar associada a menores taxas reprodutivas e de sobrevivência de linhagens infectadas, sugerindo que R. rickettsii seja patogênica também para os seus vetores. Infecções experimentais demonstraram que 80-100% dos indivíduos de uma colônia de A. aureolatum mantida em laboratório são infectados por R. rickettsii, enquanto apenas 10-60% de A. cajennense adquirem a bactéria. Esses dados indicam que as respostas dessas duas espécies de carrapatos à infecção sejam diferentes, resultando em diferentes taxas de prevalência da bactéria. Dessa maneira, a caracterização molecular das interações entre carrapatos do gênero Amblyomma e a bactéria R. rickettsii é importante, podendo gerar informações não somente para o esclarecimento acerca dos mecanismos de patogenicidade de R. rickettsii para os carrapatos, mas também para um melhor entendimento dos mecanismos responsáveis pela aparente restringência de A. cajennense à infecção. Assim, os objetivos do presente estudo foram: (i) analisar os efeitos da infecção por R. rickettsii sobre o perfil de expressão gênica de carrapatos A. cajennense por hibridação subtrativa por supressão (SSH), (ii) validar os dados de SSH por reação em cadeia de polimerase quantitativa precedida por transcrição reversa (RT-qPCR) e (iii) caracterizar funcionalmente dois genes com expressão induzida pela infecção por RNA de interferência (RNAi). Após a análise bioinformática dos dados de SSH, 44 sequências únicas foram obtidas, das quais 36 representam genes com expressão induzida e 8 genes com expressão reprimida pela infecção. A indução dos genes codificadores da subunidade I da citocromo c oxidase (COX1), da subunidade IV da NADH desidrogenase, de uma proteína com domínio de inibidor de serina-proteases Kunitz-type (papilina-like), identificados por SSH, e de um peptídeo antimicrobiano (hebraeína), foi confirmada por RT-qPCR. O silenciamento gênico da hebraeína e da papilina-like não teve nenhum efeito na aquisição de R. rickettsii pelo vetor, indicando que, isoladamente, não são responsáveis pela proteção de A. cajennense contra a infecção. Os dados gerados pelo presente estudo abrem perspectivas para que outros genes sejam avaliados quanto ao seu papel na aquisição de R. rickettsii, os quais, no futuro, podem ser considerados como alvos para o desenvolvimento de vacinas. / The etiologic agent of the Rocky Mountain Spotted Fever (RMSF), also known as Brazilian Spotted Fever in Brazil, is the bacterium Rickettsia rickettsii. This rickettsia is transmitted to humans by the bite of various tick species. In Brazil, Amblyomma cajennense and A. aureolatum are known as vectors. The prevalence rates of R. rickettsii infected ticks in RMSF endemic areas are low, oscillating around 1%. These low prevalence rates seems to be associated with lower reproductive and survival rates of infected ticks, suggesting that R. rickettsii is also pathogenic to its vectors. Experimental infections with R. rickettsii have demonstrated that 80 to 100% of A. aureolatum ticks from a laboratory colony acquire this bacterium, whereas only 10 to 60% of A. cajennense ticks become infected. These results indicate that the responses of these two tick species against infection are different, resulting in different prevalence rates of the bacterium. Therefore, the elucidation of the interactions between ticks of the genera Amblyomma and the bacterium R. rickettsii at a molecular level is important to provide information to better understand the mechanisms of pathogenicity of R. rickettsii against ticks as well as for the elucidation of the mechanisms responsible for the apparent refractoriness of A. cajennense against infection. Therefore, the objectives of the current study were: (i) analyze the effets of the infection with R. rickettsii on the gene expression of ticks A. cajennense by suppression subtractive hybridization (SSH), (ii) validate SSH data by reverse transcription quantitative polymerase chain reaction (RT-qPCR), and (iii) functionally characterize two genes induced by infection using RNA interference (RNAi). After bioinformatics analysis of SSH data, 44 unique sequences were obtained, among which 36 represent genes with expression induced and 8 repressed genes by infection. The induction of genes encoding subunit I of cytochrome c oxidase (COX1), the NADH dehydrogenase subunit IV, a protein containing Kunitz-type inhibitor domain (papilin-like), identified by SSH, and an antimicrobial peptide (hebraein), was confirmed by RT-qPCR. The effects of knockdown of hebraein and papilin-like encoding genes had no effect on the acquisition of R. rickettsii by the vector. Data of the current study may be used to evaluate the role of other genes in acquisition of R. rickettsii, which, in the future, may be considered as target for vaccine development.

Uma característica marcante do processo contemporâneo de urbanização em diversas regiões do país e do mundo é a expansão cada vez mais extensiva da mancha urbana sobre o território, conformando núcleos urbanos dispersos e territorialmente desagregados do conjunto urbano principal. No contexto da Região Metropolitana de São Paulo (RMSP), a dispersão urbana se materializa pelo espraiamento difuso de loteamentos clandestinos e de condomínios fechados de alto e médio padrão nas franjas urbanas, consolidando áreas periféricas ainda mais complexas do que aquelas que predominaram até a década de 1980. Um dos principais impactos dessa forma de expansão é a degradação do Cinturão Verde da Cidade de São Paulo, com sérias consequências para a população e para qualidade ambiental urbana metropolitana. O principal objetivo desta tese é estudar o papel das formas contemporâneas de urbanização na supressão da cobertura vegetal em áreas periféricas, tomando como objeto de estudo a Região Metropolitana de São Paulo. O recorte temporal se estende da década de 1980 até os dias atuais, quando as principais características dos processos contemporâneos de urbanização se tornaram mais nítidas. A questão que dá suporte ao trabalho é a de que esses processos apresentam características distintas em relação aos padrões anteriores de urbanização, alterando, consequentemente, a natureza dos impactos que provocam sobre os recursos vegetais. O agravamento dos problemas ambientais urbanos, associado ao novo quadro de urbanização, exige a realização de estudos empíricos teoricamente embasados que possam ampliar a compreensão desse processo e subsidiar a formulação de políticas públicas mais afinadas ao novo contexto. / One striking feature of the current urbanization process seen in several regions of Brazil and throughout the world is the increasing urban sprawl across the land, and the shaping of more dispersed urban nuclei that are isolated from the main urban setting. Within the context of the São Paulo Metropolitan Region (RMSP), urban sprawl is seen in the diffusion of both slums and mid-high income gated properties in the urban suburbs, producing peripheral areas that are even more complex than those seen in the 80s. One of the main impacts of this type of expansion is the degradation of the city of São Paulos Green Belt, which has severe consequences on the metropoliss people and its environment. The main objective of this research is to study the role of contemporary urban forms in the suppression of vegetation in peripheral areas, with a focus on the Metropolitan Region of São Paulo. The time frame ranges from the 1980s to present time, when the main features of these contemporary processes have become clearer. The idea behind this study is that these processes present distinct traits in relation to the previous patterns of urbanization, therefore changing the nature of the impact on natural plant resources. The rising urban environmental problems related to this new urbanization scenario call for theoretically-based empirical studies in order to better understand the process and to support the creation of public policies that are better aligned with this new context.

Neste trabalho, estudou-se o efeito da adição de acetonitrila nas propriedades de micelas do detergente aniônico, dodecil sulfato de sódio (SDS), e do detergente catiônico, cloreto de hexadeciltrimetilamônio (CTACl). Medidas de condutividade foram utilizadas para determinar a concentração micelar crítica, cmc, e o grau de dissociação, α, das micelas em função da fração molar de acetonitrila, XAc. Medidas de supressão de fluorescência, resolvida no tempo, com pireno como sonda, foram utilizadas para determinar a influência de acetonitrila no número de agregação das micelas, N, e na dinâmica de migração de solutos entre as fases aquosa e micelar. Em baixas frações molares XAc < 0,2), a acetonitrila insere-se nas cavidades da água, quebrando parcialmente as pontes de hidrogênio da água com a formação de novas pontes de hidrogênio entre as moléculas de acetonitrila e as moléculas de água. Nesta faixa de concentração, ocorre um aumento da cmc e do α, acompanhada de uma diminuição de N. Observa-se também alterações na dinâmica da interação de contra-íons e co-íons supressores na micela. Assim, as micelas de SDS e CTACl formadas em misturas acetonitrila-água são menores, mais dissociadas e apresentam maior fluidez interna. Ao redor de XAc = 0,2, as misturas de água-acetonitrila tornam-se microheterogêneos com o aparecimento de microdomínios ricos em acetonitrila e microdomínios ricos em água. A proporção das regiões ricas em acetonitrila aumenta com o aumento da fração molar de acetonitrila, com apenas pequenas modificações das propriedades dos dois tipos de microdomínios. Em XAc > 0,2 a variação de cmc e de α com a XAc passa a ser menos acentuada, sugerindo que o detergente forma agregados preferencialmente nas regiões mais aquosas; a sonda fluorescente pireno começa sair das micelas durante o tempo de vida do estado excitado; e há claras mudanças na dinâmica de incorporação de íons nos agregados. / This work presents a study of the effect of added acetonitrile on the properties of the micelles of the anionic detergent sodium dodecylsulfate (SDS) and the cationic detergent hexadecyltrimethylammonium chloride (CTACl). Conductimetric measurements were employed to determine the critical micelle concentration, cmc, and the degree of counterion dissociation, α, of the micelles as a function of the mole fraction of added acetonitrile, XAc. Time resolved fluorescence quenching measurements with pyrene as probe were employed to determine the effect of acetonitrile on the micellar aggregation number, N, and the dynamics of solute migration between the micellar and aqueous phases. At low mole fractions (XAc < 0.2), acetonitrile inserts into the cavities present in liquid water, partially disrupting the hydrogen bonding of water, with formation of new hydrogen bonds between water and acetonitrile. In this range, both the cmc and α increase, while N decreases. The dynamics of incorporation of counterionic and coionic quenchers into the micelles is also altered. Thus, the SDS and CTACl micelles formed in these acetonitrile-water mixtures are smaller, more highly dissociated and internally more fluid than those in aqueous solution. Above XAc of ca. 0,2, acetonitrile-water mixtures become microheterogeneous, the solution containing microdomains rich in acetonitrile and microdomains rich in water. The proportion of acetonitrile-rich microdomians increases with increasing XAc, with only small changes in the properties of the two types of microdomains. Correspondingly, at XAc > > ca. 0.2: the variation of the cmc and α with XAc is much less pronounced, suggesting that the detergent forms aggregates preferentially in the aqueous-rich domains; the fluorescence probe pyrene begins to exit the micelles during its excited state lifetime; and there are distinct changes in the rate constants for the incorporation of ions into the micelles.

Ao longo de várias décadas vem se intensificando a urbanização no interior de áreas de mananciais da Região Metropolitana de São Paulo - RMSP. Como resultado tem-se a diminuição da cobertura vegetal, a poluição de mananciais e a precariedade das ocupações informais, a colocar em risco a vida de milhares de pessoas. O principal objetivo desta tese é avaliar que os instrumentos da nova legislação de mananciais não foram suficientes para uma efetiva melhora e de que os ajustes da nova legislação ainda que tenham promovido um avanço e uma certa contenção do quadro de degradação ambiental e social, ainda carecem de uma maior integração entre os agentes públicos do Estado e dos Municípios envolvidos na aplicação dos instrumentos previstos. Para tanto foi adotado um recorte territorial abrangendo municípios da RMSP e distritos do município de São Paulo que estivessem total ou parcialmente abrangidos pela LPM/1975-1976, a fim de avaliar, caso a caso, o crescimento demográfico, a expansão urbana e a diminuição da cobertura vegetal dentro e fora de mananciais. Constatamos um adensamento nos territórios abrangidos pela LPM/1975-1976 selecionados para estudo, o que implica mudanças nos padrões de ocupação e uma possível diminuição da pressão sobre os remanescentes florestais. Não obstante as medidas emergenciais levadas a efeito nessas áreas, o passivo ambiental ainda é significativo, exigindo ações coordenadas e integradas dos agentes públicos do Estado e municípios envolvidos, visando à melhoria das condições ambientais e de qualidade de vida de seus habitantes e à preservação dos mananciais de abastecimento público. Entendemos que tais movimentos podem constituir o caminho para a construção de áreas urbanas com um mínimo de sustentabilidade ambiental, tendo como horizonte futuro a possibilidade de existirem cidades sustentáveis, espaço de convivência de toda sua população. / During several decades the urbanization around areas of water spring in the \"São Paulo Metropolitan Region (RMSP)\"has become more intense. As a result of this process, the increase of informal occupancy, the decrease of vegetation in the affected areas and pollution of the water spring put the life of thousands of people at risk. This thesis evaluates that the legislation dedicated to water springs was not sufficient in providing a solution to the problems above. The instruments provided by the new legislation - though successful in improving the overall picture of social and environmental degradation of the spring regions - remain mostly unenforced due to a lack of integration between the state and city government levels. In order to show this result, a sample of territories of the RMSP and districts of the city of São Paulo was chosen among those covered by the Water Supply Protection Law - LPM/1975-1976. Case by case, demographic increase, urban expansion and the decrease in vegetation around spring regions was researched. We observed an increase of population density in the sampled territories encompassed by the LPM/1975-1976, which implies a change in the patterns of occupancy and less degradation of areas of forests possibly. Although emergency actions were taken, the environmental degradation is far reaching. The preservation of the water and vegetation of the spring and the improvements of life quality of the local population require coordinated effort from public agents in the state and city levels. In our understanding, these coordinated actions may form a path to the ultimate goal of constructing urban areas with environmental sustainability.

Made available in DSpace on 2016-04-29T13:18:11Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Deniges Maurel Regis Neto.pdf: 596409 bytes, checksum: 66d18ae3780210e2f35957e33476f53b (MD5) Previous issue date: 2009-04-29 / Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior / The present work intended to create some conditions for the study of the conditional suppression with human beings. Counting on seven participants, the study involved an activity in the computer in which the participants would have to click with the mouse s cursor on a small circle that moved through the screen of a computer in sessions lasting 15 minutes. Two conditions had been simultaneously presented: one produced reinforces for clicks in mouse in VI 60 s schedule of reinforcement, and another reinforcer was provided for participation in the session under FT 1 s schedule. Two arrangements had been conducted: for four participants R$0,50 were produced and accumulated in a counter presented the screen of the computer under the schedule VI 60 s and 0,01 point was accumulated in another counter under schedule FT 1 s. To the others three participants 1,00 point was produced under schedule VI 60 s for the clicks and R$0,01 was produced under schedule FT1 s. After the stabilization of the rates of responses or a maximum of four sessions, over the schedules already presented was added to the sessions an association between a tone and three events: the appearance of a person smiling and pointing in the direction of the participant, a sound of laugh (both with 3 s of duration) and the loss of 50% of the value of the reinforcement accumulated for the FT schedule (whose decrease lasted 1 s). The duration of the tone had been manipulated differently for two groups of participants. In the last session just the presentation of the tone was maintained in a respondent extinction. The data had shown to clear or occasional suppressions during the tone for four participants; two of them showed an induction of responses when the duration of the tone raised and an alteration in the stability of the suppression rates during shorter presentations of the tone / O presente trabalho pretendeu criar algumas condições para o estudo da supressão condicionada com humanos. Contando com sete participantes, o estudo envolvia uma atividade no computador na qual os participantes deveriam clicar com o cursor do mouse sobre um pequeno círculo em movimento na tela de um computador em sessões de 15 minutos. Dois reforçadores foram utilizados: um era produzido por cliques no mouse em esquema de VI 60 s, e outro reforçador era ganho ao longo da sessão esquema de FT 1 s. Dois arranjos foram criados: para quatro participantes R$0,50 eram produzidos e acumulados em um contador na tela do computador no esquema de VI 60 e 0,01 ponto era acumulado em outro contador em esquema de FT 1 s. Para outros três participantes 1,00 ponto era produzido em esquema de VI 60 s pelos cliques e R$0,01 era produzido pelo esquema de FT 1s. Após a estabilização das taxas de respostas ou um máximo de quatro sessões, era adicionado às sessões um pareamento entre um tom e três eventos: a aparição de uma pessoa sorrindo e apontando na direção do participante, um som de risada (ambos com duração de 3 s) e a perda de 50% do valor do reforço acumulado pelo esquema de FT 1s (cujo decréscimo durava 1 s). As durações do tom foram manipuladas diferentemente para dois grupos de participantes. Na sessão última sessão o pareamento era desfeito. Os dados mostraram evidentes ou ocasionais supressões de respostas durante o tom para quatro participantes; observou-se uma indução de respostas na duração mais elevada do tom e uma alteração na estabilidade das taxas de supressão durante apresentações mais curtas do tom