Submitted by Automação e Estatística (sst@bczm.ufrn.br) on 2018-05-03T23:26:43Z No. of bitstreams: 1 LeandroGurgelDeMedeiros_DISSERT.pdf: 1967257 bytes, checksum: 24d83816c9f20214330af094f0fa32df (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2018-05-14T23:21:52Z (GMT) No. of bitstreams: 1 LeandroGurgelDeMedeiros_DISSERT.pdf: 1967257 bytes, checksum: 24d83816c9f20214330af094f0fa32df (MD5) / Made available in DSpace on 2018-05-14T23:21:52Z (GMT). No. of bitstreams: 1 LeandroGurgelDeMedeiros_DISSERT.pdf: 1967257 bytes, checksum: 24d83816c9f20214330af094f0fa32df (MD5) Previous issue date: 2018-02-19 / Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq) / A dengue é uma doença complexa e multifatorial, encontrada principalmente nas regiões tropicais e subtropicais, com incidência global variando entre 50 a 100 milhões de casos por ano. O agente etiológico, o vírus dengue (DENV), é um arbovírus do grupo B, assim designado porque a sua manutenção na natureza depende da transmissão para hospedeiros vertebrados, por vetores artrópodes hematófagos (Artrophod-Borne Vírus). São transmitidos aos humanos por mosquitos fêmeas do gênero Aedes, especialmente Aedes aegypti e Aedes albopictus. Os DENV são vírus de RNA fita simples, com polaridade positiva, tamanho aproximado de 11Kb e com uma única janela de leitura aberta. É classificado na família Flaviviridae, gênero Flavivirus, sendo descritos quatro sorotipos distintos (DENV-1, DENV-2, DENV-3 e DENV-4), sorologicamente semelhantes, mas com determinantes antigênicos específicos para cada sorotipo. Esse trabalho objetivou pesquisar os vírus dengue em culicídeos capturados no município de Natal-RN, Brasil, no período de janeiro a novembro de 2016. Foram analisados 137 pools de fêmeas das espécies Aedes aegypti, Aedes albopictus, Culex quinquefasciatus, Wyeomyia sp., Ochlerotatus scapularis e Haemagogus leucocelaenus. Cada pool foi analisado para detecção do material genético dos DENV, pela técnica de RT-PCR. A espécie Aedes aegypti foi a mais representada, com 72 pools analisados. O RNA foi detectado em 19,70% (27/137) dos pools. Nos distritos sanitários oeste e norte, houve a maior incidência de mosquitos coletados. Foi constatada a presença de dois sorotipos de dengue: o DENV-1 e o DENV-3, sendo o DENV-1, o sorotipo mais prevalente, detectado em 92,60% dos pools positivos (25/27), enquanto que DENV-3 foi detectado em apenas 7,40% (2/27). Os meses de fevereiro e abril foram os que tiveram um maior número de pools de mosquitos positivos para o DENV, ambos com 44,4% (12/27) do total de pools positivos. Essas informações possibilitaram o reconhecimento de áreas prioritárias para a realização de ações de controle da dengue em Natal-RN, bem como dos sorotipos circulantes no município no ano do estudo e revelaram a presença do DENV em outras espécies de culicídeos, sendo esse um achado pioneiro no município. / Dengue is a complex and multifactorial disease, found mainly in tropical and subtropical regions, with a global incidence ranging from 50 to 100 million cases per year. Its etiologic agent is dengue virus (DENV), a group B arbovirus, so designated because its maintenance in nature depends on transmission to vertebrate hosts by hematophagous arthropod vectors (Artrophod-Borne Virus). They are transmitted to humans by female mosquitoes of the genus Aedes, especially Aedes aegypti and Aedes albopictus. DENVs are single-stranded RNA viruses with positive polarity, approximate size 11Kb and with a single open reading frame. It is classified in the Flaviviridae family, genus Flavivirus, and four serotypes (DENV-1, DENV-2, DENV-3 and DENV-4) are described, serologically similar, but with specific antigenic determinants for each serotype. This work aimed to investigate the dengue virus in culicidae captured in the municipality of Natal-RN, Brazil, from January to November, 2016. We analyzed 137 pools of females of the species Aedes aegypti, Aedes albopictus, Culex quinquefasciatus, Wyeomyia sp., Ochlerotatus scapularis and Haemagogus leucocelaenus. Each pool was analyzed for the genetic material of DENV by the RT-PCR technique. The species Aedes aegypti was the most represented, with 72 analyzed pools. RNA was detected in 19,70% (27/137) of the pools. In the western and northern sanitary districts, there was a higher incidence of mosquitoes collected. Two types of serotypes were detected: DENV-1 and DENV-3. DENV-1, the most prevalent serotype, was detected in 92,60% of the positive pools (25/27), while DENV- 3 was detected in only 7,40% (2/27). The months of February and April were the ones that had a greater number of mosquito pools tested positive for DENV, both with 44,4% (12/27) of the total positive pools. This information allowed the recognition of priority areas for dengue control actions in Natal-RN, as well as the serotypes circulating in the municipality during the year of the study and revealed the presence of DENV in other species of culicidae, a pioneer finding in the municipality.

Orientador: Deilson Elgui de Oliveira / Banca: Claudia Esther Alicia Rocio Hassan / Banca: João Pessoa Araújo Junior / Resumo: O herpesvírus associado ao sarcoma de Kaposi (KSHV) é um gammaherpesvírus associado ao sarcoma de Kaposi (SK). A proteína K1 do KSHV é conhecida por aumentar a sobrevivência e proliferação celular em células infectadas. A ORF-K1 viral apresenta elevada variabilidade, de modo a discriminar diferentes genótipos do KSHV. Até o momento não se sabe se diferentes genótipos virais apresentam características biológicas próprias. Assim, vetores recombinantes contendo a ORF-K1 de genótipos virais A e B foram gerados. A ORF-K1 foi obtida a partir do DNA de linhagens de linfoma de efusão primária (PEL) constitutivamente infectadas pelo KSHV. O amplicon da ORF-K1 e vetor comercial foram digeridos, ligados e clonados em bactéria E. coli DH5α. Clones selecionados foram então submetidos à sequenciamento automatizado de DNA. As sequências geradas dos vetores recombinantes foram alinhadas e comparadas com sequências-protótipo de ORF-K1 do KSHV. Sequência de aminoácidos dos vetores recombinantes foram geradas e analisadas quanto a região codificadora do ITAM de K1. Um clone validado de cada vetor recombinante foi transfectado estavelmente em células HEK293 e a expressão de K1 foi avaliada por Western blot (WB) O sequenciamento de DNA demonstrou que a ORF-K1 dos vetores recombinantes de genótipo A, B e C corresponde a de sequências-protótipo depositadas de linhagens de PEL. A presença de K1 no lisado de células HEK293 transfectadas foi demonstrada por WB. A análise da sequência de aminoácidos de K1 codificada nos vetores recombinantes revelou que o domínio ITAM de K1 do genótipo B apresenta aminoácidos distintos em relação ao ITAM de K1 de genótipos A e C. Portanto, vetores recombinantes de ORF-K1 foram produzidos e validados, e serão úteis para se estabelecer modelo experimental para análises das propriedades biológicas da proteína K1 do KSHV / Abstract: Kaposi's sarcoma-associated herpesvirus (KSHV) is a gammaherpesvirus associated with the development of Kaposi's sarcoma. The K1 protein of KSHV has been shown to induce increases the survival and proliferation of infected cells. The viral ORF-K1 shows high variability, so it is possible to distinguish different KSHV genotypes (genotypes A, B, C, D). So far, it is unclear whether different viral genotypes have their own biological characteristics. To this intent, recombinant vectors were generated containing the ORFK1 genotypes A and B. ORF-K1 was obtained from the DNA of primary effusion lymphoma (PEL) cell lines. The amplicon generated and the commercial vector were digested, bonded and cloned in E.coli DH5α. Selected clones underwent automated DNA sequencing. The generated sequences were compared with prototype sequences of ORF-K1. The amino acid sequences from vectors were generated and analyzed in the K1 ITAM-coding region. Validated clones were stably transfected into HEK293 cells and K1 expression was evaluated using Western blot (WB). DNA sequencing showed that the ORF-K1 recombinant vectors corresponds to the prototype sequences deposited from PEL cell lines. WB demonstrated the presence of K1 in the lysate of HEK293 transfected cells. Analysis of the K1 amino acid sequence encoded in the vectors revealed that ITAM domain of K1 (genotype B) has distinct amino acids from the ones in the ITAM domain of K1 (genotypes A and C). Therefore ORF-K1 recombinant vectors were produced and validated, and will be useful to establish an experimental model for analysis of the biological properties of the K1 protein / Mestre

Orientador: José Rafael Modolo / Coorientador: Cassino Victória / Banca: Mara Cristina Pinto / Banca: Newton Gourlart Madeira / Resumo: As doenças transmitidas por vetores são um dos principais problemas de saúde pública atualmente. Nas últimas duas décadas, muitas dessas doenças reapareceram ou se espalharam para novas partes do planeta, como é o caso das leishmanioses, que são transmitidas por várias espécies de flebotomíneos. O acompanhamento sistemático da superfície do solo com a utilização de armadilhas de emersão tem identificação dos locais de desenvolvimento natural dos flebotomíneos e os estudos da biologia larval, auxiliam o desenvolvimento de possíveis medidas para o controle do vetor nesta fase, uma vez que existe dificuldade em se controlar o adulto. Nestas condições, o presente trabalho teve como objetivo identificar áreas de maior risco para criação e manutenção dos flebotomíneos baseado nas características ambientais, captura dos flebotomíneos por um modelo adaptado de armadilha de emersão e associadas aos resultados das análises de solo, em ambiente urbano. Foram instaladas 333 armadilhas em 2 municípios, no período de novembro de 2012 a janeiro de 2014, sendo possível observar 11.857 insetos, dos quais 9.239 pertenciam à Ordem Diptera. Entretanto, nenhum flebotomíneo de importância médico-veterinária foi capturado. As análises de solo revelaram que o solo da região amostrada caracteriza-se como arenoso, com baixo índice de acidez e alto teor de matéria orgânica. Notou-se a presença de animais como cão, gato, galinha, bovinos e equinos nos quintais, bem como vegetação tanto frutífera quanto ornamental. Não foi possível realizar a correlação entre características ambientais, do solo e presença de criadouros naturais de flebotomíneos pelo fato de não ter capturado nenhum exemplar em ambos os municípios. Entretanto, outras pesquisas devem ser realizadas, pois esse tipo de informação obtida é de extrema importância para o planejamento e desenvolvimento de medidas de controle para o vetor, já que as ... / Abstract: Currently, vector-borne diseases are a major public health problems. In last 20 years, many of these diseases have reappeared or spread to new parts of the planet, as leishmaniasis, which is transmitted by several species of sandflies. Systematic monitoring of the soil surface combined with emergence traps must identify sandflies natural breedings sites and studies of their larval biology, help to develop possible measures for vector control at this stage, since there is difficulty in to control adult sandfly. Accordingly , this study aimed to identify areas of greatest risk for the development and maintenance of sandflies based on environmental characteristics, to catch sandflies by an adapted emergence trap and analytical results of soil in urban environment . A total of 333 traps were placed in 2 municipalities from November 2012 to January 2014. Was possible to observe 11,857 insects, of which 9,239 belonged to the Order Diptera. However, no sandfly medical and veterinary importance was captured. Soil analysis revealed that the soil from the study area is characterized as sandy, with low acidity and high content of organic matter. The presence of animals like dog, cat, chicken, cattle and horses, as well as fruitful as both ornamental vegetation, were noted in backyards. Unable to perform the correlation between environmental characteristics , soil and presence of natural breeding sites of sandflies by not having captured no copy in both municipalities . However, other studies should be conducted, because this type of information is important for the planning and development of control measures for the vector, since the measures directed to reservoir (dog) , are not well accepted by population / Mestre

Orientador: Marcio José Tiera / Banca: Miguel Jafelicci Junior / Banca: Julio C. Fernandes / Resumo: A terapia gênica baseada em vetores não virais, tais como aqueles que se utiliza de sistemas poliméricos, é uma proposta promissora para o tratamento de doenças que se manifestam devido alguma disfunção gênica. Entretanto, o maior desafio desta técnica é a transferência do material genético, e a maioria dos esforços focaliza o desenvolvimento de vetores eficientes que possam transportar e transferir o DNA de modo seguro e eficaz. Neste trabalho, buscou-se sintetizar derivados de Poli(L-Lisina) (PLL) introduzindo o grupo fosforilcolina (PC) nos grupos amino da PLL, procurando-se variar os graus de substituição, com o objetivo de melhorar as propriedades deste vetor. A caracterização dos derivados foi realizada por RMN de hidrogênio, FTIR-ATR e GPC. O grau de substituição foi determinado com as técnicas de RMN de hidrogênio e potenciometria. A modificação da PLL com PC aumentou a capacidade de tamponamento dos derivados substituídos, o que pode melhorar a eficiência de transfecção. Estudos de interação entre PLL e PLL-PC com o DNA plasmidial VR1412 foram realizados em dois pHs (pH 5,0 e 7,4) por meio das técnicas de espectroscopia de fluorescência, eletroforese em gel de agarose, espalhamento de luz dinâmico e potencial zeta. Os resultados mostraram que os derivados são capazes de formar poliplexos e que a interação depende do grau de substituição, do pH, e da razão de cargas (razão N/P: razão de mol de grupos amino (polímero) por mol de grupos fosfato (pDNA)). Os estudos de espalhamento de luz dinâmico mostraram a formação de nanopartículas com diâmetros de 150 a 300 nm em pH 5,0 e de 350 a 700 nm em pH 7,4. As partículas exibiram carga superficial positiva (~ +25 mV em pH 5,0 e ~ +10 mV em pH 7,4), propriedade importante no processo de internalização dos poliplexos por endocitose. A viabilidade celular utilizando o ensaio colorimétrico com o MTS mostrou que proporções crescentes de PC podem ... / Abstract: Gene therapy based on non-viral vectors, such as those that utilize polymerics systems, is a promising treatment for diseases that arise due some genetic disorder. However the challenge of using this technique is the transfer of the genetic material and most of the efforts have focused on the development of effective vectors to efficiently deliver the DNA into the cells. In this work, the main purpose was to synthesize PLL derivatives containing increasing proportions of the group phosphorylcholine (PC), aiming to improve the PLL properties as a non viral vector. The derivatives were characterized by ¹H NMR, FTIR-ATR and GPC techniques. The degree of substitution was determined by ¹H NMR and potentiometry. The buffering capacity was evaluated and showed the grafting with PC groups increased the buffering capacity, which may improve the transfection efficiency. The interaction between PLL and PLL-PC derivatives and the plasmid VR 1412, was studied at two pH values (pH 5.0 and 7.4) by fluorescence, agarose gel electrophoresis, dynamic light scattering and zeta potential techniques. The results showed that all derivatives were able to form polyplexes depending on the degree of substitution, pH and the charge ratio (N/P, the ratio of amino groups to phosphate groups from the pDNA). Nanoparticles prepared using the coacervation process showed sizes varying from 150 to 300 nm at pH 5.0 and from 350 to 700 nm at pH 7.4. The particles exhibited positives surface charges (~ +25 mV at pH 5.0 and ~ +10 mV at pH 7.4) an important property for promoting the internalization process by endocytosis. Cell viability using the MTS colorimetric assay showed that increasing proportions of PC groups can reduce the cytotoxicity of nanoparticles, and IC50 values for the sinthesized polymers were graphically determined. The in vitro transfection efficiencies were shown to depend on the degree of substitution and N/P ratio and all the derivatives showed ... / Mestre

Made available in DSpace on 2014-12-17T14:55:12Z (GMT). No. of bitstreams: 1 AdrianaT_TESE.pdf: 618602 bytes, checksum: 8ea994949daea03408599ce92036681a (MD5) Previous issue date: 2012-09-26 / The Support Vector Machines (SVM) has attracted increasing attention in machine learning area, particularly on classification and patterns recognition. However, in some cases it is not easy to determinate accurately the class which given pattern belongs. This thesis involves the construction of a intervalar pattern classifier using SVM in association with intervalar theory, in order to model the separation of a pattern set between distinct classes with precision, aiming to obtain an optimized separation capable to treat imprecisions contained in the initial data and generated during the computational processing. The SVM is a linear machine. In order to allow it to solve real-world problems (usually nonlinear problems), it is necessary to treat the pattern set, know as input set, transforming from nonlinear nature to linear problem. The kernel machines are responsible to do this mapping. To create the intervalar extension of SVM, both for linear and nonlinear problems, it was necessary define intervalar kernel and the Mercer s theorem (which caracterize a kernel function) to intervalar function / As m?quinas de vetores suporte (SVM - Support Vector Machines) t?m atra?do muita aten??o na ?rea de aprendizagem de m?quinas, em especial em classifica??o e reconhecimento de padr?es, por?m, em alguns casos nem sempre ? f?cil classificar com precis?o determinados padr?es entre classes distintas. Este trabalho envolve a constru??o de um classificador de padr?es intervalar, utilizando a SVM associada com a teoria intervalar, de modo a modelar com uma precis?o controlada a separa??o entre classes distintas de um conjunto de padr?es, com o objetivo de obter uma separa??o otimizada tratando de imprecis?es contidas nas informa??es do conjunto de padr?es, sejam nos dados iniciais ou erros computacionais. A SVM ? uma m?quina linear, e para que ela possa resolver problemas do mundo real, geralmente problemas n?o lineares, ? necess?rio tratar o conjunto de padr?es, mais conhecido como conjunto de entrada, de natureza n?o linear para um problema linear, as m?quinas kernels s?o respons?veis por esse mapeamento. Para a extens?o intervalar da SVM, tanto para problemas lineares quanto n?o lineares, este trabalho introduz a defini??o de kernel intervalar, bem como estabelece o teorema que valida uma fun??o ser um kernel, o teorema de Mercer para fun??es intervalares

Manguezal é um ecossistema costeiro que ocorre nas regiões tropicais e subtropicais do planeta, ocupando a zona entremarés dos oceanos, e sendo caracterizado pela presença de vegetação arbórea adaptada à condições adversas de salinidade, substrato, baixa oxigenação e submersão periódica. A pressão sobre os manguezais do Estado do Rio de Janeiro vem se intensificando nas últimas décadas, e estão associadas a vetores de pressão como os aterros, desmatamentos, queimadas, corte seletivo de madeira, captura predatória de moluscos e crustáceos, lançamento de efluentes de origens diversas, a superexplotação dos recursos pesqueiros e a utilização de técnicas e apetrechos inadequados. Considerando a inexistência de mapeamento integrado e atualizado dos remanescentes de manguezal, indicando sua localização e dimensionamento, o presente estudo veio suprir essa demanda, construindo uma ferramenta consistente para a análise dos principais vetores a que estão expostos, subsidiando a proposição de ações para a conservação e monitoramento desse ecossistema. Essas ações consideram a necessidade de preservação da biodiversidade, da manutenção da atividade pesqueira, da estabilidade da linha de costa, e da subsistência de diversas populações que habitam a região costeira. O mapeamento dos manguezais do Estado do Rio de Janeiro foi elaborado a partir da interpretação visual de ortofotografias coloridas do ano de 2005, na escala 1:10.000, tendo sido realizadas checagens de campo para identificação da verdade terrestre. Os remanescentes mapeados totalizam uma área de aproximadamente 17.720 ha, estando distribuídos por sete regiões hidrográficas localizadas na zona costeira fluminense. Esses ocorrem com mais freqüência, e com maiores dimensões, nas regiões da baía da Ilha Grande, Guandu(Sepetiba) e baía de Guanabara. O estudo contemplou ainda o levantamento e sistematização de dados cartográficos e de sensoriamento remoto, e a identificação e análise dos principais vetores de pressão que atuam sobre esses, a partir da adaptação da metodologia da Análise de Cadeia Causal. Nessa análise foram identificados como principais problemas ambientais dos manguezais fluminenses, a Modificação de habitats e comunidades, a Poluição, e a Exploração não sustentável dos recursos pesqueiros, todos associados aos diferentes vetores de pressão já relacionados. Por fim, foram apresentadas propostas de ações para subsidiar a implementação da Política Estadual para a Conservação dos Manguezais do Estado do Rio de Janeiro, contemplando os níveis operacional, de planejamento, e político. A reativação do Grupo Técnico Permanente sobre Manguezais é de vital importância para a retomada dessas discussões e para a implementação de ações, apoiado na ampliação dos conhecimentos sobre esse rico ecossistema e, integrando e fortalecendo a atuação dos diversos atores envolvidos, buscando assim garantir a integridade dos manguezais fluminenses / Mangrove is a coastal system that occurs in tropical and sub-tropical regions of the planet, occupying entremares zone of oceans, and featured by the presence of arbórea vegetation very much adapted to adverses conditions of salinity, substractm low oxygenation and periodic submersion. The pressure over the mangrove in Rio de Janeiro have been intensifeid in the last decades and are associated to vectors such as landfills, deforestation, real state speculation and disorganized occupation, infrastructure works, sewage discharge and several residues, and overexploitation of fishing resources. Considering the nonexistence mapping integrated and updated of the remaining mangroves, indicating its location and sizing, the present study sought to supply this demand, building a consistent subsidy for analyses the main vectors they are exposed to. It sought too, to manage a proposal of strategic actions for the maintenance and monitoring of this ecosystem. The knowledge of the space distribution and the dimensions of these remaining mangroves is directly related to the fishing activity, the stability of the coast line, the tourism activities, the subsistence of many people that live in these regions and also the global climate changes. The analyse of the pressure vectors developed on this study, followed the criterion of partitioning this territory in ten hydrographics regions enabling an environmental planning. This mapping was elaborated basicly from visual interpretation of colorful orthophotos taken in 2005 and carefully checked to identify the terrestrial truth. The mangrove mapping in Rio de Janeiro in scale 1:10.000, resulted in a total remaining area of approximately 17.720 ha, distributed in seven hydrographics regions located in the fluminense coast line, occurring in a more expressive way in 3 of theme. The study contemplated the survey and systematization of cartographic elements and remote sensing mapping the remaining mangroves, identification and analysis of main vectors and pressure over them, from adaptation of the Analysis of the Casual Chain metodology and proposed actions to subsidize the implementation of State Politics for the maintenance of Mangroves in the State of Rio de Janeiro. Finally, were presented proposals of actions to resume the discussion over the management and maintenance of mangrove in Rio de Janeiro, subdivided in the following levels: operating, planning and political. The implementation of public politics integrated is indispensable for the social, economic and environmental development in our state.

Submitted by Automa??o e Estat?stica (sst@bczm.ufrn.br) on 2016-10-26T22:15:37Z No. of bitstreams: 1 CassioLazaroSilvaInacio_DISSERT.pdf: 5801249 bytes, checksum: 3cdf87a3d45993242eed738714106ede (MD5) / Approved for entry into archive by Arlan Eloi Leite Silva (eloihistoriador@yahoo.com.br) on 2016-12-26T17:06:40Z (GMT) No. of bitstreams: 1 CassioLazaroSilvaInacio_DISSERT.pdf: 5801249 bytes, checksum: 3cdf87a3d45993242eed738714106ede (MD5) / Made available in DSpace on 2016-12-26T17:06:40Z (GMT). No. of bitstreams: 1 CassioLazaroSilvaInacio_DISSERT.pdf: 5801249 bytes, checksum: 3cdf87a3d45993242eed738714106ede (MD5) Previous issue date: 2016-03-18 / No Rio Grande do Norte os mais recentes estudos sobre a fauna de mosquitos t?m sido realizados em unidades de conserva??o nos dois dom?nios morfoclim?ticos presentes no estado, a Mata Atl?ntica e a Caatinga, tais estudos s?o limitados quanto a sua abrang?ncia geogr?fica. O s?tio Areias, no qual foi realizado o presente trabalho, est? localizado no munic?pio de Currais Novos-RN, no Serid? potiguar. Em tal regi?o ? predominante a Caatinga Hiperxer?fila Serid?, conhecida por ser a vegeta??o mais seca do estado, e est? em processo de desertifica??o. Durante o per?odo chuvoso, a caatinga pode apresentar h?bitats prop?cios para a prolifera??o de mosquitos, pois ? poss?vel o ac?mulo de ?guapermitindo assim o desenvolvimento de mosquitos com h?bitos comportamentais e hematof?gicos diversos. Tais fatores aliados a escassez de conhecimento da entomofauna de culic?deos na caatinga instigaram a realiza??o deste estudo. Para realiza??o do estudo, foram realizadas coletas mensais de mosquitos adultos, ovos e larvas por meio de dois procedimentos o primeiro com a armadilha Shannon e o segundo com a ovitrampa durante os per?odos de mar?o-maio e agosto-outubro dos anos de 2014 e 2015, em tr?s intervalos de hor?rios (17h-18h, 18h-19h e 19h-20h). Foram coletados e identificados 2291 esp?cimes, apenas na armadilha Shannon, n?o sendo observado nenhum ovo ou larva nas ovitrampas instaladas. A classifica??o revelou 14 t?xons: Anopheles marajoara; Anopheles argyritarsis; Anopheles braziliensis; Anopheles deaneorum; Aedes lepidus; Aedes scapularis; Aedes taeniorhynchus; Culex coronator; Culex (Cux.) spp.; Haemagogus spegazzinii; Mansonia indubitans; Mansonia wilsoni; Psorophora ferox e Uranotaenia lowii. Al?m da ocorr?ncia de esp?cies para o Rio Grande do Norte s?o mostradas rela??es ecol?gicas dos mosquitos na Caatinga potiguar. Tal estudo registrou pela primeira vez no Estado a presen?a das esp?cies Culex (Cux.) coronator e Anopheles (Nys.) deaneorum. Vale ressaltar ainda, que, a presen?a de algumas esp?cies em ?reas rurais pode ter alguma import?ncia quando se considera insetos com capacidade vetorial em ?reas pr?ximas aos hospedeiros, o que pode gerar impacto na sa?de p?blica. / In Rio Grande do Norte the latest studies on mosquito fauna have been carried out in protected areas in both morphoclimatic domains present in the state, the Atlantic Forest and Caatinga, these studies are limited in their geographical scope. The farm Areias, where this work was done, is located in the city of Currais Novos, RN, in the region of Serid?. On this region is predominantly Caatinga Hyperxerophilic Serid?, known by being driest vegetation of the state, in the process of desertification. During the rainy season, the caatinga can show habitats conducive to the proliferation of mosquitoes because the water accumulation is possible, allowing the development of mosquitoes with behavioral habits and several hematophagous. These factors associate with lack of knowledge of the insect fauna of mosquitoes in the bush, prompted this study. For the study, monthly mosquito, eggs and larvae collections were made through two procedures: the first with Shannon trap and the second with the egg trap during the period from march to may and august to october the years 2014 and 2015 in three intervals of time (17h-18h, 18h-19h and 19h-20h). They were collected and identified 2291 specimens, only the Shannon trap, eggs or larvae were not observed in ovitraps installed. The classification revealed 14 taxa: Anopheles argyritarsis; Anopheles braziliensis; Anopheles deaneorum; Anopheles marajoara; Aedes lepidus; Aedes scapularis; Aedes taeniorhynchus; Culex coronator; Culex (Cux.) spp.; Haemagogus Spegazzinii; Mansonia indubitans; Mansonia wilsoni; Psorophora ferox and Uranotaenia lowii. In addition to the occurrence of species in the Rio Grande do Norte state ecological relationships of mosquitoes are shown in Caatinga. This study recorded the first time in the state the presence of species Culex (Cux.) coronator (Group) and Anopheles (Nys.) deaneorum (identification male genitaly). It is worth noting also that the presence of some species in rural areas may have some importance when considering insects with vectorial capacity in areas close to the host, which may have an impact on public health.

O objetivo desta Tese é realizar o levantamento taxonômico e avaliar a dinâmica populacional de Simuliidae em localidades sob influência do Aproveitamento Hidrelétrico de Peixe Angical, TO. Os simulídeos possuem abrangente distribuição geográfica, e os estágios imaturos utilizam ambientes lóticos como sítios de criação. Algumas espécies podem atuar como vetores de vírus, protozoários e helmintos, o que confere ao grupo importância médica e veterinária. O hábito hematofágico das fêmeas de simulídeos pode acarretar sérios prejuízos ao turismo; ocasiona baixa no rendimento escolar; e na agropecuária dificulta a execução do trabalho o que reduz a produtividade. Durante a construção de grandes empreendimentos ocorre em pouco tempo à introdução de contingente populacional com drástica transformação do meio. A intervenção do homem sobre os ecossistemas e o crescimento desordenado pode provocar desequilíbrio ecológico que propicia a proliferação de espécimes vetores com consequentes problemas médico sanitários. A maior parte dos trabalhos realizados com insetos vetores em áreas sob influência da construção de hidrelétricas se refere aos culicídeos. O estudo dos aspectos taxonômicos permitirá o levantamento da biodiversidade e o diferencial deste projeto está no estabelecimento da sazonalidade e dinâmica das populações de imaturos e adultos de simulídeos. As amostras foram obtidas em áreas de influência direta e indireta da UHE Peixe no rio Tocantins, em 12 pontos diferentes de coleta, nos municípios deJaú do Tocantins, Peixe, Palmeirópolis, Paranã e São Salvador do Tocantins. Foram realizadas bimestralmente de 2004 a 2007, um total de 24 campanhas para coleta em criadouros pré-selecionados, que acompanharam todas as fases de construção início das obras, formação do lago, funcionamento da Usina. OS dados abióticos foram aferidos, e os imaturos removidos do substrato manualmente por 10 minutos e posteriormente preparados para eclosão dos adultos. Parte do material foi identificado no Laboratório de Simulídeos e Oncocercose do Instituto Oswaldo Cruz, onde foram verificados novos registros específicos para a ocorrência de Simuliidae em Tocantins, além do assinalamento de espécies antropofílicas e/ou vetores de Onchocerca volvulus. Nas áreas usadas para a formação do lago houve desaparecimento de criadouros. O desmatamento ocorrido aliado ao vigor dos simulídeos que conseguem realizar voos de longas distâncias na procura de alimento ou locais adequados a oviposição devem ter contribuído para a dispersão de espécimes. Há relatos sobre a da ocorrência de oncocercose na área estudada, um foco foi demarcado na divisa de Goiás com Tocantins, municípios Paranã e Minaçu investigado a partir de um caso autóctone de oncocercose. Este estudo é relevante uma vez que o Brasil possui potencial hidroenergético e prevê a construção de inúmeras hidrelétricas nos próximos anos. É importante estudas as áreas impactadas, conhecer a sua biodiversidade e os aspectos bioecológicos de Simuliidae no país. / This project aims to carry out the taxonomic survey and population dynamics of Simuliidae in locations under the use influence of hydroelectric power station at Peixe Angical (Tocantins). Immature black-flies use lotic environments as rearing sites. Some species are vectors of viruses, protozoa or helminths, which assigns them medical as well as veterinary importance. The blood feeding habits of females affect rural life causing financial damages to tourism, declining of school performance and reducing of agricultural productivity. During the construction of large enterprises the need of hiring extra personnel drastically affects the environment. Human intervention on ecosystems as well as disorderly population growth can cause ecological imbalance added to significant vector proliferation causing health as well as sanitary problems. Deforestation and exploitation in the river beds also affect population of black-flies dynamics influencing their geographical distribution. In specialized literature, most of the work carried out in hydroelectric construction areas is referred to culicidae. Studies that mention black-flies in impacted areas by hydroelectric power stations in Brazil are restricted to taxonomic survey and brief comments on the formation of lakes with consequent disappearance of breeding sites in lotic environments. This research work is part of a larger project that studies the black-flies and their local associated entomological fauna, which will allow us to carry out its biodiversity surveillance. The differential of this project is to establish the seasonality and population dynamics of immature as well as adult black-flies. Samples were obtained in areas of direct and indirect influence of Peixe Hydroelectric power station in 12 different collecting sites in the municipalities of Peixe, Paranã, Palmeirópolis, Jaú and São Salvador do Tocantins. Were conducted bimonthly from 2004 to 2007, a total of 24 campaigns, which accompanied building phases: start of groundwork, lake formation and operation of the plant. All abiotic data were registered and immature black-flies removed from the substrate for 10 minutes and prepared for the outbreaking of adults. Part of the material has been identified at the Simuliidae and Onchocerciasis laboratory at Oswaldo Cruz Institute, where new records of specific occurrence of Simuliidae in Tocantins have been registered, as well as anthropophilic species and / or vectors of Onchocerca volvulus. Mansonella ozzardi of vector species were not collected in the study area. It is expected that the prevalence is higher in the rainy months of the year. In areas where there was a lake formation there was loss of habitats. Black-flies can fly long distances in search of food or oviposition sites and that fact, coupled with deforestation may lead to the dispersal of species. There is a report on the occurrence of an autochthonous case of onchocerciasis in Paranã and Minaçu, municipality of Goiás and boarding area of the studied sites. This study is relevant to knowledge of biodiversity and bioecological aspects of Simuliidae in Brazil.

Sistemas para assistência de pessoas com sequelas de Acidente Vascular Cerebral (AVC) como, por exemplo, a Disartria apresenta interesse crescente devido ao aumento da parcela da população com esses distúrbios. Este trabalho propõe a aquisição e o processamento dos biosinais de Eletromiografia de Superficie (sEMG) no músculos do rosto ligados ao processo da fala e de Eletroencefalografia (EEG), sincronizados no tempo mediante um arquivo de áudio. Para isso realizaram-se coletas em voluntários saudáveis no Laboratório IEE e com voluntários com Disartria, previamente diagnosticados com AVC, no departamento de Fisioterapia do Hospital de Clínicas de Porto Alegre. O objetivo principal é classificar esses biosinais frente a comandos verbais estabelecidos, mediante o método computacional Support Vector Machine (SVM) para o sinal de sEMG e Naive Bayes (NB) para o sinal de EEG, visando o futuro estudo e classificação do grau de Disartria do paciente. Estes métodos foram comparados com o Linear Discriminant Analysis (LDA), que foi implementado para os sinais de sEMG e EEG. As características extraídas do sinal de sEMG foram: desvio padrão, média aritmética, skewness, kurtosis e RMS; para o sinal de EEG as características extraídas na frequência foram: Mínimo, Máximo, Média e Desvio padrão e Skewness e Kurtosis, no domínio do tempo. Como parte do pré-processamento também foi empregado o filtro espacial Common Spatial Pattern (CSP) de forma a aumentar a atividade discriminativa entre as classes de movimento no sinal de EEG. Foi avaliado através de um Projeto de Experimentos Fatorial, a natureza das coletas, o sujeito, o método computacional, o estado do sujeito e a banda de frequência filtrada para EEG. Os comandos verbais definidos: “Direita”, “Esquerda”, “Para Frente” e “Para Trás”, possibilitaram a identificação de tarefas mentais em sujeitos saudáveis e com Disartria, atingindo-se Accuracy de 77,6% - 80,8%. / Assistive technology for people with Cerebrovascular Accident (CVA) aftereffects, such as Dysarthria, is gaining interest due to the increasing proportion of the population with these disorders. This work proposes the acquisition and processing of Surface Electromyography (sEMG) signal from the speech process face muscles and Electroencephalography (EEG) signal, synchronized in time by an audio file. For that reason assays were carried out with healthy volunteers at IEE Laboratory and with dysarthric volunteers, previously diagnosed with CVA, at the physiotherapy department of the Porto Alegre University Hospital. The main objective is to classify these biosignals in front of verbal commands established, by computational method of Support Vector Machine (SVM) for the sEMG and Naive Bayes (NB) for EEG, regarding the future study and classification of pacient degree of Dysarthria. These methods were compared with Linear Discriminant Analysis (LDA), who was implemented for sEMG and EEG. The extracted features of sEMG signal were: standard deviation, arithmetic mean, skewness, kurtosis and RMS; for EEG signal extracted features in frequency domain were: minimum, maximum, average and standard deviation, skewness and kurtosis, were used for time domain extraction. As part of pre-processing, Common Spatial Pattern (CSP) filter was also employed, in order to increase the discriminating activity between motion classes in the EEG signal. Data were evaluated in a factorial experiment project, with nature of assays, subject, computational method, subject health state and specifically for EEG were evaluated frequency band filtered. Defined verbal commands, "Right", "Left", "Forward" and "Back", allowed the identification of mental tasks in healthy subjects and dysarthric subjects, reaching Accuracy of 77.6% - 80.8%.

Dissertação (mestrado)—Universidade de Brasília, Instituto de Ciências Biológicas, Departamento de Biologia Celular, 2008. / Submitted by Diogo Trindade Fóis (diogo_fois@hotmail.com) on 2009-10-06T11:45:45Z No. of bitstreams: 1 2008_RobertoTernesArrial.pdf: 1174697 bytes, checksum: deb680a64e956cb71d50d5d028a379c8 (MD5) / Approved for entry into archive by Guimaraes Jacqueline(jacqueline.guimaraes@bce.unb.br) on 2009-11-03T17:27:16Z (GMT) No. of bitstreams: 1 2008_RobertoTernesArrial.pdf: 1174697 bytes, checksum: deb680a64e956cb71d50d5d028a379c8 (MD5) / Made available in DSpace on 2009-11-03T17:27:16Z (GMT). No. of bitstreams: 1 2008_RobertoTernesArrial.pdf: 1174697 bytes, checksum: deb680a64e956cb71d50d5d028a379c8 (MD5) Previous issue date: 2008-04 / Paracoccidioides brasiliensis (Pb) é um fungo saprófito e dimórfico de importância clínica, pois seus propágulos, quando inalados por humanos, desencadeiam a doença conhecida como paracoccidioidomicose. No ano de 2005 foi publicado o transcriptoma do Pb, apontando diversos alvos potenciais de drogas, mas ainda assim uma parte significativa dos transcritos seqüenciados não possui proteínas homólogas identificadas. Esse trabalho sugere que alguns desses RNAs possam ser não-codificadores (ncRNAs), uma classe de moléculas biologicamente funcionais que no entanto não codificam para nenhum produto protéico. Para tanto foi feita uma abordagem exclusivamente computacional, utilizando exemplos conhecidos de mRNAs e ncRNAs para treinamento de dois algoritmos de aprendizado de máquina: naive Bayes (nB) e Máquinas de Vetores de Suporte (MVS). Diversos programas descritos na literatura e desenvolvidos localmente foram usados para obter propriedades dos transcritos e de seus produtos protéicos, de forma que os algoritmos de aprendizado de máquina fossem capazes de diferenciar satisfatoriamente um mRNA de um ncRNA. O uso de várias medidas de eficiência mostra que ambos algoritmos, MVS e nB, induziram classificadores que discriminam as duas classes de RNAs de forma muito eficiente, mas também indicam que o MVS possui uma vantagem significativa em relação à sua detecção de ncRNAs. Acurácia média mensurada por validação cruzada de 10 vezes para o MVS foi de 92,4%, e para o nB, 75,3%. Quando usados no transcriptoma de Pb, o MVS e o nB detectam, respectivamente, 970 e 262 ncRNAs, dos quais a maior parte é de transcritos sem anotação e singlets, duas características que apóiam a possibilidade de que esses transcritos sejam realmente ncRNAs. Comparações a programas relacionados mostram que o programa aqui descrito apresenta um ganho em velocidade computacional sem perda de acurácia. Foi desenvolvido nesse trabalho um programa computacional de análise ab initio, designado PORTRAIT, especializado em detecção de ncRNAs em transcriptomas de organismos pouco caracterizados. __________________________________________________________________________________________ ABSTRACT / Paracoccidioides brasiliensis (Pb) is a saprophytic and dimorphic fungus of clinical importance because its propagules, when inhaled by humans, cause the disease known as paracoccidioidomycosis. In the year 2005 the Pb transcriptome was published, pointing out several potential drug targets, but still a significative amount of sequenced transcripts lack identified homologous proteins. This work suggests that these RNAs may be non-coding RNAs (ncRNAs), a class of biologically functional molecules that do not code for any protein product. Aiming this, a strictly computational approach was made, using known examples of mRNAs and ncRNAs for training two machine learning algorithms: naive Bayes (nB) and Support Vector Machines (SVM). Several programs available from literature and locally developed were used to obtain properties from transcripts and its corresponding protein products, in such a way that machine learning algorithms could successfully discriminate between mRNA and ncRNA. Several efficiency measurements show that both algorithms, SVM and nB, induced classifiers able to efficiently discriminate the two classes of RNAs, and also indicate that SVM has a significative advantage regarding ncRNA detection. Mean accuracy as estimated by 10-fold cross-validation procedure was 92.4% for SVM and 75.3% for nB. When used in the Pb transcriptome, SVM and nB detect, respectively, 970 and 262 ncRNAs, of which the majority is composed of singlets and unnanotated transcripts, two characteristics that support the possibility that these transcripts are real ncRNAs. Comparison to related works indicates that the described program offers a computational speed improvement without hindering accuracy. This work describes the design of a computational program for ab initio analysis, named PORTRAIT, specialized in detection of ncRNAs in transcriptomes from poorly characterized organisms.